Jeden gen trzy choroby; efekty fenotypowe premutacji/mutacji w genie FMR1

Podobne dokumenty
Sesja 14. Neurogenetyka

INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA

BADANIA GENETYCZNE W DYSTROFIACH MIOTONICZNYCH

Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA)

NIEPEŁNOSPRAWNOŚĆ INTELEKTUALNA. Anna Materna-Kiryluk Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu. Niepełnosprawność intelektualna - definicja

Dziedziczenie jednogenowe. Rodowody

Czy można zmniejszyć ryzyko występowania defektów genetycznych w populacji polskich koni arabskich?

Biologia medyczna. materiały dla studentów Kobieta (XX)

Genetyka kliniczna - opis przedmiotu

CZĘSTOŚĆ WYSTĘPOWANIA OTĘPIEŃ

Infantylny autyzm. prof. MUDr. Ivo Paclt, CSc.

Składniki jądrowego genomu człowieka

BIOLOGICZNE MECHANIZMY ZACHOWANIA II JĄDRA PODSTAWY KRESOMÓZGOWIA I KONTROLA RUCHOWA

Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak

ZESPÓŁ ŁAMLIWEGO CHROMOSOMU X I CHOROBY FMR1 ZALEŻNE OBJAWY KLINICZNE, EPIDEMIOLOGIA I PODŁOŻE MOLEKULARNE CHOROBY*

Podłoże molekularne NF1 i RASopatii. Możliwości diagnostyczne.

Problemy zdrowotne u kobiet nosicielek premutacji w genie FMR1

Temat 6: Genetyczne uwarunkowania płci. Cechy sprzężone z płcią.

Wstęp do genetyki człowieka Choroby rzadkie nie są takie rzadkie

Analiza mutacji p.d36n i p.n318s oraz polimorfizmu p.s474x genu lipazy lipoproteinowej u chorych z hipercholesterolemią rodzinną.

starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg

Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej

POTRZEBY DZIECKA Z PROBLEMAMI -DYSTROFIA MIĘŚNIOWA DUCHENNE A NEUROLOGICZNYMI W SZKOLE

NIPT Nieinwazyjny Test Prenatalny (ang. Non-Invasive Prenatal Test)

u Czynniki ryzyka wystąpienia zakrzepicy? - przykłady cech osobniczych i stanów klinicznych - przykłady interwencji diagnostycznych i leczniczych

Jednostka chorobowa. Czas analizy [dni roboczych] Literatura Gen. Cena [PLN] Badany Gen. Materiał biologiczny. Chorobowa

Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I dla kierunku Lekarskiego, rok I 2015/2016. Ćwiczenie nr 1 (

Tomasz Mazurczak. Ataksja Friedreicha. Klinika Neurologii Dzieci i Młodzieży Instytut Matki i Dziecka Warszawa 2015

2. Rozdział materiału genetycznego w czasie podziałów komórkowych - mitozy i mejozy

Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym

Podział chorób neurometabolicznych jest sprawą otwartą. W zależności od. potrzeb można posłużyć się jednym z niżej wymienionych podziałów.

Genetyka kliniczna nowe wyzwanie dla opieki pediatrycznej. Jacek J. Pietrzyk Klinika Chorób Dzieci Katedra Pediatrii Collegium Medicum UJ

Niepełnosprawność intelektualna

GIMNAZJUM SPRAWDZIANY SUKCES W NAUCE

ADRENOLEUKODYSTROFIA I RODZINNE PARAPAREZY SPASTYCZNE

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT

Podstawy genetyki człowieka

prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie

KARTA BADANIA LEKARSKIEGO

mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii

Zespoły neurodegeneracyjne. Dr n. med. Marcin Wełnicki III Klinika Chorób Wewnętrznych i Kardiologii II WL Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego

Grant NCN 2011/03/B/ST7/ Model anatomiczno-neurologiczno-radiologiczny: obszar unaczynienia objawy neurologiczne - lokalizacja

Sposoby determinacji płci

Etiologia i znaczenie kliniczne miejsc kruchych w chromosomach człowieka

Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17

Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO

W dniu odbyło się posiedzenie grupy ekspertów powołanych przez Zarząd

PROGRAM NAUCZANIA PRZEDMIOTU FAKULTATYWNEGO NA WYDZIALE LEKARSKIM I ROK AKADEMICKI 2015/2016 PRZEWODNIK DYDAKTYCZNY

a) lokalizacja DNA i RNA w komórkach stożka wzrostu korzenia Allium cepa prep. mikr. rys.

