IDENTYFIKACJA PROCESU HEMOLIZY



Podobne dokumenty
Ćwiczenie nr 2: ZaleŜność okresu drgań wahadła od amplitudy

Politechnika Gdańska

PROGNOZOWANIE CENY OGÓRKA SZKLARNIOWEGO ZA POMOCĄ SIECI NEURONOWYCH

Politechnika Gdańska Wydział Elektrotechniki i Automatyki Katedra Inżynierii Systemów Sterowania

OPTYMALIZACJA PARAMETRÓW PRACY PNEUMATYCZNEGO SEPARATORA KASKADOWEGO

Równania kwadratowe. Zad. 4: (profil matematyczno-fizyczny) Dla jakich wartości parametru m równanie mx 2 + 2x + m 2 = 0 ma dwa pierwiastki mniejsze

R L. Badanie układu RLC COACH 07. Program: Coach 6 Projekt: CMA Coach Projects\ PTSN Coach 6\ Elektronika\RLC.cma Przykłady: RLC.cmr, RLC1.

Typowe błędy w analizie rynku nieruchomości przy uŝyciu metod statystycznych

Dla naszego obiektu ciągłego: przy czasie próbkowania T p =2.

Statystyczne Metody Opracowania Wyników Pomiarów

MODEL MATEMATYCZNY OCENY WYTRZYMAŁOŚCI KINETYCZNEJ GRANULATU

W2. Zmienne losowe i ich rozkłady. Wnioskowanie statystyczne.

Statystyczne Metody Opracowania Wyników Pomiarów

Modelowanie reakcji chemicznych

Streszczenie. Słowa kluczowe: towary paczkowane, statystyczna analiza procesu SPC

Testowanie hipotez statystycznych.

WYZNACZANIE STAŁEJ DYSOCJACJI p-nitrofenolu METODĄ SPEKTROFOTOMETRII ABSORPCYJNEJ

Walidacja metod analitycznych

Analiza korelacyjna i regresyjna

W zaleŝności od charakteru i ilości cząstek wyróŝniamy: a. opadanie cząstek ziarnistych, b. opadanie cząstek kłaczkowatych.

KARTA INFORMACYJNA PRZEDMIOTU

Statystyczne Metody Opracowania Wyników Pomiarów

MODELOWANIE POŁĄCZEŃ TYPU SWORZEŃ OTWÓR ZA POMOCĄ MES BEZ UŻYCIA ANALIZY KONTAKTOWEJ

1. Jednoczynnikowa analiza wariancji 2. Porównania szczegółowe

Politechnika Wrocławska, Wydział Informatyki i Zarządzania. Modelowanie

Wprowadzenie do analizy korelacji i regresji

Przykład 1 ceny mieszkań

KSZTAŁTOWANIE KLIMATU AKUSTYCZNEGO PROJEKTOWANYCH STANOWISK PRACY Z WYKORZYSTANIEM NARZĘDZI WSPOMAGAJĄCYCH

Rachunek prawdopodobieństwa projekt Ilustracja metody Monte Carlo obliczania całek oznaczonych

Analiza wyników sprawdzianu w województwie pomorskim latach

Cyfrowe algorytmy sterowania AR S1 semestr 4 Projekt 4

K p. K o G o (s) METODY DOBORU NASTAW Metoda linii pierwiastkowych Metody analityczne Metoda linii pierwiastkowych

Analiza metod prognozowania kursów akcji

Pomiar długości fali świetlnej i stałej siatki dyfrakcyjnej.

Wyznaczanie przyspieszenia ziemskiego za pomocą wahadła prostego

Monitorowanie i Diagnostyka w Systemach Sterowania na studiach II stopnia specjalności: Systemy Sterowania i Podejmowania Decyzji

Drzewa Decyzyjne, cz.2

Kondensator, pojemność elektryczna

Testowanie hipotez statystycznych. Wnioskowanie statystyczne

Weryfikacja hipotez statystycznych, parametryczne testy istotności w populacji

Ćwiczenie nr 96: Dozymetria promieniowania γ

Wstęp do teorii niepewności pomiaru. Danuta J. Michczyńska Adam Michczyński

Temat ćwiczenia. Wyznaczanie mocy akustycznej

POLITECHNIKA WROCŁAWSKA INSTYTUT TECHNIKI CIEPLNEJ I MECHANIKI PŁYWNÓW ZAKŁAD SPALANIA I DETONACJI Raport wewnętrzny

Ćwiczenie 14. Maria Bełtowska-Brzezinska KINETYKA REAKCJI ENZYMATYCZNYCH

Statystyka od podstaw Janina Jóźwiak, Jarosław Podgórski

PLAN WYNIKOWY DLA KLASY DRUGIEJ POZIOM PODSTAWOWY I ROZSZERZONY. I. Proste na płaszczyźnie (15 godz.)

