Modelowanie molekularne
|
|
- Patrycja Wiśniewska
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 k08 Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład hemii Teoretycznej Wydział hemii UJ Wykład 1
2 Theoretical chemistry Quantum chemistry omputational chemistry Molecular modelling Molecular informatics (cheminformatics, bioinfiormatics)
3 Modelowanie molekularne What is molecular modelling? Molecular clearly implies some connection with molecules. The Oxford English Dictionary defines model as a simplified or idealized description of a system or process, often in mathematical terms, devised to facilitate calculations and predictions. Molecular modelling would therefore appear to be concerned with ways to mimic the behaviour of molecules and molecular systems.
4 Modelowanie molekularne - Modelowanie kwantowochemiczne - Mechanika molekularna - Dynamika molekularna - Symulacje Monte-arlo - Grafika molekularna
5 Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Praktyczne zapoznanie z metodami obliczeniowymi chemii kwantowej i ich zastosowaniami w chemii Podstawowe zasady obsługi oprogramowania kwantowo-chemicznego; dane do obliczeń kwantowo-chemicznych; możliwości powszechnie dostępnych systemów obliczeniowych. Przybliżenie Borna-Oppenheimera; powierzchnia energii potencjalnej; punkty stacjonarne. Praktyczne aspekty optymalizacji geometrii układów molekularnych; optymalizacja stanów przejściowych; ścieżki reakcji. Metody wariacyjne; przybliżenie jedno-elektronowe, metoda Hartree-Focka (HF); metody RHF i UHF; realizacje ab initio i półempiryczne metody HF. Bazy funkcyjne w obliczeniach ab initio. Orbitale molekularne, gęstość elektronowa, analiza populacyjna. Sposoby wizualizacji. Wiązanie chemiczne; mapy różnicowe gęstości elektronowej; orbitale HF i orbitale zlokalizowane; metody lokalizacji orbitali; indeksy rzędów wiązań. Analiza wibracyjna; drgania normalne. Korelacja elektronowa; metoda mieszania konfiguracji (I); perturbacyjna metoda MP. Teoria funkcjonałów gęstości i metoda Kohna- Shama. Praktyczne aspekty obliczeń DFT; wybór funkcjonału korelacyjno-wymiennego. Modelowanie dużych układów molekularnych, metody hybrydowe (QMMM). Modelowanie rozpuszczalnika, metody continuum. Reaktywność chemiczna; jedno- i dwu-reagentowe indeksy reaktywności; podział energii oddziaływania. Modelowanie reakcji elementarnych skomplikowanych procesów chemicznych. Wielkości termodynamiczne; energia swobodna reakcji chemicznych; dynamika molekularna.
6 Modelowanie molekularne metodami ch.. kwantowej Praktyczne zapoznanie z metodami obliczeniowymi chemii kwantowej i ich zastosowaniami w chemii Podstawowe idee i metody chemii kwantowej: Funkcja falowa, gęstość elektronowa; równanie Schrodingera; Teoria Funkcjonałów Gęstości (DFT); przyblienie Borna-Oppenheimera, zasada wariacyjna w mechanice kwantowej i w DFT, przyblienie jednoelektronowe; metoda HF; korelacja elektronowa; metody korelacyjne oparte na funkcji falowej; metoda Kohna-Shama Dane do obliczeń kwantowo-chemicznych; oprogramowanie; program GAMESS: Geometria czasteczki; macierz Z; bazy funkcyjne w obliczeniach ab initio ; input/output programu GAMESS Struktura geometryczna układów molekularnych: Optymalizacja geometrii; optymalizacja z wiazami; analiza konformacyjna; problem minimum globalnego Struktura elektronowa układów molekularnych: Orbitale molekularne, orbitale KS; wiazanie chemiczne; gęstość rónicowa; orbitale zlokalizowane; analiza populacyjna; analiza rzędów wiązań Analiza wibracyjna; Wielkości termodynamiczne; Reaktywność chemiczna: Analiza wibracyjna; wielkosci termodynamiczne; modelowanie reakcji chemicznych; optymalizacja geometrii stanu przejściowego, IR; indeksy reaktywności chemicznej, molekularny potencjał elektrostatyczny, funkcja Fukui ego i teoria orbitali granicznych; jedno- i dwu-reagentowe indeksy reaktywności Inne zagadnienia: Metody hybrydowe QM/MM; modelowanie wielkich układów; efety rozpuszczalnika; modelowanie w katalizie homo- i heterogenicznej; oddziaływania międzycząsteczkowe, i. in.
7 Modelowanie molekularne Literatura: metodami chemii kwantowej Andrew R. Leach Molecular modelling. Principles and Applications. Prentice Hall, 2001
8 Modelowanie molekularne Literatura: metodami chemii kwantowej Frank Jensen, Introduction to omputational hemistry, Wiley, 1999; second edition 2006 W. Koch, M.. Holthausen, A hemist's Guide to Density Functional Theory, Wiley, David. Young omputational hemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real-World Problems, Wiley 2001 Encyclopedia of omputational hemistry. Wiley, (wybrane artykuły) wybrane artykuły z czasopism chemicznych hemia kwantowa (teoria): R.F. Nalewajski Podstawy i metody chemii kwantowej. PWN L.Piela, Idee chemi kwantowej. PWN 2001 A. Szabo, N.L. Ostlund, Modern Quantum hemistry: Introduction to Advanced Electronic Structure Theory, Dover, 1989
9 hemia kwantowa hemia Fizyka Biologia
10 Quantum hemistry = Quantum Mechanics + hemistry Who are quantum mechanics? Mechanics that repair quantum.
11 Atomy, cząsteczki, wiązania chemiczne N N Pd
12 Atomy, cząsteczki, wiązania chemiczne
13 Model Bohra Atom wodoru jądro elektron M=1/1840 u. M = 1 u. 0,529*10-10 m = 0,529 Å
14 Atom wodoru elektron jądro ok. 10 km ok ton ok ton średnia prędkość elektronu w stanie podstawowym atomu wodoru: ok km/s
15 Funkcja falowa Funkcja falowa (reprezentacja położeń lub pędów): Interpretacja probabilistyczna: N-cząstek, 4N współrzędnych
16 Funkcja falowa Wartość spodziewana wielkości fizycznej A: A =... Ψ * Aˆ ΨdQ Ψ Aˆ Ψ E =... Ψ * Hˆ ΨdQ Ψ Hˆ Ψ
17 Teoria Funkcjonałów Gęstości (DFT: Density Functional Theory) Hohenberg; Kohn 1964 Kohn; Sham Walter Kohn nagroda Nobla Podstawowa wielkość: gęstość elektronowa, ρ(r)
18 Teoria Funkcjonałów Gęstości (DFT: Density Functional Theory) Podstawowa wielkość: gęstość elektronowa, ρ(r) I twierdzenie Hohenberga-Kohna ρ określa jednoznacznie Hamiltonian, a zatem wszystkie wielkości fizyczne układu E = E[ρ] (dokładna postać funkcjonału - nieznana)
19 Równanie Schrödingera Równanie Schrödingera zależne od czasu: Stany stacjonarne N-elektronowa gęstość prawdopodobieństwa nie zależy od czasu: Funkcja falowa iloczyn funkcji zależnej od położenia i czasu: Funkcja falowa zawsze zależy od czasu!!! Równanie Schrödingera niezależne od czasu:
20 Równanie Schrödingera ĤΨ = EΨ Ψ funkcja falowa E - energia Ĥ - operator energii (Hamiltonian)
21 Równanie Schrödingera Rozwiązania analityczne proste układy: cząstka swobodna; układ cząstek nieoddziałujących; cząstka w pudle potencjału; oscylator harmoniczny; oscylator Morse a; rotator sztywny; atom wodoru; harmonium (atom dwuelektronowy z elektronami oddziałującymi z jądrem potencjałem harmonicznym) Atomy wieloelektronowe i cząsteczki chemiczne - rozwiązania metodami przybliżonymi
22 Równanie Schrödingera Separowalne problemy wielowymiarowe Jeżeli: To:
23 Równanie Równanie Schrödingera Schrödingera Separowalne problemy wielowymiarowe Np. jedno- i dwuwymiarowe pudło potencjału b V= V=0 a 1 nπx cos ψn = 2a 2a ψ n,n x y n yπy 1 nxπx 1 cos cos = 2a 2a 2b 2a
24 Rotator sztywny: Ruch środka masy: Równanie Schrödingera Hamiltonian ruchu względnego:
25 Równanie Schrödingera Zagadnienia własne: Harmoniki sferyczne:
26 Harmoniki sferyczne: s ( l = 0 )
27 Harmoniki sferyczne : p ( l = 1 )
28 Harmoniki sferyczne : d ( l = 2 )
29 Harmoniki sferyczne : f ( l = 3 )
30 Jednostki atomowe l=1a.u. q=-1a.u. m=1a.u. q=1a.u. Atom wodoru wg. Bohra
31 Atom wodoru Atom wodoru r Hamiltonian ruchu względnego: Zagadnienie własne Hamiltonianu: ),, ( ),, ( sin 1 sin sin ϕ θ ϕ θ ϕ θ θ θ θ θ r E r r kze r r r r r r m Ψ = Ψ + + h
32 Hamiltonian ruchu względnego: Atom wodoru r Zagadnienie własne Hamiltonianu: Funkcje własne Hamiltonianu: Ortonormalność:
33 Atom wodoru Atom wodoru r Jednoczesne zagadnienia własne: ),, ( ),, ( ˆ ϕ ϑ ψ ϕ ϑ ψ r E r h nlm n nlm = ),, ( 1) ( ),, ( ˆ 2 2 ϕ ϑ ψ ϕ ϑ ψ r l l r L nlm nlm h + = ),, ( ),, ( ˆ ϕ ϑ ψ ϕ ϑ ψ r m r L nlm nlm z h = ),, ( 1) ( ),, ( ˆ 2 2 ϕ ϑ ψ ϕ ϑ ψ r s s r S nlm nlm h + = ),, ( ),, ( ˆ ϕ ϑ ψ ϕ ϑ ψ r m r S nlm s nlm z h = n = 1,2,... l = 0,1,...,n-1 m = -l,..0,...,l s = ½ m s = -½, +½
34 Funkcje własne Hamiltonianu: Atom wodoru r R 10 1s R 20 2s r R 21 2p R 30 3s r R 31 3p r R 32 3d r r
35 Orbitale s r 1s r 2s 3s r
36 Orbitale 2p Orbitale 3p
37 Orbitale 3d Orbitale 4d
38 Atom wodoru 1s r F.falowa stanu podstawowego 1s: wartość maksymalna w pozycji jądra Sprzeczność????? R=a 0 =1a.u. Model atomu wodoru Bohra: elektron krąży po orbicie o promieniu a 0 (1 a.u.) q=1a.u. Atom wodoru wg. Bohra
39 Atom wodoru Prawdopodobieństwo napotkania elektronu w odległości r od jądra [w infinitezymalnej warstwie sferycznej wyznaczonej przez dwie kule o promieniach r i (r + dr) ] : Radialna gęstość prawdopodobieństwa: r 2 R 2 nl (r), a nie R 2 nl (r)!!!
