Spokrewnienie i inbred w małej populacji



Podobne dokumenty
W CZASIE WYKŁADU TELEFONY KOMÓRKOWE POWINNY BYĆ WYŁĄCZONE LUB WYCISZONE MAPY

Małgorzata Żak. Zapisane w genach. czyli o zastosowaniu matematyki w genetyce

DARIUSZ KULMA. Jak zdać maturę. z matematyki. na poziomie rozszerzonym DLA BYSTRZAKÓW I NIE TYLKO! WYDAWNICTWO ELITMAT Mińsk Mazowiecki 2013

PRAWO CZYSTOŚCI GAMET (I Prawo Mendla) RELACJE MIĘDZY ALLELAMI TEGO SAMEGO GENU

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT

Podstawy genetyki. ESPZiWP 2010

WYZNACZANIE OGNISKOWEJ SOCZEWEK CIENKICH ZA POMOCĄ ŁAWY OPTYCZNEJ

5. Zadania tekstowe.

1. Analiza asocjacyjna. Cechy ciągłe. Cechy binarne. Analiza sprzężeń. Runs of homozygosity. Signatures of selection

Raport na temat stężenia fluorków w wodzie przeznaczonej do spożycia przez ludzi będącej pod nadzorem PPIS w Gdyni za 2006 rok

i na matematycznej wyspie materiały dla ucznia, pakiet 89, s. KARTA:... Z KLASY:...

Selekcja, dobór hodowlany. ESPZiWP

Trapez. w trapezie przynamniej jedna para boków jest równoległa δ γ a, b podstawy trapezu. c h d c, d - ramiona trapezu α β h wysokość trapezu

Komisja Egzaminacyjna dla Aktuariuszy LII Egzamin dla Aktuariuszy z 15 marca 2010 r. Część I Matematyka finansowa

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 1 Biologia I MGR /

DZIAŁ 2. Figury geometryczne

Zarządzanie populacjami zwierząt. Czynniki zaburzające równowagę Wykład 2

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt

Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej

BLISKIE SPOTKANIA Z BIOLOGIĄ

Podstawy genetyki człowieka. Cechy wieloczynnikowe

PODSTAWY GENETYKI. Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk

GENETYCZNE PODSTAWY ZMIENNOŚCI ORGANIZMÓW ZASADY DZIEDZICZENIA CECH PODSTAWY GENETYKI POPULACYJNEJ

GENETYKA POPULACJI. Fot. W. Wołkow

Twoje zdrowie -isamopoczucie

Zadania. I. Podzielność liczb całkowitych

Genetyka Populacji

GENETYKA POPULACJI. Ćwiczenia 4 Biologia I MGR

Regionalne Koło Matematyczne

Przepisy Hokeja na Trawie Hala

a) Zapisz genotyp tego mężczyzny... oraz zaznacz poniżej (A, B, C lub D), jaki procent gamet tego mężczyzny będzie miało genotyp ax b.

Macierze substytucji. PAM - Point Accepted Mutations Margaret Dayhoff Macierze substytucji zależna od prawdopodobieństwa mutacji

Projekt współfinansowany przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. best in training PRE TEST

Plan wykładów z genetyki ogólnej

WYŻSZA SZKOŁA INFORMATYKI STOSOWANEJ I ZARZĄDZANIA

Mapowanie genów cz owieka. podstawy

nosiciel choroby chora. mężczyzna kobieta. pleć nieokreślona. małżeństwo rozwiedzione. małżeństwo. potomstworodzeństwo

Komisja Egzaminacyjna dla Aktuariuszy LIX Egzamin dla Aktuariuszy z 12 marca 2012 r. Część I Matematyka finansowa

Dziedziczenie poligenowe

Autor: Zbigniew Tuzimek Opracowanie wersji elektronicznej: Tomasz Wdowiak

Podłoże genetyczne fakomatoz - dziedziczenie, zmienność, możliwości diagnostyczne. Fakomatozy. Fakomatozy. Nerwiakowłókniakowatość typu I

