Mechanizmy kontroli rozwoju roślin. Rafał Archacki
|
|
- Kamil Lisowski
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Mechanizmy kontroli rozwoju roślin Rafał Archacki
2 Drzewo życia pozycja roślin i zwierząt
3 Ewolucja roślin ewolucja procesu rozmnażania i rozwoju
4 Cykl rozwojowy roślin wyższych na przykładzie Arabidopsis thaliana Diévart A, Clark S E Development 2004;131:
5 Mechanizmy kontroli rozwoju zwierząt i roślin są w większości odmienne ANIMALS Pattern formation in development PLANTS Embryo development Master regulatory genes contain homeobox (Hox genes) Dorsal-ventral specification controlled by TGF-related proteins (GURKEN), receptor tyrosine kinases, Ras activation, transcription factors of kappa B, Rel, basic HLH families Flower development Master regulatory genes contain MADS box No relatives of GURKEN No receptor tyrosine kinases No Ras proteins No kappa B or Rel type TFs Weak similarity of the bhlh domain Cell-cell signaling Critical role of receptor tyrosine kinases, Critical role of serine/threonine Ras activation kinases of the type not found in animals Chromatin Meyerowitz, EM. Science (2002)
6 Embryo development Master regulatory genes contain homeobox (Hox genes) Cell-cell signaling Czy można wskazać elementy wspólne? Critical role of receptor tyrosine kinases, Critical role of serine/threonine Ras activation kinases of the type not found in ANIMALS animals PLANTS Pattern formation in development Chromatin Flower development Histones, histone modifying proteins, Swi/Snf-type ATPases, Trx proteins, Polycomb proteins, HP1-type proteins. Master regulatory genes contain MADS box Dorsal-ventral specification controlled by TGF-related proteins (GURKEN), receptor tyrosine kinases, Ras activation, transcription factors of kappa B, Rel, basic HLH families Enahncer of zeste (Polycomb-type maintains repression of the Hox genes (Ultrabithorax) No relatives of GURKEN No receptor tyrosine kinases No Ras proteins No genes kappa (AGAMOUS) B or Rel type TFs Weak similarity of the bhlh domain CURLY LEAF (Polycomb type) maintains repression of the MADS Cell-cell signaling Mechanizmy związane z regulacją struktury chromatyny funkcjonują też u drożdży Critical role of receptor tyrosine kinases, Critical role of serine/threonine Ras activation kinases of the type not found in animals Były prawdopodobnie obecne u ostatniego wspólnego przodka roślin Chromatin i zwierząt Histones, histone modifying proteins, Swi/Snf-type Meyerowitz, EM. Science (2002) ATPases, Trx proteins, Polycomb proteins, HP1-type proteins.
7 The chromatin Yin / Yang Heterochromatin Euchrochromatin Giacomo CAVALLI. Montpellier, December 2006
8 Modyfikacje struktury chromatyny modyfikacje DNA metylacja DNA modyfikacje potranslacyjne histonów np. acetylacja wyspecjalizowane warianty histonów ATP-zależna przebudowa (remodeling) chromatyny Białka Polycomb
9 W trakcie rozwoju te same geny w różnych tkankach i komórkach utrzymywane są w stanie aktywnym lub wyciszonym modyfikacje chromatyny Current Opinion in Genetics & Development 2011, 21:
10 Reprogramowanie epigenetyczne u zwierząt Wolf Reik, NATURE, 2007
11 Reprogramowanie epigenetyczne u roślin
12 Modyfikacje struktury chromatyny 1. modyfikacje DNA metylacja DNA 2. modyfikacje potranslacyjne histonów np. acetylacja 3. wyspecjalizowane warianty histonów 4. ATP-zależna przebudowa (remodeling) chromatyny 5. Białka Polycomb
13 Kompleksy SWI/SNF u różnych grup Eukariota Przykład uniwersalnego składnika systemu modyfikacji chromatyny Kwon, Wagner, 2007
14 Kompleksy remodelujące chromatynę w rozwoju ssaków Ho, Crabtree, Nature, 2010
