6. Chromatografia oddziaływań hydrofobowych (hydrophobic interaction chromatography HIC)

Podobne dokumenty
SPECJALNE TECHNIKI ROZDZIELANIA W BIOTECHNOLOGII. Laboratorium nr1 CHROMATOGRAFIA ODDZIAŁYWAŃ HYDROFOBOWYCH

7. Chromatografia odwróconej fazy (reversed phase chromatography RPC)

CEL ĆWICZENIA: Zapoznanie się z przykładową procedurą odsalania oczyszczanych preparatów enzymatycznych w procesie klasycznej filtracji żelowej.

Wpływ ilości modyfikatora na współczynnik retencji w technice wysokosprawnej chromatografii cieczowej

5. Chromatografia jonowymienna (ion exchange chromatography IEC) 5.1. Podstawy teoretyczne chromatografii jonowymiennej

PORÓWNANIE FAZ STACJONARNYCH STOSOWANYCH W HPLC

Instrukcja do ćwiczeń laboratoryjnych

RP WPROWADZENIE. M. Kamiński PG WCh Gdańsk Układy faz odwróconych RP-HPLC, RP-TLC gdy:

-- w części przypomnienie - Gdańsk 2010

CHROMATOGRAFIA W UKŁADACH FAZ ODWRÓCONYCH RP-HPLC

ROZDZIELENIE OD PODSTAW czyli wszystko (?) O KOLUMNIE CHROMATOGRAFICZNEJ

Instrukcja do ćwiczeń laboratoryjnych

WPŁYW ILOŚCI MODYFIKATORA NA WSPÓŁCZYNNIK RETENCJI W TECHNICE WYSOKOSPRAWNEJ CHROMATOGRAFII CIECZOWEJ

Postępowanie-WB NG ZAŁĄCZNIK NR 5. Cena jednostkowa netto (zł) Nazwa asortymentu parametry techniczne

Ćwiczenie 1. Zastosowanie średniociśnieniowej chromatografii cieczowej do izolacji i charakterystyki biomakromolekuł

RP WPROWADZENIE. M. Kamioski PG WCh Gdaosk 2013

Ślesin, 29 maja 2019 XXV Sympozjum Analityka od podstaw

3. Urządzenia i aparatura stosowane w chromatografii cieczowej

Deproteinizacja jako niezbędny etap przygotowania próbek biologicznych

Pytania z Wysokosprawnej chromatografii cieczowej

Metody chromatograficzne w chemii i biotechnologii, wykład 6. Łukasz Berlicki

Techniki immunochemiczne. opierają się na specyficznych oddziaływaniach między antygenami a przeciwciałami

Instrukcja ćwiczenia laboratoryjnego HPLC-2 Nowoczesne techniki analityczne

HPLC? HPLC cz.1. Analiza chromatograficzna. Klasyfikacja metod chromatograficznych

Chromatogramy Załącznik do instrukcji z Technik Rozdzielania Mieszanin

Oznaczanie wybranych farmaceutyków w próbach wody

HPLC_UPLC_PLC. Aparatura / problemy z aparaturą / sposoby ich eliminacji, minimalizacji (bez detekcji) 2/9/2014

Proteomika. Złożoność proteomów

1.Wstęp. Ćwiczenie nr 9 Zatężanie z wody związków organicznych techniką SPE (solid phase extraction)

4A. Chromatografia adsorpcyjna B. Chromatografia podziałowa C. Adsorpcyjne oczyszczanie gazów... 5

Roztwory buforowe (bufory) (opracowanie: dr Katarzyna Makyła-Juzak)

Metody chromatograficzne w chemii i biotechnologii, wykład 5. Łukasz Berlicki

CHROMATOGRAFIA BARWNIKÓW ROŚLINNYCH

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Cz. 5. Podstawy instrumentalizacji chromatografii. aparatura chromatograficzna w skali analitycznej i modelowej - -- w części przypomnienie -

POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI. Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ

WYZNACZANIE MAS CZĄSTECZKOWYCH BIAŁEK METODĄ SĄCZENIA ŻELOWEGO ORAZ OCZYSZCZANIE BIAŁEK METODĄ CHORMATOGRAFII JONOWYMIENNEJ

Sposób otrzymywania białek o właściwościach immunoregulatorowych. Przedmiotem wynalazku jest sposób otrzymywania fragmentów witellogeniny.

WPŁYW SUBSTANCJI TOWARZYSZĄCYCH NA ROZPUSZCZALNOŚĆ OSADÓW

Gel-Out. 50 izolacji, 250 izolacji. Nr kat , Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617

Transport przez błony

PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika

PP7: Wymiana jonowa i chromatografia jonowymienna oznaczanie kationów i anionów

Kontrola produktu leczniczego. Piotr Podsadni

Chromatografia. Chromatografia po co? Zastosowanie: Optymalizacja eluentu. Chromatografia kolumnowa. oczyszczanie. wydzielanie. analiza jakościowa

8. Chromatografia powinowactwa (affinity chromatography - AC) 8.1. Podstawy teoretyczne chromatografii powinowactwa

Chromatografia kolumnowa planarna

3. Jak zmienią się właściwości żelu krzemionkowego jako fazy stacjonarnej, jeśli zwiążemy go chemicznie z grupą n-oktadecylodimetylosililową?

