Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych

Podobne dokumenty
BADANIA GENETYCZNE W DYSTROFIACH MIOTONICZNYCH

Choroba Buntingtona jako przykład choroby neurodegeneracyjnej ze szczególnym uwzględnieniem aspektów genetycznych

INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA

MUTACJE DYNAMICZNE. h a r d s 1995).

Jednostka chorobowa. Czas analizy [dni roboczych] Literatura Gen. Cena [PLN] Badany Gen. Materiał biologiczny. Chorobowa

Dziedziczenie jednogenowe. Rodowody

NIEPEŁNOSPRAWNOŚĆ INTELEKTUALNA. Anna Materna-Kiryluk Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu. Niepełnosprawność intelektualna - definicja

Składniki jądrowego genomu człowieka

Pacjent z odsiebnym niedowładem

Sesja 14. Neurogenetyka

Poszukiwanie zmutowanego genu 1

Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany

BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO

Jeden gen trzy choroby; efekty fenotypowe premutacji/mutacji w genie FMR1

Podłoże molekularne NF1 i RASopatii. Możliwości diagnostyczne.

Tomasz Mazurczak. Ataksja Friedreicha. Klinika Neurologii Dzieci i Młodzieży Instytut Matki i Dziecka Warszawa 2015

OFERTA BADAŃ GENETYCZNYCH

Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej

Wstęp do genetyki człowieka Choroby rzadkie nie są takie rzadkie

Niepełnosprawność intelektualna

Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???

TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

POTRZEBY DZIECKA Z PROBLEMAMI -DYSTROFIA MIĘŚNIOWA DUCHENNE A NEUROLOGICZNYMI W SZKOLE

TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów

WIEDZA. wskazuje lokalizacje przebiegu procesów komórkowych

Jednostka chorobowa HFE HFE Wykrycie mutacji w genie HFE odpowiedzialnych za heterochromatozę. Analiza mutacji w kodonach: C282Y, H63D.

mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

Analiza DNA w diagnostyce dystrofii mięśniowej Duchenne'a-Beckera

Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA)

GIMNAZJUM SPRAWDZIANY SUKCES W NAUCE

1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia

MUTACJE GENETYCZNE. Wykonane przez Malwinę Krasnodębską kl III A

Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe

Temat 6: Genetyczne uwarunkowania płci. Cechy sprzężone z płcią.

października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II

Ćwiczenie 12. Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania. Prof. dr hab. Roman Zieliński

Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I dla kierunku Lekarskiego, rok I 2015/2016. Ćwiczenie nr 1 (

Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:

Genetyka kliniczna - opis przedmiotu

Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD.

II WYDZIAŁ LEKARSKI, II ROK

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu

Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2

Krakowska Akademia im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego. Karta przedmiotu. obowiązuje studentów, którzy rozpoczęli studia w roku akademickim 2014/2015

Choroby genetyczne na tle zmian w genomie człowieka rodzaje, fenotyp, diagnostyka genetyczna

Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy

Wysokie CK. Anna Kostera-Pruszczyk Klinika Neurologii Warszawski Uniwersytet Medyczny

Tematyka zajęć z biologii

Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych

prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie

Diagnostyka neurofibromatozy typu I,

Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17

BADANIA GENETYCZNE W HODOWLI KOTÓW: CHOROBA SPICHRZENIOWA GLIKOGENU TYPU IV (GLYCOGEN STORAGE DISEASE TYPE IV - GSD IV)

2. Rozdział materiału genetycznego w czasie podziałów komórkowych - mitozy i mejozy

Imię i nazwisko...kl...

Mitochondrialna Ewa;

Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń narządu ruchu

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

Wykład 14 Biosynteza białek

S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Biologia medyczna. Nie dotyczy

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT

Konkurs szkolny Mistrz genetyki etap II

Człowiek mendlowski? Genetyka człowieka w XX i XXI w.

powtarzane co rok w sezonie jesiennym. W przypadku przewlekłej niewydolności

Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny

TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR DIAGNOSTICS OF MONOGENIC DISORDERS

Zadania maturalne z biologii - 2

Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych

Materiał i metody. Wyniki

Jakie są przyczyny uszkodzenia słuchu?

Częstotliwość występowania tej choroby to 1: żywych urodzeń w Polsce ok. 5-6 przypadków rocznie.

Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???

l.p CBM CBM s. Rydygiera SPSK

Podstawy genetyki człowieka

HCR-APOB Analiza. Wykrycie charakterystycznych mutacji genu APOB warunkujących występowanie hipercholesterolemii rodzinnej.

Nowoczesne systemy ekspresji genów

S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Stacjonarne (s)

Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości

Mapowanie genów cz owieka. podstawy

Informacje dla pacjentów i rodzin

Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi

Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...

Czy można zmniejszyć ryzyko występowania defektów genetycznych w populacji polskich koni arabskich?

Genetyczna "szara strefa" choroby Huntingtona: co to wszystko oznacza? Podstawy Genetyczne

CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Biologia medyczna, materiały dla studentów

Opieka nad chorymi z Dystrofią Mięśniową Duchenne a

Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym

u Czynniki ryzyka wystąpienia zakrzepicy? - przykłady cech osobniczych i stanów klinicznych - przykłady interwencji diagnostycznych i leczniczych

Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii

Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP

Zasady obliczania ryzyka genetycznego. Podstawy genetyki populacyjnej.