15 Kompleksy remodelujące chromatynę w rozwoju roślin Mutanty Arabidopsis pozbawione jednego z głównych składników kompleksu SWI/SNF:
16 Kompleksy remodelujące chromatynę w rozwoju roślin podobnie jak u zwierząt, niektóre mutacje w podjednostkach SWI/SNF są embrioletalne Bezhani et al., 2008, Plant Cell
17 Antagonistyczne funkcje białek Thritorax i Polycomb Białka Thritorax - należą do nich m.in. składniki kompleksu SWI/SNF
18 Utrzymywanie wzorów ekspresji kluczowych genów regulatorowych w trakcie rozwoju antagonizm PcG-Trx
19 Mutacje homeotyczne w mutantach polycomb Sparmann and Lohuizen Nature Reviews Cancer 6, , 2006
20 Kompleksy Polycomb - Drosophila E(z) Esc Ph PSC Su(z)12 Nurf55 Pc RING PRC2 PRC1 Drosophila PRC2 has a conserved core of four proteins E(Z) ESC SU(Z)12 NURF55 Enhancer of zeste (E(Z)) Extra sex comb (ESC) Suppressor of zeste 12 (SU(Z)12) The Plant Cell, 2010 NURF55
21 Homologi podjednostek PRC2 Developmental Cell 19, November 16, 2010
22 Zróżnicowanie kompleksów PcG - rośliny Drosophila PRC2 E(Z) (methylase) ESC SU(Z)12 NURF55 Arabidopsis PRC2 - więcej podjednostek (dlaczego?) CURLY LEAF (CLF) MEDEA (MEA) FERTILIZATION INDEPENDENT ENDOSPERM (FIE) FERTILIZATION-INDEPENDENT SEED 2 (FIS2) EMBRYONIC FLOWER 2 (EMF2) MULTICOPY SUPPRESSOR OF IRA1 (MSI1,2,3,4,5) SWINGER (SWN) VERNALIZATION 2 (VRN2) The Plant Cell, 2010
23 U roślin występuje wiele kompleksów Polycomb typu PRC2 o wyspecjalizowanych funkcjach Lars Hennig, Maria Derkacheva, 2009
24 Mutacje polycomb Arabidopsis Chanvivattana Y et al. Development 2004;131:
25 Geny kontrolowane przez roślinne białka Polycomb Roślinne geny homeotyczne (kodują białka zawierające domenę MADS) Chanvivattana Y et al. Development 2004;131: Uproszczony model regulacji rozwoju kwiatu (model ABC) Geny ABC (homeotyczne) Grupa A: Apetala1 (AP1) Apetala2 (AP2) Grupa B: Apetala3 (AP3) Pistilata (PI) Grupa C: Agamous (AG)
26 Czy opisany u zwierząt antagonizm PcG Trx w regulacji kluczowych genów rozwojowych występuje również u roślin? TAK ten sam mechanizm został niedawno udowodniony ( ) Wu M et al. PNAS 2012;109:
27 Regulacja rozwoju u zwierząt i roślin przykład konwergencji Cell-cell signaling Critical role of receptor tyrosine kinases, Critical role of serine/threonine Ras activation ANIMALS kinases of the PLANTS type not found in animals Pattern formation in development Chromatin Embryo development Flower development Master regulatory Histones, genes histone contain modifying proteins, Master regulatory Swi/Snf-type genes homeobox ATPases, (Hox Trx genes) proteins, Polycomb proteins, contain MADS HP1-type box proteins. Dorsal-ventral specification controlled Enahncer by TGF-related of zeste (Polycomb-type proteins (GURKEN), maintains receptor repression tyrosine kinases, of Ras the activation, Hox genes transcription (Ultrabithorax) factors of kappa B, Rel, basic HLH families Hormonal signaling Cell-cell signaling CURLY No relatives LEAF of GURKEN (Polycomb type) maintains No receptor repression tyrosine kinases of the MADS genes No Ras (AGAMOUS) proteins No kappa B or Rel type TFs Weak similarity of the bhlh domain Critical role of receptor tyrosine kinases, Critical role of serine/threonine Ras activation kinases of the type not found in animals Chromatin Weak similarity of the bhlh domain Different molecules, different signaling components Cellular and nuclear receptors, chromatin-based regulatory mechanisms, proteasome regulation Histones, histone modifying proteins, Swi/Snf-type ATPases, Trx proteins, Polycomb proteins, HP1-type proteins.
