Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów

Transkrypt

1 Zawartość Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej 3.3. Budowa cząstek wirusowych o strukturze ikosaedralnej 3.4. Osłonki wirusowe 3.5. Wirusy o złożonej strukturze wirionu 4. Poznanie sekwencji nukleotydowej genomów wirusowych 4.1. Sekwencje nukleotydowe genomów wirusowych 4.2. Analiza sekwencji genomowych 4.3. Analiza sekwencji aminokwasów w cząsteczkach białek 5. Białka wirusowe 5.1. Białka strukturalne 5.2. Wirionowe białka enzymatyczne 5.3. Białka enzymatyczne powstające w fazie namnażania 5.4. Potranslacyjna modyfikacja białek 6. Organizacja i struktura genomów wirusów typu (+)RNA 6.1. Struktury drugorzędowe 6.2. Struktury trzeciorzędowe 6.3. Struktura i organizacja genomu wirusów zawierających jako genom RNA o dodatniej polarności Budowa genomu wirusów prokariotycznych Budowa i struktura genomu wirusów eukariotycznych 7. Struktura i organizacja genomów wirusów typu (-)RNA 7.1. Wirusy o genomie jednosegmentowym 7.2. Wirusy o genomie wielosegmentowym 8. Struktura i organizacja genetyczna genomu wirusów typu RNA zawierających dwuniciowy RNA (dsrna wirusy) 8.1. Wirusy o genomie jednosegmentowym 8.2. Wirusy o genomie wielosegmentowym Birnawirusy Reoviridae Rotawirusy Reowirusy Fitowirusy 9. Struktura i organizacja genetyczna wirusów typu DNA 9.1. Wirusy zawierające jako genom jednoniciowy DNA 9.2. Wirusy zawierające jako genom dwuniciowy kolisty DNA 9.3. Wirusy zawierające jako genom dwuniciowy liniowy DNA

2 10. Struktura i organizacja genomu wirusów wykorzystujących odwrotną transkryptazę w wewnątrzkomórkowym cyklu rozwojowym Retrowirusy Wirusy typu DNA wykorzystujące odwrotną transkryptazę 11. Zmienność genetyczna wirusów Zmienność mutacyjna Rearanżacje materiału genetycznego wirusów Rekombinacja homologiczna genomowego DNA Rekombinacja genomu retrowirusów Rekombinacja umiejscowiona (niehomologiczna) Rekombinacja RNA wirusów Nabywanie sekwencji liderowych jako specyficzny typ rekombinacji Rekombinacja w warunkach naturalnych Rekombinacja a powstawanie defektywnych cząsteczek interferujących Struktura genomów wirusów defektywnych typu RNA, mechanizm powstawania i zjawisko interferencji Defektywne cząstki (+)RNA wirusów Efekt biologiczny cząstek defektywnych wirusów typu RNA Defektywne wirusy typu DNA Rearanżacja genomowa rotawirusów Reasortacja genetyczna Niegenetyczne oddziaływania pomiędzy wirusami 12. Namnażanie wirusów Etapy procesu namnażania wirusów Etapy wczesne Wirusy prokariotyczne: adsorpcja i penetracja Losy DNA fagowego w komórce Wnikanie wirusów zwierzęcych do komórki Receptory wirusowe Receptory pikornawirusów i hipoteza kanionu Usuwanie płaszcza wirusowego pod wpływem oddziaływań receptora komórkowego z wirusem Wiązanie się wirusów poprzez receptory wirusowe zlokalizowane w białkach osłonki Wnikanie cząstek wirusowych do komórki i przechodzenie do jądra 13. Ekspresja materiału genetycznego wirusów typu RNA Ekspresja materiału genetycznego prokariotycznych (+)RNA wirusów Ekspresja materiału genetycznego eukariotycznych (+)RNA wirusów Regulacja na poziomie transkrypcji Regulacja na poziomie translacji Regulacja ekspresji genów wirusów typu (+)RNA na poziomie translacji Translacyjne odkodowywanie informacji Potranslacyjna obróbka proteolityczna białek Ekspresja genów wirusów wykorzystujących obróbkę proteolityczną białek jako podstawową strategię rozwoju Kontrola ekspresji genów wirusów wykorzystujących mechanizmy kontrolne na poziomie transkrypcji i translacji Wirusy nie wykorzystujące obróbki proteolitycznej do ekspresji materiału genetycznego 14. Ekspresja genów wirusów zawierających jako genom RNA o ujemnej polarności Ekspresja genów wirusów o genomie w postaci pojedynczego segmentu (-)RNA