Ćwiczenie 5 PROGNOZOWANIE

Kontrola i zapewnienie jakości wyników

Rekurencje. Jeśli algorytm zawiera wywołanie samego siebie, jego czas działania moŝe być określony rekurencją. Przykład: sortowanie przez scalanie:

Matematyka i statystyka matematyczna dla rolników w SGGW

bo od managera wymaga się perfekcji

Ćw. 8 Bramki logiczne

Statystyka w pracy badawczej nauczyciela Wykład 4: Analiza współzależności. dr inż. Walery Susłow walery.suslow@ie.tu.koszalin.pl

Rozkład prędkości statków na torze wodnym Szczecin - Świnoujście

Metody Ilościowe w Socjologii

WSPÓŁCZYNNIK GOTOWOŚCI SYSTEMU LOKOMOTYW SPALINOWYCH SERII SM48

Copyright by Wydawnictwo Naukowe Scholar, Warszawa 2000, 2008

Podstawy opracowania wyników pomiarów z elementami analizy niepewności pomiarowych

Instrukcja do ćwiczeń laboratoryjnych

LABORATORIUM Z FIZYKI

USTALANIE WARTOŚCI NOMINALNYCH W POMIARACH TOROMIERZAMI ELEKTRONICZNYMI

AKADEMIA GÓRNICZO HUTNICZA Wydział Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Elektroniki Katedra Elektroniki

POMIAR NAPIĘCIA STAŁEGO PRZYRZĄDAMI ANALOGOWYMI I CYFROWYMI. Cel ćwiczenia. Program ćwiczenia

Analiza porównawcza dwóch metod wyznaczania wskaźnika wytrzymałości na przebicie kulką dla dzianin

ZAJĘCIA 25. Wartość bezwzględna. Interpretacja geometryczna wartości bezwzględnej.

istocie dziedzina zajmująca się poszukiwaniem zależności na podstawie prowadzenia doświadczeń jest o wiele starsza: tak na przykład matematycy

Analiza Danych Sprawozdanie regresja Marek Lewandowski Inf 59817

Rozdział 8. Regresja. Definiowanie modelu

( x) Równanie regresji liniowej ma postać. By obliczyć współczynniki a i b należy posłużyć się następującymi wzorami 1 : Gdzie:

ANALIZA METROLOGICZNA WYNIKÓW BADAŃ NA PRZYKŁADZIE ŁOŻYSK ŚLIZGOWYCH

Regulacja dwupołożeniowa.

STRESZCZENIE. rozprawy doktorskiej pt. Zmienne jakościowe w procesie wyceny wartości rynkowej nieruchomości. Ujęcie statystyczne.

Analiza wyników egzaminu gimnazjalnego w województwie pomorskim w latach

BADANIE CIEPLNE LAMINATÓW EPOKSYDOWO-SZKLANYCH STARZONYCH W WODZIE THERMAL RESERACH OF GLASS/EPOXY LAMINATED AGING IN WATER

Statystyczna analiza awarii pojazdów samochodowych. Failure analysis of cars

7. Identyfikacja defektów badanego obiektu

BADANIE PROSTEGO ZJAWISKA PIEZOELEKTRYCZNEGO POMIAR NAPRĘśEŃ BADANIE ODWROTNEGO ZJAWISKA PIEZOELEKTRYCZNEGO METODĄ STATYCZNĄ. POMIAR MAŁYCH DEFORMACJI

ZALICZENIA. W celu uzyskania zaliczenia należy wybrać jeden z trzech poniższych wariantów I, II lub III

Laboratorium optycznego przetwarzania informacji i holografii. Ćwiczenie 4. Badanie optycznej transformaty Fouriera