Drzewo życia pozycja roślin. Ewolucja genetycznych narzędzi kontroli rozwoju roślin
Chlorophytes Charophytes Bryophytes Lycophytes Ferns Gymnosperms Angiosperms 2014-02-05 Ewolucja genetycznych narzędzi kontroli rozwoju roślin Drzewo życia pozycja roślin Rafał Archacki http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399
Bardziej szczegółowoEwolucja genetycznych narzędzi kontroli rozwoju roślin
Ewolucja genetycznych narzędzi kontroli rozwoju roślin Rafał Archacki Zakład Biologii Systemów Drzewo życia pozycja roślin http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399 Chlorophytes Charophytes Bryophytes
Bardziej szczegółowoHeterochromatyna i epigenetyczne wyciszanie ekspresji genów
Heterochromatyna i epigenetyczne wyciszanie ekspresji genów 1 Plan wykładu: 1. Charakterystyka heterochromatyny 2. Wyciszanie transpozonów 3. Przebudowa chromatyny rola białek Polycomb 4. Funkcje białek
Bardziej szczegółowoEpigenetyczna regulacja ekspresji genów w trakcie rozwoju zwierząt i roślin
Epigenetyczna regulacja ekspresji genów w trakcie rozwoju zwierząt i roślin Rozwój jest z natury epigenetyczny te same geny w różnych tkankach i komórkach utrzymywane są w stanie aktywnym lub wyciszonym
Bardziej szczegółowoWykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Bardziej szczegółowoINICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Bardziej szczegółowoRola chromatyny w regulacji ekspresji genów. Monika Zakrzewska-Płaczek
Rola chromatyny w regulacji ekspresji genów Monika Zakrzewska-Płaczek monika.z@ibb.waw.pl Co oznacza epigenetyka? Epigenetyczna regulacja ekspresji genów = zmiana ekspresji genu, która zachodzi bez zmiany
Bardziej szczegółowoRola chromatyny w regulacji ekspresji genów. Monika Zakrzewska-Płaczek
Rola chromatyny w regulacji ekspresji genów Monika Zakrzewska-Płaczek monika.z@ibb.waw.pl Epigenetyczna etyczna regulacja ekspresji genów zmiana ekspresji genu, która zachodzi bez zmiany sekwencji DNA
Bardziej szczegółowoChromatyna struktura i funkcja
Chromatyna struktura i funkcja dr hab. Marta Koblowska dr Rafał Archacki http://www.accessexcellence.org/ab/gg/nucleosome.html GENETYKA FRIEDRICH MIESCHER (1844-1895) W 1869 roku wyizolował z jąder komórkowych
Bardziej szczegółowoPlan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy. Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję
Nukleosomy 1 Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję Metody pozwalające na wyznaczanie miejsc wiązania nukleosomów Charakterystyka obsadzenia nukleosomów
Bardziej szczegółowo518 M. J. OLSZEWSKA wiadaj¹ za ekspresjê genów w zale noœci od pochodzenia rodzicielskiego (tzw. parent-of-origin effect). Wœród jedenastu zbadanych g
POSTÊPY BIOLOGII KOMÓRKI BIA KA POLYCOMB I TRITORAX U ROŒLIN TOM 36 2009 NR 4 (517 537) EPIGENETYCZNA KONTROLA ROZWOJU ROŒLIN PRZEZ BIA KA GRUPY POLYCOMB I TRITORAX* EPIGENETIC CONTROL OF PLANT DEVELOPEMENT
Bardziej szczegółowoEwolucja genów i genomów
Ewolucja genów i genomów The Revised Classification of Eukaryotes SAR Stramenopila Alveolata Rhizaria 2 Journal of Eukaryotic Microbiology Volume 59, Issue 5, pages 429-514, 28 SEP 2012 DOI: 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x
Bardziej szczegółowoOferta tematyki badań
Oferta tematyki badań Warszawa, 27.02.2016 Imię i nazwisko: dr hab. Marta Koblowska, prof UW Miejsce pracy: Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski Adres: Pawińskiego 5A, 02-106 Warszawa Adres e-mail:
Bardziej szczegółowoKomórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Bardziej szczegółowoBudowa histonów rdzeniowych
Histony rdzeniowe Budowa histonów rdzeniowych Histon H4 Silnie dodatnio naładowany N-koniec białka Globularna hydrofobowa domena odpowiedzialna za oddziaływania histon-histon oraz histon-dna Domena histonowa
Bardziej szczegółowoAlchemia epigenetycznej regulacji pluripotencji