Ilościowa analiza mieszaniny alkoholi techniką GC/FID

Identyfikacja substancji pochodzenia roślinnego z użyciem detektora CORONA CAD

Wysokosprawna chromatografia cieczowa w analizie jakościowej i ilościowej

CHROMATOGRAFIA JONOWYMIENNA

DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko

Oznaczanie SO 2 w powietrzu atmosferycznym

BADANIE ZAWARTOŚCI WIELOPIERŚCIENIOWYCH WĘGLOWODORÓW AROMATYCZNYCH (OZNACZANIE ANTRACENU W PRÓBKACH GLEBY).

masy cząsteczkowej polimerów nisko i średnio polarnych, a także lipidów, fosfolipidów itp.. silanizowanyżel krzemionkowy

Techniki Rozdzielania Mieszanin

Mechanizm działania buforów *

Laboratorium 5. Wpływ temperatury na aktywność enzymów. Inaktywacja termiczna

Kolumnowa Chromatografia Cieczowa I. 1. Czym różni się (z punktu widzenia użytkownika) chromatografia gazowa od chromatografii cieczowej?

Reakcje utleniania i redukcji Reakcje metali z wodorotlenkiem sodu (6 mol/dm 3 )

OZNACZANIE ŻELAZA METODĄ SPEKTROFOTOMETRII UV/VIS

I BIOTECHNOLOGIA. 3-letnie studia stacjonarne I stopnia

Oznaczanie żelaza i miedzi metodą miareczkowania spektrofotometrycznego

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Ciśnieniowe techniki membranowe (część 2)

ĆWICZENIE NR 4 OTRZYMYWANIE PREPARATÓW RADIOCHEMICZNIE CZYSTYCH.

PROCESY JEDNOSTKOWE W TECHNOLOGIACH ŚRODOWISKOWYCH WYMIANA JONOWA

WYZNACZANIE ZAKRESU WYKLUCZANIA DLA WYPEŁNIEŃ STOSOWANYCH W WYSOKOSPRAWNEJ CHROMATOGRAFII WYKLUCZANIA (HPSEC)

K02 Instrukcja wykonania ćwiczenia

Współczesne metody oczyszczania białek

ĆWICZENIE I - BIAŁKA. Celem ćwiczenia jest zapoznanie się z właściwościami fizykochemicznymi białek i ich reakcjami charakterystycznymi.

Lp. Opis wymaganych parametrów Opis oferowanych parametrów 1. System chromatograficzny dedykowany do analizy, rozdziału i oczyszczania białek.

WYDZIAŁ TECHNOLOGII ŻYWNOŚCI STANDARYZACJA, MONITORING I ATESTACJA ŻYWNOŚCI

ELEKTROFOREZA. Wykonanie ćwiczenia 8. ELEKTROFOREZA BARWNIKÓW W ŻELU AGAROZOWYM

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R

4. WYZNACZENIE IZOTERMY ADSORPCJI METODĄ ECP

Materiały polimerowe laboratorium

Zastosowanie chromatografii do preparacji białek

Jakościowa i ilościowa analiza mieszaniny alkoholi techniką chromatografii gazowej

ĆWICZENIE 2. Usuwanie chromu (VI) z zastosowaniem wymieniaczy jonowych

WPŁYW SUBSTANCJI TOWARZYSZĄCYCH NA ROZPUSZCZALNOŚĆ OSADÓW

10. ODSALANIE I ZATĘŻANIE ROZTWORU BIAŁKA W PROCESIE FILTRACJI STYCZNEJ

SKUTECZNOŚĆ IZOLACJI JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI? JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI?

Spis treści. Wstęp... 9

OD HPLC do UPLC. Prof. dr hab. inż. Agata Kot-Wasik. Katedra Chemii Analitycznej Wydział Chemiczny, Politechnika Gdańska

CHROMATOGRAFIA CHROMATOGRAFIA GAZOWA

OZNACZANIE WYBRANYCH FARMACEUTYKÓW W PRÓBACH WODY.

Kopolimery statystyczne. Kopolimery blokowe. kopolimerów w blokowych. Sonochemiczna synteza -A-A-A-A-A-A-A-B-B-B-B-B-B-B-B-B-B- Typowe metody syntezy:

Recenzja pracy doktorskiej mgr. inż. Wojciecha Marka zatytułowanej "Rozdział białek za pomocą łączonych technik chromatograficznych"

Definicja immobilizacji

protos (gr.) pierwszy protein/proteins (ang.)

GraŜyna Chwatko Zakład Chemii Środowiska

Zadanie: 1 (3 pkt) Metanoamina (metyloamina) rozpuszcza się w wodzie, a także reaguje z nią.

Adsorpcyjne oczyszczanie gazów z zanieczyszczeń związkami organicznymi

Instrukcja do ćwiczeń laboratoryjnych. Ćwiczenie nr 2

MATERIAŁY DO ĆWICZEŃ LABORATORYJNYCH - CHROMATOGRAFIA JONOWA

Total RNA Zol-Out. 25 izolacji, 100 izolacji

Odpowiedź:. Oblicz stężenie procentowe tlenu w wodzie deszczowej, wiedząc, że 1 dm 3 tej wody zawiera 0,055g tlenu. (d wody = 1 g/cm 3 )

Podstawy chromatografii i technik elektromigracyjnych / Zygfryd Witkiewicz, Joanna Kałużna-Czaplińska. wyd. 6-1 w PWN. Warszawa, cop.