VI.2 Podsumowanie planu zarządzania ryzykiem dla produktu Zanacodar Combi przeznaczone do publicznej wiadomości

Test BRCA1. BRCA1 testing

AD/HD ( Attention Deficit Hyperactivity Disorder) Zespół Nadpobudliwości Psychoruchowej z Zaburzeniami Koncentracji Uwagi

Materiał i metody. Wyniki

Sposoby determinacji płci

OFERTA BADAŃ GENETYCZNYCH

Pacjent z odsiebnym niedowładem

S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne. Genetyka Kliniczna. Wydział Lekarsko-Stomatologiczny(WLS)

PŁODU JAKO PRZYCZYNA UTRATY CIĄŻY - l e k. K a r o l i n y M a t u s z e w s k i e j

Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...

S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Biologia medyczna. Nie dotyczy

6. Uzupełnij zdanie, wstawiajac w odpowiednie miejsce wyrażenie ujawni się lub nie ujawni się :

a) Zapisz genotyp tego mężczyzny... oraz zaznacz poniżej (A, B, C lub D), jaki procent gamet tego mężczyzny będzie miało genotyp ax b.

II WYDZIAŁ LEKARSKI, II ROK

Tematyka zajęć z biologii

Załącznik nr 5 do zarządzenia Nr 53/2006 Prezesa Narodowego Funduszu Zdrowia. Program badań prenatalnych

Informacje dla pacjentów i rodzin

ZESPÓŁ ŁAMLIWEGO CHROMOSOMU X I CHOROBY FMR1 ZALEŻNE POSTĘPOWANIE DIAGNOSTYCZNE NA PODSTAWIE DOŚWIADCZEŃ WŁASNYCH*

Genetyka niemendlowska

MUTACJE DYNAMICZNE. h a r d s 1995).

ATAKSJE RDZENIOWO-MÓ D KOWE UWARUNKOWANE GENETYCZNIE

Imię i nazwisko...kl...

Wysokie CK. Anna Kostera-Pruszczyk Klinika Neurologii Warszawski Uniwersytet Medyczny

ZARZĄDZANIE POPULACJAMI ZWIERZĄT 1. RÓWNOWAGA GENETYCZNA POPULACJI. Prowadzący: dr Wioleta Drobik Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt

Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy

Genetyczna "szara strefa" choroby Huntingtona: co to wszystko oznacza? Podstawy Genetyczne

Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników

Jaki jest związek między chorobą Huntingtona i rakiem? Historia HD i raka

Zalecenia PRAC dotyczące przesłanek do aktualizacji informacji o produkcie

Mikrosatelitarne sekwencje DNA

Sesja 3. Choroby układu pozapiramidowego

LECZENIE CHOROBY GAUCHERA ICD-10 E

PODSTAWY BIOINFORMATYKI 11 BAZA DANYCH HAPMAP

NaCoBeZu klasa 8 Dział Temat nacobezu programu I. Genetyka 1. Czym jest genetyka? 2. Nośnik informacji genetycznej DNA 3. Podziały komórkowe

Dziedziczenie dominujące

Szczegółowy harmonogram ćwiczeń Biologia medyczna w Zakładzie Biologii w roku akademickim 2017/2018 Analityka Medyczna I rok

Neurologiczne podłoże zachowań emocjonalnych. Halszka Kwiatkowska

Móżdżek. Móżdżek położony jest w dole tylnym czaszki pod namiotem móżdżku. Sąsiaduje z płatem skroniowym, potylicznym oraz z pniem mózgu.

