Zak lad Metod Obliczeniowych Chemii UJ 15 marca 2005
1 2 Możliwości przyspieszenia obliczeń 3 GAMESS 2004 4
Zastosowania symetrii Zmniejszenie zapotrzebowania na zasoby (procesor, pami eć, dysk) Utrzymanie wynikajacych z symmetrii relacji podczas obliczeń Dodatkowe możliwości intepretacyjne
Ca lkowanie Plan Możliwości przyspieszenia obliczeń Możliwe sa dwa podejścia Petite List Obliczane sa tylko ca lki nierównoważne przez symetrie Reszta ca lek generowana z unikalnych Double Cosets Liczone sa tylko niezerowe ca lki Ponadto, w DFT, generacja ca lek na podstawie ca lkowania numerycznego tylko po fragmentach gridu
Specyfikacja geometrii 1 GAMESS 2004 Parametr $contrl/coord cart wspó lrz edne kartezjańskie wszystkich atomów zmt macierz Z, wszystkie atomy uniq wspó lrz edne kartezjańskie, ale tylko atomów nierównoważnych przez symetri e Inne, bardziej egzotyczne możliwości - patrz INPUT.DOC
Specyfikacja geometrii 2 GAMESS 2004 Grupa $data Specyfikacja grupy punktowej w drugiej linijce Dla każdej grupy punktowej z wyjatkiem C1 trzecia linijka pusta Wspó lrz edne musza być podane w standardowej orientacji Istnieje możliwość podania wspó lrz ednych w innej orientacji niż standardowa (wtedy w drugiej i ew. trzeciej linijce podajemy opis transformacji), ale nie należy z tej możliwości korzystać
Specyfikacja grupy symetrii GAMESS 2004 Pierwsza linijka grupy $data Zapis oparty na notacji Schoenfliesa Grupa C1: C1 Grupy C i D: symbol_grupy krotność_osi_g lównej (np D2h zapiszemy Dnh 2) Grupy S sa zapisywane jako S2n n/2 (np S6 zapiszemy S2n 3) Pozosta le grupy: notacja Schoenfliesa
Orientacja standardowa GAMESS 2004 1 Środek symetrii (jeżeli istnieje) w środku uk ladu wspó lrz ednych 2 G lówna oś symetrii (jeżeli istnieje) tożsama z osia z 3 Oś podwójna prostopad la do osi g lównej (jeżeli istnieje) tożsama z osia x 4 P laszczyzna σ v (jeżeli istnieje) tożsama z p laszczyzna xz 5 P laszczyzna σ h (jeżeli istnieje) tożsama z p laszczyzna xy
Czasteczka benzenu Prosze zmierzyć czas obliczeń dla czasteczki benzenu w bazie 6-31G, przy zadanej symetrii C1, Ci, Cs, C2, C3, C6, D3h i D6h. Obliczenia prosze prowadzić w optymalnej geometrii, używajac trybu direct i wy l aczaj ac inkrementalna konstrukcje macierzy Focka. Prosze sprawdzić zajmowana przestrzeń dyskowa w analogicznych obliczeniach prowadzonych w trybie dyskowym. Prosz e omówić zapotrzebowanie na zasoby w obu przypadkach
Symetria orbitali molekularnych Prosze krótko omówić symetrie orbitali w czasteczce BH dla prawid lowego i nieprawid lowego rozwiazania (patrz pierwsze zajecia). Obliczenia prosze przeprowadzić w symetrii C2v. Prosze krótko omówić symetrie orbitali HOMO i LUMO w czasteczce benzenu. Obliczenia prosze przeprowadzić w symetrii D6h.