Transkrypt:

6. Chromatografia oddziaływań hydrofobowych (hydrophobic interaction chromatography HIC) Przeważająca większość makrocząsteczek posiada skomplikowaną strukturę wewnętrzną, w której można wyróżnić zarówno obszary hydrofilowe eksponowane na zewnątrz cząsteczki w polarnym otoczeniu wody, jak i obszary hydrofobowe ukryte w jej wnętrzu i eksponowane na zewnątrz przy zmianie środowiska na niepolarne. Zarówno ilość takich obszarów hydrofobowych, jak i ich umiejscowienie w strukturze cząsteczki stanowią indywidualną cechę makrocząsteczek. Umożliwia to ich rozdział ze względu na odmienne właściwości hydrofobowe. 6.1. Podstawy teoretyczne chromatografii oddziaływań hydrofobowych Chromatografia oddziaływań hydrofobowych (HIC) jest szeroko wykorzystywana do separacji i oczyszczania makrocząsteczek białkowych. Białka adsorbowane są na złożu dzięki występowaniu oddziaływań hydrofobowych fragmentów białka z silnie hydrofobowymi grupami ligandów, trwale umocowanych na powierzchni nośnika pozbawionego ładunku elektrycznego. Różne czynniki mają wpływ na zachowanie się cząsteczek białkowych w kontakcie z hydrofobowym adsorbentem. Niektóre z nich mają krytyczny wpływ na rozdzielczość i selektywność metody, a także zdolność wiązania cząsteczek przez złoże. Poniżej są wymienione i omówione najważniejsze czynniki, tj: - typ liganda oraz jego gęstość na powierzchni nośnika, - rodzaj nośnika, - rodzaj i stężenie soli, - stężenie jonów wodorowych - ph, - temperatura, - skład solwentów. Typ liganda unieruchomionego na nośniku (łańcuch alkilowy lub aromatyczne grupy arylowe) determinuje sposób adsorpcji makrocząsteczek. Liniowe łańcuchy alkilowe wykazują zdolność do czysto hydrofobowego oddziaływania, podczas gdy ligandy arylowe mają mieszane własności, tj. oddziałują zarówno przez liniowe fragmenty łańcucha, jak i wykorzystują wiązania typu π π (z aromatycznych pierścieni grup arylowych). Przy stałej gęstości powierzchniowej liganda, pojemność złoża do wiązania białek wzrasta wraz z długością łańcuchów alkilowych, jednakże siła z jaką ulegną związaniu duże 88

makromolekuły z długimi łańcuchami alkilowymi może być na tyle duża, że trudno będzie przeprowadzić desorpcję tych makromolekuł ze złoża. Wybór miedzy ligandem alkilowym a arylowym dokonywany jest zwykle drogą prób, osobno dla każdego rodzaju rozdzielanych makromolekuł oraz warunków, w jakich separacja ta ma się odbywać. Pomocne są w tym względzie zestawy złóż z różnymi rodzajami związanych ligandów (kolumny HiTrap), pozwalające w bardzo prosty sposób, z zastosowaniem strzykawki, dokonać wyboru odpowiedniego złoża oraz liganda. Gęstość powierzchniowa liganda w zdecydowany sposób wpływa na pojemność wiązania makromolekuł i na siłę tego wiązania. Wraz ze wzrostem gęstości liganda wzrasta pojemność wiązania, aż do osiągnięcia stanu wysycenia przy około 30 milimolach liganda na 1 ml żelu. Dzięki możliwości realizacji wielopunktowego oddziaływania wzrasta również siła wiązania makromolekuł do liganda. Jednak zbyt silnie związane makromolekuły trudno później usunąć z żelu, dlatego istotny jest odpowiedni dobór liganda i jego gęstości powierzchniowej. Rodzaj zastosowanego nośnika ma duże znaczenie przy wyborze warunków wiązania i elucji zaadsorbowanych makromolekuł. Zasadniczo stosowane są trzy rodzaje nośnika: - usieciowana agaroza (Sepharose) - syntetyczne polimery silikonowe - polimery akrylamidowe. Wszystkie typy stosowanego nośnika wykazują właściwości hydrofobowe, ale o różnym natężeniu. Jest to przyczyną różnic w oddziaływaniu makromolekuł z hydrofobowym ligandem unieruchomionym na odmiennie hydrofilowej powierzchni. Z tego też powodu trudno jest przenosić doświadczenie uzyskane przy udziale jednego typu nośnika na inny jego typ. Zmiana nośnika wymaga często zmiany warunków adsorpcji i elucji. Rodzaj i stężenie soli bardzo silnie wpływają na oddziaływanie białko-ligand w chromatografii hydrofobowej. Ze wzrostem stężenia soli wzrasta ilość białka wiązanego z hydrofobowymi ligandami. Początkowo wzrost ten jest liniowy, ale powyżej pewnego stężenia ilość białka wiązanego przez ligandy wzrasta wykładniczo. Wykładniczy wzrost ilości wiązanego białka obserwuje się przy stężeniu soli, w którym zachodzi wysalanie tego białka. Białko wytrąca się wówczas na kolumnie chromatograficznej. Efekt ten, pomimo obserwowanego wzrostu ilości wiązania białka, ma ujemny wpływ na selektywność rozdziału chromatograficznego i należy go unikać. Poza stężeniem soli również jej rodzaj ma duże znaczenie dla wydajności i selektywności wiązania oraz elucji białek. Wszystkie typy soli rozpuszczalne w wodzie zostały uszeregowane ze względu na zdolność wysalania białek (seria Hofmeistera). Nie wszystkie sole mają jednak podobne znaczenie w praktyce 89