PODSTAWY BIOINFORMATYKI 11 BAZA DANYCH HAPMAP

GENETYKA. Genetyka. Dziedziczność przekazywanie cech rodziców potomstwu Zmienność występowanie różnic pomiędzy różnymi osobnikami tego samego gatunku

KONKURS MATEMATYCZNY dla uczniów gimnazjów w roku szkolnym 2012/13. Propozycja punktowania rozwiązań zadań

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

h a V. GEOMETRIA PŁASKA TRÓJKĄT :

MATeMAtyka 3 inf. Przedmiotowy system oceniania wraz z określeniem wymagań edukacyjnych. Zakres podstawowy i rozszerzony. Dorota Ponczek, Karolina Wej

Ruch unoszenia, względny i bezwzględny

UŻYWANIE SUBSTANCJI PSYCHOAKTYWNYCH PRZEZ MŁODZIEŻ 2005

symbol dodatkowy element graficzny kolorystyka typografia

Biologia medyczna, lekarski Ćwiczenie ; Ćwiczenie 19

Dziedziczenie cech sprzężonych, crossing-over i mapy chromosomów

2. PODSTAWY STATYKI NA PŁASZCZYŹNIE

Analiza sprzężeń u człowieka. Podstawy

Algorytm genetyczny (genetic algorithm)-

Identyfikacja parametrów modelu maszyny synchronicznej jawnobiegunowej

1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia

Podsumowanie wyników ankiet dotyczących żywienia w sklepikach szkolnych.

Imię i nazwisko...kl...

ω a, ω - prędkości kątowe członów czynnego a i biernego b przy

Wprowadzenie do genetyki medycznej i sądowej

Kodowanie liczb. Kodowanie stałopozycyjne liczb całkowitych. Niech liczba całkowita a ma w systemie dwójkowym postać: Kod prosty

Semantyka i Weryfikacja Programów - Laboratorium 2 Działania na ułamkach, krotki i rekordy

Wektor kolumnowy m wymiarowy macierz prostokątna o wymiarze n=1 Wektor wierszowy n wymiarowy macierz prostokątna o wymiarze m=1

Zadania z genetyki. Jacek Grzebyta. 21.XII.2005 version Powered by Λ. L A TEX 4 Unicode

w sprawie rodzajów dokumentacji medycznej w zakładach opieki zdrowotnej, sposobu jej prowadzenia

Opracowanie zbiorcze wyników ankiet przeprowadzonych wśród rodziców na temat koncepcji pracy szkoły szkoły.

Napisz, który z przedstawionych schematycznie rodzajów replikacji (A, B czy C) ilustruje replikację semikonserwatywną. Wyjaśnij, na czym polega ten

JEDNOŚĆ O R G R N ŻYDÓW PO LSKICH.

INSTRUKCJA. - Jak rozwiązywać zadania wysoko punktowane?

Projektas Standartizuotų mokinių pasiekimų vertinimo ir įsivertinimo įrankių bendrojo lavinimo mokykloms kūrimas, II etapas

Katalog produktów. Kuźnia Batory

Sekwencjonowanie nowej generacji i rozwój programów selekcyjnych w akwakulturze ryb łososiowatych

RBD Relacyjne Bazy Danych

2. Rozdział materiału genetycznego w czasie podziałów komórkowych - mitozy i mejozy

do Regulaminu przyznawania środków finansowych na rozwój przedsiębiorczości w projekcie Dojrzała przedsiębiorczość

1.6. Ćwiczenia w ciąży

Genetyka populacyjna. Populacja

Metabolizm i biochemia

Prosta metoda sprawdzania fundamentów ze względu na przebicie

prof. dr hab. inż. Marta Kasprzak Instytut Informatyki, Politechnika Poznańska

REPLIKACJA DNA REPLIKACJA DNA CYKL ŻYCIOWY KOMÓRKI

BIOINFORMATYKA 8. Analiza asocjacyjna - teoria

6. Uzupełnij zdanie, wstawiajac w odpowiednie miejsce wyrażenie ujawni się lub nie ujawni się :

Co można zrobić za pomocą maszyny Turinga? Wszystko! Maszyna Turinga potrafi rozwiązać każdy efektywnie rozwiązywalny problem algorytmiczny!