40 Atom wodoru Przykład: stan podstawowy atomu wodoru Maksimum radialnej gęstości prawdopodobieństwa: dla Z = 1 r maks maks = a 0
41 Atom wodoru Radialna gęstość prawdopodobieństwa:
42 Równanie Schrödingera Równanie Schrödingera Ψ = ĤΨ E Dla atomu wodoru: ),, ( ),, ( sin 1 sin sin ϕ θ ϕ θ ϕ θ θ θ θ θ r E r r kze r r r r r r m Ψ = Ψ + + h znamy dokładne rozwiązania równania Schrödingera Dla innych atomów oraz dla cząsteczek - jedynie rozwiązania przybliżone
43 Rozwiązania przybliżone dla atomów i cząsteczek 1 ( ij kl) dr * * = χi ( r1 ) χ j ( r2 ) χ k ( r1 ) χl ( r2 ) dr1 2 r12 F = Liczne metody przybliżone chemii kwantowej Oparte na funkcji m falowej m N lub gęstości elektronowej = χ hˆ + * 1 α χ βq 2α iβi γ δ i 2 αβ h αβ + m m γ δ P αβ 1 2 ( γδ αβ ) ( γβ δα ) ( γδ αβ ) ( γβ δα ) = ( i j k l ) = A B D ( i A j A k l )δ AB δ D
44 lata 1960 Wybitny polski chemik kwantowy prof. Włodzimierz Kołos pokazał dla cząsteczki H 2, że dokładność przybliżonych obliczeń kwantowochemicznych może być lepsza od doświadczalnej Prof. Włodzimierz Kołos ( )
45 ząsteczka H 2 kontrowersja Kołosa i Wolniewicza
46 ząsteczka H 2 energia jonizacji
47 Dokładność Dokładnośćprzybliżonych przybliżonychmetod metodkwantowo-chemicznych kwantowo-chemicznych Przykład: Odległości - w prostych węglowodorach Etan: H3-H3 Etylen: H2=H2 Acetylen: H H Różnica 0,2 Å czyli ok. 13% Obliczone: 1,536 Å Ekperyment: 1,540 Å Różnica: 0,004 Å czyli 0,3% Metoda DFT/BP86/DZP 1,332 Å 1,338 Å Różnica: 0,006 Å czyli 0,4% 1,209 Å 1,203 Å Różnica: 0,006 Å czyli 0,5%
48 Struktura elektronowa i i własności molekularne Akrylonitryl - HOMO Akrylonitryl - LUMO Akrylan metylu - MEP Akrylan metylu - FF
49 ząsteczka benzenu kontur gęstości elektronowej Gęstość elektronowa: ρ(x,y,z) Benzen: 6 H 6
50 ząsteczka benzenu - różnicowa gęstość elektronowa N at ρ (r ) = ρ mol. (r ) ρ iat. (r ) i =1
51 Etylen orbitale zlokalizowane
52 R. cykloaddycji: Etylen + butadien TS izolowane reagenty Produkt ostateczny Produkt s
53 Mechanizm polimeryzacji etylenu N N Pd
54 Projektowanie leków Metody in vivo Metody in vitro Metody in sillico
55 Laboratorium chemika teoretyka Klaster obliczeniowy cobalt, Uniwersytet w algary, Kanada, 1998
56 Metody przyblizone chemii kwantowej praktyczne narzędzie stosowane w wielu dziedzinach chemii 1 ( ij kl) dr * * = χi ( r1 ) χ j ( r2 ) χ k ( r1 ) χl ( r2 ) dr1 2 r12 F = αβ h = αβ + χ α m m γ m m N ˆ + * χ βq 2α i γ δ i h δ P αβ 1 2 βi ( γδ αβ ) ( γβ δα ) ( γδ αβ ) ( γβ δα ) 1 2 = ( i j k l ) = ( i A B D A j A k l )δ AB δ D
57 N Metody przybliżone oparte na na funkcji falowej lub gęstości elektronowej N O ĤΨ = EΨ O O O O O O Ψ =?????? O O O O N N O O O O O O N N N
58 Przybliżenie Borna-Oppenheimera
59 Przybliżenie Borna-Oppenheimera N elektronów, m jąder: Funkcja iloczynowa: warunki ortonormalności:
60 Przybliżenie Borna-Oppenheimera Molekularny Hamiltonian:
61 Przybliżenie Borna-Oppenheimera Molekularny Hamiltonian:
62 Przybliżenie Borna-Oppenheimera Molekularny Hamiltonian: Hamiltonian elektronowy: Nie zawiera energii kinetycznej jąder
63 Przybliżenie Borna-Oppenheimera Równanie Schrodingera z funkcją iloczynową: Operator en. kin. jąder działa na f. iloczynową: Przybliżenie adiabatyczne
64 Przybliżenie Borna-Oppenheimera Równanie Schrodingera z funkcją iloczynową: Operator en. kin. jąder działa na f. iloczynową: Przybliżenie Borna-Oppenheimera
65 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera Równanie dynamiki jąder (wycałkowanie po wsp. elektronowych): Przybliżenie Borna-Oppenheimera Elektronowa powierzchnia energii potencjalnej (PES):
66 Przybliżenie Borna-Oppenheimera Powierzchnia energii potencjalnej: E k e R XY
67 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera Elektronowa powierzchnia energii potencjalnej (PES): E k e R XY Dwuetapowe rozwiązanie równania Schrodingera dla molekuły: 1) Rozwiązanie równania elektronowego dla wielu geometrii cząsteczki wyznaczenie potencjału efektywnego dla ruchu jąder 2) Rozwiązanie równania dynamiki jąder poruszajacych się na PES (w efektywnym potencjale od elektronów)
68 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera PES - pozwala zdefiniować geometrię cząsteczki N N Pd
69 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera PES - pozwala zdefiniować geometrię cząsteczki
70 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera TS PES - pozwala zdefiniować geometrię cząsteczki Punkty charakterystyczne na PES: -minima odpowiadają geometriom równowagowym (substraty, produkty reakcji chemicznych); - punkty siodłowe stany przejściowe (TS) reakcji chemicznych TS
71 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera TS TS Punkty charakterystyczne na PES: -minima odpowiadają geometriom równowagowym (substraty, produkty reakcji chemicznych); - punkty siodłowe stany przejściowe (TS) reakcji chemicznych Ścieżki reakcji chemicznej krzywe na PES łączące substraty i produkty reakcji poprzez odpowiedni TS
72 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera TS TS Punkty charakterystyczne na PES: -minima odpowiadają geometriom równowagowym (substraty, produkty reakcji chemicznych); - punkty siodłowe stany przejściowe (TS) reakcji chemicznych Ścieżki reakcji chemicznej krzywe na PES łączące substraty i produkty reakcji poprzez odpowiedni TS
73 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera TS E TS TS E akt produkt substrat s Profil energetyczny reakcji
74 Przybliżenie adiabatyczne i Borna-Oppenheimera TS TS Podstawowe wiadomości: 1) elektronowa funkcja falowa jest wyznaczana dla każdej konfiguracji jąder; 2) Struktura reagentów (substratów i produktów) jest wyznaczana w procesie optymalizacji geometrii (poszukiwanie minimów na PES) 3) Struktura stanu przejsciowego jest wyznaczana w procesie optymalizacji TS (poszukiwanie punktów siodłowych na PES)
75 N Metody przybliżone oparte na na funkcji falowej lub gęstości elektronowej N O ĤΨ = EΨ O O O O O O Ψ =?????? el O O O O N N O O O O O O N N N
76 Metoda wariacyjna Dowolna funkcja próbna (przybliżona f.f. stanu podstawowego): Energia stanu próbnego: ZASADA WARIAYJNA:
77 Zasada wariacyjna w DFT II twierdzenie Hohenberga-Kohna Energia dla dowolnej gęstości próbnej (przybliżenie dla gęstości stanu podstawowego) ρ dla założonych N oraz v : E [ ρ( N)] E [ ρ ( N)] E 0[ N, v] v v o = Energia stanu podstawowego
