MARTA B. WIŚNIEWSKA AUTOREFERAT
|
|
- Robert Żurek
- 9 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MARTA B. WIŚNIEWSKA AUTOREFERAT Aktywność czynnika transkrypcyjnego β-katenina~lef1/tcf w neuronach występowanie, regulacja, geny docelowe, hipotetyczna funkcja Spis treści strona 1. Imię i nazwisko Dyplomy i stopnie naukowe Zatrudnienie w jednostkach naukowych Dorobek publikacyjny przed uzyskaniem stopnia doktora A. Praca magisterska tytuł i lista publikacji 3 4.B. Praca doktorska tytuł i lista publikacji 3 5. Omówienie dorobku publikacyjnego ze stażu podoktorskiego A. Tytuł i lista publikacji 4 5.B. Problematyka i cel badawczy 4 5.C. Podsumowanie wyników 6 6. Osiągnięcie naukowe, o którym mowa w art. 16 ust Ustawy z dnia 14 marca 2003 r. o stopniach naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule w zakresie sztuki (Dz. U. nr 65, poz. 595 ze zm.) 6.A. Tytuł osiągnięcia 9 6.B. Lista publikacji 9 6.C. Problematyka i cele badawcze 10 6.D. Opis i dyskusja wyników 13 6.E. Podsumowanie, wnioski i znaczenie badań Udział w innych projektach tytuły i lista publikacji... 23
2 1. Imię i nazwisko Marta B. Wiśniewska 2. Dyplomy i stopnie naukowe Magister biologii, Wydział Biologii Uniwersytetu Warszawskiego; praca magisterska wykonana pod opieką Prof. Piotra Węgleńskiego w Zakładzie Genetyki; Doktor biologii ze specjalnością biologia molekularna, Instytut im. M. Nenckiego PAN w Warszawie; praca wykonana pod opieką Prof. Bożeny Kamińskiej w Pracowni Regulacji Transkrypcji 3. Zatrudnienie w jednostkach naukowych Asystent w Pracowni Regulacji Transkrypcji Instytutu im. M. Nenckiego PAN w Warszawie; realizacja pracy doktorskiej; Postdoc w Instytucie Pasteur a w Paryżu; praca pod kierunkiem Prof. Moshe Yaniv'a i Dr. Jonathana B. Weitzman a w Pracowni Ekspresji Genów i Patologii (Unité d Expression Génétique et Maladies); staż podoktorski; Badacz w Laboratorium Neurodegeneracji kierowanym przez Prof. Jacka Kuxnickiego w Międzynarodowym Instytutucie Biologii Molekularnej i Komórkowej (MIBMiK) w Warszawie; realizacja pracy habilitacyjnej; Adiunkt, kierownik Laboratorium Neurobiologii Molekularnej w Centrum Nowych Technologii Uniwersytetu Warszawskiego (CeNT-UW) 2
3 4. Dorobek publikacyjny przed uzyskaniem stopnia doktora 4.A. Praca magisterska - tytuł i lista publikacji Klonowanie i wstępna charakterystyka genu OtaA z Aspergillus nidulans 1. Dzikowska A, Swianiewicz M, Talarczyk A, Wisniewska M, Goras M, Scazzocchio C, Weglenski P; Cloning, characterisation and regulation of the ornithine transaminase (otaa) gene of Aspergillus nidulans; Curr Genet 1999, 35: B. Praca doktorska - tytuł i lista publikacji Regulacja aktywności czynnika transkrypcyjnego NFAT w czasie apoptozy tymocytów indukowanej glukokortykoidami in vivo 2. Kaminska B, Mosieniak G, Wisniewska M; Współdziałanie czynników transkrypcyjnych AP-1 i NFAT w procesie regulacji eksprsji genów (Cross-talk between Transcription Factors AP-1 and NFAT in the regulation of gene expression); Postępy Biochemii 1996, 42: ; artykuł przeglądowy po polsku; 3. Wisniewska M, Stanczyk M, Grzelakowska-Sztabert B, Kaminska B; Nuclear Factor of Activated T cells (NFAT) is a possible target for dexamethasone in thymocyte apoptosis; Cell Biol Int 1997, 21: ; 4. Kaminska B, Pyrzynska B, Ciechomska I, Wisniewska M; Modulation of the composition of AP-1 complex and its impact on transcriptional activity; Acta Neurobiol Exp 2000, 60: ; artykuł przeglądowy; 5. Wisniewska M, Pyrzynska B, Kaminska B; Impaired AP-1 dimers and NFAT complex formation in immature thymocytes during in vivo glucocorticoid-induced apoptosis; Cell Biol Int 2004,28:
4 5. Omówienie dorobku publikacyjnego ze stażu dokotorskiego 5.A. Tytuł i lista publikacji Współdziałanie czynników transkrypcyjnych AP-1 i NFAT w regulacji ekspresji genów kodujących cytokiny w limfocytach T 6. Bakiri L, Matsuo K, Wisniewska M, Wagner EF, Yaniv M; Promoter specificity and biological activity of tethered AP-1 dimer; Mol Cell Biol 2002, 22: ; IF 9,84; 7. Ameyar M, Wisniewska M*, Weitzman JB; A role for AP-1 in apoptosis: the case for and against; Biochimie 2003, 20085: ; artykuł przeglądowy napisany na zaproszenie, IF 3.30; 8. Ameyar-Zazoua M, Wisniewska MB, Bakiri L, Wagner EF, Yaniv M, Weitzman JB; AP-1 dimers regulate transcription of the p14/p19arf tumor suppressor gene; Oncogene 2005, 24: ; IF 6.31; 9. Wisniewska MB**, Ameyar-Zazoua M, Bakiri L, Kaminska B, Yaniv M; Weitzman JB; Dimer composition and promoter context contribute to functional cooperation between AP-1 and NFAT; J Mol Biol 2007, 371: ; IF 4.89 * równy udział wszystkich autorów ** autor korespondencyjny 5.B. Problematyka i cel badawczy AP-1 (ang. Activator Protein) jest dimerycznym czynnikiem transkrypcyjnym, w skład którego wchodzą dwa białka JUN lub białko JUN i FOS [Ameyar i wsp., Oncogene 2003], ewentualnie białko JUN i ATF2 [van Dam & Castellazzi, Oncogene 2001], MAF [Kerppola & Curran, Oncogene 1994] lub BATF [Williams i wsp., Eur J Immunol 2001]. U ssaków występują trzy białka JUN: JUN (cjun), JUNB, JUND, i cztery białka FOS: FOS (cfos), FOSB, ΔFOSB, FOSL1 (FRA1) i FOSL2 (FRA2). Tworzenie się kompleksu AP-1 zachodzi poprzez dimeryzację α- helikalnych struktur suwaków leucynowych (ang. leucin zipper) podjednostek białkowych, na skutek oddziaływania równomiernie rozłożonych reszt leucynowych. AP-1 oddziałuje bezpośrednio ze specyficzną sekwencją TRE (ang. TPA Responsive Element) poprzez domenę zasadową (ang. basic domain) bogatą w leucyny i argininy. Ściśle rzecz biorąc, nie ma jednego czynnika AP-1, ale ponad 20 różnych dimerów AP-1. Dimery AP-1 mogą różnić się od 4
5 siebie wieloma parametrami, ale wszystkie rozpoznają tę samą sekwencję DNA, z powodu dużego podobieństwa w obszarze domen zasadowych podjednostek JUN i FOS. Białka JUN i FOS zaliczane są do grupy onkogenów, ponieważ ich nadmierna aktywność prowadzi do wzmożonej proliferacji komórek i transformacji nowotworowej [Angel & Karin, Biochim Biophys Acta 1991]. W warunkach fizjologicznych AP-1 aktywowany jest przez sygnały zewnątrzkomórkowe takie jak mitogeny, a także w odpowiedzi na stres komórkowy [Wisdom, Exp Cell Res 1999]. Aktywacja AP-1 zachodzi przez syntezę de novo i fosforylację [Karin, Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 1996; Lallemand i wsp., Oncogene 1997]. Ta ostatnia dotyczy przede wszystkim białka JUN, fosforylowanego przez kinazę JNK (ang. cjun N- terminal Kinase) należącą do kinaz MAP (ang. Mitogen Activated Protein kinases). Dodatkowo AP-1 może współdziałać z innymi czynnikami transkrypcyjnymi, w szczególności z NFAT (ang. Nuclear Factor of Activated T cells), który wiąże się z DNA w kompleksie z AP-1 [Kaminska i wsp., Postępy Biochemii 1996; Rao i wsp., Annu Rev Immunol 1997]. Pierwszymi odkrytymi białkami dimeru AP-1 były FOS i JUN, a właściwie ich zmutowane formy vfos i vjun, sklonowane z wirusów wywołujących mięsaka odpowiednio u myszy i ptaków [Curran i wsp., Mol Cell Biol 1983; Maki i wsp., Proc Natl Acad Sci USA 1987] i zdolne do pobudzenia proliferacji i transformacji nowotworowej komórek, jak już wspomniano. Wkrótce sklonowano kolejne białka z tej rodziny. W latach 90-tych stwierdzono, że AP-1 nie tylko indukuje proliferację, ale uczestniczy także w różnicowaniu komórek [Wang i wsp., Nature 1992; Lord i wsp., Mol Cell Biol 1993] i apoptozie [Ham i wsp., Neuron 1995; Bossy- Wetzel i wsp., EMBO J 1997; Weitzman i wsp., Mol Cell 2000]. Tym samym obraz roli czynnika AP-1 bardzo sie skomplikował. Białka JUN/FOS nie mogły już być traktowane jedynie jako czynniki onkogenne. Ponadto zdano sobie sprawę, że poszczególne białka z tej rodziny wywierają na komórki różny wpływ. Do tych odkryć przyczynił się miedzy innymi zespół prof. Yaniva, do którego dołaczyłam w 2001 roku, po uzyskaniu stopnia doktora. W Laboratorium Wirusów Onkogennych sklonowano gen Jund [Hirai i wsp., EMBO J 1989] i stworzono pozbawione go myszy [Thepot i wsp., Development 2000]. Stwierdzono, że JUND, w przeciwieństwie do białka JUN, blokuje proliferację fibroblastów indukowaną dodaniem surowicy i hamuje transformację nowotworową wywoływaną białkiem RAS [Pfarr i wsp., Cell 1994], a także chroni fibroblasty przed apoptazą wywoływaną UV i stresem cytotoksycznym [Weitzman i wsp., Mol Cell 2000]. 5
