Polimorfizm oksydacji leków Ostateczne unieczynnienie leku w ponad 95% z następuje udziałem cytochromu P-450. Cytochrom P-450

Wielkość: px
Rozpocząć pokaz od strony:

Download "Polimorfizm oksydacji leków Ostateczne unieczynnienie leku w ponad 95% z następuje udziałem cytochromu P-450. Cytochrom P-450"

Transkrypt

1 Polimorfizm oksydacji leków Ostateczne unieczynnienie leku w ponad 95% z następuje udziałem cytochromu P-450 Cytochrom P Hemoproteina o aktywności monooksygenazy - Pełni rolę końcowej oksydazy łańcucha przekazu elektronów - Obecny w retikulum endoplazmatycznym gładkim oraz w mitochondriach - Produkty są hydrofilne, co ułatwia ich usuwanie z organizmu - Najwięcej jest go w wątrobie i rdzeniu nadnerczy - Wiele izoenzymów oksydacja leków nasercowych, psychotropowych, pochodnych morfiny - Bierze udział w metabolizmie amfetaminy (oksydacyjna deaminacja) oraz detoksykacji alkoholowej (obok dehydrogenazy alkoholowej) - liczba alleli 80, część alleli powiązano z tempem metabolizmu poszczególnych leków - Aktywność można oceniać przez genotypowanie lub fenotypowanie RH + O 2 + NADPH + H + ROH + H 2 O + NADP +

2 Izoenzymy CYP450 i ich polimorfizmy

3 przeciętnie metabolizujący Lek metabolizowany zgodnie z oczekiwaniami wolno metabolizujący Prowadzi do gromadzenia się leku w organizmie, często powyżej zakresu terapeutycznego Gen posiada mutacje zmniejszające aktywność przynajmniej jednej kopii genu szybko metabolizujący Nie osiągają stężeń terapeutycznych, za to produkt metabolizmu leku może być toksyczny dla organizmu

4 CYP2D6 Katalizuje oksydacje ponad 40 istotnych klinicznie leków: psychotropowych, beta-blokerów, pochodnych morfiny i innych Obecnie znanych jest ok. 80 alleli, wiele prowadzi do fenotypu o wolniejszym metabolizmie Duże zróżnicowanie etniczne: populacja kaukaska 7% słabych metabolizerów pozostałe rasy 1-2% we wschodniej Afryce nawet 30% populacji ma fenotyp ultra-szybko metabolizujących (amplifikacja genu)

5 Polimorfizm CYP2D6 osoby powoli metabolizujące - wzrost toksyczności -sparteina (zwiększone skurcze macicy) -flekainid (arytmie komorowe) -propafenon (skurcz oskrzeli i toksyczne działanie na ośrodkowy układ nerw.) -nortryptylina (spadek ciśnienia krwi i splątanie) -brak działania opioidów - tramadolu i kodeiny osoby szybko metabolizujące wzrost toksyczności -kodeina (depresja ośrodka oddechowego) -enkainid (arytmie komorowe) -utrata działania nortryptyliny i propafenonu

6 Farmakodynamika Polimorfizm transporterów oraz receptorów leków Udział czynnika farmakodynamicznego w farmakogenetyce mniejszy niż farmakokinetycznego istnieje wiele różnic międzygatunkowych w metabolizmie leku, ale wiele podobieństw w receptorach

7 Polimorfizm transporterów leków wystepujących w przewodzie pokarmowym, wątrobie, nerkach oraz mózgu: transportery ABC (ATP-binding transporters) białka MRP (multidrug resistance-associated protein) glikoproteina P (P-gp) produkt genu MDR (multidrug response) Pacjenci z padaczką odporną na farmakoterapię wykazują podwyższoną ekspresję P-gp i białek MRP co prowadzi do szybszego usuwania leku z rejonu działania (astrocyty, endotelialne naczynia włosowate, neurony)

8

9 Entuzjazm

10 HapMap (The Haplotype Genetic Map) katalog częstych haplotypów Haplotyp grupa wariantów genetycznych położonych blisko w genomie i dziedziczonych łącznie. CardioGene projekt, którego celem jest zidentyfikownie genetycznych markerów nawrotów zwężania naczyń krwionośnych w miejscu koronerografii (in-stent restenosis)

11

12 Realizm

13

14 Metody detekcji SNP Identyfikacja nowych polimorfizmów Poszukiwanie mutacji w oparciu o konformację jednoniciowego DNA (ang. single-strand conformation polymorphism analysis)

15 Metody wykorzystujące różnice w konformacji dwuniciowego DNA Elektroforeza wykrywająca różnice w konformacji CSGE (ang. conformationsensitive gel electrophoresis) Jedna nieprawidłowo sparowana zasada powoduje zmiany w konformacji podwójnej helisy, które wpływają na migrację w żelu. Homodupleksy (wszystkie zasady prawidłowo sparowane) i heterodupleksy (obecność nieprawidłowo sparowanych zasad) charakteryzują się odmienną ruchliwością w żelu. Łagodnie denaturujące warunki zwiększają tendencję do tworzenia form posiadających zgięcie o odmiennej ruchliwości elektroforetycznej w stosunku do homodupleksów.

16 Typ dziki Sekwencja badana 5 -TCCAGGG AGGTCCC TCC?GGG AGG?CCC TCCAGGG AGGTCCC TCCTGGG AGGACCC -5 Denaturacja 95 C Annealing 68 C Homodupleksy 5 -TCCAGGG AGGTCCC TCCTGGG AGGACCC -5 Heterodupleksy 5 -TCCAGGG AGGACCC TCCTGGG AGGTCCC -5

17 Cztery warianty sekwencji 5 TCCNGGG TCCAGGG AGGTCCC TCCTGGG AGGACCC TCCCGGG AGGGCCC TCCGGGG AGGCCCC -5 Denaturacja 95 C Annealing 68 C 5 -TCCAGGG AGGTCCC TCCTGGG AGGACCC TCCCGGG AGGGCCC TCCGGGG AGGCCCC -5 Homo dupleksy 5 -TCCAGGG AGGACCC TCCAGGG AGGCCCC TCCTGGG AGGTCCC TCCGGGG AGGTCCC TCCAGGG AGGGCCC TCCGGGG AGGGCCC TCCCGGG AGGTCCC TCCCGGG AGGCCCC -5 Hetero dupleksy 5 -TCCTGGG AGGGCCC TCCCGGG AGGACCC TCCTGGG AGGCCCC TCCGGGG AGGACCC -5