3 Mechanizm transkrypcji Mechanizm ekspresji genów wirusów o genomie w postaci kilku segmentów (-)RNA 15. Ekspresja genomu eukariotycznych dsrna wirusów 16. Ekspresja materiału genetycznego wirusów prokariotycznych o genomie w postaci DNA Prokariotyczne DNA wirusy Bakteriofagi zawierające genom ssdna Bakteriofagi zawierające genom dsdna Bakteriofagi zdolne do wywołania wyłącznie cyklu litycznego Rola czynników komórkowych w rozwoju Coliphage T Bacillus phage Φ Coliphage T Bacillus phage SPO Bakteriofagi zdolne do wywołania lizogenii Ekspresja genów faga lambda 17. Ekspresja materiału genetycznego wirusów eukariotycznych o genomie w postaci DNA Ekspresja genów eukariotycznych wirusów o genomie w postaci ssdna Ekspresja genów eukariotycznych wirusów o genomie w postaci dsdna 18. Ekspresja i replikacja materiału genetycznego wirusów typu RNA i DNA, w których cykl replikacyjny zachodzi z udziałem odwrotnej transkryptazy Ekspresja materiału genetycznego i replikacja retrowirusów Synteza prowirusowego DNA Integracja Regulacja ekspresji materiału genetycznego retrowirusów Wirusy gąbczaste Endogenne retrowirusy Ekspresja materiału genetycznego wirusów typu DNA wykorzystujących odwrotną transkryptazę 19. Replikacja genomowego RNA o polarności dodatniej Białka wirusowe biorące udział w replikacji genomu Rola białek komórkowych w replikacji genomu (+)RNA wirusów Rola błon komórkowych w replikacji Modele replikacji (+)RNA wirusów Replikacja RNA bakteriofagów Mechanizm replikacji genomowego RNA wirusów eukariotycznych Replikacja wirusów nie mających białka VPg na końcu 5' 20. Replikacja genomowego RNA o polarności ujemnej 21. Replikacja genomu wirusów o genomie dsrna 22. Replikacja genomowego DNA wirusów prokariotycznych Replikacja DNA fagów o genomie ssdna Replikacja DNA faga lambda Replikacja Bacillus phage Φ29 (bakteriofaga Φ29) Replikacja DNA Coliphage T7 (faga T7) Replikacja Coliphage T4 (faga T4) 23. Replikacja genomowego DNA wirusów eukariotycznych

4 23.1. Replikacja DNA papowawirusów Replikacja DNA parwowirusów Replikacja DNA geminiwirusów Replikacja DNA adenowirusów Replikacja DNA herpeswirusów Replikacja DNA pokswirusów Replikacja DNA bakulowirusów 24. Składanie i dojrzewanie cząstek wirusowych Składanie i dojrzewanie bakteriofagów Składanie bakteriofagów o strukturze helikalnej i ikosaedralnej Składanie bakteriofagów o złożonej strukturze Uwalnianie cząstek fagowych z komórki Składanie cząstek wirusów eukariotycznych Składanie cząstek zawierających osłonki; retrowirusy 25. Mechanizm patogenności wirusów Zakażenie wirusowe Zakażenie wywołane wirusami roślinnymi Czynniki wirusowe determinujące przenoszenie Przenoszenie wirusów w roślinie Patogenność wirusów roślinnych Zakażenie wirusami zwierzęcymi Drogi zakażenia Przebieg zakażenia wirusowego Choroby wirusowe człowieka Patogenność wirusów Uszkadzanie komórek Hamowanie transkrypcji Hamowanie procesu translacji Fuzja błon komórkowych Apoptoza Stan niedoboru układu odpornościowego wywoływany przez wirusy Transformacja nowotworowa wywołana przez wirusy Przeciwwirusowe mechanizmy obronne gospodarza Interferony Apoptoza Odporność komórkowa Odpowiedź humoralna Sposoby unikania działania sił obronnych przez wirusy Przeciwwirusowe mechanizmy obronne roślin 26. Nietypowe formy patogenne, czynniki subwirusowe Satelity Wiroidy Replikacja Pospiviroidae Replikacja Avsunviroidae Patogenność wiroidów Organizacja i ekspresja wirusa zapalenia wątroby typu delta Replikacja HDV Priony

5 27. Nowo wyłaniające się choroby wirusowe 28. Szczepionki przeciwwirusowe Pytania i problemy Wybrane definicje, skróty i symbole Skorowidz