6 W czasie kiedy dołączyłam do zespołu prof. Yaniva, w środowisku badaczy zajmujących się AP-1 stawiano pytanie o specyficzność działania różnych białek JUN i FOS [Kaminska i wsp., Acta Neurobiol Exp 2000; Mechta-Grigoriou i wsp., Oncogene 2001]. Moje zainteresowania także kierowały się w tę stronę. Za cel badawczy postawiłam sobie określenie wpływu podjednostkowego składu dimeru AP-1 na jego współdziałanie z czynnikiem transkrypcyjnym NFAT w regulacji ekspresji cytokin w limfocytach T. 5.C. Podsumowanie wyników AP-1 czynnik pro- czy antyapoptyczny? (artykuł przeglądowy, nr 7) W związku z zaangażowaniem Laboratorium w badanie roli AP-1 w apoptozie i przeżywaniu komórek wraz z dr. Weitzmanem i dr Ameyar-Zazouą otrzymaliśmy propozycję napisania artykułu przeglądowego na ten temat [Ameyar-Zazoua i wsp., Biochimie 2003]. Postanowiliśmy pokazać, że AP-1 nie zawsze jest aktywatorem tego procesu, jak się do niedawna wydawało, ale może też promować przeżywanie komórek. Przeanalizowaliśmy pod względem udziału AP-1 trzy przypadki apoptozy: śmierć neuronów pozbawionych czynników wzrostowych, śmierć zależną od receptora Fas i jego liganda FasL, i w końcu apoptozę hepatocytów (tutaj właściwie dwa typy apotozy rozwojową i indukowaną przez lipopolisacharydy imitujące sepsę). W mojej części artykułu przedstawiłam niejasności dotyczące roli AP-1 w apoptozie zależnej od systemu Fas/FasL. Receptor Fas, zwany też receptorem śmierci, obecny jest na błonie większości komórek, a jego aktywność ujawnia się dopiero po związaniu liganda, błonowego białka FasL [Krammer, Nature 2000]. Wtedy dochodzi do aktywacji kaspaz, które przeprowadzają proces samobójczej śmierci. Ekspresja FasL aktywowana jest przez różnorodne czynniki stresowe, takie jak UV, promieniowanie γ, stres genotoksyczny czy szok cieplny, a także w apoptozie indukowanej aktywacją (AICD, ang. Activation Induced Apoptosis) obwodowych limfocytów T. Szereg badań in vitro pokazało krytyczny udział kinaz JNK i AP-1 w indukcji apoptozy zależnej od FasL i w samej aktywacji promotora FasL [Kasibhatla i wsp., Mol Cell 1998; Matsui i wsp., J Immunol 2000; Kolbus i wsp., Mol Cell Biol 2000]. Jednakże w przypadku AICD limfocytów T, która jest głównym mechanizmem kontrolowania populacji tych komórek, udział JNK był wątpliwy. W doświadczeniach in vitro ekspresja dominującego negatywnego (DN) mutanta JUN lub DN- JNK hamowała AICD w liniach limfocytów T [Zhang i wsp., J Exp Med 2000; Baumann i wsp., 6
7 Oncogene 2003]. Z kolei w badaniach homeostazy komórek T in vivo, na myszach z nadekspresja DN-JNK lub delecją JNK2, kwestia AICD dojrzałych limfocytów T została pominięta lub wspomniano negatywne wyniki [Rincon i wsp., J Exp Med 1998; Sabapathy i wsp., Curr Biol 1999]. Dopiero całkiem niedawno powrócono do tego tematu badając limfocytarne białko BATF, które jest partnerem JUN i uważane jest za inhibitor aktywności AP-1 [Williams i wsp., Eur J Immunol 2001]. U myszy z nadekspresją BATF rozwija się choroba limfoproliferacyjna, prawdopodobnie na skutek zaburzenia apoptozy limfocytów T [Logan i wsp., Cell Death Dis 2012]. Odkrycie to otwiera nową perspektywę badania roli AP-1 w regulowaniu wielkości populacji limfocytów T, w tym AICD. Podsumowując nasze rozważania stwierdziliśmy, że AP-1 może wywierać zarówno projak i anty-apoptyczny efekt, działając w różnym kontekście komórkowym, a także postawiliśmy tezę, że działanie poszczególnych białek JUN i FOS lub ich kombinacji może być różne czy wręcz przeciwne. Duża liczba cytowań naszej pracy przeglądowej (79) świadczy o jej dobrym odbiorze i o wpływie, jaki wywarła na sposób widzenia regulacji procesów komórkowych przez czynnik AP-1. Różnicowa regulacji ekspresji cytokin przez dimery AP-1 i NFAT (artykuły nr 6, 8, 9) Na poczatku mojej współpracy z prof. Yanivem uczestniczyłam w przygotowaniu nowego narzędzia molekularnego, które miało umożliwić rozróżnianie funkcji poszczególnych dimerów AP-1. Narzędziem tym były konstrukty DNA kodujące dwa białka z rodziny JUN lub białka JUN i FOS, przedzielone 18-aminokwasowym linkerem bogatym w reszty glicynowe. Te jednołańcuchowe dimery AP-1 wykazywały zarówno specyficzność wiązania z DNA jak i potencjał transaktywacyjny podobny naturalnym dwubiałkowym dimerom AP-1 [Bakiri i wsp., Mol Cell Biol 2002]. Przygotowałyśmy 19 różnych dimerów AP- 1. Narzędzia tego użyliśmy w badaniu regulacji promotora genu supresora nowotworowego p14/p19arf [Amayar-Zazoua i wsp., Oncogene 2005]. Wykorzystałam je także przy realizacji własnego projektu, do zbadania efektywności poszczególnych dimerów AP-1 w aktywacji promotorów interleukiny 2 i 4 (IL2 i IL4) [Wisniewska i wsp., J Mol Biol 2007]. Czynniki transkrypcyjne AP-1 i NFAT, które ulegają aktywacji w limfocytach T na skutek pobudzenia receptora TCR (ang. T Cell Receptor), są jednymi z głównych regulatorów ekspresji cytokin. Leżące obok siebie miejsca wiązania NFAT i sekwencje podobne do sekwencji consensus dla AP-1 występują między innymi w promotorach genów kodujących 7
8 IL2 i 4, interferon gamma (IFNγ) oraz czynnik stymulujacy powstanie kolonii granulocytów i makrofagów (GMCSF), a więc cytokiny produkowane przez pomocnicze limfocyty T (Th, ang. T helper cells) [Macian i wsp., Oncogene 2001]. W zależności od profilu produkowanych cytokin, komórki Th, określane jako Th1 i Th2, pośredniczą odpowiednio w rozwoju komórkowej lub humoralnej odpowiedzi układu odpornościowego [Kaiko i wsp., Immunology 2008]. Postawiłam hipotezę, że na profil ekspresji cytokin, a w konsekwencji typ odpowiedzi odpornościowej, wpływa między innymi skład dimeru AP-1. Stwierdziłam, że homodimery AP-1 (JUN/JUN), wykazujące w odróżnieniu od heterodimerów (JUN/FOS) bardzo słabą aktywność w stosunku do promotorów z elementami TRE [Bakiri i wsp., Mol Cell Biol 2002, Wisniewska i wsp., J Mol Biol 2007], we współpracy z czynnikiem NFAT efektywnie aktywują transkrypcję [Wisniewska i wsp., J Mol Biol 2007]. Wykazałam ponadto, że poszczególne dimery AP-1 różnicowo aktywują promotory genów Il2 i Il4. Dodatkowo, promotor Il4 okazał się w większym stopniu zależny od współpracy AP-1 z NFAT niż promotor Il2. Uzyskane wyniki sugerowały, że podjednostkowy skład AP-1 oraz poziom aktywacji NFAT może wpływać na dynamikę i typ odpowiedzi odpornościowej. Kontynuacją tych badań była wykonana przeze mnie charakterystyka komórek układu odpornościowego myszy Jund-/- w grasicy, śledzionie i szpiku kostnym oraz analizy profilu produkcji IL2, IL4 i IFNγ in vitro i in vivo w limfocytach Th. U myszy pozbawionych genu Jund zaobserwowałam między innymi deficyt limfocytów B i podwyższony, w porównaniu do myszy kontrolnych, udział aktywowanych limfocytów produkujących IFNγ w populacji limfocytów Th. To ostatnie świadczyło o nadmiernym rozwoju odpowiedzi Th1, co było szczególnie interesujące ze względu na fakt, że brak równowagi między profilem Th1 i Th2 obserwuje się u pacjentów z poważnymi chorobami autoimmunizacyjnymi, takimi jak stwardnienie rozsiane, reumatoidalne zapalenie stawów, atopowe zapalenie skóry i astma oskrzelowa czy toczeń rumieniowaty układowy [Singh i wsp., J Immunol 1999]. Pod koniec mojego pobytu w Laboratorium prof. Yaniva inna grupa badawcza opublikowała wyniki podobnej analizy komórek T izolowanych ze śledziony myszy z nadekspresją Jund i myszy Jund-/-, dochodząc do podobnego wniosku, że JUND działa hamująco na odpowiedź Th1 [Meixner i wsp., EMBO J 2004]. Uniemożliwiło mi to opublikowanie własnych badań dotyczących komórek T, natomiast wątek komórek B nie był wystarczająco pogłębiony. Prowadzenie dalszych badań w tym kierunku nie było możliwe ze względu na koniec mojego stypendium i zamknięcie Laboratorium w związku z przejściem prof. Yaniva na emeryturę. 8