18 Cztery produkty PCR - homodupleksy 6 próbek zawierających homo- i heterodupleksy, Próbki otrzymano mieszając parami produkty PCR

19 12 heterodupleksów otrzymanych przez asymetryczny PCR

20 1. Amplifikacja fragmentu DNA zawierającego polimorfizm 2. Utworzenie heterodupleksu 3. Elektroforeza w odpowiednich warunkach COL1A1

21 Metody wykorzystujące różnice w konformacji dwuniciowego DNA c.d. Elektroforeza w gradiencie denaturującym Metoda podobna do poprzedniej, ale wymaga zastosowania żelu poliakrylamidowego o wzrastającym gradiencie denaturującym (formamid i mocznik). Zalety dokładność, niski koszt Wady trudności w optymalizacji, mała wydajność HPLC w warunkach denaturujących Analiza ruchliwości różnych heterodupleksów z zastosowaniem chromatografii w lekko denaturujących warunkach. 1. Próba badana jest hybrydyzowana z DNA typu dzikiego mieszanina hetero- i homodupleksów 2. Chromatografia w temperaturze częściowo denaturującej heterodupleksy

22 Wykrywanie nieprawidłowo sparowanych nukleotydów dzięki ich podatności na trawienie przez enzymy lub inne substancje chemiczne

23 Dimery naftyrydyny Detekcja plazmonowy rezonans powierzchniowy

24 Sekwencjonowanie metoda dla laboratoriów bogatych i wyposażonych w odpowiedni sprzęt. - metoda skuteczna, ale droga - dlatego też najpierw poszukuje się cząsteczek DNA, które potencjalnie mogą się różnić, a następnie takie wyselekcjonowane cząsteczki DNA poddaje się sekwencjonowaniu.

25 Sekwencjonowanie na dużą skalę sequencing system 454 Genome Sequencer FLX System

26 Sekwencjonowanie na dużą skalę sequencing system 454 GS Junior System Targeted Resequencing High sensitivity amplicon sequencing Perform ultra-deep sequencing of amplicons (PCR products) with the GS Junior System. Generating an average of 100,000 high quality reads per run, the system is ideally suited for detecting low level variants (<1% frequency) in pooled amplicon samples, such as viral or human DNA. For many targeted sequencing projects, dozens or hundreds of amplicons can be tiled across genomic regions of interest (i.e. disease-associated regions) and sequenced together.

27 Sekwencjonowanie na dużą skalę sequencing system 454 idea działania. Przygotowanie matrycy Ligacja adaptorów Przyłączanie do kulek magnetycznych PCR emulsyjny Pirosekwencjonowanie każdej kulki osobno (sekwencjonowanie do tys. kulek jednocześnie). Analiza wyników

28 Metody wykrywania znanych polimorfizmów wykorzystujące elektroforezę żelową PCR-RFLP Detekcja mutacji punktowej w 12 kodonie onkogenu K-ras aktywacja onkogenu, wykrywana jako brak miejsca cięcia dla enzymu MvaI. Występowanie tej mutacji stwierdzono u przynajmniej 75% chorych na nowotwór trzustki.

29 Ligacja oligonukleotydów (ang. oligonucleotides ligation assay genotyping OLA) - metoda jest szybka, specyficzna, czuła - OLA wymaga trzech oligonukleotydów: 1. specyficznego dla allelu typu dzikiego 2. specyficznego dla allelu zmutowanego 3. sonda wspólna dla obu alleli - Strategia Oli połączenie dwóch oligonukleotydów (sondy wspólnej dla obu alleili i jednego oligonukleotydu specyficznego) przez ligazę pod warunkiem, że uległy one hybrydyzacji z matrycą - Specyficzność ligacji wynika z trzech czynników: 1. oligonukleotydy hybrydyzują do sekwencji komplementarnych 2. oligonukleotydy muszą przyłączyć się do matrycy dokładnie jeden za drugim 3. w miejscu połączenia oligonukleotydów muszą one być idealnie komplementarne do matrycy.

30 Metody o dużej wydajności nie wykorzystujące elektroforezy żelowej 1. Metody wykorzystujące FRET (ang. Fluorescence resonance energy transfer) FRET

31 Analiza TaqMan (ang. TaqMan Allelic Discrimination assay) Wykorzystuje 5 nukleazową aktywnośćtaq polimerazy do detekcji sygnału fluorescencyjnego powstającego w czasie lub po PCR Dwie sondy TaqMan różniące się w miejscu polimorficznym posiadające na 5 końcu znacznik reporterowy i na 3 końcu znacznik wyciszający Jeśli sondy są nienaruszone fluorescencja jest wyciszana Podczas annealingu sondy hybrydyzują do matrycy, podczas etapu wydłużania starterów znacznik reporterowy jest uwalniany przez 5 nukleazową aktywność Taq polimerazy wzrost fluorescencji charakterystycznej dla danego znacznika reporterowego Wynik pomiar intensywności sygnału fluorescencyjnego właściwego dla dwóch różnych znaczników reporterowych po zakończeniu PCR

32

33 Molecular beacons MB to sondy oligonukleotydowe posiadające na swych końcach wzajemnie komplementarne fragmenty flankujące segment komplementarny do sekwencji docelowej zawierającej miejsce polimorficzne Na przeciwległych końcach sondy znajdują się znaczniki donorowe i akceptorowe Jeśli sonda nie hybrydyzuje do sekwencji docelowej przyjmuje strukturę spinki do włosów, znaczniki są blisko siebie sygnał nie powstaje Kiedy sonda hybrydyzuje, znaczniki są odseparowane i następuje gwałtowny wzrost sygnału fluorescencyjnego

34 - Istota metody hybrydy posiadające nie wszystkie sparowane zasady dysocjują w temperaturach niższych niż hybrydy o pełnej komplementarności - W teście, w tej samej reakcji PCR stosuje się dwie sondy jedną komplementarną do sekwencji typu dzikiego, drugą do zmutowanej - Te dwie sondy są znakowane różnymi znacznikami fluorescencyjnymi

