Analizy populacyjne, ªadunki atomowe

Podobne dokumenty
Przybli»one metody uwzgl dniania rozpuszczalnika. Šadunki atomowe

Przeksztaªcenia liniowe

Relacj binarn okre±lon w zbiorze X nazywamy podzbiór ϱ X X.

Modelowanie molekularne

ARYTMETYKA MODULARNA. Grzegorz Szkibiel. Wiosna 2014/15

Karta pracy: Ćwiczenie 5.

Ukªady równa«liniowych

Statystyka. Šukasz Dawidowski. Instytut Matematyki, Uniwersytet l ski

2 Liczby rzeczywiste - cz. 2

Materiaªy do Repetytorium z matematyki

Funkcje wielu zmiennych

Elementarna statystyka Wnioskowanie o regresji (Inference 2 czerwca for regression) / 13

Atom poziom rozszerzony

Wska¹niki, tablice dynamiczne wielowymiarowe

Ciaªa i wielomiany. 1 Denicja ciaªa. Ciaªa i wielomiany 1

Wst p do informatyki. Systemy liczbowe. Piotr Fulma«ski. 21 pa¹dziernika Wydziaª Matematyki i Informatyki, Uniwersytet Šódzki, Polska

Nanostruktury, spintronika, komputer kwantowy

Model obiektu w JavaScript

1 Elektrostatyka. 1.1 Wst p teoretyczny

1 Granice funkcji wielu zmiennych.

Proste modele o zªo»onej dynamice

Metody dowodzenia twierdze«

Rzędy wiązań chemicznych

Szeregowanie zada« Przedmiot fakultatywny 15h wykªadu + 15h wicze« dr Hanna Furma«czyk. 7 pa¹dziernika 2013

Zbiory i odwzorowania

Ekonometria - wykªad 8

Kwantowa teoria wzgl dno±ci

A = n. 2. Ka»dy podzbiór zbioru sko«czonego jest zbiorem sko«czonym. Dowody tych twierdze«(elementarne, lecz nieco nu» ce) pominiemy.

1 Przypomnienie wiadomo±ci ze szkoªy ±redniej. Rozwi zywanie prostych równa«i nierówno±ci

Oba zbiory s uporz dkowane liniowo. Badamy funkcj w pobli»u kresów dziedziny. Pewne punkty szczególne (np. zmiana denicji funkcji).

Wykªad 7. Ekstrema lokalne funkcji dwóch zmiennych.

1 Bª dy i arytmetyka zmiennopozycyjna

Funkcje, wielomiany. Informacje pomocnicze

WST P DO TEORII INFORMACJI I KODOWANIA. Grzegorz Szkibiel. Wiosna 2013/14

ARYTMETYKA MODULARNA. Grzegorz Szkibiel. Wiosna 2014/15

Metody numeryczne. Wst p do metod numerycznych. Dawid Rasaªa. January 9, Dawid Rasaªa Metody numeryczne 1 / 9

Macierze. 1 Podstawowe denicje. 2 Rodzaje macierzy. Denicja

3. (8 punktów) EGZAMIN MAGISTERSKI, Biomatematyka

Rys.2 N = H (N cos = N) : (1) H y = q x2. y = q x2 2 H : (3) Warto± siªy H, która mo»e by uto»samiana z siª naci gu kabla, jest równa: z (3) przy

Nagroda Nobla z fizjologii i medycyny w 2004 r.

WICZENIE 2 Badanie podstawowych elementów pasywnych

x y x y x y x + y x y

Podstawy matematyki dla informatyków. Logika formalna. Skªadnia rachunku zda« Skróty i priorytety. Wykªad 10 (Klasyczny rachunek zda«) 15 grudnia 2011

Stechiometria równań reakcji chemicznych, objętość gazów w warunkach odmiennych od warunków normalnych (0 o C 273K, 273hPa)

Podstawy matematyki dla informatyków

przewidywania zapotrzebowania na moc elektryczn

Lekcja 9 - LICZBY LOSOWE, ZMIENNE

Numeryczne zadanie wªasne

W poprzednim odcinku... Podstawy matematyki dla informatyków. Relacje równowa»no±ci. Zbiór (typ) ilorazowy. Klasy abstrakcji

ARYTMETYKA MODULARNA. Grzegorz Szkibiel. Wiosna 2014/15

Wybrane poj cia i twierdzenia z wykªadu z teorii liczb

Matematyka z elementami statystyki

Wykªad 10. Spis tre±ci. 1 Niesko«czona studnia potencjaªu. Fizyka 2 (Informatyka - EEIiA 2006/07) c Mariusz Krasi«ski 2007

Janusz Adamowski METODY OBLICZENIOWE FIZYKI Zastosowanie eliptycznych równa«ró»niczkowych

Liniowe równania ró»niczkowe n tego rz du o staªych wspóªczynnikach

Analizy populacyjne i rzedy

Interpolacja funkcjami sklejanymi

Od redakcji. Symbolem oznaczono zadania wykraczające poza zakres materiału omówionego w podręczniku Fizyka z plusem cz. 2.