78 Metoda wariacyjna ZASADA WARIAYJNA: E np. E [ φ 1 ] E [ φ 2 ] E [ φ 3 ] E [ φ 4 ] E 0 Funkcja φ 4 stanowi najlepsze przybliżenie dla f.f. stanu podstawowego
79 Metoda wariacyjna ZASADA WARIAYJNA: E np. E [ φ 1 ] E [ φ 2 ] E [ φ 3 ] E [ φ 4 ] E 0 Funkcja φ 4 stanowi najlepsze przybliżenie dla f.f. stanu podstawowego Metoda prób i błędów - obliczenie funkcjonału energii dla różnych funkcji próbnych
80 Metoda wariacyjna Klasa funkcji próbnych z parametrami wariacyjnymi: Funkcjonał energii funkcja parametrów wariacyjnych: Szukamy optymalnych wartości parametrów wariacyjnych: minimalizujących energię: z układu równań:
81 Metoda wariacyjna
82 Metoda wariacyjna Przykład: atom wodoropodobny: Szukamy funkcji próbnej w postaci: ψ ( r, θ, ϕ) gdzie λ parametr wariacyjny: daje optymalną wartość: = Ne E [ λ ] = ½ λ λ Z de [ λ ] / d λ = λ Z = 0 λ = Z λr i optymalną postać f. falowej: Zr ψ θ E opt = Z 2 ( r,, ϕ) = Ne Rozwiązanie dokładne!
83 Metoda wariacyjna Przykład: atom wodoropodobny: Szukamy funkcji próbnej w postaci: ψ ( r, θ, ϕ) = Ne λr 2 daje optymalną wartość: λ = 8 Z 2 / (9π) E opt = Z 2 Energia wyższa od dokładnej!
84 Metoda wariacyjna Przykład: atom helu: Szukamy funkcji próbnej w postaci: Funkcja : spełnia zagadnienie własne atomu wodoropodobnego: z efektywnym ładunkiem jądra ζ Optymalna wartość ζ opt = 27/16 < Z E opt = a.u. E dokł dokł = a.u. E pert pert = a.u.
85 Metoda Ritza Wariacyjna metoda kombinacji liniowej Zadana baza: Poszukiwane współczynniki wariacyjne:
86 Metoda Ritza Warunek minimum: Układ równań sekularnych:
87 Układ równań sekularnych: Metoda Ritza Warunek unormowania: Wyznacznik sekularny: Równanie s-tego stopnia na E
88 Zapis macierzowy: Metoda Ritza
89 Metoda Ritza Kombinacja dwóch funkcji bazy: ałki nakładania: Elementy macierzy operatora energii: Równania sekularne: Wyznacznik sekularny: Równanie kwadratowe:
90 Metoda Ritza Przypadek równych poziomów: Zwykle: Wyznacznik sekularny równanie kwadratowe: Rozwiązania: E efekt antywiążący E 2 α efekt wiążący E 1
91 Metoda Ritza Przypadek równych poziomów: Rozwiązania: E ząsteczka H 2 kombinacja liniowa orbitali 1s atomów α E 2 E 1
92 Metoda Ritza Przypadek równych poziomów: Rozwiązania: E ząsteczka H 2 kombinacja liniowa orbitali 1s atomów α E 2 E 1
93 Metoda Ritza Przypadek równych poziomów: Rozwiązania: E ząsteczka He 2 kombinacja liniowa orbitali 1s atomów α E 2 E 1
94 Metoda Ritza Przypadek nierównych poziomów: Z równania sekularnego: Modul efektu wiążącego ograniczony nierównością:
95 Metoda Ritza Przypadek nierównych poziomów: Z równania sekularnego: Modul efektu wiążącego ograniczony nierównością: efekt energetyczny tym większy, im bliższe poziomy α, α 1 2 (maksymalny efekt dla α = α 1 2 ) efekt energetyczny znika dla β = S = 0 (brak nakładania)
96 Metoda Ritza Przypadek nierównych poziomów:
97 Przybliżenie orbitalne (jednoelektronowe) Ruch każdego elektronu opisany funkcją zależna od współrzędnych tylko tego elektronu (funkcją jednoelektronową, jednoelektronowym orbitalem molekularnym) ząsteczka H 2 O orbitale molekularne
98 Przybliżenie orbitalne (jednoelektronowe) Spinorbital: część przestrzenna (orbital) część spinowa
99 Przybliżenie orbitalne (jednoelektronowe) Spinorbital: Przybliżenie orbitalne z restrykcją spinową: część przestrzenna (orbital) część spinowa Przybliżenie orbitalne bez restrykcji spinowej:
100 Przybliżenie orbitalne Funkcja wyznacznikowa (wyznacznik Slatera) Układ N fermionów: antysymetryczna względem wymiany cząstek
101 Przybliżenie orbitalne Funkcja wyznacznikowa (wyznacznik Slatera) Układ N fermionów: Energia wartość spodziewana Hamiltonianu: E =... Ψ * Hˆ ΨdQ Ψ Hˆ Ψ
102 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa dla wyznacznika Slatera: h i,i całki jednoelektronowe (energia kinetyczna i przyciąganie przez jądra) J i,j - całki kulombowskie (odpychanie międzyelektronowe część klasyczna) K i,j - całki wymienne (oddziaływanie miedzyelektronowe część nieklasyczna)
103 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa dla wyznacznika Slatera: h i,i całki jednoelektronowe (energia kinetyczna i przyciąganie przez jądra):
104 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa dla wyznacznika Slatera: J i,j - całki kulombowskie (odpychanie międzyelektronowe część klasyczna): J = 1 ( dr dr ψ * * 12 1 r1 ) ψ 1( r1 ) ψ 2( r2 ) ψ 2( r2 ) r12 1 2
105 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa dla wyznacznika Slatera: J i,j - całki kulombowskie (odpychanie międzyelektronowe część klasyczna): J = 1 ( dr dr ψ * * 12 1 r1 ) ψ 1( r1 ) ψ 2( r2 ) ψ 2( r2 ) r12 K i,j - całki wymienne (odpychanie międzyelektronowe część nieklasyczna): K = ψ * * 12 1 r1 ) ψ 2( r1 ) ψ 2( r2 ) ψ 1( r2 ) r ( dr dr 2 1 2
106 Przybliżenie orbitalne Klasyczne odpychanie elektronowe: r 12 V ee = 1 / r 12
107 Przybliżenie orbitalne Klasyczne odpychanie elektronowe: ρ 1 (r) r 12 V ee = 1 / r 12 ρ 2 (r)
108 Przybliżenie orbitalne Klasyczne odpychanie elektronowe: ρ 1 (r) r 12 V ee = 1 / r 12 ρ 2 (r) E ee = 1 ρ ( dr1 dr 1 r1 ) ρ2( r2 ) r12 2
109 Przybliżenie orbitalne Klasyczne odpychanie elektronowe: ρ 1 (r) r 12 V ee = 1 / r 12 E ee = 1 ρ ( dr1 dr 1 r1 ) ρ2( r2 ) r12 2 ρ (r) 2 * ( r ) ( r) ) ρ = ψ i i ψ i ( r E ee = ψ 1 * * 1( r1 ) ψ1( r1 ) ψ 2( r2 ) ψ 2( r2 ) dr1 dr2 r12
110 Przybliżenie orbitalne Klasyczne odpychanie elektronowe: całka kulombowska ρ 1 (r) r 12 V ee = 1 / r 12 E ee = 1 ρ ( dr1 dr 1 r1 ) ρ2( r2 ) r12 2 ρ (r) 2 * ρ ( r ) = ψ ( r) ψ ( r) i i i 1 E ee ψ ψ ψ ψ = = * * 1( r1 ) 1( r1 ) 2( r2 ) 2( r2 ) dr1 dr2 J12 r12
111 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa dla wyznacznika Slatera: J i,j - całki kulombowskie (odpychanie międzyelektronowe część klasyczna): J = 1 ( ψ ψ ψ dr dr * * 12 1 r1 ) 1( r1 ) 2( r2 ) 2( r2 ) r12 ψ K i,j - całki wymienne (odpychanie międzyelektronowe część nieklasyczna): K = * * 12 1 r1 ) 2( r1 ) 2( r2 ) 1( r2 ) r12 ψ 1 1 ( ψ ψ ψ dr dr 2 1 2
112 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa w stanie zamkniętopowłokowym - suma przyczynków jedno- i dwuelektronowych: Znajac funkcję falową (orbitale) można policzyć energię jak wyżej. Jak znaleźć orbitale?
