INFORMATYKA W SELEKCJI 9 MODELE MIESZANE



Podobne dokumenty
INFORMATYKA W SELEKCJI

INFORMATYKA W SELEKCJI

PAKIETY STATYSTYCZNE

PAKIETY STATYSTYCZNE

Oprogramowanie dla GWAS

PAKIETY STATYSTYCZNE 5. SAS wprowadzenie - środowisko Windows

Modelowanie danych hodowlanych

Szacowanie wartości hodowlanej. Zarządzanie populacjami

Autor: Dariusz Piwczyński 1 Ćwiczenie: Doświadczenia 2-grupowe w układzie niezależnym i zależnym.

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka

Analiza danych jakościowych

Problem równoczesności w MNK

BIOMETRIA 3. Wprowadzenie do pakietu SAS

Analiza zależności cech ilościowych regresja liniowa (Wykład 13)

Informatyka w selekcji - Wykªad 1

1 Obliczenia na danych

PAKIETY STATYSTYCZNE

INFORMATYKA W SELEKCJI

Genetyka populacji. Ćwiczenia 7

Ekonometria. Modele regresji wielorakiej - dobór zmiennych, szacowanie. Paweł Cibis pawel@cibis.pl. 1 kwietnia 2007

Ekonometria dla IiE i MSEMat Z7

STATYSTYKA MATEMATYCZNA

STATYSTYKA MATEMATYCZNA WYKŁAD 4. Testowanie hipotez Estymacja parametrów







Regresja liniowa w R Piotr J. Sobczyk

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka. Wykład 12

CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka. Wykład 12

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka

Autor: Dariusz Piwczyński 1 Ćwiczenie. Analiza zmienności złożona. Testy wielokrotnych porównań

INFORMATYKA W SELEKCJI

Natalia Nehrebecka Stanisław Cichocki. Wykład 10

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka. Wykład 10

WSTĘP Oprogramowanie dla GWAS

Regresja liniowa wprowadzenie

Regresja logistyczna. Regresja logistyczna. Przykłady DV. Wymagania

Adam Kirpsza Zastosowanie regresji logistycznej w studiach nad Unią Europejska. Anna Stankiewicz Izabela Słomska

Katedra Genetyki i Podstaw Hodowli Zwierząt Wydział Hodowli i Biologii Zwierząt, UTP w Bydgoszczy

STATYSTYKA MATEMATYCZNA

Ocena wartości hodowlanej. Dr Agnieszka Suchecka

Wnioskowanie statystyczne. Statystyka w 5

Metoda najmniejszych kwadratów

Ekonometria Ćwiczenia 19/01/05

PAKIETY STATYSTYCZNE

Podstawowe pojęcia. Własności próby. Cechy statystyczne dzielimy na

Zadanie 1. a) Przeprowadzono test RESET. Czy model ma poprawną formę funkcyjną? 1

dr hab. Dariusz Piwczyński, prof. nadzw. UTP

140, , ,000 80, ROK

PAKIETY STATYSTYCZNE

Natalia Nehrebecka Stanisław Cichocki. Wykład 6

Zarządzanie populacjami zwierząt. Parametry genetyczne cech

STATYSTYKA MATEMATYCZNA

SAS Podstawowe informacje przed ćwiczeniem 1

X Y 4,0 3,3 8,0 6,8 12,0 11,0 16,0 15,2 20,0 18,9

Estymacja parametro w 1

Wprowadzenie do estymacji rozkładów w SAS.

1 Modele ADL - interpretacja współczynników

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka. Wykład 14

Wykład Centralne twierdzenie graniczne. Statystyka matematyczna: Estymacja parametrów rozkładu

Programowanie, algorytmy i struktury danych

Rozkłady statystyk z próby. Statystyka

Metody Statystyczne. Metody Statystyczne. #8 Błąd I i II rodzaju powtórzenie. Dwuczynnikowa analiza wariancji

Testy własności składnika losowego Testy formy funkcyjnej. Diagnostyka modelu. Część 2. Diagnostyka modelu

Rozdział 8. Regresja. Definiowanie modelu

Komputerowa Analiza Danych Doświadczalnych

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka. Wykład 9

, a ilość poziomów czynnika A., b ilość poziomów czynnika B. gdzie

WIELKA SGH-OWA POWTÓRKA ZE STATYSTYKI. Test zgodności i analiza wariancji Analiza wariancji