chromatograficznej. Najważniejsze z nich, uszeregowane według intensywności efektu wysalania, podane są poniżej (1): Na 2 SO 4 >K 2 SO 4 >(NH 4 ) 2 SO 4 >Na 2 HPO 4 >NaCl>KCl>LiCl>NaBr>KBr Jak widać, siarczany sodu, potasu i amonu mają najsilniejszy efekt wysalania białek i one też powodują największe ilościowo wiązanie białek do hydrofobowych ligandów. Nieco słabsze są fosforan i chlorek sodu, które jednak pozwalają uzyskać zdecydowanie lepszą selektywność wiązania i elucji białek. Większość białek związanych z hydrofobowym ligandem daje się stosunkowo łatwo odmyć stosując jako eluent tę samą sól, ale w niższym stężeniu. Stężenie jonów wodorowych (wartość ph) jest czynnikiem, który musi być uwzględniany przy optymalizacji rozdziału w technice HIC. Zaobserwowano, że siła oddziaływań hydrofobowych białka z hydrofobowym ligandem jest tym większa, im niższa jest wartość ph. Z drugiej strony, podwyższenie wartości ph umożliwia rozbicie wielopunktowych oddziaływań hydrofobowych pomiędzy makromolekułą a długimi alifatycznymi łańcuchami, gęsto unieruchomionymi na powierzchni nośnika. Jednak wartość ph powyżej 8,5 sprzyja występowaniu silnych oddziaływań hydrofobowych. Temperatura odgrywa istotną rolę we właściwym przeprowadzeniu rozdziału HIC. Ogólnie rzecz biorąc obserwuje się znaczne różnice w selektywności separacji makromolekuł w różnych temperaturach. Wynika to stąd, że oddziaływania hydrofobowe makromolekuł z hydrofobowym ligandem mają charakter sił van der Waalsa, które są zależne od temperatury. Im wyższa temperatura, tym oddziaływania hydrofobowe są silniejsze. Jednak pewne białka wykazują nieco odmienne właściwości hydrofobowe w funkcji temperatury. Te odstępstwa od reguły przypisuje się odwrotnym zmianom konformacyjnym i związanym z nimi zmianom w rozpuszczalności tych białek w funkcji temperatury. Skład solwentów może decydować zarówno o sile oddziaływań hydrofobowych makromolekuł z hydrofobowym ligandem, jak i o selektywności tych oddziaływań. Wpływ różnych rodzajów i stężeń soli został omówiony powyżej. Zastosowane inne czynniki, takie jak alkohole i detergenty, zdecydowanie obniżają siłę wiązania białka z ligandami, konkurując z nimi o miejsca wiążące na ligandzie. Efekt ten może być wykorzystywany do poprawienia selektywności wiązania i elucji białek. Należy jednak zawsze mieć na uwadze możliwość denaturacji makromolekuł przez alkohole, oraz trwałe zmiany konformacyjne dokonywane w strukturze białka przez detergenty. Niezależnie od tego, alkohole i detergenty mogą być bardzo przydatne w czyszczeniu (sanityzacji) kolumn. 90

Zalety i wady techniki chromatografii oddziaływań hydrofobowych Zalety: - w technice gradientowej objętość próbki nanoszonej na kolumnę może być wielokrotnie większa od objętości kolumny, a stężenie separowanych substancji może być bardzo niskie; - technika ta pozwala na wielokrotne zatężenie wyjściowego materiału; - pojemność kolumny jest zwykle bardzo duża; - rozdzielczość metody jest wysoka. Wady: - składniki eluowane w solwencie o dużym stężeniu soli muszą być dializowane lub poddawane rechromatografii techniką filtracji żelowej w celu usunięcia nadmiaru soli. 6.2. Złoża stosowane w chromatografii oddziaływań hydrofobowych Złoża do chromatografii oddziaływań hydrofobowych różnią się zarówno rodzajem nośnika jak i rodzajem oraz długością hydrofobowych ligandów. W tabeli 6.1. zestawiono niektóre właściwości złóż najczęściej stosowanych w technice HIC. Należy zwrócić uwagę, że złoża te zostały przewidziane dla technik chromatografii niskociśnieniowej i nie spełniają warunków wymaganych w systemach FPLC lub HPLC. Dla tych systemów przewidziano złoża, których nośniki charakteryzują się lepszymi parametrami mechanicznymi (tabela 6.2.). Tabela 6.1. Zestawienie wybranych złóż do chromatografii HIC. Dane na podstawie aktualnego (2000 r.) katalogu firmy Amersham Pharmacia Biotech. Phenyl Sepharose 6 FF (low /high sub) Butyl Sepharose 4 FF Octyl Sepharose 4FF SOURCE 15 PHE SOURCE 15 ISO SOURCE 15 ETH Rodzaj liganda fenyl n-butyl n-octyl Fenyl izopropyl Eter Powierzchniowa gęstość liganda (µmoli/ml żelu) Rodzaj nośnika Maksymalne ciśnienie pracy złoża (MPa) Pojemność wiązania (mg HSA /ml żelu) 20/40 50 5 30-40 30-40 30-40 Sieciowana agaroza (6%) sieciowana agaroza (4%) sieciowana agaroza (4%) polistyren sieciowany z dwuwinylobenzenem polistyren sieciowany z dwuwinylobenzenem Polistyren sieciowany z dwuwinylobenzenem 0,3 0,3 0,3 1,5 1,5 1,5 24/36 27 27 25 25 25 W kolumnie dotyczącej żelu Phenyl Sepharose 6 FF podano dane dla złóż o niskiej i wysokiej gęstości powierzchniowej liganda. 91

