Techniki oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych in vitro



Podobne dokumenty
Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro

Oznaczanie aktywności cytotoksycznej chemoterapeutyków wobec komórek nowotworowych

BIOLOGIA KOMÓRKI. Testy witalności komórek

BIOLOGIA KOMÓRKI. Analiza żywotności komórek w warunkach in vitro

PODSTAWY BIOLOGII KOMÓRKI. Bankowanie komórek i ocena ich żywotności

PODSTAWY BIOLOGII KOMÓRKI. Bankowanie komórek i ocena ich żywotności

1. Oznaczanie aktywności lipazy trzustkowej i jej zależności od stężenia enzymu oraz żółci jako modulatora reakcji enzymatycznej.

ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN

Metody badania aktywności leków in vitro

Technika hodowli komórek leukemicznych

Laboratorium 8. Badanie stresu oksydacyjnego jako efektu działania czynników toksycznych

Przykłady analizy płynów z jam ciała na analizatorze XE-5000

Otrzymany w pkt. 8 osad, zawieszony w 2 ml wody destylowanej rozpipetować do 4 szklanych probówek po ok. 0.5 ml do każdej.

BADANIE WŁASNOŚCI KOENZYMÓW OKSYDOREDUKTAZ

Separacja komórek w gradiencie gęstości PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI (BT 231)

Analiza spektralna i pomiary spektrofotometryczne

data ĆWICZENIE 12 BIOCHEMIA MOCZU Doświadczenie 1

OZNACZANIE ŻELAZA METODĄ SPEKTROFOTOMETRII UV/VIS

BIOLOGIA KOMÓRKI. Podstawy mikroskopii fluorescencyjnej -1 Barwienia przyżyciowe organelli komórkowych

ĆWICZENIE 2. Usuwanie chromu (VI) z zastosowaniem wymieniaczy jonowych

Spektroskopia molekularna. Ćwiczenie nr 1. Widma absorpcyjne błękitu tymolowego

POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI. Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ

Komórka - budowa i funkcje

BIOLOGIA KOMÓRKI. Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli wewnątrzkomórkowych

Próba kontrolna (PK) 1000 l 1000 l

II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne. Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową

ANALIZA TŁUSZCZÓW WŁAŚCIWYCH CZ II

data ĆWICZENIE 7 DYSTRYBUCJA TKANKOWA AMIDOHYDROLAZ

ĆWICZENIE NR 3 BADANIE MIKROBIOLOGICZNEGO UTLENIENIA AMONIAKU DO AZOTYNÓW ZA POMOCĄ BAKTERII NITROSOMONAS sp.

BIOLOGIA KOMÓRKI KOMÓRKI EUKARIOTYCZNE W MIKROSKOPIE ŚWIETLNYM JASNEGO POLA I KONTRASTOWO- FAZOWYM; BARWIENIA CYTOCHEMICZNE KOMÓREK

Technika fluorescencyjnego oznaczania aktywności enzymów. Wstęp:

Oznaczanie mocznika w płynach ustrojowych metodą hydrolizy enzymatycznej

pobrano z

Szkoła Letnia STC Łódź 2013 Oznaczanie zabarwienia cukru białego, cukrów surowych i specjalnych w roztworze wodnym i metodą MOPS przy ph 7,0

EKSTRAHOWANIE KWASÓW NUKLEINOWYCH JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI? JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI?

ĆWICZENIE B: Oznaczenie zawartości chlorków i chromu (VI) w spoiwach mineralnych

1. PRZYGOTOWANIE ROZTWORÓW KOMPLEKSUJĄCYCH

Techniki immunoenzymatycznego oznaczania poziomu hormonów (EIA)

POLITECHNIKA GDAŃSKA WYDZIAŁ CHEMICZNY

Informacja do zadań Woda morska zawiera średnio 3,5% soli.

Oznaczanie aktywności proteolitycznej trypsyny metodą Ansona

ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ŚRODOWISKA 1)

Oznaczanie żelaza i miedzi metodą miareczkowania spektrofotometrycznego

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Instrukcja do ćwiczeń laboratoryjnych

SKUTECZNOŚĆ IZOLACJI JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI? JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI?

Katedra Fizyki i Biofizyki instrukcje do ćwiczeń laboratoryjnych dla kierunku Lekarskiego

BIOLOGIA KOMÓRKI. Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli wewnątrzkomórkowych

Ćwiczenie nr 5 - Reaktywne formy tlenu

ĆWICZENIE 4. Oczyszczanie ścieków ze związków fosforu

Nanocząstki srebra w medycynie

Instrukcja do ćwiczeń laboratoryjnych

Zadanie: 1 (1pkt) Zadanie: 2 (1 pkt)

JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI? JAK ZMIERZYĆ ILOŚĆ KWASÓW NUKLEINOWYCH PO IZOLACJI?

