WPŁYW WARUNKÓW HODOWLI NA POZIOM AKTYWNOŚCI ENDOPEPTYDAZY SYNTETYZOWANEJ PRZEZ GLEBOWE BAKTERIE Pseudomonas fluorescens



Podobne dokumenty
ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN

Roman Marecik, Paweł Cyplik

Ćwiczenie 4-5 Mikrobiologiczne kryteria oceny sanitarnej wody

KALKULACJA CENY OFERTY Część I - podłoża i dodatki do podłoży. Jednostka miary. op. = 500g 4. op. = 500g 4. op. = 500g 7

CHARAKTERYSTYKA WŁAŚCIWOŚCI PROTEOLITYCZNYCH DWÓCH WYBRANYCH SZCZEPÓW BAKTERII Z RZĘDU Myxococcales

HODOWLA PERIODYCZNA DROBNOUSTROJÓW

op. = 500g 2 ampłka 100 ampułka 15

SKUTKI SUSZY W GLEBIE

liczba godzin 2 MIKROBIOLOGIA KOSMETOLOGICZNA dla studentów II roku, studiów I st. kierunku KOSMETOLOGIA półpłynne stałe

VII. Pałeczki Gram-dodatnie: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus - ćwiczenia praktyczne

Załącznik A do siwz. OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA CZĘŚĆ I podłoża. Szczegółowy opis/zastosowanie

Oznaczanie aktywności proteolitycznej trypsyny Zajęcia 3-godzinne część A, zajęcia 4-godzinne część A i B

BIOTECHNOLOGIA OGÓLNA

ĆWICZENIE NR 3 BADANIE MIKROBIOLOGICZNEGO UTLENIENIA AMONIAKU DO AZOTYNÓW ZA POMOCĄ BAKTERII NITROSOMONAS sp.

Składniki podłoża hodowlanego

data ĆWICZENIE 7 DYSTRYBUCJA TKANKOWA AMIDOHYDROLAZ

WYMIENIALNOŚĆ SIDEROFORÓW PRZEZ BAKTERIE RODZAJU Pseudomonas

woda do 1000 ml ph=6,9-7,1. Po sterylizacji dodać nystatynę (końcowe stężenie ok. 50 μg/ml). Agar z wyciągiem glebowym i ekstraktem drożdżowym (YS)

VII. Fizjologia bakterii - ćwiczenia praktyczne

Trawienie i wchłanianie substancji odżywczych

E.coli Transformer Zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli

Oznaczanie aktywności proteolitycznej trypsyny metodą Ansona

1. Oznaczanie aktywności lipazy trzustkowej i jej zależności od stężenia enzymu oraz żółci jako modulatora reakcji enzymatycznej.

Stymulowanie wzrostu bakterii fermentacji mlekowej przez białka mleka. Waldemar Gustaw

Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna.

(12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) (13) B1

Kontrola pożywek mikrobiologicznych. Sekcja Badań Epidemiologicznych

Roztwory buforowe (bufory) (opracowanie: dr Katarzyna Makyła-Juzak)

BIOAKTYWNE METABOLITY RYZOSFEROWYCH BAKTERII Pseudomonas

Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl

Ćwiczenie 14. Technologie z udziałem bakterii kwasu mlekowego: wykorzystanie fermentacji mlekowej, masłowej i propionowej

Jednostka Ilość miary zastosowanie do Yersinia enterocolitica 1 op.= 5 fiolek (fiolka wystarcza na 1000 ml podłoża) op.

Odpowiedzi na zapytania

PROTEOLYTIC ACTIVITY OF Bacillus cereus STRAINS

STRESZCZENIE Mikroorganizmy zimnolubne zwane psychrofilami mogą być źródłem enzymów o unikalnych właściwościach hydrolaz (β-galaktozydazy,

WYKRYWANIE ZANIECZYSZCZEŃ WODY POWIERZA I GLEBY

III. Fizjologia bakterii i zasady diagnostyki bakteriologicznej

Hodowlą nazywamy masę drobnoustrojów wyrosłych na podłożu o dowolnej konsystencji.

zastosowanie do Yersinia enterocolitica 1 op.= 5 fiolek (fiolka wystarcza na 1000 ml podłoża) op. = 5 fiolek 5

BIOSYNTEZA ACYLAZY PENICYLINOWEJ. Ćwiczenia z Mikrobiologii Przemysłowej 2011

KALKULACJA CENY OFERTY Część I Podłoża i dodatki do podłoży. Jednostka miary. op.= 250g 1

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY WE WROCŁAWIU, Wrocław, PL BUP 21/10

WPŁYW METABOLITÓW PROPIONIBACTERIUM NA WZROST WYBRANYCH GRZYBÓW CHOROBOTWÓRCZYCH I WYTWARZANIE MIKOTOKSYN

WPŁYW SKŁADU POŻYWKI NA WYBRANE CECHY MUSZKI OWOCOWEJ Drosophila melanogaster

KINETYKA HYDROLIZY SACHAROZY

RAPORT Z BADAŃ 164/Z/ /D/JOGA. Dostarczony materiał: próbki tworzyw sztucznych. Ilość próbek: 1. Rodzaj próbek: tworzywo

Aminokwasy, peptydy i białka. Związki wielofunkcyjne

Zakład Biologii Sanitarnej i Ekotechniki ĆWICZENIE 2 BUDOWA I FUNKCJE ENZYMÓW. ZASTOSOWANIE BADAŃ ENZYMATYCZNYCH W INŻYNIERII ŚRODOWISKA.

data ĆWICZENIE 12 BIOCHEMIA MOCZU Doświadczenie 1

Stosowanie w skali laboratoryjnej

SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20005/11858/09

Cena jednostkowa brutto [zł] *** 1. Agar aloa Producent:..* Nr katalogowy:

Szczegółowy opis. Do dostawy wymagany certyfikat jakości lub inny dokument potwierdzający spełnienie wymagań w języku polskim lub angielskim.