Wektory [ ] Oczywiście wektor w przestrzeni trójwymiarowej wektor będzie miał trzy współrzędne. B (x B. , y B. α A (x A, y A ) to jest wektor


lek.wet. Agnieszka Dereczeniuk

ANALIZA ANKIETY SKIEROWANEJ DO UCZNIÓW ZESPOŁU SZKÓŁ

DZIEDZICZENIE UMASZCZENIA U PINCZERÓW ŚREDNICH. Marta Gotowiecka (hodowla Casarius)

Podstawy genetyki. Genetyka klasyczna, narzędzia badawcze genetyki

Biologiczne podstawy ewolucji. Informacja genetyczna. Co to jest ewolucja.

Ekologia molekularna. wykład 14. Genetyka ilościowa

Ćwiczenie 3/4. Prawa Mendla: zadania, analiza rodowodów Sprzężenia i odległość genetyczna. Kariotypy i chromosomopatie. Prof. dr hab.

Ewolucjonizm NEODARWINIZM. Dr Jacek Francikowski Uniwersyteckie Towarzystwo Naukowe Uniwersytet Śląski w Katowicach

Polskie Towarzystwo Ludoznawcze WZORNIK IDENTYFIKACJI WIZUALNEJ

4. RACHUNEK WEKTOROWY

PODSTAWY BAZ DANYCH Wykład 3 2. Pojęcie Relacyjnej Bazy Danych

Metoda kropli wosku Renferta

MARKERY MIKROSATELITARNE

Transkrypt:

Spokrenienie i inre młej populcji Zuz Nok Dory hooc. Dory hooc to oso, któr sposó śiomy prozi prcę selekcyjną y utrzymć zierzęt orej konycji i polepszć ich prmetry użytkoe 2 1

Pul geno Pul genó kżego orgnizmu jest stł i niezmienn przez cłe życie Pul genó kżego gtunku jest stł, lecz licz rintó nego genu może yć zmienn zleżności o rsy/ populcji Dl gtunku Homo spiens opisno ok 20,5tys genó koujących różnego rozju iłk lu łńcuchy minoksoe (skłoe iłek) Przypuszcz się, że ¼ genó luzkich jest IDENTYCZNA z genmi Cnis lupus fmiliris, ½ genó luzkich m soje opoieniki (nieientyczne ersje) genomie ps ni oioły, że licz okrytych iłek syntetyzonych orgnizmie jest 5 rzy iększ niż licz opisnych genó 3 Ską ierze się zmienność genetyczn? Allele to rinty jenego genu DNA Allel ziki Allel zmutony Allel zmutony (ktyny) (niektyny) (ktyny) GEN-A GEN- GEN-A* trnskrypcj trnskrypcj trnskrypcj trnskrypcj RNA RNA RNA RNA trnslcj trnslcj trnslcj IAŁKO IAŁKO IAŁKO IAŁKO Śrenie propooieństo utrleni nturlnej mutcji to 10-6 Tkie tempo utrleni mutcji nie pozoliło y n efektyną eolucję orgnizmó! 4 2

Ską ierze się zmienność genetyczn? Zjisko rekomincji (crossing over) ystępuje poczs kżorzoego torzeni się gmet i przyczyni się o postni NOWYCH UKŁADÓW poszczególnych rintó genó Rekomincj mięzy genmi zchozi tylko tey, gy znjują się one chromosomch homologicznych, jej propooieństo rośnie rz ze ziększniem się oległości mięzy genmi Rekomincję możn zoseroć, gy śró genotypó potomst znją się genotypy inne niż rozicó 5 Ską ierze się zmienność genetyczn? Rekomincj zchozi mięzy kżą prą chromosomó homologicznych poczs ytrzni gmet, zróno męskich jk i żeńskich. Częstość zchozeni rekomincji pomięzy genmi znjującymi się chromosomie jest zleżn o: ) oległości pomięzy nimi; ) położeni genó chromosomie- geny znjujące się części ośrokoej chromosomu (przy przeężeniu pierotnym- centromerze), ęą uległy crossing over rzziej niż geny położone ystlnie (przy telomerch). Rekomincj nego ocink chromosomu może ystąpić rzy i tey jest on niezużln! 6 3