9 6. Osiągnięcie naukowe, o którym mowa w art. 16 ust. 2 Ustawy z dnia 14 marca 2003 r. o stopniach naukowych i tytule naukowym oraz o stopniach i tytule w zakresie sztuki (Dz. U. nr 65, poz. 595 ze zm.) Pod koniec 2004 roku dołączyłam do zespołu prof. Kuźnickiego w MIBMiK, zajmującego się molekularnymi podstawami chorób neurodegeneracyjnych i zaburzeń poznawczych, żeby w ramach grantu europejskiego badać rolę β-kateniny w fizjologii neuronów. Wiązało się to z przemyślaną decyzją zmiany dziedziny badawczej na neurobiologię, przy wykorzystaniu zdobytej wiedzy o regulacji ekspresji genów, doświadczenia w stosowaniu technik biologii molekularnej i praktyki w pracy z modelami komórkowymi i zwierzęcymi. Badania przeprowadzone w MIBMiK stały się podstawą mojej pracy habilitacyjnej. 6.A. Tytuł osiągnięcia Aktywność czynnika transkrypcyjnego β-katenina~lef1/tcf w neuronach występowanie, regulacja, geny docelowe, hipotetyczna funkcja 6.B. Lista publikacji 10. Wisniewska MB**, Misztal K, Michowski W, Szczot M, Purta E, Lesniak W, Klejman ME, Dabrowski M, Filipkowski RK, Nagalski A, Mozrzymas JW, Kuznicki J; LEF1/β-catenin complex regulates transcription of the Cav3.1 calcium channel gene (Cacna1g) in thalamic neurons of the adult brain; J Neurosci 2010, 30: ; IF 7.18; 11. Misztal K, Wisniewska MB, Ambrozkiewicz M, Nagalski A, Kuznicki J; Wnt proteinindependent constitutive nuclear localization of β-catenin protein and its low degradation rate in thalamic neurons; J Biol Chem 2011, 286: ; IF 5.33; 12. Nagalski A, Irimia M, Szewczyk L, Ferran JL, Misztal K, Kuznicki J, Wisniewska MB**; Postnatal isoform switch and protein localization of LEF1 and TCF7L2 transcription factors, in cortical, thalamic, and mesencephalic regions of the adult mouse brain; Brain Struct Funct 2012, DOI /s ; IF 5.63; 13. Wisniewska MB**, Nagalski A, Dabrowski M, Misztal K, Kuznicki J; 2012; Novel betacatenin target genes identified in thalamic neurons encode modulators of neuronal excitability; BMC Genomics 13:635; IF 4.07; 14. Wisniewska MB**; Physiological role of β-catenin/tcf signaling in neurons of the adult brain; Neurochem Res 2013, DOI: /s ; artykuł przeglądowy napisany na zaproszenie; IF 2.24; ** autor korespondencyjny 9
10 6.C. Problematyka i cele badawcze Znaczenie β-kateniny w organizmie ssaków β-katenina, kofaktor czynników transkrypcyjnych z rodziny LEF1/TCF, zaliczana jest do onkogenów, ponieważ jej nadmierna aktywność wiąże się z rozwojem nowotworów, przede wszystkim tych związanych z układem pokarmowym [Clevers & Nusse, Cell 2012]. W szczególności mutacje genu kodującego białko APC, które jest odpowiedzialne za utrzymanie w cytoplazmie niskiego poziomu β-kateniny, są przyczyną rodzinnej polipowatości jelita grubego. Tak jak wiele innych onkogenów, β-katenina odgrywa kluczową rolę w rozwoju organizmu [van Amerongen & Nusse, Development 2009]. Na jego wczesnych etapach inicjuje tworzenie się osi przód-tył zarodka i uczestniczy w morfogenezie. Na dalszych etapach odgrywa rolę w rozwoju poszczególnych tkanek i narządów, między innymi mózgu, wpływając na procesy proliferacji, różnicowania i apoptozy. Zakłócenie aktywności kanonicznego szlaku Wnt, którego efektorem jest β-katenina, prowadzi do letalnych zaburzeń rozwojowych. W organizmie dorosłym w warunkach fizjologicznych β-katenina zapewnia prawidłową homeostazę w niszach komórek macierzystych, między innymi w nabłonku jelita oraz warstwie podziarnistej zakrętu zębatego w mózgu [Wisniewska, Neurochem Res 2013; Kuhl & Kuhl, Biochim Biophys Acta 2013]. Badania prowadzone przeze mnie w ramach projektu habilitacyjnego (przedstawione w rozdziale Opis wynków) doprowadziły do wskazania nowego miejsca aktywności β-kateniny i czynników LEF1/TCF w dorosłym organizmie oraz zaproponowania ich nowej roli w mózgu. β-katenina pełni funkcję aktywatora ekspresji genów w odpowiedzi na sygnał (patrz kolejny podrozdział), warto jednak wspomnieć, że powszechnie i stale występuje pod błoną komórkową, gdzie służy do kotwiczenia białek adhezji komórkowej kadheryn w cytoszkielecie aktynowym (Ryc. 1A) [Valenta i wsp., EMBO J 2012; Wisniewska, Neurochem Res 2013]. Funkcje błonowej β-kateniny nie były jednak przedmiotem mojej pracy, w której koncentrowałam się na cytoplazmatycznej i jądrowej puli β-kateniny. 10
11 Fig.1. β-katenina pełni dwie główne funkcje w komórce. Z Wisniewska, J Neurochem 2013 A β-katenina oddziałuje z Kadherynami przy błonie komórkowej i kotwiczy je w cytoszkielecie aktynowym. B Cytoplazmatyczna β-katenina jest mediatorem kanonicznego szlaku Wnt. Pod nieobecność ligandów WNT, β- katenina jest fosforylowana przez GSK3α/β a nastepnie degradowana w proteasomie. Po stymulacji receptora Frizzled cząsteczką Wnt, dochodzi do dysocjacji kompleksu destrukcyjnego. β- katenina akumuluje się i przemieszcza do jądra komórkowego, gdzie aktywuje czynniki LtranskrypcyjneEF1/TCF. β-katenina, czynniki transkrypcyjne LEF1/TCF i kanoniczny szlak sygnałowy Wnt Niezwiązana z błonami β-katenina ulega fosforylacji na resztach seryn 33, 37 i 45 oraz treoniny 41 w tzw. kompleksie destrukcyjnym, składającym się z kinaz CK1 i GSK3α/β,a także białek rusztowania aksyny i APC [Clevers & Nusse, Cell 2012; Wisniewska, Neurochem Res 2013]. W formie ufosforylowanej β-katenina rozpoznawana jest przez receptor ligazy ubikwityny E3, a następnie jest ubikwitowana i degradowana w proteasomie. Klasyczną drogą aktywacji β-kateniny jest kanoniczny szlak sygnałowy Wnt, nazywany też szlakiem Wnt/β-katenina. Po zadziałaniu sygnału Wnt, czyli przyłączeniu się sekrecyjnej glikoproteiny WNT do receptora przezbłonowego Frizzled i koreceptora LRP5/6, dochodzi do rozpadu kompleksu destrukcyjnego, czego wynikiem jest nagromadzanie się β-kateniny w cytoplazmie (Ryc. 1B). β-katenina po przejściu do jądra komórkowego aktywuje czynniki z rodziny LEF1/TCF. U ssaków rodzinę tę tworzą cztery białka: LEF1, TCF7 (TCF1), TCF7L1 (TCF3) i TCF7L2 (TCF4), wiążące się ze specyficzną sekwencją DNA - WRE (ang. Wnt Responsive Element), poprzez domenę HMG (ang. High Mobility Group) [Archbold i wsp., Acta Physiol (Oxf) 2012]. β-katenina oddziałuje z czynnikami LEF1/TCF i rekrutuje do wspólnego kompleksu szereg koaktywatorów transkrypcji, takich jak białka p300 i CBP. Na skutek tych wydarzeń dochodzi do aktywacji ekspresji docelowych genów. Czy β-katenina i czynniki LEF1/TCF biorą udział w regulacji działania mózgu? Szereg obserwacji wskazuje na hipotetyczny związek między zaburzeniami psychicznymi o charakterze afektywnym i psychotycznym a aktywnością szlaku Wnt/βkatenina. Gdy rozpoczynałam pracę, wiadomo było że lit, lek z wyboru w leczeniu choroby afektywnej dwubiegunowej (ChAD), wykazuje aktywność inhibitora kinazy GSK3α/β [Stambolic i wsp., Current Biol 1996; Klein & Melton, Proc Natl Acad Sci USA 1996], która jest 11
