Aneta Gerszberg i Andrzej K. Kononowicz. Zakład Cytogenetyki i Biologii Molekularnej Roślin Uniwersytet Łódzki

Podobne dokumenty
Bloki licencjackie i studia magisterskie na Kierunkach: Biotechnologia, specjalność Biotechnologia roślinna oraz Genetyka

Perspektywy rozwoju biotechnologii w Polsce

Specjalność (studia II stopnia) Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych

Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka

Pytania Egzamin magisterski

Mikroorganizmy Zmodyfikowane Genetycznie

Sylabus Biologia molekularna

Sylabus Biologia molekularna

1. Biotechnologia i inżynieria genetyczna zagadnienia wstępne 13

Sukces kultur in vitro oparty jest na zjawisku totipotencji, czyli nieograniczonej zdolności komórek do dzielenia się i odtwarzania całego organizmu

Ekspresja genów heterogenicznych w drożdżach Pichia pastoris

Inżynieria Genetyczna ćw. 3

Biologia molekularna z genetyką

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

Biotechnologia studia stacjonarne II stopnia - Biotechnologia drobnoustrojów

Księgarnia PWN: Biotechnologia roślin, redakcja naukowa: Stefan Malepszy SPIS TREŚCI

WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP

Laboratorium Pomorskiego Parku Naukowo-Technologicznego Gdynia.

Wybrane zastosowania metod inżynierii genetycznej

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

Biologia molekularna

Rośliny z probówki. Jak powstają? Alina Trejgell & Agata Stawicka, UMK

ETYCZNE ASPEKTY INŻYNIERII GENETYCZNEJ

Nowoczesne systemy ekspresji genów

Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń narządu ruchu

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

LEKI CHEMICZNE A LEKI BIOLOGICZNE

Inżynieria genetyczna

PL B1. Polska Akademia Nauk, Instytut Biochemii i Biofizyki,Warszawa,PL BUP 18/04

Organizmy Modyfikowane Genetycznie Rośliny transgeniczne

Rośliny modyfikowane genetycznie (GMO)

Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów

Pytania Egzamin Licencjacki. 1. Wyjaśnij pojęcie: szybkość reakcji enzymatycznej. Omów metodę wyznaczenia szybkości reakcji enzymatycznej.

Rośliny Genetycznie Zmodyfikowane

Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii

Ekspresja białek w komórkach ssaczych

Zakażenie pszczoły miodnej patogenem Nosema ceranae. Diagnostyka infekcji wirusowych pszczoły miodnej

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Od kapusty do mamuta wyzwania biotechnologii. Renata Szymańska

Pytania Egzamin Dyplomowy Licencjacki

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9

Wprowadzanie zrekombinowanego DNA do komórek bakterii. Sposoby wprowadzania DNA do innych (niż bakterie) typów komórek

Inwestycja w przyszłość czyli znaczenie ochrony własności przemysłowej dla współczesnej biotechnologii

[2ZPK/KII] Inżynieria genetyczna w kosmetologii

TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA

mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii

Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych

KLONOWANIE DNA REKOMBINACJA DNA WEKTORY

Agenda: Wynalazek jako własnośd intelektualna. Co może byd wynalazkiem. Wynalazek biotechnologiczny. Ochrona patentowa

Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:

Informacja na temat obszaru działania jednostek badawczych Uniwersytetu Łódzkiego w Centrum BioTechMed

Ogólnopolski Dzień Biotechnologii DNA encyklopedia życia Kwiecień Prof. dr hab. Małgorzata Robak Uniwersytet Przyrodniczy we Wrocławiu

PROF. DR HAB. EWA SAWICKA-SIENKIEWICZ

Immunogenetyka 1. Jakie są różnice między epitopami rozpoznawanymi przez limfocyty T i B? 2. O czym mówi "hipoteza higieniczna"?

METODYKA STOSOWANA W ZAKŁADZIE BIOLOGII ROZWOJU ROŚLIN

Transgeniczne zwierzęta

Kolory biotechnologii

GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu

Prokaryotyczne i eukaryotyczne systemy nadekspresji bia lek.

Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad

Biotechnologia jest dyscypliną nauk technicznych, która wykorzystuje procesy biologiczne na skalę przemysłową. Inaczej są to wszelkie działania na

Opis efektów uczenia się dla kierunku studiów

BIOTECHNOLOGIA ZAGADNIENIA EGZAMINACYJNE NA MAGISTERSKI EGZAMIN DYPLOMOWY (2017/2018)

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU. Czym są choroby prionowe?

Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu

Wprowadzanie zrekombinowanego DNA do komórek bakterii. Sposoby wprowadzania DNA do innych (niż bakterie) typów komórek

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

WNIOSEK O WYDANIE ZGODY NA ZAMKNIĘTE UŻYCIE GMO

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

UNIWERSYTET WARSZAWSKI. ul. ILJI MIECZNIKOWA 1, WARSZAWA

Zielona biotechnologia

Inżynieria genetyczna PEF Copyright by Polskie Towarzystwo Tomasza z Akwinu

Drożdżowe systemy ekspresyjne

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

SESJA 10 ODPOWIEDŹ ORGANIZMÓW NA CZYNNIKI BIOTYCZNE I ABIOTYCZNE WYKŁADY

Charakterystyka izoenzymów aminotransferazy asparaginianowej z siewek pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)

Zagadnienia na egzamin magisterski na kierunku Biologia Rok akad. 2017/2018

SPIS TREŚCI WYKAZ SKRÓTÓW WSTĘP... 15

Rośliny i żywność genetycznie modyfikowane

KARTA PRZEDMIOTU. 1. Nazwa przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA. 2. Numer kodowy BIO04c. 3. Język, w którym prowadzone są zajęcia polski

Metody badania ekspresji genów

Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny

Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii

Biologia medyczna, materiały dla studentów

Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu prof. dr hab. Krystyna Skwarło-Sońta pracownik emerytowany

ĆWICZENIA Z BIOCHEMII

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca

Warszawa, dnia 3 sierpnia 2016 r. Poz. 1173

Rekombinacja in vitro i wprowadzanie zrekombinowanego DNA do komórek

Profil metaboliczny róŝnych organów ciała

Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna

Techniki molekularne w mikrobiologii SYLABUS A. Informacje ogólne

Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB BN-s Punkty ECTS: 3. Kierunek: Inżynieria Biomedyczna Specjalność: Bionanotechnologie

FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach

GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu

Znaczenie genetyki. Opracował A. Podgórski

Zdobycze biotechnologii w medycynie i ochronie środowiska

Badanie funkcji genu

Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?

Transkrypt:

Aneta Gerszberg i Andrzej K. Kononowicz Zakład Cytogenetyki i Biologii Molekularnej Roślin Uniwersytet Łódzki

Molekularna uprawa Termin molekularna uprawa (ang. molecular farming), odnosi się do produkcji na masową skalę (uprawy polowe) rekombinowanych białek przez rośliny. Możliwość wykorzystania roślin jako systemów produkcyjnych dla białek o znaczeniu farmakologicznym została wykazana w drugiej połowie lat 90. Molekularna uprawa poprzedzona jest identyfikacją białka o pożądanej aktywności terapeutycznej czy diagnostycznej, jego analizą na poziomie molekularnym i wreszcie jego ekspresją w heterologicznym systemie komórkowym.

Zalety molekularnej uprawy możliwość otrzymania materiału roślinnego na masową skalę przy niskich kosztach produkcji; opracowanie skutecznych technik transformacji oraz regeneracji in vitro; obecność eukariotycznych szlaków biosyntezy białek, co pozwala na uzyskanie prawidłowego produktu białkowego; uzyskanie bezpiecznego produktu; nie istnieje bowiem niebezpieczeństwo zakażenia człowieka takimi patogenami jak wirus HIV, priony czy wirus żółtaczki; pominięcie lub uproszczenie procedury oczyszczania produktu białkowego; tkanki mogą być wykorzystane jako jadalne szczepionki; docelowe kierowanie białek do wewnątrzkomórkowych przedziałów np. chloroplastów (transformacja chloroplastów minimalizuje ryzyko horyzontalnego transferu genów oraz umożliwia akumulację produktu białkowego do poziomu 46% całkowitego rozpuszczalnego białka; gwarantuje stabilną ekspresję transgenu).