35 Test intruza (ang. Invader assay) - Pozwala wykrywać SNP bez stosowania PCR - Wymaga zastosowania dwóch sond sygnałowych homologicznej do sekwencji typu dzikiego i zmutowanej oraz sondy intruza, hybrydyzującej powyżej sond sygnałowych - Istota metody: jeśli dwa hybrydyzujące z tą samą nicią oligonukleotydy nakładają się przynajmniej 1 nukleotydem powstaje struktura rozpoznawana i trawiona przez enzym Cleavase - Brak idealnego sparowania powyżej miejsca cięcia powoduje powstanie struktury, która nie jest rozpoznawana przez enzym -Sonda sygnałowa posiada FLAP ze nacznikiem reporterowym, jego sygnał jest wyciszany przez drugi znacznik znajdujący się w części zlokalizowanej po drugiej stronie miejsca cięcia - Przecięta sonda dysocjuje i przyłącza się następna amplifikacja sygnału

36 Serial invasive signal amplification reaction (SISAR)

37 Ligacja znakowanych oligonukleotydów DOL (dye-labeled oligonucleotide ligation) Łączy metody OLA i FRET Wymaga starterów PCR o wysokich temperaturach topnienia oraz trzech znakowanych sond ligacyjnych o niskich temperaturach topnienia Jedna z sond jest wspólna dla typu dzikiego i zmutowanego, posiada na 5 końcu znacznik donorowy, ta sonda kończy się tuż powyżej miejsca polimorficznego Dwie pozostałe sondy są specyficzne dla dzikiego lub zmutowanego allelu i mają na końcach 5 nukleotyd polimorficzny, natomiast na końcach 3 różne znaczniki akceptorowe Pierwsza część reakcji PCR odbywa się wysokich temperaturach, amplifikowana jest odpowiednia ilość produktu, a sondy ligacyjne nie są w stanie hybrydyzować W drugim etapie temperatura jest niższa i następuje ligacja sondy wspólnej z odpowiednią sondą specyficzną dla danego allelu sygnał fluorescencyjny

38 ASO

39 ASO

40 Microarray, Chip DNA, mikropanel Silikonowe płytki o powierzchni 2 cm 2 lub mniejszej, z gęsto rozmieszczonymi w znanym porządku oligonukleotydami 10 6 ASO na 2 cm 2 Testowany DNA jest amplifikowany w reakcji PCR i jednocześnie znakowany fluorescencyjnie, a następnie nanoszony na powierzchnię płytki. Każdy oligonukleotyd na chipie działa jak sonda specyficzna dla allelu. Jeśli dana sonda jest w pełni komplementarna do testowanego DNA, to hybrydyzuje bardziej wydajnie i sygnał fluorescencyjny powstający w danym miejscu jest silniejszy niż tam, gdzie znajdują się oligonukleotydy nie w pełni komplementarne Microarray zawiera dziesiatki, a nawet setki sond do detekcji każdego SNP Sygnały fluorescencyjne są mierzone przez skanery o wysokiej rozdzielczości

41 The Colors of a Microarray In this schematic: GREEN represents Control DNA RED represents Sample DNA YELLOW represents a combination of Control and Sample DNA, where both hybridized equally to the target DNA. BLACK represents areas where neither the Control nor Sample DNA hybridized to the target DNA.

42 Dynamiczna hybrydyzacja specyficzna dla allelu (ang. Dynamic allele-specific hybridization DASH) Hybrydyzacja zachodzi w roztworze na przykład na płytce titracyjnej, jest wykrywana za pomocą znacznika fluorescencyjnego, który wiąże się tylko z dwuniciowym DNA sygnał jest emitowany tylko wtedy, gdy zachodzi hybrydyzacja Początkowo warunki (temperatura) pozwalają na hybrydyzację nawet wówczas, gdy w hybrydach istnieją pojedyncze niesparowane zasady badany DNA i oligonukleotydy hybrydyzują niezależnie od tego, który allel występuje w badanym DNA Allele można rozróżnić podnosząc temperaturę hybrydy z niesparowanymi zasadami są mniej stabilne niż pełne hybrydy i rozpadają się w niższej temperaturze Temperatura rozpadu hybrydy (zanik sygnału) mówi o tym jaki allel znajduje się w badanym DNA.

43 DASH A well functioning DASH assay will produce the following results: The blue line is for a homozygous match, the purple line for a heterozygote, and the yellow line is for a homozygous mismatch.

44 Wydłużanie startera specyficzne dla allelu Stosuje się dwa startery łączące się do sekwencji powyżej SNP, posiadające na 3 końcu nukleotyd komplementarny do odróżniającego allele. Tylko całkowicie komplementarny starter jest wydłużany

45 Wydłużanie jednonukleotydowe z detekcją fluorescencyjną Starter do sekwencjonowania jest projektowany tak, aby kończył się bezpośrednio powyżej miejsca polimorficznego W obecności dideoksynukleotydów znakowanych różnymi znacznikami fluorescencyjnymi do startera przyłączany jest dideoksynukleotyd specyficzny dla danego allelu

46 Minisequencing-arrayed primer extension (APEX) Wykrywanie 3 SNP: SNP1 A/G SNP2 G/C SNP3 C/T Array of arrays

47 Wbudowywanie nukleotydu specyficzne dla allelu Pyrosequencing Wykrywa nukleotyd wbudowany de novo w oparciu o specyficzną matrycę. Idea metody wbudowaniu nukleotydu towarzyszy uwolnienie reszty pirofosforanowej, która jest włączana do ATP, ATP stymuluje lucyferazę, jej aktywacja powoduje emisję światła.

48 Polymerase catalyzes incorporation of nucleotide(s) into a nucleic acid chain. A PPi molecule(s) is released. (a and c) The PPi is converted to ATP by ATP sulfurylase using adenosine phosphosulfate (APS) as substrate and (b) the PPi molecule is converted to ATP by phosphopyruvate dikinase (PPDK) using phosphoenol pyruvate (PEP) as substrate (developed by Hitachi). Generated ATP is subsequently sensed by luciferase and proportional amount of light is produced when luciferin is oxidized. Unreacted nucleotide is either removed by washing (a and b) or enzymatically (c) to allow iterative addition of nucleotides.

Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi

Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego

Bardziej szczegółowo

PCR. Aleksandra Sałagacka

PCR. Aleksandra Sałagacka PCR Aleksandra Sałagacka Reakcja PCR naśladuje proces replikacji DNA in vitro pozwala na amplifikację określonego krótkiego (kilkadziesiąt kilka tys.pz) fragmentu DNA obecnie najważniejsze narzędzie biologii

Bardziej szczegółowo

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane

Bardziej szczegółowo

Farmakogenetyka Biotechnologia Medyczna I o

Farmakogenetyka Biotechnologia Medyczna I o ĆWICZENIE 2 Oznaczanie polimorfizmu cytochromu CYP2D6 za pomocą tradycyjnych metod biologii molekularnej: PCR-RFLP I. Łańcuchowa reakcja polimerazy PCR (polymerase chain reaction) Technika PCR rozwinęła

Bardziej szczegółowo

Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny

Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom

Bardziej szczegółowo

TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR DIAGNOSTICS OF MONOGENIC DISORDERS

TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR DIAGNOSTICS OF MONOGENIC DISORDERS Nowiny Lekarskie 2006, 75, 5, 486 490 ALINA LICZBAŃSKA, ANNA WOŹNIAK, ANNA WAWROCKA, MACIEJ R. KRAWCZYŃSKI TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR

Bardziej szczegółowo

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności

Bardziej szczegółowo

dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG Publikacja współfinansowana ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego

dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG Publikacja współfinansowana ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego Wk Wykrywanie polimorfizmów i mutacji Badania przesiewowe mutacji Wykrywanie znanych mutacji punktowych dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG Publikacja współfinansowana ze środków Unii Europejskiej

Bardziej szczegółowo

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA

Bardziej szczegółowo

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych

Bardziej szczegółowo

PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego

PL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności

Bardziej szczegółowo

PCR - ang. polymerase chain reaction

PCR - ang. polymerase chain reaction PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu

Bardziej szczegółowo

PCR - ang. polymerase chain reaction

PCR - ang. polymerase chain reaction PCR - ang. polymerase chain reaction Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu DNA) Jest to reakcja powielania (replikacji)

Bardziej szczegółowo

Zastosowanie transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET) w ilościowej metodzie oznaczania ekspresji genów na przykładzie sondy TaqMan

Zastosowanie transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET) w ilościowej metodzie oznaczania ekspresji genów na przykładzie sondy TaqMan Anna KOZIOROWSKA, Maria ROMEROWICZ-MISIELAK Uniwersytet Rzeszowski, Polska Zastosowanie transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET) w ilościowej metodzie oznaczania ekspresji genów na przykładzie

Bardziej szczegółowo

Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych

Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenia 1 Wirtualne Klonowanie Prowadzący: mgr inż. Joanna Tymeck-Mulik i mgr Lidia Gaffke. Część teoretyczna:

Ćwiczenia 1 Wirtualne Klonowanie Prowadzący: mgr inż. Joanna Tymeck-Mulik i mgr Lidia Gaffke. Część teoretyczna: Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią Biologia II rok ===============================================================================================

Bardziej szczegółowo

INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA

INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA XX Międzynarodowa konferencja Polskie Stowarzyszenie Choroby Huntingtona Warszawa, 17-18- 19 kwietnia 2015 r. Metody badań i leczenie choroby Huntingtona - aktualności INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH

Bardziej szczegółowo

Mikrosatelitarne sekwencje DNA

Mikrosatelitarne sekwencje DNA Mikrosatelitarne sekwencje DNA Małgorzata Pałucka Wykorzystanie sekwencji mikrosatelitarnych w jądrowym DNA drzew leśnych do udowodnienia pochodzenia materiału dowodowego w postępowaniu sądowym 27.09.2012

Bardziej szczegółowo

7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej

7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej 7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej 7.2. Metody biologii molekularnej (technika PCR, sekwencjonowanie DNA) wykorzystywane w taksonomii roślin Autor: Magdalena Dudek

Bardziej szczegółowo

Optymalizacja warunków reakcji PCR w gradiencie temperatury i magnezu

Optymalizacja warunków reakcji PCR w gradiencie temperatury i magnezu Protokół pochodzi ze strony molekularnie.wordpress.com Kopiowanie i rozpowszechnianie wyłącznie w całości, z zachowaniem praw autorskich zgodnie z zasadami licencji GNU Dziękuję za uszanowanie mojej pracy,

Bardziej szczegółowo

2016-01-14. Sekwencje mikrosatelitarne. SNP Single Nucleotide Polymorphism (mutacje punktowe, polimorfizm jednonukleotydowy)

2016-01-14. Sekwencje mikrosatelitarne. SNP Single Nucleotide Polymorphism (mutacje punktowe, polimorfizm jednonukleotydowy) Sekwencje mikrosatelitarne Próba nr 1 GGGGGGGGGGGG 4x GG Próba nr 2 GGGGGGGGGGGGGGGG 6x GG Próba nr 1 GGGGGGGGG Próba nr 2 GGG GGGG SNP Single Nucleotide Polymorphism (mutacje punktowe, polimorfizm jednonukleotydowy)

Bardziej szczegółowo

GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE

GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE GENOMIKA. MAPOWANIE GENOMÓW MAPY GENOMICZNE Bioinformatyka, wykład 3 (21.X.2008) krzysztof_pawlowski@sggw.waw.pl tydzień temu Gen??? Biologiczne bazy danych historia Biologiczne bazy danych najważniejsze

Bardziej szczegółowo

ŁAŃCUCHOWA REAKCJA POLIMERAZY Z ANALIZĄ W CZASIE RZECZYWISTYM (RT-PCR) REAL-TIME POLYMERASE CHAIN REACTION (RT-PCR)

ŁAŃCUCHOWA REAKCJA POLIMERAZY Z ANALIZĄ W CZASIE RZECZYWISTYM (RT-PCR) REAL-TIME POLYMERASE CHAIN REACTION (RT-PCR) A N N A L E S A C A D E M I A E M E D I C A E S T E T I N E N S I S R O C Z N I K I P O M O R S K I E J A K A D E M I I M E D Y C Z N E J W S Z C Z E C I N I E 2007, 53, 3, 5 9 KATARZYNA WIEDRO, EWA STACHOWSKA,

Bardziej szczegółowo

Techniki biologii molekularnej przydatne w diagnostyce onkologicznej. Prof. Barbara Pieńkowska-Grela

Techniki biologii molekularnej przydatne w diagnostyce onkologicznej. Prof. Barbara Pieńkowska-Grela Techniki biologii molekularnej przydatne w diagnostyce onkologicznej Prof. Barbara Pieńkowska-Grela Warszawa, 9 czerwca 2015 Badanie genetyczne w nowotworach polega na stwierdzeniu obecności i określeniu

Bardziej szczegółowo

AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)

AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość

Bardziej szczegółowo

prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie

prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO

Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA

Bardziej szczegółowo

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU PCR sposób na DNA.

