ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS W CHEMII ORGANICZNEJ I BIOCHEMII

Podobne dokumenty
FIZYKOCHEMICZNE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH PODSTAWY SPEKTROMETRII MAS

ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS W CHEMII ORGANICZNEJ I BIOCHEMII

ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS W CHEMII ORGANICZNEJ I BIOCHEMII WYKŁAD I PODSTAWY SPEKTROMETRII MAS

dobry punkt wyjściowy do analizy nieznanego związku

Spektrometria mas (1)

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH. Witold Danikiewicz. Instytut Chemii Organicznej PAN ul. Kasprzaka 44/52, Warszawa

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH. Witold Danikiewicz. Instytut Chemii Organicznej PAN ul. Kasprzaka 44/52, Warszawa

Jonizacja plazmą wzbudzaną indukcyjnie (ICP)

Schemat ideowy spektrometru mas z podwójnym ogniskowaniem przedstawiono na rys. 1. Pierwsze ogniskowanie według energii jonów odbywa się w sektorze

Metody desorpcyjne: DESIi DART. Analizator masy typu Orbitrap. Spektrometry typu TOF-TOF. Witold Danikiewicz. Copyright 2012

ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS W CHEMII ORGANICZNEJ I BIOCHEMII WYKŁAD 15 NOWE ZASTOSOWANIA I KIERUNKI ROZWOJU SPEKTROMETRII MAS

PODSTAWY INTERPRETACJI WIDM MASOWYCH. Copyright 2003 Witold Danikiewicz

Masowo-spektrometryczne badania reakcji jonowo-molekularnych w mieszaninach amoniaku i argonu

PODSTAWY INTERPRETACJI WIDM MASOWYCH. Copyright 2005 Witold Danikiewicz

Detekcja spektrometrii mas

ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS W CHEMII ORGANICZNEJ I BIOCHEMII WYKŁAD II ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS

Zadania powtórkowe do egzaminu maturalnego z chemii Wiązania chemiczne, budowa cząsteczek

Co to jest spektrometria mas?

Otrzymywanie halogenków alkilów

FIZYKOCHEMICZNE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH PODSTAWY INTERPRETACJI WIDM MASOWYCH

WARSZTATY olimpijskie. Co już było: Atomy i elektrony Cząsteczki i wiązania Stechiometria Gazy, termochemia Równowaga chemiczna Kinetyka

Próżnia w badaniach materiałów

Zadanie 4. Mrówczan metylu ma taki sam wzór sumaryczny jak: A. octan etylu. C. kwas mrówkowy. B. octan metylu. D. kwas octowy.

MECHANIZMY FRAGMENTACJI ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH. Copyright 2003 Witold Danikiewicz

RJC. 1 Kwasy i Zasady. Kwasy i zasady Brønsteda Stabilizacja Rezonansowa Kwasy i Zasady Lewisa HA + B: A - + BH + Slides 1 to 35

ODPOWIEDZI I SCHEMAT PUNKTOWANIA POZIOM ROZSZERZONY

Chemia ogólna nieorganiczna Wykład XII Kinetyka i statyka chemiczna

X / \ Y Y Y Z / \ W W ... imię i nazwisko,nazwa szkoły, miasto

Spektroskopia. Spotkanie pierwsze. Prowadzący: Dr Barbara Gil

Roztwory elekreolitów

VI Podkarpacki Konkurs Chemiczny 2013/2014

relacje ilościowe ( masowe,objętościowe i molowe ) dotyczące połączeń 1. pierwiastków w związkach chemicznych 2. związków chemicznych w reakcjach

Podstawy termodynamiki.

