BIOLOGIA KOMÓRKI. Techniki generowania heterokariontów

Podobne dokumenty
BIOLOGIA KOMÓRKI. Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli wewnątrzkomórkowych

BIOLOGIA KOMÓRKI. Mikroskopia fluorescencyjna -2 Przyżyciowe barwienia organelli wewnątrzkomórkowych

BIOLOGIA KOMÓRKI. Podstawy mikroskopii fluorescencyjnej -1 Barwienia przyżyciowe organelli komórkowych

BIOLOGIA KOMÓRKI KOMÓRKI EUKARIOTYCZNE W MIKROSKOPIE ŚWIETLNYM JASNEGO POLA I KONTRASTOWO- FAZOWYM; BARWIENIA CYTOCHEMICZNE KOMÓREK

BIOLOGIA KOMÓRKI. Ocena końcowa z kursu będzie liczona jako: 20% oceny z ćwiczeń 80% oceny z egzaminu

Metody immunocytochemiczne. Barwienie fluorescencyjne komórek prawidłowych i nowotworowych PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI (BT 206, BT 231)

Metody immunocytochemiczne. Barwienie fluorescencyjne komórek prawidłowych i nowotworowych PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI (BT 106)

BIOLOGIA KOMÓRKI ANALIZA AKTYWNOŚCI ENDOCYTARNEJ KOMÓREK

BIOLOGIA KOMÓRKI DLA BIOCHEMIKÓW. Podstawy mikroskopii fluorescencyjnej -1 Barwienia przyŝyciowe organelli komórkowych

BIOLOGIA KOMÓRKI. Testy witalności komórek

POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI. Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ

Wykorzystanie metod immunocytochemicznych w diagnostyce medycznej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI (BT 206, BT 231)

BIOLOGIA KOMÓRKI BANKOWANIE KOMÓREK

BIOLOGIA KOMÓRKI. Analiza żywotności komórek w warunkach in vitro

Prezentacja: Katarzyna Świtoń

Wykorzystanie metod immunocytochemicznych w diagnostyce medycznej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI (BT 206, BT 231)

Tematy- Biologia zakres rozszerzony, klasa 2TA,2TŻ-1, 2TŻ-2

Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii. Biologia komórki nowotworowej: Ćwiczenie B

Prezentuje: Magdalena Jasińska

Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej

WYKORZYSTANIE TECHNIKI ZAPŁODNIENIA

The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals

Temat ćwiczenia: Techniki stosowane w badaniach toksyczności in vitro

I nforma cje ogólne. I stopnia X II stopnia. - zaliczenie

TEST Z CYTOLOGII GRUPA II

Z47 BADANIA WŁAŚCIWOŚCI ELEKTROFIZJOLOGICZNYCH BŁON KOMÓRKOWYCH

Informacje ogólne. Wydział PUM. Specjalność - jednolite magisterskie * I stopnia X II stopnia. Poziom studiów

Transformation of Sperm Nuclein to Metaphase Chromosomes in the Cytoplasm of Maturing Oocytes of the Mouse.

Właściwości błony komórkowej

Komórki macierzyste zastosowania w biotechnologii i medycynie BT Metody identyfikacji i fenotypowania populacji komórek macierzystych

Mikroskopia fluorescencyjna

Separacja komórek w gradiencie gęstości PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI (BT 231)

AUTOREFERAT ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. The role of Sdf-1 in the migration and differentiation of stem cells during skeletal muscle regeneration

I nforma cje ogólne. I stopnia X II stopnia. - zaliczenie

Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów

Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć

PODSTAWY BIOLOGII KOMÓRKI. Bankowanie komórek i ocena ich żywotności

KARTA PRZEDMIOTU CYTOFIZJOLOGIA/SYLABUS

Podstawy mikrobiologii. Wirusy bezkomórkowe formy materii oŝywionej

Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu

Transport przez błony

Informacje ogólne. Wydział PUM. Specjalność - jednolite magisterskie * I stopnia X II stopnia. Poziom studiów

