Aktualny stan i perspektywy nieinwazyjnej diagnostyki prenatalnej w konfliktach matczyno-płodowych
|
|
- Filip Ostrowski
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 PRACA POGLĄDOWA Journal of Transfusion Medicine 2010, tom 3, nr 4, Copyright 2010 Via Medica ISSN Aktualny stan i perspektywy nieinwazyjnej diagnostyki prenatalnej w konfliktach matczyno-płodowych Actual status and perspectives of the noninvasive prenatal diagnostics in feto-maternal incompatibilities Katarzyna Guz, Agnieszka Orzińska, Izabella Kopeć, Magdalena Krzemienowska, Justyna Smolarczyk-Wodzyńska, Ewa Brojer Zakład Immunologii Hematologicznej i Transfuzjologicznej Instytutu Hematologii i Transfuzjologii Streszczenie Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna jest oparta na analizie pozakomórkowego DNA płodu obecnego w osoczu kobiet w ciąży. W niniejszej pracy poglądowej autorki przeanalizowały przyczyny stosowania obecnie tej metodologii tylko do genotypowania niektórych antygenów krwinek czerwonych płodu. Podsumowały też doświadczenia Instytutu Hematologii i Transfuzjologii w prenatalnej diagnostyce konfliktów matczyno-płodowych w zakresie antygenów RhD, RhC+D, Rhc, RhE i K oraz omówiły perspektywy rozwoju badań prenatalnych na podstawie nowoczesnych technologii: digital PCR, spektrometrii mas MALDI-TOF, sekwencjonowania nowej generacji. Słowa kluczowe: nieinwazyjna diagnostyka prenatalna; choroba hemolityczna płodów/ /noworodków, RhD, RhC, Rhc, RhE, K, HPA1a; genotypowanie, pozakomórkowe DNA płodu J. Transf. Med. 2010; 4: Summary Non-invasive prenatal diagnostics is based on the analysis of cell free fetal DNA present in the plasma of pregnant women. In this review we analysed the reasons why this methodology can be currently used only for genotyping of some fetal red blood cell antigens. We also summerised the experience of the Institute of Haematology and Transfusion Medicine in prenatal diagnostics of feto-maternal incompalibilities against RhD, RhC+D, Rhc, RhE and K antigens and discussed the perspectives of development of prenatal tests based on modern technologies: digital PCR, mass spectrometry MALDI-TOF, new generation sequencing. Key words: non-invasive prenatal diagnostics, hemolytic disease of newborn, RhD, RhC, Rhc, RhE, K, HPA1a, genotyping, cell free fetal DNA J. Transf. Med. 2010; 4: Adres do korespondencji: dr n. biol. Katarzyna Guz, Zakład Immunologii Hematologicznej i Transfuzjologicznej IHiT, ul. Chocimska 5, Warszawa, kguz@ihit.waw.pl 144
2 Katarzyna Guz i wsp., Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna w konfliktach serologicznych Wstęp Pozakomórkowe DNA płodowe w osoczu matki (cff-dna, cell free fetal DNA) odkryto w 1997 roku [1]. Stanowi 3 6% DNA izolowanego z osocza, jest wykrywalne już w 5 7 tygodniu ciąży. Jego stężenie wzrasta w trakcie ciąży, ale szybko zanika po porodzie zatem wynik jego badania dotyczy aktualnej ciąży [2, 3], w odróżnieniu od komórek płodowych obecnych w krwiobiegu matki, które mogą pochodzić z poprzednich ciąż [4]. Analiza cff-dna, mimo jego niewielkiej ilości, stała się możliwa dzięki ilościowej technice PCR (polymerase chain reaction) w czasie rzeczywistym (RQ-PCR, real-time quantitative PCR), szczególnie z wykorzystaniem sond TaqMan. Pierwsze prace wykorzystujące cff-dna jako materiał do badań prenatalnych dotyczyły poszukiwania genów z chromosomu Y oraz genu RHD, najprostszych technicznie do wykrywania, ponieważ nie ma ich u matek (brak chromosomu Y u kobiet, brak genu RHD u większości osób RhD-ujemnych) [3, 5]. Dało to możliwość nieinwazyjnej diagnostyki najpowszechniejszego konfliktu serologicznego w zakresie antygenu RhD oraz analizy dziedziczenia chorób sprzężonych z płcią [5, 6]. Duże trudności metodologiczne napotkało natomiast badanie genów determinowanych przez polimorfizmy punktowe, tak zwane SNP (single nucleotide polimorphism), potrzebnych do nieinwazyjnej diagnostyki konfliktów serologicznych innych niż konflikt RhD lub różnych chorób uwarunkowanych genetycznie (np. w chromosomie X oraz w genach autosomalnych między innymi b-talasemia, choroba Huntingtona, dystrofia mięśniowa, niedokrwistość sierpowata) oraz do wykrywania chromosomalnych anaploidii (m.in. trisomia 21, 18, 13; monosomia X i inne zaburzenia liczby chromosomów X/Y) [7 9]. W ostatnich latach nastąpił znaczący postęp w tej dziedzinie poprzez wykorzystanie innych technologii niż klasyczny RQ-PCR, takich jak digital PCR [10], spektrometria mas MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization time-of- -flight) [11] oraz sekwencjonowanie nowej generacji [12], które omówiono w niniejszej pracy. Zasadniczym celem prezentowanej pracy jest udzielenie odpowiedzi na pytania: jaka jest przydatność nieinwazyjnych badań prenatalnych? na czym polegają trudności w ich wykonywaniu? dla których konfliktów serologicznych badania nieinwazyjne są prowadzone w Polsce i na świecie i jakie są ich wyniki? co wymaga ulepszenia? Przydatność nieinwazyjnej diagnostyki w konfliktach serologicznych Konflikty matczyno-płodowe w antygenach krwinek czerwonych Badania nad