Politechnika Śląska Wydział Chemiczny Katedra Technologii Chemicznej Organicznej i Petrochemii INSTRUKCJA. Metody analizy związków chemicznych:

ET AAS 1 - pierwiastkowa, GW ppb. ICP OES n - pierwiastkowa, GW ppm n - pierwiastkowa, GW <ppb

V KONKURS CHEMICZNY 23.X. 2007r. DLA UCZNIÓW GIMNAZJÓW WOJEWÓDZTWA ŚWIĘTOKRZYSKIEGO Etap I czas trwania: 90 min Nazwa szkoły

CHEMIA BUDOWLANA ĆWICZENIE NR 3

Równowaga kwasowo-zasadowa

dr Małgorzata Czerwicka Zakład Analizy Środowiska Instytut Ochrony Środowiska i Zdrowia Człowieka Wydział Chemii UG

Proteomika. 1. Definicja proteomiki i techniki stosowane w proteomice

Projekt współfinansowany przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego O O

Wykład 11 Równowaga kwasowo-zasadowa

UKŁAD OKRESOWY PIERWIASTKÓW

III Podkarpacki Konkurs Chemiczny 2010/2011. ETAP I r. Godz Zadanie 1

Mechanizm dehydratacji alkoholi

TYPY REAKCJI CHEMICZNYCH

Wykład przygotowany w oparciu o podręczniki:

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH

11) Stan energetyczny elektronu w atomie kwantowanym jest zespołem : a dwóch liczb kwantowych b + czterech liczb kwantowych c nie jest kwantowany

Spektrometria Mas. Możesz skorzystać z gotowego programu sprawdzając powyższe parametry.

ZWIĄZKI KOMPLEKSOWE SOLE PODWÓJNE

MODEL ODPOWIEDZI I SCHEMAT PUNKTOWANIA

Spektroskopia charakterystycznych strat energii elektronów EELS (Electron Energy-Loss Spectroscopy)

O MATURZE Z CHEMII ANALIZA TRUDNYCH DLA ZDAJĄCYCH PROBLEMÓW

SPEKTROMETRIA MAS GOLUS KATARZYNA FIZYKA TECHNICZNA SEM.VIII

Opis przedmiotu zamówienia

Obliczenia chemiczne. Zakład Chemii Medycznej Pomorski Uniwersytet Medyczny

1. Określ liczbę wiązań σ i π w cząsteczkach: wody, amoniaku i chloru

Podstawy termodynamiki.

2. Metody, których podstawą są widma atomowe 32

RÓWNOWAGI W ROZTWORACH ELEKTROLITÓW

6. ph i ELEKTROLITY. 6. ph i elektrolity

Inne koncepcje wiązań chemicznych. 1. Jak przewidywac strukturę cząsteczki? 2. Co to jest wiązanie? 3. Jakie są rodzaje wiązań?

Temat 7. Równowagi jonowe w roztworach słabych elektrolitów, stała dysocjacji, ph

ODPOWIEDZI I SCHEMAT PUNKTOWANIA POZIOM ROZSZERZONY

Reakcje chemiczne. Typ reakcji Schemat Przykłady Reakcja syntezy

Proteomika. Spektrometria mas. i jej zastosowanie do badań białek

FIZYKOCHEMICZNE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH. Witold Danikiewicz

PODSTAWY CHEMII INŻYNIERIA BIOMEDYCZNA. Wykład 2

Zadania dodatkowe z konwersatorium z podstaw chemii Semestr letni, rok akademicki 2012/2013

a. Dobierz współczynniki w powyższym schemacie tak, aby stał się równaniem reakcji chemicznej.

Kwas HA i odpowiadająca mu zasada A stanowią sprzężoną parę (podobnie zasada B i kwas BH + ):

2. Właściwości kwasowo-zasadowe związków organicznych

1. Od czego i w jaki sposób zależy szybkość reakcji chemicznej?

Copyright 2003 Witold Danikiewicz ELECTROSPRAY IONIZATION (ESI)

Proteomika. Spektrometria mas. i jej zastosowanie do badań białek

Konkurs przedmiotowy z chemii dla uczniów gimnazjów 6 marca 2015 r. zawody III stopnia (wojewódzkie)

PRÓBNY EGZAMIN MATURALNY Z CHEMII

Rafał Frański, Grzegorz Schroeder

Ćwiczenie 2. Charakteryzacja niskotemperaturowego czujnika tlenu. (na prawach rękopisu)

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH

ZWIĄZKI KOMPLEKSOWE. dr Henryk Myszka - Uniwersytet Gdański - Wydział Chemii

Test kompetencji z chemii do liceum. Grupa A.