113 Przybliżenie orbitalne Energia elektronowa w stanie zamkniętopowłokowym - suma przyczynków jedno- i dwuelektronowych: Znajac funkcję falową (orbitale) można policzyć energię jak wyżej. Jak znaleźć orbitale? Z zasady wariacyjnej orbitale które minimalizują energię: Metoda Hartree-Focka
114 Równania HF: Metoda Hartree-Focka Operator Focka: Operatory kulombowski i wymienny:
115 Równania HF: Metoda Hartree-Focka Operator Focka: Operatory kulombowski i wymienny zależą od orbitali :
116 Równania HF: Metoda Hartree-Focka Operator Focka: Operatory kulombowski i wymienny zależą od orbitali : Rozwiązanie iteracyjne
117 Równania HF: Metoda Hartree-Focka Rozwiązanie iteracyjne (SF self-consistent-field method, metoda pola samouzgodnionego) orbitale operator Focka nowe orbitale nowy op. Focka, itd. dopóki orbitale (i energia) praktycznie się nie zmieniają
118 Metoda Hartree-Focka-Roothana Analityczna metoda HF Funkja falowa wyznacznik Slatera Orbtale jednoelektronowe kombinacja liniowa założonych funkcji bazy Ψ = 1 N! ϕ (1) ϕ ( N) 1 1 M M ϕ (1) ϕ ( N) 2 2 M M... M M... ϕ N N M (1) M ϕ ( N) funkcje bazy m ϕ ( 1) = χ (1) i c ji j= 1 j
119 Metoda Hartree-Focka Odtwarza do 99 % energii całkowitej Pozostały 1% jest często bardzo ważny w chemii! Przybliżenie jednoelektronowe zaniedbuje korelację elektronową
120 Metoda Hartree-Focka E Błędy metody SF E SF ε błąd bazy = E HFL E < SF 0 E HFL (granica Hartree-Focka HF limit nieskończona baza) E korel = E NREL E < HFL 0 energia korelacji E NREL ( dokładne podejście nierelatwistyczne) E rel = E e E < NREL 0 (poprawka relatywistyczna) E e (dokładna energia relatywistyczna) He: Si: E korel = > E rel = E korel = < E rel =
121 Metody korelacyjne Funkcja falowa jako kombinacja wielu wyznaczników Slatera: Mieszanie konfiguracji (I, configuration interaction); Metody wielokonfiguracyjne; Metody perturbacyjne (teoria zaburzeń); Metody sprzężonych klastrów; Teoria funkcjonałów gęstości (DFT) I, IS, ID, ISD, etc. MSF, ASSF,, SD, SDT, SDTQ, etc. MP, MP2, MP3, MP4, etc. DFT, LDA, VWN, BP, PW91,BLYP, PBE, B3LYP, B3PW91, etc. Nie są oparte na zasadzie wariacyjnej - energia może być niższa od dokładnej!
122 Teoria funkcjonałów gęstości (DFT) Metoda Kohna-Shama Wyznacznik KS zbudowany ze spinorbitali Jedno-wyznacznikowa funkcja falowa: Hipotetyczny układ nieoddziaływających elektronów o gęstości odpowiadające układowi rzeczywistemu elektronów odzdiaływajacych Gestość elektronowa:
123 Teoria funkcjonałów gęstości (DFT) Metoda Kohna-Shama Funkcjonał energii T s [ρ] - energia kinetyczna elektronów niezależnych V ne [ρ] - przyciąganie elektron-jądro J ee [ρ] - klasyczne odpychanie międzyelektronowe E xc [ρ] - funkcjonał korelacyjno wymienny (złony nieklasyczne) zawaira korelacyjną poprawkę do energii kinetycznej Nieznana dokładna postać E X - stosowane przybliżone funkcjonały X
124 Równania KS : Metoda Kohna-Shama Rozwiązania iteracyjne ponieważ Metoda LAO baza
125 Kohn-Sham method Przybliżenie lokalnych gęstości spinowych, (Local spin density approximation, LSDA)
126 Przyczynki korelacyno wymienne: Funkcjonały X
127 LDA/LSDA Funkcjonały X
128 Funkcjonały X Funkcjonały gradientowe (zawiarają człony zależne od gradientów gęstości) Perdew-Wang 1986 Becke 1988 Perdew-Wang 1991
129 Funkcjonały X Gradient functionals (contains terms dependent of density-gradients) Perdew-Wang 1986 Becke 1988 Perdew-Wang 1991 Lee-Yang-Parr (LYP) Perdew 1986
130 Funkcjonały X Funkcjonały gradientowe (zawiarają człony zależne od gradientów gęstości) PW86/88 PW91 BLYP PBE
131 Funkcjonały X Funkcjonały hybrydowe - zawiarają domieszkę dokładnej wymiany (HF) B3LYP B3PW91 Metoda HF dokładna wymiana, brak korelacji Metoda KS zawiara wymianę i korelacje, ale oba przyczynki przybliżone
132 Podsumowanie przybliżenie Borna-Oppenheimera dla cząsteczek powierzchnia energii potencjalnej (PES) przybliżenie jednoelektronowe, przybliżenie orbitalne metoda HF DFT metoda KS (przybliżone funkcjonały X) bazy funkcyjne (metoda LAO) w obu przypadkach - HF, DFT rozwiązania iteracyjne równań HF i KS
133 c.d.n.
Modelowanie molekularne
Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej Wydział Chemii UJ Wykład 4 http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/ Podstawowe idee i metody chemii
Bardziej szczegółowoModelowanie molekularne
Ck08 Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej Wydział Chemii UJ Wykład 10 http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/ Podstawowe idee i metody
Bardziej szczegółowoModelowanie molekularne
Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej Wydział Chemii UJ Wykład 4 http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/ Podstawowe idee i metody chemii
Bardziej szczegółowoUniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Wydział Matematyki, Fizyki i Chemii
Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Kierunek i poziom studiów: Chemia, pierwszy poziom Sylabus modułu: Chemia kwantowa 021 Nazwa wariantu modułu (opcjonalnie): 1. Informacje ogólne koordynator modułu
Bardziej szczegółowoUniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Wydział Matematyki, Fizyki i Chemii
Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Kierunek i poziom studiów: Chemia, drugi Sylabus modułu: Chemia teoretyczna (023) 1. Informacje ogólne koordynator modułu dr hab. Monika Musiał, prof. UŚ rok akademicki
Bardziej szczegółowoTEORIA FUNKCJONA LÓW. (Density Functional Theory - DFT) Monika Musia l
TEORIA FUNKCJONA LÓW GȨSTOŚCI (Density Functional Theory - DFT) Monika Musia l PRZEDMIOT BADAŃ Uk lad N elektronów + K j ader atomowych Przybliżenie Borna-Oppenheimera Zamiast funkcji falowej Ψ(r 1,σ 1,r
Bardziej szczegółowoModelowanie molekularne
Ck08 Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej Wydział Chemii UJ Wykład 2 http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/ Podstawowe idee i metody
Bardziej szczegółowoDotyczy to zarówno istniejących już związków, jak i związków, których jeszcze dotąd nie otrzymano.
Chemia teoretyczna to dział chemii zaliczany do chemii fizycznej, zajmujący się zagadnieniami związanymi z wiedzą chemiczną od strony teoretycznej, tj. bez wykonywania eksperymentów na stole laboratoryjnym.