12 zaangażowana, jak opisano wyżej, w degradację β-kateniny. Ponadto w ciągu ostatnich kilku lat pojawiły się nowe przesłanki wskazujące na możliwy udział β-kateniny i czynników LEF1/TCF w etiologii ChAD, depresji i schizofrenii. Stwierdzono, że białko kodowane przez gen DISC1 (ang. Disrupted in Schizophrenia 1) powiązany w badaniach genetycznych z występowaniem wspomnianych chorób, bezpośrednio oddziałuje z GSK3β i hamuje jej aktywność w neuronalnych komórkach progenitorowych, tym samym wpływając pozytywnie na poziom cytoplazmatycznej β-kateniny [Mao i wsp., Cell 2009]. Z kolei badania genetyczne przeprowadzone na kilkutysięcznej grupie pacjentów i ludzi zdrowych pokazały, że wariant genu TCF7L2 jest czynnikiem ryzyka rozwoju schizofrenii [Hansen i wsp., Biol Psychiatry 2011; Alkelai i wsp., PLOS One 2012]. Co więcej, myszy pozbawione jednej kopii tego genu wykazywały deficyty w testach behawioralnych [Savic i wsp., PLOS One 2011]. Powiązanie β-kateniny i czynników LEF1/TCF z zaburzeniami psychicznymi wskazywało, że białka te mogą pełnić pewne funkcje w mózgu dojrzałego organizmu, zadałam więc pytanie o ich fizjologiczne znaczenie w neuronach. Kwestia ta nie była wcześniej podejmowana. Wprawdzie niedługo przed rozpoczęciem mojej pracy ukazały się publikacje opisujące udział β-kateniny w działaniu synaps [Nishimura i wsp., J Neurosci 2002; Murase i wsp., Neuron 2002; Coussen i wsp., J Neurosci 2002], chodziło tu jednak o jej pulę oddziałującą z białkami błony synaptycznej, pełniącą między innymi funkcję strukturalną, nic natomiast nie było wiadomo o ewentualnej roli β-kateniny w regulacji ekspresji genów w dojrzałych neuronach mózgu. W tym właśnie kierunku zdecydowałam się rozwinąć badania. Szczegółowe cele badawcze 1. Pierwszym celem mojej pracy było zbadanie występowania i lokalizacji czynników LEF1/TCF oraz β-kateniny w dorosłym mózgu myszy i szczurów. Ten cel rozbudowaliśmy później o analizę absolutnego poziomu ekspresji Lef1 i Tcf7l2, a także analizę wariantów splicingowych mrna tych genów, przeprowadzoną wspólnie z mgr. Andrzejem Nagalskim wykonującym pracę doktorską pod moją opieką. 2. Po uzyskaniu wyników świadczących o stałej akumulacji β-kateniny specyficznie w neuronach wzgórza, kolejnym celem, jaki postawiłam, stało się wyjaśnienie mechanizmu tego zjawiska z wykorzystaniem pierwotnych hodowli neuronalnych. Podjęłam się jego realizacji razem z mgr Katarzyną Misztal, pełniąc rolę opiekunki jej pracy doktorskiej. 12
13 3. Zasadniczym celem mojego projektu habilitacyjnego była identyfikacja genów regulowanych przez kompleks β-katenina~lef1/tcf w neuronach wzgórza. Wykorzystałam tutaj metody in silico do wstępnej identyfikacji, a następnie cały szereg metod biologii molekularnej in vitro i in vivo do potwierdzenia regulacji wytypowanych genów. Poznanie specyficznie wzgórzowego programu zależnego od β-kateniny miało pozwolić na zaproponowanie nowej roli β-kateniny. 4. Jako ostatni i szczególnie ważny cel zaplanowałam weryfikację hipotetycznego wpływu β-kateniny na fizjologię neuronów, poprzez przeprowadzenie testu funkcjonalnego. 6.D. Opis i dyskusja wyników Występowanie i subkomórkowa lokalizacja β-kateniny i czynników LEF1/TCF 2 w mózgu szczura i myszy (artykuły nr 10, 11, 12) Gdy rozpoczynałam pracę, w literaturze brakowało kompleksowych analiz występowania wymienionych białek, które pozwoliłyby stwierdzić, czy w dorosłym mózgu może dochodzić do aktywacji transkrypcji przez β-kateninę. W zróżnicowanej tkance nie oczekiwano aktywności kompleksu β-katenina~lef1/tcf. Dopiero w 2004 i 2009 roku metodą hybrydyzacji in situ wykryto ekspresję genów Lef1 i Tcf7l2 we wzgórzu mózgu myszy i małp [Jones & Rubenstein, J Comp Neurol 2004; Shimogori i wsp., J Comp Neurol 2004; Lee i wsp., J Comp Neurol 2009]. Projekt rozpoczęłam od zbadania występowania i lokalizacji β-kateniny oraz białek LEF1 i TCF7L2 w skrawkach mózgowych myszy i szczura, stosując różne metody immunodetekcji: immunohistochemię, immunofluorescencję (współbarwienie z przeciwciałami specyficznymi dla markerów neuronalnych) oraz analizę Western-blot frakcji subkomórkowych izolowanych z różnych struktur mózgu. Podobne badania przeprowadziliśmy in vitro w pierwotnych hodowlach neuronów. Zaobserwowaliśmy, że β-katenina zlokalizowana jest przede wszystkim w błonach cytoplazmatycznych neuronów i astrocytów w całym mózgu, co było oczekiwane, ale także w ciele i jądrach komórkowych neuronów wzgórza [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010, Misztal i wsp.; J Biol Chem 2011]. Taka lokalizacja β-kateniny w komórkach zróżnicowanych jest ewenementem. Równie nietypowy jest wysoki poziom czynników 13
14 transkrypcyjnych LEF1 i TCF7L2, jaki zaobserwowaliśmy we wzgórzu nie tylko w czasie rozwoju, ale także u zwierząt dorosłych, zarówno na poziome mrna jak i białka [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010; Nagalski i wsp., Brain Struct Funct 2012]. W przypadku RNA oszacowaliśmy, że średnio w jednej komórce wzgórza dorosłego osobnika znajduje się około 50 kopii Lef1 i 400 kopi Tcf7l2. Przeprowadziliśmy także analizę obecności izoform LEF1 i TCF7L2 za pomocą reakcji PCR i metody Western blot. Okazało się, że we wzgórzu embrionalnym przeważa dominująca negatywna izoforma TCF7L2, natomiast u myszy dorosłych TCF7L2 występuje w formie zdolnej do oddziaływania z β-kateniną, a więc zdolnej do aktywacji ekspresji genów [Nagalski i wsp., Brain Struct Funct 2012]. β-katenina i czynniki LEF1 i TCF7L2 wydają się więc odgrywać szczególną rolę w neuronach wzgórzowych, także w dojrzałym mózgu. Czy wzgórze warto badać? Wzgórze jest bardzo ciekawą, choć do niedawna niedocenianą, częścią mózgu. Wszystkie informacje zmysłowe poza węchowymi docierają najpierw do wzgórza, i dopiero stamtąd kierowane są do kory mózgowej, w której zostają poddane analizie [Guillery & Sherman, Neuron 2002]. Neurony wzgórzowe, nazywane neuronami przekaźnikowymi, nie tylko po prostu przesyłają informacje do kory, ale w zależności od kontekstu behawioralnego są zdolne wpływać na ich format korzystając z możliwości generowania potencjałów czynnościowych w dwóch trybach, tonicznym i paczkowym [Sherman, Trends Neurosci 2001]. Ta szczególna właściwość, wraz z możliwością modulacji wielkości reakcji i synchronizacji neuronów, sprawia, że wzgórze aktywnie wpływa na procesy selektywnej uwagi, świadomej percepcji oraz regulacji stanów snu i czuwania [Basso i wsp., Neuron 2005; Saalmann & Kastner, Neuron 2011]. Nasze odkrycie aktywnej β-kateniny w neuronach wzgórzowych było szczególnie interesujące z dwóch powodów. Z jednej strony neurony wzgórzowe mogą uczestniczyć w etiologii zaburzeń afektywnych i psychotycznych. Rozwojowe zaburzenia wzgórza, takie jak zmniejszenie objętości niektórych obszarów, załamanie systemu neuroprzekaźnikowego, czy zaburzenie połączeń wzgórzowo-korowych, wskazuje się jako jedną z przyczyn schizofrenii i ChAD, natomiast powiększenie wzgórza stwierdzono w niektórych przypadkach ciężkich zaburzeń depresyjnych [Clinton i wsp., Am J Psychiatry 2005; Harms i wsp., J Neurosci 2007; Young i wsp., Br J Psychiatry 2008; Pinault, Schizophr Bull 2011; Marenco i wsp., Neuropsychopharmacology 2012]. Z drugiej strony, jak wspomniałam w rozdziale Problematyka i Cele badawcze, wyżej wymieniony choroby wiązane są z nieprawidłową aktywnością β-kateniny i czynnika TCF7L2. 14