XIX. Pałeczki Gram-ujemne część I - ćwiczenia praktyczne

właściwości i zalety

POLITECHNIKA GDAŃSKA WYDZIAŁ CHEMICZNY

X. Diagnostyka mikrobiologiczna bakterii chorobotwórczych z rodzaju: Corynebacterium, Mycobacterium, Borrelia, Treponema, Neisseria

Ćwiczenie 6 Aminokwasy

Licealista w świecie nauki

Doktorantka: Żaneta Lewandowska

Laboratorium 5. Wpływ temperatury na aktywność enzymów. Inaktywacja termiczna

SPIS TREŚCI OD AUTORÓW... 5

3. Badanie kinetyki enzymów

FUNGISTATYCZNE ODDZIAŁYWANIE SZCZEPU BACILLUS COAGULANS W PORÓWNANIU Z ODDZIAŁYWANIEM WYBRANYCH FUNGICYDÓW

E.coli Transformer Kit

Zadanie 1. [ 3 pkt.] Uzupełnij zdania, wpisując brakującą informację z odpowiednimi jednostkami.

LABORATORIUM Z KATALIZY HOMOGENICZNEJ I HETEROGENICZNEJ WYZNACZANIE STAŁEJ SZYBKOŚCI REAKCJI UTLENIANIA POLITECHNIKA ŚLĄSKA WYDZIAŁ CHEMICZNY

WYKRYWANIE OBECNOŚCI BAKTERII Z RODZAJU LISTERIA W ŻYWNOŚCI

Badanie termostabilności oraz wpływu aktywatorów i inhibitorów na działanie α-amylazy [EC ]

ph roztworu (prawie) się nie zmieniło. Zawiesina soi ma ph obojętne (lekko kwaśne). Zapach nie zmienił się.

WYMAGANIA EDUKACYJNE Z BIOLOGII KLASA 5 DOBRY. DZIAŁ 1. Biologia jako nauka ( 4godzin)

KREW: 1. Oznaczenie stężenia Hb. Metoda cyjanmethemoglobinowa: Zasada metody:

Urszula Jankiewicz*, Anna Wojtowicz*, Marian Korc** ZDOLNOŚĆ DO AKUMULACJI I TOLERANCJI METALI CIĘŻKICH PRZEZ BAKTERIE PSEUDOMONAS I BACILLUS

Substancje o Znaczeniu Biologicznym

ACIDOPHILUS. Streszczenie

BIOCHEMICZNE ZAPOTRZEBOWANIE TLENU

Dział PP klasa Doświadczenie Dział PP klasa obserwacja

ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW

ZAPYTANIE OFERTOWE ROCZNE nr 13/K z dnia r. NA ODCZYNNIKI CHEMICZNE I MATERIAŁY ZUŻYWALNE DLA FIRMY CELON PHARMA SA

Co ma wspólnego ludzka dwunastnica z proszkiem do. prania?

PL B1. Nowy szczep bakterii Bacillus subtilis i sposób otrzymywania α-amylazy przy użyciu nowego szczepu

Podstawy biogospodarki. Wykład 7

SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09

Scenariusz lekcji chemii w klasie III gimnazjum. Temat lekcji: Białka skład pierwiastkowy, budowa, właściwości i reakcje charakterystyczne

ĆWICZENIA Z BIOCHEMII

Bliskie spotkania z biologią METABOLIZM. dr hab. Joanna Moraczewska, prof. UKW. Instytut Biologii Eksperymetalnej, Zakład Biochemii i Biologii Komórki

Zadanie 2. (1 pkt) Uzupełnij tabelę, wpisując wzory sumaryczne tlenków w odpowiednie kolumny. CrO CO 2 Fe 2 O 3 BaO SO 3 NO Cu 2 O

Procesy biotransformacji

a) proces denaturacji białka następuje w probówce: b) proces zachodzący w probówce nr 1 nazywa się:

Oznaczanie żelaza i miedzi metodą miareczkowania spektrofotometrycznego

Oznaczanie mocznika w płynach ustrojowych metodą hydrolizy enzymatycznej

Co to jest FERMENTACJA?

Do jednego litra medium dodać 10,0 g skrobi ziemniaczanej lub kukurydzianej i mieszać do uzyskania zawiesiny. Sterylizować w autoklawie.

