Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych
|
|
- Władysława Staniszewska
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Postępy Psychiatrii i Neurologii, 1997, 6, Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego Dynamie mutations in degenerative diseases oj the nervous system DOROTA HOFFMAN-ZACHARSKA Z Zakładu Genetyki IPiN w Warszawie STRESZCZENIE. W pracy omówiono istotę mutacji dynamicznych, przypuszczalny mechanizm ich powstawania oraz ich znaczenie w patogenezie niektórych procesów zwyrodnieniowych układu nerwowego. Przedstawiono dokladniej amplifikację określonych sekwencji trójnukleotydowych w kilku chorobach (red.). SUMMARY. The nature of dynamie mutations, their presumable underlying mechanism, as we!! as their role in the pathogenesis of some degenerative diseases o f the nervous system are discussed in the paper. More attention is devoted to amplification of selected trinucleotide sequences in several diseases (ed.). Słowa kluczowe: choroby zwyrodnieniowe o.u.n. l mutacje dynamiczne Key words: degenerative diseases of the CNS l dynamie mutations W ostatnich latach neurogenetyka molekularna rozwinęła się w jedną z bardziej aktywnych i obiecujących gałęzi neurobiologii. Jest to nowa dziedzina wykorzystująca techniki nowoczesnej genetyki molekularnej w badaniach klasycznych schorzeń neurologicznych o charakterze dziedzicznym, określanych mianem "chorób neurogenetycznych" i definiowanych jako kliniczne jednostki chorobowe, powodowane defektem jednego lub większej ilości genów, prowadzącym do zaburzenia różnicowania i funkqji neuroektodermy oraz jej pochodnych [Muller i wsp. 1994]. Choroby neurogenetyczne mogą być wynikiem zaburzenia prawidłowej ekspresji genu w neuroektodermie (typ I: wiele klasycznych dziedzicznych chorób zwyrodnieniowych, nerwowo-mięśniowych i zaburzeń rozwojowych mózgu), lub ich neurologiczny charakter może być powodowany pośrednio przez defekt genu nie ulegającego ekspresji w tkance nerwowej (typ II: choroby metaboliczne oraz dysplazje kostne z objawami neurologicznymi). Pod względem podłoża genetycznego można podzielić je na cztery grupy [Muller i wsp. 1994]: (l) grupa chorób powodowanych przez tzw. mutacje dynamiczne, czyli zwielokrotnienie sekwencji trójnukleotydowych w obrębie genów (np. choroba Huntingtona, bezład rdzeniowo -móżdżkowy, dystrofia miotoniczna, zespół kruchego chromosomu X), (2) choroby związane z wystąpieniem delecji lub disomiemości jednorodzicielskiej (np. dystrofia Duchenne'a -Beckera, zespół Pradera i Willego- -Algemana, zespół Millera-Dieker), (3) grupa chorób powodowanych głównie wystąpieniem mutacji punktowych (leukodystrofie sprzężone z chromosomem X, choroba Charcot-Marie -Tooth typ I i inne), (4) choroby genetycznie heterogenne, jak choroba Alzheimera czy choroba Parkinsona.
2 50 Dorota Hoffman-Zacharska W mmejszej pracy omówione zostanie podłoże molekularne chorób należących do pierwszej z wymienionych grup, ze szczególnym zwróceniem uwagi na choroby zwyrodnieniowe układu nerwowego. ANTYCYPACJA W CHOROBACH UWARUNKOWANYCH GENETYCZNIE Antycypację definiuje się jako występowanie, w przypadku niektórych chorób dziedzicznych, zjawiska cięższego przebiegu choroby, której objawy występowały już w kolejnych, wcześniejszych pokoleniach. Pojęcie to wprowadzono na początku XX wieku w wyniku szczegółowych badań klinicznych rodzin dotkniętych dystrofią miotoniczną (myotonic dystrophy, MD), podczas których zaobserwowano wyraźną "ewolucję" tej choroby od formy łagodnej (zaćma) poprzez wystąpienie w następnych pokoleniach klasycznej formy MD (postępujące osłabienie i zanik mięśni), której często w tym samym lub następnym pokoleniu towarzyszyły bezpłodność, upośledzenie umysłowe i przed- wczesna śmiertelność, aż do wystąpienia najostrzejszej, wrodzonej formy MD ( eongenital MD, CMD) z głębokim upośledzeniem umysłowym i zanikiem mięśni, która zawsze związana była z przekazywaniem choroby przez matkę (rys. la). Dalsze badania wykazały, że we wszystkich przypadkach wystąpiło dziedziczenie cechy w sposób autosomalny dominujący. Szczególny przypadek antycypacji zaobserwowano w dziedziczeniu zespołu kruchego chromosomu X (jragile X syndrom, zespół fra-x), najczęstszej formy dziedzicznego upośledzenia umysłowego, przekazywanej jako cecha dominująca o niepełnej penetracji, sprzężona z chromosomem X. Charakterystyczne dla zespołu fra-x jest, że 20% mężczyzn będących nosicielami mutacji nie wykazuje objawów upośledzenia, podczas gdy 30% kobiet nosicielek opóźnionychjest w rozwoju umysłowym. Ponadto córki bezobjawowych nosicieli nigdy nie wykazują objawów choroby, które pojawiają się dopiero w następnym pokoleniu, tzn. u ich wnuków. Podobnie, jak w przypadku Rys. 1a m O zdrowy mężczyzna O zdrowa kobieta chory mężczyzna chora kobieta CMD 5/2000 5/17 <> pleć nieznana [) heterozyg o ta EJ0 nosiciele 40% 16% 50% 28% Rysunek la. Antycypacja w dziedziczeniu dystrofii miotonicznej (MD -typowa forma dystrofii, CMD - wrodzona forma dystrofii), dla poszczególnych osób zaznaczono ilość powtórzeń erg w obrębie genu DM-19 [wg Caskey i wsp. 1992] Rysunek Ib. Paradoks Sherman, empirycznie wyznaczone ryzyko wystąpienia objawów zespołu fra-x w zależności od położenia w rodowodzie [wg Fu i wsp. 1991]