Alchemia epigenetycznej regulacji pluripotencji Joanna Bem Iwona Grabowska * Zakład Cytologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, Warszawa * Zakład Cytologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski,
Bardziej szczegółowoAnalizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
Bardziej szczegółowoRegulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Definicja genu Region DNA, który określa dziedziczoną cechę organizmu; zwykle koduje pojedyncze białko lub RNA. Zawiera całą funkcjonalną podjednostkę wraz
Bardziej szczegółowobiałka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Bardziej szczegółowocytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Bardziej szczegółowoRegulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Klasyczne wyobrażenie genu fragment DNA, który koduje mrna Definicja genu GEN- podstawowa jednostka dziedziczenia Region DNA, który określa charakterystyczną
Bardziej szczegółowoRegulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Klasyczne wyobrażenie genu fragment DNA, który koduje mrna Definicja genu - klasyczna GEN- podstawowa jednostka dziedziczenia Region DNA, który określa charakterystyczną
Bardziej szczegółowoODKRYCIE POLIMERAZY RNA IV
ODKRYCIE POLIMERAZY RNA IV Ewa Róg-ZieliR Zielińska POLIMERAZY RNA U eukariota występuj pują trzy podstawowe rodzaje polimeraz RNA zależnych od DNA Wszystkie te polimerazy są złożone one z około o 12-17
Bardziej szczegółowoROLA BIAŁEK POLYCOMB I TRITHORAX W ROZWOJU NOWOTWORÓW
Studia Medyczne 2008; 10: 5966 PRACA POGLĄDOWA ROLA BIAŁEK POLYCOMB I TRITHORAX W ROZWOJU NOWOTWORÓW THE ROLE OF POLYCOMB AND TRITHORAX PROTEINS IN CANCER PROGRESSION Joanna Wawszczyk, Jan Pałyga Zakład
Bardziej szczegółowoGenetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21 003 Uchwała RW Nr 141/2018 z dnia 28 czerwca 2018 r. NAZWA PRZEDMIOTU pkt ECTS E/Z suma godz wykł. konw. sem. ćw. lab. ćw. ter. SEMESTR
Bardziej szczegółowoModyfikacje histonów rdzeniowych
Modyfikacje histonów rdzeniowych Fosforylacja (seryna, treonina) Acetylacja (lizyna) Modyfikacje histonów rdzeniowych Metylacja (lizyna, arginina) ADP-rybozylacja Ubikwitynylacja (lizyna) Sumoilacja (lizyna)
Bardziej szczegółowoPrzebudowa struktur chromatynowych przez kompleksy wielobiałkowe. The rearrangement of chromatin structures by multiprotein complexes
Przebudowa struktur chromatynowych przez kompleksy wielobiałkowe The rearrangement of chromatin structures by multiprotein complexes TOMASZ T. CALIKOWSKI Spis treści: I. Wstęp II. Maszyny komórkowe zaangażowane
Bardziej szczegółowoEwolucja genów i genomów
Ewolucja genów i genomów Rozmiar genomu Eukaryota 1 pg DNA = 1Gzasad Alexandrium tamarense Około 140 chromosomów 200 pg DNA/komórkę Rośliny do 150 pg 2 Ciągła reorganizacja genomu Bloki genów zachowane
Bardziej szczegółowoANDRZEJ T. WIERZBICKI Zakład Biologii Molekularnej Roślin Uniwersytet Warszawski Pawińskiego 5a, Warszawa
Tom 53, 2004 Numer 3 4 (264 265) Strony 271 280 ANDRZEJ T. WIERZBICKI Zakład Biologii Molekularnej Roślin Uniwersytet Warszawski Pawińskiego 5a, 02-106 Warszawa e-mail: andw@ibb.waw.pl DZIEDZICZENIE EPIGENETYCZNE
Bardziej szczegółowoGenetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19
003 Uchwała RW Nr 136/2018 z dnia 24 maja 2018 r. zmiana w ofercie przedmiotów do wyboru dla II roku 2018/19 (zmiana Uchwały RW Nr 130/2017 z dnia 25 maja 2017 r.) Genetyka i biologia eksperymentalna studia
Bardziej szczegółowoGenetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19
003 Uchwała RW Nr 136/2018 z dnia 24 maja 2018 r. zmiana w ofercie przedmiotów do wyboru dla II roku 2018/19 (zmiana Uchwały RW Nr 130/2017 z dnia 25 maja 2017 r.) Genetyka i biologia eksperymentalna studia
Bardziej szczegółowoHistoria informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Bardziej szczegółowoRegulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Klasyczne wyobrażenie genu fragment DNA, który koduje mrna Definicja genu GEN- podstawowa jednostka dziedziczenia Region DNA, który określa charakterystyczną