Wyznaczanie krzywej ładowania kondensatora

PRZEPŁYW CIECZY W KORYCIE VENTURIEGO

Komputerowa Analiza Danych Doświadczalnych

Spis treści. Przedmowa... XI. Rozdział 1. Pomiar: jednostki miar Rozdział 2. Pomiar: liczby i obliczenia liczbowe... 16

POLSKIE TOWARZYSTWO ELEKTROCIEPŁOWNI ZAWODOWYCH

Wpływ zanieczyszczenia torowiska na drogę hamowania tramwaju

WNIOSKOWANIE STATYSTYCZNE

WPŁYW OBRÓBKI TERMICZNEJ ZIEMNIAKÓW NA PRĘDKOŚĆ PROPAGACJI FAL ULTRADŹWIĘKOWYCH

O 2 O 1. Temat: Wyznaczenie przyspieszenia ziemskiego za pomocą wahadła rewersyjnego

Modelowanie i symulacja zagadnień biomedycznych PROJEKT BARTŁOMIEJ GRZEBYTA, JAKUB OTWOROWSKI

BŁĘDY W POMIARACH BEZPOŚREDNICH

7.2.2 Zadania rozwiązane

WSKAZÓWKI DO WYKONANIA SPRAWOZDANIA Z WYRÓWNAWCZYCH ZAJĘĆ LABORATORYJNYCH

Estymacja wektora stanu w prostym układzie elektroenergetycznym

Bezwładność - Zrywanie nici nad i pod cięŝarkiem (rozszerzenie klasycznego ćwiczenia pokazowego)

Wyznaczanie symulacyjne granicy minimalnej w portfelu Markowitza

WIECZOROWE STUDIA NIESTACJONARNE LABORATORIUM UKŁADÓW ELEKTRONICZNYCH

Prognoza terminu sadzenia rozsady sałaty w uprawach szklarniowych. Janusz Górczyński, Jolanta Kobryń, Wojciech Zieliński

Ćwiczenie N 13 ROZKŁAD CIŚNIENIA WZDŁUś ZWĘśKI VENTURIEGO

Eksperymentalne określenie krzywej podatności. dla płaskiej próbki z karbem krawędziowym (SEC)

Transkrypt:

Jerzy ŚWIĄTEK *, Krzysztof DOBOSZ, Mateusz LIS, Łukasz PINTAL ** IDENTYFIKACJA PROCESU HEMOLIZY Streszczenie W pracy podjęto próbę zamodelowania procesu rozpadu erytrocytów w 0,1% roztworze krwi oraz wpływu podania leku w znanym stęŝeniu na jej przebieg. Badano zaleŝność procentowej ilości zniszczonych komórek od czasu i stęŝenia substancji aktywnej w próbce. W dalszej kolejności porównano proces identyfikacji jedno i dwuetapowej oraz zaproponowano nowy model procesu dla stałego stęŝenia antybiotyku, który uwzględnia anomalie wynikające z przebiegu hemolizy na poziomie pojedynczej komórki. 1. Eksperyment 1.1. Opis procesu hemolizy Proces hemolizy jest to proces przejścia hemoglobiny do osocza krwi wywołany zniszczeniem erytrocytów. Na poziomie komórki przebieg hemolizy jest następujący: erytrocyt wypełnia się płynem z otoczenia, pęcznieje, po czym pęka. Przypuszcza się, Ŝe niektóre substancje mogą mieć wpływ na szybkość zachodzenia hemolizy oraz końcową ilość zniszczonych komórek. Przebieg hemolizy analizuje się oświetlając próbkę światłem o znanym natę- Ŝeniu i mierząc natęŝenie światła przepuszczonego przez roztwór. Próbka, w której nie zachodzi hemoliza jest mętna, próbka w której wszystkie komórki uległy hemolizie ma przejrzystość ośrodka, w którym rozpuszczona była krew. 1.. Przebieg eksperymentu W eksperymencie zbadano próbki 0,1% krwi od czterech róŝnych dawców, mieszane z antybiotykiem w stęŝeniach 0 µm (próbki kontrolne), 0,36 µm oraz 0,6 µm. UŜytą substancją aktywną był melittin. Próbki po wzbogaceniu lekiem zostały składowane przez godzinę w inkubatorze w temperaturze 37 O C. Następnie próbki przenoszone są na urządzenie stopped flow, gdzie zachodzi hemoliza. * Politechnika Wrocławska ** Politechnika Wrocławska