3 Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 51 MD, występuje tu zaostrzenie objawów choroby w kolejnych generacjach z tym, że ryzyko zachorowania zależy od pozycji danej osoby w drzewie rodowym (rys. lb). Jest to tzw. paradoks Sherman, który mówi, że prawdopodobieństwo wystąpienia choroby wśród rodzeństwa bezobjawowych nosicieli jest znacznie mniejsze (9%) niż wśród jego wnuków i prawnuków (40-50%) [Sherman i wsp. 1985]. W obu wymienionych przypadkach wytłumaczenie obserwowanych awisk było niezmiernie trudne w świetle założeń klasycznej genetyki mendlowskiej, definiującej geny jako stabilne elementy tylko rzadko zmieniane przez mutacje (częstość mutacji spontanicznych szacuje się na l x 10-9 na zasadę na pokolenie). Spowodowało to duży sceptycyzm w stosunku do obserwowanego awiska (pomimo, że antycypację opisano w kolejnych chorobach - np. w chorobie Huntingtona) i wreszcie uznanie go za wynik subiektywnego doboru danych klinicznych i statystycznych. Takie stwierdzenia można spotkać jeszcze w podręcznikach genetyki z lat osiemdziesiątych [Teisberg 1995]. Badania molekularne prowadzone w tych latach wykazały jednak, że materiał genetyczny nie jest aż tak stabilny, jak zakładano uprzednio, i doprowadziły do uznania antycypacji za awisko autentyczne, a nie fikcję. MUTACJE DYNAMICZNE - MOLEKU LARNE PODŁOŻE ANTYCYPACJI Genetyka klasyczna definiowała mutacje jako dziedzicznie utrwalone zmiany w sekwencji DNA prowadzące do zaburzenia prawidłowego funkcjonowania genów. Mutacje w takim ujęciu miały stabilny charakter, zarówno pod względem niezmienności przy przekazywaniu z pokolenia na pokolenie, jak również wpływu na prawdopodobieństwo zajścia kolejnych zmian w obrębie zmutowanej sekwencji DNA. Do weryfikacji tej definicji zmusiło odkrycie w genomach eukariotycznych obecności sekwencji mutujących z dużą częstością, niejednokrotnie przy każdorazowym przekazywaniu ich potomstwu. Sekwencje takie określono mianem niestabilnych sekwencji DNA. Niestabilne sekwencje DNA należą do grupy sekwencji repetytywnych (powtarzających się) stanowiących znaczącą frakcję (u zwierząt do 50%) DNA genomowego. Jednym z rodzajów takich sekwencji są tzw. sekwencje mikrosatelitarne składające się z wielu następujących po sobie powtórzeń sekwencji 2-5 nukleotydowych [Charlesworth i wsp. 1994]. Sekwencje te charakteryzują się dużym polimorfizmem, co oznacza, że występują w genomie w wielu formach różniących się między sobą ilością --ł CAO H CAO H CAO H CAO H CAO H CAG H CAG f-- DNA --ł OTC H GTC H OTC H GTC H OTC H OTC H GTC ::;:;::;::;:;:;:;:;:;:;:;;:L.--:l _Nićsyntetyzowana --ł GTC H. ----'H' 'H. _,H. _,H. _,HL jl-- Matryca =:z l ---ł;; Ubm:::::::::jJ@::::::::::::t.:=:::U:::::::::::::::;:;:.;?.:i;::::! nowe ;;;rzenia -lorch H H H H H Rysunek 2. Schemat przedstawiający prawdopodobny mechanizm ślizgania się polimerazy (polymerase slippage) mogący prowadzić do zmiany ilości powtórzeń w obrębie sekwencji mikrosatelitarnych
4 52 Dorota Hoffman-Zacharska powtórzeń sekwencji podstawowej. Przyczyną tak znacznego polimorfizmu jest zapewne łatwość z jaką zachodzi w ich obrębie mutacja, polegająca na zmianie - amplifikacji (zwiększeniu) lub kontrakcji (zmniejszeniu) ilości jednostek podstawowych. Mechanizm powstawania tego typu mutacji nie jest obecnie wyjaśniony. Wydaje się jednak, że w przypadku sekwencji mikrosatelitamych są one wynikiem tzw. ślizgania się polimerazy (polymerase sli'ppage) - rys. 2 [Dover 1995], a prawdopodobieństwo ich zajścia zależy od długości niestabilnej sekwencji. Mutacje te określa się mianem mutacji dynamicznych. Obecność niestabilnych sekwencji DNA, będących przyczyną mutacji dynamicznych nie tylko w obszarach niekodujących genomu, ale i w obrębie sekwencji kodujących, jest przyczyną występowania szeregu chorób genetycznie uwarunkowanych. We wszystkich opisanych do tej pory przypadkach chorób należących do tej grupy dochodzi do amplifikacji trójnukleotydowych sekwencji powtórzonych (trinucleotyde repeats, TNRs), których liczba u osób zdrowych utrzymuje się w określonych granicach, a u osób chorych znacznie je przekracza. Stopień niestabilności sekwencji TNR zależy od ich długości (liczby już występujących powtórzeń), co tłumaczy zmienność fenotypową wywoływanych przez nie chorób, jak również zaostrzenie objawów w kolejnych pokoleniach, czyli obserwowane zjawisko antycypacji. MUTACJE DYNAMICZNE JAKO PRZYCZYNA NIEKTÓRYCH CHORÓB GENETYCZNYCH CZŁOWIEKA Jak już wspomniano powyżej, występowanie trójnukleotydowych sekwencji powtórzonych w rejonach kodujących niektórych genów jest przyczyną występowania chorób uwarunkowanych genetycznie. Do tej pory opisano dziewięć takich jednostek chorobowych: (l) zespół kruchego chromosomu X związany z obecnością kruchego miejsca FRAXA (FRAXA mental retardation), (2) lekkie upośledzenie umysłowe związane z obecnością kruchego miejsca FRAXE (FRAXE mental retardation), (3) dystrofia miotaniczna (miotonic dystrophy - MD), (4) rdzeniowo-opuszkowy zanik mięśni typu Kennedy'ego (spinobulbar muscular atrophy - SBMA), (5) choroba Hunringtona (Huntington disease - HD), (6) ataksja rdzeniowo-móżdżkowa typu l (spinocerebellar ataxia type l - SCAl), (7) padaczka miokloniczna z ruchami pląsawiczymi ( dentatorubral-pallidoluysian atrophy - DRPLA) będąca alleliczną formą zespołu Haw River (Haw River syndrome - HRS), (8) choroba Machado-Joseph (Machado Joseph di'sease- MJD) alleliczna z ataksją możdżkowo-rdzeniową typu 3 (spinocerebellar ataxia typ 3 - SCA3), (9) ataksja Friedreicha (Friedreich's ataxia -FRDA). Zestawienie danych dotyczących chorób związanych z amplifikacją powtórzonych sekwencji trójnukleotydowych, nazywanych niekiedy chorobami TNR (TNR disorders), przedstawiono w tabl. l. Wśród opisanych chorób związanych z amplifikacją sekwencji TNR na podstawie położenia w obrębie genu mutujących sekwencji oraz zakresu chorobotwórczego powtórzeń można wyróżnić dwie grupy (rys. 3). Pierwsza z nich obejmuje cztery jednostki chorobowe: upośledzenia umysłowe związane z kruchymi miejscami FRAXA i FRA XE, MD i FRDA, gdzie mutacje dotyczą obszarów genów nie ulegających translacji, związane są z bardzo silną amplifikacją sekwencji podstawowych - powyżej 200 powtórzeń i prowadzą do obniżenia, czy wręcz zahamowania, ekspresji genów. W przypadku