nieinwazyjną diagnostyką płodu w konfliktach serologicznych rozpoczęto na świecie pod koniec lat 90. XX wieku [1, 2], a od 2000 roku są prowadzone w Instytucie Hematologii i Transfuzjologii w Warszawie (IHiT), gdzie wdrożono protokoły dla konfliktu w antygenach RhD, Rhc, RhE i RhC z układu Rh i w antygenie K z układu Kell [13 15]. Metody te są wykorzystywane przez ginekologów w przypadkach, gdy istnieje podejrzenie, że występujące u kobiety ciężarnej przeciwciała mogą spowodować chorobę hemolityczną płodów/noworodków (HDFN, hemolytic disease of the fetus and newborn). Wiadomo, że przeciwciała obecne u matki mogą być groźne, jeśli płód nosi antygen, do którego są skierowane. Wykrycie genu lub allelu płodu, kodującego antygen niezgodny z matką (tj. RHD, RHCE*C, RHCE*c, RHCE*E, KEL*1) zawęża grupę kobiet wymagających ścisłego monitorowania HDFN i ewentualnego leczenia. Jeśli dziecko jest antygenowo ujemne, co może mieć miejsce, gdy ojciec dziecka ma heterozygotyczny genotyp, to przeciwciała mu nie zagrażają, gdyż są wynikiem poprzedniej ciąży lub immunizacji przez przetoczenie krwi. Wykazanie braku szukanego genu/allelu płodu w osoczu matki, przy potwierdzeniu obecności cff-dna wykryciem markera dziedziczonego po ojcu, stanowi argument do zaniechania inwazyjnych zabiegów pobierania materiału od płodu (amniopunkcja, kordocenteza), które zawsze wiążą się z około 1-procentowym ryzykiem utraty ciąży i dodatkową immunizacją matki [16]. W latach w IHiT we współpracy z Regionalnymi Centrami Krwiodawstwa i Krwiolecznictwa przeprowadzono analizę wykrywania przeciwciał do antygenów krwinek czerwonych u kobiet ciężarnych w Polsce. Zebrano dane od grupy stanowiącej około 48% wszystkich ciężarnych [17]. Analizy te pozwoliły ocenić skalę immunizacji antygenem RhD i antygenami nie-rhd w Polsce i tym samym przewidzieć skalę ewentualnych badań nieinwazyjnych w ciążach zagrożonych HDFN. Szacuje się, że kobiet ciężarnych z przeciwciałami anty-d jest około 1000 rocznie. W około 400 przypadkach (40% kobiet teoretycznie powinno mieć RhD-ujemne płody) nieinwazyjne badanie RHD płodu pomogłoby wykluczyć konflikt matczyno-płodowy, a tylko pozostałe musiałyby być monitorowane pod kątem objawów HDFN. U kobiet RhD-ujem- 145
3 Journal of Transfusion Medicine 2010, tom 3, nr 4 nych z rzadkimi przeciwciałami anty-g obok nieinwazyjnego oznaczenia genu RHD istotne jest też oznaczenie statusu RhC płodu, ponieważ obecność RHD i/lub allelu RHCE*C potwierdza ryzyko wystąpienia HDFN z powodu przeciwciał anty-g. Z przeprowadzonych badań wynika też, że kobiet ciężarnych z przeciwciałami do innych antygenów niż antygen RhD, tak zwany nie-rhd, jest szacunkowo 2000 rocznie. Wśród nich największy odsetek stanowią kobiety z przeciwciałami anty-k lub anty-c (25%, czyli ~500). Przeciwciała anty-k mogą wywołać ciężkie objawy HDFN [18], podczas gdy HDFN z powodu przeciwciał anty-c ma zazwyczaj łagodną postać, ale u 20% przypadków wymaga wymiennego przetoczenia krwi stąd duże znaczenie diagnostyczne opracowanych nieinwazyjnych badań prenatalnych. Przeciwciała anty-e też są stosunkowo często wykrywane. Rzadko wywołują ciężką postać HDFN, ale notowano pojedyncze przypadki o takim przebiegu [19]. Wprowadzenie do praktyki klinicznej metody nieinwazyjnego genotypowania płodu jest więc zasadne. Dla diagnostyki pozostałych konfliktów matczyno-płodowych, między innymi w antygenie K, Fy a/b, Jk a/b, Co a, Di b, wciąż brakuje metod nieinwazyjnych, choć warto podkreślić, że stosunkowo rzadko wywołują one HDFN. Znajomość statusu RhD płodu jest także ważna dla profilaktyki konfliktu RhD, prowadzonej u kobiet bez przeciwciał. W Polsce jak dotąd immunoglobulinę anty-d podaje się dopiero po porodzie, kiedy można oznaczyć antygen RhD z krwi dziecka. Taki schemat obniżył odsetek przypadków immunizacji anty-d w drugiej ciąży po urodzeniu pierwszego RhD-dodatniego dziecka z 13 20% do poziomu 1,6% [18]. Skuteczność obecnie stosowanego systemu profilaktyki szacuje się na około 90%. Przyczyny niepowodzenia wynikają głównie z zaniedbań w podawaniu immunoglobuliny anty-d, podania zbyt małych dawek w stosunku do liczby krwinek płodu przeciekających do krwioobiegu matki, z błędów w oznaczaniu antygenu RhD u noworodków, ale także z faktu, że u 1% kobiet Rh-ujemnych dochodzi do immunizacji już w trakcie pierwszej ciąży. Z tej przyczyny w wielu krajach wysoko rozwiniętych wprowadzono rekomendacje, by podawać immunoglobulinę anty-d 2-krotnie w 28 i 34 tygodniu ciąży albo jednorazowo w większej dawce w 34 tygodniu. Procedura taka zmiejsza częstość alloimmunizacji antygenem RhD do poziomu 0,3% [20]. Ponadto chroni aktualną ciążę, a nie dopiero następną, która może nie mieć miejsca wobec tendencji zmiejszającej się dzietności społeczeństw. W krajach stosujących ten schemat immunoprofilaktyki rozważa się możliwości i zasadność oznaczania genu RHD płodu w osoczu matki w celu wykluczania z immunoprofilaktyki kobiet z RhD-ujemnym płodem. W dyskusjach nad takim projektem podkreśla się, że ograniczenie liczby kobiet poddanych immunoprofilaktyce jest ważne z punktu widzenia ekonomii (oszczędzanie drogiego, deficytowego preparatu anty-d), aspektów etycznych (ograniczenie liczby dawców krwi szczepionych krwinkami RhD-dodatnimi do jego produkcji) oraz zdrowotnych (eliminacja ryzyka przeniesienia nieznanych czynników zakaźnych w produkcie krwiopochodnym) [21]. Van der Schoot i wsp. przeanalizowała koszt wykonania takich badań u Rh-ujemnych ciężarnych i oszacowała, jak ich wprowadzenie wpłynie na koszty immunoprofilaktyki [20]. Według obecnie obowiązującego schematu w Holandii immunoglobulinę anty-d w ciąży otrzymują tylko kobiety nieposiadające dzieci. Ograniczenie to wynika ze względów ekonomicznych oraz ze względu na ograniczoną dostępność preparatu anty-d (w Holandii wytwarza się preparat anty-d tylko z osocza dawców holenderskich). W tym schemacie immunoprofilaktyki wprowadzenie nieinwazyjnego badania genu RHD płodu kosztowałoby tyle, ile immunoglobulina anty-d niepotrzebnie podana kobietom noszącym RhD-ujemne płody (3,1 mln v. 3 mln euro). Gdyby immunoprofilaktyką objęto wszystkie RhD- -ujemne ciężarne, to nieinwazyjne badania przyczyniłyby się do 40% oszczędności (6,6 mln v. 3,9 mln euro). Konflikty matczyno-płodowe w antygenach płytek krwi Diagnostyka konfliktów w zakresie antygenów płytek krwi (HPA, human platelets antigens) czeka na opracowanie wiarygodnych metod nieinwazyjnych. Szczególnie potrzebna jest prenatalna diagnostyka konfliktu HPA1a, który stanowi 80 90% klinicznych przypadków alloimmunologicznej małopłytkowości płodów/noworodków (FNAIT, fenal and neonatal alloimmune thrombocytopenia), występującej z częstością około 1: urodzeń [22, 23]. Problem ten dotyczy kobiet ciężarnych o fenotypie HPA1a-ujemnym, czyli o genotypie HPA1bb (homozygoty w zakresie przeciwstawnego allelu HPA*1b), wykrywanego u 2% osób w populacjach kaukaskich. Z badań prospektywnych wynika, że odsetek kobiet HPA1a-ujemnych ulegających alloimmunizacji wynosi 10%, a u 31% z nich prowadzi to do ciężkich objawów FNAIT [24, 25]. Istotną różnicą w porównaniu z konfliktem RhD jest fakt, że 25 50% przypadków FNAIT z powodu przeciwciał anty-hpa1a pojawia się już w pierwszej ciąży [22]. Dlatego nieinwazyjne wykrycie allelu HPA*1a pło- 146
4 Katarzyna Guz i wsp., Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna w konfliktach serologicznych du jest ważne nie tylko dla diagnostyki ciąż z obciążonym wywiadem, ale także dla badań przesiewowych w celu rozpoznawania FNAIT w trakcie ciąży. Biorąc pod uwagę liczbę urodzeń z 2009 roku [26], w Polsce teoretycznie należałoby się spodziewać około 700 przypadków alloimmunizacji anty- HPA1a rocznie, w tym około 220 przypadków ciężkiej FNAIT ( urodzeń 2% ciężarnych HPA1bb 85% płodów HPA1a-dodatnich 10% ulegających alloimmunizacji 31% z ciężką FNAIT). Trudności nieinwazyjnych badań prenatalnych i próby ich przezwyciężania Wykonywanie badań genów/alleli płodu w osoczu antygenowo ujemnej kobiety ciężarnej podejrzewanej o konflikt serologiczny jest wysoko specjalistycznym badaniem. Trudności w wykonaniu takich badań wynikają z kilku przyczyn, które szczegółowo omówiono poniżej. Niskie stężenie cff-dna i proporcja względem DNA matczynego Dla wykrycia genów płodu konieczne jest wyizolowanie odpowiedniej ilości płodowego DNA. W osoczu, jak powiedziano we wstępie, występuje tylko nieznaczna ilość cff-dna; przeważającą część stanowi pozakomórkowe DNA matczyne. Konieczne jest więc izolowanie DNA z dużej objętości osocza, a tym samym pobranie przynajmniej ml krwi. Dodatkowo ważne jest, by ograniczać proces rozpadu komórek matki, ponieważ z nich jest uwalniane dodatkowe matczyne DNA. Przeciwdziała temu pobieranie krwi do probówek z barierą żelową i napylonym EDTA (ethylene-diamine-tetra-acetic acid), które trzeba odwirować w ciągu 5 h, ściśle według zaleceń producenta, by nie spowodować zubożenia frakcji cff- DNA. W tak odseparowanym osoczu cff-dna jest stabilne w temperaturze pokojowej do 48 h od pobrania i w takich warunkach może być transportowane do laboratorium diagnostycznego [27]. Probówkę zawierającą osocze, oddzielone od elementów morfotycznych barierą żelową, można też dostarczyć w stanie zamrożonym. Niedopuszczalne jest natomiast zamrażanie rozmrożonego osocza, ponieważ prowadzi to do degradacji cff-dna. Ostatnio Fernando i wsp. z firmy Streck opisali nowy typ probówek przeznaczonych do badań prenatalnych, które nie mają bariery żelowej i nie wymagą odwirowania osocza, a cff-dna jest w nich stabilne do 14 dni od pobrania [28]. Metoda izolowania DNA musi być efektywna, przeznaczona dla pozyskiwania drobnocząsteczkowego DNA. Poleca się zestawy do izolowania kwasów nukleinowych wirusów, najlepiej z dużych objętości osocza ( 1 ml) [29, 30]. Z uwagi na przewidywaną skalę badań i mniejsze ryzyko zanieczyszczenia obcym DNA (procedury dekontaminacyjne, bardziej zamknięty układ izolowania) duże oczekiwania wiąże się z wydajnymi metodami automatycznymi [30, 27]. Szczególnie przydatne wydają się metody z wykorzystaniem kuleczek magnetycznych opłaszczonych krzemionką, które lepiej wychwytują drobnocząsteczkowe DNA niż metody ze złożem ubitym w kolumnie [31]. Metoda