Ćwiczenie 74. Zagadnienia kontrolne. 2. Sposoby otrzymywania światła spolaryzowanego liniowo. Inne rodzaje polaryzacji fali świetlnej.

Cel główny: Uczeń posiada umiejętność czytania tekstów kultury ze zrozumieniem

KREW: 1. Oznaczenie stężenia Hb. Metoda cyjanmethemoglobinowa: Zasada metody:

Oznaczanie SO 2 w powietrzu atmosferycznym

Izolowanie DNA i RNA z komórek hodowlanych. Ocena jakości uzyskanego materiału

ALGALTOXKIT F Procedura testu

Opracował dr inż. Tadeusz Janiak

Konspekt z przedmiotu biologia realizowany w klasie II gimnazjum przez nauczyciela Sabinę Gądek

Oznaczanie aktywności - i β- amylazy słodu metodą kolorymetryczną

SPRAWDZIAN klasa II ORGANELLA KOMÓRKOWE, MITOZA, MEJOZA

PRACOWNIA ANALIZY ILOŚCIOWEJ. Analiza substancji biologicznie aktywnej w preparacie farmaceutycznym kwas acetylosalicylowy

13. TERMODYNAMIKA WYZNACZANIE ENTALPII REAKCJI ZOBOJĘTNIANIA MOCNEJ ZASADY MOCNYMI KWASAMI I ENTALPII PROCESU ROZPUSZCZANIA SOLI

3. MATERIAŁY I SPRZĘT WYMAGANE, ALE NIE DOSTARCZONE:

Chemia klasa VII Wymagania edukacyjne na poszczególne oceny Semestr II

Wysokosprawna chromatografia cieczowa w analizie jakościowej i ilościowej

BIOLOGIA KOMÓRKI BANKOWANIE KOMÓREK

Laboratorium Podstaw Biofizyki

WYMAGANIA EDUKACYJNE

WYKORZYSTANIE TECHNIKI ZAPŁODNIENIA

CEL ĆWICZENIA: Zapoznanie się z przykładową procedurą odsalania oczyszczanych preparatów enzymatycznych w procesie klasycznej filtracji żelowej.

Biochemia Ćwiczenie 4

ENZYMOLOGIA. Ćwiczenie 4. α-amylaza (cz. I) Oznaczanie aktywności enzymu metodą kolorymetryczną

d[a] = dt gdzie: [A] - stężenie aspiryny [OH - ] - stężenie jonów hydroksylowych - ] K[A][OH

6. Wykorzystanie tyrozynazy otrzymywanej z pieczarki dwuzarodnikowej (Agaricus Bisporus) do produkcji L-DOPA

Laboratorium 4. Określenie aktywności katalitycznej enzymu. Wprowadzenie do metod analitycznych. 1. CZĘŚĆ TEORETYCZNA

C 6 H 12 O 6 2 C 2 O 5 OH + 2 CO 2 H = -84 kj/mol

Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii. Biologia komórki nowotworowej: Ćwiczenie B

THAMNOTOXKIT F Procedura testu

Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia

Nauczanie na kierunku biotechnologia umiejętności pracy w laboratorium na przykładzie badań przeżywalności komórek w hodowli in vitro

Pro apoptotyczne właściwości ekstraktów z kory Cochlospermum angolense Welw.

Identyfikacja mikroorganizmów systemem firmy Biolog

Wpływ zdeklastrowanego medium hodowlanego RPMI na żywotność i zdolność proliferacji komórek nowotworowych układu hematopoetycznego człowieka.

OSTRACODTOXKIT F Procedura testu

Jan Drzymała ANALIZA INSTRUMENTALNA SPEKTROSKOPIA W ŚWIETLE WIDZIALNYM I PODCZERWONYM

WŁASNOŚCI SPEKTRALNE NUKLEOTYDÓW PIRYDYNOWYCH (NAD +, NADP + ) OZNACZANIE AKTYWNOŚCI TRANSAMINAZY ALANINOWEJ

WOJEWÓDZKI KONKURS PRZEDMIOTOWY Z CHEMII DLA UCZNIÓW DOTYCHCZASOWYCH GIMNAZJÓW 2017/2018. Eliminacje szkolne

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

WYKRYWANIE OŁOWIU W WINIE

m OPIS OCHRONNY PL 59703

[IMIĘ I NAZWISKO: KLASA.NR..]