Pytania Egzamin magisterski

PODSTAWY BIOLOGII KOMÓRKI. Bankowanie komórek i ocena ich żywotności

TEST Z CYTOLOGII - GRUPA I

Funkcje błon biologicznych

RAPORT Z BADAŃ 01369/2015/D/AGST. Blirt S.A Gdańsk, ul. Trzy Lipy 3/1.38. Dział DNA-Gdańsk. Nr zlecenia

XLII Liceum Ogólnokształcące im. M. Konopnickiej w Warszawie

WYDZIAŁ LEKARSKI II. Poziom i forma studiów. Osoba odpowiedzialna (imię, nazwisko, , nr tel. służbowego) Rodzaj zajęć i liczba godzin

Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej

Biologia medyczna. 3 obligatoryjny Polski. Wiedza z zakresu zjawisk biologicznych opanowana na wcześniejszych etapach edukacji. Kierunek: Fizjoterapia

DNA musi współdziałać z białkami!

Podział komórkowy u bakterii

Podział tkanki mięśniowej w zależności od budowy i lokalizacji w organizmie

Novabeads Food DNA Kit

THAMNOTOXKIT F Procedura testu

Informacje ogólne. Wydział PUM. Specjalność - jednolite magisterskie X * I stopnia II stopnia. Poziom studiów

Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej

KARTA KURSU. Kod Punktacja ECTS* 3. Poznanie sposobów i typów hodowli komórek i tkanek zwierzęcych oraz metodyki pracy w warunkach sterylnych.

Eukariota - błony wewnątrzkomórkowe. Błony wewnętrzne stanowiące granice poszczególnych. przedziałów komórki i otaczające organelle komórkowe

VIII Bałtycki Festiwal Nauki Koło Studentów Biotechnologii PG

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Nowoczesne systemy ekspresji genów

Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń narządu ruchu

ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW

ZAKRES TREŚCI: 1. budowa chemiczna organizmów 3. lokalizacja DNA w komórce 2. budowa i funkcjonowanie komórki 4. budowa i właściwości DNA.

OSTRACODTOXKIT F Procedura testu

Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii. Izolacja mitochondriów z komórek eukariotycznych

KARTA KURSU. Biotechnology in Environmental Protection. Kod Punktacja ECTS* 1

Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.

OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA ARKUSZ KALKULACYJNY OKREŚLAJĄCY CENĘ OFERTY. zestaw 4

ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN

Granudacyn. Nowoczesne i bezpieczne przemywanie, płukanie i nawilżanie ran.

Część praktyczna: Metody pozyskiwania komórek do badań laboratoryjnych cz. I

Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).

Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii. Biologia komórki nowotworowej: Ćwiczenie E

Raport z obecnych postępów: Projekt naukowy: Badanie symetrii dystrybucji inkluzji białkowych i jej wpływu na komórki normalne i nowotworowe

Licealista w świecie nauki

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Kit for rapid detection Legionella pneumophilla

Oznaczanie mocznika w płynach ustrojowych metodą hydrolizy enzymatycznej

I BIOLOGIA JAKO NAUKA

Doktorantka: Żaneta Lewandowska

Sylabus Biologia molekularna

Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia

Transport pęcherzykowy

Transformation of sperm nuclei to metaphase chromosomes in the cytoplasm of maturing oocytes. Dawid Wolaniuk

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

Podziały komórkowe cz. I

MECHANIZMY RUCHÓW KOMÓRKOWYCH - DZIAŁANIE ANESTETYKÓW NA KOMÓRKI

Właściwości błony komórkowej

BIOLOGIA KLASA I GIMNAZJUM - wymagania edukacyjne.

UNIWERSYTET W BIAŁYMSTOKU WYDZIAŁ BIOLOGICZNO CHEMICZNY. Joanna Kotyńska

Wprowadzenie do cytometrii przepływowej: metody znakowania komórek

Technika hodowli komórek leukemicznych

Molekularne podstawy diagnostyki chorób genetycznych - ćwiczenia

Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia

Wprowadzenie do biologii molekularnej.