Rozwi zanie równania ró»niczkowego metod operatorow (zastosowanie transformaty Laplace'a).

Ekonometria. wiczenia 2 Werykacja modelu liniowego. Andrzej Torój. Instytut Ekonometrii Zakªad Ekonometrii Stosowanej

CHEMIA KWANTOWA MONIKA MUSIA L METODA HÜCKLA. Ćwiczenia. mm

1 Trochoidalny selektor elektronów

Bifurkacje. Ewa Gudowska-Nowak Nowak. Plus ratio quam vis

1 Metody iteracyjne rozwi zywania równania f(x)=0

Programowanie funkcyjne. Wykªad 13

KLASYCZNE ZDANIA KATEGORYCZNE. ogólne - orzekaj co± o wszystkich desygnatach podmiotu szczegóªowe - orzekaj co± o niektórych desygnatach podmiotu

O pewnym zadaniu olimpijskim

Metody probablistyczne i statystyka stosowana

Mathematica - podstawy

i, lub, nie Cegieªki buduj ce wspóªczesne procesory. Piotr Fulma«ski 5 kwietnia 2017

Zagadnienia na wej±ciówki z matematyki Technologia Chemiczna

Podzbiory Symbol Newtona Zasada szuadkowa Dirichleta Zasada wª czania i wyª czania. Ilo± najkrótszych dróg. Kombinatoryka. Magdalena Lema«ska

Twierdzenie Wainera. Marek Czarnecki. Warszawa, 3 lipca Wydziaª Filozoi i Socjologii Uniwersytet Warszawski

Podstawy matematyki dla informatyków. Funkcje. Funkcje caªkowite i cz ±ciowe. Deniowanie funkcji. Wykªad pa¹dziernika 2012

CAŠKOWANIE METODAMI MONTE CARLO Janusz Adamowski

spektroskopia UV Vis (cz. 2)

Funkcje wielu zmiennych

Metody numeryczne i statystyka dla in»ynierów

Matematyka dyskretna dla informatyków

Spis tre±ci. Plan. 1 Pochodna cz stkowa. 1.1 Denicja Przykªady Wªasno±ci Pochodne wy»szych rz dów... 3

Zadania z kolokwiów ze Wst pu do Informatyki. Semestr II.

ELEMENTARNA TEORIA LICZB. 1. Podzielno±

ARYTMETYKA MODULARNA. Grzegorz Szkibiel. Wiosna 2014/15

CZ STECZKA. Do opisu wi za chemicznych stosuje si najcz ciej jedn z dwóch metod (teorii): metoda wi za walencyjnych (VB)

Wielomiany. El»bieta Sadowska-Owczorz. 19 listopada 2018

Liczenie podziaªów liczby: algorytm Eulera

Zadania z z matematyki dla studentów gospodarki przestrzennej UŠ. Marek Majewski Aktualizacja: 31 pa¹dziernika 2006

Indeksowane rodziny zbiorów

Przetwarzanie sygnaªów

Lab. 02: Algorytm Schrage

Pochodna funkcji jednej zmiennej

Statystyka matematyczna

Zadanie 1. Zadanie 2. Zadanie 3. Zadanie 4

Ekonometria. wiczenia 8 Modele zmiennej jako±ciowej. Andrzej Torój. Instytut Ekonometrii Zakªad Ekonometrii Stosowanej

Agrofi k zy a Wyk Wy ł k ad V Marek Kasprowicz

+ + Struktura cia³a sta³ego. Kryszta³y jonowe. Kryszta³y atomowe. struktura krystaliczna. struktura amorficzna

r = x x2 2 + x2 3.

1 Klasy. 1.1 Denicja klasy. 1.2 Skªadniki klasy.

Ksztaªt orbity planety: I prawo Keplera

Ekonometria Bayesowska

Transkrypt:

Dodatek do w. # 3 i # 4

Šadunki atomowe, analizy populacyjne Q A = Z A N A Q A efektywny ªadunek atomu A, Z A N A liczba porz dkowa dla atomu A (czyli ªadunek j dra) efektywna liczba elektronów przypisana do atomu A (populacja elektronowa atomu A) Jak mo»na j okre±li? o tym za chwil... Przez sumowanie ªadunków atomowych mo»na okre±li ªadunki caªych grup funcyjnych. Zsumowanie ªadunków wszystkich atomów w czasteczce da po prostu caªkowity ªadunek cz steczki (zero dla cz steczki oboj tnej) W przeciwie«stwie do caªkowitego ªadunku cz steczki, ªadunki atomowe (grupowe) nie s jednoznacznie zdeniowane, ani mierzalne eksperymentalnie; nie s obserwablami Mimo to s ch tnie deniowane i u»ywane przez chemików