Dla szybkiego sprawdzenia warunków separacji wybranego materiału techniką chromatografii oddziaływań hydrofobowych, z zastosowaniem złóż podanych w tabeli 6.1., firma Amersham Pharmacia Biotech oferuje zestaw kolumienek HiTrap HIC. Kolumienki te (1 ml każda) mogą być użyte w dowolnym systemie chromatograficznym (HPLC, FPLC, ÄKTA, systemy niskociśnieniowe GradiFrac lub ÄKTAprime), ale mogą być również operowane za pomocą zwykłej strzykawki. Tabela 6.2. Zestawienie wybranych kolumn do wysokociśnieniowej chromatografii oddziaływań hydrofobowych. Dane na podstawie katalogu firmy Amersham Pharmacia Biotech (1999 r.). Alkyl Superose Phenyl Superose Rodzaj liganda Neopentyl Fenyl Rodzaj nośnika Superose 12 Superose 12 Maksymalne ciśnienie (MPa) 2,5 2,5 Zakres temperatur ( o C) 4-40 4 40 Zakres ph 2-13 2 13 Odporność chemiczna mocznik, chlorowodorek guanidyny, detergenty, rozpuszczalniki organiczne mocznik, chlorowodorek guanidyny, detergenty, rozpuszczalniki organiczne Pojemność wiązania (mg białka/ ml żelu) HSA - 60 Chymotrypsynogen 50 6.3. Przykłady zastosowań techniki chromatografii oddziaływań hydrofobowych Przykład 6.1. Rozdzielanie α-laktoalbuminy i β-laktoglobuliny z zastosowaniem złoża Phenyl- Sepharose 6 FF (2) Wprowadzenie: Struktura przestrzenna wielu białek podlega zmianom indukowanym obecnością jonów metali. Zmiany te, poza regulacją funkcji tych białek, prowadzą do zmian ich właściwości hydrofobowych. Zjawisko to może być wykorzystane do izolowania i oczyszczania białek 92

wiążących jony metali. Dwie obecne w mleku proteiny, α-laktoalbumina i β-laktoglobulina, mają zdolność wiązania jonów Ca 2+. Obecność jonów wapnia powoduje zmniejszenie hydrofobowości α-laktoalbuminy. Natomiast właściwości hydrofobowe β-laktoglobuliny słabo zależą od obecności tych jonów. Można wiec stosunkowo łatwo dokonać separacji tych dwóch białek z wykorzystaniem złoża Phenyl-Sepharose 6 FF. W pierwszym etapie separacji przez kolumnę przepuszcza się mieszaninę tych białek w obecność EDTA. W takich warunkach α-laktoalbumina wiąże się ze złożem, a β-laktoglobulina przepływa przez kolumnę praktycznie bez oddziaływań. W drugim etapie wystarczy wyeluować zaadsorbowane na kolumnie białko, korzystając z buforu zawierającego jony wapnia. Materiał: 1. Białka α-laktoalbumina i β-laktoglobulina. Aparatura: 1. System chromatografii niskociśnieniowej GradiFrac. 2. Kolumna HiTrap Phenyl Sepharose 6 FF. Odczynniki: 1. Bufor A - 50 mm Tris/HCl, zawierający 0,2 M EDTA, ph 7,5. 2. Bufor B - 50 mm Tris/HCl, zawierający 1 mm CaCl 2, ph 7,5. 3. 20% etanol. Przygotowanie systemu i kolumny chromatograficznej: a) Przygotowanie systemu. - Do naczyń na solwenty nalać po 500 ml odpowiednio buforów A i B. - Sprawdzić, czy w wężykach doprowadzających solwenty do pompy znajduje się ciecz. Jeżeli nie, to napełnić je przy pomocy strzykawki, zgodnie z instrukcją użytkowania systemu. - Ustawić %B = 50 i przepuścić przez system 20 ml mieszaniny buforów A i B. - Ustawić %B = 0 i przepuścić 20 ml buforu A. - Sprawdzić czy pętla zamocowana w zaworze iniekcyjnym ma wystarczającą objętość (1 lub 2 ml). - Sprawdzić czy w detektorze UV1 zainstalowany jest w filtr 280 nm, ustawić rodzaj pracy na AU, a zakres na 1.0 i włączyć zasilanie. Stabilną pracę lampy uzyskuje się po około 1 godzinie od włączenia. - Uruchomić rejestrator Rec-112 i ustawić zakres pracy kanału niebieskiego (sygnał z detektora) na zakres 10 mv, a kanału czerwonego (% B) na 1 V. - Do koszyczka kolektora frakcji wstawić 10 probówek o objętości 4 ml. b) Przygotowanie kolumny. - Zamocować kolumnę HiTrap Phenyl Sepharose 6 FF w systemie GradiFrac, zwracając uwagę, aby nie dopuścić do dostania się powietrza do wnętrza kolumny przez jej wlot. Najłatwiej to wykonać przy całkowicie wypełnionym wężyku doprowadzającym solwent do kolumny. - Przepuścić przez pętlę i kolumnę 10 ml buforu A. - Zatrzymać przepływ solwentów. Przebieg doświadczenia: - Zmieszać 500 µl (2 mg/ml) α-laktoalbuminy z 500 µl (2 mg/ml) β-laktoglobuliny. 93

