Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2018 REALIZOWANE W ROKU AKADEMICKIM 2016/2017 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Medyczne bazy Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek) Nazwa jednostki realizującej przedmiot Kierunek studiów Poziom kształcenia Profil Forma studiów Wydział Matematyczno - Przyrodniczy Wydział Matematyczno - Przyrodniczy Informatyka studia II-go stopnia (poinżynierskie) ogólnoakademicki stacjonarne Rok i semestr studiów rok I, semestr 1 Rodzaj przedmiotu Koordynator przedmiot kształcenia specjalnościowego o tematyce obieralnej dr Dariusz Bober Imię i nazwisko osoby prowadzącej / osób dr Dariusz Bober prowadzących * - zgodnie z ustaleniami na wydziale 1.2. Formy zajęć dydaktycznych, wymiar godzin i punktów ECTS Wykł. Ćw. Konw. Lab. Sem. ZP Prakt. Inne ( jakie?) Liczba pkt ECTS 15 15 3 1.3. Sposób realizacji zajęć zajęcia w formie tradycyjnej zajęcia realizowane z wykorzystaniem metod i technik kształcenia na odległość 1.4. Forma zaliczenia przedmiotu/ modułu ( z toku) ( egzamin, zaliczenie z oceną, zaliczenie bez oceny) ZALICZENIE Z OCENĄ 2.WYMAGANIA WSTĘPNE Rozumienie reguł przetwarzania podstawowych oraz złożonych typów, podstawy baz. Inżynieria oprogramowania. 3. CELE, EFEKTY KSZTAŁCENIA, TREŚCI PROGRAMOWE I STOSOWANE METODY DYDAKTYCZNE 3.1. Cele przedmiotu/modułu Nabycie przez studentów wiedzy i wykształcenie umiejętności w projektowaniu i eksploatacji medycznych C1 baz.
3.2 EFEKTY KSZTAŁCENIA DLA PRZEDMIOTU/ MODUŁU ( WYPEŁNIA KOORDYNATOR) EK ( efekt kształcenia) EK_01 EK_02 Treść efektu kształcenia zdefiniowanego dla przedmiotu (modułu) W1: Student ma ogólną wiedzę w zakresie zróżnicowanych repozytoriów medycznych, w tym standardy wymiany medycznych U1: Student potrafi zaprojektować repozytorium medycznych oraz zaimplementować je w wybranym systemie zarzadzania bazami. Ponadto potrafi przeszukiwać dostępną bazę medycznych w oparciu o kontekst oraz przetwarzać dane zeskładowane bazie. Odniesienie do efektów kierunkowych (KEK) K_W02, K_W13, K_W14 K_U02, K_U04, K_U09, K_U13 3.3 TREŚCI PROGRAMOWE (wypełnia koordynator) A. Problematyka wykładu Treści merytoryczne Funkcje i struktura systemów baz. Medyczne rekordy pacjenta (EHR,PHR). Przegląd różnych modeli (hierarchiczny, sieciowy, relacyjny i obiektowy). Przegląd baz tematycznych dostępnych on-line (w Internecie). Typy baz : tekstowe, bazy literaturowe, czasopisma online, bazy strukturalne, bazy chemiczne i biochemiczne, bazy multimedialne. Telemedycyna i strumieniowe przetwarzanie. Heterogeniczne modele i ich reprezentacja w medycznej bazie Wybrane elementy obiektowości w projektowaniu medycznych baz. Przetwarzanie multimedialnych w wybranym systemie bazodanowym (tu, Oracle). Typy przeznaczone do przechowywania o znacznej wielkości (LOB, CLOB, BLOB, BFILE) oraz metody przetwarzania tych. Przechowywanie i udostępnianie medycznych w standardzie DICOM. Indeksowanie obrazów zawartością w medycynie. Przetwarzanie semistrukturalnych w bazie Oracle, na przykładzie dokumentów XML. Przedstawiona zostanie definicja, funkcjonalność oraz typy XML-owych. Sposoby przechowywania i mechanizmy przetwarzania dokumentów XML. B. Problematyka ćwiczeń audytoryjnych, konwersatoryjnych, laboratoryjnych, zajęć praktycznych Treści merytoryczne Wybrane elementy obiektowości w projektowaniu medycznych baz. Konstruktory złożonych struktur, przykład złożonej rzeczywistości. Jawne związki między danymi, hierarchiczne zależności między kolekcjami obiektów oraz mechanizmy polimorfizmu i późnego wiązania. Heterogeniczne kolekcje, dynamiczne wiązanie metod, referencyjny typ. Przetwarzanie multimedialnych w wybranym systemie bazodanowym (tu, Oracle). Typy przeznaczone do przechowywania o znacznej wielkości (LOB, CLOB, BLOB, BFILE) oraz metody przetwarzania tych. Przechowywanie i udostępnianie medycznych w standardzie DICOM. Indeksowanie obrazów zawartością w medycynie. Zagadnienia bezpieczeństwa medycznych.