Bardziej szczegółowoTHE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Bardziej szczegółowomirna i zmiany faz wzrostu wegetatywnego
mirna i zmiany faz wzrostu wegetatywnego mir156 reguluje ekspresję genów SPL (SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE) Defekty morfologiczne wywołane nadekspresją mirna w Arabidopsis" mirna156 mirna166
Bardziej szczegółowoTransport makrocząsteczek (białek)
Transport makrocząsteczek (białek) Transport makrocząsteczek sortowanie białek - sekwencje sygnałowe lata 70-te XX w. - Günter Blobel - hipoteza sygnałowa; 1999r - nagroda Nobla Sekwencja sygnałowa: A
Bardziej szczegółowoTRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Bardziej szczegółowoWPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Bardziej szczegółowoRegulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Definicja genu GEN- podstawowa jednostka dziedziczenia Region DNA, który określa charakterystyczną dziedziczoną cechę organizmu; zwykle koduje pojedyncze białko
Bardziej szczegółowoGenetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21 003 SEMESTR 1 Uchwała RW Nr 141/2018 z dnia 28 czerwca 2018 r. Biofizyka Biophysics 2 E 30 20 10 25-GBE-S1-E1-Biofiz Chemia ogólna i analityczna
Bardziej szczegółowoUchwała nr 7/09/2019. Komisji Rekrutacyjnej Szkoły Doktorskiej Nauk Ścisłych i Przyrodniczych. z dnia 17 września 2019 r.
Uchwała nr 7/09/2019 Komisji Rekrutacyjnej Szkoły Doktorskiej Nauk Ścisłych i Przyrodniczych z dnia 17 września 2019 r. w sprawie ogłoszenia dodatkowego konkursu w postępowaniu rekrutacyjnym na rok akademicki
Bardziej szczegółowoRzęski, wici - budowa Mikrotubule. rozmieszczenie organelli. Stabilne mikrotubule szkielet rzęsek i wici
Mikrotubule dynamiczna niestabilność - stabilizacja rozmieszczenie organelli ER Golgi organizują wnętrze komórki - polaryzacja komórki Mt Mt organizacja ER, aparatu Golgiego przemieszczanie mitochondriów
Bardziej szczegółowoGenetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20 002 SEMESTR 1 Biofizyka Biophysics 2 E 30 20 10 Chemia ogólna i analityczna General and analytical chemistry 6 E 90 30 60 Matematyka Mathematics
Bardziej szczegółowoDr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Bardziej szczegółowoRegulacja ekspresji genów. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Regulacja ekspresji genów Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Problem: jak sprawić aby z jednej komórki powstał wielokomórkowy
Bardziej szczegółowoWPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Bardziej szczegółowoOcena rozprawy doktorskiej mgr Justyny Kowalczyk
Dr hab. Paweł Bednarek, prof. IChB PAN Instytut Chemii Bioorganicznej PAN ul. Noskowskiego 12/14 61-704 Poznań Ocena rozprawy doktorskiej mgr Justyny Kowalczyk Identyfikacja i charakterystyka nowego regulatora
Bardziej szczegółowoRegulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Dr hab. Marta Koblowska, prof. UW Zakład Biologii Systemów, Wydział Biologii UW Pracownia Analiz Mikromacierzy i Sekwencjonowania UW/IBB PAN Klasyczne wyobrażenie
Bardziej szczegółowoJak działają geny. Podstawy biologii molekularnej genu
Jak działają geny Podstawy biologii molekularnej genu Uniwersalność życia Podstawowe mechanizmy są takie same u wszystkich znanych organizmów budowa DNA i RNA kod genetyczny repertuar aminokwasów budujących
Bardziej szczegółowomikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii
Zawartość 139371 1. Wstęp zarys historii genetyki, czyli od genetyki klasycznej do genomiki 2. Chromosomy i podziały jądra komórkowego 2.1. Budowa chromosomu 2.2. Barwienie prążkowe chromosomów 2.3. Mitoza
Bardziej szczegółowoZmiany epigenetyczne a dieta
GENO-centryczne teorie mają ograniczony zasięg Klasyczna genetyka nie może wytłumaczyć na przykład : Zmiany epigenetyczne a dieta 1. różnorodności fenotypowej w obrębie populacji; 2. dlaczego bliźniaki
Bardziej szczegółowoToruń, dnia r.