Wiązania. w świetle teorii kwantów fenomenologicznie

Chemia - laboratorium

Egzamin maturalny z chemii - poziom rozszerzony Kryteria oceniania - model odpowiedzi. Kryteria oceniania

MODEL ODPOWIEDZI I SCHEMAT PUNKTOWANIA

Repetytorium z wybranych zagadnień z chemii

Wydział Chemii, Zakład Dydaktyki Chemii ul. Ingardena 3, Kraków tel./fax:

Konkurs przedmiotowy z chemii dla uczniów dotychczasowych gimnazjów. 07 marca 2019 r. zawody III stopnia (wojewódzkie)

RJC E + E H. Slides 1 to 41

Spektrometria mas w badaniu. dr hab. Andrzej Kotarba, prof. UJ mgr Piotr Legutko, inż.

Krzywe energii potencjalnej dla molekuły dwuatomowej ilustracja przejść dysocjacyjnych IDENTYFIKACJA ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH

MATERIAŁY POMOCNICZE 1 GDYBY MATURA 2002 BYŁA DZISIAJ CHEMIA ZESTAW EGZAMINACYJNY PIERWSZY ARKUSZ EGZAMINACYJNY I

PRÓBNY EGZAMIN MATURALNY Z CHEMII

Spis treści Wstęp Spektrometria masowa (ang. Mass Spectrometry, MS)

Zastosowanie spektroskopii masowej w odlewnictwie

VIII Podkarpacki Konkurs Chemiczny 2015/2016

WOJEWÓDZKI KONKURS PRZEDMIOTOWY Z CHEMII DLA UCZNIÓW DOTYCHCZASOWYCH GIMNAZJÓW 2017/2018. Eliminacje szkolne

Transkrypt:

ZASTOSOWANIA SPEKTROMETRII MAS W CHEMII ORGANICZNEJ I BIOCHEMII WYKŁAD II JONIZACJA CHEMICZNA (CI), JONIZACJA POLEM (FI) I DESORPCJA POLEM (FD), SPEKTROMETRIA JONÓW WTÓRNYCH (FAB, LSIMS)

W jaki sposób można otrzymać jony w warunkach wysokiej próżni? 1. Przeprowadzenie substancji obojętnej z jej naturalnego stanu skupienia pod ciśnieniem atmosferycznym do warunków wysokiej próżni, a następnie jonizacja. 2. Przeprowadzenie jonów z układu pod ciśnieniem atmosferycznym (roztwór, ciało stałe) do warunków wysokiej próżni.

Metody jonizacji substancji obojętnej w warunkach wysokiej próżni Jonizacja substancji w fazie gazowej: Jonizacja elektronowa (EI Electron Ionization) Jonizacja polem (FI Field Ionization) Jonizacja w wyniku reakcji z innymi jonami, czyli jonizacja chemiczna (CI Chemical Ionization)

Metody jonizacji substancji obojętnej w warunkach wysokiej próżni Jonizacja substancji, która w warunkach wysokiej próżni znajduje się w fazie ciekłej lub stałej: Bombardowanie szybkimi atomami lub jonami (FAB Fast Atom Bombardment lub LSIMS Liquid matrix Secondary Ions Mass Spectrometry) Jonizacja laserowa (MALDI Matrix-Assisted Laser Desorption Ionization) Bezpośrednia jonizacja chemiczna (DCI Direct Chemical Ionization) Desorpcja polem (FD Field Desorption)

