Streszczenie. Summary. Joanna Zawacka-Pankau**, Katarzyna Maleńczyk**, Alicja Sznarkowska
|
|
- Marian Stasiak
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; 64: e-issn Review Received: Accepted: Published: Struktura i regulacja białka p73 w komórce implikacja w terapii przeciwnowotworowej* The structure and cellular regulation of p73: Their implication in anticancer therapy Joanna Zawacka-Pankau**, Katarzyna Maleńczyk**, Alicja Sznarkowska Katedra Biotechnologii, Pracownia Diagnostyki Molekularnej, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii, Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego Streszczenie Białko p73 z białkiem p63 należy do rodziny białek p53. Jest stosunkowo mało poznanym, strukturalnym i funkcjonalnym homologiem dokładnie opisanego supresoru nowotworu - p53, powszechnie uznawanego za strażnika genomu. Białko p73, podobnie jak i p53, ulega aktywacji na skutek uszkodzeń DNA indukowanych m.in. przez chemioterapeutyki i wiąże się do grupy tych samych sekwencji promotorowych, co białko p53. Oba białka biorą udział w szlakach transdukcji sygnału, prowadzących do aktywacji apoptozy bądź zatrzymania cyklu komórkowego. Nad terapiami przeciwnowotworowymi ukierunkowanymi na aktywację białka p53 pracuje się intensywnie od prawie 10 lat. Okazuje się jednak, że podobna strategia może być wykorzystana względem białka p73. W przeciwieństwie do genu TP53, gen białka p73 jest bardzo rzadko zmutowany w nowotworach, choć samo białko jest często nieaktywne. Może to być wykorzystane do poszukiwania molekuł, które selektywnie aktywowałyby białko p73 w komórkach nowotworowych, a w konsekwencji indukowały ich śmierć. Celem pracy jest szczegółowy opis struktury, funkcji i regulacji komórkowej białka p73 oraz ukazanie potencjału terapeutycznego, a także możliwości stworzenia terapii celowanej w ten niedoceniony dotąd homolog białka p53. Słowa kluczowe: białko supresoru nowotworu p73 apoptoza terapia przeciwnowotworowa związki niskocząsteczkowe Summary p73 protein belongs, together with p63, to the p53 family. It is a relatively poorly studied structural and functional homolog of the well-described tumor suppressor protein p53, also known as the guardian of the genome. p73 protein, like p53, becomes activated by, for example, DNA damaging agents and it targets the same promoter sequences as p53. Both proteins participate in pathways of signal transduction whose activation leads to apoptosis induction or cell-cycle arrest. Studies concerning anticancer treatment focusing on the activation of p53 have been carried out extensively for about 10 years. It appears that a similar therapeutic strategy can be successfully applied in p73 activation as well. Unlike the TP53 gene, the gene encoding p73 protein is rarely mutated in tumors although the protein is found to be inactive. This can become very useful when designing molecules which will selectively activate p73 and consequently induce * Praca finansowana z grantu na badania własne Uniwersytetu Gdańskiego BW B (J. Z-P) oraz z grantu na badania własne Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego nr rej. N N (J. Z-P). ** Podani autorzy mieli równy udział w powstałej pracy przeglądowej. 78
2 Zawacka-Pankau J. i wsp. Struktura i regulacja białka p73 w komórce cancer-cell death. The aim of the present study was to describe in detail the structure, function, as well as cellular regulation of p73 in light of its therapeutic potential. Key words: tumor suppressor protein p73 apoptosis anticancer therapy low-molecular-weight molecules Full-text PDF: Word count: 4597 Tables: Figures: 3 References: 58 Adres autorki: Wykaz skrótów: dr Joanna Zawacka-Pankau, Katedra Biotechnologii, Pracownia Diagnostyki Molekularnej, Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii Uniwersytetu Gdańskiego i Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, ul. Kładki 24, Gdańsk; jzawacka@biotech.ug.gda.pl DBD domena wiążąca DNA; mtp53 zmutowane białko p53; p53re sekwencje promotorowe rozpoznawane przez białko p53 (p53 responsive elements); PKCd białkowa kinaza Cd (protein kinase Cd); PRR rejon bogaty w reszty proliny (proline rich region); SAM spiralny motyw alfa (sterile alpha motif); TA domena transaktywacyjna (transactivation domain); wtp53 typ dziki białka p53 (wild-type p53); YAP białko powiązane z białkiem Yes (Yes-associated protein). Wprowadzenie Białko p73 zostało odkryte w 1997 r., kiedy to Kaghad i wsp. [21] podczas poszukiwania nowych interleukin przypadkowo trafili na sekwencję kodującą białko podobne do białka p53. Sekwencja ta umiejscowiona w genomie ludzkim na krótkim ramieniu chromosomu 1 (1p36.2-3), często ulegająca delecji w przypadkach nerwiaka płodowego i innych nowotworów, nazwana genem TP73 (tumor suppressor protein 73). Ze względu na homologię strukturalną z białkiem p53, a także newralgiczne położenie samego genu, białku p73 początkowo przypisywano rolę klasycznego białka supresora nowotworu działającego wg schematu Knudsona. Oznaczałoby to, iż do utraty właściwości supresorowych, konieczna jest mutacja lub delecja obu alleli. Liczne badania wykazały jednak, iż w przeciwieństwie do genu TP53, zmutowanego w ponad 50% przypadków wszystkich nowotworów ludzkich, gen TP73 leży w rejonie stosunkowo rzadko ulegającym mutacjom. Zaobserwowano je zaledwie w 0,5% przypadków nowotworów u ludzi [42]. Ponadto wstępne analizy genetyczne u myszy pozbawionych genu TP73 nie wykazały spontanicznego rozwoju nowotworów, jak to się dzieje w przypadku myszy typu TP53 /. Obserwowano natomiast u tych zwierząt ciężkie wady rozwojowe, takie jak wodogłowie, dysgenezje struktur hipokampa oraz zaburzenia związane z rozpoznawaniem feromonów. Wyniki te sugerowały zatem, że białko p73 in vivo może brać udział raczej w regulacji procesów rozwojowych (zwłaszcza rozwoju układu nerwowego), niż supresji nowotworów [55]. Inne doniesienia literaturowe wskazały, iż onkoproteiny wirusowe, takie jak antygen T wirusa SV40, adenowirusowe E1B 55K lub E6 wirusa HPV nie wiążą się do białka p73, mimo iż przyłączają się do białka p53, a miejsca odpowiedzialne za te interakcje należą do najbardziej konserwowanych regionów między tymi białkami. Wydaje się więc, że p73 raczej promuje niż hamuje rozwój onkogennych wirusów, a w fizjologicznym stężeniu odpowiada za proliferację komórek [31]. Jak niedawno dowiedziono, białko p73 oddziałując z protoonkogennym c-jun zwiększa aktywność czynnika transkrypcyjnego AP-1 (activator protein 1) i wpływa tym samym na przeżycie i wzrost komórek [52]. Podczas analizy poziomu ekspresji genu TP73 wykazano, iż w większości zdrowych tkanek poziom zarówno transkryptów, jak i samego białka jest bardzo niski. Natomiast w przypadku tkanek nowotworowych, takich jak rak płuca, prostaty, pęcherza moczowego, piersi, jajnika czy przełyku, poziom p73 był znacznie podwyższony. Wysoki poziom tego białka u pacjentów z nowotworami wiązał sie także ze złym rokowaniem klinicznym. Mogłoby to sugerować onkogenny charakter białka p73 [47,49]. Jednocześnie wykazano, że p73 ze względu na strukturalne podobieństwo do białka p53, może się przyłączać do sekwencji DNA wiążących białko p53 (p53re p53 responsive elements), aktywując transkrypcję genów, których produkty odpowiadają za zahamowanie cyklu komórkowego na etapie G1/S oraz za indukcję procesu apoptozy [42,46]. Białko p73 w wyniku ogromnej strukturalnej homologii do p53 wykazuje wiele podobnych aktywności komórkowych. Jednocześnie jest jednak strukturalnie bardziej skomplikowane, a duża liczba izoform, w których może występować sprawia, że zakres jego biologicznych funkcji wydaje się szerszy. Sieć oddziaływań, w którą białko p73 jest zaangażowane, a także ich regulacja, to tematy wciąż wymagające wielu badań [41]. Znaczenie terapeutyczne regulacji funkcji białka p73 w komórkach nowotworowych to temat niniejszej pracy przeglądowej. 79