Bardziej szczegółowoTeoria funkcjonału gęstości
Teoria funkcjonału gęstości Łukasz Rajchel Interdyscyplinarne Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytet Warszawski lrajchel1981@gmail.com Wykład dostępny w sieci: http://tiger.chem.uw.edu.pl/staff/lrajchel/
Bardziej szczegółowo13.1 Układy helopodobne (trójcząstkowe układy dwuelektronowe)
Janusz Adamowski METODY OBLICZENIOWE FIZYKI 1 Rozdział 13 UKŁADY KILKU CZĄSTEK W MECHANICE KWANTOWEJ 13.1 Układy helopodobne (trójcząstkowe układy dwuelektronowe) Zajmiemy się kwantowym opisem atomu He
Bardziej szczegółowoRozdział 22 METODA FUNKCJONAŁÓW GĘSTOŚCI Wstęp. Janusz Adamowski METODY OBLICZENIOWE FIZYKI 1
Janusz Adamowski METODY OBLICZENIOWE FIZYKI 1 Rozdział 22 METODA FUNKCJONAŁÓW GĘSTOŚCI 22.1 Wstęp Definiujemy dla gazu elektronowego operatory anihilacji ψ σ (r) i kreacji ψ σ(r) pola fermionowego ψ σ
Bardziej szczegółowoKARTA PRZEDMIOTU. Informacje ogólne WYDZIAŁ MATEMATYCZNO-PRZYRODNICZY. SZKOŁA NAUK ŚCISŁYCH UNIWERSYTET KARDYNAŁA STEFANA WYSZYŃSKIEGO W WARSZAWIE
1 2 4 5 6 7 8 8.0 Kod przedmiotu Nazwa przedmiotu Jednostka Punkty ECTS Język wykładowy polski Poziom przedmiotu podstawowy K_W01 2 wiedza Symbole efektów kształcenia K_U01 2 umiejętności K_K01 11 kompetencje
Bardziej szczegółowoTeoria funkcjona lu g Density Functional Theory (DFT)
Teoria funkcjona lu g estości Density Functional Theory (DFT) Cz eść slajdów tego wyk ladu pochodzi z wyk ladu wyg loszonego przez dra Lukasza Rajchela w Interdyscyplinarnym Centrum Modelowania Matematycznego
Bardziej szczegółowoc) prawdopodobieństwo znalezienia cząstki między x=1.0 a x=1.5 jest równe
TEST 1. Ortogonalne i znormalizowane funkcje f 1 i f są funkcjami własnymi operatora, przy czym: f 1 =1.05 f 1 i f =.41 f. Stan pewnej cząstki opisuje znormalizowana funkcja 1 3 falowa = f1 f. Jakie jest
Bardziej szczegółowoKierunek i poziom studiów: Chemia. Drugi. Sylabus modułu: Chemia kwantowa i modelowanie molekularne (0310-CH-S2-B-062)
Uniwersytet Śląski w Katowicach str. 1 Kierunek i poziom studiów: Chemia. Drugi. Sylabus modułu: Chemia kwantowa i modelowanie molekularne (0310-CH-S2-B-062) 1. Informacje ogólne koordynator modułu dr
Bardziej szczegółowoPodstawy chemii obliczeniowej
Podstawy chemii obliczeniowej Anna Kaczmarek Kędziera Katedra Chemii Materiałów, Adsorpcji i Katalizy Wydział Chemii UMK, Toruń Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki 2015 Plan wykładu 15 godzin
Bardziej szczegółowoChemia teoretyczna I Semestr V (1 )
1/ 6 Chemia Chemia teoretyczna I Semestr V (1 ) Osoba odpowiedzialna za przedmiot: dr hab. inż. Aleksander Herman. 2/ 6 Wykład Program Podstawy mechaniki kwantowej Ważne problemy modelowe Charakterystyka
Bardziej szczegółowoże w wyniku pomiaru zmiennej dynamicznej A, której odpowiada operator αˆ otrzymana zostanie wartość 2.41?
TEST. Ortogonalne i znormalizowane funkcje f i f są funkcjami własnymi operatora αˆ, przy czym: α ˆ f =. 05 f i α ˆ f =. 4f. Stan pewnej cząstki opisuje 3 znormalizowana funkcja falowa Ψ = f + f. Jakie
Bardziej szczegółowoRozdział 23 KWANTOWA DYNAMIKA MOLEKULARNA Wstęp. Janusz Adamowski METODY OBLICZENIOWE FIZYKI 1
Janusz Adamowski METODY OBLICZENIOWE FIZYKI 1 Rozdział 3 KWANTOWA DYNAMIKA MOLEKULARNA 3.1 Wstęp Metoda ta umożliwia opis układu złożonego z wielu jonów i elektronów w stanie podstawowym. Hamiltonian układu
Bardziej szczegółowoJEDNOSTKI ATOMOWE =1, m e =1, e=1, ; 1 E 2 h = 4, J. Energia atomu wodoru lub jonu wodoropodobnego w jednostkach atomowych:
do wyk ladu z 1.10.13 Atom wodoru i jon wodoropodobny Ze - ladunek jadra, e - ladunek elektronu, µ - masa zredukowana µ = mem j m e+m j ( µ m e ) M j - masa jadra, m e - masa elektronu, ε 0 - przenikalność
Bardziej szczegółowoElementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki Zagadnienia na egzamin
Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki Zagadnienia na egzamin 1. Zapisz konfigurację elektronową dla atomu helu (dwa elektrony) i wyjaśnij, dlaczego cząsteczka wodoru jest stabilna, a cząsteczka
Bardziej szczegółowoModelowanie molekularne
Ck08 Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej Wydział Chemii UJ Wykład 7 http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/ Podstawowe idee i metody
Bardziej szczegółowoAtomy wieloelektronowe
Wiązania atomowe Atomy wieloelektronowe, obsadzanie stanów elektronowych, układ poziomów energii. Przykładowe konfiguracje elektronów, gazy szlachetne, litowce, chlorowce, układ okresowy pierwiastków,
Bardziej szczegółowoZałącznik Nr 5 do Zarz. Nr 33/11/12
Załącznik Nr 5 do Zarz. Nr 33/11/12 Z1-PU7 WYDANIE N1 Strona 1 z 5 (pieczęć wydziału) KARTA PRZEDMIOTU 1. Nazwa przedmiotu: CHEMIA TEORETYCZNA 2. Kod przedmiotu: - 3. Karta przedmiotu ważna od roku akademickiego:
Bardziej szczegółowoModelowanie molekularne
Ck08 Modelowanie molekularne metodami chemii kwantowej Dr hab. Artur Michalak Zakład Chemii Teoretycznej Wydział Chemii UJ Wykład 13 http://www.chemia.uj.edu.pl/~michalak/mmod2007/ Podstawowe idee i metody
Bardziej szczegółowoWstęp do Optyki i Fizyki Materii Skondensowanej
Wstęp do Optyki i Fizyki Materii Skondensowanej Część I: Optyka, wykład 9 wykład: Piotr Fita pokazy: Andrzej Wysmołek ćwiczenia: Anna Grochola, Barbara Piętka Wydział Fizyki Uniwersytet Warszawski 2014/15
Bardziej szczegółowo1. Przesłanki doświadczalne mechaniki kwantowej.
1 Pytania egzaminacyjne: 1. Przesłanki doświadczalne mechaniki kwantowej. 2. Efekt fotoelektryczny- interpretacja Einsteina. 3. Efekt fotoelektryczny: jak skorelowana jest liczba wybijanych elektronów
Bardziej szczegółowoUkłady wieloelektronowe
Układy wieloelektronowe spin cząstki nierozróżnialność cząstek a symetria funkcji falowej fermiony i bozony przybliżenie jednoelektonowe wyznacznik Slatera konfiguracje elektronowe atomów ciało posiadające
Bardziej szczegółowoRóżne typy wiązań mają ta sama przyczynę: energia powstającej stabilnej cząsteczki jest mniejsza niż sumaryczna energia tworzących ją, oddalonych
Wiązania atomowe Atomy wieloelektronowe, obsadzanie stanów elektronowych, układ poziomów energii. Przykładowe konfiguracje elektronów, gazy szlachetne, litowce, chlorowce, układ okresowy pierwiastków,
Bardziej szczegółowoMetody obliczeniowe chemii teoretycznej
Metody obliczeniowe chemii teoretycznej mechanika kwantowa mechanika klasyczna ւ ց WFT DFT MM FFM metody bazuj ace na metody bazuj ace na Mechanika Molekularna funkcji falowej gȩstości elektronowej Wave
Bardziej szczegółowoGeometria cząsteczek wieloatomowych. Hybrydyzacja orbitali atomowych.