76 Jerzy Świątek, Krzysztof Dobosz, Mateusz Lis, Łukasz Pintal Czas od momentu procesu do ustalenia się poziomu transmitancji wynosi ok. 65 sek. KaŜda seria pomiarowa zawiera 350 pomiarów. RóŜnica w czasie między pomiarami wynosiła t = 0.0 sek.. Opis obiektu identyfikacji Wejściem naszego obiektu jest czas oraz stęŝenie podanego leku. Wyjściem jest stosunek (transmitancja) natęŝenia światła przepuszczonego przez roztwór do natęŝenia światła, którym oświetlana była próbka, który odpowiada procentowej ilości komórek, które uległy rozpadowi. PoniewaŜ model przewiduje niezaleŝność wyników od indywidualnych cech dawcy, została wyznaczona regresja liniowa i rzędu dla wszystkich serii pomiarowych przy stałym stęŝeniu antybiotyku, co jest równoznaczne uśrednieniu wszystkich próbek dla danego stęŝenia do jednej reprezentatywnej. Rys. 1. Reprezentatywne próbki dla stęŝeń po uśrednieniu wyników ze wszystkich serii pomiarowych 3. Dobór klasy modelu Celem procesu identyfikacji jest dobranie takiej funkcji Φ(s,, gdzie s - stę- Ŝenie, t - czas, aby jej przebieg był jak najbliŝszy rzeczywistym wynikom pomiarów K(s,. Przyjmujemy, Ŝe satysfakcjonującym przybliŝeniem obiektu będzie funkcja eksponencjalna z odpowiednio dobranymi parametrami: tc( s) Φ ( s, = A( s) B( s) e. (1) Dalsza analiza prowadzi do przyjęcia zaleŝności parametrów od stęŝenia:

Identyfikacja procesu hemolizy 77 A, B ~ s + k,( k R), C ~ s+ k,( k R), zatem ostateczna postać proponowanego modelu jest następująca: t( a4s+ a5 ) Φ ( s, = a0s + a1 ( as + a3) e. (3) () Rys.. Przykładowa seria pomiarowa dla próbki kontrolnej (s = 0) Przyjmujemy kryterium sumy kwadratów: Q( A) A= [ a N = 0 ( K n Φ( s, t, A)), n= 0 (4), a, a, a, a, a,]. 1 3 4 5 4. Identyfikacja parametrów Otrzymane wyniki pomiarów pozwalają przyjąć załoŝenie, iŝ statystyczny błąd pomiarowy ma wartość oczekiwaną równą 0 oraz skończoną wariancję, dlatego w dalszej części pracy do identyfikacji przyjmiemy metodę najmniejszych kwadratów. 4.1. Identyfikacja bezpośrednia Proces identyfikacji sprowadza się do zadania optymalizacji funkcji sześciu zmiennych Q(A). Rys. 3. Wykres otrzymanego modelu (identyfikacja jednostopniowa)

78 Jerzy Świątek, Krzysztof Dobosz, Mateusz Lis, Łukasz Pintal Optymalizacja została przeprowadzona w środowisku Python (za pomocą biblioteki SciPy), metodą Neldera Meada. 4.. Identyfikacja dwuetapowa Otrzymanie modelu globalnie optymalnego jest zadaniem skomplikowanym oraz pochłaniającym duŝe ilości zasobów z powodu konieczności optymalizacji funkcji duŝej ilości zmiennych, postanowiliśmy więc porównać otrzymane wyniki identyfikacji jednostopniowej z modelem otrzymanym na podstawie modeli lokalnie optymalnych dla stałego stęŝenia. MoŜemy przeprowadzić proces identyfikacji dla poszczególnych wartości stęŝenia (s = 0, 0.36, 0.6) i postaci modelu dla stałego stęŝenia zaproponowanej w punkcie 3 (1). Na podstawie modeli lokalnie optymalnych dla stałych wartości stęŝeń moŝemy zbudować model w ustalonej klasie. Rys. 4. Wykres otrzymanego modelu (identyfikacja dwustopniowa) 4.3. Porównanie metod Pomimo znaczącej róŝnicy wartości kryterium jakości dla obu modeli otrzymane średnie procentowe wartości błędu wynikającego z ich zastosowania wynoszą odpowiednio 0,% i 0,3%, a zatem oba pozwalają osiągnąć satysfakcjonujące przybliŝenia. Warte uwagi jest jednak to, Ŝe maksymalne odchylenie od danych rzeczywistych, koncentruje się na obszarze pierwszych pięciu sekund pomiaru (niezaleŝnie od stęŝenia), otrzymane w przypadku estymacji parametrów modelu jest w obu przypadkach o dwa rzędy większe od średniego. Prowadzi to do konkluzji, Ŝe moŝna zaproponować lepszą klasę modelu, uwzględniającą wyniki pomiarów na tym obszarze.