Oocyty myszy stopniowo rozwijają zdolność do aktywacji podczas bloku w metafazie II. Jacek Z. Kubiak

Biologia molekularna

Transkrypt:

BIOLOGIA KOMÓRKI Techniki generowania heterokariontów

Zjawisko fuzji łączenia dwóch lub więcej komórek w jedną strukturę występuje w przyrodzie w czasie wielu procesów fizjologicznych. Dotyczy ono głównie organizmów należących do królestwa Eukaryota, których wnętrze komórek ulega fragmentacji na przedziały otoczone błonami białkowo-lipidowymi. Proces ten towarzyszy zapłodnieniu, kiedy to dochodzi do fuzji komórki jajowej i plemnika. Dalej, zjawisko to obserwuje się w przebiegu rozwoju zarodkowego, gdzie odpowiada za ogromną różnorodność rozwijających się struktur. W przypadku wielu organizmów fuzje komórek stanowią kluczowy element w dojrzewaniu tkanek i organów. W czasie tworzenia włókien mięśniowych dochodzi do fuzji mioblastów i powstania wielojądrzastych miotub. Różnicowanie komórek kości zachodzi poprzez fuzje jednojądrzastych prekursorów osteoklastów do komórek wielojądrzastych. Również inwazja patogenów Prokaryota może być kierowana fuzją, z uwagi na fakt, że wiele wirusów zawierających dwuwarstwową otoczkę produkuje białka fuzyjne umożliwiające inwazję komórki gospodarza. W końcu, niekontrolowane fuzje komórek stanowią jedną z hipotez tłumaczących rozwój nowotworu. Mimo tak powszechnego występowania w przyrodzie, zjawisko fuzji komórek do dziś nie jest do końca poznane. Wiadomo, że w pierwszej kolejności dochodzi do wymieszania lipidów błonowych, poczym następuje reorganizacja zawartości komórek. Uwzględniając fazę pośrednią można wymienić trzy następujące po sobie etapy fuzji komórek: a. kontakt i fuzja błon komórkowych; b. powstanie mostków cytoplazmatycznych pomiędzy komórkami; c. reorganizacja cytoszkieletu i zmiana położenia organelli komórkowych prowadząca do utworzenia nowej, stabilnej struktury. Aby możliwa była fuzja błon komórkowych, muszą one ulec agregacji (na odległość kilku nanometrów), a następnie znacznemu zbliżeniu (na odległość kilku Angstremów). Proces ten zależny jest od usunięcia warstwy hydratacyjnej z błony komórkowej. Zaistniała w następstwie rearanżacja obu dwuwarstw zwiększa swój zasięg, co prowadzi do wymieszania składników błon i ich dyfuzji z miejsca kontaktu (powstaje por fuzyjny, Rys. 1). Rys. 1. Schemat procesu fuzji błon komórkowych. Badania in vitro z wykorzystaniem syntetycznych liposomów wykazały, że kluczową rolę w fuzji błon odrywają jony dwuwartościowe (Ca 2+, Mg 2+ ). Poprzez wiązanie negatywnie naładowanych lipidów takich jak fosfatydyloseryna lub fosfatydyloglicerol minimalizują one oddziaływania elektrostatyczne i umożliwiają dostatecznie bliski kontakt obu błon. W warunkach in vivo proces fuzji podlega regulacji przez białka fuzyjne zasocjowane z błoną komórkową. Ułatwiają one powstanie mostu z lipidów błon fuzjujących komórek, a następnie uformowanie pora fuzyjnego. Pierwszymi poznanymi białkami tego typu były wirusowe białka fuzyjne, które umożliwiają przeniesienie materiału genetycznego do komórki gospodarza. Obecnie wyróżnia się dwie klasy wirusowych białek fuzyjnych: zależne i niezależne od ph środowiska. Te pierwsze (np. wirus grypy) ulegają aktywacji w niskim ph endosomów i, aby spełnić swą rolę, muszą najpierw ulec endocytozie. Te drugie mogą funkcjonować w neutralnym ph, ulegając bezpośrednio fuzji z błoną 2