detekcji cff-dna musi wykrywać pojedyncze kopie genów. Rutynowo używana obecnie metodologia RQ-PCR daje takie możliwości. Ważnym elementem jej standaryzacji jest wykazanie czułości wykrywania jednej kopii genu, poprzez sporządzenie krzywych wzorcowych z serii rozcieńczeń DNA pozyskanego od dawcy pozytywnego pod względem badanej cechy w DNA pozyskanym od osoby o przeciwstawnym genotypie. Wszystkie 3 wymienione elementy analizy cff-dna są bardzo ważne z uwagi na konieczność ograniczania ryzyka wydania fałszywie ujemnego wyniku badania prenatalnego (brak lub niska koncentracja cff-dna w pobranym osoczu z powodu nieprawidłowego odwirowania lub przechowywania osocza; niska wydajność izolowania cff-dna; mała czułość metody RQ-PCR). W przypadkach z klinicznym podejrzeniem HDFN (obecne alloprzeciwciała u matki) wyniki fałszywie ujemne wiążą się z szczególnie dużym niebezpieczeństwem. Opierając się na nich, lekarz może podjąć niewłaściwą decyzję o zaniechaniu leczenia płodu, które może się okazać konieczne dla ratowania zdrowia i życia dziecka. W badaniach profilaktycznych kobiet RhD-ujemnych bez przeciwciał uzyskanie wyniku fałszywie ujemnego wiąże się z mniejszym zagrożeniem kobieta nie dostanie immunoglobuliny anty-d w ciąży, ale dostanie ją po porodzie, po określeniu fenotypu D dodatniego krwinek dziecka. Charakter polimorfizmu badanego genu Polimorfizm delecji genu warianty genu RHD Teoretycznie wykrywanie genu RHD płodu w osoczu ciężarnej RhD-ujemnej kobiety (czyli nieposiadającej genu RHD) powinno być technicznie proste, szczególnie, gdy operuje się tak czułą techniką, jak RQ-PCR. Tym niemniej w badaniu tym napotyka się na wiele trudności związanych ze zróżnicowanym podłożem genetycznym fenotypu RhD-ujemnego i występowaniem licznych wariantów genu RHD. 147
5 Journal of Transfusion Medicine 2010, tom 3, nr 4 U 99% osób z populacji kaukaskiej podstawą fenotypu RhD-ujemnego jest brak całego genu RHD, natomiast u około 1% osób sekwencje genu RHD są obecne, ale z powodu różnych mechanizmów mutacji (SNP w regionach kodujących lub na styku intron-ekson, delecje/insercje, rekombinacje z genem RHCE) gen RHD jest niefunkcjonalny, czyli nie powstaje białko RhD albo jest on odpowiedzialny za tworzenie wariantów białka RhD o obniżonej ekspresji (tzw. D słabe, Del) bądź pozbawionych części epitopów antygenowych (tzw. D częściowe) [19, 32]. Warianty D częściowe (większość hybryd RHD-CE-D; mutacje punktowe w sekwencjach kodujących zewnątrzkomórkowe fragmenty białka RhD) oraz D słabe (najczęściej mutacje punktowe w sekwencjach kodujących regiony przezbłonowe lub wewnątrzkomórkowe białka RhD; część hybryd RHD-CE-D) często nie są wykrywane w rutynowych badaniach serologicznych. Część z nich może być zidentyfikowana w bardziej zaawansowanych badaniach serologicznych z kombinacją różnych przeciwiał monoklonalnych. Warianty Del (najczęściej mutacje punktowe na styku intron- -ekson, niektóre mutacje w sekwencji kodującej, delecje eksonu 8 lub 9 RHD) charakteryzują się natomiast tak słabą ekspesją, że są możliwe do wykrycia jedynie techniką adsorpcji/elucji. Bardziej szczegółowych informacji na temat częstości nietypowych fenotypów Rh ujemnych w populacjach europejskich dostarczają badania genetyczne dawców krwi. Ogółem odsetek osób RhD-ujemnych z wariantem genu RHD w Niemczech wynosi 0,21% [32], w Austrii 0,4% [33], a w Polsce 0,45% [34]. W innych grupach etnicznych podłoże genetyczne fenotypu RhD-ujemnego jest odmienne: u 67% osób RhD-ujemnych w rasie negroidalnej jest obecny pseudogen RHDY z duplikacją 37 par zasad (pz) w 4 eksonie RHD i mutacją nonsensowną w eksonie 6, a u 15% występuje gen hybrydowy RHD-CE(3-9)-D [19]. W rasie żółtej u 20 30% osób RhD-ujemnych są obecne różne allele RHDel, a u 4 6% hybrydy RHD-CE(3-9)-D [19]. Z omówionych powodów, diagnozując przypadek konfliktu RhD, powinno się znać pochodzenie etniczne rodziców. W świetle tej wiedzy dla zapewnienia wiarygodności nieinwazyjnych badań RHD płodu jest konieczne badanie kilku fragmentów genu RHD [21, 29, 35]. W publikowanych pracach zastosowano różne strategie doboru starterów (tab. 1) [36 59]. Problem najbardziej optymalnego pod względem ekonomicznym doboru badanych fragmentów RHD był dyskutowany na ostatnich warsztatach genotypowania krwinki czerwonej w Berlinie podczas Zjazdu ISBT w 2010 roku, gdzie skłaniano się do wykluczenia badań eksonu 10 RHD jako często dającego wyniki fałszywie dodatnie z powodu obecności w genach hybrydowych, determinujących fenotyp RhD-ujemny. W protokole RQ-PCR opracowanym w IHiT oznacza się równolegle obecność intronu 4, eksonu 7 i 10 [13]. Ten dobór regionów pozwala na ewentualne wykrycie i zakwalifikowanie większości alleli RHD, z wyjątkiem mutacji punktowych i pseudogenu RHDY, którego częstość w rasie kaukaskiej jest znikoma. Protokół umożliwia też różnicowanie, czy gen RHD pochodzi od matki czy od płodu, dzięki przyrównaniu poziomu wykrywania jego poszczególnych fragmentów do poziomu genu kontrolnego CCR5, wspólnego dla cff-dna i DNA matczynego. Jeśli sygnał dla wszystkich lub części fragmentów RHD jest