Identyfikacja procesu hemolizy 79 5. Anomalie w wynikach pomiarów 5.1. Sformułowanie problemu Jak zostało juŝ wspomniane, zaproponowana postać modelu nie oddaje w stopniu dostatecznym charakteru procesu w początkowej jego fazie. MoŜemy zaobserwować charakterystyczne,,przegięcie'' krzywej transmitancji na przedziale [0; 5] sek: Rys. 5. Krzywa transmitancji dla pojedynczej serii pomiarowej z zaznaczonym przegięciem Prawdopodobną przyczyną wystąpienia tego zjawiska jest przebieg hemolizy na poziomie pojedynczej komórki. Przypuszcza się, Ŝe w ciągu pierwszych sekund procesu erytrocyty masowo pęcznieją, przez co gwałtownie zmienia się przezroczystość cieczy w próbce, następnie pozostają przez chwilę w tym stanie, po czym następuje ich stopniowy rozpad. 5.1. Propozycja nowego modelu Rozpatrzymy przebieg hemolizy dla próbki z zerowym stęŝeniem antybiotyku, poniewaŝ dla takich parametrów zjawisko to jest najwyraźniejsze (próbka w oparciu o którą przeprowadzona zostanie identyfikacja na rys. 5). PoniewaŜ przyjęty uprzednio model dobrze opisuje proces na pozostałym przedziale czasowym, jego podstawowa struktura powinna zostać zachowana. Proponowany nowy model będzie postaci: Ψ ( =Φ( + ε (, (5) gdzie: Φ( - proponowana uprzednio postać modelu (3), ε ( - jest funkcją spełniającą poniŝsze załoŝenia:

80 Jerzy Świątek, Krzysztof Dobosz, Mateusz Lis, Łukasz Pintal ε ( 0 dla t > 5 sek; ε ( > 0 dla t < ~ sek; ε ( < 0 dla ~ sek < t < 5 sek. Funkcją spełniającą powyŝsze załoŝenia jest tłumiony sinus. Ostateczna postać klasy modelu to: a a t 3 Ψ( = a0 a1e + sin a t a 6. (7) 4 t + a 5 5.. Identyfikacja w zadanej klasie modelu Optymalizacja przeprowadzona metodą Neldera Meada dała wyniki dla których wartość kryterium jakości to 80.3 (wartość kryterium jakości dla modelu lokalnie optymalnego dla zerowego stęŝenia wynosi 37.08). 6. Podsumowanie W pracy zaproponowany został model zjawiska hemolizy przy obecności melittinu w róŝnych stęŝeniach. Identyfikacja procesu przeprowadzona została na dwa sposoby jedno i dwustopniowo. Estymacja parametrów modelu globalnie optymalnego dała lepsze rezultaty niŝ utworzenie modelu ogólnego z lokalnie optymalnych. Udało się równieŝ zaproponować klasę modelu opisującą nieuwzględniane we wcześniejszych badaniach zjawisko towarzyszące hemolizie i mające wpływ na jej przebieg. Abstract This paper is an approach to model the process of hemolisys in 0.1 percent blood solution, as well as an analysis of the influence of medicine applied during this process. Relation between percentage of destroyed cells, time and concentration the active constutuent was investigated. Further, there is a comparison of one and two-level identification and a proposal of a new model taking into account constant concentration of antibiotic in which abnormal flow of the hemolisys curve (implied by the way the hemolisys process runs on the level of a single cell) was considered.

Identyfikacja procesu hemolizy 81 Bibliografia: [1] Bubnicki Z., Identyfikacja obiektów sterowania, PWN, Warszawa 1974. [] Nelles O., Nonlinear system identification: from classical approaches to neural networks and fuzzy models, Springer, Berlin, 001. Recenzent: dr Krzysztof Bzdyra