Kwasowość i zasadowość w fazie gazowej Powinowactwo do protonu cząsteczki obojętnej B + H + BH + PA(B) = H Powinowactwo do protonu anionu A - + H + AH PA(A - ) = H PA = Proton Affinity Kwasowość w roztworze HA + H 2 O A - + H 3 O + K a = [A - ][H 3 O + ]/[HA] pk a = - log(k a )

Kwasowość w roztworze i w fazie gazowej Tam, gdzie różnice energii solwatacji są duże, kwasowości w roztworze i w fazie gazowej mogą różnić się zasadniczo. Klasycznym przykładem jest szereg alkoholi alifatycznych: W roztworze: MeOH > EtOH > iproh > t-buoh pk a 15,5 16 17,1 18 W fazie gazowej: t-buoh > iproh > EtOH > MeOH PA(A - ) 1567 1570 1582 1596 kj/mol Orientacyjne przeliczenie: jednostka pk a = 5,7 kj/mol

JONIZACJA CHEMICZNA (CI)

Źródło jonów do EI i CI doprowadzenie gazu reagującego miejsce wprowadzania próbki (prostopadle do płaszczyzny rysunku) elektroda odpychająca katoda + obudowa komory jonizacyjnej (U A = 8000 V) magnes N S - magnes - soczewki ogniskujące elektroda przyspieszająca (U = 0 V) szczelina wejściowa wiązka jonów (do analizatora) E = zeu A Czas przebywania próbki w źródle jonów: ok. 10-6 s

Źródło jonów w spektrometrze AMD 604

Jonizacja chemiczna z wykorzystaniem metanu e CH - 4 CH + 4 + e - EI niskie CH + 4 CH + 3 + H ciśnienie Ułamek molowy I I CH 4 + CH 5 + C 2 H 5 + CH + 4 + CH 4 CH + 5 + CH 3 CI wysokie CH 3+ + CH 4 C 2 H + 5 + H 2 ciśnienie CH 4 + CH 5 + C 2 H 5 + CH 3 + Ciśnienie P P = 10-5 Torr P = 1 Torr C 3 H 5 +

Reakcje tworzenia kationów w źródle CI Wymiana protonu Wymiana ładunku M + XH + MH + + X M + X + M + + X Addycja elektrofilowa M + X + MX + Oderwanie anionu AB + X + A + + BX Utworzone w ten sposób kationy mogą ulegać dalszym reakcjom

Powinowactwo do protonu cząsteczek obojętnych B + H + BH + Zasada sprzężona (B) PA(B) = H Kation (BH + ) PA(B) [kj/mol] H 2 H + 3 423 CH 4 CH + 5 536 C 2 H 6 C 2 H + 7 585 H 2 O CH 3 OH H 3 O + CH 3 OH 2 + 712 762 CH 3 CN CH 3 CNH + 782 (CH 3 ) 2 C=CH 2 (CH 3 ) 3 C + 810 NH 3 NH + 4 847 CH 3 NH 2 CH 3 NH + 3 884 NH 2 (CH 2 ) 2 NH 2 NH 2 (CH 2 ) 2 NH + 3 936 Zdolność do protonowania

Wykorzystanie wartości powinowactwa do protonu Porównanie jonizacji chemicznej octanu etylu z wykorzystaniem CH 4 i NH 3 CH 3 COOEt + CH 5+ [CH 3 COOEt + H + ] + + CH 4 H r =? CH 4 + H + CH 5+ H 1 = -PA(CH 4 ) = -536 kj/mol CH 3 COOEt + H + [CH 3 COOEt + H + ] + H 2 = - PA(EtOAc) = -836 kj/mol H r = H 2 H 1 = PA(CH 4 ) PA(EtOAc) = -300 kj/mol CH 3 COOEt + NH 4+ [CH 3 COOEt + H + ] + + NH 3 H r =? NH 3 + H + NH 4+ H 1 = -PA(NH 3 ) = -847 kj/mol CH 3 COOEt + H + [CH 3 COOEt + H + ] + H 2 = - PA(EtOAc) = -836 kj/mol H r = H 2 H 1 = PA(NH 3 ) PA(EtOAc) = 11 kj/mol Zasada sprzężona (B) H 2 423 CH 4 536 C 2 H 6 585 H 2 O CH 3 OH PA(B) [kj/mol] 712 762 CH 3 CN 782 (CH 3 ) 2 C=CH 2 NH 3 810 CH 3 NH 2 847 884 NH 2 (CH 2 ) 2 NH 2 936 Średnia energia dysocjacji wiązania: C CO 354 kj/mol, O CO 420 kj/mol, C Br 302 kj/mol, C I 241 kj/mol