dr hab. Dariusz Jan Smoliński Zakład Biologii Komórki Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu Toruń, dnia 24.06.2013 r. RECENZJA rozprawy doktorskiej Pana magistra
Bardziej szczegółowoTransport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Bardziej szczegółowowykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Budowa rybosomu Translacja
Bardziej szczegółowoSkładniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
Bardziej szczegółowoBiałka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi
Marta Klimczak Studium Medycyny Molekularnej Warszawski Uniwersytet Medyczny Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Praca wykonana w Zakładzie Biologii Molekularnej
Bardziej szczegółowoWykład 3. Organizacja jądra komórkowego struktura chromatyny
Wykład 3 Organizacja jądra komórkowego struktura chromatyny Struktura jądra komórkowego Matriks jądrowa - jądro komórkowe pozbawione chromatyny Nukleoplazma Heterochromatyna Euchromatyna Jąderko Otoczka
Bardziej szczegółowoTATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Bardziej szczegółowoBadanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Bardziej szczegółowoLaboratoria.net Innowacje Nauka Technologie
Akceptuję W ramach naszej witryny stosujemy pliki cookies w celu świadczenia państwu usług na najwyższym poziomie, w tym w sposób dostosowany do indywidualnych potrzeb. Korzystanie z witryny bez zmiany
Bardziej szczegółowoEwolucja człowieka. Ślady w ziemi i ślady w genach
Ewolucja człowieka Ślady w ziemi i ślady w genach 1 Złożone zagadki } } Odnaleziono wiele skamieniałości naczelnych, różne gatunki w tym samym czasie Trudno ustalić relacje między nimi } Przodkowie, czy
Bardziej szczegółowoEwolucja złożoności biologicznej
Scala naturae Koncepcja drabiny bytów wywodzi się od Arystotelesa i została włączona przez św. Tomasza z Akwinu do teologii katolickiej Ewolucja złożoności biologicznej Ziemska część skali rozpoczyna się
Bardziej szczegółowoTRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Bardziej szczegółowoBIOTECHNOLOGIA I BIOLOGIA EKSPERYMENTALNA ROŚLIN
BIOTECHNOLOGIA I BIOLOGIA EKSPERYMENTALNA ROŚLIN Udział w międzynarodowych projektach badawczych: Rodzaj projektu: międzynarodowy, współfinansowany Nr grantu: 2904/FAO/IAEA/2013/0 Temat: Pakiet narzędzi
Bardziej szczegółowoDr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
Bardziej szczegółowoż ę ć ę ę ę ę ę ę ę ć Ż ę ę ę ż ę ę ę ę ę Ż ć ż ż ę ż Ę ć ę ż ę ęż ę ę ę ę ż ć ź Ł Ę ę ż Ę ć ę Ż ę ęż ę ę ę ę ż ć ź Ę Ł ę ę Ą ż Ę ż Ę ż Ę ż ę Ą Ą ę Ę ę ę Ż ź Ż Ż ż ć ź ź ę ż Ę ż Ę ę Ę Ę ć ż ę ć ż ć ź Ł