na poziomie genu CCR5, to niemożliwa staje się nieinwazyjna diagnostyka prenatalna, ponieważ mamy do czynienia z wariantem genu RHD u matki, który maskuje ewentualny gen RHD płodu [60]. Polimorfizmy punktowe Nieinwazyjna diagnostyka konfliktów matczyno- -płodowych determinowanych przez SNP jest bardzo trudna do badania klasyczną techniką RQ- PCR, ze względu na wysoki poziom niespecyficznej amplifikacji, powstający z przeważającej ilości DNA matczynego. Jedynie badanie alleli RHCE*c, RHCE*E genu RHCE daje zadowalające wyniki ze względu na to, że użyte startery zawierają dodatkowe SNP, prócz tych warunkujących antygeny Rhc czy RhE [49, 61, 10]. Wykrywanie allelu RHCE*C nie opiera się natomiast bezpośrednio na różnicach SNP, ale na analizie obecności insercji w intronie 2 genu RHCE, nieobecnej w sekwecji allelu RHCE*c [61]. Unikalną strategię badań RQ-PCR opracowano dla wykrywania płodowego allelu KEL*1 [49]. Znaczne obniżenie poziomu niespecyficznej amplifikacji uzyskano poprzez modyfikację startera specyficznego dla allelu KEL*1, polegającą na wstawieniu dwóch analogów nukleotydów tak zwanych LNA (locked nucleic acids) tuż przed specyficznym nukleotydem dla KEL*1 na końcu 3. Niestety, sygnał specyficznej amplifikacji dla KEL*1 jest słabszy niż w przypadku genu RHD i przez to generuje większy odsetek wyników fałszywie ujemnych we wczesnych ciążach. Nowego pomysłu pokonania trudności technicznych badania SNP dostarcza prezentacja Scheffera i wsp. ze zjazdu ISBT w Berlinie w 2010 roku, dotycząca konfliktu HPA1a [62]. W celu obniżenia poziomu niespecyficznej amplifikacji z DNA matki, autorzy proponują jego eliminację poprzez enzymatyczne wytrawianie. Odpowiednio dobrany enzym 148
6 Katarzyna Guz i wsp., Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna w konfliktach serologicznych Tabela 1. Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna konfliktów matczyno-płodowych doniesienia z lat Table 1. Non-invasive prenatal diagnostics of feto-maternal incompatibilities the publications between 2005 and 2010 Piśmiennictwo Liczba Tydzień Badany Zastosowane Zastosowana Specyficzność Czułość kobiet ciąży fragment geny procedura, testu testu genu kontrolne modyfikacje (%) (%) Obecna 348 RhD 7 RHD intron 4, SRY, RQ-PCR 99,7* 100 praca 5 RhC ekson 7, ins/del, 21 Rhc RHCE*C CCR RhE RHCE*c K RHCE*E KEL* [36] RHD SRY, RHCE, RQ-PCR ekson 7, 10 B-aktyna [37] RHD ekson 10 Real-time PCR [38] RHD ekson 7, 10 SRY, RHCE, RQ-PCR RHCE*C/ RHCE*E B-aktyna [39] RHD ekson 7 B-aktyna RQ-PCR [40] 98 Brak RHD ekson 4, SRY/ RQ-PCR 98 95,9 danych 5, 10 /8 ins/del [41] RHD ekson 7, 10 Bd RQ-PCR [42] RHD ekson 5 (82bp), SRY/ RQ-PCR dupleks /8 ins/del [43] RHD ekson 10, RQ 93,8 98,3 intron 4 [44] RHD ekson 4, 5, 10 SRY/ RQ-PCR 99,7 99,7 /8 ins/del [45] 54 I, III RHD ekson 4, 7 RASSF1A RQ-PCR [46] RHD ekson 7 CCR5 RQ-PCR 99,6 99,8 [47] RHD ekson 4, 5, 10 SRY RQ-PCR ,8 4, 5 ekson; 4 ekson 94,6 97,1 10 ekson 5 ekson 96,9 10 ekson [48] RHD ekson (Free DNA RQ-PCR , 10 (Free DNA Fetal Kit RhD) Fetal Kit RhD) [49] 44 Rhc RHCE*c CCR5 RQ-PCR RhE RHCE*E RhC RHCE*C K KEL*1 LNA 96,2 96,2 [50] 32 II, III KEL*1 MALDI-TOF MS [21] RHD ekson 5, 7 CCR5 RQ-PCR 99,2 99,84 [51] RHD ekson 10 SRY PCR, kapilarna elektroforeza [52] RHD ekson 5, 7, 10 SRY, RQ-PCR 93, loci STR [53] 140 RHD 3 fragmenty SRY, RASSF1A RQ-PCR [54] 102 RHD ekson 7, 10 RQ-PCR [55] RHD ekson 5 B-globina RQ-PCR 62,5 92,3 [56] RHD ekson 5, 7 B-globina RQ-PCR [57] 175 RhD 9 RHD ekson 5, 7 SRY/ RQ-PCR Rhc RHCE*c /24 ins/del RhE RHCE*E RhC RHCE*C K KEL*1 97,9 100 [58] RHD ekson 5, 7, 10 SRY CCR5 RQ-PCR [59] RHD ekson 4 GADPH RQ-PCR 99,2 100 *w 1/88 przypadków z wynikiem RhD-ujemnym nie znaleziono markera na potwierdzenie obecności cff-dna RQ-PCR (real-time quantitative polymerase chain reaction) reakcja łańcuchowa polimerazy w czasie rzeczywistym; MALDI-TOF MS (matrix assisted laser desorption ionisation-time-of-flight mass spectrometry) spektometria mas techniką desorpcji laserowej z udziałem matrycy i analizatora czasu przelotu 149
7 Journal of Transfusion Medicine 2010, tom 3, nr 4 restrykcyjny rozpoznaje i rozcina w miejscu SNP tylko sekwencję allelu HPA*1b, charakterystycznego dla DNA matki. Konieczność potwierdzania obecności cff-dna w badanej próbce W każdym przypadku, w którym uzyska się wynik ujemny na poszukiwanie celowanego genu płodu, istnieje konieczność udowodnienia, że w próbce obecne było DNA płodu i że jego jakość i ilość były odpowiednie. Taki dowód uzyskuje się poprzez wykrycie genu/ów płodu, dziedziczonych po ojcu, a nie obecnych u matki. Dla płodów płci męskiej poszukuje się genu SRY z chromosomu Y, zawsze analizowanego w podstawowym protokole. Dla płodów płci żeńskiej jedyną możliwością jest, nie zawsze skuteczne, poszukiwanie ojcowskiego markera typu insercja/delecja (ins/del) [13, 57]. Pewne nadzieje wiązano z analizą epigenetyczną promotora genu RASSF1A, ponieważ płodowe sekwencje zawierają dużą ilość reszt metylowych (hipermetylacja), w odróżnieniu od sekwencji matczynych, z niewielkim odsetkiem reszt metylowych (hypometylacja) [45]. Enzymatyczne