Zależność stopnia fragmentacji od rodzaju reagenta w CI HO N O CH3 M = 241 Zasada sprzężona (B) H 2 O CH 3 OH PA(B) [kj/mol] H 2 423 CH 4 536 C 2 H 6 585 712 762 CH 3 CN 782 (CH 3 ) 2 C=CH 2 NH 3 810 CH 3 NH 2 847 884 NH 2 (CH 2 ) 2 NH 2 936

Widma CI (CH 4 ) chlorku benzylu i p-chlorotoluenu CH 2 Cl CH 3 [M + H] + Cl [M + C 2 H 5 ] +

Widmo bezpośredniej jonizacji chemicznej (DCI)

Widma EI i CI n-dekanolu (M = 158) [M OH] + EI C 10 H 21 + [M H] + CI (CH 4 ) [M H] + CI (i-c 4 H 10 ) [C 9 H 19 CH=OH] +

Powstawanie jonów o m/z 141 i 157 w widmie CI n-dekanolu Powstawanie jonu o m/z 141 C 9 H 19 CH 2 OH + CH 5+ C 9 H 19 CH 2 OH 2+ + CH 4 C 9 H 19 CH 2 OH 2 + C 9 H 19 CH 2+ + H 2 O Powstawanie jonu o m/z 157 C 9 H 19 CH 2 OH + CH 5+ C 9 H 19 CH=OH + + CH 4 + H 2

Widma CI (H 3 + ) nitroanilin

Energia rekombinacji X + + e - X RE(X + ) = H Kationorodnik (X + ) He + He 24.6 Ar + Ar 15.8 N + 2 N 2 15.3 CO + CO 14.0 CO 2 + CO 2 Związek (X) RE(X + ) [ev] 13.8 CS + 2 CS 2 ~10 NO + NO 9.3 Wzrost zdolności do pobierania elektronu przez kationorodnik C 6 H 6 + C 6 H 6 9.2 1eV 96 kj/mol 23 kcal/mol

Kombinowane widmo CI z przeniesieniem protonu i przeniesieniem ładunku Układ Ar H 2 O H 3 O + przeniesienie protonu: powstaje jon M+H + Ar + przeniesienie ładunku: powstaje jon M +, który ulega fragmentacji

Mechanizmy tworzenia anionów w warunkach CI A. WYCHWYT ELEKTRONU Asocjacyjny wychwyt elektronu AB + e - AB - Dysocjacyjny wychwyt elektronu AB + e - A - + B Tworzenie par jonowych AB + e - A - + B + + e - B. REAKCJE JONOWO-CZĄSTECZKOWE Przeniesienie protonu MH + X - M - + HX Wymiana ładunku M + X - M - + X Addycja nukleofilowa M + X - MX - Podstawienie nukleofilowe AB + X - BX + A -

Powinowactwo do protonu anionów A - + H + HA PA(A - ) = H Anion (A - ) Kwas sprzężony (HA) PA(A - ) [kj/mol] NH - 2 NH 3 1689 H - H 2 1676 OH - H 2 O 1636 O - HO 1595 CH 3 O - CH 3 OH 1583 (CH 3 ) 2 CHO - (CH 3 ) 2 CHOH 1565 CH 2 CN - CH 3 CN 1556 F - HF 1554 Zasadowość C 5 H 5 - C 5 H 6 1480 O - 2 HO 2 1465 CN - HCN 1462 Cl - HCl 1395 p-no 2 -Ph-CHCN - p-no 2 -Ph-CH 2 CN 1378