Geometria cząsteczek wieloatomowych. Hybrydyzacja orbitali atomowych. Geometria cząsteczek Geometria cząsteczek decyduje zarówno o ich właściwościach fizycznych jak i chemicznych, np. temperaturze wrzenia,
Bardziej szczegółowoTeorie wiązania chemicznego i podstawowe zasady mechaniki kwantowej Zjawiska, które zapowiadały nadejście nowej ery w fizyce i przybliżały
WYKŁAD 1 Teorie wiązania chemicznego i podstawowe zasady mechaniki kwantowej Zjawiska, które zapowiadały nadejście nowej ery w fizyce i przybliżały sformułowanie praw fizyki kwantowej: promieniowanie katodowe
Bardziej szczegółowoWykład 16: Atomy wieloelektronowe
Wykład 16: Atomy wieloelektronowe Funkcje falowe Kolejność zapełniania orbitali Energia elektronów Konfiguracja elektronowa Reguła Hunda i zakaz Pauliego Efektywna liczba atomowa Reguły Slatera Wydział
Bardziej szczegółowoNotatki do wyk ladu IV (z 27.10.2014)
Dla orbitalnego momentu p edu (L): Notatki do wyk ladu IV (z 7.10.014) ˆL ψ nlm = l(l + 1) ψ nlm (1) ˆL z ψ nlm = m ψ nlm () l + 1 możliwych wartości rzutu L z na wyróżniony kierunek w przestrzeni (l -liczba
Bardziej szczegółowoChemia kwantowa. Pytania egzaminacyjne. 2010/2011: 1. Przesłanki doświadczalne mechaniki kwantowej.
1 Chemia kwantowa. Pytania egzaminacyjne. 21/211: 1. Przesłanki doświadczalne mechaniki kwantowej. 2. Efekt fotoelektryczny - interpretacja Einsteina. 3. Efekt fotoelektryczny: jak skorelowana jest licza
Bardziej szczegółowoWykład 5: Cząsteczki dwuatomowe
Wykład 5: Cząsteczki dwuatomowe Wiązania jonowe i kowalencyjne Ograniczenia teorii Lewisa Orbitale cząsteczkowe Kombinacja liniowa orbitali atomowych Orbitale dwucentrowe Schematy nakładania orbitali Diagramy
Bardziej szczegółowoRzędy wiązań chemicznych
Seminarium Magisterskie Rzędy wiązań chemicznych w ujęciu Teorii Komunikacji Opracowanie Dariusz Szczepanik Promotor Dr hab. Janusz Mrozek Rzędy wiązań chemicznych w ujęciu Teorii Komunikacji Plan prezentacji
Bardziej szczegółowoElektronowa struktura atomu
Elektronowa struktura atomu Model atomu Bohra oparty na teorii klasycznych oddziaływań elektrostatycznych Elektrony mogą przebywać tylko w określonych stanach, zwanych stacjonarnymi, o określonej energii
Bardziej szczegółowoTeoria Orbitali Molekularnych. tworzenie wiązań chemicznych
Teoria Orbitali Molekularnych tworzenie wiązań chemicznych Zbliżanie się atomów aż do momentu nałożenia się ich orbitali H a +H b H a H b Wykres obrazujący zależność energii od odległości atomów długość
Bardziej szczegółowoStruktura elektronowa σ-kompleksu benzenu z centrum aktywnym Fe IV O cytochromu P450
Struktura elektronowa σ-kompleksu benzenu z centrum aktywnym Fe IV O cytochromu P450 Modelowanie metodami DFT, CASSCF i CASPT2 Andrzej Niedziela 1 1 Wydział Chemii Uniwersytet Jagielloński 14.01.2009 /Seminarium
Bardziej szczegółowoWykład Budowa atomu 3
Wykład 14. 12.2016 Budowa atomu 3 Model atomu według mechaniki kwantowej Równanie Schrödingera dla atomu wodoru i jego rozwiązania Liczby kwantowe n, l, m l : - Kwantowanie energii i liczba kwantowa n
Bardziej szczegółowoMetody obliczeniowe ab initio w fizyce struktur atomowych. Wykład 1: Wstęp
Metody obliczeniowe ab initio w fizyce struktur atomowych. Wykład 1: Wstęp dr inż. Paweł Scharoch, dr Jerzy Peisert Instytut Fizyki Politechniki Wrocławskiej, 03.02.2005r. Streszczenie: wyjaśnienie pojęcia
Bardziej szczegółowoPodstawy chemii obliczeniowej
Podstawy chemii obliczeniowej Anna Kaczmarek Kędziera Katedra Chemii Materiałów, Adsorpcji i Katalizy Wydział Chemii UMK, Toruń Elementy chemii obliczeniowej i bioinformatyki 2015 Plan wykładu 15 godzin
Bardziej szczegółowoMechanika kwantowa. Jak opisać atom wodoru? Jak opisać inne cząsteczki?
Mechanika kwantowa Jak opisać atom wodoru? Jak opisać inne cząsteczki? Mechanika kwantowa Elektron fala stojąca wokół jądra Mechanika kwantowa Równanie Schrödingera Ĥ E ψ H ˆψ = Eψ operator różniczkowy
Bardziej szczegółowoMetody obliczeniowe chemii kwantowej oparte na funkcji falowej. Dla uk ladu N elektronów i K j ader atomowych hamiltonian przyjmuje postać:
Metody obliczeniowe chemii kwantowej oparte na funkcji falowej Równanie Schrödingera: ĤΨ = EΨ Dla uk ladu N elektronów i K j ader atomowych hamiltonian przyjmuje postać: Ĥ = h 2 K α=1 1 2M α 2 α h2 2m
Bardziej szczegółowoModelowanie, wybór i budowa modelu procesu. Modelowanie matematyczne. Maszyny matematyczne. Modelowanie fizyczne. Energia w reakcjach.
Modelowanie, wybór i budowa modelu procesu. Modelowanie służy do poznania danego procesu, po przez zastąpienie go uproszczonym układem, który odzwierciedla jedynie wybrane cechy procesu. Analizę informacji
Bardziej szczegółowoWykład 3: Atomy wieloelektronowe
Wykład 3: Atomy wieloelektronowe Funkcje falowe Kolejność zapełniania orbitali Energia elektronów Konfiguracja elektronowa Reguła Hunda i zakaz Pauliego Efektywna liczba atomowa Reguły Slatera Wydział
Bardziej szczegółowoBudowa atomów. Atomy wieloelektronowe Układ okresowy pierwiastków
Budowa atomów Atomy wieloelektronowe Układ okresowy pierwiastków Model atomu Bohra atom zjonizowany (ciągłe wartości energii) stany wzbudzone jądro Energia (ev) elektron orbita stan podstawowy Poziomy
Bardziej szczegółowoWstęp do Optyki i Fizyki Materii Skondensowanej
Wstęp do Optyki i Fizyki Materii Skondensowanej Część I: Optyka, wykład 10 wykład: Piotr Fita pokazy: Andrzej Wysmołek ćwiczenia: Paweł Kowalczyk, Barbara Piętka Wydział Fizyki Uniwersytet Warszawski 2015/16
Bardziej szczegółowoRozwój i zastosowanie wieloreferencyjnych metod sprzężonych klasterów w opisie stanów podstawowych i wzbudzonych układów atomowych i molekularnych
Rozwój i zastosowanie wieloreferencyjnych metod sprzężonych klasterów w opisie stanów podstawowych i wzbudzonych układów atomowych i molekularnych Justyna Cembrzyńska Zakład Mechaniki Kwantowej Uniwersytet
Bardziej szczegółowoStruktura elektronowa czasteczek. przybliżenie Borna-Oppenheimera. równania Schrödingera dla elektronów przy ustalonym po lożeniu jader
Notatki do wyk ladu VII Struktura elektronowa czasteczek przybliżenie Borna-Oppenheimera rozwiazanie równania Schrödingera dla elektronów przy ustalonym po lożeniu jader przybliżenie jednoelektronowe metoda
Bardziej szczegółowoOrbitale typu σ i typu π
Orbitale typu σ i typu π Dwa odpowiadające sobie orbitale sąsiednich atomów tworzą kombinacje: wiążącą i antywiążącą. W rezultacie mogą powstać orbitale o rozkładzie przestrzennym dwojakiego typu: σ -
Bardziej szczegółowoTeoria funkcjona lu g
Notatki do wyk ladu XI Teoria funkcjona lu g estości Density Functional Theory - DFT Czy znajomość funkcji falowej jest niezb edna? Ψ(1,, 3,..., N) dla uk ladu N-elektronowego zależy od 4N zmiennych (dla
Bardziej szczegółowoWykład 9 Podstawy teorii kwantów fale materii, dualizm falowo-korpuskularny, funkcja falowa, równanie Schrödingera, stacjonarne równanie
Wykład 9 Podstawy teorii kwantów fale materii, dualizm falowo-korpuskularny, funkcja falowa, równanie Schrödingera, stacjonarne równanie Schrödingera, zasada nieoznaczoności Heisenberga, ruch cząstki swobodnej,
Bardziej szczegółowoCząsteczki. 1.Dlaczego atomy łącz. 2.Jak atomy łącz. 3.Co to jest wiązanie chemiczne? Jakie sąs. typy wiąza
Cząsteczki 1.Dlaczego atomy łącz czą się w cząsteczki?.jak atomy łącz czą się w cząsteczki? 3.Co to jest wiązanie chemiczne? Co to jest rząd d wiązania? Jakie sąs typy wiąza zań? Dlaczego atomy łącz czą
Bardziej szczegółowoModel wiązania kowalencyjnego cząsteczka H 2
Model wiązania kowalencyjnego cząsteczka H 2 + Współrzędne elektronu i protonów Orbitale wiążący i antywiążący otrzymane jako kombinacje orbitali atomowych Orbital wiążący duża gęstość ładunku między jądrami
Bardziej szczegółowoWyznaczanie krzywych energii potencjalnej dla wybranych cząsteczek dwuatomowych
Wyznaczanie krzywych energii potencjalnej dla wybranych cząsteczek dwuatomowych Wstęp Krzywa energii potencjalnej 1 to wykres zależności energii potencjalnej cząsteczek od długości wiązania (czyli od wzajemnej
Bardziej szczegółowoSpis treści. 1. Wstęp... 17. 2. Masa i rozmiary atomu... 21. 3. Izotopy... 45. Przedmowa do wydania szóstego... 13
5 Spis treści Przedmowa do wydania szóstego........................................ 13 Przedmowa do wydania czwartego....................................... 14 Przedmowa do wydania pierwszego.......................................