Ingredients Research Concepts Consultancy Production for the dairy industry. Milase Premium. Marta Misiuwianiec-Królikiewicz

OZNACZANIE ZAWARTOŚCI MANGANU W GLEBIE

Kuratorium Oświaty w Lublinie ZESTAW ZADAŃ KONKURSOWYCH Z CHEMII DLA UCZNIÓW GIMNAZJUM ROK SZKOLNY 2016/2017 ETAP TRZECI

AE/ZP-27-17/15 Załącznik Nr 1 Formularz Cenowy

KARTA KURSU. Kod Punktacja ECTS* 2

IV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne

prof. dr hab. Maciej Ugorski Efekty kształcenia 2 Posiada podstawowe wiadomości z zakresu enzymologii BC_1A_W04

Transkrypt:

ROCZNIKI GLEBOZNAWCZE TOM LVIII NR 3/4 WARSZAWA 2007: 84-94 URSZULA JANKIEWICZ WPŁYW WARUNKÓW HODOWLI NA POZIOM AKTYWNOŚCI ENDOPEPTYDAZY SYNTETYZOWANEJ PRZEZ GLEBOWE BAKTERIE Pseudomonas fluorescens EFFECT OF CULTURE CONDITIONS ON THE LEVEL OF ENDOPEPTIDASE ACTIVITY BY SOIL BACTERIA Pseudomonas fluorescens Katedra Biochemii, Wydział Rolnictwa i Biologii SGGW Summary'. This paper characterizes in biochemical sense a bacteria strain isolated from the soil, identified as Pseudomonas flu orescen s. It has been affirmed that this strain in experimental conditions synthesizes extracellular endopeptidase, which is an inductive enzyme. High activity o f this enzyme appears along with the presence o f peptide substrate in soil. Adding o f the ions Ca2 ' into the nutrient causes an increase in endopeptidase activity. Inorganic sources o f carbon and nitrogen in the substrate significantly decrease the level o f enzymatic activity. Substantial inhibition o f this enzym e s synthesis was observed in presence o f the glucose (concentration greater than 1%) in the culture medium. Endopeptidase activity remained constant in the wide range o f ph (6,5-8,0). The highest enzymatic activity was detected after 36 hours o f bacteria breeding in the temperature o f 25 C. The highest enzymatic activity was observed in the late log phase o f bacteria growth and the early stationary phase. Based on zymogram, the presence o f one band o f the endopeptidase activity was affirmed, that is synthesized extracellularly by this strain. Słowa kluczow e: peptydaza zewnątrzkomórkowa, endopeptydaza, Pseudom onas fluorescens. Key words', extracellular peptidase, endopeptidase, Pseudomonas fluorescens.

Wpływ warunków hodowli Ps. fluorescens na aktywność endopeptydazy 85 WSTĘP Peptydazy są to enzymy z klasy hydrolaz występujące u wszystkich organizmów żywych i uczestniczące w szeregu niezbędnych dla życia procesów fizjologicznych i biochemicznych. Białka jako podstawowe składniki komórkowe są rozkładane z udziałem enzymów proteolitycznych wewnątrzkomórkowych oraz syntetyzowane wciąż na nowo. W zależności od położenia w łańcuchu białkowym rozkładanego wiązania peptydowego wyróżnia się egzopeptydazy i endopeptydazy. Zaliczane do egzopeptydaz aminopeptydazy i karboksypeptydazy rozkładają wiązania peptydowe skrajnie położone, odpowiednio z N- lub С-końca łańcucha polipeptydowego. W odróżnieniu od nich endopeptydazy rozszczepiają wiązania peptydowe położone wewnątrz łańcucha polipeptydowego. Enzymy te klasyfikuje się zazwyczaj na podstawie ich katalitycznego działania i budowy centrum aktywnego wyróżniając: peptydazy serynowe, cysternowe, metalopeptydazy oraz nieopisane dotychczas u bakterii peptydazy aspartylowe [Barrett i in. 1998]. Mikroorganizmy zdolne są do syntezy enzymów proteolitycznych zarówno wewnątrzkomórkowych, jak i zewnątrzkomórkowych. Peptydazy wewnątrzkomórkowe są ważne ze względu na wewnątrzkomórkowy obrót białkowy. Enzymy zewnątrzkomórkowe są odpowiedzialne za rozkład białek w środowisku bytowania mikroorganizmów. Niskocząsteczkowe produkty reakcji katalizowanych przez te enzymy mogą przenikać przez błonę komórkową i stanowią dla mikroorganizmów źródło energii. Zewnątrzkomórkowe peptydazy ze względu na swoje właściwości i łatwość pozyskiwania znalazły zastoso-wanie m.in. w przemyśle chemicznym, spożywczym i paszowym. Dlatego intensywne badania nad właściwościami oraz regulacjąbiosyntezy tych enzymów wynikająz potrzeb praktycznych U bakterii z rodzaju Pseudomonas stwierdzono obecność wewnątrzkomórkowych aminopeptydaz, karboksypetydaz oraz endopeptydaz [Levy, Goldman 1967; Jankiewicz, Bielawski 2002ab; Korzą, Bochtler2005]. Pozakomórkowo bakterie z tego rodzaju syntetyzują przede wszystkim endopeptydazy. Znanych jest kilka psychrofilnych szczepów z gatunku P fluorescens, które powodują psucie się produktów mlecznych i mięsnych [Schokker, van Boekel 1997; Burger i in. 2000]. W literaturze naukowej natomiast niewiele miejsca poświęca się endopeptydazom syntetyzowanym przez bakterie glebowe, chociaż te enzymy odgrywają istotną rolę w rozkładzie występujących w ich środowisku resztek białkowych. W ten sposób wzbogacająone glebę w cenne składniki. Wyizolowany szczep bakterii jest ciekawym obiektem badań, ponieważ ma także zdolność do intensywnej syntezy piowerdyny - sideroforu, chelatu żelaza [Jankiewicz 2006]. Celem badań w prezentowanej pracy było zbadanie wpływu niektórych warunków hodowli na poziom zewnątrzkomórkowej endopeptydazy syntetyzowanej przez szczep P. fluorescens. METODYKA BADAŃ 1. Materiał biologiczny M ateriałem badawczym był izolat z gleby, gatunku bakterii Pseudomonas fluorescens.