3 Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; tom 64: Budowa białka p73 Białko p73 jest jądrową fosfoproteiną o masie 69,623 kda i długości 636 aminokwasów (dla izoformy TAp73a; transcriptionally active). Może ono ulegać ekspresji z dwóch promotorów P1 i P2. Ekspresja z promotora P1 (znajdującego się powyżej eksonu 1) powoduje powstanie aktywnego transkrypcyjnie białka TAp73. Ekspresja z promotora P2 (w obrębie 3 intronu) daje pozbawioną domeny N-terminalnej skróconą wersję białka Np73. Tak duża liczba izoform, w których może występować białko p73 jest związana także z możliwością alternatywnego składania transkryptów. Może on zachodzić w pre-mrna zarówno na końcu 3 jak i 5. Brak eksonu 2, 3 lub obu, daje postaci białka p73 różniące się na N-końcu, wspólnie określane jako TAp73 (ex2 p73, ex3 p73, ex2/3 p73). Natomiast alternatywne składanie eksonów generuje izoformy a, b, g, d, e, z, h, h 1 i f różniące się na C-końcu [35]. Białko p73 należąc do rodziny białek p53 wykazuje względem niego znaczną strukturalną homologię. Budowa obu tych białek jest typowa dla aktywatorów transkrypcji. W ich skład wchodzi domena N-terminalna, rdzeń oraz domena C-terminalna (ryc. 1). składający się z dwóch homodimerów jest preferowaną, bardziej stabilną postacią strukturalną [12]. Dodatkowo w obrębie domeny oligomeryzacyjnej znajduje się region ( ) odpowiedzialny za jądrowe umiejscowienie białka p73 (NLS nuclear localisation signal) [38]. Domena oligomeryzacyjna pokrywa się częściowo z drugą domeną aktywującą transkrypcję (aminokwasy ). W jej skład wchodzi druga a-helisa obecna w domenie OD. C-terminalna domena transkrypcyjna reguluje ekspresję genów zaangażowanych w przebieg cyklu komórkowego, a jej aktywność zmienia się zależnie od etapu cyklu i fosforylacji Ser-388 przez białko PKC (protein kinase C) [39]. Ponieważ C-koniec białka p73 jest znacznie wydłużony, zawiera także domeny niewystępujące w białku p53. W obrębie aminokwasów znajduje się dodatkowy, nieobecny w p53 region bogaty w reszty proliny [38]. Kolejną domeną znajdującą się na C-końcu (aminokwasy ) obecną w izoformach p73a jest część alfa z motywem SAM (sterile alpha motif). SAM jest globularną domeną składającą się z czterech a-helis oraz małej helisy 3 10, występującą w wielu białkach zaangażowanych w rozwój organizmu. Jest odpowiedzialna za interakcje z innymi białkami oraz za wiązanie do błon lipidowych [4,13]. W obrębie domeny N-terminalnej (aminokwasy 1-54), tak jak w przypadku białek p53 i p63, znajduje się domena transaktywacyjna (TA transactivation). Aminokwasy wchodzą w skład regionu bogatego w reszty proliny (PR proline rich domain). Jest to domena obecna we wszystkich białkach z rodziny p53, o strukturze złożonej z motywów PXXP, gdzie P to prolina, a X jest dowolnym aminokwasem [38]. Rdzeniem (aminokwasy ) jest najbardziej konserwowana w tej rodzinie domena wiążąca się swoiście do DNA (DBD DNA binding domain). W białkach p73 i p53 w domenach wiążących DNA aż 63% wszystkich aminokwasów jest identycznych [33,38]. W obrębie bardzo rozbudowanej w przypadku białka p73 domeny C-terminalnej (aminokwasy ) występuje domena odpowiedzialna za oligomeryzację (OD oligomerization domain). Sekwencje aminokwasowe domen oligomeryzacyjnych białek p53 i p73 charakteryzują się 43% identycznością. Dużo większa homologia (60%) występuje jednak między OD p73 i p63. Ostatnio w strukturze trzeciorzędowej domeny OD obu tych białek (ale nie p53) wykazano obecność dodatkowej a-helisy (w p73 aminokwasy ). Może to tłumaczyć to, iż białko p73 tworzące homotetramery lub heterotetramery może oligomeryzować z bliższym mu strukturalnie białkiem p63. Nie wykazano natomiast takich interakcji z białkiem p53 typu niezmutowanego. Wydaje się nawet, iż heterotetramer p73-p63, DOMENA N-TERMINALNA TA 80 PR RDZEŃ DOMENA C-TERMINALNA NLS TA DBD SAM TID PR OD Domena leżąca na C-końcu w obrębie aminokwasów jest domeną hamującą transkrypcję (TID transcription inhibitory domain). W ostatnich badaniach wykazano, że zarówno SAM jak i TID są niezbędne do hamowania aktywności domeny TA. Inhibicja nie zachodzi jednak w wyniku bezpośredniej interakcji tych domen. Domeny C-terminalne nie zaburzają także zdolności domeny DBD do wiązania DNA. Hamowanie transkrypcji następuje w wyniku uniemożliwienia przez SAM i TID białku p73 oddziaływania z koaktywatorami transkrypcji białkami p300/cbp, niezbędnymi do inicjacji tego procesu [26]. C-końcowa domena TID może ulegać proteolitycznemu cięciu przez proteazę serynową HtrA (high temperature requirement A). Generuje to bliższą strukturalnie białku p53 skróconą postać TAp73 o zwiększonej aktywności. Cięcie takie jest jednak możliwe dopiero, gdy mitochondrialna proteaza HtrA w wyniku proapoptotycznych sygnałów znajdzie się w cytoplazmie [30]. Ryc 1. Schemat struktury pierwszorzędowej białka p73 z uwzględnieniem podziału na domeny na przykładzie TAp73. Białko p73 składa się z domeny N-terminalnej, rdzenia oraz domeny C-terminalnej. W obrębie domeny N-terminalnej znajdują się: domena transaktywacyjna (TA; 1 54 aa), domena bogata w reszty proliny (PR; aa). W skład rdzenia wchodzi domena wiążąca DNA (DBD; aa). Domena C-terminalna składa się z domeny bogatej w reszty prolin (PR; aa), oligomeryzacyjnej (OD; aa), transaktywacyjnej (TA; aa), motywu alfa (SAM; aa) oraz domeny hamującej transkrypcję (TID; aa). W obrębie domeny C-terminalnej znajduje się sygnał kierujący białko p73 do jądra komórkowego (NLS; aa)
4 Zawacka-Pankau J. i wsp. Struktura i regulacja białka p73 w komórce 1.2. Domena N-terminalna białka p73 Domena N-terminalna białka p73 jest kwaśnym, bogatym w kwas asparaginowy i glutaminowy fragmentem o długości 116 aminokwasów. Ze względu na dużą labilność domeny N-terminalnej w roztworach, dotąd nie udało się jej skrystalizować. Jest ważnym regionem zarówno do regulacji funkcji białka p73, jak i jego proapoptotycznej aktywności. Domena N-terminalna jest miejscem licznych modyfikacji potranslacyjnych (fosforylacja Ser-8, 47, 97, 110, Thr-86, Tyr-99; omówione szerzej w dalszej części pracy) oraz regionem oddziaływania z innymi białkami [35]. Jak już wspomniano, w obrębie N-końca można wyróżnić dwie funkcjonalne domeny. Pierwszą z nich jest domena TA (1 54 aa), będąca w 29% homologiczną do domeny transaktywacyjnej białka p53 [33]. Burge i wsp. [8] wykazali, iż można wyodrębnić dwie składające się na nią subdomeny TAD1 (10 31 aa) i TAD2 (46 67 aa) połączone odcinkiem linkerowym. TAD1 w białkach p53 i p73 jest regionem bardziej konserwowanym, podczas gdy między subdomenami TAD2 obu tych białek obserwuje się dużo więcej różnic w sekwencji aminokwasowej. Każda z nich charakteryzuje się także nieco inną reaktywnością. W skład domeny N-terminalnej białka p73 wchodzi region bogaty w prolinę ( aa). Jest on obecny u wszystkich znanych przedstawicieli rodziny białek p53. W przypadku białka p73 w jego obrębie można wyróżnić dwa motywy PXXP (84 88 aa oraz aa). Ich obecność wiąże się z formowaniem w tym rejonie struktur lewoskrętnych poliprolinowych helis typu II (PPII). Tworzą one miejsce wiązania dla domen SH3 obecnych w wielu białkach związanych z transdukcją sygnału [11], stając się miejscem oddziaływania m.in. z kompleksami białkowymi cyklinakinaza zależna od cykliny (CDK cyclin-dependent kinase), c-abl (cellular Abelson leukemia) oraz JNK (c-jun N-terminal kinase) [35]. 