Wady molekularnej uprawy niewłaściwe wstawienie, integracja genu i w konsekwencji ograniczenie jego ekspresji; możliwość potranskrypcyjnego wyciszenia genu, wtórny i pleiotropowy efekt ekspresji genu, obecność roślinnych specyficznych glikanaz (np. α-1,3-fukozy czy β-1,2-ksylozy), które mogą zmieniać właściwości rekombinowanych białek w roślinach, indukcja insercyjnej mutagenezy będącej wynikiem integracji transgenu w obszarze endogennego genu; horyzontalny transfer genów (złamanie barier międzygatunkowych wśród roślin za pośrednictwem transgenicznego pyłku)

Roślinne kultury tkankowe w produkcji rekombinowanych białek zawiesiny komórkowe kultury korzeniowe kultury somatycznych zarodków

Lista wybranych biofarmaceutyków produkowanych przy wykorzystaniu systemów roślinnych Potencjalne zastosowanie Zapalenie wątroby typu B i C Inhibitor trypsyny dla zabiegów transplantacyjnych Antybakteryjne Hormon wzrostu Oparzenia, operacje chirurgiczne Inhibitor trombiny Kolagen Zabliźnianie ran Roślina transgeniczna Ryż Tytoń Kukurydza Ziemniak Tytoń Tytoń Rzepak Tytoń Tytoń Białko Interferon α Interferon β Aprotynina Laktoferyna Somatotropina Albumina Hirudyna Homotrimeryczny kolagen Czynnik wzrostu Poziom ekspresji - < 0,01 % świeżej masy - 0,10 % 7,00 % 0,02 % 0,30 % < 0,01 % świeżej masy < 0,01 %

Białka i enzymy przemysłowe uzyskiwane z roślin transgenicznych awidyna, lakaza, trypsyna i β-glukuronidaza produkowane w transgenicznej kukurydzy, laktoferyna i β-kazeina produkowane w transgenicznych ziemniakach, bakteryjna celulaza produkowana w Arabidopsis thaliana, ksylanaza grzybowa produkowana w rzepaku i tytoniu, fitaza produkowana w rzepaku, hirudyna w połączeniu z oleozyną produkowaną w rzepaku

Stafylokinaza Stafylokinaza jest białkiem wytwarzanym i wydzielanym przez niektóre szczepy Staphyloccocus aureus,, a także S. epidermidis, S. lentus, S. sciuri, S. lugdunensis, S. xylosus, S. hominis. Obecnie do produkcji stafylokinazy wykorzystuje się różnorodne systemy s ekspresyjne np. Escherichia coli, Proteus mirabilis, Pichia pastoris, Bacillus subtilis.

Model aktywacji plazminogenu przez stafylokinazę wg. Collen i Lijnen, 1993. [1] Plg + Sak Plg - Sak [2] Pli - Sak [3] 1. nieaktywny kompleks Plg Sak 2. generowanie aktywnej plazminy ze stafylokinazą Pli Sak 3. wytwarzanie aktywnej plazminy Plg Pli

W toku naszych dotychczasowych badań skonstruowaliśmy transgeniczne rośliny ziemniaka (Solanum tuberosum cv. Desireé) produkujące białko fuzyjne recsak-mgfp-gus, którego domena recsak wykazuje właściwości amidolityczne, charakteryzujące bakteryjną stafylokinazę. Do transformacji wykorzystano szczep AGL1 Agrobacterium tumefaciens, ze zrekombinowanym plazmidem pcambia1304 zawierającym fuzję genową stafylokinazy i genów reporterowych, pod kontrolą promotora CaMV 35S.

Nośnikiem zrekombinowanego genu stafylokinazy był plazmid binarny pcambia 1304 (Center for the Application of Molecular Biology to International Agriculture, Canberra, Australia). W odcinku T-DNA tego plazmidu znajduje się roślinny gen selekcyjny odporności na higromycynę oraz marker reporterowy w postaci fuzji genowej mgfp5-gusa-his6.

Transformacja Solanum tuberosum za pośrednictwem A. tumefaciens. Histochemiczna analiza poziomu ekspresji β-glukuronidazy. Histochemiczna analiza aktywności β-glukuronidazy in situ. Izolacja genomowego DNA z tkanki S. tuberosum. Amplifikacja DNA techniką PCR. METODY Rozdziały elektroforetyczne w żelach agarozowych. Izolacja białek z tkanki przetransformowanych roślin S. tuberosum. Analiza Western blot oraz elektroforeza białek (SDS-PAGE). Test na aktywność amidolityczną ekstraktu białkowego z transgenicznych roślin S. tuberosum.