86 U. Jankiew icz TABELA 1. Wybrane cechy morfologiczne i biochemiczne szczepu bakterii Pałeczki Gram - Opis kolonii drobne, śluzowate barwy żółto-miodowej Katalaza + Oksydaza + Utlenianie podłoża Hugh-Leifsona.+ Fermentacja w podłożu Hugh-Leifsona - Rozkład azotanów (V) do azotanów (III) - Rozkład cytrynianów na podłożu Simmonsa + Wzrost w temp. 4 C - Wzrost w temp. 37 C + Wzrost w temp. 42 C - Identyfikację drobnoustrojów przeprowadzono na podstawie klasycznych testów biochemicznych (katalaza, oksydaza) i testów Microgen (UK) obejmujących 24 cechy biochemiczne (tab. 1) oraz analizy mikroskopowej. 2. Warunki hodowli bakterii i skład stosowanych pożywek Do przechowywania i namnażania bakterii wykorzystywano podłoże King B. We wszystkich doświadczeniach hodowle bakterii prowadzono w kolbach o pojemności 250 cm3 zawierających 50 cm3 podłoża. Hodowlę bakterii prowadzono w większości doświadczeń przez 36 godzin w temperaturze 25 C z ciągłym wstrząsaniem ( 150 cykli na minutę). Po tym czasie płyn pohodowlany odwirowywano, osad komórek odrzucano, w uzyskanym supematancie oznaczano aktywność endopeptydazy. W doświadczeniach, w których badano zależność poziomu aktywności endopeptydazy od czasu hodowli, pobierano sterylnie, co 12 godzin po 3 cm3 płynnej kultury bakteryjnej w celu wykonania oznaczeń. W większości doświadczeń bakterie hodowano na pożywce podstawowej : mineralnej o składzie: 0,03% K^HPO^ 0,03% KH2P04,0,05% MgS04 0,05% NaCl, 0,0015% FeCl3 wzbogaconej l,50%tryptonu i 0,25% ekstraktu drożdżowego,odczyn pożywki doprowadzano do ph 7,0 przed autoklawowaniem przez dodanie odpowiedniej ilości 1M NaOH. W doświadczeniach, w których badano zmiany w poziomie aktywności endopeptydazy w zależności od odczynu podłoża, ph pożywki podstawowej doprowadzano do wymaganego za pomocą 1 M NaOH lub 1 M HC1. W doświadczeniach, w których badano wpływ składników podłoża hodowlanego na poziom uzyskiwanej aktywności, stosowano w składzie pożywki podstawowej zamiast tryptonu inne substraty pokarmowe. Odczyn pożywki doprowadzano do ph 7,0 dodając 1 M HC1 lub NaOH. W doświadczeniach, w których badano wpływ glukozy lub soli nieorganicznych na poziom aktywności endopeptydazy, do pożywki podstawowej dodawano odpowiednie ilości

Wpływ warunków hodowli Ps. fluorescens na aktyw ność endopeptydazy 87 roztworu glukozy lub soli nieorganicznych. Roztwory glukozy i soli nieorganicznych sterylizowano poprzez filtrację i dodawano do wysterylizowanej uprzednio pożywki podstawowej. Wszystkie podłoża bakteryjne przygotowywano na wodzie dejonizowanej i sterylizowano w autoklawie przez 17 minut w temp. 121 C. Intensywność wzrostu bakterii określano na podstawie wzrostu gęstości optycznej pożywek (OD600 nm). 3. Oznaczenia enzymatyczne Aktywność endopeptydazy oznaczano w obecności jako substratu 1% roztworu azokazeiny w 100 mm buforze Tris-HCl o ph 7,0. Inkubację prowadzono 60 minut w 37 C. Reakcję przerywano stosując 10% TCA. Absorbancję mierzono przy długości fali 360 nm. Jako jednostkę aktywności przyjęto absorbancję przeliczoną na 1 cm3 płynu pohodowlanego (A360). Jako produktywność endopeptydazy badanego szczepu określano stosunek wartości A _./O D,... JoU ouu 4. Zymogramy Zymogramy uzyskiwano po elektroforetycznym rozdziale białek płynu pohodowlanego zgodnie z procedurą opisaną przez Laemmli [1970]. Elektroforezę natywną prowadzono na 10% żelu poliakryloamidowym z unieruchomioną 0,1% hemoglobiną. Po rozdziale elektroforetycznym żele inkubowano w 50 mm buforze Tris-HCl o ph 7,0 przez 20 minut w temperaturze 37 C, wybarwiano je w 0,1 % czerni amidowej, a następnie płukano w 7% kwasie octowym. Aktywność proteolityczną wykrywano na podstawie obecności jasnych (niezabarwionych pasm) na niebieskim tle żelu. Wszystkie wyniki o charakterze liczbowym prezentowane w tej pracy stanowią średnią z trzech niezależnych powtórzeń, błąd średni, oznaczający maksymalne względne odchylenie wyników pomiarów od średniej, nie przekraczał 7%. W YNIKI BADAŃ Po rozdziale elektroforetycznym białek płynu pohodowlanego uzyskanego po 36-godzinnej hodowli bakterii na pożywce podstawowej na zymogranie widoczne było jedno pasmo aktywności enzymatycznej. Miejsce hydrolizy hemoglobiny wyznaczał prążek widoczny na żelu w postaci przejaśnienia (fot. 1). Pozwala to sądzić, FOTOGRAFIA l. Zymogram płynu że badany szczep w warunkach doświadczeń pohodowlanego syntetyzował jedno zewnątrzkomórkowe białko PH0TO 1- Zymogram of cell-free culture,,.!,. ^ supernatant o aktywności endopeptydazowej. Zymogramy