5 Tablica l. Zestawienie chorób powodowanych ampliftk:acją sekwencji trójnukleotydowych (dziedziczenie: A - autosomalne, X - sprzężone z chromosomem X, D -dominujące, R- recesywne; antycypacja: mat., ojc. -występująca odpowiedź w dziedziczeniu mutacji od matki lub ojca; lok. powtórzeń: UTR -rejon genu nie ulegający translacji, ORF - otwarta ramka odczytu) s n. ą. g. c g_ g_ ". ci n; ;:,: s g. ;:: c Ul w Częstość Lokali- Dziedzi- Antycy- Lokaliza- Pow- Ilość Choroba występ o- Gen Produkt genu zacja po- czenie pacja cja genu tórzenia powtórzeń w ani a wtórzeń Efekt l mutacji Zespół kruchego mężczyźni: XJD + (mat.) Xq27.3 FMR-1 bialko wiążące CGG norm 'UTR inhibicja chromosomu X 1/1250 RNA premut transkrypcji mut. >200 mut biety: 1/2000 mut Upośledzenie umysłowe? XJD (?)? Xq28 FMR-2? CCG norm 'UTR? (inhibicja związane z FRAXE premut.? transkrypcji) Dystrofia miotaniczna 1/8000 AjD + (mat.) 19q13.3 MT-PK miotonina- CTG norm 'UTR inhibicja (MD) kinaza bialkowa premut mut transkrypcji Ataksja Friedreicha 1/50000 A/R? 9ql X-25 frataksyna - GAA norm intron. inhibicja (FRDA) funkcja niezn. premut.? transkrypcji mu t. 20->l 000 Rdzeniowo-opuszkowy? X/R + Xqll-q12 AR receptor CAG norm ORF zmiana zanik mięśni (SBMA) androgenów premut.? aktywności - cz. transkryp. mut bialka Choroba Buntingtona 1/10000 AJD + (ojc.) 4p16.3 IT15 huntingtina CAG norm ORF? (zmiana (HD) - funkcja niezn. premut aktywności mut bialka) Bezład rdzeniowo-? AjD + (ojc.) 6p22-p23 SCAl ataksyna-l CAG norm ORF? (zmiana -móżdżkowy typu l - funkcja niezn. premut. niezn. aktywności (SCAl) mut białka) Ataksja Machado-? AjD + (ojc.) 14q32 MIDI CAG norm ORF? (zmiana -Joseph {MID/SCA3) premut. niezn. aktywności bialka) Padaczka miokloniczna? AjD + (ojc.) 12p12 B37 atrofina-1 CAG norm ORF? (zmiana z ruchami pląsawiczymi - funkcja niezn. premut. niezn. aktywności (DRPLA{HRS) mut białka) ---
6 54 Dorota Hoffman-Zacharska Ryc. 3a DNA PROMOTOR E REJON KODUJĄCY E E E E TERMINATOR hnrna TRANSKRYPCJA mrna BIAŁKO 5'UTR l SPLICING ORF TRANSLACJA 1 3'UTR Ryc. 3b 5' UTR EGZON INTRON E GZO N ; {f EGZON 3' UTR FRAXA FRAXE MD CGG &-2\BIBI.. IMMIiilliililliii!!BIBIBII IE ulh CCG 11117olll!: 0 111! 0 11tllll llliiiiiiiibbiii!bbii!!ibl8iliiiii J::=:::::==:::::: a:::::::::;;===:: -OOBB.BBiiBIBIBIMIU iiBIBIRI8 ; RIMIBIIIR CAG tst SBMA HD MJD/SCA3 SCA1 z: mm CAG CAG '8" 1- li 7-8 liii88! eiiilllllll liiibis... llllllllii!i!18sn B!U BI-MI*!IV,iSIBIS RH DRPLA/HRS FRDA IIIIII H H l CAG l_1 liiilliiliii GAA Jt CAG 7-23 } piiifflłl8118!tlllł lllililillli.illilllil '19- Rysunek 3a. Schemat przedstawiający etapy ekspresji genu eukariotycznego. Sekwencja DNA zawierająca zarówno egzony (E), jak i introny (I) przepisywana jest narnaw postaci pierwotnego transkryptu (hnrna), z którego w procesie splicing wycinane są sekwencje niekodujące- introny. mrna stanowi matrycę do syntezy białka, sekwencje UTR na 5' i 3' końcu cząsteczki przed kodonem AUG i za kodonem "stop" nie ulegają translacji Rysunek 3b. Schemat przedstawiający rozmieszczenie sekwencji trójnukleotydowych w genach dla różnych chorób genetycznych powodowanych mutacjami dynamicznymi. W każdym przypadku podano rodzaj sekwencji, zakres powtórzeń u osób zdrowych (powyżej) i osób chorych. Objaśnienia skrótów nazw chorób znajdują się w tekście
7 Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 55 FRAXA i FRAXE mamy do czynienia z amplifikacją odpowiednio sekwencji CGG i CCG, której towarzyszy wystąpienie łamliwych miejsc w chromosomie X. Zwielokrotnienie sekwencji zachodzi na 5' końcu genu. Interesujące jest, że za wystąpienie w genomie człowieka trzech innych miejsc łamliwych również odpowiedzialne są zwielokrotnione podobne sekwencje trójnukleotydowe - FRAXF (GCC), FRA16A (CCG) oraz FRAllB (CCG) [Parrish i wsp. 1994, Jones i wsp. 1995]. We wszystkich przypadkach sekwencje te sąsiadują z tzw. wyspami CpG (CpG islands). Sekwencje CpG u pacjentów. z zespołem fra-x, u których w badaniu cytogenetycznym wykrywa się obecność miejsca FRAXA zawsze ulegają hipermetylacji. W przypadku MD amplifikowana jest sekwencja CTG w rejonie 3' UTR [Brook i wsp. 1992], a w FRDA sekwencja GAA w obszarzelintronu genu [Campuzano i wsp. 1996]. Druga grupa- to szereg chorób, w przypadku których mutacje obejmują obszary genów odczytywane w procesie translacji (otwarta ramka odczytu z ang. open reading frame- ORF), dotyczą one tylko sekwencji CAG (kodonu kodującego glutaminę) i prowadzą do wydłużenia ciągu glutamin w produkcie białkowym, zmieniając w ten sposób jego podstawową funkcję. Niestabilność sekwencji nie jest tu tak silna, a liczba powtórzeń trójnukleotydu CAG nigdy nie przekracza 150. Do grupy tych chorób należą: HD [Huntington Disease Collaborative Group 1993], SBMA [La Spada i wsp. 1991], SCAl [Orr i wsp. 1994], MJD [Kawaguchi i wsp. 1994] i DRPLA [Koide i wsp. 1994] będące chorobami zwyrodnieniowymi układu nerwowego o charakterze postępującym, związanymi z selektywną utratą neuronów. Choroby te dziedziczone są w sposób dominujący (wyjątek stanowi SBMA), charakteryzują się późnym występowaniem objawów (po 30 roku życia) i antycypacją, związaną z ojcowskim przekazywaniem zmutowanego genu, prowadzącą do występowania form młodzieńczych (objawy przed 20 rokiem życia). Rdzeniowo-opuszkowy zanik mięśni typu Kennedy'ego Rdzeniowo-opuszkowy zanik mięśni - to choroba należąca do grupy chorób nerwowo-mięśniowych charakteryzująca się zanikiem neuronów ruchowych. Jest to choroba wieku średniego o charakterze postępującym, której główne objawy obejmują osłabienie i zanik mięśni. Choroba dziedziczona jest jako cecha recesywna sprzężona z płcią. Występuje tylko u mężczyzn, u których oprócz głównych objawów stwierdza się obniżoną płodność i ginekomastię. Przyczyną tej choroby jest mutacja w l egzonie genu AR- kodującego receptor androgenu. Mutacja polega na amplifikacji sekwencji CAG, co prowadzi do wydłużenia ciągu glutamin na N-końcu białka. Receptor androgenu pełni funkcję czynnika transkrypcyjnego aktywowanego obecnością androgenów. Mutacja, która zaburza funkcję aktywującą białka, nie zachodzi jednak ani w domenie wiążącej hormon, ani w domenie oddziałującej z DNA. W chwili obecnej nie wiadomo, jaki jest związek pomiędzy amplifikacją sekwencji CAG a degeneracją neuronów ruchowych. Nie jest to najprawdopodobniej prosta utrata funkcji białka, gdyż u pacjentów z delecją genu AR nie obserwuje się objawów charakterystycznych dla SBMA, jedynie zespół jąder feminizujących [Bingham i wsp. 1995]. Choroba (pląsawica) Rontingtona Choroba Buntingtona (HD) jest chorobą zwyrodnieniową mózgu charakteryzującą się zanikiem neuronów prążkowi a i kory płatów czołowych. Podstawowymi jej objawami są mimowolne ruchy pląsawicze (początkowo ograniczonych grup mięśni z późniejszym stałym niepokojem ruchowym z zaburzeniami chodu) i postępujące otępienie. Objawy chorobowe w 90% przypadków występują między 35 i 40 rokiem życia, w 10% w tzw. postaci młodzieńczej HD, przed 20 rokiem życia. Przeciętnie chorzy umierają po latach od pojawienia się objawów choroby. Postaci młodzieńczej,