1 Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki. 2 Podstawowy model dziedziczenia

WADY SERCA U DZIECI Z ZESPOŁEM MARFANA

OFERTA BADAŃ GENETYCZNYCH

KARTA BADANIA LEKARSKIEGO OSOBY UBIEGAJĄCEJ SIĘ LUB POSIADAJĄCEJ POZWOLENIE NA BROŃ

Urząd Miasta Bielsko-Biała - um.bielsko.pl Wygenerowano: /14:10: listopada - Światowym Dniem Walki z Cukrzycą

Encefalopatie endogenne. Zakład Neuropatologii, IPiN Teresa Wierzba-Bobrowicz

Geny letalne, semiletalne i subwitalne. Wady wrodzone. Nie każda wada się dziedziczy. powstają w wyniku mutacji genowych

NIEPOWODZENIA ROZRODU

BADANIA GENETYCZNE W HODOWLI KOTÓW: CHOROBA SPICHRZENIOWA GLIKOGENU TYPU IV (GLYCOGEN STORAGE DISEASE TYPE IV - GSD IV)

Wymagania edukacyjne

Podstawowe informacje o chorobach i raku gruczołu krokowego

STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ

Efekty leczenia lamiwudyną przewlekłych wirusowych zapaleń wątroby typu B na podstawie materiału własnego.

Transkrypt:

Kurs Neurogenetyka Warszawa IPiN, 30.11-04.12.2015 Jeden gen trzy choroby; efekty fenotypowe premutacji/mutacji w genie FMR1 Wioletta Krysa, Marta Rajkiewicz Zakład Genetyki Instytut Psychiatrii i Neurologii, Warszawa

Charakterystyka genu FMR1 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 CGGn 5 3 (CpG) - sekwencje eksonowe niekodujące - sekwencje eksonowe kodujące białko - sekwencje intronowe FMR1 FRAGILE X MENTAL RETARDATION PROTEIN; FMRP Białko FMR (RNA-binding protein) - wchodzi w kompleks mrna i rybonukleoprotein, który łączy się polirybosomami, co sugeruje jego udział w procesie translacji, - ulega ekspresji w mózgu, tk. chrzęstnej i wątrobie płodów, - wykazuje wysoki poziom ekspresji w spermatogoniach u dorosłych mężczyzn Plejotropowe działanie mutacji w genie FMR1 - FraX

Charakterystyka genu FMR1 7- (54) 59 CGG ZAKRES PRAWIDŁOWY Allele pośrednie ( intrermediate alleles ) Gray zone alleles (55) 60-200 CGG PREMUTACJA >200 CGG PEŁNA MUTACJA Region powtórzeń (CGG) n 6-35 35-42 43-54 Sekwencja intronowa PR IN GZ (gray zone, borderline alleles)

Efekty fenotypowe premutacji/mutacji w genie FMR1 7- (54) 59 CGG ZAKRES PRAWIDŁOWY (55) 60-200 CGG PREMUTACJA >200 CGG PEŁNA MUTACJA CGG CGG CGG mrna FXTAS FMRP FMRP Mutacja typu RNA gain of function POF FXPOI FraX Mutacja typu loss of function

Efekty fenotypowe mutacji w genie FMR1 7- (54) 59 CGG ZAKRES PRAWIDŁOWY (55)60-200 CGG PREMUTACJA >200 CGG PEŁNA MUTACJA FraX

Fra X (Fragile X syndrome FraX) - 1943 r. Martin & Bell - Choroba sprzężona z chromosomem X, wykazuje semi-dominujący typ dziedziczenia, dotyczy zarówno kobiet jak i mężczyzn. - Częstość występowania FraX wśród mężczyzn z upośledzeniem umysłowym o nieznanej etiologii wynosi od 0,5 do 3%, (7,5-11%). W populacji kaukaskiej częstość występowania tej choroby określono na 1:3717-1:9818 osób.

Zespół kruchego chromosomu X (Fragile X syndrome FraX) Objawy FraX Niepełnosprawnośd intelektualna głębszego stopnia 80%, u 20% chorych 70-80 IQ (pogranicze normy) Cechy fenotypowe: makroorchidyzm, podłużna twarz, nadmierna ruchomośd stawów, odstające uszy, wysokie podniebienie, wydatna żuchwa, skrzywienie kręgosłupa Zaburzenia budowy tkanki łącznej, m.in - gładka, aksamitna skóra (tzw. velvet skin) - poszerzenie ujścia aorty - wypadanie zastawki mitralnej Inne cechy fenotypowe: otyłośd, okrągła twarz, małe dłonie i stopy, hipogonadyzm Zaburzenia zachowania wynikające głównie z upośledzenia umysłowego: - nadmierna nieśmiałośd i słaby kontakt wzrokowy. W niektórych przypadkach występuje padaczka oraz zmiany w EEG.