88 U. Jankiew icz czas (h)/ time (h) RYSUNEK 1. Wzrost bakterii i produktywność endopetydazy uzyskiwane na pożywce podstawowej w temperaturze 25 C FIGURE 1. Growth and productivity of endopeptidase in basal medium at 25 C uzyskiwane po rozdziałach elektroforetycznych płynów hodowlanych z pozostałych doświadczeń prezentowały taki sam obraz jak na fotografii 1, dlatego nie umieszczono ich w pracy. Aktywność endopeptydazy w płynie pohodowlanym wykrywano już w 12. godzinie hodowli bakterii, jednak najwyższa produktywność tego enzymu pojawiała się w pożywce w 36. godzinie hodowli (rys. 1). W dalszym czasie hodowli produktywność utrzymywała się niemalże na stałym poziomie, wykazując niewielki spadek po 60 godzinach hodowli. Temperatura hodowli okazała się również istotnym czynnikiem wpływającym na poziom oznaczanej aktywności. Produktywność endopeptydazy w płynie pohodowlanym była najwyższa w hodowlach bakterii prowadzonych w temperaturze 25 C (rys. 2). Niższy o około 30% poziom produktywności uzyskiwano w hodowlach prowadzonych w temperaturze 30 C i 37 C. Podobnie, podczas hodowli bakterii w temperaturze niższej niż 25 C uzyskiwano mniejszą produktywność tego enzymu. Badany szczep bakterii wykazywał zdolność do wzrostu i syntezy enzymu w szerokim zakresie ph (5,0-9,0), jednak najwyższą produktywność enzymu uzyskiwano w ph 6,5-7,0 (rys. 3). Prawie trzykrotnie niższą aktywność endopeptydazy uzyskiwano w hodowlach bakterii na pożywkach o skrajnych wartościach ph: 9,0 i 5,0. W doświadczeniu, w którym badano zależność aktywności endopetydazy od składu podłoża hodowlanego, zastąpiono w podłożu podstawowym trypton poprzez inne składniki organiczne oraz nieorganiczne (tab. 2). Najwyższą aktywność endopeptydazy uzyskiwano podczas hodowli bakterii na pożywkach, gdzie źródłem węgla i azotu były związki organiczne, takie jak: trypton, bulion odżywczy, pepton sojowy czy hydrolizat kazeiny, chociaż tu także obserwowano zróżnicowanie w poziomie

Wpływ warunków hodowli Ps. fluorescens na aktywność endopeptydazy 89 tem peratura '>C /tem p eratu re,' C RYSUNEK 2. Wpływ temperatury hodowli bakterii na produktywność endopeptydazy (kultury bakterii hodowano 36 h na pożywce podstawowej) FIGURE 2. Effect o f temperature of bacterial culture on productivity of endopeptidase (bacterial culture was cultivated 36 h on the basal medium) ph pożywki/ph of medium RYSUNEK 3. Wpływ ph pożywki hodowlanej na produktywność endopeptydazy FIGURE 3. Effect o f ph o f culture medium on productivity of endopeptidase