8 56 Dorota Hoffman-Zacharska związanej zazwyczaj z dziedziczeniem ojcowskim, towarzyszą ostrzejsze objawy i szybszy przebieg choroby. HD przekazywana jest jako cecha autosomaina dominująca o pełnej penetracji. Przyczyną tej choroby jest mutacja położonego na chromosomie4 genu IT15 kodującego huntingtynę -białko o nieznanej funkcji, nie wykazujące istotnej homologii do żadnego innego znanego obecnie białka. Huntingtyna jest białkiem cytoplazmatycznym, którego ekspresja, zarówno u osób zdrowych, jak i chorych, zachodzi w większości tkanek -nie jest ograniczona do układu nerwowego. Mutacja chorobotwórcza w tym przypadku związana jest również z niestabilnością sekwencji CAG znajdującej się na 5' końcu genu IT15. Ilość powtórzeń tej sekwencji w populacji osób zdrowych jest wysokozmienna - od 7 do 36, z tym, że w większości przypadków (> 99%) nie przekracza 30. U osób dotkniętych HD spotyka się ilość powtórzeń CAG w zakresie od 37 do ponad 120 (najczęściej ). Amplifikację tej sekwencji powyżej 37 powtórzeń stwierdza się niemal u wszystkich (99%) pacjentów, u których rozpoznano HD. Uznaje się więc, że jest to specyficzny marker pozwalający na weryfikację rozpoznania klinicznego, a u osób pochodzących z rodzin ryzyka HD nie wykazujących objawów- na stwierdzenie lub wykluczenie nosicielstwa mutacji związanej z tą chorobą. Szereg badań wykazuje istnienie korelacji pomiędzy wiekiem zachorowania a wielkością rejonu powtórzeń CAG w obrębie genu IT15, tzn. im większa liczba powtórzeń tym wcześniej występują objawy choroby. Najwyraźniej zależność ta widoczna jest w przypadkach młodzieńczych, gdzie objawy występują przed 20 rokiem życia, a liczba powtórzeń przekracza 50. Liczba powtórzeń nie poiwala jednak przewidywać w konkretnym przypadku ani wieku zachorowania ani klinicznego przebiegu choroby. Mechanizm patogenezy choroby Hunringtona nie został jeszcze poznany. Porlobnie jak w przypadku SBMA, selektywna utrata neuronów nie jest wynikiem utraty aktywności jednego allelu IT15, lecz zmiany funkcji kodowanego przez niego białka, za czym przemawia fakt, że pacjenci z zespołem Wolf-Hirshorna, będący hemizygotami dla obszaru obejmującego gen IT15, na skutek częściowej delecji krótkiego ramienia chromosomu 4, nie wykazują objawów charakterystycznych dla HD. Dziedziczne ataksje rdzeniowo-móżdżkowe Dziedziczne ataksje rdzeniowo-móżdżkowe (spinocerebellar ataxias- SCAs) stanowią heterogenną grupę postępujących chorób zwyrodnieniowych związanych z degeneracją neuronów w móżdżku, rdzeniu kręgowym i pniu mózgu. Pod względem genetycznym choroby te można podzielić na autosomalne recesywne, autosoma1ne dominujące i przypadki izolowane. Dla ataksji o dziedziczeniu recesywnym opisano dwa loci, na chromosomie 8q (ataksja związana z niedoborem wit. E) i 9q (ataksja Friedreicha). Do chwili obecnej, zmapowano również siedem loci związanych z ataksjami o dziedziczeniu dominującym: SCAl na chromosomie 6p, SCA2 na chromosomie 12q, choroba Machado-Joseph/SCA3-14q, SCA4-16q, SCA7-3p, SCA5 w centromerowym rejonie chromosomu 11 i DRPLA na chromosomie 12p - tabl. 2. W przypadku czterech z tych chorób uszkodzenia poszczegó1nych genów związane są z mutacjami dynamicznymi. W FRDA amplifikacji ulega trójnukleotyd GAA położony w obrębie intronu prowadząc do obniżenia poziomu mrna, w SCAl, MJD oraz DRPLA amplifikacji ulega sekwencja CAG w otwartej ramce odczytu, prowadząc, podobnie jak w przypadku SBMA i HD, do powstania białka o zwiększonym ciągu glutamin. U chorych z SCA2 i SCA 7 (AD CAli) również stwierdzono występowanie białek o dużych rejonach paliglutaminowych [Trottier i wsp. 1995], co, biorąc pod uwagę fakt występowania antycypacji w ich dziedziczeniu, może wskazywać na analogiczne podłoże molekularne mutacji.
9 Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 57 Tablica 2. Zestawienie danych dotyczących ataksji o charakterze dziedzicznym [wg Harding 1995, Schols i wsp. 1995, Junck i Fink 1996] l. Ataksje o dziedziczeniu recesywnym Lokalizacja genu Mutacja Częstość występowania AVED 8ql3 nieznana nieznana FRDA 9ql8-q21.1 powt. GAA cz. 1/50000 (nos. 1/120) 2. Ataksje o dziedziczeniu dominującym AutosomaJne dominujące ataksje móżdżkowe typu I - ADCA I SCAl 6p22-23 powt. CAG 17% SCA2 12p23-24 nieznana (CAG?) nieznana SCA3/MID 14q32 powt. CAG 18% SCA4 16q24 nieznana nieznana AutosomaJne dominujące ataksje móżdżkowe typu II - ADCA II SCA7 3p nieznana (CAG?) nieznana AutosomaJne dominujące ataksje móżdżkowe typu III - ADCA III SCAS llcent. nieznana nieznana DRPLAjHRS -padaczka miokloniczna z ruchami pląsawiczymi AutosomaJne dominujące ataksje periodyczne 12p12 powt. CAG 3% 12p i 19p nieznane DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA MUTACJI DYNAMICZNYCH Diagnostyka molekularna chorób wywoływanych przez mutacje dynamiczne opiera się w chwili obecnej na bezpośredniej analizie regionów ulegających mutacji. Sposób diagnostyki dla wszystkich chorób należących do tej grupy jest podobny i jego podstawą jest określenie wielkości fragmentu 4a 4b (CGG)n EcoRI sonda EcoRI l l l pełna mutacja - promutacja..._-_- -_, allel dziki- 5,2 kb Rysunek 4. Diagnostyka molekularna w zespole fra-x oparta na analizie restrykcyjnej DNA połączonej z hybrydyzacją. DNA cięty jest enzymem restrykcyjnym EcoRI, a następnie fragmenty DNA rozdzielane są w żelu agarazowym i po przeniesieniu na f:jltr hybrydyzowane z sondą. Niestabilne sekwencje (CGG). położone są wewnątrz fragmentu EcoRI rozpoznawanego przez sondę (4a). Wielkości hybrydyzujących fragmentów odpowiadają stopniowi zwielokrotnienia tej sekwencji (4b)
10 58 Dorota Hoffman-Zacharska NPR. (CAG ) PR. (CAG 8-34) Rysunek 5. Diagnostyka molekularna w chorobie Huntingtona. Na zdjęciu przedstawiona jest analiza produktów amplifikacji PCR rejonu obejmującego powtórzenia (CAG). genu IT15. Produkty reakcji rozdzielone zostały w 6% żelu poliakrylamidowym w warunkach denaturujących. Wielkośc;i poszczególnych fragmentów, na podstawie których wyliczono liczbę powtórzeń CAG,.ustalono poprzez bezpośrednie ich porównanie ze standardem wielkości - w tym przypadku reakcja sekwencjonowania faga Ml3/mp18. Amplifikację DNA prowadzono przy zastosowaniu starterów HDljHD3, liczbę powtórzeń CAG = (wielkość prod. PCR-47bp)/3 [Warner i wsp. 1993]