III A. Roztwory i reakcje zachodzące w roztworach wodnych

Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu

METODY ANALIZY PARAMETRÓW FUNKCJONALNYCH MĘSKICH KOMÓREK ROZRODCZYCH

ĆWICZENIE 1: BUFORY 1. Zapoznanie z Regulaminem BHP 2. Oznaczanie ph 2.1. metoda z zastosowaniem papierków wskaźnikowych

Transkrypt:

Fizjologiczne techniki badań Techniki oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych in vitro Wstęp: Oznaczanie cytotoksyczności związków chemioterapeutycznych wobec komórek w hodowlach in vitro stanowi ważny wstęp do ogólnie pojmowanych badań toksykologicznych, niezbędnych do określenia prawidłowego działania oraz bezpieczeństwa leku. Zastosowanie modeli komórkowych w badaniach toksykologicznych posiada wiele zalet, takich jak: szybkość i łatwość badania procesów komórkowych i molekularnych, powtarzalność, możliwość stosowania niewielkich ilości badanych substancji, czy możliwość pracy na komórkach ludzkich. Do ilościowego określenia aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych wykorzystuje się różnego rodzaju testy komórkowe. Każdy test składa się z tych samych etapów: 1. Inkubacja komórek z testowanym związkiem przez określony czas i przy wzrastających stężeniach; 2. Oznaczenie określonego parametru np. liczby komórek proliferacji komórek funkcjonowania błony komórkowej aktywności mitochondriów aktywności enzymów związanych z metabolizmem komórki inkorporacji barwników do lizosomów całkowitej zawartość białka czy DNA w komórce zahamowania syntezy DNA Często stosowane testy oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych opierają się na badaniu integralności błony komórkowej, ponieważ wszystkie trwałe uszkodzenia błony komórkowej prowadzą do śmierci komórki. Szereg innych technik mierzy żywotność komórek poprzez analizę ich aktywności metabolicznej. W testach określających zmiany w integralności błony komórkowej, badane komórki inkubuje się z roztworem barwnika o dodatnim ładunku. Zastosowany barwnik nie wnika do żywych komórek, a w komórkach umierających (gdy błona zostanie trwale uszkodzona i

następuje zanik potencjału pomiędzy zewnętrzną a wewnętrzną stroną błony), przenika do ich wnętrza barwiąc cytoplazmę lub/i jądro. Najpowszechniej stosowanym barwnikiem z tej grupy jest błękit trypanu, który wybarwia komórki martwe (późnoapoptotyczne i nekrotyczne) na kolor niebieski. Komórki wybarwione błękitem trypanu zliczane są manualnie w mikroskopie świetlnym. Obecnie dostępne są aparaty do automatycznej analizy liczby i żywotności komórek barwionych błękitem trypanu np. Countess Automated Cell Counter (Invitrogen), TC20 TM Automated Cell Counter (Bio-Rad). Innym przykładem barwnika stosowanego do przyżyciowej analizy zmian w integralności błony komórkowej jest barwnik fluorescencyjny - jodek propidyny (PI). PI wnika do wnętrza komórek martwych i interkaluje z kwasami nukleinowymi, wykazując czerwoną fluorescencję. Najczęściej stosowanym testem do analizy aktywności metabolicznej komórki jest test MTT. Test MTT jest oparty na zdolności enzymu - dehydrogenazy mitochondrialnej do przekształcania pomarańczowej, rozpuszczalnej w wodzie soli tetrazolowej (bromek 3-(4,5- dimetylotiazol-2-yl)- 2,5-difenylotetrazoliowy) do nierozpuszczalnego formazanu, będącego ciemnoniebieskim produktem powyższej reakcji. Po rozpuszczeniu kryształów formazanu w DMSO lub izopropanolu, powstaje barwny roztwór, którego intensywność zabarwienia mierzona jest spektrofotometrycznie w zakresie długości fal 492 570 nm. Ilość barwnego zredukowanego MTT jest proporcjonalna do aktywności oksydacyjnej mitochondriów komórki, a w ściśle określonych warunkach doświadczalnych do liczby aktywnych metabolicznie (żywych) komórek w populacji. Test MTT może być też używany do określania żywotności komórek w populacjach komórek już nie dzielących się, ale aktywnych metabolicznie. Test MTT jest obecnie najczęściej stosowany do oceny działania cytotoksycznego i zalecany jako referencyjny przez międzynarodowe organizacje normotwórcze. Test MTS stanowi z kolei udoskonaloną wersję testu MTT, w której produkt reakcji konwersji soli tetrazolowej przez dehydrogenazę powstaje w obecności PMS (ang. phenazine methosulfate) i jest w pełni rozpuszczalny w wodzie. Miarą aktywności cytotoksycznej testowanego związku jest wartość stężenia IC 50 (ang. inhibitory concentration), czyli takie jego stężenie, przy którym proliferacja/żywotność komórek zostaje zahamowana w 50%, w odniesieniu do kontroli. W celu wyznaczenia wartości IC 50 należy wykonać wykres zależności określonego parametru np. żywotność komórek (wyrażone jako procent w stosunku do kontroli, którą przyjmuje się za 100%) od stężenia badanego związku - krzywa dawka-efekt (Ryc.1).