90 U. Jankiew icz TABELA 2. Wpływ składu podłoża hodowlanego na poziom aktywności endopeptydazy u badanego szczepu TABLE 2. Effect of composition of culture medium on endopeptidase activity of the studied strains Składnik pożywki Component of medium Pożywka podstawowa Basal medium* Stężenie Concentration [%] Aktywność Activity Wzrost Growth Produktywność Productivity 1,25±0,088 1,35 ±0,095 0,93 ±0,066 Trypton - Tryptone 0,50 0,88 ± 0,062 1,00 ± 0,070 0,88 ± 0,062 Bulion odżywczy 0,50 0,50 ± 0,035 1,00±0,070 0,50±0,035 Nutrient broth 1,50 0,90 ± 0,063 1,30±0,091 0,69±0,048 Pepton sojowy 0,50 1,00±0,070 1,18±0,083 0,85±0,060 Soy peptone 1,50 1,10±0,077 1,23±0,086 0,89±0,062 Hydrolizat kazeiny 0,50 1,30±0,091 1,56±0,109 0,83±0,058 Casamino acid 1,50 1,80±0,126 1,60±0,112 1,12±0,079 Mieszanina aminokwasów** 0,45 0,03±0,002 0,49±0,035 0,06±0,004 Mixture of amino acids** 1,50 0,05±0,004 0,57±0,040 0,09±0,006 Glicerol 0,50 0,10±0,007 0,90±0,063 0,11±0,008 Glycerol 1,50 0,17±0,012 0,90±0,063 0,19±0,013 Bursztynian sodu 0,50 0,05±0,035 0,38±0,026 0,11±0,008 Sodium succinate 1,50 0,04±0,028 0,49±0,034 0,09±0,006 Cytrynian sodu 0,50 0,02±0,001 0,45±0,031 0,04±0,003 Sodium citrate 1,50 0,03±0,002 0,5±0,035 0,06±0,004 *1,5% trypton został zastąpiony w pożywce przez wymienione w tabeli 2 składniki; *1.5% tryptone in the basal rredium was substituted with components from Table 2; **w skład mieszaniny wchodziły: Ala, Cys, Gly każdy o końcowym stężeniu 0,15% i 0,50%; **amino acid mixture consisted of Ala, Cys, Gly in concentration 0.15% and 0.50% each of then aktywności zależności od stężenia składnika i jego rodzaju. Najlepszym składnikiem pożywki podstawowej, w którego obecności uzyskiwano najwyższą aktywność badanego enzymu był hydrolizat kazeiny w stężeniu 1,5%. Interesujących wyników dostarczył^ hodowle bakterii na pożywkach zawierających mieszaninę aminokwasów. W płynie pohodowlanym uzyskiwano wówczas jedynie niewielki poziom badanej aktywności, pomimo dość intensywnego wzrostu bakterii. Podobne zjawisko obserwowano na pożywkach z glicerolem, na których aktywność endopeptydazy była kilkanaście razy niższa w porównaniu z wynikami uzyskiwanymi na pożywkach podstawowych pomimo niewielkich różnic w tempie wzrostu bakterii na obu tych podłożach. Poziom aktywności endopeptydazy był wyjątkowo niski w hodowlach bakterii w pożywkach podstawowych, w których trypton zastąpiono przez nieorganiczne składniki, takie jak: cytrynian sodu czy bursztynian sodu. Zbadano także, czy poziom aktywności endopeptydazy jest zależny od jonów Mg2 r i Ca24. Obecność w pożywce hodowlanej 0,25% chlorku wapnia spowodowała ok. 20% wzrost poziomu aktywności endopeptydazowej, natomiast 0,25% siarczan(vi) magnezu obniżył jej poziom radykalnie (tab. 3).

Wpływ warunków hodowli Ps. fluorescens na aktywność endopeptydazy 91 TABELA 3. Wpływ chlorku wapnia i siarczanu magnezu na poziom aktywności endopeptydazy TABLE 3. Effect o f calcium chloride and magnesium sulfate on endopeptidase activity Dodawana sól Salt added Stężenie Concentration [%] Aktywność Activity (A360) Wzrost Growth Produktywność Productivity Pożywka podstawowa Basal medium - 1,25±0,088 1,35±0,095 0,93±0,066 С а Ц 0,25 1,49±0,105 1,30±0,091 1,16±0,081 M gs04 0,25 0,50±0,035 1,00±0,070 0,50±0,035 Obecność glukozy w podstawowym podłożu hodowlanym również spowodowała zmiany w poziomie aktywności badanego enzymu (tab. 4). Niskie stężenie (0,5%) tego cukru stymulowało wzrost i syntezę enzymu, wyższe stężenia powodowały znaczne obniżenie aktywności enzymatycznej przy zachowaniu intensywnego wzrostu bakterii. DYSKUSJA W pracy wyizolowano ze środowiska glebowego szczep bakterii z rodzaju Pseudomonas. Na podstawie jego cech biochemicznych i morfologicznych sklasyfikowano go jako Pseudomonas fluorescens. Stwierdzono, że ten szczep w zastosowanych warunkach hodowli syntetyzuje pozakomórkową endopeptydazę. Większość z dotychczas opisanych szczepów P. fluorescens wyizolowanych z różnych środowisk syntetyzuje jedno zew nątrzkom órkow e białko enzym atyczne o aktyw ności endopeptydazy. Wykazano, że enzym ten ma zwykle zbliżone właściwości u różnych szczepów P fluorescens [Kohlmann i in. 1991; Hellio i in. 1993; Liao, Mc Callus 1998; Koka, Weimer 2000]. Rajmohan i in. [2002] stwierdzili jednak w płynie pohodowlanym u kilku izolatów z gatunku P. fluorescens obecność na zymogramach jeszcze innych TABELA 4. Wpływ stężenia glukozy na poziom aktywności endopeptydazy TABLE 4. Effect of glucose concentration of endopeptidase activity Stężenie glukozy Glucose concentration [%] Aktywność Activity Wzrost Growth Produktywność Productivity Pożywka podstawowa Basal medium 1,25±0,088 1,35±0,095 0,93±0,066 0,50 1,38±0,097 1,40±0,098 0,99±0,069 1,00 0,69±0,048 1,52±0,106 0,45±0,032 1,50 0,21±0,015 1,52±0,106 0,14±0,009 2,00 0,20±0,014 1,45±0,102 0,14±0,009 2,50 0,11±0,008 1,45±0,102 0,08±0,006 3,00 0,10±0,007 1,39±0,098 0,07±0,005