11 Mutacje dynamiczne w chorobach zwyrodnieniowych układu nerwowego 59 DNA obejmującego region niestabilny oraz ustalenie czy ilość powtórzeń sekwencji TNR znajduje się w zakresie patogennym dla danej choroby. W badaniach stosuje się dwie podstawowe metody: analizę restrykcyjną połączoną z hybrydyzacją oraz reakcję amplifikacji DNA metodą PCR (rys. 4, 5). Pierwsza z tych metod wykorzystywana jest w testach diagnostycznych chorób związanych z silną amplifikacją sekwencji TNR (MD, zespół fra-x), druga stosowana jest w diagnostyce wszystkich chorób, gdzie dochodzi do ograniczonej amplifikacji sekwencji CAG. Bezpośrednia analiza molekularna niestabilnych rejonów DNA o znaczeniu chorobotwórczym pozwala na jednoznaczną klasyfikację jednostek chorobowych (co jest szczególnie istotne w przypadku HD i ataksji móżdżkowych o dziedziczeniu dominującym), a w praktyce może być wykorzystywana jako rutynowe badanie weryfikujące diagnozę kliniczną. Analiza DNA pozwala również na ustalenie nosicielstwa choroby u osób nie wykazujących objawów, a pochodzących z rodzin ryzyka genetycznego oraz w diagnostyce prenatalnej. Badania tego typu powodująjednak szereg problemów etycznych, szczególnie w przypadku chorób zwyrodnieniowych układu nerwowego o późnym wieku zachorowania. Doprowadziło to już do opracowania międzynarodowych zasad poradnictwa genetycznego dla rodzin dotkniętych HD [IHA, WFN 1994], które również powinny być stosowane w przypadku pozostałych chorób o podobnym przebiegu klinicznym i takim samym podłożu genetycznym. PIŚ:MIENNICTWO l. Bingbam P.M., Scott M.O., Wang S.M., McPhaul M.J., Wilson E.M., Garbem J.Y., Merry D.E., Fischbeck K.H.: Stability of expanded trinucleotide repeat in the androgen receptor gene in transgenie mice. Nature Genetics 1995, 9, Brook J.D., McCurrach M., Harley H.G.: Molecutar basis of myotonic dystrophy: expansion of a trinucleotide (CTG) repeart at the 3' end of a transcript encoding a protein kinase famiły member. Celi 1992, 68, Campuzano V., Montermini L., Molto M.D., Pianese L., Cossee M., Cavalcanti F., Koenig M., Pandolfo: Friedreich's ataxia: autosomai recessive disease caused by an intronic GAA tripiet repeat expansion. Science 1996, 271, Caskey C.T., Pizzuti A., Fu Y-H., Fenwiek R.G., Nelson D.L.: Tripiet repeat mutations in human disease. Science 1992, 256, Charlesworth B., Sniegowski P., Stepban W.: The evolutionary dynamics of repetitive DNA in eukaryotes. Nature 1994, 371, Dover G. : Slippery DNA runs on and on and on... Nature Genetics 1995, 10, Fu Y-H., Kuhl D.P., Pizzuti A., Pieretti M., Sutcliffe J.S., Richards S., Verkerk A.J.M., Warren S.T., Oostra B.A., Caskey C.T.: V ariation of the CGG repeat at the fragile X site results in genetic instability: resolution of the Sherman paradox. Celi 1991, 67, Huntington Disease Collaborative Research Group: A novel gene containing a trinucleotide repeat that is expanded and unstable on Huntington's disease chromosome. Cell 1993, 72, International Huntington Association (IHA) and World Federation of Neurology (WFN): Guidelines for the molecular genetics predictive test in Huntington's disease. Neurology 1994, 44, Kawaguchi Y., Okamoto T., Tamiwaki M.: CAG expansion in anovel gen e for Macbado -J osep h disease at chromosame 14q N ature Genetics 1994, 8, Koide R., Ik:euchi T., Onodera 0., Tanaka H., Igarashi S., Miike T., Naito H., Ikuta F., Tsuji S.: Unstable expansion of CAG repeat in hereditary dentatorubral-pallidoluysian atrophy (DRPLA) Nature Genetics 1994, 6, La Spada A.R., Wilson E.M., Lubahn D.B., Harding A.E., Fischbeck K.H.: Androgen receptor gene mutations in X-linked spinał and bulbar muscular atrophy. Nature 1992, 352, 77-79
12 60 Dorota Hoffman-Zacharska 13. Muller U., Graeber M.B., Haberhausen G., Kohler A.: Molecular basis and diagnosis of neurogenetic disorders. J. Neurol. Sciences 1994, 124, Orr H. T., Chung M., Banfi S., (1993) Expansion of unstable trinucleotide CAG repeat in spinocerebellar ataxia type I. Nature Genetics, 1993, 4, Parrish J., Oostra B.A., Verkerk J.M.H., Richards C.S., Reynolds J., Spikes A.S., Shaffer L.G., Nelson D.L.: Isolation of GCC repeat showing expansion in FRAXF, a fragile site distal to FRAXA and FRAXE. Nature Genetics 1994, 8, Sherman S.L., Jacobs P.A., Morton N.E., Froster-Iskenius U., Howard-Peebles P.N., Nielsen K.B., Watson M.: Furtber segregation analysis of the fragile X syndrome with speclal reference to transmiting males. Hum. Genet. 1985, 69, Teisberg P.: The genetic background o f anticipation. J.Royal Society of Medicine 1995, 88, Trottier Y., Lutz Y., Stevanin G., Imbert G., Devys D., Cancel G., Agid Y., Brice A., Mandel J-L.: Polyglutamine expansion as a pathological epitope in Huntingtin's disease and four dominant cerehehar ataxias. Nature 1995, 378, Warner J.P., Barran L.H., Brock J.H.: A new polymerase chain reaction (PCR) assay for the trinucleotide repeat that is unstable and expanded on Huntington's disease chromosomes. MolecuTiar and Cellular Probes 1993,7, Adres: Dr Dorota Hoffman-Zacharska, Zakład Genetyki IPiN, Al. Sobieskiego 1/9, Warszawa
BADANIA GENETYCZNE W DYSTROFIACH MIOTONICZNYCH
Kurs Neurogenetyki BADANIA GENETYCZNE W DYSTROFIACH MIOTONICZNYCH Anna Sułek Pracownia Molekularnych Podstaw Chorób Neurodegeneracyjnych Zakład Genetyki, IPiN OBRAZ KLINICZNY DYSTROFII MIOTONICZNEJ WIELE
Choroba Buntingtona jako przykład choroby neurodegeneracyjnej ze szczególnym uwzględnieniem aspektów genetycznych
Postępy Psychiatrii i Neurologii, 2002, II, I49-I53 Praca poglądowa Review paper Choroba Buntingtona jako przykład choroby neurodegeneracyjnej ze szczególnym uwzględnieniem aspektów genetycznych Huntington
INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA
XX Międzynarodowa konferencja Polskie Stowarzyszenie Choroby Huntingtona Warszawa, 17-18- 19 kwietnia 2015 r. Metody badań i leczenie choroby Huntingtona - aktualności INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH
MUTACJE DYNAMICZNE. h a r d s 1995).