Bardziej szczegółowoć ą ą ą ż ą ż ć Ę ą ą ż ć ą ą ń ą ą ż ń ą ą ą ą ą ą ą ą ż ż ń ą ą ą ż ą ń Ś ą ą Ó ą Ęż ż ń Ś ń ń ń Ę ą ą Ó ń ą ą Ż ą ą Ó ą Ó ą Ż Ó Ó ą Ż ą ą Ó Ó ą ą Ś ą ą ń ń ą ą ą Ó ą Ż Ó ą Ę Ę Ł ą ą Ł Ą Ł Ł Ś ć ą Ś
Bardziej szczegółowoż ż Ę Ę Ę Ó ś ó ę Ć ęż ś ę ę ó ś ę ó ę ę Ę ę ó ść Ę ęć Ż Ś ę ę ę ó ż ż ź ę ż ż ś ę Ó ę ę Ł ęż ś ę ę ó ś ę ż ó Ę ę ę ę ść Ę ę ę ę ęć ę ż ś ę ę ę ę ó ż ę Ł Ę ę ż Ę ęż ś ę ó ę ś ę ż ó ę ę ż ść ę ę ę ę ę ęć
Bardziej szczegółowoZarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Bardziej szczegółowoWARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
Bardziej szczegółowoSpis treści. 1 Budowa genomu jądrowego (M.J. Olszewska, J. Małuszyńska) 13. Przedmowa 10
Spis treści Przedmowa 10 1 Budowa genomu jądrowego (M.J. Olszewska, J. Małuszyńska) 13 1.1. Organizacja DNA jądrowego 13 1.1.1. Rodzaje sekwencji powtarzalnych i ich lokalizacja 14 1.1.1.1. Sekwencje rozproszone
Bardziej szczegółowoRola białek błonowych w odpowiedzi roślin nas abiotyczne czynniki stresowe
Rola białek błonowych w odpowiedzi roślin nas abiotyczne czynniki stresowe Grażyna Kłobus, Zakład Fizjologii Molekularnej Roślin, Instytut Biologii Eksperymentalnej, Uniwersytet Wroicławski Pompy protonowe
Bardziej szczegółowoPodstawy genetyki molekularnej
Podstawy genetyki molekularnej Materiał genetyczny Materiałem genetycznym są kwasy nukleinowe Materiałem genetycznym organizmów komórkowych jest kwas deoksyrybonukleinowy (DNA) 5 DNA zbudowany jest z nukleotydów
Bardziej szczegółowoEpigenome - 'above the genome'
e - 'above the genome' Wydziaª Matematyki i Informatyki UJ Instytut Informatyki 14 stycznia 2013 e Rysunek: ¹ródªo: http://learn.genetics.utah.edu/content/epigenetics/nutrition/ e Plan Genom 1 Genom e
Bardziej szczegółowoEPIGENETYKA. genetyka XXI wieku? HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT. CELE: 1. Identyfikacja - około 25 tys.
EPIGENETYKA genetyka XXI wieku? HUMAN GENOME PROJECT CELE: 1. Identyfikacja - około 25 tys. genów 2. Oznaczenie sekwencji - 3 miliardów par zasad 3. Zgromadzenie informacji w formie bazy danych. Planowany
Bardziej szczegółowoRegulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Bardziej szczegółowo1
PLAN STUDIÓW kierunek BIOTECHNOLOGIA MOLEKULARNA studia drugiego stopnia PIERWSZY ROK STUDIÓW I semestr (zimowy) WBt BT2 001 Biochemia kurs zaawansowany 1 0+5 Z 7 WBt BT2 004 Biotechnologia dla środowiska
Bardziej szczegółowoREGULACJA ROZWOJU (jak z genów odczytywana jest anatomia?)