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

Zakład Genetyki Medycznej OFERTA BADAŃ DIAGNOSTYCZNYCH

Napisz, który z przedstawionych schematycznie rodzajów replikacji (A, B czy C) ilustruje replikację semikonserwatywną. Wyjaśnij, na czym polega ten

Transkrypt:

Postępy Psychiatrii i Neurologii, 1997, 6, 49--60 Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego Dynamie mutations in degenerative diseases oj the nervous system DOROTA HOFFMAN-ZACHARSKA Z Zakładu Genetyki IPiN w Warszawie STRESZCZENIE. W pracy omówiono istotę mutacji dynamicznych, przypuszczalny mechanizm ich powstawania oraz ich znaczenie w patogenezie niektórych procesów zwyrodnieniowych układu nerwowego. Przedstawiono dokladniej amplifikację określonych sekwencji trójnukleotydowych w kilku chorobach (red.). SUMMARY. The nature of dynamie mutations, their presumable underlying mechanism, as we!! as their role in the pathogenesis of some degenerative diseases o f the nervous system are discussed in the paper. More attention is devoted to amplification of selected trinucleotide sequences in several diseases (ed.). Słowa kluczowe: choroby zwyrodnieniowe o.u.n. l mutacje dynamiczne Key words: degenerative diseases of the CNS l dynamie mutations W ostatnich latach neurogenetyka molekularna rozwinęła się w jedną z bardziej aktywnych i obiecujących gałęzi neurobiologii. Jest to nowa dziedzina wykorzystująca techniki nowoczesnej genetyki molekularnej w badaniach klasycznych schorzeń neurologicznych o charakterze dziedzicznym, określanych mianem "chorób neurogenetycznych" i definiowanych jako kliniczne jednostki chorobowe, powodowane defektem jednego lub większej ilości genów, prowadzącym do zaburzenia różnicowania i funkqji neuroektodermy oraz jej pochodnych [Muller i wsp. 1994]. Choroby neurogenetyczne mogą być wynikiem zaburzenia prawidłowej ekspresji genu w neuroektodermie (typ I: wiele klasycznych dziedzicznych chorób zwyrodnieniowych, nerwowo-mięśniowych i zaburzeń rozwojowych mózgu), lub ich neurologiczny charakter może być powodowany pośrednio przez defekt genu nie ulegającego ekspresji w tkance nerwowej (typ II: choroby metaboliczne oraz dysplazje kostne z objawami neurologicznymi). Pod względem podłoża genetycznego można podzielić je na cztery grupy [Muller i wsp. 1994]: (l) grupa chorób powodowanych przez tzw. mutacje dynamiczne, czyli zwielokrotnienie sekwencji trójnukleotydowych w obrębie genów (np. choroba Huntingtona, bezład rdzeniowo -móżdżkowy, dystrofia miotoniczna, zespół kruchego chromosomu X), (2) choroby związane z wystąpieniem delecji lub disomiemości jednorodzicielskiej (np. dystrofia Duchenne'a -Beckera, zespół Pradera i Willego- -Algemana, zespół Millera-Dieker), (3) grupa chorób powodowanych głównie wystąpieniem mutacji punktowych (leukodystrofie sprzężone z chromosomem X, choroba Charcot-Marie -Tooth typ I i inne), (4) choroby genetycznie heterogenne, jak choroba Alzheimera czy choroba Parkinsona.

50 Dorota Hoffman-Zacharska W mmejszej pracy omówione zostanie podłoże molekularne chorób należących do pierwszej z wymienionych grup, ze szczególnym zwróceniem uwagi na choroby zwyrodnieniowe układu nerwowego. ANTYCYPACJA W CHOROBACH UWARUNKOWANYCH GENETYCZNIE Antycypację definiuje się jako występowanie, w przypadku niektórych chorób dziedzicznych, zjawiska cięższego przebiegu choroby, której objawy występowały już w kolejnych, wcześniejszych pokoleniach. Pojęcie to wprowadzono na początku XX wieku w wyniku szczegółowych badań klinicznych rodzin dotkniętych dystrofią miotoniczną (myotonic dystrophy, MD), podczas których zaobserwowano wyraźną "ewolucję" tej choroby od formy łagodnej (zaćma) poprzez wystąpienie w następnych pokoleniach klasycznej formy MD (postępujące osłabienie i zanik mięśni), której często w tym samym lub następnym pokoleniu towarzyszyły bezpłodność, upośledzenie umysłowe i przed- wczesna śmiertelność, aż do wystąpienia najostrzejszej, wrodzonej formy MD ( eongenital MD, CMD) z głębokim upośledzeniem umysłowym i zanikiem mięśni, która zawsze związana była z przekazywaniem choroby przez matkę (rys. la). Dalsze badania wykazały, że we wszystkich przypadkach wystąpiło dziedziczenie cechy w sposób autosomalny dominujący. Szczególny przypadek antycypacji zaobserwowano w dziedziczeniu zespołu kruchego chromosomu X (jragile X syndrom, zespół fra-x), najczęstszej formy dziedzicznego upośledzenia umysłowego, przekazywanej jako cecha dominująca o niepełnej penetracji, sprzężona z chromosomem X. Charakterystyczne dla zespołu fra-x jest, że 20% mężczyzn będących nosicielami mutacji nie wykazuje objawów upośledzenia, podczas gdy 30% kobiet nosicielek opóźnionychjest w rozwoju umysłowym. Ponadto córki bezobjawowych nosicieli nigdy nie wykazują objawów choroby, które pojawiają się dopiero w następnym pokoleniu, tzn. u ich wnuków. Podobnie, jak w przypadku Rys. 1a m O zdrowy mężczyzna O zdrowa kobieta chory mężczyzna chora kobieta CMD 5/2000 5/17 <> pleć nieznana [) heterozyg o ta EJ0 nosiciele 40% 16% 50% 28% Rysunek la. Antycypacja w dziedziczeniu dystrofii miotonicznej (MD -typowa forma dystrofii, CMD - wrodzona forma dystrofii), dla poszczególnych osób zaznaczono ilość powtórzeń erg w obrębie genu DM-19 [wg Caskey i wsp. 1992] Rysunek Ib. Paradoks Sherman, empirycznie wyznaczone ryzyko wystąpienia objawów zespołu fra-x w zależności od położenia w rodowodzie [wg Fu i wsp. 1991]

Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 51 MD, występuje tu zaostrzenie objawów choroby w kolejnych generacjach z tym, że ryzyko zachorowania zależy od pozycji danej osoby w drzewie rodowym (rys. lb). Jest to tzw. paradoks Sherman, który mówi, że prawdopodobieństwo wystąpienia choroby wśród rodzeństwa bezobjawowych nosicieli jest znacznie mniejsze (9%) niż wśród jego wnuków i prawnuków (40-50%) [Sherman i wsp. 1985]. W obu wymienionych przypadkach wytłumaczenie obserwowanych awisk było niezmiernie trudne w świetle założeń klasycznej genetyki mendlowskiej, definiującej geny jako stabilne elementy tylko rzadko zmieniane przez mutacje (częstość mutacji spontanicznych szacuje się na l x 10-9 na zasadę na pokolenie). Spowodowało to duży sceptycyzm w stosunku do obserwowanego awiska (pomimo, że antycypację opisano w kolejnych chorobach - np. w chorobie Huntingtona) i wreszcie uznanie go za wynik subiektywnego doboru danych klinicznych i statystycznych. Takie stwierdzenia można spotkać jeszcze w podręcznikach genetyki z lat osiemdziesiątych [Teisberg 1995]. Badania molekularne prowadzone w tych latach wykazały jednak, że materiał genetyczny nie jest aż tak stabilny, jak zakładano uprzednio, i doprowadziły do uznania antycypacji za awisko autentyczne, a nie fikcję. MUTACJE DYNAMICZNE - MOLEKU LARNE PODŁOŻE ANTYCYPACJI Genetyka klasyczna definiowała mutacje jako dziedzicznie utrwalone zmiany w sekwencji DNA prowadzące do zaburzenia prawidłowego funkcjonowania genów. Mutacje w takim ujęciu miały stabilny charakter, zarówno pod względem niezmienności przy przekazywaniu z pokolenia na pokolenie, jak również wpływu na prawdopodobieństwo zajścia kolejnych zmian w obrębie zmutowanej sekwencji DNA. Do weryfikacji tej definicji zmusiło odkrycie w genomach eukariotycznych obecności sekwencji mutujących z dużą częstością, niejednokrotnie przy każdorazowym przekazywaniu ich potomstwu. Sekwencje takie określono mianem niestabilnych sekwencji DNA. Niestabilne sekwencje DNA należą do grupy sekwencji repetytywnych (powtarzających się) stanowiących znaczącą frakcję (u zwierząt do 50%) DNA genomowego. Jednym z rodzajów takich sekwencji są tzw. sekwencje mikrosatelitarne składające się z wielu następujących po sobie powtórzeń sekwencji 2-5 nukleotydowych [Charlesworth i wsp. 1994]. Sekwencje te charakteryzują się dużym polimorfizmem, co oznacza, że występują w genomie w wielu formach różniących się między sobą ilością --ł CAO H CAO H CAO H CAO H CAO H CAG H CAG f-- DNA --ł OTC H GTC H OTC H GTC H OTC H OTC H GTC ::;:;::;::;:;:;:;:;:;:;:;;:L.--:l _Nićsyntetyzowana --ł GTC H. ----'H'-------'H. _,H. _,H. _,HL jl-- Matryca =:z l ---ł;; Ubm:::::::::jJ@::::::::::::t.:=:::U:::::::::::::::;:;:.;?.:i;::::! nowe ;;;rzenia -lorch H H H H H Rysunek 2. Schemat przedstawiający prawdopodobny mechanizm ślizgania się polimerazy (polymerase slippage) mogący prowadzić do zmiany ilości powtórzeń w obrębie sekwencji mikrosatelitarnych