1.9 Czasowy wymiar danych

ESTYMACJA BŁĘDU PREDYKCJI I JEJ ZASTOSOWANIA

weryfikacja hipotez dotyczących parametrów populacji (średnia, wariancja)

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka

parametrów strukturalnych modelu = Y zmienna objaśniana, X 1,X 2,,X k zmienne objaśniające, k zmiennych objaśniających,

Instalacja Pakietu R

WSTĘP. Copyright 2011, Joanna Szyda

Informatyka w selekcji - Wykªad 4

METODY STATYSTYCZNE W BIOLOGII

STATYSTYKA MATEMATYCZNA

Szeregi czasowe, analiza zależności krótkoi długozasięgowych


Statystyczna analiza danych

Statystyka matematyczna Testowanie hipotez i estymacja parametrów. Wrocław, r

Projekt Nowa oferta edukacyjna Uniwersytetu Wrocławskiego odpowiedzią na współczesne potrzeby rynku pracy i gospodarki opartej na wiedzy

A L (nh) zmierzone w kombinacji z połówką rdzenia bez szczeliny / A L (nh) measured in combination with ungapped core half

Przykład 2. Stopa bezrobocia

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka. Wykład 7

Egzamin z ekonometrii wersja IiE, MSEMAT

Przykład 1 ceny mieszkań

(LMP-Liniowy model prawdopodobieństwa)

Stanisław Cichocki. Natalia Nehrebecka

Dr Łukasz Goczek. Uniwersytet Warszawski

( x) Równanie regresji liniowej ma postać. By obliczyć współczynniki a i b należy posłużyć się następującymi wzorami 1 : Gdzie:

Heteroscedastyczność. Zjawisko heteroscedastyczności Uogólniona Metoda Najmniejszych Kwadratów Stosowalna Metoda Najmniejszych Kwadratów

JEDNOCZYNNIKOWA ANALIZA WARIANCJI, ANOVA 1

Metody Ilościowe w Socjologii

Transkrypt:

INFORMATYKA W SELEKCJI 9 MODELE MIESZANE

SAS WYKORYSTANIE PAKIETU SAS DO ESTYMACJI EFEKTÓW MODELI MIESZANYCH. Modl stały, a modl miszany. Macirz spokrwniń addytywni polignicznych 3. Przygotowani danych 4. Zastosowani procdury mixd 5. Intrprtacja wyników

MODEL STAŁY, A MODEL MIESZANY PRÓBA DANYCH. Bonitacja młodych koni rasy śląskij kwalifikowanych do hodowli. Punkty przyznawan w różnych katgoriach Nazwa Nr Nr ojca Nr ojca_o Nr matki-o Suma punktów Próba Rok ur Misiąc ur NIWA 9 336 9.5 7 4 BERNIKLA 73 9 58 89.54 7 4 DELTA 3 55 56 44 88.59 7 3 ABISYNIA 4 55 56 44 88.5 7 3 4 IWA 5 3 83 387 87.5 7 4 3 ELEGIA 6 59 93 485 86.69 7 4 BELA 7 58 4 473 86.5 7 5

MODEL STAŁY, A MODEL MIESZANY Nazwa Nr Nr ojca Nr ojca_o Nr matki-o Suma punktów Próba Rok ur Misiąc ur NIWA 9 336 9.5 7 4 BERNIKLA 73 9 58 89.54 7 4 DELTA 3 55 56 44 88.59 7 3 ABISYNIA 4 55 56 44 88.5 7 3 4 suma _ punktów ojcic misiąi _ urodznia y Zo 9.5 89.54 3 73 88.59 4 55 88.5 9.5 * *73 *55 *3 *4 m 3 4 ojcic misiąc

MODEL STAŁY, A MODEL MIESZANY R y R m Zo y modl stały zakłada brak powiązań między fktami (ojcami) stały fkt ojca

MODEL STAŁY, A MODEL MIESZANY modl miszany pozwala na wykorzystani informacji o podobiństwi między fktami uwzględnini spokrwninia między ojcami losowy fkt ojca y Zo m o G 4 4 o R y o ZGZ' R