Wstęp do biologii 7. REGULACJA ROZWOJU (jak z genów odczytywana jest anatomia?) Jerzy Dzik Instytut Paleobiologii PAN Instytut Zoologii UW 2015 WIELOKOMÓRKOWOŚĆ daje korzyści krasnorost sprzed 600 mln
Bardziej szczegółowoplezjomorfie: podobieństwa dziedziczone po dalszych przodkach (c. atawistyczna)
Podobieństwa pomiędzy organizmami - cechy homologiczne: podobieństwa wynikające z dziedziczenia - apomorfie: podobieństwa dziedziczone po najbliższym przodku lub pojawiająca się de novo (c. ewolucyjnie
Bardziej szczegółowoGeny, a funkcjonowanie organizmu
Geny, a funkcjonowanie organizmu Wprowadzenie do genów letalnych Geny kodują Białka Kwasy rybonukleinowe 1 Geny Występują zwykle w 2 kopiach Kopia pochodząca od matki Kopia pochodząca od ojca Ekspresji
Bardziej szczegółowoPlan studiów NA KIERUNKU STUDIÓW WYŻSZYCH: BIOCHEMIA II stopień
Załącznik nr do Uchwały Rady Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ z dnia 9 czerwca 08 r. w sprawie zmian programu i planu studiów na kierunku BIOCHEMIA na poziomie studiów drugiego stopnia
Bardziej szczegółowoDNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro
DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany
Bardziej szczegółowoROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Bardziej szczegółowoPLAN STUDIÓW. Rodzaj zajęć. e-nauczanie,
Załącznik nr 3 do Uchwały Rady Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ z dnia 19 czerwca 2018 r. w sprawie programu i planu studiów na kierunku BIOTECHNOLOGIA MOLEKULARNA na poziomie studiów
Bardziej szczegółowoRecenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
Bardziej szczegółowoLinker histones: global and specific functions
Linker histones: global and specific functions Andrzej Jerzmanowski Zakład Biologii Molekularnej Roślin Uniwersytet Warszawski i Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Linker (H1) histones basic characteristics
Bardziej szczegółowoCzynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Bardziej szczegółowoMetody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
Bardziej szczegółowoktóre wpływałyby na profil transkrypcyjny genomu linii komórkowej T87 w odniesieniu do genomu ekotypu wyjściowego Col-0 (genom referencyjny).
Prof. dr hab. Jan Sadowski Poznań, 23 marca 2017 r. Zakład Biotechnologii Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii Wydział Biologii Uniwersytet im. Adama Mickiewicza ul. Umultowska 89, 61-614 Poznań
Bardziej szczegółowoEwolucja człowieka. Ślady w ziemi i ślady w genach
Ewolucja człowieka Ślady w ziemi i ślady w genach!1 !2 !3 Nie taka prosta historia } mtdna współczesnych Europejczyków różni się od mtdna Europejczyków sprzed 10 000 lat } fala migracji neolitycznej (~
Bardziej szczegółowotranskrypcja chromatyny
transkrypcja chromatyny problem: Jak to może e działać: dysocjacja histonów? kompleks pol II RNA >500 kd skip: split: nukleosom: 145 bp DNA = 100 kd rdzeń histonowy = 100 kd strip: + Skip czy Split czy
Bardziej szczegółowoĆWICZENIA Z BIOCHEMII
ĆWICZENIA Z BIOCHEMII D U STUDENTfiW WYDZIAŁU LEKARSKIEGO Pod redakcją Piotra Laidlera, Barbary Piekarskiej, Marii Wróbel WYDAWNICTWO UNIWERSYTETU JAGIELLOŃSKIEGO ĆWICZENIA Z BIOCHEMII DLA STUDENTÓW WYDZIAŁU
Bardziej szczegółowoWYMAGANIA EDUKACYJNE Z BIOLOGII KLASA 5 DOBRY. DZIAŁ 1. Biologia jako nauka ( 4godzin)
WYMAGANIA EDUKACYJNE Z BIOLOGII KLASA 5 DOPUSZCZAJĄCY DOSTATECZNY DOBRY BARDZO DOBRY CELUJĄCY DZIAŁ 1. Biologia jako nauka ( 4godzin) wskazuje biologię jako naukę o organizmach wymienia czynności życiowe
Bardziej szczegółowoInstytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii
Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii dr hab. Piotr Ziółkowski Przegląd prac dyplomowych w Zakładach Instytutu Biologii Molekularnej i Biotechnologii www.ibmib.amu.edu.pl Instytut Biologii Molekularnej
Bardziej szczegółowodr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
Bardziej szczegółowo