A 1 mm 1 mm B Kolejne etapy regeneracji Solanum tuberosum cv. Desireé po transformacji Agrobacterium tumefaciens 1 mm C 1 mm D E 2 mm 2 mm F A i B różnicująca się tkanka kalusowa C G formujące się roślinki H transformant na pożywce selekcyjnej 1 mm G 2 cm H

Regeneranty Solanum tuberosum A roślina kontrolna (z lewej), roślina transgeniczna (z prawej) B rośliny transgeniczne A B

Elektroforegram produktów amplifikacji sekwencji kodującej stafylokinazę na matrycy genomowego DNA S. tuberosum, po transformacji A. tumefaciens. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 kanał 1 wzorzec mas kanał 7 S 24 kanał 2 roślina kontrolna kanał 8 S 25 kanał 3 S 5 kanał 9 S 26 kanał 4 S 7 kanał 10 S 27 kanał 5 S 13 kanał 11 S 28 kanał 6 S 23

Elektroforegram produktów amplifikacji sekwencji kodującej stafylokinazę na matrycy genomowego DNA Solanum tuberosum po transformacji A. tumefaciens. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 kanał 1 wzorzec mas kanał 2 roślina kontrolna kanał 3 S 6 kanał 4 S 8 kanał 5 S 9 kanał 6 S 17 kanał 7 S 18 kanał 8 S 19 kanał 9 S 21 kanał 10 S 22

1 mm A 1 mm B Histochemiczna analiza aktywności β-glukuronidazy w zregenerowanych roślinach Solanum tuberosum. 1 mm C 1 mm D A kontrola negatywna B roślina GUS-pozytywna C-D przykłady chimeryzmu genu gusa w tkankach S. tuberosum E-F mikroskopowa detekcja ekspresji GUS 200 µm E 100 µm F

Analiza Western blot 119 kda 97,4 kda 1 2 3 4 5 2 3 4 5 A B A elektroforeza białek kanał 1 wzorzec mas kanał 2-2 S 6 kanał 3 roślina kontrolna kanał 4 S 8 kanał 5 S 9 B Western blot kanał 4 S 8 kanał 5 S 9

Aktywność amidolityczna stafylokinazy Kontrola Transgeniczne rośliny

WNIOSKI Konstrukcja transgenicznych roślin Solanum tuberosum produkujących białko fuzyjne SAK-mGFP mgfp-gusagusa analiza PCR wykazała a obecność sekwencji sak będącej elementem transgenu CaMV::sak sak-mgfp-gusa gusa w genomowym DNA 22,5% zregenerowanych roślin Solanum tuberosum, ekspresja białka fuzyjnego SAK-mGFP mgfp-gusa GUSA została a potwierdzona testem histochemicznym na aktywność β-glukuronidazy, analiza Western blot ujawniła a obecność stafylokinazy w ekstrakcie białkowym z dwóch na sześć analizowanych roślin, w preparacie białkowym tylko jednej z dotychczas zbadanych roślin, stwierdzono aktywność amidolityczną charakteryzującą stafylokinazę, rozbieżności pomiędzy wynikami analiz PCR, aktywności GUS, Western blot i aktywności amidolitycznej ekstraktów w białkowych wskazują na wysokie prawdopodobieństwo u otrzymanych roślin transgenicznych z jednej strony uszkodzeń lub rearanżacji acji transgenu, z drugiej zaś na możliwo liwość zakłóce ceń w ekspresji genu i aktywności jego produktu białkowego

PODSUMOWANIE Niniejsza praca dostarczyła po raz pierwszy eksperymentalnych dowodów na możliwość wprowadzenia do roślin genu kodującego stafylokinazę, jego ekspresję w otrzymanych roślinach oraz uzyskania tą drogą produktu białkowego wykazującego właściwości amidolityczne. Praca ta dowodzi możliwości wykorzystania roślin jako naturalnych bioreaktorów do produkcji rekombinowanej stafylokinazy, białkowego aktywatora plazminogenu, preparatu białkowego do wykorzystania w terapii chorób układu krążenia krwi u człowieka, spowodowanych wewnątrznaczyniowymi zakrzepami.

Andrzej K. Kononowicz Aneta Gerszberg Piotr Łuchniak Joanna Kaźmierczak Uniwersytet Łódzki Aneta Wiktorek-Smagur Katarzyna Hnatuszko Tomasz Sakowicz Uniwersytet Medyczny Janusz Szemraj Tadeusz Pietrucha