92 U. Jankiew icz pasm o mniejszej aktywności. W niniejszej pracy na zymogramach uzyskiwano pojedyncze pasmo aktywności endopeptydazy, co pozwala stwierdzić, że ten szczep syntetyzuj e tylko j edną zewnątrzkomórkową endopeptydazę. Niewielką aktywność w płynie pohodowlanym wykrywano już we wczesnej fazie logarytmicznej wzrostu, znaczący wzrost aktywności obserwowano w późnej fezie logarytmicznej i wczesnej stacjonarnej fazie wzrostu. Podobne wyniki uzyskali liell io i in. [1993] oraznicodeme i in. [2005] w badaniach nad syntezą endopeptydaz przez szczepy P fluorescens. W pracy stwierdzono wyraźną zależność poziomu oznaczanej w podłożu hodowlanym aktywności endopeptydazy od temperatury oraz składu i wartości ph podłoża hodowlanego, jak też od czasu trwania hodowli bakterii. Synteza pozakomórkowych peptydaz przez mikroorganizmy może być indukowana w obecności w podłożu hodowlanym substratu białkowego, może także zależeć od wielu innych czynników, m.in. łatwo przyswajalnych źródeł azotu, łatwo metabolizowanych cukrów czy stosunku C/N w podłożu hodowlanym. Znane są także enzymy konstytutywne, syntetyzowane przez mikroorganizmy niezależnie od składu podłoża hodowlanego. Wyniki badań wskazujące na ścisłą zależność pomiędzy poziomem aktywności endopeptydazy oznaczanej w podłożu hodowlanym a składem pożywek hodowlanych mogą świadczyć o indukcyjnym charakterze badanego enzymu. Organiczne, peptydowe składniki pożywek stymulowały syntezę enzymu, natomiast nieorganiczne źródła węgla i azotu powodowały znaczne jej ograniczenie. Wobec braku induktora w pożywce, a więc obecności niebiałkowych źródeł węgla i azotu obserwowano jedynie śladową aktywność endopeptydazy. Podobne wyniki w badaniach nad endopeptydazami bakterii Pseudomonas otrzymali m.in. Malik i in. [1985] oraz Rahman i in. [2005]. Natomiast Whooley i in. [1983] stwierdzili, że u Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145 synteza zewnątrzkomórkowej endopeptydazy ma charakter w dużej mierze konstytutywny. Niską aktywność tego enzymu obserwowaną w obecności mieszaniny aminokwasów jako źródła węgla i azotu można tłumaczyć represją syntezy enzymu w obecności jego końcowego produktu. W skład mieszaniny wchodziły takie aminokwasy, jak: alanina, cysteina, i glicyna. Podobne doświadczenia wykonane przez Rahman i in. [2005] wskazują, że szczególnie silnym represorem syntezy zewnątrzkomórkowej endopeptydazy u P. aeruginosa jest właśnie glicyna i cysteina. Induktorem endopeptydaz syntetyzowanych przez niektóre szczepy Pseudomonas mogą być jony wapnia [Nicodeme i in. 2005]. Potwierdziły to także wyniki badań przeprowadzone w ramach tej pracy, gdzie również po wzbogaceniu podłoża podstawowego w jony wapnia uzyskano wzrost poziomu aktywności. Natomiast w przypadku dodania do podstawowej pożywki hodowlanej jonów magnezu obserwowano znaczne zahamowanie aktywności, co potwierdziło wyniki badań przeprowadzonych przez Malik i in. [1985], ale jest sprzeczne z wynikami uzyskanymi prze Rahman i in. [2005]. Wyniki te są trudne do interpretacji, ponieważ jony Ca2+ i Mg2" mogły wpływać na aktywność samego enzymu, a nie na tempo jego biosyntezy. W obecności glukozy w pożywce podstawowej zaobserwowano zmiany w poziomie aktywności endopeptydazy. Niższe stężenia tego cukru (0,5%) w znacznym stopniu stymulowały wydzielanie peptydazy. W obecności wyższych stężeń glukozy obserwowano

Wpływ warunków hodowli Ps. fluorescens na aktywność endopeptydazy 93 obniżenie aktywności tego enzymu pomimo intensywnego wzrostu bakterii. Zjawisko represji syntezy peptydaz w obecności glukozy jest opisane także dla szczepu Pseudomonas sp. B-25, Ps. fluorescens CM 12 [Malik i in. 1985; Al.-Salech, Zahran 1997]. Aktywność endopeptydazy wykrywano w szerokim zakresie ph zastosowanego podłoża hodowlanego (ph 5,0-9,0), przy czym najwyższą aktywność uzyskiwano w podłożach o odczynie zbliżonym do obojętnego (ph 6,5-7,0). Podobne wyniki zostały uzyskane u Ps. fluorescens CM 12 oraz Ps.fragi [Al.-Salech, Zahran 1997; Myhara, Skura 1990]. W przeprowadzonych badaniach obserwowano wyraźną zależność poziomu aktywności enzymatycznej od temperatury hodowli. Bakterie intensywnie syntetyzowały badaną endopeptydazę w temperaturze 25 C. W niższych i w wyższych niż 25 C temperaturach hodowli uzyskiwano znacznie mniejsząproduktywność enzymu. Wydaje się, że niewielkie wymagania tego szczepu bakterii względem niektórych warunków środowiskowych, tzn. odczynu środowiska oraz niezbyt wysokiej temperatury, w której intensywnie wydzielają enzym, jest ich doskonałym przystosowaniem do życia w glebie. Mikroorganizmy syntetyzujące peptydazy spełniają wyjątkowo istotne funkcje, ze względu na udział w rozkładzie obficie występujących w glebie wielu resztek białkowych. WNIOSKI 1. Wyizolowany z gleby szczep Pseudomonas fluorescens jest zdolny do syntezy pozakomórkowej endopeptydazy. 2. Najwyższa aktywność endopeptydazy w podłożu hodowlanym pojawiała się w 36. godz. hodowli, w późnej fazie logarytmicznej i wczesnej fazie stacjonarnej wzrostu bakterii. 3. Optymalną temperaturą hodowli bakterii, przy której uzyskiwano najwyższy poziom aktywności badanej endopeptydazy, było 25 C. 4. Najwyższą aktywność endopeptydazy uzyskiwano w pożywkach o odczynie zbliżonym do obojętnego. 5. Synteza pozakomórkowej endopeptydazy przez badany szczep podlega indukcji przez składniki peptydowe obecne w podłożu hodowlanym. 6. Represja kataboliczna wywołana obecnością glukozy lub niektórych aminokwasów jest jednym z mechanizmów regulujących syntezę tego enzymu. LITERATURA AL.-SALECH A., ZAHRAN A. 1997: Protease production by Pseudomonas fluorescens CM 12 isolated from raw milk. Egyptian J. D airy Sei. 25: 327-336. BARRETT A.J., RAWLINGS N.D., WOESSNER J.F. 1998: Handbook o f proteolytic enzymes. London: Academic Press (wydanie CD). BURGER M., WOODS G., McCARTHY C., BEACHAM I. R. 2000: Temperature regulation of protease in Pseudomonas fluorescens LS107d2 by an ECF sigma factor and a transmembrane activator. M icrobiology 146: 3149-3155.