Bardziej szczegółowoMechanika kwantowa. Erwin Schrödinger ( ) Werner Heisenberg
Mechanika kwantowa Erwin Schrödinger (1887-1961) Werner Heisenberg 1901-1976 Falowe równanie ruchu (uproszczenie: przypadek jednowymiarowy) Dla fotonów Dla cząstek Równanie Schrödingera y x = 1 c y t y(
Bardziej szczegółowoTEORIA ORBITALI MOLEKULARNYCH (MO) dr Henryk Myszka - Uniwersytet Gdański - Wydział Chemii
TERIA RBITALI MLEKULARNYCH (M) Metoda (teoria) orbitali molekularnych (M) podstawy metody M - F. Hund, R.S. Mulliken Teoria M zakłada, że zachowanie się elektronu w cząsteczce opisuje orbital molekularny
Bardziej szczegółowoFizyka 2. Janusz Andrzejewski
Fizyka 2 wykład 14 Janusz Andrzejewski Atom wodoru Wczesne modele atomu -W czasach Newtona atom uważany była za małą twardą kulkę co dość dobrze sprawdzało się w rozważaniach dotyczących kinetycznej teorii
Bardziej szczegółowoUwzględnienie energii korelacji w metodach ab initio - przykłady
Uwzględnienie energii korelacji w metodach ab initio - przykłady Funkcje falowe (i funkcje bazy) jawnie skorelowane - zależa jawnie od odległości międzyelektronowych r ij = r i r j Funkcje falowe w postaci
Bardziej szczegółowoPodstawy chemii. dr hab. Wacław Makowski. Wykład 1: Wprowadzenie
Podstawy chemii dr hab. Wacław Makowski Wykład 1: Wprowadzenie Wspomnienia ze szkoły Elementarz (powtórka z gimnazjum) Układ okresowy Dalsze wtajemniczenia (liceum) Program zajęć Podręczniki Wydział Chemii
Bardziej szczegółowoSpis treści. Przedmowa redaktora do wydania czwartego 11
Mechanika kwantowa : teoria nierelatywistyczna / Lew D. Landau, Jewgienij M. Lifszyc ; z jęz. ros. tł. Ludwik Dobrzyński, Andrzej Pindor. - Wyd. 3. Warszawa, 2012 Spis treści Przedmowa redaktora do wydania
Bardziej szczegółowoInżynieria Biomedyczna. Wykład XII
Inżynieria Biomedyczna Wykład XII Plan Wiązania chemiczne Teoria Lewisa Teoria orbitali molekularnych Homojądrowe cząsteczki dwuatomowe Heterojądrowe cząsteczki dwuatomowe Elektroujemność Hybrydyzacja
Bardziej szczegółowoNumeryczne rozwiązanie równania Schrodingera
Numeryczne rozwiązanie równania Schrodingera Równanie ruchu dla cząstki o masie m (elektron- cząstka elementarna o masie ~9.1 10-31 kg) Mechanika klasyczna - mechanika kwantowa 1. Druga zasada dynamiki
Bardziej szczegółowoChemia Ogólna wykład 1
Chemia Ogólna wykład 1 Materia związki chemiczne cząsteczka http://scholaris.pl/ obojętne elektrycznie indywiduum chemiczne, złożone z więcej niż jednego atomu, które są ze sobą trwale połączone wiązaniami
Bardziej szczegółowoStara i nowa teoria kwantowa
Stara i nowa teoria kwantowa Braki teorii Bohra: - podane jedynie położenia linii, brak natężeń -nie tłumaczy ilości elektronów na poszczególnych orbitach - model działa gorzej dla atomów z więcej niż
Bardziej szczegółowoOPTYKA KWANTOWA Wykład dla 5. roku Fizyki
OPTYKA KWANTOWA Wykład dla 5. roku Fizyki c Adam Bechler 2006 Instytut Fizyki Uniwersytetu Szczecińskiego Rezonansowe oddziaływanie układu atomowego z promieniowaniem "! "!! # $%&'()*+,-./-(01+'2'34'*5%.25%&+)*-(6
Bardziej szczegółowoZasady obsadzania poziomów
Zasady obsadzania poziomów Model atomu Bohra Model kwantowy atomu Fala stojąca Liczby kwantowe -główna liczba kwantowa (n = 1,2,3...) kwantuje energię elektronu (numer orbity) -poboczna liczba kwantowa
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 4: Modelowanie reakcji chemicznych. Stan przejściowy.
Ćwiczenie 4: Modelowanie reakcji chemicznych. Stan przejściowy. Celem ćwiczenia jest wymodelowanie przebiegu reakcji chemicznej podstawienia nukleofilowego zachodzącego zgodnie z mechanizmem SN2. Wprowadzenie:
Bardziej szczegółowoKARTA PRZEDMIOTU. Informacje ogólne WYDZIAŁ MATEMATYCZNO-PRZYRODNICZY. SZKOŁA NAUK ŚCISŁYCH UNIWERSYTET KARDYNAŁA STEFANA WYSZYŃSKIEGO W WARSZAWIE
1 3 4 5 6 7 8 8.0 Kod przedmiotu Nazwa przedmiotu Jednostka Punkty ECTS Język wykładowy Poziom przedmiotu Symbole efektów kształcenia Symbole efektów dla obszaru kształcenia Symbole efektów kierunkowych
Bardziej szczegółowoINŻYNIERIA BIOMEDYCZNA. Wykład X
INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA Wykład X 2015-12-25 1 Mechanika kwantowa opiera się na dwóch prawach Dualizm korpuskularno-falowy (de Broglie a) λ h p Zasada nieoznaczoności Heisenberga p x h/(4 ) Gęstość prawdopodobieństwa
Bardziej szczegółowoFizyka 3.3 WYKŁAD II
Fizyka 3.3 WYKŁAD II Promieniowanie elektromagnetyczne Dualizm korpuskularno-falowy światła Fala elektromagnetyczna Strumień fotonów o energii E F : E F = hc λ c = 3 10 8 m/s h = 6. 63 10 34 J s Światło
Bardziej szczegółowoCHEMIA 1. INSTYTUT MEDICUS Kurs przygotowawczy na studia medyczne kierunek lekarski, stomatologia, farmacja, analityka medyczna ATOM.