- Dodać 1 ml buforu A i inkubować w temperaturze pokojowej w ciągu 30 minut. - W tym czasie wprowadzić do systemu program chromatograficzny wg schematu: METHOD BASE: VOLUME (ml) FRACTIONATION BY: VOLUME (ml) VOLUME 0,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 1,0 VOLUME 3,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 1,0 VOLUME 7,0; CONC %B 100,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 1,0 VOLUME 8,0; CONC %B 100,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 0,0 VOLUME 9,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 0,0 VOLUME 12,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 0,0 - Uruchomić przepływ buforu A przez kolumnę i obserwować linię bazową rysowaną przez rejestrator. - Po ustaleniu się linii bazowej, ustawić zawór iniekcyjny IV-7 w pozycję LOAD i przy pomocy strzykawki z filtrem (0,45 µm) nanieść separowany materiał (1 ml) do pętli. - Wcisnąć przycisk start i jednocześnie przestawić zawór iniekcyjny w pozycję INJECT. - Dalej proces separacji będzie nadzorowany i wykonany przez system GradiFrac. Oczekiwane wyniki: β-laktoglobulina powinna opuścić kolumnę bez oddziaływań i znaleźć się w 1 i 2 frakcji. Natomiast α-laktoalbumina powinna być wyeluowana wtedy, gdy EDTA zostanie w znacznej mierze usunięte z kolumny i zastąpiony jonami wapnia, tj we frakcjach powyżej numeru 5. gęstość optyczna w 280 nm 0,32 0,27 0,22 0,17 0,12 0,07 0,02 OD w 280 nm % buforu B β-laktoglobulina kolumna: HiTrap Phenyl Sepharose 6FF przepływ: 1 ml/min próbka: 1 ml, α-laktoalbumina (0.25 mg/ml) β-laktoglobulina (0.25 mg/ml) gradient: 0% B do 3 min. 0-100% B od 3 do 7 min, 100% B od 7 do 8 min. α-laktoalbumina 100% B -0,03 0 1 2 3 4 5 6 7 8 czas retencji (min) Rys. 6.1. Przykładowy wynik separacji białek wiążących jony metali z wykorzystaniem chromatografii oddziaływań hydrofobowych. Zmiany konformacyjne białek, wynikające z braku jonów wapnia, powodują bardzo istotne różnice właściwości hydrofobowych separowanych molekuł. 94

Regeneracja i przechowywanie kolumny: Zakończenie programu chromatograficznego pozostawia kolumnę w stanie gotowości do ponownego użycia. Po zakończonej pracy kolumnę przemyć wodą destylowaną (10 ml), następnie 20% etanolem (3 ml) i przechowywać w temperaturze pokojowej chroniąc przed nadmiernym nasłonecznieniem. Przed ponownym użyciem wystarczy kolumnę przemyć 20 ml wody. Uwagi: 1. Wszystkie bufory stosowane do chromatografii cieczowej oraz nanoszone próbki należy filtrować przed użyciem. Próbki zamiast filtrowania można poddać wirowaniu (5000 x g, 10 min). Ma to na celu zabezpieczenie kolumny przed zatkaniem. 2. Bufory dobrze jest przygotować na kilka godzin przed użyciem, ale bezpośrednio przed ich zastosowaniem należy sprawdzić wartość ph i w razie konieczności ponownie doprowadzić do potrzebnej wartości. 3. Podobny rezultat można uzyskać wymuszając przepływ solwentów przez kolumnę HiTrap przy pomocy strzykawki. W takim przypadku należy przygotować skokową zmianę buforów na kolumnie. Przykład 6.2. Izolowanie białek z mieszaniny z zastosowaniem złoża Phenyl-Sepharose (3) Wprowadzenie: Sól obecna w wysokich stężeniach w roztworze białek wywołuje liczne zmiany konformacyjne tych białek. W krańcowych przypadkach zmiany te prowadzą do wytrącenia niektórych z nich z roztworu. Zjawisko to (wysalanie białek) często stosowane jest do szybkiej, wstępnej separacji białek. Pozostałe w roztworze białka wykazują silne właściwości hydrofobowe i mogą być rozdzielane z zastosowaniem techniki chromatografii oddziaływań hydrofobowych. Po naniesieniu na kolumnę mieszaniny białek, znajdujących się w środowisku o wysokim stężeniu soli, dojdzie do oddziaływania hydrofobowych fragmentów tych białek z hydrofobowymi łańcuchami ligandów związanych trwale z nośnikiem. Po odmyciu niespecyficznie zaadsorbowanych molekuł można eluować związane białka w funkcji ich hydrofobowości, stosując eluenty o malejącym stężeniu soli. Materiał: 1. Standardy białkowe: cytochrom c, mioglobina, rybonukleaza, lizozym, oraz chymotrypsynogen A. 95