2. Rola białka p73 w komórce Jak już wspomniano, p73 podobnie jak białko p53 odgrywa ważną rolę zarówno w regulacji cyklu komórkowego, jak i procesu apoptozy. Ostateczny efekt aktywności białka p73 w komórce zależy od przewagi ilościowej i funkcjonalnej którejś z jego izoform, a współpraca między nimi gwarantuje równowagę między proliferacją, różnicowaniem, a śmiercią komórki. Zaburzenie równowagi między izoformami TAp73 i Np73 wiąże się natomiast m.in. z występowaniem nowotworów tarczycy, płuca, piersi, jajnika czy też okrężnicy [28]. Postacie TAp73, wykazując strukturalne podobieństwo do p53 są głównymi, działającymi jak białka supresoru nowotworu izoformami aktywującymi transkrypcję wybranej grupy genów [24]. Przewaga TAp73 jest związana zwykle z zatrzymaniem cyklu komórkowego w fazie G1. Aktywowana jest także transkrypcja ważnych dla regulacji cyklu komórkowego i apoptozy genów, będących pod kontrolą białka p53, takich jak MDM2, CCNG (cyklina G), CD95/FAS, kodujący receptor śmierci, a także s, PIG3 (p53-inducible gene 3), p53aip1 (p53-regulated apoptosis-inducing protein 1) i IGF-BP3 (insulin-like growth factor binding protein 3). Innymi indukowanymi przez postać TAp73 genami są WAF/CIP, którego produkt białkowy p21 jest inhibitorem kinazy CDK, GADD45 (growth arrest and DNA-damage-inducible) kodujący białko, które pod wpływem stresu komórkowego bierze udział w aktywacji szlaku p38/jnk zaangażowanego w odpowiedź na sygnały zewnętrzne dochodzące do komórki (mitogeny). TAp73, wiążąc się do rejonów p53re indukuje też ekspresję z genów kodujących proapoptotyczne białka z rodziny Bcl-2, takie jak Bax (Bcl-2 associated X protein), PUMA (p53 up-regulated modulator of apoptosis) oraz NOXA [44,53]. Wiązanie białka p73 (ale także p63) do promotorów zawierających sekwencje p53re oraz aktywacja transkrypcji genów znajdujących się pod ich kontrolą wydaje się niezmiernie istotne. Wykazano bowiem, iż w odpowiedzi na uszkodzenia DNA białko p53 nie może samodzielnie indukować apoptozy. W komórkach p63/p73 / białko p53 nie wiązało sie do promotorów genów, takich jak NOXA i PUMA. Co sugeruje, że białka p73 i p63, przynajmniej częściowo, są niezbędne do prawidłowego działania p53 jako białka supresoru nowotworu [36]. Znaleziono także wiele genów, niemających sekwencji p53re, dla których białko TAp73 odgrywa rolę unikalnego aktywatora transkrypcji. Produkty białkowe tych genów pełnią różne funkcje komórkowe. Na przykład białko CaN19 jest wiążącym Ca 2+ potencjalnym białkiem supresoru nowotworu, związanym z cyklem komórkowym i różnicowaniem. a1-antitrypsyna jest białkiem ostrej fazy i silnym inhibitorem proteaz serynowych. Odgrywa ważną rolę w odpowiedzi immunologicznej. Geny JAG1 i JAG2 (jagged) kodują natomiast transbłonowe białka będące ligandami receptorów Notch. Wiadomo, że mutacje w tych genach są związane z wadami rozwojowymi [14]. ANXA8 (anneksyna A8) jest wiążącym fosfolipidy zależnym od wapnia białkiem z rodziny anneksyn, a nadekspresję jej genu stwierdzono w przypadkach ostrej białaczki mielocytarnej [9]. p57kip to zależny od cyklin inhibitor kinazy p57. Jego indukcja przez TAp73b może się wiązać z zatrzymaniem cyklu komórkowego [3]. Regulacja ekspresji wszystkich wymienionych genów jest właśnie regulowana przez białko p73. Wielokrotnie wykazano, iż postać Np73 jest dominującym negatywnym regulatorem białkatap73 (ale także TAp63 i p53) [53]. Mechanizm tej regulacji może być dwojaki. Hamowanie aktywności białek z rodziny p53 mających domenę TA może się odbywać w wyniku oddziaływania ich domen OD z domeną oligomeryzacyjną białka Np73 (zazwyczaj z izoformą a) i tworzenie transkrypcyjnie nieaktywnych heterooligomerów. Jakkolwiek nie potwierdzono zdolności białka p73 do tworzenia heterotetramerów z białkiem 53, hipoteza ta nie została odrzucona. Drugim potencjalnym mechanizmem jest kompetycyjne wiązanie Np73 do p53re i uniemożliwianie efektywnej transkrypcji [47,53]. Istotnym wydaje się to, iż TAp73 a także białko p53 mogą regulować poziom białka Np73 przez bezpośrednią aktywację transkrypcji z promotora P2. Świadczy to o istnieniu mechanizmu negatywnego sprzężenia zwrotnego regulującego aktywność transkrypcyjną białek TAp73 i p53 [37]. Jako negatywny regulator postaci TA, postać Np73 wykazuje antyapoptotyczny, onkogenny charakter. Ma jednak także inne funkcje. Wraz z białkiem Np63, dzięki obecności dodatkowej C-terminalnej 81
5 Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; tom 64: domeny aktywacyjnej, realizuje własny, odmienny program aktywacji transkrypcji. W komórkach pozbawionych białka p53 indukuje ekspresję onkogennych białek EGR- 1 (early growth response protein 1) i c-myc. Ponadto pozbawione domeny N-terminalnej białko p73 odpowiada za hiperfosforylację białka retinoblastomy prb i w efekcie aktywację czynnika transkrypcyjnego E2F, promując tym samym proliferację komórek [7]. Białko Np73 pełni także istotną rolę w rozwoju układu nerwowego. Jest główną postacią występującą w rozwijającym się mózgu u myszy. Podczas tworzenia układu nerwowego przeciwdziała indukowanej przez białko p53 śmierci neuronów. Pełni także rolę w regulującej przeżycie komórek nerwowych ścieżce sygnałowej zależnej od czynnika wzrostu nerwu (NGF nerve growth factor) [35]. Jednak założenie, iż wszystkie izoformy Np73 działają jako dominujące negatywne regulatory TAp73 o właściwościach antyapoptotycznych wydaje się błędne. Marazzo i wsp. [32] uzyskali wyniki podważające powszechnie przyjętą onkogenną funkcją pozbawionej domeny N-terminalnej izoformy p73. Wykazali oni, iż przewaga postaci Np73 nie wpływa na wzrost komórek ani na ich wrażliwość na chemioterapię zarówno w liniach pozbawionych białka p53, jak i zawierających typ dziki tego białka. Co więcej, Liu i wsp. [27] dowiedli, iż ekspresja Np73b na poziomie fizjologicznym prowadzi do supresji wzrostu komórek nowotworowych H1299 i MCF-7, niezależnie od statusu białka p53. Być może wyjaśnieniem tego nieoczekiwanego rezultatu jest obecność w izoformach Np73 domeny aktywującej transkrypcję, która nie występuje w postaciach TAp73. Domenę tę tworzy trzynasty aminokwas eksonu 3 Np73 wraz z rejonem bogatym w reszty prolin kodowanym przez ekson 4. Interesujące jest to, że izoforma Np73a, mimo iż ma tę domenę, nie powoduje supresji wzrostu. Wskazuje to, iż również sekwencje kodujące domeny C-terminalne białka mogą wpływać na końcowy fenotyp generowany przez nadmierną ilość postaci Np73. Wydaje się, że w różnych sytuacjach różne izoformy Np73 mogą zachowywać się odmiennie. Irwin uważa, iż istotny wpływ na odpowiedź komórek na wytwarzanie postaci Np73 ma stadium i poziom nadekspresji tego białka [19]. Być może jeśli postać Np73a ulega ekspresji we wczesnej fazie nowotworzenia w relatywnie niezmienionych jeszcze komórkach, skutkuje to promocją wzrostu. I tak okazuje się, iż egzogenne wytwarzanie białka Np73 powoduje transformację nowotworową pierwotnych fibroblastów in vitro i in vivo, lecz nadmiar tego białka w nowotworowych komórkach linii HCT116 i H1299 nie powoduje ich wzmożonej proliferacji in vitro, ani też bardziej agresywnego fenotypu ksenograftów u myszy. Jak większość komórek nowotworowych, linie HCT116 i H1299 nagromadziły wiele zmian w genomach i możliwe jest, że klony te mogą tolerować ekspresję Np73. Mają one najprawdopodobniej zmienione szlaki regulacji onkogenów i supresorów nowotworów, a także różne poziomy białek regulatorowych biorących udział w procesie apoptozy zależnej od białka p73. Co więcej, możliwe jest, że różne C-terminalne izoformy białka Np73 mają odmienne aktywności w wielu typach nowotworów. Większość badań opisujących białko Np73 jako negatywny czynnik prognostyczny nie rozróżnia które izoformy C-końca ulegają ekspresji w nowotworach pierwotnych. Być może, izoformy a, b, g, itd. wpływają odmiennie na wzrost i różnie regulują odpowiedź na chemioterapię, prawdopodobnie ze względu na różnice w wiązaniu się do białek regulatorowych [19]. 