Projekt medycznej bazy. 3.4 METODY DYDAKTYCZNE Wykład: wykład problemowy, wykład z prezentacją multimedialną, metody kształcenia na odległość. Laboratorium: wykonywanie doświadczeń, projektowanie doświadczeń, praca w grupach, rozwiązywanie zadań, dyskusja, metody kształcenia na odległość 4 METODY I KRYTERIA OCENY 4.1 Sposoby weryfikacji efektów kształcenia Symbol efektu EK_ 01 EK_ 02 Metody oceny efektów kształcenia ( np.: kolokwium, egzamin ustny, egzamin pisemny, projekt, sprawozdanie, obserwacja w trakcie zajęć) Obserwacja w trakcie zajęć, terminowość i poprawności realizacji projektu Zadania problemowe do wykonania samodzielnie za zajęciach laboratoryjnych. Oceniane sprawozdania z realizacji tych zadań. Terminowość i poprawność wykonywania zadań. Projekt na ocenę. Forma zajęć dydaktycznych ( w, ćw, ) W LAB 4.2 Warunki zaliczenia przedmiotu (kryteria oceniania) Kryterium oceny Efekt kształcenia Ocena W1: EK_01: Student ma ogólną wiedzę w zakresie zróżnicowanych repozytoriów medycznych, w tym standardy wymiany medycznych U1: EK_02: Student potrafi zaprojektować repozytorium medycznych oraz zaimplementować je w wybranym systemie zarzadzania dst db bdb dst db Student zna i lokalizuje w sieci Internet wybrane repozytoria medycznych.. - zna obsługę narzędzi do eksplorować dane z formatu DICOM Student spełnia kryterium oceny dostateczny a ponadto: - zna historyczne architektury repozytoriów medycznych - zna współczesne narzędzia modelowania złożonych struktur, - zna metody obsługi standardu DICOM z poziomu poleceń ODL bazy Student spełnia kryterium oceny dobry a ponadto: - zna definicję typów i ich właściwości w zakresie przechowywania medycznych, - zna i potrafi opisać więcej niż jeden standard wymiany medycznych (np.: DICOM, EDIFACT, HL7) Student rozumie podstawowe pojęcia z obiektowości, Rozróżnia cechy heterogenicznych medycznych oraz potrafi zdefiniować model dla wybranej danej medycznej, Przedłożone zadania na laboratoriach zrealizuje w ciągu semestru. Student spełnia kryterium oceny dostateczny a ponadto: - potrafi posługiwać się językiem ODL w zakresie implementacji modelu obiektowego w medycznej bazie, - potrafi składować dane DICOM pobrane z zewnętrznego repozytorium do obiektów wewnętrznych bazy, Zadania z laboratorium zrealizuje w terminie nieprzekraczającym zajęć dydaktycznych.