Aparatura: 1. System chromatografii niskociśnieniowej GradiFrac. 2. Kolumna HiTrap Phenyl Sepharose 6 FF. Odczynniki: 1. Bufor A - 50 mm bufor fosforanowy, ph 7.0. 2. Bufor B - 50 mm bufor fosforanowy, zawierający 1,7 M (NH 4 ) 2 SO 4, ph 7.0. 3. 20% etanol. Przygotowanie systemu i kolumny chromatograficznej: - Wszystkie czynności przygotowania systemu i kolumny należy wykonać tak jak w ćwiczeniu 6.1. Przebieg doświadczenia: - Korzystając z buforu A, zawierającego 1,7 M siarczanu amonu, przygotować mieszaninę białek standardowych: cytochrom c (1 mg/ml), mioglobina (2 mg/ml), rybonukleaza (5 mg/ml), lizozym (1 mg/ml), chymotrypsynogen A (3 mg/ml). - Przygotować program chromatograficzny wg schematu: METHOD BASE: VOLUME (ml) FRACTIONATION BY: VOLUME (ml) VOLUME 0,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 1,0 VOLUME 2,5; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 1,0 VOLUME 18,0; CONC %B 100,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 1,0 VOLUME 20,0; CONC %B 100,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 0,0 VOLUME 21,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 0,0 VOLUME 25,0; CONC %B 0,0; FLOW 1 ml/min.; FRACTION 0,0 - Przy pomocy strzykawki uzbrojonej w filtr (0,45µm) nanieść 1 ml mieszaniny do pętli zaworu iniekcyjnego (zawór w pozycji LOAD). - Po ustaleniu się linii bazowej uruchomić program oraz przestawić zawór w pozycję INJECT. gęstośc optyczna w 280 nm 3 2,5 2 1,5 1 0,5 1 OD w 280 nm % buforu B 2 kolumna: HiTrap Phenyl Sepharose 6 FF przepływ: 1 ml/min. próbka: mieszanina standardów 10 mg/ 500 µl gradient: 0% B do 2,5 min. 0-100% B w 15 min. 3 4 5 100% B Rys. 6.2. 0 0 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 czas retencji (min) Separacja standardów białkowych: cytochrom (1), mioglobina (2), rybonukleaza (3), lizozym (4), chymotrypsynogen (5) w technice chromatografii oddziaływań hydrofobowych. Rozdział przeprowadzono na kolumnie HiTrap Phenyl Sepharose 6 FF zainstalowanej w systemie chromatograficznym GradiFrac. 96

Oczekiwane wyniki: Kolejność wymywania białek przedstawiona jest na rysunku 6.2. Regeneracja i przechowywanie kolumny: Zakończenie programu chromatograficznego pozostawia kolumnę w stanie gotowości do ponownego użycia. Po zakończonej pracy kolumnę przemyć wodą destylowaną (10 ml), a następnie 20% etanolem (3 ml) i przechowywać w temperaturze pokojowej. Przed ponownym użyciem kolumnę przemyć 20 ml wody. Uwagi: Zastosowanie mają wszystkie uwagi jak w przykładzie 6.1. Przykład 6.3. Oczyszczanie przeciwciał monoklonalnych z zastosowaniem techniki chromatografii oddziaływań hydrofobowych (4) Wprowadzenie: W przykładzie 5.2. opisano sposób izolowania przeciwciał monoklonalnych z mysiego płynu wysiękowego z zastosowaniem chromatografii jonowymiennej. Niestety, często spotyka się przeciwciała, których cząsteczki są niezwykle czułe na niewielkie zmiany wartości ph, a zmiany takie zachodzą w sposób słabo kontrolowany na jonowymieniaczu. W takiej sytuacji może dojść do nieodwracalnej utraty aktywności biologicznej przeciwciała. Alternatywną metodą może być zastosowanie chromatografii oddziaływań hydrofobowych. Każda cząsteczka immunoglobuliny posiada regiony hydrofobowe mogące uczestniczyć w oddziaływaniach z nieruchomymi ligandami złoża, umożliwiając tym samym izolowanie ich z mieszaniny. Materiał: 1. Mysi płyn wysiękowy Aparatura: 1. System chromatografii cieczowej ÄKTAFPLC 2. Kolumna Alkyl Superose HR 5/5 Odczynniki: 1. Bufor A - 100 mm bufor fosforanowy z dodatkiem 2 M (NH 4 ) 2 SO 4, ph 7,0. 2. Bufor B - 100 mm bufor fosforanowy, ph 7,0. 3. Bufor C - 100 mm bufor fosforanowy z dodatkiem 0,8 M (NH 4 ) 2 SO 4, ph 7,0 4. 20% etanol. 97