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Tom 46, 1997 Numer 2 (235) Strony 213-220 Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika C e l in a J a n io n Instytut Biochemii i Biofizyki PAN ul Pawińskiego 5A,
Jednostka chorobowa. Czas analizy [dni roboczych] Literatura Gen. Cena [PLN] Badany Gen. Materiał biologiczny. Chorobowa
Jednostka chorobowa Jednostka Oznaczenie Chorobowa testu OMIM TM Badany Gen Literatura Gen OMIM TM Opis/cel badania Zakres analizy Materiał biologiczny Czas analizy [dni roboczych] Cena [PLN] ALZHEIMERA
Dziedziczenie jednogenowe. Rodowody
Dziedziczenie jednogenowe. Rodowody Dr n.biol. Anna Wawrocka Rodowód jest podstawą ustalenia trybu dziedziczenia. Umożliwia określenie ryzyka genetycznego powtórzenia się choroby. Symbole rodowodu Linie
NIEPEŁNOSPRAWNOŚĆ INTELEKTUALNA. Anna Materna-Kiryluk Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu. Niepełnosprawność intelektualna - definicja
NIEPEŁNOSPRAWNOŚĆ INTELEKTUALNA Anna Materna-Kiryluk Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu Niepełnosprawność intelektualna - definicja Istotnie niższe od przeciętnego funkcjonowanie intelektualne
Składniki jądrowego genomu człowieka
Składniki jądrowego genomu człowieka Genom człowieka 3 000 Mpz (3x10 9, 100 cm) Geny i sekwencje związane z genami (900 Mpz, 30% g. jądrowego) DNA pozagenowy (2100 Mpz, 70%) DNA kodujący (90 Mpz ~ ok.
Pacjent z odsiebnym niedowładem
Pacjent z odsiebnym niedowładem Beata Szyluk Klinika Neurologii WUM III Warszawskie Dni Chorób Nerwowo-Mięśniowych, 25-26 maja 2018 Pacjent z odsiebnym niedowładem Wypadanie przedmiotów z rąk Trudności
Sesja 14. Neurogenetyka
ISSN 1734 5251 www.neuroedu.pl OFICJALNE PORTALE INTERNETOWE PTN www.ptneuro.pl Sesja 14. Neurogenetyka Przewodniczą: prof. Jacek Zaremba, prof. Urszula Fiszer Badania molekularne w chorobie Huntingtona
Poszukiwanie zmutowanego genu 1
Postępy Psychiatrii i Neurologii, 1999, 8, 129-140 Praca poglądowa Poszukiwanie zmutowanego genu 1 In search oj a mutated gene JANUSZ G. ZIMOWSKI Z Zakładu Genetyki lpin w Warszawie STRESZCZENIE. Genetyka
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Jeden gen trzy choroby; efekty fenotypowe premutacji/mutacji w genie FMR1
Kurs Neurogenetyka Warszawa IPiN, 30.11-04.12.2015 Jeden gen trzy choroby; efekty fenotypowe premutacji/mutacji w genie FMR1 Wioletta Krysa, Marta Rajkiewicz Zakład Genetyki Instytut Psychiatrii i Neurologii,
Podłoże molekularne NF1 i RASopatii. Możliwości diagnostyczne.
Podłoże molekularne NF1 i RASopatii. Możliwości diagnostyczne. MONIKA G O S Z AKŁAD G ENETYKI MEDYCZ NEJ, I N STYTUT MATKI I DZIECKA SYMPOZJUM A LBA - JULIA WARSZAWA, 2-3.12.2017 Czym jest gen? Definicja:
Tomasz Mazurczak. Ataksja Friedreicha. Klinika Neurologii Dzieci i Młodzieży Instytut Matki i Dziecka Warszawa 2015
Tomasz Mazurczak Ataksja Friedreicha Klinika Neurologii Dzieci i Młodzieży Instytut Matki i Dziecka Warszawa 2015 ( FRDA) Postępujący proces uszkodzenia: Struktur rdzenia kręgowego Móżdżku Mięśnia sercowego
OFERTA BADAŃ GENETYCZNYCH
OFERTA BADAŃ GENETYCZNYCH Obowiązuje od stycznia 2014 NEUROLOGIA Załącznik nr 2 Kod badania Jednostka chorobowa Opis do badań Materiał do badań Cena Czas realizacji NEU-01 Badanie mutacji w eksonach 5-8
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Wstęp do genetyki człowieka Choroby rzadkie nie są takie rzadkie
Wstęp do genetyki człowieka Choroby rzadkie nie są takie rzadkie Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Medycznej Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego 2018 Ludzki genom: 46 chromosomów 22 pary
Niepełnosprawność intelektualna
Niepełnosprawność intelektualna stan badań a możliwości diagnostyki molekularnej Agnieszka Charzewska Zakład Genetyki Medycznej Instytut Matki i Dziecka Niepełnosprawność intelektualna (NI, ID) zaburzenie
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
POTRZEBY DZIECKA Z PROBLEMAMI -DYSTROFIA MIĘŚNIOWA DUCHENNE A NEUROLOGICZNYMI W SZKOLE
POTRZEBY DZIECKA Z PROBLEMAMI NEUROLOGICZNYMI W SZKOLE -DYSTROFIA MIĘŚNIOWA DUCHENNE A Klinika Neurologii Rozwojowej Gdański Uniwersytet Medyczny Ewa Pilarska Dystrofie mięśniowe to grupa przewlekłych
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
WIEDZA. wskazuje lokalizacje przebiegu procesów komórkowych
Załącznik nr 7 do zarządzenia nr 12 Rektora UJ z 15 lutego 2012 r. Opis zakładanych efektów kształcenia na studiach podyplomowych Nazwa studiów: Medycyna Molekularna w Praktyce Klinicznej Typ studiów:
Jednostka chorobowa. 235200 HFE HFE 235200 Wykrycie mutacji w genie HFE odpowiedzialnych za heterochromatozę. Analiza mutacji w kodonach: C282Y, H63D.
Jednostka chorobowa Jednostka Oznaczenie Chorobowa testu OMIM TM Badany Gen Literatura Gen OMIM TM Opis/cel badania Zakres analizy Materiał biologiczny Czas analizy [dni roboczych] Cena [PLN] HEMOCHROMATOZA
mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii
Zawartość 139371 1. Wstęp zarys historii genetyki, czyli od genetyki klasycznej do genomiki 2. Chromosomy i podziały jądra komórkowego 2.1. Budowa chromosomu 2.2. Barwienie prążkowe chromosomów 2.3. Mitoza
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Analiza DNA w diagnostyce dystrofii mięśniowej Duchenne'a-Beckera
Postępy Psychiatrii i Neurologii, 1997, 6, 43-48 Analiza DNA w diagnostyce dystrofii mięśniowej Duchenne'a-Beckera DNA analysis in diagnostics ofthe Duchenne-Becker muscular dystrophy JANUSZ ZIMOWSKI Z
Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA)
Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA) RAPORT GENETYCZNY Wyniki testu dla Pacjent Testowy Pacjent Pacjent Testowy ID pacjenta 0999900004112 Imię i nazwisko pacjenta Pacjent Testowy
GIMNAZJUM SPRAWDZIANY SUKCES W NAUCE
GIMNAZJUM SPRAWDZIANY BIOLOGIA klasa III SUKCES W NAUCE II GENETYKA CZŁOWIEKA Zadanie 1. Cechy organizmu są warunkowane przez allele dominujące i recesywne. Uzupełnij tabelę, wykorzystując poniższe określenia,
1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia
Rachunek Prawdopodobieństwa MAP8 Wydział Matematyki, Matematyka Stosowana Projekt - zastosowania rachunku prawdopodobieństwa w genetyce Opracowanie: Antonina Urbaniak Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki
MUTACJE GENETYCZNE. Wykonane przez Malwinę Krasnodębską kl III A
MUTACJE GENETYCZNE Wykonane przez Malwinę Krasnodębską kl III A Mutacje - rodzaje - opis Mutacje genowe powstają na skutek wymiany wypadnięcia lub dodatnia jednego albo kilku nukleotydów. Zmiany w liczbie
Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe
Podstawy genetyki człowieka Cechy wieloczynnikowe Dziedziczenie Mendlowskie - jeden gen = jedna cecha np. allele jednego genu decydują o barwie kwiatów groszku Bardziej złożone - interakcje kilku genów
Temat 6: Genetyczne uwarunkowania płci. Cechy sprzężone z płcią.