bazami. Ponadto potrafi przeszukiwać dostępną bazę medycznych w oparciu o kontekst oraz przetwarzać dane zeskładowane bazie. bdb Kryteria uzyskania oceny końcowej: Student spełnia kryterium oceny dobry a ponadto: - potrafi wyszukać wybraną daną medyczną, w oparciu o kontekst (zadaną wartość cechy DICOM) - potrafi wyeksportować odnalezioną dana do zewnętrznego pliku - potrafi w zaprojektowanym przez siebie repozytorium zeskładować dane pochodzące z systemów (plików) zewnętrznych). - tworzy model dla zadanego projektu medycznego, - zadania z laboratorium zrealizuje w sposób autorski, gdzie porównanie rozwiązań jest wykonywane z zadaniami osób poprzedzających dane sprawozdanie studenta. Zaliczenie laboratoriów następuje na podstawie zaliczenia wszystkich efektów spośród W1, U1 w dwóch kolokwiach oraz punktów uzyskanych za ponadprzeciętną aktywność w trakcie realizacji zadań laboratoryjnych (lub przy braku zaliczenia w terminie w jednym kolokwium zaliczeniowym) Zaliczenie wykładu na podstawie kolokwium i frekwencji. Zaliczenie przedmiotu następuje na podstawie średniej ocen: uzyskanych na laboratoriach oraz kolokwium zaliczeniowego obejmującego materiał przedmiotu z wykładu Student otrzymuje ocenę niedostateczny gdy nie zaliczył laboratoriów lub kolokwium zaliczeniowe wykaże, iż co najmniej jeden z efektów W1, U1 nie został osiągnięty; Student otrzymuje ocenę dostateczny gdy posiada zaliczenie z laboratoriów, a przeciętnie każdy z efektów weryfikowanych na kolokwium zaliczeniowym zostanie osiągnięty na poziomie co najmniej 3.0; Student otrzymuje ocenę dobry gdy posiada zaliczenie z laboratoriów oraz przeciętna ocena z zaliczenia każdego efektu spośród weryfikowanych na kolokwium zaliczeniowym wyniesie co najmniej 3.75; Student otrzymuje ocenę bardzo dobry gdy posiada zaliczenie z laboratoriów oraz przeciętna ocena z zaliczenia każdego efektu spośród weryfikowanych na kolokwium zaliczeniowym wyniesie co najmniej 4.75. 5. Całkowity nakład pracy studenta potrzebny do osiągnięcia założonych efektów w godzinach oraz punktach ECTS Aktywność godziny zajęć wg planu z nauczycielem 30 przygotowanie do zajęć 30 udział w konsultacjach 2 Inne (jakie?) przygotowanie projektu 25 SUMA GODZIN 89 SUMARYCZNA LICZBA PUNKTÓW ECTS 3 Liczba godzin/ nakład pracy studenta 6. PRAKTYKI ZAWODOWE W RAMACH PRZEDMIOTU/ MODUŁU wymiar godzinowy - zasady i formy odbywania praktyk -
7. LITERATURA Literatura podstawowa: 1. R. Elmasri, S.B. Navathe, Wprowadzenie do systemów baz, Helion, Gliwice 2005.. 2. B. Gietz "Oracle 9i Application Developers Guide - Object-Relational Features", Oracle Corporation, 2001. 3. J. L. Harrington Obiektowe bazy, Wydawnictwo Informatyczne MIKOM, luty 2001 4. Georg Lausen, Gottfried Vossen - "Obiektowe bazy : modele i języki." - Warszawa. WNT, 2000, BUR 5. Tadeusiewicz R.: Informatyka Medyczna. Wydawnictwo UMCS, Lublin 2011, http://informatyka.umcs.lublin.pl/files/tadeusiewicz.pdf Literatura uzupełniająca: 1. Siczek M: Tomografia Komputerowa i Rezonans Magnetyczny dla studentów kierunku Informatyka. Wydawnictwo UMCS Lublin 2011, http://informatyka.umcs.lublin.pl/files/siczek.pdf 2. Oracle Database Concepts (rozdział Object Datatypes and Object Views): http://downloaduk.oracle.com/docs/cd/b19306_01/server.102/b14220/objects.htm#i440066 Akceptacja Kierownika Jednostki lub osoby upoważnionej