komórkową. Według takiego schematu działa m.in. wirus HIV oraz Herpes. Warto tutaj zwrócić uwagę na fakt, że fuzje komórek mogą przyczynić się do przenoszenia chorób między organizmami oraz pojawiania się nowych schorzeń. Postuluje się np. że wspomniany wirus HIV powstał na skutek połączenia sekwencji ludzkiego retrowirusa z wirusem niedoboru odporności występującym w populacji szympansów. Komórki eukariotyczne wykorzystują inną klasę białek fuzyjnych, z których najlepiej poznane należą do rodziny białek SNARE. W miejscach fuzji w komórkach wykazano obecność białka winkuliny, filamentów aktyny oraz -aktyniny. Dowiedziono, że w trakcie fuzji jądra komórkowe pozostają w centrum komórki, a krótkie fragmenty błony komórkowej znajdują się w cytoplazmie. Jednocześnie dochodzi do fragmentacji połączeń zwierających i zamykających. W warunkach hodowli in vitro rzadko dochodzi do spontanicznych fuzji między komórkami. Jednakże częstość tego zjawiska można znacznie zwiększyć działając na komórki odpowiednimi czynnikami. Do najczęściej stosowanych w tym celu związków chemicznych należą: glikol polietylenowy (PEG) i lizolecytyna. Mechanizm działania tych związków pozostaje na razie nieznany, jednak niektórzy badacze sugerują, że PEG, przez wiązanie dużej ilości cząsteczek wody prowadzi do dehydratacji warstwy lipidowej. Zwiększeniu wydajności procesu fuzjowania sprzyja również wysokie stężenie jonów wapnia oraz wysokie ph pożywki. Komórki można ponadto fuzjować poddając je działaniu zmiennego pola elektrycznego o częstotliwościach radiowych przez czas rzędu milisekund (elektrofuzja), co prowadzi do lokalnej rearanżacji lipidów w błonach fuzjujących komórek, lub inkubując komórki ze zinaktywowanym wirusem Sendai. Badania procesów fuzji opierają się na analizie struktury błony lipidowej sfuzjowanych komórek (np. z wykorzystaniem metody FRET) lub ocenie zawartości tychże komórek. Proces fuzji komórek wykorzystywany jest jako metoda badawcza zarówno w biologii komórki jak i biotechnologii. Istnieje możliwość przeprowadzania fuzji różnych typów komórek tego samego gatunku, jak również komórek pochodzących z różnych, odległych filogenetycznie organizmów. W wyniku takich połączeń powstają heterokarionty (posiadające dwa różne jądra) lub, jeśli doszło do fuzji jąder, synkarionty (komórki mieszańcowe). Komórki powstałe na drodze tego typu eksperymentów stanowią dogodny model w badaniach biochemicznych oraz w badaniach procesów różnicowania. Co więcej, fuzja komórek może służyć regeneracji zniszczonych tkanek, terapii genowej, czy też badaniom genetycznym. Najważniejszym praktycznym zastosowaniem fuzji jest łączenie komórek szpiczaków mysich (zdolnych do szybkiego i nieograniczonego wzrostu w hodowli in vitro) z komórkami plazmatycznymi (produkującymi przeciwciała). Proces ten umożliwia produkcję przeciwciał monoklonalnych, które znajdują szerokie zastosowanie w badaniach naukowych, diagnostyce i medycynie. Ćwiczenie ma na celu obserwację zjawiska fuzji, przyczepionych do podłoża komórek szczurzego mięsaka XC, wywołanej działaniem glikolu polietylenowego o masie cząsteczkowej 6000. W celu ułatwienia określenia wydajności fuzji jądra utrwalonych komórek należy wybarwić barwnikiem fluorescencyjnym specyficznie wiążącym się z DNA Hoechst 33 342 lub 33 258. Ponieważ glikol polietylenowy w stężeniach wykorzystywanych w ćwiczeniu może być dla komórek toksyczny, krytyczne znaczenie dla powodzenia eksperymentu ma przestrzeganie podanego czasu inkubacji komórek z roztworem glikolu polietylenowego, a następnie dokładne jego wypłukanie. Pożywka, w której następnie inkubujemy fuzjujące komórki nie powinna już zawierać glikolu. 3