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU PCR sposób na DNA. SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU PCR sposób na DNA. SPIS TREŚCI: 1. Wprowadzenie. 2. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. 3. Karty pracy. 1. Karta

Bardziej szczegółowo

Przykładowe zadania. przygotowujące do egzaminu maturalnego

Przykładowe zadania. przygotowujące do egzaminu maturalnego Przykładowe zadania z BIOLOGii przygotowujące do egzaminu maturalnego Prezentowane zadania są zgodne z podstawą programową kształcenia ogólnego w zakresie rozszerzonym i podstawowym. Prócz zadań, które

Bardziej szczegółowo

2015-11-18. DNA i RNA ENZYMY MODYFIKUJĄCE KOŃCE CZĄSTECZEK. DNA i RNA. DNA i RNA

2015-11-18. DNA i RNA ENZYMY MODYFIKUJĄCE KOŃCE CZĄSTECZEK. DNA i RNA. DNA i RNA Fosfataza alkaliczna CIP Calf Intestine Phosphatase- pochodzenie: jelito cielęce BAP Bacterial Alcaline Phosphatase- pochodzenie: E. coli SAP Shrimp Alcaline Phosphatase- pochodzenie: krewetki Pandalus

Bardziej szczegółowo

dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG

dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG Metody amplifikacji kwasów nukleinowych dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii PG Publikacja współfinansowana ze środków Unii Europejskiej pj j w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego Amplifikacja

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.

Bardziej szczegółowo

Techniki molekularne wykorzystywane w diagnostyce lekooporności związanej z transporterami nadrodziny ABC

Techniki molekularne wykorzystywane w diagnostyce lekooporności związanej z transporterami nadrodziny ABC diagnostyka laboratoryjna Journal of Laboratory Diagnostics 2011 Volume 47 Number 2 205-209 Praca poglądowa Review Article Techniki molekularne wykorzystywane w diagnostyce lekooporności związanej z transporterami

Bardziej szczegółowo

Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy

Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy Praca wykonana pod kierunkiem dr hab. Tomasza Grzybowskiego w Katedrze Medycyny Sądowej w Zakładzie Genetyki Molekularnej

Bardziej szczegółowo

Organizacja genomu człowieka i sekwencjonowanie DNA

Organizacja genomu człowieka i sekwencjonowanie DNA Organizacja genomu człowieka i sekwencjonowanie DNA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Organizacja genów na ludzkim chromosomie.

Bardziej szczegółowo

Zmienność genomu. Przyczyny, skutki i sposoby kontroli

Zmienność genomu. Przyczyny, skutki i sposoby kontroli Zmienność genomu Przyczyny, skutki i sposoby kontroli Zmienność genomu Przez zmienność genomu (polimorfizm) rozumiemy różnice w sekwencji DNA genomowego pomiędzy osobnikami jednego gatunku. Wyróżniamy:

Bardziej szczegółowo

Polimorfizm genetyczny wybranych alleli cytochromu CYP2D6 u pacjentów z kardiomiopatią rozstrzeniową i zapaleniem mięśnia sercowego* 1

Polimorfizm genetyczny wybranych alleli cytochromu CYP2D6 u pacjentów z kardiomiopatią rozstrzeniową i zapaleniem mięśnia sercowego* 1 PRACA ORYGINALNA Polimorfizm genetyczny wybranych alleli cytochromu CYP2D6 u pacjentów z kardiomiopatią rozstrzeniową i zapaleniem mięśnia sercowego* 1 Genetical polymporphism of chosen CYP2D6 alleles

Bardziej szczegółowo

Materiał i metody. Wyniki

Materiał i metody. Wyniki Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).

Bardziej szczegółowo

Nanotechnologie w diagnostyce

Nanotechnologie w diagnostyce Nanotechnologie w diagnostyce Diagnostyka endoskopowa Nanotechnologie mogą być przydatne w diagnostyce niedostępnych miejsc w badaniach endoskopowych. Temu mogą służyć mikrokamery wielkości antybiotyku,

Bardziej szczegółowo

Diagnostyka molekularna w OIT

Diagnostyka molekularna w OIT Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C

Bardziej szczegółowo

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9 Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara

Bardziej szczegółowo

Stowarzyszenie na Rzecz Dzieci z Zaburzeniami Genetycznymi Badania molekularne

Stowarzyszenie na Rzecz Dzieci z Zaburzeniami Genetycznymi Badania molekularne http://www.genetyka-ginekolog.pl/ Techniki molekularne z przykładami Jedną z podstawowych technik wykorzystywanych w genetyce molekularnej jest RFLP (ang. restriction fragments length polymorphism, czyli

Bardziej szczegółowo

Izolowanie i amplifikacja kwasów nukleinowych

Izolowanie i amplifikacja kwasów nukleinowych ROZDZIAŁ 4 Izolowanie i amplifikacja kwasów nukleinowych Wojciech Garczorz Diagnostyka molekularna jest obecnie najszybciej rozwijającym się działem diagnostyki medycznej. W wielu dziedzinach medycyny

Bardziej szczegółowo

PROJEKT WSPÓŁFINANSOWANY PRZEZ UNIĘ EUROPEJSKĄ Z EUROPEJSKIEGO FUNDUSZU ROZWOJU REGIONALNEGO 1 z 7

PROJEKT WSPÓŁFINANSOWANY PRZEZ UNIĘ EUROPEJSKĄ Z EUROPEJSKIEGO FUNDUSZU ROZWOJU REGIONALNEGO 1 z 7 Poznań, dnia 28.04.2014 r. BioVentures Institute Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością ul. Promienista 83 60 141 Poznań Zapytanie ofertowe nr 01/2014 Projekt Nowa technologia wytwarzania szczepionek

Bardziej szczegółowo

Biologia Molekularna Podstawy

Biologia Molekularna Podstawy Biologia Molekularna Podstawy Budowa DNA Budowa DNA Zasady: Purynowe: adenina i guanina Pirymidynowe: cytozyna i tymina 2 -deoksyryboza Grupy fosforanowe Budowa RNA Budowa RNA Zasady: purynowe: adenina

Bardziej szczegółowo

Techniki molekularne w mikrobiologii SYLABUS A. Informacje ogólne

Techniki molekularne w mikrobiologii SYLABUS A. Informacje ogólne Techniki molekularne w mikrobiologii A. Informacje ogólne Elementy sylabusu Nazwa jednostki prowadzącej kierunek Nazwa kierunku studiów Poziom kształcenia Profil studiów Forma studiów Rodzaj Rok studiów

Bardziej szczegółowo

Analiza mutacji p.d36n i p.n318s oraz polimorfizmu p.s474x genu lipazy lipoproteinowej u chorych z hipercholesterolemią rodzinną.