Ską ierze się zmienność genetyczn? A A A x A A A A A A 7 Ską ierze się zmienność genetyczn? Noe mutcje ziększją liczę rintó genó le nie kży noy rint ęzie ktyny Rekomincj nie pły n liczę rintó genó le n liczę ich komincji! Sprzężenie genó oji się rkiem rekomincji W- hite - lue eye D- efness Wszystkie 3 geny (grupy genó) znjują się tym smym chromosomie rzo lisko sieie Istnieje tylko ok 5% szns n rekomincję mięzy genmi W i orz ok 10% mięzy genmi i D 8 4

Ską ierze się zmienność genetyczn? W W D D iły; łękitne oczy; głuchy kolor; koloroe oczy; słyszący D W D W W D 10% 5% 0,5% 9 Ską ierze się rk zmienności? Ujenolicenie fenotypoe rsy, to selekcj kierunku określonych cech i kojrzenie poonych o sieie osonikó Pooieństo njczęściej ynik z pokreieńst Osoniki nleżące o tej smej rsy są ięc rziej spokrenione ze soą niż z osonikmi innych rs Jest to cłkoicie nturlne! 10 5

Kiey rk zmienności przestje yć nturlny? Mo n.. ną cechę np. typ umszczeni itp.. Wszyscy chcemy mieć ppierch rzo utytułonego rozic. Pomyłki roooch. Wyór osonikó o kryci jest zyt mły. 11 Czym jest inre? Jest to ziększenie się ukłó homozygotycznych u pojeynczego osonik, ęącego potomkiem kojrzeni kreniczego ukł homozygotyczny= ientyczne rinty (llele) tego smego genu ukł heterozygotyczny= różne rinty (llele) tego smego genu 12 6

Czym jest inre? 50% ukłó homozygotycznych! 16 16 8:8 x x x 8:8 8:8 8:8 8:8 rk ukłó homozygotycznych 25% ukłó homozygotycznych 13 Kiey inre jest nieezpieczny? Niektyne rinty genó mją n ogół chrkter recesyny Kiey genomie gromzą się ukły homozygotyczne niektynych rintó genó ochozi o ujnieni się rku proukonego iłk fenotypie ukł ominujący heterozygot ukł recesyny heterozygot heterozygot heterozygot 14 7

Kiey inre jest nieezpieczny? Gromzenie ukłó homozygotycznych niektynych rintó genó prozi o zjisk epresji inreoej- ystąpienie tego zjisk yzncz grnice iologicznej ytrzymłości orgnizmó; postrzegn jest l cłej populcji Depresj inreo oji się: oniżeniem plenności; częstymi upkmi młoych, przeczesnymi ojmi strzeni się, częstą zplnością n choroy itp. Żey móić o ystąpieniu epresji inreoej, musi zostć zoseronych iększość opisnych symptomó populcji/rsie Tempo nrstni inreu ęzie zleżne: - o intensyności selekcji (ysoko lu nisko postionej poprzeczki ymgń, jkie musi spełnić reprouktor) - o kierunku selekcji (ilości i chrkteru cech, n które ęziemy zrcć ugę przy yorze reprouktor) 15 Kiey inre jest nieezpieczny? 1 0,9 0,8 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 32 19 47 28 29 26 25 27 58 16 10 34 4 3 1 57 12 56 9 66 59 31 30 14 60 49 13 63 23 46 5 42 16 8