INSTYTUT MEDICUS Kurs przygotowawczy na studia medyczne kierunek lekarski, stomatologia, farmacja, analityka medyczna tel. 0501 38 39 55 www.medicus.edu.pl CHEMIA 1 ATOM Budowa atomu - jądro, zawierające
Bardziej szczegółowoStruktura elektronowa i własności elektryczne powierzchni
Struktura elektronowa i własności elektryczne powierzchni Struktura elektronowa powierzchni metody teoretyczne Praca wyjścia Sposoby badania pasm elektronowych - technika UPS Cienkie warstwy Zastosowanie
Bardziej szczegółowoAtom wodoru i jony wodoropodobne
Atom wodoru i jony wodoropodobne dr inż. Ireneusz Owczarek CMF PŁ ireneusz.owczarek@p.lodz.pl http://cmf.p.lodz.pl/iowczarek 2012/13 Spis treści Spis treści 1. Model Bohra atomu wodoru 2 1.1. Porządek
Bardziej szczegółowoPodstawowe metody i przybliżenia: metoda wariacyjna, rachunek zaburzeń
Wyk lad 6 Podstawowe metody i przybliżenia: metoda wariacyjna, rachunek zaburzeń Uk lady modelowe czastka swobodna czastka na barierze potencja lu czastka w pudle oscylator harmoniczny oscylator Morse
Bardziej szczegółowoStany skupienia materii
Stany skupienia materii Ciała stałe - ustalony kształt i objętość - uporządkowanie dalekiego zasięgu - oddziaływania harmoniczne Ciecze -słabo ściśliwe - uporządkowanie bliskiego zasięgu -tworzą powierzchnię
Bardziej szczegółowoAtom wodoru w mechanice kwantowej. Równanie Schrödingera
Fizyka atomowa Atom wodoru w mechanice kwantowej Moment pędu Funkcje falowe atomu wodoru Spin Liczby kwantowe Poprawki do równania Schrödingera: struktura subtelna i nadsubtelna; przesunięcie Lamba Zakaz
Bardziej szczegółowoTermodynamika i właściwości fizyczne stopów - zastosowanie w przemyśle
Termodynamika i właściwości fizyczne stopów - zastosowanie w przemyśle Marcela Trybuła Władysław Gąsior Alain Pasturel Noel Jakse Plan: 1. Materiał badawczy 2. Eksperyment Metodologia 3. Teoria Metodologia
Bardziej szczegółowoGrupa Moniki Musiał. Uniwersytet Śląski Instytut Chemii Zakład Chemii Teoretycznej
Wieloreferencyjna metoda sprzężonych klasterów w dwuwalencyjnych sektorach przestrzeni Focka oraz metoda równań ruchu w zastosowaniu do opisu stanów wzbudzonych Grupa Moniki Musiał Uniwersytet Śląski Instytut
Bardziej szczegółowoPrzejścia optyczne w strukturach niskowymiarowych
Współczynnik absorpcji w układzie dwuwymiarowym można opisać wyrażeniem: E E gdzie i oraz f są energiami stanu początkowego i końcowego elektronu, zapełnienie tych stanów opisane jest funkcją rozkładu
Bardziej szczegółowoUkład okresowy. Przewidywania teorii kwantowej
Przewidywania teorii kwantowej Chemia kwantowa - podsumowanie Cząstka w pudle Atom wodoru Równanie Schroedingera H ˆ = ˆ T e Hˆ = Tˆ e + Vˆ e j Chemia kwantowa - podsumowanie rozwiązanie Cząstka w pudle
Bardziej szczegółowoobrotów. Funkcje falowe cząstki ze spinem - spinory. Wykład II.3 29 Pierwsza konwencja Condona-Shortley a
Wykład II.1 25 Obroty układu kwantowego Interpretacja aktywna i pasywna. Macierz obrotu w trzech wymiarach a operator obrotu w przestrzeni stanów. Reprezentacja obrotu w przestrzeni funkcji falowych. Transformacje
Bardziej szczegółowoMetoda Hartree-Focka (Hartree ego-focka)
Notatki do wyk ladu V Metoda Hartree-Focka (Hartree ego-focka) Metoda wariacyjna, w której przyjmuje sie, że przybliżona funkcja falowa, opisujaca stan uk ladu n-elektronowego ma postać wyznacznika Slatera,
Bardziej szczegółowoKrótki wstęp do mechaniki kwantowej
Piotr Kowalczewski III rok fizyki, e-mail: piotrkowalczewski@gmailcom Krótki wstęp do mechaniki kwantowej Spotkanie Sekcji Informatyki Kwantowej Mechanika kwantowa w cytatach If quantum mechanics hasn
Bardziej szczegółowoMechanika kwantowa. Jak opisać atom wodoru? Jak opisać inne cząsteczki?
Mechanika kwantowa Jak opisać atom wodoru? Jak opisać inne cząsteczki? Mechanika kwantowa Równanie Schrödingera Ĥ E ψ H ˆψ = Eψ operator różniczkow Hamiltona energia funkcja falowa h d d d + + m d d dz
Bardziej szczegółowoChemia ogólna - część I: Atomy i cząsteczki
dr ab. Wacław Makowski Cemia ogólna - część I: Atomy i cząsteczki 1. Kwantowanie. Atom wodoru 3. Atomy wieloelektronowe 4. Termy atomowe 5. Cząsteczki dwuatomowe 6. Hybrydyzacja 7. Orbitale zdelokalizowane
Bardziej szczegółowoWłaściwości chemiczne i fizyczne pierwiastków powtarzają się w pewnym cyklu (zebrane w grupy 2, 8, 8, 18, 18, 32 pierwiastków).
Właściwości chemiczne i fizyczne pierwiastków powtarzają się w pewnym cyklu (zebrane w grupy 2, 8, 8, 18, 18, 32 pierwiastków). 1925r. postulat Pauliego: Na jednej orbicie może znajdować się nie więcej
Bardziej szczegółowoWykład V Wiązanie kowalencyjne. Półprzewodniki
Wykład V Wiązanie kowalencyjne. Półprzewodniki Wiązanie kowalencyjne molekuła H 2 Tworzenie wiązania kowalencyjnego w molekule H 2 : elektron w jednym atomie przyciągany jest przez jądro drugiego. Wiązanie
Bardziej szczegółowoZad Sprawdzić, czy dana funkcja jest funkcją własną danego operatora. Jeśli tak, znaleźć wartość własną funkcji.
Zad. 1.1. Sprawdzić, czy dana funkcja jest funkcją własną danego operatora. Jeśli tak, znaleźć wartość własną funkcji. Zad. 1.1.a. Funkcja: ϕ = sin2x Zad. 1.1.b. Funkcja: ϕ = e x 2 2 Operator: f = d2 dx
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3. Spektroskopia elektronowa. Etylen. Trypletowe przejścia elektronowe *
Ćwiczenie 3 Spektroskopia elektronowa. Etylen. Trypletowe przejścia elektronowe * 1 Ćwiczenie 3 Spektroskopia elektronowa. Etylen. Trypletowe przejścia elektronowe * I. Narysuj etylen a) Wybierz Default
Bardziej szczegółowoWYKŁAD 3 CZĄSTECZKI WIELOATOMOWE ZWIĄZKI WĘGLA
WYKŁAD 3 ZĄSTEZKI WIELOATOMOWE ZWIĄZKI WĘGLA O : (s) O: (s) (s) (p z ) (p x ) (p y ) px py s 90 o? s 4 : (s) (s) (p x ) (p y ) (s) (s) (p x ) (p y ) (p z ) s pz px py s so : (s) s s.orbital MOLEKULARNY
Bardziej szczegółowoAtom wodoru. Model klasyczny: nieruchome jądro +p i poruszający się wokół niego elektron e w odległości r; energia potencjalna elektronu:
ATOM WODORU Atom wodoru Model klasyczny: nieruchome jądro +p i poruszający się wokół niego elektron e w odległości r; energia potencjalna elektronu: U = 4πε Opis kwantowy: wykorzystując zasadę odpowiedniości
Bardziej szczegółowoIX. MECHANIKA (FIZYKA) KWANTOWA
IX. MECHANIKA (FIZYKA) KWANTOWA IX.1. OPERACJE OBSERWACJI. a) klasycznie nie ważna kolejność, w jakiej wykonujemy pomiary. AB = BA A pomiar wielkości A B pomiar wielkości B b) kwantowo wartość obserwacji
Bardziej szczegółowoPOSTULATY MECHANIKI KWANTOWEJ cd i formalizm matematyczny
POSTULATY MECHANIKI KWANTOWEJ cd i formalizm matematyczny Funkcja Falowa Postulat 1 Dla każdego układu istnieje funkcja falowa (funkcja współrzędnych i czasu), która jest ciągła, całkowalna w kwadracie,
Bardziej szczegółowoSTEREOCHEMIA ORGANICZNA
STEREOEMIA ORGANINA Sławomir Jarosz Wykład 5 TOPOWOŚĆ Podział grup wg topowości 1. omotopowe (wymienialne operacją symetrii n ) 2. Enancjotopowe (wymienialne przez płaszczyznę σ) 3. Diastereotopowe (niewymienialne
Bardziej szczegółowoElementy mechaniki kwantowej S XX
kierunek studiów: FIZYKA specjalność: FIZYKA s I WYDZIAŁ FIZYKI UwB KOD USOS: 0900 FS1 Karta przedmiotu Przedmiot grupa ECTS Elementy mechaniki kwantowej S XX Formy zajęć wykład konwersatorium seminarium
Bardziej szczegółowo