Analiza mutacji p.d36n i p.n318s oraz polimorfizmu p.s474x genu lipazy lipoproteinowej u chorych z hipercholesterolemią rodzinną. Analiza mutacji p.d36n i p.n318s oraz polimorfizmu p.s474x genu lipazy lipoproteinowej u chorych z hipercholesterolemią rodzinną. Monika śuk opiekun: prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład

Bardziej szczegółowo

biologia molekularna CLONTECH

biologia molekularna CLONTECH biologia molekularna CLONTECH Clontech Laboratoires to najnowszy członek Takara Bio Group, która jest światowym liderem w produkcji rozwiązań dedykowanych technikom molekularnym. Dostarczając odczynniki,

Bardziej szczegółowo

Justyna Krystyna Ciepły Nr albumu 41624. Charakterystyka lekoopornych szczepów wirusa HIV 1 izolowanych w Polsce w 2008 roku

Justyna Krystyna Ciepły Nr albumu 41624. Charakterystyka lekoopornych szczepów wirusa HIV 1 izolowanych w Polsce w 2008 roku Warszawski Uniwersytet Medyczny Wydział Farmaceutyczny Oddział Analityki Medycznej Justyna Krystyna Ciepły Nr albumu 41624 Charakterystyka lekoopornych szczepów wirusa HIV 1 izolowanych w Polsce w 2008

Bardziej szczegółowo

Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów

Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów DNA and RNA analyses in detection of genetic predisposition to cancer 2 Streszczenie W ostatnich latach obserwuje się

Bardziej szczegółowo

AmpliQ 5x HOT EvaGreen HRM Mix (ROX)

AmpliQ 5x HOT EvaGreen HRM Mix (ROX) Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com AmpliQ 5x HOT EvaGreen HRM Mix (ROX) Gotowy premix zawierający

Bardziej szczegółowo

(12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) (13) T3 (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego: 20.07.2007 07787764.

(12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) (13) T3 (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego: 20.07.2007 07787764. RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) PL/EP 4698 (13) T3 (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego:.07.07 07787764. (1) Int. Cl. C12Q1/68 (06.01) (97) O udzieleniu

Bardziej szczegółowo

MIKROMACIERZE. dr inż. Aleksandra Świercz dr Agnieszka Żmieńko

MIKROMACIERZE. dr inż. Aleksandra Świercz dr Agnieszka Żmieńko MIKROMACIERZE dr inż. Aleksandra Świercz dr Agnieszka Żmieńko Informacje ogólne Wykłady będą częściowo dostępne w formie elektronicznej http://cs.put.poznan.pl/aswiercz aswiercz@cs.put.poznan.pl Godziny

Bardziej szczegółowo

Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym

Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym mgr Magdalena Brzeskwiniewicz Promotor: Prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Gdański Uniwersytet Medyczny

Bardziej szczegółowo

Zastosowanie Y-SNPs w genetyce sądowej Application of Y-SNPs in forensic genetics

Zastosowanie Y-SNPs w genetyce sądowej Application of Y-SNPs in forensic genetics ARCH. MED. SĄD. KRYMINOL., 2011, LXI, 161-169 PRACE ORYGINALNE / ORIGINAL PAPERS Monica Abreu-Głowacka¹, Małgorzata Koralewska-Kordel¹, Eliza Michalak¹, Czesław Żaba¹, Zygmunt Przybylski² Zastosowanie

Bardziej szczegółowo

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość* Poznao, 6 lutego 2012 r. Zapytanie ofertowe nr 001 /2012 dotyczące zakupu odczynników chemicznych do izolacji DNA i reakcji PCR GENESIS Polska Sp. z o.o Ul. Za Cytadelą 19, 61-659 Poznao NIP 778 13 56

Bardziej szczegółowo

Replikacja DNA. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.

Replikacja DNA. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Replikacja DNA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Replikacja DNA jest bardzo złożonym procesem, w którym biorą udział setki

Bardziej szczegółowo

Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków.

Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków. Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków. Katarzyna Mazur-Kominek Współautorzy Tomasz Romanowski, Krzysztof P. Bielawski, Bogumiła Kiełbratowska, Magdalena Słomińska-

Bardziej szczegółowo

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki

Bardziej szczegółowo

Agata Kodroń, Edyta Rychlicka, Iwona Milewska, Marcin Woźniak, Tomasz Grzybowski WSTĘP

Agata Kodroń, Edyta Rychlicka, Iwona Milewska, Marcin Woźniak, Tomasz Grzybowski WSTĘP ARCH. MED. SĄD. KRYMINOL., 2010, LX, 243-247 PRACE ORYGINALNE / ORIGINALS Agata Kodroń, Edyta Rychlicka, Iwona Milewska, Marcin Woźniak, Tomasz Grzybowski Analiza danych populacyjnych loci ministr: D10S1248,

Bardziej szczegółowo

LRN - Laboratory Response Network

LRN - Laboratory Response Network LRN - Laboratory Response Network Sieć laboratoriów w USA, które będą zdolne do szybkiej odpowiedzi na zagrożenie związane z uwolnieniem czynników zakaźnych lub w przypadku użycia toksyn lub pojawienia

Bardziej szczegółowo

Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA)

Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA) Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA) RAPORT GENETYCZNY Wyniki testu dla Pacjent Testowy Pacjent Pacjent Testowy ID pacjenta 0999900004112 Imię i nazwisko pacjenta Pacjent Testowy

Bardziej szczegółowo

GENETYKA POPULACYJNA LOCUS D19S433 W REGIONIE POLSKI PÓŁNOCNEJ POPULATION GENETICS OF THE D19S433 LOCUS IN THE NORTHERN POLAND

GENETYKA POPULACYJNA LOCUS D19S433 W REGIONIE POLSKI PÓŁNOCNEJ POPULATION GENETICS OF THE D19S433 LOCUS IN THE NORTHERN POLAND Ann. Acad. Med. Gedan., 2005, 35, 181 185 JOANNA WYSOCKA, EWA KAPIŃSKA, KRZYSZTOF RĘBAŁA, ZOFIA SZCZERKOWSKA, LIDIA CYBULSKA GENETYKA POPULACYJNA LOCUS D19S433 W REGIONIE POLSKI PÓŁNOCNEJ POPULATION GENETICS

Bardziej szczegółowo

Spis treści. Aparatura

Spis treści. Aparatura Spis treści Aparatura I. Podstawowe wyposażenie laboratoryjne... 13 I.I. Probówki i naczynia laboratoryjne... 13 I.II. Pipety... 17 I.II.I. Rodzaje pipet automatycznych... 17 I.II.II. Techniki pipetowania...