Przygotowanie systemu i kolumny chromatograficznej: - Bufory przepuścić przez filtry (0,45 µm) i dokładnie odpowietrzyć pod próżnią. - Wypełnić odpowiednimi buforami wężyki systemu ÄKTAFPLC. - Zainstalować kolumnę Alkyl Superose HR 5/5 i przepuścić przez nią 5 ml buforu A przy przepływie 0,5 ml/min. - Korzystając z programu komputerowego UNICORN, sterującego systemem ÄKTA, przygotować program separacji próbki, wprowadzając następujące parametry: a) prędkość przepływu 0,5 ml/min., b) detekcja w 280 nm, c) frakcje 2 ml, d) 25 % B w czasie 10 min., e) iniekcja próbki f) 25% B w czasie 5 min., g) 25-75% B w czasie 90 min., h) 75-100% B w czasie 1 min., i) 100% B w czasie 10 min., j) 100-25% B w czasie 5 min., Przebieg doświadczenia: - Płyn wysiękowy (200 µl) rozcieńczyć trzykrotnie buforem C i odwirować (10 min, 5000 x g, RT) a następnie zebrać supernatant i pobrać go do 1 ml strzykawki. - Uruchomić program UNICORN sterujący systemem ÄKTAFPLC, oraz gromadzący dane z detektorów i pozwalający na ewaluację uzyskanych wyników. - Nanieść 600 µl przygotowanej próbki do pętli (1 ml) zaworu iniekcyjnego INV-907, stosując filtr (0,45 µm). - Uruchomić przygotowany wcześniej program separacji użytego materiału. gęstość optyczna w 280 nm 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 kolumna: Alkyl Superose HR 5/5 próbka: mysi płyn wysiękowy przepływ: 0,5 ml/min. gradient: 25% B do 5 min., 25-75% w czasie 90 min., 75-100% w czasie 1 min., 100% B do 100 min. albumina IgG OD w 280 nm % B 100% B 0 0 20 40 60 80 100 czas retencji (min.) Rys. 6.3. Izolowanie przeciwciała monoklonalnego z mysiego płynu wysiękowego z zastosowaniem chromatografii oddziaływań hydrofobowych. Linią ciągłą przedstawiono zmiany gęstości optycznej w 280 nm, podczas gdy linia przerywana obrazuje % buforu B na kolumnie w trakcie realizacji programu separacji. 98

Oczekiwane wyniki: Białka zawarte w próbce mysiego płynu wysiękowego poddane działaniu siarczanu amonu w stężeniu 0,8 M ulegną częściowemu wytrąceniu z roztworu. Dotyczy to głównie białek silnie hydrofobowych. Pozostałe w roztworze cząsteczki, a wśród nich immunoglobuliny, mogą być użyte do chromatografii. W pierwszych frakcjach z kolumny wypłyną hydrofilowe białka, które słabo lub wcale nie oddziałują z hydrofobowymi ligandami złoża. W kolejnych frakcjach eluowane będą białka wykazujące średnie właściwości hydrofobowe, między innymi albuminy. Dopiero gdy stężenie siarczanu amonu obniży się do około 1M (około 50% B) kolumnę opuszczą interesujące nas immunoglobuliny (rysunek 5.3). Regeneracja i przechowywanie kolumny: Zakończenie programu chromatograficznego pozostawia kolumnę w stanie gotowości do ponownego użycia w tym samym celu. Po zakończonej pracy kolumnę przemyć wodą destylowaną (10 ml), a następnie 20% etanolem (3 ml) i przechowywać w temperaturze pokojowej. Przed ponownym użyciem kolumnę przemyć 20 ml wody. Uwagi: 1. Zastosowanie mają wszystkie uwagi jak w przykładzie 6.1. 2. Zastosowana w tym przykładzie kolumna nie może być obsługiwana przez systemy chromatografii niskociśnieniowej. Przy braku systemu wysokociśnieniowego można wykonać podobną procedurę izolowania immunoglobulin stosując kolumny HiTrap Octyl, HiTrap Phenyl lub HiTrap Butyl. Zastosowanie tych kolumn wymaga jednak wcześniejszego, doświadczalnego sprawdzenia warunków niezbędnych dla związania konkretnych białek. 3. System ÄKTAFPLC wraz z programem UNIKORN pozwala bardzo łatwo odtworzyć przeprowadzoną separację. Kolumna Alkyl Superose HR 5/5 może współpracować również z innymi systemami wysokociśnieniowymi. 6.4. Literatura 1. Hofmeister F. Arch. Exp. Pathol. Pharmacol., 24, 247, 1988. 2. Lindahl L., Vogel HJ. Anal. Biochem., 140, 394, 1984. 3. Szepesy L., Horvath C. Chromatographia, 28, 13, 1988. 4. Monoclonal Antibody Purification - Handbook. Pharmacia Biotech. 18-1037-46, 1997. 99