Populacje spinowe Caªkowita populacja elektronowa atomu A (zwi zana z ªadunkiem atomowym) obejmuje zarówno elektrony o spinie α i β. Mozemy zdeniowa osobne populacje elektronów ze spinem α i β przypisanych do atomu A: N A,α i N A,β. Oczywi±cie N A = N A,α + N A,β Natomiast S A = N A,α N A,β to tzw. populacja spinowa atomu A. Wyra»a ona efektywn ilo± niesparowanych elektronów, jakie mo»na przypisa do atomu A Oczywiste relacje: A N A = N = N α + N β oraz: A S A = N α N β = 2S (S spin cz steczki)

Denicje ªadunków atomowych 1 Podziaª caªkowitej populacji elektronowej mi dzy AO przypisane do poszczególnych atomów Analizy populacyjne Mullikena, Löwdina, itp. (stosowane zarówno dla ªadunków, jak i populacji spinowych) 2 Podziaª g sto±ci elektronowej na przyczynki atomowe Analizy Hirshfelda i Badera 3 Šadunki wyznaczone z rozkªadu pot. elektrostatatycznego wokóª molekuªy ªadunki ESP

Analizy populacyjne Mullikena i Löwdina Podstaw jest nast puj cy sposób okre±lenia liczby elektronów w cz steczce: N = Tr(PS) = P ij S ij = P ij S ij, ij A i A j gdzie N Mulliken A N Löwdin A P macierz g sto±ci w bazie AO, np. w RHF P = CnC T, gdzie n = diag(2,..., 2, 0,..., 0) S macierz caªek nakªadania, S ij = χ i χ j = i A = i A P ii j P ij S ij w bazie AO (nieortogonalnej) w bazie zortogonalizowanych AO ( S = I).

Šadunki wyznaczone z rozkªadu pot. elektrostatatycznego czyli ªadunki ESP Molekularny potencjaª elektrostatyczny (g sto± elektronowa ρ = ρ( r) pochodzi z oblicze«kwantowochemicznych): V ( r) = A Z A r R A d 3 r ρ( r ) r r Model: efektywne ªadunki punktowe na atomach (w pozycjach j der) Ṽ ( r) = A Q A r R A Szukamy takich ªadunków {Q A },»eby Ṽ ( r) mo»liwie dobrze oddawaª V ( r) wokóª cz steczki (np. w wielu punktach na molekularnej powierzchni van der Waalsa; s ró»ne sposoby dobierania tych punktów).

Uwagi dot. ªadunków atomowych Ró»ne denicje daj zwykle jako±ciowo podobne przewidywania co do rozkªadu ªadunku w cz steczce. Jednak»e liczbowe warto±ci ªadunków uzyskiwane przy ró»nych denicjach nie s identyczne. Nie s te» równe ªadunkom formalnym, jakie zaznaczamy na wzorach chemicznych. Šadunki na atomach nie s obserwablami; nawet gdyby±my byli w stanie dokªadnie rozwi za elektronowe równanie Schrödingera, nie osi gn liby±my konsensusu w sprawie ich dokªadnych warto±ci! Nie ma wi kszego sensu dyskusja dokªadnych warto±ci numerycznych, jak równie» porównywanie ªadunków uzyskiwanych ró»nymi metodami. Nale»y te» pami ta,»e ªad. Mullikena i Löwdina s silnie zale»ne od u»ytej bazy funkcyjnej! Analogiczne uwagi dotycz populacji spinowych na atomach (np. denicje Mullikena, Löwdina) oraz rz dów wi za«(np. denicje Meyera, Nalewajskiego-Mrozka).

Do czego mog si przyda ªadunki atomowe? Dlaczego w takim razie lubimy dyskutowa ªadunki atomowe, czy atomowe populacje spinowe? Generalnie z tego samego powodu, dla którego lubimy modele cz steczek zbudowane z kul i pr tów cho wiemy dobrze,»e prawdziwa cz steczka tak nie wygl da. :) By Peter Murray-Rust - Peter Murray-Rust, CC BY-SA 2.5, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=771484

Do czego mog si przyda ªadunki atomowe? Dlaczego w takim razie lubimy dyskutowa ªadunki atomowe, czy atomowe populacje spinowe? Generalnie z tego samego powodu, dla którego lubimy modele cz steczek zbudowane z kul i pr tów cho wiemy dobrze,»e prawdziwa cz steczka tak nie wygl da. :) By Peter Murray-Rust - Peter Murray-Rust, CC BY-SA 2.5, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=771484 jako±ciowe zrozumienie rozkªadu ªadunku (ªadunki) czy charakteru rodnikowego (populacje spinowe) w czasteczce zrozumienie i wyja±nianie trendów w reaktywno±ci parametryzacja pól siªowych

Przykªad HCOOH, RHF/6-31G** (w pró»ni) podane ªadunki wg denicji: Mullikena / Löwdina / ESP