Efekty fenotypowe premutacji w genie FMR1 7- (54) 59 CGG ZAKRES PRAWIDŁOWY (55) 60-200 CGG PREMUTACJA >200 CGG PEŁNA MUTACJA POF FXPOI Zakres premutacji obejmuje 55-200 CGG wg Hagerman 59-200 CGG wg EMQN Rousseau et al. (1995) reported a population frequency of 1 in 259 for female carriers of an allele of more than 54 repeats. Dombrowski et al. (2002) screened 10,572 independent French Canadian males for premutation-size FMR1 alleles and identified 13 who carried alleles of more than 54 repeats, which corresponded to a population frequency of 1 in 813.

Przedwczesne klimakterium (Premature ovarian failure POF) X-associated primary ovarian insufficiency (FXPOI) Wyodrębniono dwa gorące regiony ściśle związane z występowaniem wczesnego klimakterium - POF1 - obszar obejmujący gen FMR1 Xq26 - q28 - POF2 - Xq13.3 - q21.1 - nieznany mechanizm przedwczesnego wygasania jajników prawdopodobnie patogenny wpływ występującego w nadmiarze transkryptu z premutacją - brak owulacji poniżej 40 r.ż., podwyższony poziom gonadotropin, FSH > 40 IU/L,

Przedwczesne klimakterium (Premature ovarian failure POF) X-associated primary ovarian insufficiency (FXPOI) Szacunkowo u 5-6% kobiet z wczesnym klimakterium podłoże genetyczne stanowi premutacja w genie FMR1, ryzyko to wzrasta do 14%-20% gdy w wywiadzie rodzinnym stwierdzony został Zespół Kruchego Chromosomu X POF dotyczy dziesięciokrotnie częściej kobiet, które allel z premutacją odziedziczyły od ojca nadmierne piętnowanie genomowe? Liczba powtórzeń CGG w zakresie premutacji nie wpływa na wiek wystąpienia wczesnego klimakterium nieznany mechanizm POF, prawdopodobny patogenny wpływ transkryptu występującego w nadmiarze

Efekty fenotypowe premutacji w genie FMR1 7- (54) 59 CGG ZAKRES PRAWIDŁOWY (55) 60-200 CGG PREMUTACJA >200 CGG PEŁNA MUTACJA FXTAS

Zespół drżenia i ataksji związany z kruchym chromosomem X (Fragile X tremor ataxia syndrome FXTAS) - FXTAS po raz pierwszy opisany przez Hagerman i wsp. 2001 r. - Częstość występowania tego neurodegeneracyjnego zespołu szacuje się na 1:3000 mężczyzn po 50 r.ż. (Butcher, 2004) - Częstość występowania FXTAS w grupie osób > 55 r.ż., nosicieli premutacji wynosi od 37% (Kalifornia) do 42% (Australia) (Jaquemont 2004, Loesch 2005) - 17% - 50-59 lat, - 75% u osób 80 r.ż.

Zespół drżenia i ataksji związany z kruchym chromosomem X (Fragile X tremor ataxia syndrome FXTAS) SPEKTRUM OBJAWÓW Drżenie zamiarowe Ataksja Nietypowe formy parkinsonizmu Spowolnienie ruchowe/bradykinezja Sztywność Otępienie, zaburzenia funkcji poznawczych Parapareza spastyczna Neuropatia obwodowa Zaburzenia neuropsychiczne Zaburzenia funkcjonowania pęcherza Impotencja lub zaburzenia erekcji Osłabienie siły kończyn dolnych, utrata słuchu, dysfagia

Zespół drżenia i ataksji związany z kruchym chromosomem X (Fragile X tremor ataxia syndrome FXTAS) Neuroobrazowanie wykazuje uogólniony zanik mózgowia, u połowy chorych w badaniu MRI stwierdza się ogniska o zwiększonej intensywności sygnału w obrębie konarów móżdżku. Badanie neuropatologiczne mózgu wykazuje obecność eozynofilnych, ubikwityno-pozytywnych wtrętów w jądrach neuronów i astrocytów. Największe skupienie tych inkluzji obserwuje się w hipokampie (40% neuronów) i korze czołowej, nie stwierdza się ich obecności w komórkach Purkinjego.