15 Mechanizm cytoplazmatyczno-jądrowej lokalizacji β-kateniny w neuronach wzgórza niezależność od szlaku Wnt (artykuł nr 11) Powyżej opisane wyniki skłoniły mnie do zadania pytania o mechanizm specyficznej lokalizacji subkomórkowej β-kateniny w neuronach wzgórzowych. W dorosłym mózgu obserwuje się ekspresję genów kodujących białka kanonicznego szlaku Wnt [Shimogori i wsp., J Comp Neurol 2004], między innymi receptory Frizzled we wzgórzu. Przypuszczaliśmy więc początkowo, że przyczyną stałej aktywności β-kateniny w neuronach wzgórzowych jest para- lub autokrynne działanie cząsteczek WNT. A jednak mimo zastosowania kilku różnych podejść eksperymentalnych nie udało się uzyskać wyników potwierdzających tę hipotezę. Pozbawienie neuronów wzgórzowych naturalnego mikrośrodowiska, poprzez hodowanie ich w nieobecności neuronów korowych i astrocytów, nie wpłynęło na lokalizację β-kateniny, wykluczając mechanizmy parakrynne [Misztal i wsp., J Biol Chem 2011]. Co więcej, na β- kateninę nie wypływało ani zahamowanie koreceptora LRP5/6 antagonistą DKK1, ani zaburzenie wewnątrzkomórkowego szlaku przekazywania sygnału Wnt poprzez nadekspresję białka DVL z dominującą negatywną mutacją [Misztal i wsp., J Biol Chem 2011]. Mieliśmy więc mocne podstawy, by twierdzić, że akumulacja β-kateniny w cytoplazmie i jej jądrowa lokalizacja w neuronach wzgórzowych nie jest zależna od sygnału Wnt. Była to kolejna nietypowa obserwacja. Nasza praca została zauważona przez edytorkę Science Signalling, która w rubryce Editors Choice zamieściła na jej temat komentarz pod tytułem A Wnt-Less Journey to the Nucelus [Adler, Science Signalling 2011]. Jaki więc mechanizm powoduje stałą akumulację β-kateniny w cytoplazmie i jądrze neuronów wzgórza? W trakcie naszych badań okazało się, że w porównaniu z innymi częściami mózgu, poziom białek kompleksu destrukcyjnego β-kateniny, a więc APC, Aksyny i GSK3α/β, jest we wzgórzu około trzykrotnie niższy [Misztal i wsp., J Biol Chem 2011]. Uznaliśmy więc za możliwe, że degradacja β-kateniny nie zachodzi w tych komórkach wystarczająco wydajnie. Faktycznie, eksperyment pulse-chase pokazał, że tempo degradacji cytoplazmatycznej β-kateniny jest w neuronach wzgórzowych ponad dwukrotnie wolniejsze niż w neuronach korowych [Misztal i wsp., J Biol Chem 2011]. Wydaje się więc, że obecność β-kateniny w cytoplazmie i jądrach neuronów wzgórza jest cechą autonomiczną tych komórek, związaną, przynajmniej częściowo, ze spowolnieniem jej degradacji. 15
16 Docelowe geny dla kompleksu β-katenin~lef1/tcf w neuronach wzgórzowych (artykuły nr 10 i 13) Aby przybliżyć się do poznania roli β-kateniny w dorosłym mózgu postanowiłam określić jej docelowy program genetyczny w neuronach wzgórza. Przyjęłam następujący plan badawczy: przeprowadzenie analiz in silico w celu wytypowania potencjalnych genów, wykonanie profilowania tych genów w mózgu aby skorelować ich ekspresję z występowaniem czynników LEF1/TCF i jądrową lokalizacją β-kateniny, i w końcu eksperymentalna weryfikacja regulacji danych genów przez β-kateninę. W pierwszej fazie szukaliśmy motywów wiązania czynników LEF1/TCF w konserwowanych regionach genów leżących w obszarach +/- 10 kb od startu transkrypcji w genomie szczurzym i ludzkim. Grupa genów z co najmniej dwoma konserwowanymi motywami LEF1/TCF w co najmniej jednym konserwowanym regionie (851 genów) była w sposób statystycznie istotny wzbogacona w znane geny docelowe szlaku Wnt. Co ciekawe, analiza ontologiczna pokazała, że grupa z motywami LEF1/TCF jest także wzbogacona w geny kodujące białka synaptyczne i bramkowane kanały jonowe, a więc białka o kluczowej funkcji w odbieraniu i przekazywaniu sygnału nerwowego [Wisniewska i wsp., BMC Genomics 2012]. W dalszych badaniach skupiliśmy się na tych genach (41 genów), ponieważ dawało to duże szanse na znalezienie nowych, neuronalnych, genów docelowych dla β-kateniny przy jednoczesnym znacznym zmniejszeniu kosztów eksperymentów. Kolejnym etapem była analiza profilu ekspresji genów wyłonionych in silico, w której posłużyliśmy się zaprojektowanymi przez nas macierzami PCR. Ponad 20% badanych genów (9 genów) ulegało wyraźnie wyższej ekspresji we wzgórzu niż w korze mózgowej i hipokampie, podczas gdy poziom ekspresji badanych genów w korze i hipokampie był zbliżony [Wisniewska i wsp., BMC Genomics 2012]. Kontrolna grupa genów nie wykazywała takiej preferencyjnej ekspresji we wzgórzu. Tak więc wyraźny był związek między występowaniem potencjalnych miejsc wiązania czynników LEF1/TCF w genie, a relatywnym poziomem jego ekspresji we wzgórzu. Został on także potwierdzony analizą statystyczną. Dalsze eksperymenty zmierzały do weryfikacji hipotezy, że te wzgórzowe geny z konserwowanymi motywami LEF1/TCF: Cacna1g, Cacna2d2, Kcna6, Kcnh8, Drd3, Gabra3, Glra1, Grid2 i Calb2, są faktycznie regulowane przez kompleks β-katenina~lef1/tcf. Zastosowaliśmy dwa podejścia badawcze. Po pierwsze, wykonaliśmy eksperyment typu loss of function : hamowaliśmy β-kateninę in vitro w hodowli neuronów wzgórzowych poprzez 16
17 nadekspresję Aksyny 2, białka z kompleksu destrukcyjnego, po czym badaliśmy poziom ekspresji powyższych genów [Wisniewska i wsp., BMC Genomics 2012]. Po drugie, przeprowadziliśmy immunoprecypitację chromatyny izolowanej ze wzgórza i innych części mózgu przeciwciałem skierowanym przeciwko β-kateninie, a następnie wykrywaliśmy obecność wytypowanych fragmentów genów metodą ilościowego PCR [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010; Wisniewska i wsp., BMC Genomics 2012]. Cztery geny pozytywnie przeszły oba testy: Cacna1g, Kcna6, Gabra3 i Calb2, co daje podstawy by twierdzić, że geny te są we wzgórzu bezpośrednio regulowane przez β-kateninę. Wymienione geny są pierwszymi poznanymi genami docelowymi β-kateniny o specyficznie neuronalnych funkcjach. Cacna1g i Kcna6 kodują kanały jonowe bramkowane napięciem, odpowiednio kanał wapniowy Cav3.1 i potasowy Kv1.6 [Catterall i wsp., Pharmacol Rev 2005; Gutman i wsp., Pharmacol Rev 2005]. Aktywność takich kanałów wpływa na parametry przewodnictwa elektrycznego błony komórkowej neuronów. Gabra3 jest genem dla jednego z receptorów neurotransmitera GABA (kwasu γ-aminomasłowego), który wywiera hamujący wpływ na przekazywanie sygnału elektrycznego przez neurony [Farrant & Kaila, Prog Brain Res 2007]. Warto tutaj wspomnieć, że nokaut genu Gabra3 powoduje u myszy zaburzenia w hamowaniu czuciowo-motorycznym, co jest jedną z cech schizofrenii [Yee i wsp., Proc Natl Acad Sci USA 2005]. W końcu Calb2 koduje Calbindynę 2 (znaną także jako Calretynina), wewnątrzkomórkowy bufor wapniowy, którego jedną z funkcji jest modulowanie odpowiedzi neuronów [Winsky & Kuznicki, J Neurochem 1995; Gall i wsp., J Neurosci 2003]. Sugeruje to udział β-kateniny w utrzymywaniu się prawidłowej pobudliwości neuronów wzgórza poprzez regulację ekspresji genów. β-katenina jako regulator pobudliwości neuronów wzgórzowych szczegółowa analiza regulacji promotora Cacna1g i test funkcjonalny (artykuł nr 10) Moje szczególne zainteresowanie wzbudził gen Cacna1g. Duża gęstość kodowanych przez niego kanałów Cav3.1 [Talley i wsp., J Neurosci 1999], przez które płyną prądy wapniowe typu T, umożliwia neuronom wzgórza przesyłanie informacji do kory mózgowej we wspomnianych wcześniej formatach paczkowym lub tonicznym [Kim i wsp., Neuron 2001]. Znany jest także związek Cav3.1 z padaczką z napadami nieświadomości [Singh i wsp., Hum Mutat 2007; Ernst i wsp., J Neurosci 2009]. Zdecydowaliśmy się na pogłębioną analizę regulacji promotora Cacna1g przez kompleks β-katenina~lef1/tcf oraz wykonanie 17