Temat 6: Genetyczne uwarunkowania płci. Cechy sprzężone z płcią. 1. Kariotyp człowieka. 2. Determinacja płci u człowieka. 3. Warunkowanie płci u innych organizmów. 4. Cechy związane z płcią. 5. Cechy sprzężone
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Ćwiczenie 12. Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania. Prof. dr hab. Roman Zieliński
Ćwiczenie 12 Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania Prof. dr hab. Roman Zieliński 1. Diagnostyka molekularna 1.1. Pytania i zagadnienia 1.1.1. Jak definiujemy
Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I dla kierunku Lekarskiego, rok I 2015/2016. Ćwiczenie nr 1 (06-07.10.
Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I dla kierunku Lekarskiego, rok I 2015/2016 Ćwiczenie nr 1 (06-07.10.2015) Temat: Wprowadzenie 1. Omówienie regulaminu zajęć Temat: Wprowadzenie
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
Genetyka kliniczna - opis przedmiotu
Genetyka kliniczna - opis przedmiotu Informacje ogólne Nazwa przedmiotu Genetyka kliniczna Kod przedmiotu 12.9-WL-Lek-GK Wydział Wydział Lekarski i Nauk o Zdrowiu Kierunek Lekarski Profil praktyczny Rodzaj
Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD.
Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD. Słownik agregaty grudki białka tworzące się wewnątrz komórek, występują w chorobie
II WYDZIAŁ LEKARSKI, II ROK
II WYDZIAŁ LEKARSKI, II ROK PRZEDMIOT: BIOLOGIA MEDYCZNA (CZĘŚĆ 1 GENETYKA) PROGRAM ĆWICZEŃ 2009/2010 L.p. Data zajęć Temat zajęć 1. 15.02 18.02 Podstawy genetyki klasycznej (podstawowe pojęcia i definicje
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) 3. Podstawy genetyki I nformacje ogólne Kod F3/A modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu Podstawy
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Krakowska Akademia im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego. Karta przedmiotu. obowiązuje studentów, którzy rozpoczęli studia w roku akademickim 2014/2015
Krakowska Akademia im. Andrzeja Frycza Modrzewskiego Karta przedmiotu Wydział Zdrowia i Nauk Medycznych obowiązuje studentów, którzy rozpoczęli studia w roku akademickim 014/015 Kierunek studiów: Dietetyka
Choroby genetyczne na tle zmian w genomie człowieka rodzaje, fenotyp, diagnostyka genetyczna
Przedmiot: Genetyka kliniczna V Rok, Wydział Lekarski I Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu Choroby genetyczne na tle zmian w genomie człowieka rodzaje, fenotyp, diagnostyka genetyczna Opracowanie:
Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy
Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy Praca wykonana pod kierunkiem dr hab. Tomasza Grzybowskiego w Katedrze Medycyny Sądowej w Zakładzie Genetyki Molekularnej
Wysokie CK. Anna Kostera-Pruszczyk Klinika Neurologii Warszawski Uniwersytet Medyczny
Wysokie CK Anna Kostera-Pruszczyk Klinika Neurologii Warszawski Uniwersytet Medyczny Podwyższona CK czyli jaka Podwyższona CK czyli jaka AST, ALT CK w/n CK podwyższone Choroba wątroby Choroba mięśni (?)
Tematyka zajęć z biologii
Tematyka zajęć z biologii klasy: I Lp. Temat zajęć Zakres treści 1 Zapoznanie z przedmiotowym systemem oceniania, wymaganiami edukacyjnymi i podstawą programową Podstawowe zagadnienia materiału nauczania
Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych
Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych Dr n. med. Joanna Walczak- Sztulpa Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Diagnostyka
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Diagnostyka neurofibromatozy typu I,
Diagnostyka neurofibromatozy typu I, czyli jak to się robi w XXI wieku dr n. biol. Robert Szymańczak Laboratorium NZOZ GENOMED GENOMED S.A. Neurofibromatoza typu I (choroba von Recklinghausena) częstość
Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17
Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD zakres rozszerzony LO 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17 Biologia na czasie 2 zakres rozszerzony nr dopuszczenia 564/2/2012 Biologia na czasie 3 zakres rozszerzony
BADANIA GENETYCZNE W HODOWLI KOTÓW: CHOROBA SPICHRZENIOWA GLIKOGENU TYPU IV (GLYCOGEN STORAGE DISEASE TYPE IV - GSD IV)
BADANIA GENETYCZNE W HODOWLI KOTÓW: OBOWIĄZKOWE CHOROBA SPICHRZENIOWA GLIKOGENU TYPU IV (NFO) GANGLIOZYDOZA (KOR, BUR) ZALECANE RDZENIOWY ZANIK MIĘŚNI (MCO) NIEDOBÓR KINAZY PIROGRONIANOWEJ (ABY, SOM) POSTĘPUJĄCY
2. Rozdział materiału genetycznego w czasie podziałów komórkowych - mitozy i mejozy
Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I (GENETYKA) dla kierunku Lekarskiego, rok I 2017/2018 Ćwiczenie nr 1 (09-10.10.2017) Temat: Wprowadzenie 1. Omówienie regulaminu zajęć
Imię i nazwisko...kl...
Gimnazjum nr 4 im. Ojca Świętego Jana Pawła II we Wrocławiu SPRAWDZIAN GENETYKA GR. A Imię i nazwisko...kl.... 1. Nauka o regułach i mechanizmach dziedziczenia to: (0-1pkt) a) cytologia b) biochemia c)
Mitochondrialna Ewa;
Mitochondrialna Ewa; jej sprzymierzeńcy i wrogowie Lien Dybczyńska Zakład genetyki, Uniwersytet Warszawski 01.05.2004 Milion lat temu Ale co dalej??? I wtedy wkracza biologia molekularna Analiza różnic
Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń narządu ruchu
Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń Ilość godzin: 40h seminaria Ilość grup: 2 Forma zaliczenia: zaliczenie z oceną Kierunek: Fizjoterapia ścieżka neurologiczna Rok: II - Lic Tryb: stacjonarne
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Biologia medyczna. Nie dotyczy
Załącznik Nr 3 do Uchwały enatu PUM 14/2012 YLABU MODUŁU (PRZEDMIOTU) Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów pecjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu I nformacje
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT
ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT Ćwiczenia 1 mgr Magda Kaczmarek-Okrój magda_kaczmarek_okroj@sggw.pl 1 ZAGADNIENIA struktura genetyczna populacji obliczanie frekwencji genotypów obliczanie frekwencji alleli
Konkurs szkolny Mistrz genetyki etap II
onkurs szkolny istrz genetyki etap II 1.W D pewnego pierwotniaka tymina stanowi 28 % wszystkich zasad azotowych. blicz i zapisz, jaka jest zawartość procentowa każdej z pozostałych zasad w D tego pierwotniaka.