wytrawianie hypometylowanego DNA matki, a potem detekcja techniką RQ-PCR tylko metylowanych sekwencji promotora RASSF1A mają dowodzić obecności DNA płodowego w badanej próbce. Ta metodologia cechuje się niską specyficznością z powodu niecałkowitego dotrawienia matczynego DNA, co stwarza niebezpieczeństwo fałszywego potwierdzenia obecności materiału płodowego. Niebezpieczeństwo kontaminacji obcym DNA na każdym etapie badania cff-dna Pojedyncze kopie drobnocząsteczkowego DNA z powszechnie występującymi genami, a do takich zalicza się gen RHD czy kontrolny gen SRY, mogą się przedostać do badanej próbki osocza zarówno w fazie przedanalitycznej (pobieranie krwi, separacja osocza), jak i analitycznej (izolowanie DNA, nastawianie reakcji RQ-PCR). Obce DNA może pochodzić z innej badanej próbki (kropelki krwi, osocza), z zanieczyszczonego sprzętu laboratoryjnego (wirówki, bloki grzejne, automatyczne ekstraktory DNA) lub stanowiska pracy, albo dostaje się do próbki z ciała operatora wykonującego badanie (złuszczony naskórek, wydychane powietrze z mikrokropelkami śliny). Dlatego dla nieinwazyjnych badań prenatalnych poleca się odpowiedni sposób pobierania materiału (separacja osocza bez otwierania probówek) oraz wykonywania izolowania DNA i detekcji RQ-PCR (odpowiedni strój laboranta, osobne pomieszczenia do izolacji i nastawiania RQ- -PCR, w miarę możliwości praca w komorze laminarnej; regularne procedury czyszczenia sprzętu laboratoryjnego i stanowisk pracy). Sprawą bezdyskusyjną jest restrykcyjne przestrzeganie zasad zapobiegania kontaminacjom produktami PCR w laboratorium (odpowiednia organizacja pomieszczeń części czystej i brudnej ). Konsekwencje wydania wyniku fałszywie dodatniego z powodu powyższych przyczyn nie są wprawdzie tak duże jak w przypadku wyniku fałszywie ujemnego, ale mogą być fałszywym tropem, skłaniającym lekarza do wykonania zabiegu inwazyjnego (kobiety zimmunizowane), a w przypadku profilaktyki konfliktu RhD do niepotrzebnego podania immunoglobuliny anty-d w ciąży. Aktualny stan nieinwazyjnych badań płodu w konfliktach serologicznych w Polsce i na świecie W celu podsumowania dotychczasowych badań prenatalnych w konfliktach serologicznych zestawiono je z doniesieniami opublikowanymi po 2004 roku (tab. 1). Jako parametry oceny autorki wybrały swoistość i specyficzność używanych protokołów badań. Do tej pory w IHiT przebadano 428 RhD-ujemne kobiety w ciąży. W 353 przypadkach było możliwe porównanie wyników nieinwazyjnego oznaczenia genu RHD płodu ze statusem RhD noworodka. U 5 kobiet nieinwazyjna diagnostyka RHD płodu nie była możliwa do przeprowadzenia ze względu na wykrycie u matki wariantów genu RHD: u 4 D słabe, u 1 wariant RHDel (IVS3 + 1G > A). W pozostałych 348 przypadkach wyniki nieinwazyjnego oznaczenia RHD płodu były prawidłowe: w 260 RhD-dodatnie, a w 88 RhD-ujemne. W 5 osoczach z pierwszego trymestru ciąży sygnał RQ-PCR był zbyt niski i badania wymagały powtórzenia w drugim trymestrze. Obecność cff-dna potwierdzono w 87/88 przypadkach: w 51 przez wykrycie genu SRY (noworodki były RhD-ujemnymi chłopcami), a w 36 przez wykrycie polimorfizmu insercja/delecja odziedziczonego po ojcu, a nieobecnego u matki (urodziły się RhD-ujemne dziewczynki). W jednym przypadku takiego polimorfizmu nie znaleziono i nie udało się potwierdzić obecności cff-dna przy RhD- -ujemnym wyniku. U 5 kobiet RhD-ujemnych z rzadkimi przeciwciałami anty-g dodatkowo zbadano obecność allelu RHCE*C, kodującego swoistość RhC, równie groźną w tym przypadku, co RhD. U 2 kobiet wy- 150
8 Katarzyna Guz i wsp., Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna w konfliktach serologicznych kluczono obecność obu genów RHD i RHCE*C, u 3 stwierdzono ich współwystępowanie. Badania nieinwazyjne genów płodu przeprowadzono też u 21 kobiet ciężarnych z przeciwciałami anty-rhc i 22 z przeciwciałami anty-rhe oraz u 5 kobiet z przeciwciałami anty-k. We wszystkich przypadkach wyniki nieinwazyjnej diagnostyki były prawidłowe. Według doświadczeń autorek niniejszej pracy, testy nieinwazyjnej diagnostyki, wykorzystujące do kontroli cff-dna, polimorfizmy insercja/delecja, są wiarygodne od 18. tygodnia ciąży. Dla badań we wcześniejszych etapach ciąży i opracowania nieinwazyjnej diagnostyki kolejnych konfliktów matczyno- -płodowych, determinowanych SNP (np. w zakresie HPA1a płytek krwi), konieczne jest dalsze udoskonalanie procedur. Kierunki potencjalnych usprawnień przedstawiono poniżej. Perspektywy usprawnienia badań DNA płodu w osoczu kobiet ciężarnych Fizykochemiczne różnice między cff-dna a DNA matczynym Rozdział cff-dna od DNA matczynego staje się możliwy dzięki wykryciu fizykochemicznych właściwości różniących oba rodzaje DNA, obecne w osoczu kobiet ciężarnych. Analiza porównawcza liczby i wzajemnej proporcji różnej wielkości amplikonów, powielających gen specyficzny dla cff-dna lub wspólny z DNA matczynym, wykazała, że > 99% cff-dna zawiera fragmety mniejsze niż 300 pz, a większość DNA matczynego składa się z fragmentów większych niż 500 pz. Fragmenty DNA matczynego w osoczu kobiety ciężarnej są zdecydowanie