18 wstępnych testów funkcjonalnych, mogących dostarczyć dalszych wskazówek co do roli β- kateniny w neuronach wzgórza. Sklonowaliśmy ludzki i mysi promotor genu Cacna1g. Oba promotory wykazywały podwyższoną aktywność w komórkach z nadekspresję β-kateniny i LEF1 [Wisniewska i wsp. J Neurosci 2010]. Analiza mutacyjna pozwoliła na wyznaczenie obszaru promotora odpowiadającego na β-kateninę i LEF1 był nim fragment znajdujący się pomiędzy alternatywnymi miejscami startu transkrypcji. Aby dokładniej zmapować miejsca wiązania się białka LEF1 z DNA promotora Cacna1g, przeprowadziliśmy footprinting z samodzielnie przygotowanym rekombinowanym białkiem LEF1 i znakowanymi radioaktywnie fragmentami promotora [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010]. Równoległe sekwencjonowanie pozwoliło nam precyzyjnie wyznaczyć sekwencje DNA tych miejsc. W badanym obszarze, o długości prawie 600 par zasad, znaleźliśmy cztery miejsca wiązania w promotorze ludzkim i homologiczne z nimi miejsca w promotorze mysim. Wyniki te potwierdziły bezpośrednią regulację genu Cacna1g przez kompleks β-katenina~lef1. Dalsze nieopublikowane badania pokazały, że również kompleks β-katenina~tcf7l2 jest aktywatorem promotora Cacna1g, nawet o większym potencjale niż β-katenina~lef1. Czy udział β-kateniny w regulacji ekspresji genu dla kanału wapniowego Cav3.1 jest na tyle istotny, że jej aktywność wpływa na właściwości elektrofizjologiczne neuronów wzgórzowych? By się o tym przekonać, nawiązałam współpracę z elektrofizjologami, którzy przeprowadzili rejestrację charakterystycznych dla kanału Cav3.1 prądów wapniowych T, płynących w poprzek błon komórkowych neuronów wzgórzowych traktowanych in vitro rekombinowanym białkiem WNT3A, posługując się techniką patch-clamp [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010]. Pod wpływem WNT w neuronach dochodziło do wzrostu poziomu β- kateniny oraz do wzrostu ekspresji Cacna1g. Rosło także istotnie natężenie prądów T w porównaniu do neuronów kontrolnych. Tak więc w zastosowanym modelu in vitro przy aktywacja β-kateniny dochodziło do zwiększenia prądów T, co wskazuje na udział β-kateniny w utrzymywaniu fizjologicznych właściwości neuronów wzgórzowych. Nasze odkrycie wzbudziło zainteresowanie; między innymi zacytowano je i zilustrowano na rycinie w artykule przeglądowym o rozwoju wzgórza w czasopiśmie Frontiers in Neuroscience [Hagemann & Scholpp, Front Neurosci 2012]. 18
19 Rola szlaku Wnt/β-katenina w neurogenezie dorosłych (artykuł przeglądowy, nr 14) W trakcie realizacji projektu habilitacyjnego w literaturze pojawiły się prace podejmujące temat aktywności β-kateniny w dorosłym mózgu od innej strony niż nasze badania. Zwrócono przede wszystkim uwagę na rolę β-kateniny w neurogenezie dorosłych w zakręcie zębatym hipokampa i w strefie podkomorowej komór bocznych mózgu. Korzystając z zaproszenia do napisania pracy przeglądowej do specjalnego numeru Neurochemical Research, przedstawiłam własną interpretację tych wyników oraz wyników własnych [Wisniewska, Neurochem Res 2013]. Badania na temat roli szlaku Wnt/β-katenina w proliferacji i różnicowaniu pluripotencjalnych prekursorowych komórek nerwowych (NPCs, ang. Neuronal Precursor Cells) w dorosłym mózgu wpisują się w klasyczny nurt badań nad rolą kanonicznego szlaku Wnt w rozwoju organizmu. Wyniki większości eksperymentów wskazują na pozytywny wpływ aktywacji szlaku Wnt/β-katenina na proliferację komórek prekursorowych i/lub ich różnicowanie się w kierunku neuronów, można jednak znaleźć dowody świadczące o czymś przeciwnym [Lie i wsp., Nature 2005; Yu i wsp., Mol Cell Biochem 2006; Adachi i wsp., Stem Cells 2007; Qu i wsp., Nat Cell Biol 2010; Marinaro i wsp., Cereb Cortex 2012]. Nie musi być w tych obserwacjach sprzeczności; doskonale wiadomo, że β-katenina i czynniki LEF1/TCF mogą aktywować różne programy genetyczne, zależnie od kontekstu komórkowego, między innymi obecności innych współregulatorów. Na przykład rolę swoistego przełącznika między programem proliferacji a programem różnicowania mogłaby odgrywać kinaza HIPK1, która modyfikuje odpowiedź transkrypcyjną na kompleks β-katenina~/lef1/tcf, a której ekspresję obserwuje się w NPCs [Marinaro i wsp., Cereb Cortex 2012]. Panuje więc przekonanie, że β-katenina bierze udział w neurogenezie dorosłych, choć jej faktyczna rola jest nieco kontrowersyjna. Moje wątpliwości budzi jednak brak bezpośredniego dowodu na aktywność β-kateniny i czynników LEF1/TCF w strefach neurogenezy w dorosłym mózgu. My także nie wykryliśmy w tych obszarach ani czynników LEF1 czy TCF7L2, ani jądrowej β-kateniny. Jeżeli więc dochodzi do aktywacji β- kateniny, jest ona albo bardzo krótkotrwała albo/i na niskim poziomie. Nie jest też wykluczone, że to nie β-katenina, ale inne białka aktywowane lub hamowane w szlaku Wnt, wpływają na neurogenezę w dorosłym mózgu [Hirsh i wsp., Exp Cell Res 2007]. 19
20 6.E. Podsumowanie, wnioski i znaczenie badań Podsumowanie wyników 1. Stwierdziliśmy, że w neuronach dorosłych gryzoni w specyficznym obszarze mózgu, we wzgórzu, β-katenina występuje nie tylko w błonach komórkowych ale także w cytoplazmie i jądrach komórkowych. W neuronach tych z β-kateniną współwystępują regulowane przez nią czynniki transkrypcyjne LEF1 i TCF7L2. 2. Wykazaliśmy, że zahamowanie aktywacji kanonicznego szlaku Wnt nie wpływa na poziom β-kateniny w neuronach wzgórza, co wskazuje na inny, nietypowy, mechanizm aktywacji jej cytoplazmatycznej puli. Zaobserwowaliśmy natomiast, że poziom białek tworzących kompleks destrukcyjny β-kateniny, GSK3α/β, APC i Aksyny, jest niższy w neuronach wzgórza niż w neuronach hipokampa czy kory mózgowej, in vivo i in vitro. Niższe jest również tempo degradacji cytoplazmatycznej puli β-kateniny. Powodem stałej akumulacji β-kateniny w neuronach wzgórza może być więc jej nieefektywna degradacja. 3. Znaleźliśmy nowe geny docelowe dla kompleksu β-katenina~lef1/tcf w neuronach wzgórzowych. Są to Cacna1g, Kcna6, Gabra3, Calb2, a możliwe, że także inne geny kodujące kanały jonowe bramkowane napięciem, receptory neurotransmiterów, czy białka synaptyczne. Sugeruje to udział β-kateniny w elektrofizjologii tych neuronów na poziomie regulacji ekspresji genów. 4. Pokazaliśmy, że po podwyższeniu poziomu β-kateniny w neuronach wzgórzowych in vitro wzrasta natężenie prądów wapniowych T płynących przez błonę komórkową. Świadczy to o większej gestości kanałów Cav3.1, kodowanych przez jeden z nowych genów docelowych β-kateniny Cacna1g. Jest to pierwsze funkcjonalne potwierdzenie istotnej roli β- kateniny w utrzymywaniu prawidłowej pobudliwości neuronów wzgórza. 20
21 Fig. 2. Proponowane role β-kateniny w neuronach dorosłego mózgu. Z Wisniewska 2013, Journal of Neurochemistry A Hipotetyczny model mitogennej i neurogenicznej roli kompleksów β-katenina~lef1/tcf w neuronalnych komórkach prekursorowych podczas neurogenezy dorosłych, modulowanej przez białko HIPK1 [Marinaro et al. 2012]. B Stała i niezależna od Wnt aktywność kompleksów β-katenina~lef1/tcf we neuronach wzgórza i kontrola ekspresji genów kodujących białka związane z przekazywaniem sygnału w neuronach [Wisniewska et al. 2010, Misztal et al. 2011, Wisniewska et al. 2012]. Wnioski i znaczenie badań Na podstawie powyższych wyników proponuję nową funkcję β-kateniny w dorosłym mózgu, obok jej roli w plastyczności synaptycznej (błonowa β-katenina, tutaj nie opisywana) i w neurogenezie dorosłych (kanoniczny szlak Wnt i jądrowa β-katenina, Ryc. 2A) [Wisniewska, Neurochem Res 2013]. W neuronach wzgórzowych w sposób niezależny od aktywności szlaku Wnt utrzymuje sie wysoki poziom β-kateniny w cytoplazmie i jądrze komórkowym [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010; Misztal i wsp., J Biol Chem 2011] oraz wysoki poziom czynników transkrypcyjnych LEF1 i TCF7L2 [Wisniewska i wsp, J Neurosci. 2010; Nagalski i wsp., Brain Struct Funct 2012], których β-katenina jest kofaktorem. Wszystko wskazuje na to, że jest to cecha wewnętrzna tych komórek, odróżniająca je od innych neuronów mózgu. Uzasadnione jest więc przypuszczenie, że kompleksy β- katenina~lef1 i β-katenina~tcf7l2 pełnią funkcję ostatecznych selektorów (ang. terminal selector) dla neuronów wzgórza, czyli czynników transkrypcyjnych określający i podtrzymujących cechy różnicowe tych komórek [Hobert, Annu Rev Cell Dev Biol 2011]. Bardzo mocno przemawia za tym fakt, że wzgórzowe geny docelowe β-kateniny kodują białka określające właściwości elektrofizjologiczne neuronów (Ryc. 2B) [Wisniewska i wsp., 21