52 Dorota Hoffman-Zacharska powtórzeń sekwencji podstawowej. Przyczyną tak znacznego polimorfizmu jest zapewne łatwość z jaką zachodzi w ich obrębie mutacja, polegająca na zmianie - amplifikacji (zwiększeniu) lub kontrakcji (zmniejszeniu) ilości jednostek podstawowych. Mechanizm powstawania tego typu mutacji nie jest obecnie wyjaśniony. Wydaje się jednak, że w przypadku sekwencji mikrosatelitamych są one wynikiem tzw. ślizgania się polimerazy (polymerase sli'ppage) - rys. 2 [Dover 1995], a prawdopodobieństwo ich zajścia zależy od długości niestabilnej sekwencji. Mutacje te określa się mianem mutacji dynamicznych. Obecność niestabilnych sekwencji DNA, będących przyczyną mutacji dynamicznych nie tylko w obszarach niekodujących genomu, ale i w obrębie sekwencji kodujących, jest przyczyną występowania szeregu chorób genetycznie uwarunkowanych. We wszystkich opisanych do tej pory przypadkach chorób należących do tej grupy dochodzi do amplifikacji trójnukleotydowych sekwencji powtórzonych (trinucleotyde repeats, TNRs), których liczba u osób zdrowych utrzymuje się w określonych granicach, a u osób chorych znacznie je przekracza. Stopień niestabilności sekwencji TNR zależy od ich długości (liczby już występujących powtórzeń), co tłumaczy zmienność fenotypową wywoływanych przez nie chorób, jak również zaostrzenie objawów w kolejnych pokoleniach, czyli obserwowane zjawisko antycypacji. MUTACJE DYNAMICZNE JAKO PRZYCZYNA NIEKTÓRYCH CHORÓB GENETYCZNYCH CZŁOWIEKA Jak już wspomniano powyżej, występowanie trójnukleotydowych sekwencji powtórzonych w rejonach kodujących niektórych genów jest przyczyną występowania chorób uwarunkowanych genetycznie. Do tej pory opisano dziewięć takich jednostek chorobowych: (l) zespół kruchego chromosomu X związany z obecnością kruchego miejsca FRAXA (FRAXA mental retardation), (2) lekkie upośledzenie umysłowe związane z obecnością kruchego miejsca FRAXE (FRAXE mental retardation), (3) dystrofia miotaniczna (miotonic dystrophy - MD), (4) rdzeniowo-opuszkowy zanik mięśni typu Kennedy'ego (spinobulbar muscular atrophy - SBMA), (5) choroba Hunringtona (Huntington disease - HD), (6) ataksja rdzeniowo-móżdżkowa typu l (spinocerebellar ataxia type l - SCAl), (7) padaczka miokloniczna z ruchami pląsawiczymi ( dentatorubral-pallidoluysian atrophy - DRPLA) będąca alleliczną formą zespołu Haw River (Haw River syndrome - HRS), (8) choroba Machado-Joseph (Machado Joseph di'sease- MJD) alleliczna z ataksją możdżkowo-rdzeniową typu 3 (spinocerebellar ataxia typ 3 - SCA3), (9) ataksja Friedreicha (Friedreich's ataxia -FRDA). Zestawienie danych dotyczących chorób związanych z amplifikacją powtórzonych sekwencji trójnukleotydowych, nazywanych niekiedy chorobami TNR (TNR disorders), przedstawiono w tabl. l. Wśród opisanych chorób związanych z amplifikacją sekwencji TNR na podstawie położenia w obrębie genu mutujących sekwencji oraz zakresu chorobotwórczego powtórzeń można wyróżnić dwie grupy (rys. 3). Pierwsza z nich obejmuje cztery jednostki chorobowe: upośledzenia umysłowe związane z kruchymi miejscami FRAXA i FRA XE, MD i FRDA, gdzie mutacje dotyczą obszarów genów nie ulegających translacji, związane są z bardzo silną amplifikacją sekwencji podstawowych - powyżej 200 powtórzeń i prowadzą do obniżenia, czy wręcz zahamowania, ekspresji genów. W przypadku

Tablica l. Zestawienie chorób powodowanych ampliftk:acją sekwencji trójnukleotydowych (dziedziczenie: A - autosomalne, X - sprzężone z chromosomem X, D -dominujące, R- recesywne; antycypacja: mat., ojc. -występująca odpowiedź w dziedziczeniu mutacji od matki lub ojca; lok. powtórzeń: UTR -rejon genu nie ulegający translacji, ORF - otwarta ramka odczytu) s n. ą. g. c g_ g_ ". ci n; ;:,: s g. ;:: c Ul w Częstość Lokali- Dziedzi- Antycy- Lokaliza- Pow- Ilość Choroba występ o- Gen Produkt genu zacja po- czenie pacja cja genu tórzenia powtórzeń w ani a wtórzeń Efekt l mutacji Zespół kruchego mężczyźni: XJD + (mat.) Xq27.3 FMR-1 bialko wiążące CGG norm. 5-58 5'UTR inhibicja chromosomu X 1/1250 RNA premut. 60-230 transkrypcji mut. >200 mut. 67-80 11.0biety: 1/2000 mut. 230-2000 Upośledzenie umysłowe? XJD (?)? Xq28 FMR-2? CCG norm. 6-25 5'UTR? (inhibicja związane z FRAXE premut.? transkrypcji) Dystrofia miotaniczna 1/8000 AjD + (mat.) 19q13.3 MT-PK miotonina- CTG norm. 5-35 3'UTR inhibicja (MD) kinaza bialkowa premut. 50-100 mut. 50-2000 transkrypcji Ataksja Friedreicha 1/50000 A/R? 9ql8-21.1 X-25 frataksyna - GAA norm. 7-22 intron. inhibicja (FRDA) funkcja niezn. premut.? transkrypcji mu t. 20->l 000 Rdzeniowo-opuszkowy? X/R + Xqll-q12 AR receptor CAG norm. 11-36 ORF zmiana zanik mięśni (SBMA) androgenów premut.? aktywności - cz. transkryp. mut. 40-62 bialka Choroba Buntingtona 1/10000 AJD + (ojc.) 4p16.3 IT15 huntingtina CAG norm. 10-36 ORF? (zmiana (HD) - funkcja niezn. premut. 34-36 aktywności mut. 37-120 bialka) Bezład rdzeniowo-? AjD + (ojc.) 6p22-p23 SCAl ataksyna-l CAG norm. 14-36 ORF? (zmiana -móżdżkowy typu l - funkcja niezn. premut. niezn. aktywności (SCAl) mut. 43-81 białka) Ataksja Machado-? AjD + (ojc.) 14q32 MIDI CAG norm. 13-37 ORF? (zmiana -Joseph {MID/SCA3) premut. niezn. aktywności bialka) Padaczka miokloniczna? AjD + (ojc.) 12p12 B37 atrofina-1 CAG norm. 7-23 ORF? (zmiana z ruchami pląsawiczymi - funkcja niezn. premut. niezn. aktywności (DRPLA{HRS) mut. 49-75 białka) ---