Molekularne metody analizy genu FMR1 Izolacja DNA metodą fenolową lub automatycznie Reakcja łaocuchowa polimerazy PCR (polymerase chain reaction) Rozdział na żelach: agarozowych poliakrylamidowych Analiza Southern Blot RP-PCR (Repeat Primed PCR)

Materiał - grupa pacjentów z objawami ataksji 1385 pacjentów skierowanych z rozpoznaniem ataksji rdzeniowomóżdżkowych u których przebadano geny warunkujące: SCA1, 2, 3, 6, 7, 8, 17 oraz DRPLA SCA1 225 SCA2 56 SCA8 33 SCA17 4 Niepotwierdzone przypadki choroby 962 443 pacjentów poddanych analizie pod kątem występowania premutacji w genie FMR1 50 lat 323 pacjentów (145, 178 ) < 50 lat 120 pacjentów (28, 91 ) u 84 pacjentów brak wywiadu rodzinnego (31, 53 )

Materiał - grupa pacjentek z objawami POF 40 kobiet wiek od 17 do 40 lat (średni wiek wystąpienia objawów 28,0 lat) skierowane przez lekarzy ginekologów lub endokrynologów z powodu zaobserwowanych objawów wczesnego klimakterium (przed 40 r.ż.) o nieznanej etiologii

Wyniki pacjenci z objawami ataksji W analizowanej grupie wykryto premutację w genie FMR1 warunkującą FXTAS u jednego mężczyzny l.72 (91 powtórzeń CGG). rozpoznanie: zespół móżdżkowy i neuropatia Drżenie rąk i głowy, zaburzenia równowagi, trudności w chodzeniu (67 r.ż.), niewielkiego stopnia zaburzenia funkcji wykonawczych, myślenia abstrakcyjnego i wnioskowania MRI: w tylnej części mostu obszar o podwyższonym sygnale rozciągający się wzdłuż obu konarów móżdżku, zmiany naczyniopochodne w istocie białej obu półkul mózgu Wywiad rodzinny: drżenie rąk u matki i córki probanda, drżenie głowy u brata i siostry probanda Częstość występowania FXTAS w grupie mężczyzn 0,37%. Wśród mężczyzn 50 r.ż. - 1/178 (0,56%); Wśród mężczyzn w wieku 70 lat - 1/19 (5,25%)

Wyniki pacjentki z POF Wykryto występowanie premutacji w genie FMR1 u trzech spośród 38 kobiet. Analiza cytogenetyczna wykazała dwa przypadki wzajemnych translokacji zrównoważonych obejmujących chromosom X i jeden z autosomów: 1) 46XX, t(x;5)(p13.1;q22.3), 2) 46XX, t(x;14)(q22;q24). Częstośd występowania premutacji w badanej grupie, po wykluczeniu dwóch wymienionych pacjentek, wynosi 3/38 (7,9%.) częstość % 35,0 30,0 25,0 20,0 15,0 10,0 rozkład liczby powtórzeń CGG w genie FMR1 5,0 0,0 17 19 21 22 25 26 28 29 30 31 32 35 38 39 41 70 82 98 zakres powtórzeń CGG

Analiza rodowodów * DNA * DNA 1934 86 CGG 1941 * DNA 1959 1951 1961 98/29 CGG * DNA 1985 1984 1988 2001 FraX > 200 CGG

Analiza rodowodów drżenie głowy * DNA * DNA * DNA Józef 1936 91 CGG zespół móżdżkowy FX TAS Helena P oznańska 1945 81/29 CGG drżenie głowy W ładysław 64 CGG * DNA Janusz A nna Hemmerich 1967 NP /25 CGG drż S ławomir * DNA ednarek A neta Hemmerich 22 l upośl.umysł. FraX 21 l 17 l 5 l

Algorytm postępowania Diagnozując neurodegeneracyjne choroby genetyczne należy wziąć pod uwagę częstości ich występowania w Polsce. Zestaw badań podstawowych obejmuje SCA1, SCA2 i SCA3, w następnej kolejności uwzględniane są SCA6, SCA7, SCA8, SCA17 i DRPLA, a u pacjentów, u których objawy choroby wystąpiły po 50 r.ż. także FXTAS.

[Według Maddalena et al 2001, Sherman et al 2005]. 23-27 III 2009, IPiN Warszawa