22 BMC Genomics 2012], w szczególności kanał Cav3.1. Na podstawie pomiarów prądów T przeprowadzonych na pierwotnych hodowlach neuronów wzgórzowych, można przypuszczać, że β-katenina warunkuje prawidłową pobudliwość neuronów wzgórza [Wisniewska i wsp., J Neurosci 2010]. Planowane badania in vivo na nowych modelach zwierzęcych mają na celu zweryfikowanie tej hipotezy. Jak wspomniałam wcześniej, postuluje się związek między zaburzeniami afektywnymi i psychotycznymi a nieprawidłową aktywnością β-kateniny i czynnika TCF7L2. Na podstawie naszych badań stawiam tezę, że jedną z przyczyn tych zaburzeń jest rozregulowanie ekspresji genów zależnych od kompleksu β-katenina~lef1/tcf7l2 we wzgórzu. Uzyskanie odpowiedzi na pytanie, czy taki związek faktycznie istnieje i czy dotyczy on (także) funkcjonowania wzgórza, wymaga jeszcze wielu badań, które mam nadzieje przeprowadzić. Na koniec chcę podkreślić, że nasze badania były nowatorskie, jeżeli chodzi o stawiane hipotezy, i wymagały zastosowania bardzo różnorodnych technik. Myślę, że między innymi z tych powodów zespół, w którym pracowałam i którego pracą kierowałam realizując projekt habilitacyjny, wspierana przez prof. Jacka Kuźnickiego, został wyróżniony nagrodą im. Jerzego Konorskiego przyznaną przez Polskie Towarzystwo Badania Układu Nerwowego i Polski Komitet Neurobiologii za najlepszą polską publikację w dziedzinie neurobiologii w roku
23
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Podstawowe zagadnienia. Mgr Monika Mazurek Instytut Psychologii Uniwersytet Jagielloński
Podstawowe zagadnienia Mgr Monika Mazurek Instytut Psychologii Uniwersytet Jagielloński NEUROPLASTYCZNOŚĆ - zdolność neuronów do ulegania trwałym zmianom w procesie uczenia się (Konorski,, 1948) Główne
Do oceny przedstawiono oprawioną rozprawę doktorską zawierającą 133 strony
Prof. dr hab. Maciej Zabel Katedra Histologii i Embriologii Uniwersytet Medyczny w Poznaniu Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Hanny Kędzierskiej pt. Wpływ czynnika splicingowego SRSF2 na regulację apoptozy
Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak
Katedra Fizjologii i Biochemii Roślin Uniwersytetu Łódzkiego Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Plan wykładu Przykłady
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ
mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
przebiegu stanu zapalnego i procesów nowotworowych poprzez aktywację czynnika
Ocena osiągnięcia naukowego zgłoszonego do postępowania habilitacyjnego pt. Interleukina 1 i epidermalny czynnik wzrostu regulują ekspresję genów istotnych w przebiegu stanu zapalnego i procesów nowotworowych
Ocena pracy doktorskiej mgr Magdaleny Banaś zatytułowanej: Ochronna rola chemeryny w fizjologii naskórka
Profesor Jacek Otlewski Wrocław, 23 lutego 2015 r. Ocena pracy doktorskiej mgr Magdaleny Banaś zatytułowanej: Ochronna rola chemeryny w fizjologii naskórka Rozprawa doktorska mgr Magdaleny Banaś dotyczy
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Układ pracy. Wstęp i cel pracy. Wyniki. 1. Ekspresja i supresja Peroksyredoksyny III w stabilnie transfekowanej. linii komórkowej RINm5F
The influence of an altered Prx III-expression to RINm5F cells Marta Michalska Praca magisterska wykonana W Zakładzie Medycyny Molekularnej Katedry Biochemii Klinicznej Akademii Medycznej w Gdańsku Przy
Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy
Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym
Prof. dr hab. Jacek Kuźnicki ur. 11.03.1952 r. w Łodzi
Prof. dr hab. Jacek Kuźnicki ur. 11.03.1952 r. w Łodzi Edukacja i stopnie naukowe Magisterium, Uniwersytet Warszawski, 1976 Doktorat, Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN, 1980 Habilitacja,
OCENA Rozprawy doktorskiej mgr Aksany Varabyovej Biogeneza dysmutazy ponadtlenkowej 1 w mitochondrialnej przestrzeni międzybłonowej
prof. dr hab. Barbara Zabłocka Pracownia Biologii Molekularnej Instytut Medycyny Doświadczalnej i Klinicznej im. M. Mossakowskiego PAN ul. Pawińskiego 5, 02-106 Warszawa tel: 22-60 86 486 e-mail: bzablocka@imdik.pan.pl
Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu prof. dr hab. Krystyna Skwarło-Sońta pracownik emerytowany
Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu prof. dr hab. Krystyna Skwarło-Sońta pracownik emerytowany Adiunkci: dr Jan Jabłonka dr Joanna Kotwica - Rolińska dr Paweł Majewski dr Magdalena
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt wykładu Rozpoznanie antygenu
mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii
Zawartość 139371 1. Wstęp zarys historii genetyki, czyli od genetyki klasycznej do genomiki 2. Chromosomy i podziały jądra komórkowego 2.1. Budowa chromosomu 2.2. Barwienie prążkowe chromosomów 2.3. Mitoza
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
oporność odporność oporność odporność odporność oporność
oporność odporność odporność nieswoista bierna - niskie ph na powierzchni skóry (mydła!) - enzymy - lizozym, pepsyna, kwas solny żołądka, peptydy o działaniu antybakteryjnym - laktoferyna- przeciwciała
Tolerancja immunologiczna
Tolerancja immunologiczna autotolerancja, tolerancja na alloantygeny i alergeny dr Katarzyna Bocian Zakład Immunologii kbocian@biol.uw.edu.pl Funkcje układu odpornościowego obrona bakterie alergie wirusy
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
Immunologia komórkowa
Immunologia komórkowa ocena immunofenotypu komórek Mariusz Kaczmarek Immunofenotyp Definicja I Charakterystyczny zbiór antygenów stanowiących elementy różnych struktur komórki, związany z jej różnicowaniem,
Toruń, dnia r.
dr hab. Dariusz Jan Smoliński Zakład Biologii Komórki Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu Toruń, dnia 24.06.2013 r. RECENZJA rozprawy doktorskiej Pana magistra
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII. Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro Koło Naukowe Immunolgii kolo_immunologii@biol.uw.edu.pl kolo_immunologii.kn@uw.edu.pl CEL I PRZEDMIOT PROJEKTU Celem doświadczenia
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
IL-4, IL-10, IL-17) oraz czynników transkrypcyjnych (T-bet, GATA3, E4BP4, RORγt, FoxP3) wyodrębniono subpopulacje: inkt1 (T-bet + IFN-γ + ), inkt2
Streszczenie Mimo dotychczasowych postępów współczesnej terapii, przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) nadal pozostaje chorobą nieuleczalną. Kluczem do znalezienia skutecznych rozwiązań terapeutycznych
CHOROBY REUMATYCZNE A OBNIŻENIE GĘSTOŚCI MINERALNEJ KOŚCI
CHOROBY REUMATYCZNE A OBNIŻENIE GĘSTOŚCI MINERALNEJ KOŚCI Katarzyna Pawlak-Buś Katedra i Klinika Reumatologii i Rehabilitacji Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu ECHA ASBMR 2018 WIELOCZYNNIKOWY CHARAKTER
Diagnostyka zakażeń EBV
Diagnostyka zakażeń EBV Jakie wyróżniamy główne konsekwencje kliniczne zakażenia EBV: 1) Mononukleoza zakaźna 2) Chłoniak Burkitta 3) Potransplantacyjny zespół limfoproliferacyjny Jakie są charakterystyczne
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska
Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych
Proponowane tematy prac magisterskich
Proponowane tematy prac magisterskich Analiza funkcjonalna oktopaminy w zachowaniach agresywnych mrówki ćmawej - praca wykonywana we współpracy z Pracownią IBD PAN (opiekun dr hab. Piotr Bębas/prof. dr
Pozaanestetyczne działanie anestetyków wziewnych
Pozaanestetyczne działanie anestetyków wziewnych Wojciech Dąbrowski Katedra i I Klinika Anestezjologii i Intensywnej Terapii Uniwersytetu Medycznego w Lublinie e-mail: w.dabrowski5@gmail.com eter desfluran
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
AUTOREFERAT ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. The role of Sdf-1 in the migration and differentiation of stem cells during skeletal muscle regeneration
mgr Kamil Kowalski Zakład Cytologii Wydział Biologii UW AUTOREFERAT ROZPRAWY DOKTORSKIEJ The role of Sdf-1 in the migration and differentiation of stem cells during skeletal muscle regeneration Wpływ chemokiny
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem.