54 Dorota Hoffman-Zacharska Ryc. 3a DNA PROMOTOR E REJON KODUJĄCY E E E E TERMINATOR hnrna TRANSKRYPCJA mrna BIAŁKO 5'UTR l SPLICING ORF TRANSLACJA 1 3'UTR Ryc. 3b 5' UTR EGZON INTRON E GZO N ; {f EGZON 3' UTR FRAXA FRAXE MD CGG &-2\BIBI.. IMMIiilliililliii!!BIBIBII----------IE ulh CCG 11117olll!: 0 111! 0 11tllll llliiiiiiiibbiii!bbii!!ibl8iliiiii J::=:::::==:::::: a:::::::::;;===:: -OOBB.BBiiBIBIBIMIU88188188iiBIBIRI8 ;.. 1111.. RIMIBIIIR CAG 50-2000 tst SBMA 11-33 HD MJD/SCA3 SCA1 z: mm CAG CAG '8" 1- li 7-8 liii88!111111111eiiilllllll liiibis... llllllllii!i!18sn 88118118888881B!U BI-MI*!IV,iSIBIS RH DRPLA/HRS FRDA IIIIII H H l CAG 14-36 l_1 liiilliiliii GAA Jt 200-900 CAG 7-23 } piiifflłl8118!tlllł lllililillli.illilllil '19- Rysunek 3a. Schemat przedstawiający etapy ekspresji genu eukariotycznego. Sekwencja DNA zawierająca zarówno egzony (E), jak i introny (I) przepisywana jest narnaw postaci pierwotnego transkryptu (hnrna), z którego w procesie splicing wycinane są sekwencje niekodujące- introny. mrna stanowi matrycę do syntezy białka, sekwencje UTR na 5' i 3' końcu cząsteczki przed kodonem AUG i za kodonem "stop" nie ulegają translacji Rysunek 3b. Schemat przedstawiający rozmieszczenie sekwencji trójnukleotydowych w genach dla różnych chorób genetycznych powodowanych mutacjami dynamicznymi. W każdym przypadku podano rodzaj sekwencji, zakres powtórzeń u osób zdrowych (powyżej) i osób chorych. Objaśnienia skrótów nazw chorób znajdują się w tekście

Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 55 FRAXA i FRAXE mamy do czynienia z amplifikacją odpowiednio sekwencji CGG i CCG, której towarzyszy wystąpienie łamliwych miejsc w chromosomie X. Zwielokrotnienie sekwencji zachodzi na 5' końcu genu. Interesujące jest, że za wystąpienie w genomie człowieka trzech innych miejsc łamliwych również odpowiedzialne są zwielokrotnione podobne sekwencje trójnukleotydowe - FRAXF (GCC), FRA16A (CCG) oraz FRAllB (CCG) [Parrish i wsp. 1994, Jones i wsp. 1995]. We wszystkich przypadkach sekwencje te sąsiadują z tzw. wyspami CpG (CpG islands). Sekwencje CpG u pacjentów. z zespołem fra-x, u których w badaniu cytogenetycznym wykrywa się obecność miejsca FRAXA zawsze ulegają hipermetylacji. W przypadku MD amplifikowana jest sekwencja CTG w rejonie 3' UTR [Brook i wsp. 1992], a w FRDA sekwencja GAA w obszarzelintronu genu [Campuzano i wsp. 1996]. Druga grupa- to szereg chorób, w przypadku których mutacje obejmują obszary genów odczytywane w procesie translacji (otwarta ramka odczytu z ang. open reading frame- ORF), dotyczą one tylko sekwencji CAG (kodonu kodującego glutaminę) i prowadzą do wydłużenia ciągu glutamin w produkcie białkowym, zmieniając w ten sposób jego podstawową funkcję. Niestabilność sekwencji nie jest tu tak silna, a liczba powtórzeń trójnukleotydu CAG nigdy nie przekracza 150. Do grupy tych chorób należą: HD [Huntington Disease Collaborative Group 1993], SBMA [La Spada i wsp. 1991], SCAl [Orr i wsp. 1994], MJD [Kawaguchi i wsp. 1994] i DRPLA [Koide i wsp. 1994] będące chorobami zwyrodnieniowymi układu nerwowego o charakterze postępującym, związanymi z selektywną utratą neuronów. Choroby te dziedziczone są w sposób dominujący (wyjątek stanowi SBMA), charakteryzują się późnym występowaniem objawów (po 30 roku życia) i antycypacją, związaną z ojcowskim przekazywaniem zmutowanego genu, prowadzącą do występowania form młodzieńczych (objawy przed 20 rokiem życia). Rdzeniowo-opuszkowy zanik mięśni typu Kennedy'ego Rdzeniowo-opuszkowy zanik mięśni - to choroba należąca do grupy chorób nerwowo-mięśniowych charakteryzująca się zanikiem neuronów ruchowych. Jest to choroba wieku średniego o charakterze postępującym, której główne objawy obejmują osłabienie i zanik mięśni. Choroba dziedziczona jest jako cecha recesywna sprzężona z płcią. Występuje tylko u mężczyzn, u których oprócz głównych objawów stwierdza się obniżoną płodność i ginekomastię. Przyczyną tej choroby jest mutacja w l egzonie genu AR- kodującego receptor androgenu. Mutacja polega na amplifikacji sekwencji CAG, co prowadzi do wydłużenia ciągu glutamin na N-końcu białka. Receptor androgenu pełni funkcję czynnika transkrypcyjnego aktywowanego obecnością androgenów. Mutacja, która zaburza funkcję aktywującą białka, nie zachodzi jednak ani w domenie wiążącej hormon, ani w domenie oddziałującej z DNA. W chwili obecnej nie wiadomo, jaki jest związek pomiędzy amplifikacją sekwencji CAG a degeneracją neuronów ruchowych. Nie jest to najprawdopodobniej prosta utrata funkcji białka, gdyż u pacjentów z delecją genu AR nie obserwuje się objawów charakterystycznych dla SBMA, jedynie zespół jąder feminizujących [Bingham i wsp. 1995]. Choroba (pląsawica) Rontingtona Choroba Buntingtona (HD) jest chorobą zwyrodnieniową mózgu charakteryzującą się zanikiem neuronów prążkowi a i kory płatów czołowych. Podstawowymi jej objawami są mimowolne ruchy pląsawicze (początkowo ograniczonych grup mięśni z późniejszym stałym niepokojem ruchowym z zaburzeniami chodu) i postępujące otępienie. Objawy chorobowe w 90% przypadków występują między 35 i 40 rokiem życia, w 10% w tzw. postaci młodzieńczej HD, przed 20 rokiem życia. Przeciętnie chorzy umierają po 15-20 latach od pojawienia się objawów choroby. Postaci młodzieńczej,