94 U. Jankiew icz CHESSA J.P., PETRESCU I., BENTAHIR M., VAN BEEUMEN J., GERD AY C. 2000: Purification, physico-chemical characterization and sequence o f a heat labile alkaline metalloprotease isolated from a psychrophilic Pseudomonas species. Biochim. Biophys. Acta 1479: 2 6 5-274. 4 HELLIO F.C., ORANGE N., GUESPIN-MICHEL J.F. 1993: Growth temperature controls the production o f a single extracellular protease by Pseudomonas fluorés cens MFO, in the presence o f various inducers. Res. M icrobiol 144: 617-625. JANKIEWICZ U. 2006: Synteza sideroforów przez glebowe bakterie z rodzaju Pseudomonas w zmiennych warunkach hodowli. Acta Sei. Polon. Agricultura 5: 3 3 ^ 4. JANKIEWICZ U., BIELAWSKI W. 2002 a: Purification and properties o f phenylalanyl aminopeptidase synthesized by Pseudomonas sp. J. Basic Microbiol. 42: 260-267. JANKIEWICZ U., BIELAWSKI W. 2002 b: Regulation o f the activity o f intracellular alanylaminopeptidase synthesized by Pseudomonas sp. Folia M icrobiol. 47: 230-234. KOHLMANN K.L., NIELSEN S.S., LADISCH M. 1991 : Purification and characterization of an extracellular protease produced by Pseudomonas fluorescens M3/6. J. Dairy Sei. 74: 4125^136. KOKA R., WEIMER B.C. 2000: Isolation and characterization o f a protease from Pseudomonas fluorescens R 098. J. App. Microbiol. 89: 280-288. KORZĄ H.J., BOCHTLER M. 2005: P. aeruginosa LD-carboxypeptidase: a serine peptidase with a Ser-His-Glu triad and a nucleophilic elbow. Biol. Chem. 280: 4 0 8 0 2^ 0812. LAEMMLI U.K. 1970: Cleavage o f structural proteins during the assembly o f the head o f bacteriophage T4. Nature 227: 680-685. LEVY C.C., GOLDMAN P. 1967: The enzymatic hydrolysis o f methotrexate and folic acid. J Biol. Chem. 242(12): 2933-2938. LIAO CHING-HSING, McCALLUS D. E. 1998: Biochemical and Genetic Characterization o f an Extracellular Protease from Pseudomonas fluorescens CY091. Appl. Environ. M icrobiol. 64:914-921. MALIK R.K, PRASAD R., MATUR D.K. 1985: Effect o f some nutritional and environmental factors on extracellular protease production by Pseudomonas sp. B-25. Le Lait 65: 169-183. MYHARA R. M., SKURA B. 1990: Centroid search optimization o f cultural conditions affecting the production o f extracellular proteinase by Pseudomonas fragi ATCC 4973. J. Appl. Bacteriol. 69, 4: 530-538. NICODEME M., GRILL J.P., HUMBERT G., GAILLARD J.L. 2005: Extracellular protease activity o f different Pseudomonas strains: dependence o f proteolytic activity on culture conditions. Enzyme Microbiol. Technol. 36: 749-757. RAHMAN R.N.Z.R.A., GEOK L.P., BASRI M., SALLEH A.B. 2005: An organic solvent tolerant protease from Pseudomonas aeruginosa strain K, nutritional factor affecting protease. Enz. Microbiol. Tech. 36: 749-757. RAJMOHAN S., DODD C. E. R., WAITES W. M. 2002: Enzymes from isolates o f Pseudomonas fluorescens involved in food spoilage. Ingenta Connect 93,2: 205-213. SCHOKKER E. P., VAN BOEKEL M. A. J. 1997: Production, purification and partial characterization o f extracellular proteinase from Pseudomonas fluorescens 22 F. Int. Dairy J. 1: 265-271. WHOOLEY M, O CALLAGHAN J., McLOUGHLIN A. J. 1983: Effect o f substrate on the regulation o f exoprotease production by Pseudom onas aeruginosa ATCC 10145. J. General Microbiol. 129: 981-988. D r Urszula Jankiew icz K atedra B iochem ii S G G W ul. N ow oursynow ska 159, 02-776 W arszawa