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Streszczenie Ogólnym celem niniejszej pracy było lepsze zrozumienie funkcjonowania szlaku
ZAJĘCIA 1. uczenie się i pamięć mechanizmy komórkowe. dr Marek Binder Zakład Psychofizjologii
ZAJĘCIA 1 uczenie się i pamięć mechanizmy komórkowe dr Marek Binder Zakład Psychofizjologii problem engramu dwa aspekty poziom systemowy które części mózgu odpowiadają za pamięć gdzie tworzy się engram?
Seminarium Wpływ realizacji pobytów stażowych (szkoleniowych) na rozwój potencjału dydaktycznego postdoców i doktorantów
Seminarium Wpływ realizacji pobytów stażowych (szkoleniowych) na rozwój potencjału dydaktycznego postdoców i doktorantów 7 wrzesień 2011 roku sala Rady Wydziału, ul. Oczapowskiego 1A Projekt POKL. 04.01.01-00-178/09
Prof. dr hab. Czesław S. Cierniewski
Prof. dr hab. Czesław S. Cierniewski PROFESOR EDWARD F. PLOW Dr Edward F. Plow otrzymał stopień doktora nauk przyrodniczych w zakresie biochemii w 1970 roku na Uniwersytecie Zachodniej Wirginii (West Virginia
KARTA KURSU. Neurophysiology
KARTA KURSU Nazwa Nazwa w j. ang. Neurofizjologia Neurophysiology Kod Punktacja ECTS* 1 Koordynator Dr hab. Grzegorz Formicki Zespół dydaktyczny Dr hab. Grzegorz Formicki Prof. dr hab. Peter Massanyi Dr
Tkanka nerwowa. neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające)
Tkanka nerwowa neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające) Sygnalizacja w komórkach nerwowych 100 tys. wejść informacyjnych przyjmowanie sygnału przewodzenie
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
Liczba godzin Punkty ECTS Sposób zaliczenia
Wydział: Psychologia Nazwa kierunku kształcenia: Psychologia Rodzaj przedmiotu: podstawowy Opiekun: prof. dr hab. Jan Matysiak Poziom studiów (I lub II stopnia): Jednolite magisterskie Tryb studiów: Stacjonarne
Ruch zwiększa recykling komórkowy Natura i wychowanie
Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD. Ruch zwiększa recykling komórkowy Ćwiczenia potęgują recykling komórkowy u myszy. Czy
Recenzja pracy doktorskiej Mgr Natalii Sawki. gatunków zespołu Paramecium aurelia
NENCKI INSTITUTE OF EXPERIMENTAL BIOLOGY POLISH ACADEMY OF SCIENCES 3, Pasteur Str, 02-093 Warsaw, Poland Phone: (48-22) 5892357; Fax: (48-22) 822 53 42 Recenzja pracy doktorskiej Mgr Natalii Sawki pt.
Prof. dr hab. Stanisław Okrasa Katedra Fizjologii Zwierząt Wydział Biologii i Biotechnologii UWM w Olsztynie OLSZTYN ul.
Prof. dr hab. Stanisław Okrasa Katedra Fizjologii Zwierząt Wydział Biologii i Biotechnologii UWM w Olsztynie 10-718 OLSZTYN ul. Oczapowskiego 1A Ocena rozprawy doktorskiej mgr Joanny Rzemieniec pt.: Neuroprotekcyjny
Wrocław, Ogólna charakterystyka rozprawy
Wrocław, 26.08.14 Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Piotra Zygmunta Trzeciaka pt. Wpływ podwyższonej temperatury na poziom ekspresji wybranych genów w komórkach ziarnistych kompleksu wzgórek jajonośny
Indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste
Indukowane pluripotencjalne komórki macierzyste Nagroda Nogla w dziedzinie medycyny i fizjologii z roku 2012 dla Brytyjczyka John B.Gurdon oraz Japooczyka Shinya Yamanaka Wykonały: Katarzyna Białek Katarzyna
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
Z47 BADANIA WŁAŚCIWOŚCI ELEKTROFIZJOLOGICZNYCH BŁON KOMÓRKOWYCH
Z47 BADANIA WŁAŚCIWOŚCI ELEKTROFIZJOLOGICZNYCH BŁON KOMÓRKOWYCH I. Cel ćwiczenia Celem ćwiczenia jest zapoznanie się z podstawową wiedzą na temat pomiarów elektrofizjologicznych żywych komórek metodą Patch
KARTA KURSU. Kod Punktacja ECTS* 2
KARTA KURSU Nazwa Nazwa w j. ang. Neurofizjologia Neurophysiology Kod Punktacja ECTS* 2 Koordynator Dr hab. Grzegorz Formicki Zespół dydaktyczny Dr hab. Grzegorz Formicki Prof. dr hab. Peter Massanyi Dr
3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) 3. Podstawy genetyki I nformacje ogólne Kod F3/A modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu Podstawy
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu Neuron jest podstawową jednostką przetwarzania informacji w mózgu. Sygnał biegnie w nim w kierunku od dendrytów, poprzez akson, do synaps. Neuron
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Recenzja rozprawy habilitacyjnej i ocena dorobku naukowego dr Anety Kaszy
Prof. dr hab. Jacek Bigda Gdańsk, dnia 4 czerwca 2013 roku Zakład Biologii Komórki Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii UG i GUMed Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy
Model Marczuka przebiegu infekcji.
Model Marczuka przebiegu infekcji. Karolina Szymaniuk 27 maja 2013 Karolina Szymaniuk () Model Marczuka przebiegu infekcji. 27 maja 2013 1 / 17 Substrat Związek chemiczny, który ulega przemianie w wyniku
Potencjał spoczynkowy i czynnościowy
Potencjał spoczynkowy i czynnościowy Marcin Koculak Biologiczne mechanizmy zachowania https://backyardbrains.com/ Powtórka budowy komórki 2 Istota prądu Prąd jest uporządkowanym ruchem cząstek posiadających
Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF
Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Fizjologia człowieka
Fizjologia człowieka Wykład 2, część A CZYNNIKI WZROSTU CYTOKINY 2 1 Przykłady czynników wzrostu pobudzających proliferację: PDGF - cz.wzrostu z płytek krwi działa na proliferację i migrację fibroblastów,
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)
Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 (skrajne daty) 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna
FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach
FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach FOCUS Plus to dodatek dostępny dla standardowych pasz tuczowych BioMaru, dostosowany specjalnie do potrzeb ryb narażonych na trudne
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy a) Toma A, Widłak W, Vydra N (2012) Rola czynnika transkrypcyjnego HSF1 w procesie nowotworzenia. Postępy Biologii Komórki 39(2):269 288 b) Vydra N, Toma
Zakład Chemii Teoretycznej i Strukturalnej
Badania struktury i aktywności nietypowego enzymu dekapującego ze Świdrowca nagany Białko TbALPH1 zostało zidentyfikowane jako enzym dekapujący w pasożytniczym pierwotniaku, świdrowcu nagany Trypasonoma
Metody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
OBLICZENIA ZA POMOCĄ PROTEIN
OBLICZENIA ZA POMOCĄ PROTEIN KODOWANIE I PRZETWARZANIE INFORMACJI W ORGANIZMACH Informacja genetyczna jest przechowywana w DNA i RNA w postaci liniowych sekwencji nukleotydów W genach jest przemieniana
Toczeń rumieniowaty układowy
Klinika Reumatologii i Chorób Wewnętrznych Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu Toczeń rumieniowaty układowy Magdalena Szmyrka-Kaczmarek Znaczenie autoprzeciwciał w patogenezie tocznia
Leczenie biologiczne co to znaczy?
Leczenie biologiczne co to znaczy? lek med. Anna Bochenek Centrum Badawcze Współczesnej Terapii C B W T 26 Październik 2006 W oparciu o materiały źródłowe edukacyjnego Grantu, prezentowanego na DDW 2006
Uniwersytet Łódzki. prof. dr hab. Wanda M. Krajewska Katedra Cytobiochemii Łódź 20 lipca 2016 r.
Uniwersytet Łódzki prof. dr hab. Wanda M. Krajewska Katedra Cytobiochemii Łódź 20 lipca 2016 r. Opinia pracy doktorskiej mgr Jolanty Zięby Senescencja komórek glejaka wielopostaciowego in vitro poszukiwanie
Geny, a funkcjonowanie organizmu
Geny, a funkcjonowanie organizmu Wprowadzenie do genów letalnych Geny kodują Białka Kwasy rybonukleinowe 1 Geny Występują zwykle w 2 kopiach Kopia pochodząca od matki Kopia pochodząca od ojca Ekspresji
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Zastosowanie terapii Neurofeedback w leczeniu zaburzeń psychicznych
Zastosowanie terapii Neurofeedback w leczeniu zaburzeń psychicznych Kasper Czech Zakład Psychologii Klinicznej i Sądowej Uniwersytet Śląski Definicja metody Biofeedback Metoda umożliwiająca zmianę wybranych