Najważniejsze reagenty dla NCI N 2 O N 2 O + e - N 2 + O - PA(A - ) = 1595 kj/mol N 2 O i CH 4 N 2 O + e - N 2 + O - O - + CH 4 HO - + CH 3 PA(A - ) = 1636 kj/mol CH 3 ONO CH 3 ONO + e - CH 3 O - + NO PA(A - ) = 1583 kj/mol CH 2 Cl 2 CH 2 Cl 2 + e - Cl - + CH 2 Cl PA(A - ) = 1395 kj/mol

Widma PCI (CH 5 + ) i NCI (OH - ) fenyloalaniny NCI PCI

Widmo bezpośredniej NCI glikozydu

Widmo bezpośredniej NCI glukozy (Cl - ) [M + Cl] -

JONIZACJA POLEM (FI) DESORPCJA POLEM (FD)

Źródło jonów do jonizacji polem (FI) i desorpcji polem (FD) Powiększenie aktywowanego emitera do FI/FD

Źródło jonów do jonizacji polem (FI) Spektrometr GCT firmy Micromass

Widma EI i FI stearynianu metylu O M = 298 O

Widma EI, CI (NH 3 ) i FI kaprylanu butylu O M = 200 O FI CI EI

Widma EI, FI I FD kwasu glutaminowego EI FI FD

Widma FD peptydu przy różnych natężeniach prądu emitera

SPEKTROMETRIA JONÓW WTÓRNYCH: FAB i LSIMS

Źródło jonów do LSIMS + wiązka jonów Cs + (wiązka pierwotna) o energii 10 30keV działo cezowe soczewki ogniskujące wiązka jonów wtórnych (do analizatora) komora jonizacyjna roztwór próbki w matrycy stal kwasoodporna lub miedź sonda końcówka sondy w powiększeniu

Sonda do LSIMS

Matryce stosowane w technikach FAB i LSIMS Nazwa Skrót Wzór Masa Gliceryna GLY HOCH 2 -CH(OH)-CH 2 OH 92 Tiogliceryna TGL HOCH 2 -CH(OH)-CH 2 SH 108 Ditioerytrytol/ditiotreitol DTE/DTT HSCH 2 -CH(OH)-CH(OH)-CH 2 SH 154 Alkohol NBA 153 m-nitrobenzylowy O 2 N OH Eter o-nitrofenylowo-noktylowy NPOE O C8 H 17 NO 2 251 Dietanoloamina DEA (HO-CH 2 CH 2 -) 2 NH 105 Trietanoloamina TEA (HO-CH 2 CH 2 -) 3 N 149 Glikol polietylenowy PEG HO-(-CH 2 CH 2 -O-) n -H 44 n + 18 (n = 4 8)

Widma LSIMS (+) I (-) gliceryny M = 92 93 185 LSIMS (+) 183 LSIMS ( ) 277 369 461 553 645 91 275 367 459 551 737 829 643 735 827 Jony n M + H + Jony n M H -

Widmo SIMS CsI (M = 260) Jony n M + Cs +

Porównanie widm EI i LSIMS Intensity (%age) Intensity (%age) 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 100 90 80 70 60 50 40 30 20 10 0 81 95 105 125 140 152 162 179 192 205 80 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280 300 Low Resolution M/z 84 93 97 108 120 124 136 137 152 154 166 176 179 221 221 243 257 259 P O Ph M = 256 M + H + 273 279 80 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280 300 Low Resolution M/z 289 Cl 291

Widma LSIMS (+) i (-) peptydu (M = 1188) 1189 [M + H] + 1187 [M H] -

Widmo LSIMS insuliny 2868.0 1912.4 200 pmol insuliny w 2 µl NBA 5733.6

Klastery w widmach LSIMS M + H + 2M + H + M + Na + 3M + H + M + NBA + H + 2M + Na + 3M + Na +