Człowiek mendlowski? Genetyka człowieka w XX i XXI w.
Człowiek mendlowski? Genetyka człowieka w XX i XXI w. Informacje Kontakt: Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii, Pawińskiego 5A pgolik@igib.uw.edu.pl Informacje, materiały: http://www.igib.uw.edu.pl/
powtarzane co rok w sezonie jesiennym. W przypadku przewlekłej niewydolności
Postępowanie w dystrofiach mięśniowych u młodych dorosłych Anna Kostera-Pruszczyk Klinika Neurologii AM w Warszawie Wiele chorób prowadzących do niepełnosprawności rozpoczyna się w pierwszych latach Ŝycia.
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR DIAGNOSTICS OF MONOGENIC DISORDERS
Nowiny Lekarskie 2006, 75, 5, 486 490 ALINA LICZBAŃSKA, ANNA WOŹNIAK, ANNA WAWROCKA, MACIEJ R. KRAWCZYŃSKI TECHNIKI WYKORZYSTYWANE W DIAGNOSTYCE MOLEKULARNEJ CHORÓB JEDNOGENOWYCH TECHNIQUES USED IN MOLECULAR
Zadania maturalne z biologii - 2
Koło Biologiczne Liceum Ogólnokształcące nr II w Gliwicach 2015-2016 Zadania maturalne z biologii - 2 Zadania: Zad. 1(M. Borowiecki, J. Błaszczak 3BL) Na podstawie podanych schematów określ sposób w jaki
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
Jakie są przyczyny uszkodzenia słuchu?
Jakie są przyczyny uszkodzenia słuchu? Pruszewicz według kryterium etiologicznego podzielił zaburzenia słuchu u dzieci na trzy grupy: 1. głuchota dziedziczna i wady rozwojowe, 2. głuchota wrodzona, 3.
Częstotliwość występowania tej choroby to 1: żywych urodzeń w Polsce ok. 5-6 przypadków rocznie.
GALAKTOZEMIA Częstotliwość występowania tej choroby to 1:60 000 żywych urodzeń w Polsce ok. 5-6 przypadków rocznie. galaktoza - cukier prosty (razem z glukozą i fruktozą wchłaniany w przewodzie pokarmowym),
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
l.p CBM CBM s. Rydygiera SPSK
Molekularne podstawy chorób narządu ruchu Kierunek: Fizjoterapia Rok:II - licencjat Tryb: stacjonarny opiekun kierunku: mgr Piotr Białas (pbialas@ump.edu.pl) Ilość seminariów: 40 godzin Forma zaliczenia:
Podstawy genetyki człowieka
Podstawy genetyki człowieka Dziedziczenie Mendlowskie - jeden gen = jedna cecha np. allele jednego genu decydują o barwie kwiatów groszku Bardziej złożone - interakcje kilku genów Wieloczynnikowe - interakcje
144010 HCR-APOB Analiza. Wykrycie charakterystycznych mutacji genu APOB warunkujących występowanie hipercholesterolemii rodzinnej.
Badany Gen Literatura OMIM TM Gen Jednostka chorobowa Literatura OMIM TM Jednostka chorobowa Oznaczenie testu Opis/cel badania Zakres analizy Czas analizy Materiał [dni biologiczny roboczy ch] APOB 7730
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Stacjonarne (s)
Załącznik Nr 3 do Uchwały Senatu PUM 14/2012 S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Mapowanie genów cz owieka. podstawy
Mapowanie genów czowieka podstawy Sprzężenie Geny leżące na różnych chromosomach spełniają II prawo Mendla Dla 2 genów: 4 równoliczne klasy gamet W. S Klug, M.R Cummings Concepts of Genetics 8 th edition,
Informacje dla pacjentów i rodzin
12 Zakład etyki Medycznej Instytut "Pomnik-Centrum Zdrowia Dziecka" telefon 022 815 74 50 (sekretariat) 022 815 74 51 (poradnia) Dziedziczenie sprzężone z chromosomem X, Szpital Dziecięcy, Dziekanów Leśny
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
Czy można zmniejszyć ryzyko występowania defektów genetycznych w populacji polskich koni arabskich?
Czy można zmniejszyć ryzyko występowania defektów genetycznych w populacji polskich koni arabskich? Monika Bugno-Poniewierska, Monika Stefaniuk-Szmukier, Agata Piestrzyńska-Kajtoch, Agnieszka Fornal, Katarzyna
Genetyczna "szara strefa" choroby Huntingtona: co to wszystko oznacza? Podstawy Genetyczne
Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD. Genetyczna "szara strefa" choroby Huntingtona: co to wszystko oznacza? Pośrednie allele
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Jaka tam ewolucja. Zanim trafię na jednego myślącego, muszę stoczyć bitwę zdziewięcioma orangutanami Carlos Ruis Zafon Wierzbownica drobnokwiatowa Fitosterole, garbniki, flawonoidy Właściwości przeciwzapalne,
Opieka nad chorymi z Dystrofią Mięśniową Duchenne a
Opieka nad chorymi z Dystrofią Mięśniową Duchenne a Opis potrzeb i koniecznych usprawnień w procesach badawczych i diagnostycznoterapeutycznych. Jolanta Wierzba Ośrodek Chorób Rzadkich UCK Gdańsk Gdański
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym mgr Magdalena Brzeskwiniewicz Promotor: Prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Gdański Uniwersytet Medyczny
u Czynniki ryzyka wystąpienia zakrzepicy? - przykłady cech osobniczych i stanów klinicznych - przykłady interwencji diagnostycznych i leczniczych
1 TROMBOFILIA 2 Trombofilia = nadkrzepliwość u Genetycznie uwarunkowana lub nabyta skłonność do występowania zakrzepicy żylnej, rzadko tętniczej, spowodowana nieprawidłowościami hematologicznymi 3 4 5
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP
Selekcja, dobór hodowlany ESPZiWP Celem pracy hodowlanej jest genetyczne doskonalenie zwierząt w wyznaczonym kierunku. Trudno jest doskonalić zwierzęta już urodzone, ale można doskonalić populację w ten
Zasady obliczania ryzyka genetycznego. Podstawy genetyki populacyjnej.
Zasady obliczania ryzyka genetycznego. Podstawy genetyki populacyjnej. Maciej Krawczyński Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu I. Choroby jednogenowe 1. Mendlowskie sposoby dziedziczenia:
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Budowa rybosomu Translacja
Zakład Genetyki Medycznej OFERTA BADAŃ DIAGNOSTYCZNYCH
Zakład Genetyki Medycznej OFERTA BADAŃ DIAGNOSTYCZNYCH 2006/2007 Szanowni Państwo, Działalność naukowa i diagnostyczna Zakładu Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka koncentruje się na zagadnieniach
Napisz, który z przedstawionych schematycznie rodzajów replikacji (A, B czy C) ilustruje replikację semikonserwatywną. Wyjaśnij, na czym polega ten
Napisz, który z przedstawionych schematycznie rodzajów replikacji (A, B czy C) ilustruje replikację semikonserwatywną. Wyjaśnij, na czym polega ten proces. Na schemacie przedstawiono etapy przekazywania