3. Różne poziomy regulacji białka p73 Regulacja białka p73 w komórce zachodzi na kilku poziomach. Przede wszystkim jest ono regulowane na poziomie transkrypcji. Ekspresja genu kodującego TAp73 z promotora P1 jest związana z aktywnością czynnika transkrypcyjnego E2F-1. Zarówno białko p53, jak i TAp73 indukują z kolei ekspresję postaci Np73 z promotora P2. W obrębie pierwszego intronu genu TP73 znajduje się miejsce wiązania dla inhibitora transkrypcji ZEB (zinc finger enhancer binding protein), który hamuje ekspresję TAp73 w komórkach niezróżnicowanych [57]. Dodatkowym mechanizmem regulującym poziom transkrypcji białka p73 jest metylacja jego promotora. Hipermetylacja hamująca ekspresję genu TP73 jest częsta w ostrej białaczce limfoblastycznej i chłoniaku Burrkitta. Nie wykazano jednak jej wpływu na ekspresję białka p73 w innych rodzajach nowotworów czy zdrowych limfoblastach. Wydaje się więc, iż modyfikacja ta jest swoista jedynie dla nowotworów hematologicznych [10]. Duża ilość wykazujących odmienne funkcje izoform białka p73 sugeruje, iż alternatywny splicing jest kolejnym istotnym etapem jego regulacji. W różnych liniach komórkowych izoformy białka p73 występują w różnych proporcjach. Zauważalna jest jednak tendencja, iż w większości z nich przeważają izoformy powstałe w wyniku omijania eksonów. Regulacja alternatywnego składania transkryptów nie jest jednak jeszcze wyjaśniona [50]. Bardzo ważne dla regulacji aktywności białka p73 wydają się również modyfikacje potranslacyjne. Podstawowe dla działania p73 wydaje się oddziaływanie z niereceptorową kinazą tyrozynową c-abl indukowane stresem związanym z promieniowaniem jonizującym lub w odpowiedzi na cisplatynę. Jego zahamowanie wiąże się z obniżeniem poziomu zależnej od białka p73 transkrypcji genów oraz indukcji procesu apoptozy. W wyniku interakcji domeny SH3 (Src homology 3) obecnej w c-abl oraz domeny PR białka p73, następuje fosforylacja Tyr-99, Tyr-121 i Tyr Tworzy się wówczas dodatkowy motyw niezbędny do wiązania domeny SH2 kinazy c-abl, co zapewnia białku p73 większą stabilność [50]. Zwiększona aktywność c-abl i kinazy MAP (mitogen activated kinase) p38 stymuluje wiązanie białka p73 przez białko Pin1. Jest to izomeraza peptydylowo-prolylowa katalizująca izomeryzację cis-trans w Ser/Thr-Pro fosforylowanych peptydach. Wykazano, iż zmiana konformacji, zachodząca w wyniku jej działania, indukuje zależną od białek p300/cbp acetylację białka p73 (Lys-321, 327, 331). Zachodząca w wyniku uszkodzeń DNA acetylacja białek z rodziny białek p53 zwiększa ich stabilność i aktywność transkrypcyjną, co w znacznej mierze wpływa na ich funkcje proapoptotyczne [29]. Na wspomnianą modyfikację białka p73 oprócz Pin1 i p38 mają wpływ także białka z rodziny YAP (Yes-associated protein). Białka te mają globularną domenę WW (nazwa pochodzi od dwóch konserwowanych reszt tryptofanu), biorącą udział w aktywacji transkrypcji. Aktywne, fosforylowane 82
6 Zawacka-Pankau J. i wsp. Struktura i regulacja białka p73 w komórce Pin1 Fosforylacja tyrozyny YAPWiązanie do p73 c-abl Fosforylacja seryyny Np73 Chk1, PKCδCF Fosforylacja treoniny TAp73 JNK1, JNK2, JNK3 Acetylacja mtp53 PUMA, BAX, AIP1 Aktywacja transkrypcji genów p300 E2F1 Aktywacja transkrypcji Chk1, Chk2 Stabilizacja Ryc 2. Regulacja białka p73 w komórce. Aktywność oraz stabilność białka p73 jest regulowana zarówno przez bezpośrednie interakcje białkowe, jak również modyfikacje potranslacyjne. Transkrypcję genu P73 reguluje czynnik transkrypcyjny E2F1, aktywowany przez kinazę Chk1. W odpowiedzi na uszkodzenia DNA dochodzi do aktywacji p73 poprzez fosforylację przez kinazy c-abl, Chk1, PKCδCF, JNK oraz acetylację przez białko p300. Na białko p73 aktywująco wpływają również oddziaływania z białkami YAP-1 i Pin-1. Białko Pin-1 po związaniu do p73 zmienia jego konformację w ten sposób, że ułatwia acetylację przez białko p300. Koaktywator transkrypcji białko YAP-1 aktywuje transkrypcję genu P73, a także genów zależnych od p73. Co więcej, YAP-1 stabilizuje p73, wiążąc się do białka i zapobiegając jego ubikwitynacji. Aktywacja transkrypcji genów p73-zależnych hamowana jest poprzez interakcję p73 ze zmutowaną postacią p53 (mtp53) oraz poprzez aktywność dominującej negatywnej izoformy ΔNp73 przez c-abl (Tyr-357) YAP1 wiąże się domeną WW z motywem PPXY (prolina-prolina-dowolny aminokwas-tyrozyna), znajdującym się w białku TAp73. Działając jako selektywny koaktywator transkrypcji genu kodującego białko p73, wpływa na jego akumulację w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Ponadto ułatwia zależną od białka TAp73 aktywację proapoptotycznych genów przez wiązanie się do ich promotorów. Koaktywacja ta jest jednak możliwa tylko w przypadku wybranych izoform p73a, p73b oraz p63a. Nie wpływa natomiast na izoformę p73g oraz białko p53. Białko YAP1, wiążąc się do motywu PPXY, konkuruje o miejsce wiązania z Itch (ligazą ubikwityny E3) i zapobiegając ubikwitynacji odpowiada za stabilizację p73 [23,48]. Proapoptotyczna i transkrypcyjna aktywność białka TAp73 jest także indukowana przez następującą w wyniku uszkodzeń DNA fosforylację Ser-47 przez kinazę CHK1 (checkpoint kinase 1). CHK1 wraz z CHK2 stabilizują również białko E2F wpływając przez to na wzrost transkrypcji TP73 [16]. Zwiększoną aktywność proapoptotyczną oraz transkrypcyjną białko p73 zyskuje również w wyniku fosforylacji Ser-8, 97, 110, 330, 412, a także Thr-442 i 482 przez JNK1, JNK2 i JNK3 [20]. W wyniku stresu komórkowego kinaza PKCd (protein kinase Cd) ulega proteolitycznemu cięciu przez kaspazę 3 generując fragment katalityczny PKCdCF. Fosforyluje on Ser-289 białka p73, przez co także zwiększa jego aktywność transkrypcyjną [53]. Modyfikacje potranslacyjne aktywujące białko p73 przedstawia rycina 2. Indukowana czynnikami stresowymi fosforylacja białka p73 nie zawsze wiąże się jednak z jego aktywacją. Wykazano, iż w przeciwieństwie do białka p53, p73 w czasie cyklu komórkowego podlega regulacji przez kinazy zależne od cyklin. Kompleksy mitotyczne cyklin A/CDK1/2, B/ CDK1/2 oraz E/CDK2 fosforylują p73 (Thr-86) zmniejszając jego zdolność do wiązania DNA i indukcji transkrypcji w komórkach mitotycznych, co wydaje się szczególnie ważne dla prawidłowego przebiegu mitozy i przekraczania jej punktów kontrolnych [15]. Również kinazy z rodziny Src (sarcoma), HCK (hemopoietic cell kinase), PKA (protein kinase A), Plk1 (polo-like kinase 1) poprzez fosforylację p73 hamują jego aktywność [53]. Kolejnym rodzajem modyfikacji potranslacyjnych wpływających na regulację funkcji p73 jest przyłączenie białka SUMO (small ubiquitine-like modifier) do Lys-627 w obrębie domeny hamującej transkrypcję TID. Modyfikacja ta zarówno w przypadku izoformy p73a, jak i p63a powoduje zahamowanie ich aktywności transkrypcyjnej. Jeszcze nie wiadomo czy dzieje się tak wskutek blokowania wiązania zmodyfikowanych białek do DNA, czy też w wyniku przyłączania inhibitorów transkrypcji do białek już związanych. Ciekawym wydaje się to, iż przyłączenie białka SUMO do p53 może mieć dwojaki wpływ na jego aktywność. Aktywujący lub też hamujący charakter tej modyfikacji zależy prawdopodobnie od liczby przyłączonych do białka cząsteczek. Przypuszcza się, iż modyfikacja SUMO wpływa na zwiększoną degradację białek p73 i p63 [45]. Na degradację białek z rodziny p53 niewątpliwie ma wpływ ubikwitynacja. Proces przyłączania reszt ubikwityny jest zależny od działania trzech kolejnych enzymów aktywującego ubikwitynę (E1), enzymu koniugującego (E2) oraz swoistej względem substratów ligazy ubikwityny (E3). Wykazano, że za ubikwitynację i proteasomalną degradację zarówno izoformy TAp73, jak i Np73 odpowiadają ligazy, takie jak Itch (wiąże się do izoform p63 i p73 mających na C-końcu domenę PR) oraz ligazy zawierające białko FBXO45. W fizjologicznych warunkach modyfikacja przez ubikwitynację jest jednym ze sposobów utrzymywania obu postaci białka p73 na stosunkowo niskim poziomie. W odpowiedzi na stres związany z uszkodzeniem 83