Ryc. 1. Wykres zależności stężenia związku od obserwowanego efektu. Ćwiczenie ma na celu praktyczne zapoznanie się z wybranymi testami żywotności komórek (test z błękitem trypanu, określenie liczebności komórek, test MTT) i przeprowadzenie poprawnej analizy otrzymanych wyników. Wykonanie ćwiczenia: I. Manualna i automatyczna analiza liczby i żywotności komórek barwionych błękitem trypanu. Analiza manualna 1. Przygotować badaną zawiesinę komórek (1-kontrola, 2-komórki traktowane związkiem chemioterapeutycznym). W tym celu 1 ml zawiesiny komórek przenieść do ependorfy i odwirować. Po zlaniu nadsączu komórki zawiesić w 0.5 ml PBS. 2. Zmieszać 1 część zawiesiny komórek z 1 częścią 0,4% roztworu błękitu trypanu (np. 20 µl zawiesiny komórek z 20 µl błękitu trypanu). 3. Inkubować nie dłużej niż 2 minuty. 4. Nanieść 10 µl mieszaniny do hemocytometru (komora Bürkera).

5. Zliczyć komórki żywe (niewybarwione) i martwe (wybarwione na niebiesko) pod mikroskopem (powiększenie 400x). Liczyć komórki leżące wewnątrz kwadratów o boku 1/20 mm z całej siatki zgodnie z zasadą dwóch boków. 6. Określić odsetek komórek żywych zgodnie ze wzorem: całkowita liczba komórek żywych x 100% Komórki żywe (%) = całkowita liczba komórek 7. Określić liczbę komórek zgodnie ze wzorem: c = n / v gdzie: c liczba komórek, n średnia ze zliczeń (na jeden kwadrat), v - objętość komory. Analiza automatyczna 1. Zawiesinę komórek wybarwioną błękitem trypanu (patrz punkty 2 i 3 z analizy manualnej) nanieść na płytkę (Countess cell counting chamber slide). 2. Liczbę i żywotność komórek analizować w aparacie Countess Automated Cell Counter (Invitrogen). II. Test MTT W czasie ćwiczeń zostaną wykonane punkty 3-7 (ze względu na długi czas inkubacji komórek z r-rem MTT) 1. Po upływie X godz. inkubacji komórek kontrolnych i traktowanych związkiem (w czterech różnych stężeniach), do każdej studzienki płytki wielodołkowej dodać objętość r-ru MTT równą 10% objętości dołka (np. dla płytki 24-dołkowej na 1ml zawiesiny komórek dodać 100 µl MTT). 2. Inkubować 4 godz. (w inkubatorze). 3. Powstałe kryształy formazanu rozpuścić kwaśnym izopropanolem. W tym celu do każdej studzienki płytki wielodołkowej dodać objętość izopropanolu równą objętości zawiesiny komórek (np. do 1 ml zawiesiny komórek dodać 1 ml

izopropanolu). Kryształy formazanu rozpuścić poprzez delikatne rozpipetowanie, a następnie otrzymane roztwory (1 ml) przenieść do kuwet. 4. Zmierzyć spektrofotometrycznie absorpcje roztworów przy długości fali 540 nm. 5. Opracować otrzymane wyniki: - Obliczyć średnie wartości absorpcji dla każdego stężenia testowanego związku oraz dla kontroli. - Wyznaczyć, jaki procent wartości uzyskanej dla komórek kontrolnych (100%) stanowią wyliczone średnie wartości absorpcji (A) dla poszczególnych stężeń testowanego związku. % kontroli = A średnia komórek traktowanych związkiem x 100% A średnia komórek kontrolnych 7. Sporządzić wykres zależności żywotności komórek (% kontroli) od stężenia testowanego związku. Z powyższego wykresu odczytać wartość parametru IC 50. Wymagania: - student potrafi wymienić zasady oznaczania aktywności cytotoksycznej związków chemioterapeutycznych in vitro; - student zna zasady testów do analizy cytotoksyczności: testu z błękitem trypanu i testu MTT; - student potrafi na podstawie uzyskanych wyników określić aktywność cytotoksyczną testowanych związków. Literatura: 1. Baharith LA, Al-Khouli A, Raab GM. Cytotoxic assays for screening anticancer agents. Statistic in Medicine 25: 2323-39; 2006. 1. Longo-Sorbello GS, Saydam G, Banerjee D, Bertino JR. Cytotoxicity and Cell Growth Assays. http://www.keygentec.com.cn/image/kitali/userfiles/file/mts%20xtt%20srb.pdf