Bardziej szczegółowo

Pytania Egzamin Licencjacki. 1. Wyjaśnij pojęcie: szybkość reakcji enzymatycznej. Omów metodę wyznaczenia szybkości reakcji enzymatycznej.

Pytania Egzamin Licencjacki. 1. Wyjaśnij pojęcie: szybkość reakcji enzymatycznej. Omów metodę wyznaczenia szybkości reakcji enzymatycznej. Pytania Egzamin Licencjacki Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii UG i GUMed 1. Wyjaśnij pojęcie: szybkość reakcji enzymatycznej. Omów metodę wyznaczenia szybkości reakcji enzymatycznej. 2. Wyjaśnij

Bardziej szczegółowo

Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149. Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny

Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149. Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny Rocz. Nauk. Zoot., T. 37, z. 2 (2010) 145 149 Identyfikacja sekwencji genu kodującego dehydrogenazę NADH 1 u sarny M a ł g o r z a t a N a t o n e k - W i ś n i e w s k a, E w a S ł o t a Instytut Zootechniki

Bardziej szczegółowo

OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII

OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII Opracowanie zestawu do wykrywania DNA Aspergillus flavus za pomocą specjalistycznego sprzętu medycznego. Jednym

Bardziej szczegółowo

Interdyscyplinarny charakter badań równoważności biologicznej produktów leczniczych

Interdyscyplinarny charakter badań równoważności biologicznej produktów leczniczych Interdyscyplinarny charakter badań równoważności biologicznej produktów leczniczych Piotr Rudzki Zakład Farmakologii, w Warszawie Kongres Świata Przemysłu Farmaceutycznego Łódź, 25 VI 2009 r. Prace badawczo-wdrożeniowe

Bardziej szczegółowo

MARKERY MIKROSATELITARNE

MARKERY MIKROSATELITARNE MARKERY MIKROSATELITARNE Badania laboratoryjne prowadzone w Katedrze Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt SGGW w ramach monitoringu genetycznego wykorzystują analizę genetyczną markerów mikrosatelitarnych.

Bardziej szczegółowo

Parametr Wymagany parametr Oferowany parametr 1. 2. 3. a) z wbudowaną pompą membranową PTEE, b) kondensorem par, System

Parametr Wymagany parametr Oferowany parametr 1. 2. 3. a) z wbudowaną pompą membranową PTEE, b) kondensorem par, System Załącznik nr 1A do SIWZ. PARAMETRY TECHNICZNE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Zadanie nr 1. TERMOSTAT CYRKULACYJNY Termostat cyrkulacyjny Z grzaniem i chłodzeniem Zakres temperatury roboczej 25 o C do + 200 o C

Bardziej szczegółowo

Screening, klonowanie, ekspresja i oczyszczanie białek

Screening, klonowanie, ekspresja i oczyszczanie białek Screening, klonowanie, ekspresja i oczyszczanie białek Kiedy gen jest znany Dostępna sekwencja DNA sekwencjonowanie genomu, biblioteki Dostępna sekwencja białka sekwencjonowanie białka Techniki pozyskania

Bardziej szczegółowo

ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁ ODOWSKA LUBLIN POLONIA

ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁ ODOWSKA LUBLIN POLONIA ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁ ODOWSKA LUBLIN POLONIA VOL. LXIII (3) SECTIO DD 2008 Katedra Hodowli Amatorskich i Zwierząt Dzikich Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie 20-950 Lublin, ul. Akademicka

Bardziej szczegółowo

Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów

Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów Grzegorz Kurzawski, Joanna Matyjasik Analizy molekularne DNA i RNA w wykrywaniu dziedzicznych predyspozycji do nowotworów W ostatnich latach zidentyfikowano szereg genów, których mutacje odpowiedzialne

Bardziej szczegółowo

Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów

Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:

Bardziej szczegółowo

(12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) PL/EP 1652937. (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego: 18.10.2005 05256463.

(12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) PL/EP 1652937. (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego: 18.10.2005 05256463. RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) PL/EP 1652937 (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego: 18.10.2005 05256463.0 (13) (51) T3 Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01)

Bardziej szczegółowo

ĆWICZENIA Z BIOCHEMII

ĆWICZENIA Z BIOCHEMII ĆWICZENIA Z BIOCHEMII D U STUDENTfiW WYDZIAŁU LEKARSKIEGO Pod redakcją Piotra Laidlera, Barbary Piekarskiej, Marii Wróbel WYDAWNICTWO UNIWERSYTETU JAGIELLOŃSKIEGO ĆWICZENIA Z BIOCHEMII DLA STUDENTÓW WYDZIAŁU

Bardziej szczegółowo

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza jest podstawową techniką wizualizacji kwasów nukleinowych pozwala bezpośrednio identyfikować cząsteczki DNA i jest stosunkowo czuła (po odpowiednim wybarwieniu

Bardziej szczegółowo

Nowe terapie choroby Huntingtona. Grzegorz Witkowski Katowice 2014

Nowe terapie choroby Huntingtona. Grzegorz Witkowski Katowice 2014 Nowe terapie choroby Huntingtona Grzegorz Witkowski Katowice 2014 Terapie modyfikujące przebieg choroby Zahamowanie produkcji nieprawidłowej huntingtyny Leki oparte o palce cynkowe Małe interferujące RNA

Bardziej szczegółowo

Gen choroby Huntingtona, dwadzieścia lat później

Gen choroby Huntingtona, dwadzieścia lat później Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD. Czy nowa technika zrewolucjonizuje testy genetyczne na chorobę Huntingtona? Zaprezentowano

Bardziej szczegółowo

MARKERY MOLEKULARNE dr Janusz Piechota dr Magdalena Wołoszyńska Plan wykładów:

MARKERY MOLEKULARNE dr Janusz Piechota dr Magdalena Wołoszyńska Plan wykładów: MARKERY MOLEKULARNE dr Janusz Piechota dr Magdalena Wołoszyńska Plan wykładów: Definicja słowa marker Markery związane z kwasami nukleinowymi rodzaje wykrywanie zastosowanie w diagnostyce medycznej, medycynie

Bardziej szczegółowo

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do

Bardziej szczegółowo

6. Z pięciowęglowego cukru prostego, zasady azotowej i reszty kwasu fosforowego, jest zbudowany A. nukleotyd. B. aminokwas. C. enzym. D. wielocukier.