MODEL STAŁY, A MODEL MIESZANY macirz wariancji addytywni gntycznj ojców współczynniki macirzy obliczon na podstawi spokrwninia część idntycznych przz pochodzni gnów u danj pary ojców prawdopodobiństwo, ż dany alll jst idntycznych przz pochodzni u danj pary ojców o = wariancja addytywni gntyczna fktu ojca obliczon wartości fktu ojca = wartości hodowlan G 4 4 o

PRZYGOTOWANIE DANYCH /* wczytywani danych o bonitacji koni */ data KONIE; infil 'd:/karolina/klacz.prn' firstobs= ; input IMIE $ - NROGIERA NROJCA NROJCA_OJCA NRMATKI_OJCA SUMAPKT ROKPR ROKUR MIEUR; run ; Nazwa Nr Nr ojca Nr ojca_o Nr matki-o Suma punktów Próba Rok ur Misiąc ur NIWA 9 336 9.5 7 4 BERNIKLA 73 9 58 89.54 7 4 /* wczytywani macirzy spokrwnin */ data POKREWIENSTWO ; infil 'd:karolina/g.txt' ; input ROW COLUMN VALUE ; PARM= ; output ; run ; 4 4.5 3

ZASTOSOWANIE PROCEDURY MIED /* modl miszany */ proc mixd data=konie ordr=data ; class NROJCA MIEUR ; modl SUMAPKT= MIEUR / solution ; random NROJCA / typ=lin() ldata=pokrewienstwo solution ; parms (.3) (.7) / noitr ratios ; run ; y Zo m o.3.7

PROCEDURA MIED - WYNIKI Modl Information Data St Dpndnt Variabl Coianc Structurs Estimation Mthod Rsidual Varianc Mthod Fixd Effcts SE Mthod Dgrs of Frdom Mthod Dimnsions Coianc Paramtrs Columns in Columns in Z 3 Subjcts Max Obs Pr Subjct 66 WORK.OGIERY SUMAPKT Linar, Varianc Componnts REML Paramtr Modl-Basd Containmnt Liczba wsp. wariancji: i o Liczba kolumn macirzy = liczba misięcy + Liczba kolumn macirzy Z = liczba ojców Całkowita liczba obsrwacji

PROCEDURA MIED - WYNIKI Numbr of Obsrvations Numbr of Obsrvations Rad 66 Numbr of Obsrvations Usd 66 Numbr of Obsrvations Not Usd Paramtr Sarch Liczba obsrwacji CovP CovP Rs Log Lik - Rs Log Lik.3.7-63.5395 347.789 Coianc Paramtr Estimats Założon wartości wsp. wariancji Cov Parm Estimat LIN(). Rsidual.7 Obliczon wartości wsp. wariancji

PROCEDURA MIED - WYNIKI Solution for Fixd Effcts wyniki dla fktów stałych Standard Effct MIEUR Estimat Error DF t Valu Pr > t Intrcpt 66.6733.935 3 7.65 <. MIEUR 3 6.766.975 7 6.94 <. MIEUR.336.4 7.9 <. MIEUR 5 8.8.978 7 9.6 <. MIEUR 4.4539.973 7.77 <. MIEUR 3.96.954 7 4.63 <. MIEUR 9.868.493 7 9.4 <. MIEUR 9.843.377 7 7.4 <. MIEUR 8.... kod misiąca wartość błąd standardowy prawdopodobiństwo błędu przy odrzucniu H

PROCEDURA MIED - WYNIKI Solution for Random Effcts wyniki dla fktów losowych Std Err Effct NROJCA Estimat Prd DF t Valu Pr > t NROJCA 5.43.378 7.76.4543 NROJCA 55-3.84.33 7 -.9 <. NROJCA 58.5694.336 7.76.898 NROJCA 63.59.3485 7.65.54 NROJCA 66.558.365 7.7.4894 NROJCA 67-3.3.3946 7-8.6 <. NROJCA 68.775.366 7 4.9 <. NROJCA 73 -.896.385 7-3.3.6 NROJCA 74.79.336 7 6.73 <. NROJCA 78 -.4443.945 7-4.9 <. kod ojca wartość = wartość hodowlana błąd standardowy prawdopodobiństwo błędu przy odrzucniu H

WYKORYSTANIE PAKIETU SAS DO ESTYMACJI EFEKTÓW MODELI MIESZANYCH. Modl stały, a modl miszany. Macirz spokrwniń addytywni polignicznych 3. Przygotowani danych 4. Zastosowani procdury mixd 5. Intrprtacja wyników