Kiey inre jest nieezpieczny? Pojeynczy słupek pokzuje pulę genetyczną pojeynczego ps. Kolor ozncz konkretny rozj genó/mrkeró genetycznych. Osonik o zróżniconych gench ęzie mił iele koloró soim słupku. Jeśli osoniki mją słupek jenokoloroy (lu prie jenokoloroy), śiczy to o ich młej zmienności genetycznej. N igrmie prezentone są psy pochozące z 6 rs (o leej o prej). Osoniki przynleżne o pierszych pięciu rs zostły ujenolicone z penością nie tylko fenotypoo le i genetycznie. Selekcj prozon kżej z tych rs oproził o ngromzeni się konkretnych form genó, jenocześnie eliminując inne formy. Osoniki reprezentujące osttnią rsę ykzują zróżniconie z przegą grupy genó (jenego koloru), n które nej rsie njpropooniej prozon jest selekcj. 17 Jk ronić się prze nrstniem inreu? Genom ps zostł oczytny 10 lt temu Do tej pory opisno 650 cech/ zieziczonych genetycznie W tym 257, zieziczonych sposó prosty (łty o przeizeni) W tym 187 cech/, które jesteśmy stnie zignozoć 18 9

Jk ronić się prze nrstniem inreu? Płytk mikromcierzy DNA m ługość óch zpłek i służy o nlizy zmienności 170tys miejsc genomie Możn niej nlizoć jenocześnie DNA o 12 psó T i poone techniki stosone są o 5 lt poszukiniu ziązkó mięzy ystąpieniem cechy potencjlną zminą/zmiennością genomie- meto GWAS (Genome Wie Assocition Stuies) Tką metoą potierzono, że ysplzj stu ioroego jest cechą poligeniczną potencjlne geny z nią opoiezilne znjują się 24, 26 i 34 chromosomie. Dokłn licz tych genó i ich rol nie jest jeszcze poznn! Stierzono rónież, że poligeniczny chrkter tej y przyczyni się o jej pojieni u osonikó pochozących o rozicó olnych o ysplzji. Meto t pozolił rónież yoręnić chromosomie 3 recesyny gen FJE (enign Fmilil Juvenile Epilepsy), opoiezilny z nrcjącą pczkę ogniskoą (formę epilepsji ystępującą u młoych psó) rsie Lgotto Romgnolo. Gen znnyistnieje test 19 Prolemy ze zyt użą zmiennością Rsy tk różnią się o sieie, że ich oręie utrliły się zupełnie różne rinty tego smego genu- truno jest skonstruoć jeen unierslny test genetyczny, ponież te sme ojy chorooe mogą ynikć z innego rintu mutcji! Inny typ mutcji genie SLC (SoLute Crier fmily) ęzie opoił z pojienie się cystynurii (torzenie krysztłó cysteinoych moczu) u lroró i noofunlnó, inny u ustrlijskich psó psterskich jeszcze inny u minituroych pinczeró Choro spichrzenio (gngliozyoz)- postępując ysfunkcj neroo-mięśnio i zurzeni rozoju n skutek gromzeni się glikolipiu tknkch. Husky, egle, Springer Spniel- jeen typ mutcji; Chin jpoński- rugi typ mutcji; Golen Retriver; Toy puel- trzeci typ mutcji! Wieloogniskoe zyronienie sitkóki (3 typy mutcji); 1- ulog merykński i ngielski, Austrlin Shepher, ull Mstiff, Dog e oreux, Itlin Cne Corso, Perro e Pres Cnrio 2- Lror Retriver 3- Lpoński pies stróżujący (Lpinporokoir) Rozj mutcji ęzie efinioł rozj testu, którym mnożn ną mutcję ykryć! Dltego, tk jk ymienionych przypkch nie ystrczy informcj, że możn zroić psu test n nosicielsto ąź ystąpienie nej y. Nleży oiezieć się, czy ny test pozoli n ykrycie nego RODZAJU mutcji. Dne n temt zieziczeni cech u psó możn znleźć po resem: http://omi.ngis.org.u/home/ 20 10

Co możn zroić? Nooczesne nrzęzi pozlją n przeprozenie selekcji ykorzystującej iele źróeł informcji- trze z nich korzystć! Postą jest jenk: - rzetelność informcji ostrcznej przez hoocó o sekcji - przepły informcji pomięzy sekcjmi - zioroe ni - pomoc Ziązku Kynologicznego zoyniu funuszy n ni eksperymentlne 21 11