Materiały: 1. pożywka hodowlana o składzie: 90 % MEM + 10% surowica bydlęca + 10mM buforu HEPES (pożywka) 2. 50% roztwór glikolu polietylenowego (m.cz. 6000) w MEM temp. 37º C, ph = 7 3. roztwór barwnika Hoechst 33 342 lub 33 258 (1 μg/ml w PBS) 4. 3.7% roztwór formaldehydu w PBS 5. hodowle komórek mięsaka XC komórki wysiane na szkiełka nakrywkowe umieszczone w szalkach Petriego w pożywce MEM. Komórki w gęstości zapewniającej pokrycie ok. 80% powierzchni szkiełka. Wykonanie ćwiczenia: 1. Do jednej szalki Petriego wlać 2 ml 50% roztworu glikolu polietylenowego, a do drugiej szalki 2 ml pożywki MEM. 2. Jedno szkiełko nakrywkowe z komórkami XC przenieść delikatnie, używając łopatki do ważenia, do szalki zawierającej roztwór glikolu polietylenowego (nie odwrócić szkiełka!). Włączyć stoper. Drugie szkiełko jako próbę kontrolną pozostawić w szalce bez glikolu. 3. Po 2 minutach wyjąć szkiełko z komórkami z glikolu polietylenowego i przenieść do szalki z MEM. Komórki przepłukać, a płyn hodowlany delikatnie usnąć przy użyciu pipety automatycznej. Wlać do szalki 2 ml świeżego MEM i powtórnie komórki odpłukać. Czynność tę powtórzyć 3-krotnie. Następnie komórki zalać pożywką, szalkę przykryć i umieścić w cieplarce w 37 C na okres jednej godziny. 4. Po godzinie oglądnąć szalki pod mikroskopem odwróconym. 5. Następnie zlać z szalek pożywkę, komórki przepłukać PBS i utrwalać przez 10 min. w 3.7% formaldehydzie w PBS. 6. Komórki przepłukać 2x PBS, a następnie barwić przez 10 min w roztworze barwnika Hoechst 33258 (1 μg/ml w PBS). 7. Po 10 minutach komórki dokładnie przepłukać 3x wodą i sporządzić preparat. 8. W ten sam sposób utrwalić i wybarwić komórki kontrolne. 9. Otrzymane preparaty obejrzeć w mikroskopie kontrastowo-fazowym i fluorescencyjnym (światło wzbudzające: UV). Określić wydajność fuzji jako procent komórek zawierających 2 lub więcej jąder. Zakres materiału obowiązujący do ćwiczeń: 1. Budowa błony komórkowej. 2. Fuzja błon a fuzja komórek. 3. Zjawisko fuzji komórek w procesach fizjologicznych. 4. Metody fuzji komórek in vitro, warunki niezbędne do fuzji. 5. Teorie tłumaczące proces fuzji błon komórkowych, białka fuzyjne. 6. Praktyczne wykorzystanie zjawiska fuzji komórki mieszańcowych w badaniach naukowych, zastosowanie przeciwciał monoklonalnych. 4

Zalecana literatura: B. Alberts i in.: Podstawy biologii komórki, PWN 2005; część II, rozdział 11 (str. 365-388), rozdział 15 (str. 512-516). J. Kawiak, M. Zabel: Seminaria z cytofizjologii, Wrocław 2002; rozdział 6 (str. 127-141). Praca zbiorowa po redakcją J. Kawiaka: Podstawy cytofizjologii Warszawa 1998; część II (str. 58-78). Praca zbiorowa pod redakcją J. Kawiaka i K. Ostrowskiego: Cytofizjologia, 1990; rozdział 2 (str. 56-58), rozdział 13 (str. 406-408). 5