6. Z pięciowęglowego cukru prostego, zasady azotowej i reszty kwasu fosforowego, jest zbudowany A. nukleotyd. B. aminokwas. C. enzym. D. wielocukier. ID Testu: F5679R8 Imię i nazwisko ucznia Klasa Data 1. Na indywidualne cechy danego osobnika ma (maja) wpływ A. wyłacznie czynniki środowiskowe. B. czynniki środowiskowe i materiał genetyczny. C. wyłacznie

Bardziej szczegółowo

AmpliTest TBEV (Real Time PCR)

AmpliTest TBEV (Real Time PCR) AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej

Bardziej szczegółowo

Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych

Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych Systemy Inteligencji Obliczeniowej Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych Kornel Chromiński Instytut Informatyki Uniwersytet Śląski Plan prezentacji Dane mikromacierzowe Cel badań Prezentacja

Bardziej szczegółowo

GENOMIKA PROTEOMIKA METABOLOMIKA

GENOMIKA PROTEOMIKA METABOLOMIKA GENOMIKA PROTEOMIKA METABOLOMIKA TRANSKRYPTOMIKA Metody sztucznej rekombinacji DNA nie tylko umożliwiły powstanie nowych niezwykle użytecznych narzędzi do badania podstawowych mechanizmów funkcjonowania

Bardziej szczegółowo

Indywidualizacja farmakoterapii farmakogenetyka

Indywidualizacja farmakoterapii farmakogenetyka FARMAKOGENETYKA Indywidualizacja farmakoterapii farmakogenetyka Prof. UM dr hab. Przemysław Mikołajczak Katedra i Zakład Farmakologii Uniwersytet Medyczny im. K. Marcinkowskiego w Poznaniu Zależność między

Bardziej szczegółowo

Dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii, Politechnika Gdańska

Dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii, Politechnika Gdańska Narzędzia diagnostyki molekularnej w typowaniu genetycznym (genotypowaniu) Dr hab. Beata Krawczyk Katedra Mikrobiologii, Politechnika Gdańska Publikacja współfinansowana ze środków Unii Europejskiej w

Bardziej szczegółowo

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza kwasów nukleinowych Elektroforeza jest podstawową techniką wizualizacji kwasów nukleinowych pozwala bezpośrednio identyfikować cząsteczki DNA i jest stosunkowo czuła (po odpowiednim wybarwieniu

Bardziej szczegółowo

Hybrydyzacja kwasów nukleinowych metodą Southerna

Hybrydyzacja kwasów nukleinowych metodą Southerna Hybrydyzacja kwasów nukleinowych metodą Southerna ENZYMY SŁUŻĄCE DO MANIPULACJI DNA KATEGORIA FUNKCJA CHARAKTERYSTYKA PRZYKŁADY POLIMERAZY synteza nowych polinukleotydów komplementarnych do istniejącej

Bardziej szczegółowo

DNA musi współdziałać z białkami!

DNA musi współdziałać z białkami! DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji

Bardziej szczegółowo

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.

Bardziej szczegółowo

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 10 Wykrywanie GMO metodą ilościowego PCR F. Weighardt WORLD HEALTH ORGANIZATION REGIONAL OFFICE FOR EUROPE ORGANISATION

Bardziej szczegółowo

Program zajęć z biochemii dla studentów kierunku weterynaria I roku studiów na Wydziale Lekarskim UJ CM w roku akademickim 2013/2014

Program zajęć z biochemii dla studentów kierunku weterynaria I roku studiów na Wydziale Lekarskim UJ CM w roku akademickim 2013/2014 Program zajęć z biochemii dla studentów kierunku weterynaria I roku studiów na Wydziale Lekarskim UJ CM w roku akademickim 2013/2014 S E M E S T R II Tydzień 1 24.02-28.02 2 03.03-07.03 3 10.03-14.03 Wykłady

Bardziej szczegółowo

Zastosowanie metod molekularnych w badaniach bioremediacji substancji ropopochodnych

Zastosowanie metod molekularnych w badaniach bioremediacji substancji ropopochodnych NAFTA-GAZ, ROK LXIX, Nr 11 / 2013 Joanna Brzeszcz, Piotr Kapusta, Anna Turkiewicz Instytut Nafty i Gazu Zastosowanie metod molekularnych w badaniach bioremediacji substancji ropopochodnych Zastosowanie

Bardziej szczegółowo

PL 208956 B1. Sposób wykrywania i różnicowania chorób należących do grupy hemoglobinopatii, zwłaszcza talasemii

PL 208956 B1. Sposób wykrywania i różnicowania chorób należących do grupy hemoglobinopatii, zwłaszcza talasemii RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 208956 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 381219 (22) Data zgłoszenia: 05.12.2006 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01)

Bardziej szczegółowo

Znaczenie genetyki. Opracował A. Podgórski

Znaczenie genetyki. Opracował A. Podgórski Znaczenie genetyki Opracował A. Podgórski InŜynieria genetyczna InŜynieria genetyczna ingerencja w materiał genetyczny organizmów, w celu zmiany ich właściwości dziedzicznych. Istota inŝynierii genetycznej

Bardziej szczegółowo

Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe

Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe Podstawy genetyki człowieka Cechy wieloczynnikowe Dziedziczenie Mendlowskie - jeden gen = jedna cecha np. allele jednego genu decydują o barwie kwiatów groszku Bardziej złożone - interakcje kilku genów

Bardziej szczegółowo

Najczęstsze zjawiska występujące podczas analizy profili DNA w multipleksowych systemach STR

Najczęstsze zjawiska występujące podczas analizy profili DNA w multipleksowych systemach STR Joanna Dąbrowska, Żanetta Makowska, Magdalena Spólnicka, Emilia Szabłowska-Gnap Najczęstsze zjawiska występujące podczas analizy profili DNA w multipleksowych systemach STR Wstęp Metody badań stosowane

Bardziej szczegółowo

LAMP. szybka i specyficzna detekcja patogenów

LAMP. szybka i specyficzna detekcja patogenów LABORATORIUM 5-6/2014 DIAGNOSTYKA LABORATORYJNA LAMP szybka i specyficzna detekcja patogenów STRESZCZENIE W obecnych czasach istnieje potrzeba opracowywania szybkich, tanich i skutecznych metod diagnostycznych

Bardziej szczegółowo