56 Dorota Hoffman-Zacharska związanej zazwyczaj z dziedziczeniem ojcowskim, towarzyszą ostrzejsze objawy i szybszy przebieg choroby. HD przekazywana jest jako cecha autosomaina dominująca o pełnej penetracji. Przyczyną tej choroby jest mutacja położonego na chromosomie4 genu IT15 kodującego huntingtynę -białko o nieznanej funkcji, nie wykazujące istotnej homologii do żadnego innego znanego obecnie białka. Huntingtyna jest białkiem cytoplazmatycznym, którego ekspresja, zarówno u osób zdrowych, jak i chorych, zachodzi w większości tkanek -nie jest ograniczona do układu nerwowego. Mutacja chorobotwórcza w tym przypadku związana jest również z niestabilnością sekwencji CAG znajdującej się na 5' końcu genu IT15. Ilość powtórzeń tej sekwencji w populacji osób zdrowych jest wysokozmienna - od 7 do 36, z tym, że w większości przypadków (> 99%) nie przekracza 30. U osób dotkniętych HD spotyka się ilość powtórzeń CAG w zakresie od 37 do ponad 120 (najczęściej 42---44). Amplifikację tej sekwencji powyżej 37 powtórzeń stwierdza się niemal u wszystkich (99%) pacjentów, u których rozpoznano HD. Uznaje się więc, że jest to specyficzny marker pozwalający na weryfikację rozpoznania klinicznego, a u osób pochodzących z rodzin ryzyka HD nie wykazujących objawów- na stwierdzenie lub wykluczenie nosicielstwa mutacji związanej z tą chorobą. Szereg badań wykazuje istnienie korelacji pomiędzy wiekiem zachorowania a wielkością rejonu powtórzeń CAG w obrębie genu IT15, tzn. im większa liczba powtórzeń tym wcześniej występują objawy choroby. Najwyraźniej zależność ta widoczna jest w przypadkach młodzieńczych, gdzie objawy występują przed 20 rokiem życia, a liczba powtórzeń przekracza 50. Liczba powtórzeń nie poiwala jednak przewidywać w konkretnym przypadku ani wieku zachorowania ani klinicznego przebiegu choroby. Mechanizm patogenezy choroby Hunringtona nie został jeszcze poznany. Porlobnie jak w przypadku SBMA, selektywna utrata neuronów nie jest wynikiem utraty aktywności jednego allelu IT15, lecz zmiany funkcji kodowanego przez niego białka, za czym przemawia fakt, że pacjenci z zespołem Wolf-Hirshorna, będący hemizygotami dla obszaru obejmującego gen IT15, na skutek częściowej delecji krótkiego ramienia chromosomu 4, nie wykazują objawów charakterystycznych dla HD. Dziedziczne ataksje rdzeniowo-móżdżkowe Dziedziczne ataksje rdzeniowo-móżdżkowe (spinocerebellar ataxias- SCAs) stanowią heterogenną grupę postępujących chorób zwyrodnieniowych związanych z degeneracją neuronów w móżdżku, rdzeniu kręgowym i pniu mózgu. Pod względem genetycznym choroby te można podzielić na autosomalne recesywne, autosoma1ne dominujące i przypadki izolowane. Dla ataksji o dziedziczeniu recesywnym opisano dwa loci, na chromosomie 8q (ataksja związana z niedoborem wit. E) i 9q (ataksja Friedreicha). Do chwili obecnej, zmapowano również siedem loci związanych z ataksjami o dziedziczeniu dominującym: SCAl na chromosomie 6p, SCA2 na chromosomie 12q, choroba Machado-Joseph/SCA3-14q, SCA4-16q, SCA7-3p, SCA5 w centromerowym rejonie chromosomu 11 i DRPLA na chromosomie 12p - tabl. 2. W przypadku czterech z tych chorób uszkodzenia poszczegó1nych genów związane są z mutacjami dynamicznymi. W FRDA amplifikacji ulega trójnukleotyd GAA położony w obrębie intronu prowadząc do obniżenia poziomu mrna, w SCAl, MJD oraz DRPLA amplifikacji ulega sekwencja CAG w otwartej ramce odczytu, prowadząc, podobnie jak w przypadku SBMA i HD, do powstania białka o zwiększonym ciągu glutamin. U chorych z SCA2 i SCA 7 (AD CAli) również stwierdzono występowanie białek o dużych rejonach paliglutaminowych [Trottier i wsp. 1995], co, biorąc pod uwagę fakt występowania antycypacji w ich dziedziczeniu, może wskazywać na analogiczne podłoże molekularne mutacji.

Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 57 Tablica 2. Zestawienie danych dotyczących ataksji o charakterze dziedzicznym [wg Harding 1995, Schols i wsp. 1995, Junck i Fink 1996] l. Ataksje o dziedziczeniu recesywnym Lokalizacja genu Mutacja Częstość występowania AVED 8ql3 nieznana nieznana FRDA 9ql8-q21.1 powt. GAA cz. 1/50000 (nos. 1/120) 2. Ataksje o dziedziczeniu dominującym AutosomaJne dominujące ataksje móżdżkowe typu I - ADCA I SCAl 6p22-23 powt. CAG 17% SCA2 12p23-24 nieznana (CAG?) nieznana SCA3/MID 14q32 powt. CAG 18% SCA4 16q24 nieznana nieznana AutosomaJne dominujące ataksje móżdżkowe typu II - ADCA II SCA7 3p14-21.1 nieznana (CAG?) nieznana AutosomaJne dominujące ataksje móżdżkowe typu III - ADCA III SCAS llcent. nieznana nieznana DRPLAjHRS -padaczka miokloniczna z ruchami pląsawiczymi AutosomaJne dominujące ataksje periodyczne 12p12 powt. CAG 3% 12p i 19p nieznane DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA MUTACJI DYNAMICZNYCH Diagnostyka molekularna chorób wywoływanych przez mutacje dynamiczne opiera się w chwili obecnej na bezpośredniej analizie regionów ulegających mutacji. Sposób diagnostyki dla wszystkich chorób należących do tej grupy jest podobny i jego podstawą jest określenie wielkości fragmentu 4a 4b (CGG)n EcoRI sonda EcoRI l l l pełna mutacja - promutacja..._-_- -_, allel dziki- 5,2 kb Rysunek 4. Diagnostyka molekularna w zespole fra-x oparta na analizie restrykcyjnej DNA połączonej z hybrydyzacją. DNA cięty jest enzymem restrykcyjnym EcoRI, a następnie fragmenty DNA rozdzielane są w żelu agarazowym i po przeniesieniu na f:jltr hybrydyzowane z sondą. Niestabilne sekwencje (CGG). położone są wewnątrz fragmentu EcoRI rozpoznawanego przez sondę (4a). Wielkości hybrydyzujących fragmentów odpowiadają stopniowi zwielokrotnienia tej sekwencji (4b)

58 Dorota Hoffman-Zacharska NPR. (CAG 37-120) PR. (CAG 8-34) Rysunek 5. Diagnostyka molekularna w chorobie Huntingtona. Na zdjęciu przedstawiona jest analiza produktów amplifikacji PCR rejonu obejmującego powtórzenia (CAG). genu IT15. Produkty reakcji rozdzielone zostały w 6% żelu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących. Wielkośc;i poszczególnych fragmentów, na podstawie których wyliczono liczbę powtórzeń CAG,.ustalono poprzez bezpośrednie ich porównanie ze standardem wielkości - w tym przypadku reakcja sekwencjonowania faga Ml3/mp18. Amplifikację DNA prowadzono przy zastosowaniu starterów HDljHD3, liczbę powtórzeń CAG = (wielkość prod. PCR-47bp)/3 [Warner i wsp. 1993]

Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 59 DNA obejmującego region niestabilny oraz ustalenie czy ilość powtórzeń sekwencji TNR znajduje się w zakresie patogennym dla danej choroby. W badaniach stosuje się dwie podstawowe metody: analizę restrykcyjną połączoną z hybrydyzacją oraz reakcję amplifikacji DNA metodą PCR (rys. 4, 5). Pierwsza z tych metod wykorzystywana jest w testach diagnostycznych chorób związanych z silną amplifikacją sekwencji TNR (MD, zespół fra-x), druga stosowana jest w diagnostyce wszystkich chorób, gdzie dochodzi do ograniczonej amplifikacji sekwencji CAG. Bezpośrednia analiza molekularna niestabilnych rejonów DNA o znaczeniu chorobotwórczym pozwala na jednoznaczną klasyfikację jednostek chorobowych (co jest szczególnie istotne w przypadku HD i ataksji móżdżkowych o dziedziczeniu dominującym), a w praktyce może być wykorzystywana jako rutynowe badanie weryfikujące diagnozę kliniczną. Analiza DNA pozwala również na ustalenie nosicielstwa choroby u osób nie wykazujących objawów, a pochodzących z rodzin ryzyka genetycznego oraz w diagnostyce prenatalnej. Badania tego typu powodująjednak szereg problemów etycznych, szczególnie w przypadku chorób zwyrodnieniowych układu nerwowego o późnym wieku zachorowania. Doprowadziło to już do opracowania międzynarodowych zasad poradnictwa genetycznego dla rodzin dotkniętych HD [IHA, WFN 1994], które również powinny być stosowane w przypadku pozostałych chorób o podobnym przebiegu klinicznym i takim samym podłożu genetycznym. PIŚ:MIENNICTWO l. Bingbam P.M., Scott M.O., Wang S.M., McPhaul M.J., Wilson E.M., Garbem J.Y., Merry D.E., Fischbeck K.H.: Stability of expanded trinucleotide repeat in the androgen receptor gene in transgenie mice. Nature Genetics 1995, 9, 191-196 2. Brook J.D., McCurrach M., Harley H.G.: Molecutar basis of myotonic dystrophy: expansion of a trinucleotide (CTG) repeart at the 3' end of a transcript encoding a protein kinase famiły member. Celi 1992, 68, 799-808 3. Campuzano V., Montermini L., Molto M.D., Pianese L., Cossee M., Cavalcanti F., Koenig M., Pandolfo: Friedreich's ataxia: autosomai recessive disease caused by an intronic GAA tripiet repeat expansion. Science 1996, 271, 1423-1427 4. Caskey C.T., Pizzuti A., Fu Y-H., Fenwiek R.G., Nelson D.L.: Tripiet repeat mutations in human disease. Science 1992, 256, 784-789 5. Charlesworth B., Sniegowski P., Stepban W.: The evolutionary dynamics of repetitive DNA in eukaryotes. Nature 1994, 371, 215-220 6. Dover G. : Slippery DNA runs on and on and on... Nature Genetics 1995, 10, 254-256 7. Fu Y-H., Kuhl D.P., Pizzuti A., Pieretti M., Sutcliffe J.S., Richards S., Verkerk A.J.M., Warren S.T., Oostra B.A., Caskey C.T.: V ariation of the CGG repeat at the fragile X site results in genetic instability: resolution of the Sherman paradox. Celi 1991, 67, 1047-1058 8. Huntington Disease Collaborative Research Group: A novel gene containing a trinucleotide repeat that is expanded and unstable on Huntington's disease chromosome. Cell 1993, 72, 971-983 9. International Huntington Association (IHA) and World Federation of Neurology (WFN): Guidelines for the molecular genetics predictive test in Huntington's disease. Neurology 1994, 44, 1533-1536 10. Kawaguchi Y., Okamoto T., Tamiwaki M.: CAG expansion in anovel gen e for Macbado -J osep h disease at chromosame 14q 32.1. N ature Genetics 1994, 8, 221-228 11. Koide R., Ik:euchi T., Onodera 0., Tanaka H., Igarashi S., Miike T., Naito H., Ikuta F., Tsuji S.: Unstable expansion of CAG repeat in hereditary dentatorubral-pallidoluysian atrophy (DRPLA) Nature Genetics 1994, 6, 9-13 12. La Spada A.R., Wilson E.M., Lubahn D.B., Harding A.E., Fischbeck K.H.: Androgen receptor gene mutations in X-linked spinał and bulbar muscular atrophy. Nature 1992, 352, 77-79

60 Dorota Hoffman-Zacharska 13. Muller U., Graeber M.B., Haberhausen G., Kohler A.: Molecular basis and diagnosis of neurogenetic disorders. J. Neurol. Sciences 1994, 124, 119-140 14. Orr H. T., Chung M., Banfi S., (1993) Expansion of unstable trinucleotide CAG repeat in spinocerebellar ataxia type I. Nature Genetics, 1993, 4, 221-226 15. Parrish J., Oostra B.A., Verkerk J.M.H., Richards C.S., Reynolds J., Spikes A.S., Shaffer L.G., Nelson D.L.: Isolation of GCC repeat showing expansion in FRAXF, a fragile site distal to FRAXA and FRAXE. Nature Genetics 1994, 8, 229-235 16. Sherman S.L., Jacobs P.A., Morton N.E., Froster-Iskenius U., Howard-Peebles P.N., Nielsen K.B., Watson M.: Furtber segregation analysis of the fragile X syndrome with speclal reference to transmiting males. Hum. Genet. 1985, 69, 3289-3299 17. Teisberg P.: The genetic background o f anticipation. J.Royal Society of Medicine 1995, 88, 185-187 18. Trottier Y., Lutz Y., Stevanin G., Imbert G., Devys D., Cancel G., Agid Y., Brice A., Mandel J-L.: Polyglutamine expansion as a pathological epitope in Huntingtin's disease and four dominant cerehehar ataxias. Nature 1995, 378, 403-406 19. Warner J.P., Barran L.H., Brock J.H.: A new polymerase chain reaction (PCR) assay for the trinucleotide repeat that is unstable and expanded on Huntington's disease chromosomes. MolecuTiar and Cellular Probes 1993,7,235-239 Adres: Dr Dorota Hoffman-Zacharska, Zakład Genetyki IPiN, Al. Sobieskiego 1/9, 02-957 Warszawa