7 Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; tom 64: DNA ligazy ubikwityny podlegają deregulacji odpowiadając za zwiększoną stabilność p73. Ponieważ jednak żadna z wyżej wymienionych ligaz nie wykazuje większej swoistości wobec transkrypcyjnie aktywnych lub też pozbawionych domeny N-terminalnej izoform p73, inny mechanizm musi być odpowiedzialny za przeważającą aktywność postaci TAp73 w warunkach stresu [43]. NEDL2 (NEDD- 4-like ubiquitin protein ligase 2), podobnie jak Itch i ligazy zawierające FBXO45, reguluje aktywność białka p73 poprzez ubikwitynację. Efekt tej modyfikacji jest jednak w tym przypadku odmienny. Ubikwitynacja zachodząca w obrębie C-terminalnej domeny bogatej w prolinę nie kieruje białka p73 do degradacji, a wręcz przeciwnie, zwiększa jego aktywność transkrypcyjną [34]. W przeciwieństwie do białka p53, białka p63 i p73 nie podlegają ubikwitynacji przez ligazę ubikwityny E3 MDM2 (mouse double minute 2). MDM2, a także jego ludzki homolog HDM2 oraz MDMX oddziałują z białkami TAp63 i TAp73 w sposób analogiczny do oddziaływania z p53, wiążąc się do hydrofobowego regionu na N-końcu. Prawdopodobnie jednak wskutek braku sekwencji (w p53 aminokwasy ) odpowiadającej za kierowanie białka p53 przez MDM2 do degradacji, w białkach p73 i p63 oddziaływanie jest zgoła odmienne. Wykazano, iż oddziaływanie z białkiem MDM2 stabilizuje p73. Wydaje się również, że p53 i p73 konkurują o wiązanie do MDM2. Mimo iż białko p53 wykazuje wyższe powinowactwo do MDM2, przy nadekspresji p73 obserwuje się wzrastającą liczbę kompleksów MDM2-p73 i zmniejszającą się liczbę kompleksów MDM2-p53 [40,54,58]. Taki skutek interakcji białka p73 z ligazą ubikwityny, może mieć więc znaczenie dla stabilizacji i ochrony białka p53 przed degradacją [2]. Dane literaturowe donoszą również, że MDM2 zmniejsza aktywność transkrypcyjną TAp73. Jednocześnie jednak w obecności MDM2 obserwuje się zwiększoną zdolność p73 do hamowania wzrostu komórek [53]. Poza MDM2 wykazano, że również inne białka mogą oddziaływać z p73 wpływając w ten sposób na regulację jego aktywności i stabilności komórkowej. Zarówno p73, jak p63 i p53 oddziałują z białkami z rodziny ASPP (ankyrin-rich, Src holomogy 3 domain, proline-rich proteins). Dane literaturowe wskazują, iż interakcja z ASPP1 i ASPP2 stymuluje proapoptotyczne funkcje wspomnianych białek. Wiążąc się do DBD wzmacniają aktywność transkrypcyjną białek z rodziny p53, wpływając na ekspresję genów, takich jak PIG3, BAX i PUMA. Białka ASPP nie wpływają jednak na indukcję transkrypcji genów MDM2 i p21. Oddziaływanie p53 i p73 z trzecim przedstawicielem rodziny ASPP, białkiem inhibitorowym iaspp (inhibitory member of the ASPP family), warunkuje z kolei obniżenie aktywności transkrypcyjnej tych białek. Białko iaspp wiąże się do domeny wiążącej DNA oraz rejonu bogatego w reszty prolin białek p53 i p73, przez co uniemożliwia im wiązanie się do DNA [6]. Kolejne, interesujące w kontekście regulacji funkcji p73 białko to NQO1 (NADH quinine oxidoreductase 1), które reguluje proteasomalną, niezależną od znakowania ubikwityną degradację TAp73a, ale nie TAp73b, które nie wiąże się do NQO1). W odpowiedzi na uszkodzenia DNA białko to chroni przed kierowaniem izoformy TAp73, a także białka p53 do podjednostki 20S proteasomu [1]. Z kolei białko UFD2a (ubiquitin fusion degradation protein 2a), wiążąc się do motywu SAM w białku p73a odpowiada za jego niezależną od ubikwityny degradację. Jednak w przypadku wystąpienia sygnałów proapoptotycznych (np. w odpowiedzi na cisplatynę) poziom białka UFD2a spada, pozwalając na akumulację p73 i wzrost jego aktywności [17]. Sposób regulacji białka p73 w komórce przedstawia rycina Białko p73 potencjalnym celem w terapii przeciwnowotworowej Biorąc pod uwagę, iż w ponad 50% wszystkich przypadków nowotworów u ludzi obserwuje się mutacje w genie bardzo istotnego białka supresora nowotworu p53, alternatywna ścieżka indukcji śmierci komórek zmienionych nowotworowo jest głównym celem terapii przeciwnowotworowej. Białko p73, jak już wielokrotnie wykazano, jest ważnym regulatorem przeżycia i apoptozy komórek. W komórkach nowotworowych gen tego białka stosunkowo rzadko ulega mutacjom, a w przypadku braku aktywnego białka p53, jako strukturalny i funkcjonalny homolog, częściowo przejmuje jego supresorowe funkcje. Wydaje się zatem obiecującym celem w terapii przeciwnowotworowej. Zwiększenie aktywności transkrypcyjnej lub stabilności postaci TAp73 w komórkach nowotworowych uruchamia łańcuch zdarzeń prowadzących do apoptozy (także niezależnej od poziomu i funkcji białka p53). Z tego też powodu, szczególnie ważne stają się badania koncentrujące się na poszukiwaniu i badaniu potencjalnych cząsteczek oddziałujących z białkiem p73 lub jego białkami regulatorowymi. Większość skupia się na identyfikacji niskocząsteczkowych związków, które oddziałując bądź z białkiem p73, bądź z jego inhibitorami, odwracają skutki hamowania, prowadzą do akumulacji białka p73 w komórce i aktywacji transkrypcji zależnych od niego genów [28,53]. W 2004 roku Vassilev i wsp. [51] zidentyfikowali grupę związków o nazwie nutliny i wykazali, iż działają one jako inhibitory interakcji MDM2-p53. Dzięki obecności grupy bromofenylowej mimikującej trzy reszty aminokwasowe p53, nutliny wiążą się do hydrofobowej kieszeni białka MDM2, uwalniając tym samym białko p53 od jego inhibicji. W 2003 roku Lau i wsp. [23] wykazali, iż nutlina3a blokuje również interakcję miedzy białkiem p73 a ludzkim białkiem MDM2 (human double minute 2, HDM2) w komórkach ludzkiej linii nowotworu jelita grubego pozbawionych białka p53 HCT116 p53 /, a także w linii neuroblastoma (SKNBE2). Powoduje to akumulację postaci TAp73 w komórce i jego wzmożoną aktywność transkrypcyjną, co wykazano analizując ekspresję proapoptotycznych genów NOXA i PUMA, a także CDKN1A kodującego białko p21. Nutlina 3a aktywuje i stabilizuje białka p73. Ponadto nutlina 3 wzmacnia cytotoksyczność doksorubicyny, inhibitora topoizomerazy II i induktora uszkodzeń DNA. W komórkach neuroblastoma LA155N p53 / opornych na doksorubicynę pod wpływem działania nutliny 3 obserwowano wzrost aktywności TAp73 i aktywację czynnika transkrypcyjnego E2F-1, zależną od uszkodzeń DNA. Jak wspomniano wcześniej, inhibitorowe białko z rodziny ASPP iaspp, wiążąc się do p53 i p73 powoduje hamowanie transkrypcji zależnych od nich genów. W 2007 roku Bell i wsp. [5] donieśli o syntezie, w oparciu o sekwencję białka p53 typu niezmutowanego krótkiego, złożonego z 37 84
8 Zawacka-Pankau J. i wsp. Struktura i regulacja białka p73 w komórce inhibitor p73 Nutlin RETRA 37AA inne? p73 inhibitor Ryc 3. Strategie aktywacji białka p73 ujawniają jego ukryty potencjał terapeutyczny. Związki niskocząsteczkowe, a także krótkie peptydy aktywują białko p73 w komórkach nowotworowych, co prowadzi do ich selektywnej eliminacji za pośrednictwem p73-zależnej apoptozy. Aktywatory białka p73, oddziałując bądź z białkiem p73, bądź z jego inhibitorem, odwracają skutki inhibicji i prowadzą do akumulacji białka p73 w komórce i aktywacji transkrypcji zależnych od niego genów. Udokumentowanymi aktywatorami białka p73 są RETRA, nutlina 3 oraz krótki peptyd 37 AA aminokwasów peptydu (37 AA), który wiążąc się z białkiem iaspp zapobiega wiązaniu białek p53 i p73 do ia- SPP. Peptyd 37 AA działa więc jak derepresor, prowadząc do aktywacji transkrypcji zależnych od p53 i p73 genów. Istotną postacią inaktywacji białka p73 w komórkach nowotworowych jest tworzenie heterodimerów między p73 a zmutowanym białkiem p53, prowadzące do zahamowania aktywności transkrypcyjnej białka p73. Za formowanie kompleksu odpowiedzialna jest domena wiążąca DNA oraz domena tetrameryzacyjna białek. Czynnikiem predestynującym do utworzenia heterodimeru jest polimorfizm kodonu 72 białka p53 [57]. Kravchenko i wsp. [22] zidentyfikowali niskocząsteczkowy związek RETRA, który uwalnia białko p73 z kompleksu ze zmutowanym p73 i aktywuje transkrypcję genów, których produkty biorą udział w zatrzymaniu cyklu komórkowego i w indukcji apoptozy. W naszych wcześniejszych badaniach wykazaliśmy, iż także wykorzystywana w terapii fotodynamicznej protoporfiryna IX wiąże się do białka p53 i zaburza tworzenie kompleksu p53-hdm2 [56]. Powoduje to akumulację p53 i indukcję proapoptotycznych białek Bak oraz PUMA. Zauważono również wzrost fosforylacji białka p53 w pozycji Ser-15, co ułatwia interakcje z koaktywatorami transkrypcji. PpIX indukowała także wzrost ekspresji genów zależnych od p53, takich jak PUMA, oraz co ciekawe, apoptozę w komórkach HCT116 p53 /. Ponieważ transkrypcja tych genów może być aktywowana przez TAp73 jest możliwe, że PpIX może wiązać i aktywować również ten homolog białka p53. Związki uwalniające p73 spod działania inhibitorów przedstawia rycina 3. Wnioski Uszkodzenie DNA w odpowiedzi na chemioterapię w wyniku transdukcji sygnału powoduje śmierć komórek. Ważne w tym procesie jest nie tyle samo białko p53, co współpraca między białkami p53 i p73, a może również p63. Zdolność proapoptotycznej izoformy TAp73 do indukcji apoptozy modulowana jest przez interakcje z innymi izoformami p73, a także ze zmutowanym p53. Inaktywacja białka p73 przez zmutowane p53 wskazuje na istotny mechanizm oporności komórek nowotworowych na chemioterapeutyki. Dlatego też aktywacja białka p73 w komórkach nowotworowych z użyciem niskocząsteczkowych molekuł to bardzo obiecująca metoda indukowania wrażliwości komórek nowotworowych na chemioterapię. Piśmiennictwo [1] Asher G., Tsvetkov P., Kahana C., Shaul Y.: A mechanism of ubiquitin-independent proteasomal degradation of the tumor suppressors p53 and p73. Genes Dev., 2005; 19: [2] Bálint E., Bates S., Vousden K.H.: Mdm2 binds p73a without targeting degradation. Oncogene, 1999; 18: [3] Bálint E., Phillips A.C., Kozlov S., Stewart C.L., Vousden K.H.: Induction of p57kip2 expression by p73b. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2002; 99: [4] Barrera F.N., Poveda J.A., Gonzalez-Ros J.M., Neira J.L.: Binding of the C-terminal sterile a motif (SAM) domain of human p73 to lipid membranes. J. Biol. Chem., 2003; 278: [5] Bell H.S., Dufes C., O Prey J., Crighton D., Bergamaschi D., Lu X., Schätzlein A.G., Vousden K.H., Ryan K.M.: A p53-derived apoptotic peptide derepresses p73 to cause tumor regression in vivo. J. Clin. Invest., 2007; 117: [6] Bergamaschi D., Samuels Y., Jin B., Duraisingham S., Crook T., Lu X.: ASPP1 and ASPP2: common activators of p53 family members. Mol. Cell. Biol., 2004; 24: [7] Blandino G., Dobbelstein M.: p73 and p63: why do we still need them? Cell Cycle, 2004; 3: [8] Burge S., Teufel D.P., Townsley F.M., Freund S.M., Bycroft M., Fersht A.R.: Molecular basis of the interactions between the p73 N terminus and p300: effects on transactivation and modulation by phosphorylation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009; 106: [9] Chen X., Liu G., Zhu J., Jiang J., Nozell S., Willis A.: Isolation and characterization of fourteen novel putative and nine known target genes of the p53 family. Cancer Biol. Ther., 2003; 2: [10] Corn P.G., Kuerbitz S.J., van Noesel M.M., Esteller M., Compitello N., Baylin S.B., Herman J.G.: Transcriptional silencing of the p73 gene in acute lymphoblastic leukemia and Burkitt s lymphoma is associated with 5 CpG island methylation. Cancer Res., 1999; 59: [11] Courtois S., de Fromentel C.C., Hainaut P.: p53 protein variants: structural and functional similarities with p63 and p73 isoforms. Oncogene, 2004; 23: [12] Coutandin D., Löhr F., Niesen F.H., Ikeya T., Weber T.A., Schäfer B., Zielonka E.M., Bullock A.N., Yang A., Güntert P., Knapp S., McKeon F., Ou H.D., Dötsch V.: Conformational stability and activity of p73 require a second helix in the tetramerization domain. Cell Death Differ., 2009; 16: [13] De Laurenzi V., Melino G.: Evolution of functions within the p53/ p63/p73 family. Ann. NY Acad. Sci., 2000; 926: [14] Fontemaggi G., Kela I., Amariglio N., Rechavi G., Krishnamurthy J., Strano S., Sacchi A., Givol D., Blandino G.: Identification of direct p73 target genes combining DNA microarray and chromatin immunoprecipitation analyses. J. Biol. Chem., 2002; 277: [15] Gaiddon C., Lokshin M., Gross I., Levasseur D., Taya Y., Loeffler J.P., Prives C.: Cyclin-dependent kinases phosphorylate p73 at threonine 86 in a cell cycle-dependent manner and negatively regulate p73. J. Biol. Chem., 2003; 278:
9 Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; tom 64: [16] Gonzalez S., Prives C., Cordon-Cardo C.: p73a regulation by Chk1 in response to DNA damage. Mol. Cell. Biol., 2003; 23: [17] Hosoda M., Ozaki T., Miyazaki K., Hayashi S., Furuya K., Watanabe K., Nakagawa T., Hanamoto T., Todo S., Nakagawara A.: UFD2a mediates the proteasomal turnover of p73 without promoting p73 ubiquitination. Oncogene, 2005; 24: [18] Irwin M.S.: Family feud in chemosensitvity: p73 and mutant p53. Cell Cycle, 2004; 3: [19] Irwin M.S.: Np73: misunderstood protein? Cancer Biol. Ther., 2006; 5: [20] Jones E.V., Dickman M.J., Whitmarsh A.J.: Regulation of p73-mediated apoptosis by c-jun N-terminal kinase. Biochem. J., 2007; 405: [21] Kaghad M., Bonnet H., Yang A., Creancier L., Biscan J.C., Valent A., Minty A., Chalon P., Lelias J.M., Dumont X., Ferrara P., McKeon F., Caput D.: Monoallelically expressed gene related to p53 at 1p36, a region frequently deleted in neuroblastoma and other human cancers. Cell, 1997; 90: [22] Kravchenko J.E., Ilyinskaya G.V., Komarov P.G., Agapova L.S., Kochetkov D.V., Strom E., Frolova E.I., Kovriga I., Gudkov A.V., Feinstein E., Chumakov P.M.: Small-molecule RETRA suppresses mutant p53-bearing cancer cells through a p73-dependent salvage pathway. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2008; 105: [23] Lau L.M., Nugent J.K., Zhao X., Irwin M.S.: HDM2 antagonist Nutlin-3 disrupts p73-hdm2 binding and enhances p73 function. Oncogene, 2008; 27: [24] Levy D., Adamovich Y., Reuven N., Shaul Y.: The Yes-associated protein 1 stabilizes p73 by preventing Itch-mediated ubiquitination of p73. Cell Death Differ., 2007; 14: [25] Lin Y.L., Sengupta S., Gurdziel K., Bell G.W., Jacks T., Flores E.R.: p63 and p73 transcriptionally regulate genes involved in DNA repair. PLoS Genet., 2009; 5: e [26] Liu G., Chen X.: The C-terminal sterile a motif and the extreme C terminus regulate the transcriptional activity of the a isoform of p73. J. Biol. Chem., 2005; 280: [27] Liu G., Nozell S., Xiao H., Chen X.: Np73b is active in transactivation and growth suppression. Mol. Cell. Biol., 2004; 24: [28] Lunghi P., Costanzo A., Mazzera L., Rizzoli V., Levrero M., Bonati A.: The p53 family protein p73 provides new insights into cancer chemosensitivity and targeting. Clin. Cancer Res., 2009; 15: [29] Mantovani F., Piazza S., Gostissa M., Strano S., Zacchi P., Mantovani R., Blandino G., Del Sal G.: Pin1 links the activities of c-abl and p300 in regulating p73 function. Mol. Cell, 2004; 14: [30] Marabese M., Mazzoletti M., Vikhanskaya F., Broggini M.: HtrA2 enhances the apoptotic functions of p73 on bax. Cell Death. Differ., 2008; 15: [31] Marin M.C., Jost C.A., Irwin M.S., DeCaprio J.A., Caput D., Kaelin K.G.Jr.: Viral oncoproteins discriminate between p53 and the p53 homolog p73. Mol. Cell. Biol., 1998; 18: [32] Marrazzo E., Marchini S., Previdi S., Broggini M.: Questioning the oncogenic role of Np73a in different cell lines expressing p53 or not. Cancer Biol. Ther., 2006; 5: [33] Melino G., De Laurenzi V., Vousden K.H.: p73: Friend or foe in tumorigenesis. Nat. Rev. Cancer, 2002; 2: [34] Miyazaki K., Ozaki T., Kato C., Hanamoto T., Fujita T., Irino S., Watanabe K., Nakagawa T., Nakagawara A.: A novel HECT-type E3 ubiquitin ligase, NEDL2, stabilizes p73 and enhances its transcriptional activity. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2003; 308: [35] Moll U.M., Slade N.: p63 and p73: roles in development and tumor formation. Mol. Cancer Res., 2004; 2: [36] Murray-Zmijewski F., Lane D.P., Bourdon J.C.: p53/p63/p73 isoforms: an orchestra of isoforms to harmonise cell differentiation and response to stress. Cell Death Differ., 2006; 13: [37] Nakagawa T., Takahashi M., Ozaki T., Watanabe Ki K., Todo S., Mizuguchi H., Hayakawa T., Nakagawara A.: Autoinhibitory regulation of p73 by Np73 to modulate cell survival and death through a p73-specific target element within the Np73 promoter. Mol. Cell. Biol., 2002; 22: [38] Nozell S., Wu Y., McNaughton K., Liu G., Willis A., Paik J.C., Chen X.: Characterization of p73 functional domains necessary for transactivation and growth suppression. Oncogene, 2003; 22: [39] Nyman U., Vlachos P., Cascante A., Hermanson O., Zhivotovsky B., Joseph B.: Protein kinase C-dependent phosphorylation regulates the cell cycle-inhibitory function of the p73 carboxy terminus transactivation domain. Mol. Cell. Biol., 2009; 29: [40] Ongkeko W.M., Wang X.Q., Siu W.Y., Lau A.W., Yamashita K., Harris A.L., Cox L.S., Poon R.Y.: MDM2 and MDMX bind and stabilize the p53-related protein p73. Curr. Biol., 1999; 9: [41] Oswald C., Stiewe T.: In good times and bad: p73 in cancer. Cell Cycle, 2008; 7: [42] Ozaki T., Nakagawara A.: p73, a sophisticated p53 family member in the cancer world. Cancer Sci., 2005; 96: [43] Peschiaroli A., Scialpi F., Bernassola F., Pagano M., Melino G.: The F-box protein FBXO45 promotes the proteasome-dependent degradation of p73. Oncogene, 2009; 28: [44] Ramadan S., Terrinoni A., Catani M.V., Sayan A.E., Knight R.A., Mueller M., Krammer P.H., Melino G., Candi E.: p73 induces apoptosis by different mechanisms. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2005; 331: [45] Stehmeier P., Muller S.: Regulation of p53 family members by the ubiquitin-like SUMO system. DNA Repair, 2009; 8: [46] Stiewe T., Pützer B.M.: p73 in apoptosis. Apoptosis, 2001; 6: [47] Stiewe T., Theseling C.C., Pützer B.M.: Transactivation-deficient TA-p73 inhibits p53 by direct competition for DNA binding: implications for tumorigenesis. J. Biol. Chem., 2002; 277: [48] Strano S., Monti O., Pediconi N., Baccarini A., Fontemaggi G., Lapi E., Mantovani F., Damalas A., Citro G., Sacchi A., Del Sal G., Levrero M., Blandino G.: The transcriptional coactivator Yes-associated protein drives p73 gene-target specificity in response to DNA damage. Mol. Cell, 2005; 18: [49] Tomkova K., Tomka M., Zajac V.: Contribution of p53, p63, and p73 to the developmental diseases and cancer. Neoplasma, 2008; 55: [50] Tsai K.K., Yuan Z.M.: c-abl stabilizes p73 by a phosphorylationaugmented interaction. Cancer Res., 2003; 63: [51] Vassilev L.T., Vu B.T., Graves B., Carvajal D., Podlaski F., Filipovic Z., Kong N., Kammlott U., Lukacs C., Klein C., Fotouhi N., Liu E.A.: In vivo activation of the p53 pathway by small-molecule antagonists of MDM2. Science, 2004; 303: [52] Vikhanskaya F., Toh W.H., Dulloo I., Wu Q., Boominathan L., Ng H.H., Vousden K.H., Sabapathy K.: p73 supports cellular growth through c-jun-dependent AP-1 transactivation. Nat. Cell Biol., 2007; 9: [53] Vilgelm A., El-Rifai W., Zaika A.: Therapeutic prospects for p73 and p63: rising from the shadow of p53. Drug Resist. Updat., 2008; 11: [54] Wang X.Q., Ongkeko W.M., Lau A.W., Leung K.M., Poon R.Y.: A possible role of p73 on the modulation of p53 level through MDM2. Cancer Res., 2001; 61: [55] Yang A., Walker N., Bronson R., Kaghad M., Oosterwegel M., Bonnin J., Vagner C., Bonnet H., Dikkes P., Sharpe A., McKeon F., Caput D.: p73-deficient mice have neurological, pheromonal and inflammatory defects but lack spontaneous tumours. Nature, 2000; 404: [56] Zawacka-Pankau J., Issaeva N., Hossain S., Pramanik A., Selivanova G., Podhajska A. J.: Protoporphyrin IX interacts with wild-type p53 protein in vitro and induces cell death of human colon cancer cells in a p53-dependent and -independent manner. J. Biol. Chem., 2007; 282: [57] Zawacka-Pankau J., Kostecka A., Sznarkowska A., Hedström E., Kawiak A.: p73 tumor suppressor protein a close relative of p53 not only in structure but also in anti-cancer approach. Cell Cycle, 2010; 9: [58] Zeng X., Chen L., Jost C.A., Maya R., Keller D., Wang X., Kaelin W.G. Jr., Oren M., Chen J., Lu H.: MDM2 suppresses p73 function without promoting p73 degradation. Mol. Cell. Biol., 1999; 19: Autorki deklarują brak potencjalnych konfliktów interesów. 86
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem.
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Streszczenie Ogólnym celem niniejszej pracy było lepsze zrozumienie funkcjonowania szlaku
TERAPIA GENOWA. dr Marta Żebrowska
TERAPIA GENOWA dr Marta Żebrowska Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki, Zakładu Biochemii Farmaceutycznej, Uniwersytetu Medycznego w Łodzi Źródło zdjęcia: httpblog.ebdna.plindex.phpjednoznajwiekszychzagrozenludzkosciwciazniepokonane
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Dr hab. n. med. Paweł Blecharz
BRCA1 zależny rak piersi i jajnika odmienności diagnostyczne i kliniczne (BRCA1 dependent breast and ovarian cancer clinical and diagnostic diversities) Paweł Blecharz Dr hab. n. med. Paweł Blecharz Dr
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy
Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Recenzja rozprawy doktorskiej
Prof. n. tech. dr hab. n. fiz. inż. lek. med. Halina Podbielska Katedra Inżynierii Biomedycznej i Pomiarowej Wydział Podstawowych Problemów Techniki Politechnika Wrocławska 50-370 Wrocław Wybrzeże Wyspiańskiego
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Cykl komórkowy. Rozmnażanie komórek G 1, S, G 2. (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza)
Rozmnażanie komórek (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza) G 1, S, G 2 podział komórki (faza M) Obejmuje: podwojenie zawartości komórki (skopiowanie
Mechanizmy kontroli rozwoju roślin. Rafał Archacki
Mechanizmy kontroli rozwoju roślin Rafał Archacki Drzewo życia pozycja roślin i zwierząt http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399 Ewolucja roślin ewolucja procesu rozmnażania i rozwoju http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes
The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes TAESAENG CHOI*, KENJI FUKASAWA*, RENPING ZHOUt, LINO TESSAROLLO*,
TRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
Przegląd budowy i funkcji białek
Przegląd budowy i funkcji białek Co piszą o białkach? Wyraz wprowadzony przez Jönsa J. Berzeliusa w 1883 r. w celu podkreślenia znaczenia tej grupy związków. Termin pochodzi od greckiego słowa proteios,
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy a) Toma A, Widłak W, Vydra N (2012) Rola czynnika transkrypcyjnego HSF1 w procesie nowotworzenia. Postępy Biologii Komórki 39(2):269 288 b) Vydra N, Toma
RAK JAJNIKA CZYLI RZECZ O WYBRCA-OWANYCH (WYBRAKOWANYCH) GENACH
RAK JAJNIKA CZYLI RZECZ O WYBRCA-OWANYCH (WYBRAKOWANYCH) GENACH Dr hab. n. med. Lubomir Bodnar Klinika Onkologii Wojskowy Instytut Medyczny w Warszawie PORUSZANE TEMATY Budowa genów odpowiedzialnych za
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE Ewa Waszkowska ekspert UPRP Źródła informacji w biotechnologii projekt SLING Warszawa, 9-10.12.2010 PLAN WYSTĄPIENIA Umocowania prawne Wynalazki biotechnologiczne Statystyka
Metody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
Cykl komórkowy i nowotwory. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Cykl komórkowy i nowotwory Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Kilka podstawowych informacji Komórki wielokomórkowego organizmu
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Nowe terapie choroby Huntingtona. Grzegorz Witkowski Katowice 2014
Nowe terapie choroby Huntingtona Grzegorz Witkowski Katowice 2014 Terapie modyfikujące przebieg choroby Zahamowanie produkcji nieprawidłowej huntingtyny Leki oparte o palce cynkowe Małe interferujące RNA
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
Znaczenie białka MDM2 w cyklu komórkowym
Znaczenie białka MDM2 w cyklu komórkowym Janusz Szemraj Elżbieta Rozpończyk * Jacek Bartkowiak Janusz Greger Katarzyna Oszajca Zakład Biochemii, Instytut Fizjologii i Biochemii, Uniwersytet Medyczny, Łódź
Immunoterapia w praktyce rak nerki
Immunoterapia w praktyce rak nerki VII Letnia Akademia Onkologiczna dla Dziennikarzy Warszawa 09 sierpień 2018 Piotr Tomczak Uniwersytet Medyczny Poznań Katedra i Klinika Onkologii Leczenie mrcc - zalecenia
Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Ekspresja genów jest regulowana
Reakcje enzymatyczne. Co to jest enzym? Grupy katalityczne enzymu. Model Michaelisa-Mentena. Hamowanie reakcji enzymatycznych. Reakcje enzymatyczne
Reakcje enzymatyczne Enzym białko katalizujące reakcje chemiczne w układach biologicznych (przyśpieszają reakcje przynajmniej 0 6 raza) 878, Wilhelm uehne, użył po raz pierwszy określenia enzym (w zaczynie)
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 4 Jak działają geny?
Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi
Marta Klimczak Studium Medycyny Molekularnej Warszawski Uniwersytet Medyczny Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Praca wykonana w Zakładzie Biologii Molekularnej
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym mgr Magdalena Brzeskwiniewicz Promotor: Prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Gdański Uniwersytet Medyczny
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Patogeneza przewlekłej białaczki szpikowej od genu do terapii celowanej
PRACA POGLĄDOWA Hematologia 2010, tom 1, nr 3, 195 218 Copyright 2010 Via Medica ISSN 2081 0768 Patogeneza przewlekłej białaczki szpikowej od genu do terapii celowanej Pathogenesis of chronic myeloid leukemia
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Streszczenie. Summary. Alicja Sznarkowska, Robert Olszewski, Joanna Zawacka-Pankau. Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; 64: 396-407 e-issn 1732-2693
Postepy Hig Med Dosw (online), 2010; 64: 396-407 e-issn 1732-2693 www.phmd.pl Review Received: 2010.04.28 Accepted: 2010.07.12 Published: 2010.08.20 Farmakologiczna aktywacja supresora nowotworu, natywnego
cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Uniwersytet Łódzki. prof. dr hab. Wanda M. Krajewska Katedra Cytobiochemii Łódź 20 lipca 2016 r.
Uniwersytet Łódzki prof. dr hab. Wanda M. Krajewska Katedra Cytobiochemii Łódź 20 lipca 2016 r. Opinia pracy doktorskiej mgr Jolanty Zięby Senescencja komórek glejaka wielopostaciowego in vitro poszukiwanie
ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE
Uniwersytet Medyczny w Lublinie Katedra i Zakład Patomorfologii Klinicznej ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE Lek. Joanna Irla-Miduch WERYFIKACJA HISTOPATOLOGICZNA I OCENA EKSPRESJI BIAŁKA p16 INK4A ORAZ
Rola starzenia komórkowego w kancerogenezie i terapii przeciwnowotworowej
Rola starzenia komórkowego w kancerogenezie i terapii przeciwnowotworowej Grażyna Mosieniak Anna Strzeszewska Pracownia Molekularnych Podstaw Starzenia, Instytut Biologii Doświadczalnej im. Marcelego Nenckiego
Toruń, dnia r.
dr hab. Dariusz Jan Smoliński Zakład Biologii Komórki Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu Toruń, dnia 24.06.2013 r. RECENZJA rozprawy doktorskiej Pana magistra
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Prokariota i Eukariota
Prokariota i Eukariota W komórkach organizmów żywych ilość DNA jest zazwyczaj stała i charakterystyczna dla danego gatunku. ILOŚĆ DNA PRZYPADAJĄCA NA APARAT GENETYCZNY WZRASTA WRAZ Z BARDZIEJ FILOGENETYCZNIE
IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO
IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO EWA STĘPIEŃ ZAKŁAD PATOMORFOLOGII OGÓLNEJ AKADEMII MEDYCZNEJ W BIAŁYMSTOKU KIEROWNIK I OPIEKUN PRACY: Dr KATARZYNA GUZIŃSKA-USTYMOWICZ
STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ
mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii?
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii? Wykorzystanie nowych technik molekularnych w badaniach nad genetycznymi i epigenetycznymi mechanizmami transformacji nowotworowej
Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Kosm os Tom 48, 1999 Numer 2 (243) Strony 245-253 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Ew a Ra d z is z e w s k a Instytut Biologii Doświadczalnej im. M Nenckiego
z Hsp90 w sposób bezpośredni. Ponadto pokazano, iż pomimo podobieństwa sekwencji CacyBP/SIP i Sgt1, białka te nie współzawodniczą ze sobą o wiązanie
Mgr Agnieszka Góral Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biologia Otwarcie: 28.06.2013 r. Temat: Białko CacyBP/SIP: oddziaływanie z białkiem szoku cieplnego Hsp90 oraz rola w odpowiedzi komórek na
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
2014-03-26. Analiza sekwencji promotorów
2014-03-26 Analiza sekwencji promotorów 1 2014-03-26 TFy tworzą zawiły układ regulacyjny, na który składają się różne oddziaływania białko białko poprzez wytworzenie PĘTLI Specyficzne TFy Ogólne TFy Benfey,
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy. Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję
Nukleosomy 1 Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję Metody pozwalające na wyznaczanie miejsc wiązania nukleosomów Charakterystyka obsadzenia nukleosomów
Informacje. W sprawach organizacyjnych Slajdy z wykładów
Biochemia Informacje W sprawach organizacyjnych malgorzata.dutkiewicz@wum.edu.pl Slajdy z wykładów www.takao.pl W sprawach merytorycznych Takao Ishikawa (takao@biol.uw.edu.pl) Kiedy? Co? Kto? 24 lutego
EWA PIĘTA. Streszczenie pracy doktorskiej
EWA PIĘTA Spektroskopowa analiza struktur molekularnych i procesu adsorpcji fosfinowych pochodnych pirydyny, potencjalnych inhibitorów aminopeptydazy N Streszczenie pracy doktorskiej wykonanej na Wydziale
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK
Piotr Potemski. Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Szpital im. M. Kopernika w Łodzi
Piotr Potemski Uniwersytet Medyczny w Łodzi, Szpital im. M. Kopernika w Łodzi VI Letnia Akademia Onkologiczna dla Dziennikarzy, Warszawa, 10-12.08.2016 1 Lepiej skazać stu niewinnych ludzi, niż jednego
Epigenetic modifications during oocyte growth correlates with extended parthenogenetic developement in the mouse
Epigenetic modifications during oocyte growth correlates with extended parthenogenetic developement in the mouse Tomohiro Kono, Yayoi Obata, Tomomi Yoshimzu, Tatsuo Nakahara & John Carroll Rozwój partenogenetyczny
Diagnostyka molekularna umożliwia terapie spersonalizowane. Janusz A. Siedlecki
Diagnostyka molekularna umożliwia terapie spersonalizowane. Janusz A. Siedlecki Centrum Onkologii-Instytut, Warszawa 2015 Rozwój Rozwój medycyny i nauk podstawowych w ciągu ostatnich pięćdziesięciu lat
Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii
Życie jest procesem chemicznym. Jego podstawą są dwa rodzaje cząsteczek kwasy nukleinowe, jako nośniki informacji oraz białka, które tę informację wyrażają w postaci struktury i funkcji komórek. Arthur
Mgr Dorota Przybylska
Mgr Dorota Przybylska Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biochemia Wszczęcie: 11.12.2015 Temat: Rola oksydazy NADPH 4 oraz szlaku odpowiedzi na uszkodzenia DNA w starzeniu ludzkich komórek mięśni
Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu. Wydział Medycyny Weterynaryjnej. Katedra Biochemii, Farmakologii i Toksykologii.
Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu Wydział Medycyny Weterynaryjnej Katedra Biochemii, Farmakologii i Toksykologii Aleksandra Pawlak CHARAKTERYSTYKA FENOTYPOWA KOMÓREK CHŁONIAKÓW I BIAŁACZEK PSÓW ORAZ