dłuższe niż u mężczyzn i kobiet niebędących w ciąży [63, 64]. Wyniki badań techniką mikroskopii elektronowej struktur apoptycznych (tzw. APO-bodies [apoptotic-bodies]) obecnych w osoczu kobiet ciężarnych udowodniły, że cff-dna jest uwięzione w małych strukturach odpowiadających pojedynczym nukleosomom (uwolnione mono-nukleosomy), zaś DNA matki jest zawarte w większych, niejednorodnych co do wielkości strukturach bogatych w chromatynę [65]. Trop różnicowania nukleosomów z cff-dna i chromatyny z DNA matczynym zaowocował wykryciem różnic w budowie histonu H3: większość cff-dna jest opleciona wokół histonu H3.1, charakterystycznego dla tkanek płodu, zaś DNA matki oplata histon H3.3, typowy dla komórek osób dorosłych. Na poziomie sekwencji białkowej oba podtypy histonów H3 różnią się kilkoma aminokwasami, co pozwala na ich separację przy użyciu przeciwciał monoklonalnych. Odkrycie to zostało opatentowane, a metoda separacji z wykorzystaniem przeciwciał anty-h3.1 jest własnością firmy BIOCEPT, INC. San Diego, US (nr patentu USPTO ). Separacja cff-dna od DNA matki była przeprowadzana w żelach agarozowych, ale nie znalazła powszechnego zastosowania z uwagi na duże ryzyko kontaminacji i żmudność pracy przy tego typu manipulacjach [64, 66]. Nowe perspektywy wiążą się z elektroforezą kapilarną, szczególnie przeprowadzaną z wykorzystaniem technologii mikroukładów, tak zwanych lab-on-chip [67]. Opracowanie metody wzbogacenia frakcji cff-dna być może będzie perspektywą poprawy nieinwazyjnej diagnostyki klasyczną metodą RQ-PCR różnych chorób, determinowanych przez SNP (nie tylko konflikty serologiczne), czy chromosomalnymi aneploidiami. Nowe technologie używane do genotypowania cff-dna Rynek nowych technologii badania kwasów nukleinowych bardzo prężnie się rozwija. W ciągu ostatnich 4 lat pojawiły się publikacje o jego wykorzystaniu do analizy cff-dna z osocza kobiet ciężarnych [68]. Opisane metody pokonują trudności związane z niekorzystną proporcją cff-dna względem DNA matczynego. Jedną z propozycji jest technika spektrometrii masowej MALDI-TOF, opierająca się na ilościowej analizie masy cząsteczkowej powielonych w PCR fragmentów genów, które dają różne wzory widm, nawet jeśli różnią się pojedynczym nukleotydem czy metylacją/demetylacją DNA [11]. Opublikowano pracę o badaniu allelu KEL*1 płodu i genu kontrolnego RASSF1 [50, 69]. W materiałach na stronie internetowej producenta systemu firmy Sequenom można znaleźć informacje o wynikach adaptacji techniki do konfliktu RhD. Drugą aplikacją jest digital PCR, w którym wykorzystuje się możliwość badania pojedynczych kopii genów, dzięki prowadzeniu reakcji PCR w setkach kanalików, które są obecne w specjalnie konstruowanych mikrofluidowych płytkach [10]. Ze względu na mniejszą wielkość cząsteczki cff-dna efektywniej wnikają do tych kanalików i podnosi się odsetek wykrywanych genów płodu (w 3. trymestrze z 6% na 20% względem DNA matki) [70]. Trzecią techniką jest sekwencjonowanie nowej generacji, pozwalające na analizę ogromnej liczby genów jednocześnie. Propozycji metodologii i sprzętu jest kilka [71]. Na razie prace na temat analizy cff-dna ograniczają się do dwóch producentów i dotyczą anaploidii, a autorzy podkreślają możliwość 151
9 Journal of Transfusion Medicine 2010, tom 3, nr 4 wieloczynnikowego (w tysiącach sekwencji) potwierdzenia nieprawidłowej liczby chromosomów na przykład trisomii chromosomu 13, 18, 21 [12]. Być może jest to pomysł na wieloaspektową analizę przyczyn konfliktu serologicznego identyfikację różnych polimorfizmów grup krwi. Wszystkie te technologie są jednak na razie w fazie opracowań i zmierzają do wytworzenia gotowych testów dla nieinwazyjnej diagnostyki prenatalnej, która będzie tania w przeliczeniu na jednostkowe badania, ale droga w aspekcie wyposażenia aparaturowego i wyszkolenia personelu. Zmierzają też do komercjalizacji badań. Powszechne ich stosowanie to kierunek rozwoju diagnostyki w przyszłości, ale na obecnym etapie najbardziej przystępną techniką genotypowania cff-dna wciąż pozostaje RQ-PCR. Podziękowania Opracowanie metodyki nieinwazyjnych badań prenatalnych w konfliktach serologicznych było możliwe dzięki grantom KBN i MNiSW (nr 6PO5E12821 i nr 2PO5E02129), których inicjatorem i kierownikiem była prof. dr hab. n. med. Barbara Żupańska. Dziękujemy pracownikom laboratoriów i lekarzom, którzy zajmują się kobietami w ciąży, a także im samym za zainteresowanie naszymi badaniami bez próbek osocza, badań serologicznych oraz obserwacji klinicznych nie byłyby możliwe. Piśmiennictwo 1. Lo Y., Corbetta N., Chamberlain P. i wsp. Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum. Lancet 1997; 350: Lo Y., Tein M., Lau T. i wsp. Quantitative analysis of fetal DNA in maternal plasma and serum: implications for noninvasive prenatal diagnosis. Am. J. Hum. Genet. 1998; 62: Lo Y., Zhang J., Leung T., Lau T., Chang A., Hjelm N. Rapid clearance of fetal DNA from maternal plasma. Am. J. Hum. Genet. 1999; 64: Bianchi D., Zickwolf G., Weil G., Sylvester S., DeMaria M. Male fetal progenitor cells persist in maternal blood for as long as 27 years postpartum. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996; 93: Lo Y., Hjelm N., Fidler C. i wsp. Prenatal diagnosis of fetal RhD status by molecular analysis of maternal plasma. N. Engl. J. Med. 1998; 339: Costa J., Benachi A., Gautier E. New strategy for prenatal diagnosis of X-linked disorders. N. Eng. J. Med. 2002; 346: Avent N., Madgett T., Maddocks D., Soothill P. Cell-free fetal DNA in the maternal serum and plasma: current and evolving applications. Curr. Opin. Obstet. Gynecol. 2009; 21: Chen C., Chern S., Wang W. Fetal DNA in maternal plasma: the prenatal detection of a paternally inherited fetal aneuploidy. Prenat. Diagn. 2000; 20; Engel K., Płonka T., Bilar M., Orzińska A., Brojer E., Ronin- -Walknowska E. The correlation between clinical characteristics of preeclampsia and the correlation of fetal DNA in maternal circulation. Eur. J. Obstet. Gynecol. Reprod. Biol. 2008; 139: Zimmermann B., Grill S., Holzgreve W., Zhong X., Jackson L., Hahn S. Digital PCR: a powerful new tool for noninvasive prenatal diagnosis? Prenat. Diagn. 2008; 28: Zhong X., Holzgreve W. MALDI-TOF MS in Prenatal Genomics. Transfus. Med. Hemother. 2009; 36: Fan H., Blumenfeld Y., Chitkara U., Hudgins L., Quake S. Non- -invasive diagnosis of fetal aneuploidy by shotgun sequencing DNA from maternal blood. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2008; 105: Brojer E., Żupanska B., Guz K., Orzińska A., Kalińska A. Non- -invasive determination of fetal RHD status by examination of cell-free DNA in maternal plasma. Transfusion 2005; 45: Orzińska A., Guz K., Brojer E. i wsp. Preliminary results of fetal Rhc examination in plasma of pregnant women with anti-c. Prenat. Diagn. 2008; 28: Orzińska A., Guz K., Brojer E. Nieinwazyjne badania prenatalne z osocza kobiet ciężarnych w konfliktach serologicznych w Polsce. Gin. Pol. 2009; 80: Murray J., Karp L., Williamson R., Cheng E., Luthy D. Rh isoimmunization related to amniocentesis. Am. J. Med. Genet. 1983; 16: Żupańska B., Nowaczek-Migas M., Michalik M., Michalewska B. Czy należy wykonywać badania przesiewowe u wszystkich ciężarnych w celu wykrycia przeciwciał innych niż anty-d? Gin. po Dypl. 2009; 2: Lenkiewicz B. Konflikt Rh po 25 latach stosowania immunoprofilaktyki. Gin. Pol. 2000; 71: Daniels G. Human blood group. Wyd. 2. Blackwell Science, Oxford van der Schoot C.E. Molecular genotyping in prenatal, donor and pre-transfusion testing. common ppt C. Ellen van der Schoot, MD, PhD_ver3.pdf; Finning K., Martin P., Summers J., Massey E., Poole G., Daniels G. Effect of high throughput RHD typing of fetal DNA in maternal plasma on use of anti-rhd immunoglobulin in RhD negative pregnant women: prospective feasibility study. BMJ 2008; 336: Bussel J. Diagnosis and management of the fetus and neonate with alloimmune thrombocytopenia. J. Thromb. Haemost. 2009; 7 (supl. 1): Kaplan C. Neonatal alloimmune thrombocytopenia. Haematologica 2008; 93: Kamphuis M., Paridaans N., Porcelijn L. i wsp. Screening in pregnancy for fetal or neonatal alloimmune thrombocytopenia: systematic review. BJOG 2010; 117 (11): Maslanka K., Guz K., Zupanska B. Antenatal screening of unselected pregnant women for HPA-1a antigen, antibody and alloimmune thrombocytopenia.vox Sang. 2003; 85: Rocznik demograficzny Dmochowska H. (red.). Zakład Wydawnictw Statystycznych, Warszawa 2009: Orzińska A., Guz K., Gala K., Brojer E. Wpływ warunków pobierania i przechowywania materiału oraz izolacji DNA na wyniki wykrywania genów płodu w osoczu kobiet ciężarnych w celu nieinwazyjnych badań prenatalnych. Diagn. Lab. 2007; 43:
10 Katarzyna Guz i wsp., Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna w konfliktach serologicznych 28. Fernando M., Chen K., Norton S. i wsp. A new methodology to preserve the original proportion and integrity of cell-free fetal DNA in maternal plasma during sample processing and storage. Prenat. Diagn. 2010; 30: Legler T. Prenatal rhesus testing. Vox Sang. 2010; 5: Clausen F., Krog G., Rieneck K., Dziegiel M. Improvement in fetal DNA extraction from maternal plasma. Evaluation of the NucliSens Magnetic Extraction system and the QIAamp DSP Virus Kit in comparison with the QIAamp DNA Blood Mini Kit. Prenat. Diagn. 2007; 27: Legler T., Liu Z., Heermann K. i wsp. Specific magnetic bead- -based capture of free fetal DNA from maternal plasma. Transfus. Apher. Sci. 2009; 40: Flegel W., von Zabern I., Wagner F. Six years experience performing RHD genotyping to confirm D-red blood cell units in Germany for preventing anti-d immunizations. Transfusion 2009; 49: Polin H., Danzer M., Gaszner W. i wsp. Identification of RHD alleles with the potential of anti-d immunization among seemingly D-blood donors in Upper Austria. Transfusion 2009; 49: Pelc-Kłopotowska M., Orzińska A., Michalewska B. i wsp. Badanie obecności fragmentów genu RHD u dawców RhD-ujemnych z zastosowaniem minipulowania i technologii real-time PCR. J. Transfus. Med. 2008; 1: Daniels G., Finning K., Martin P., Massey E. Noninvasive prenatal diagnosis of fetal blood group phenotypes: current practice and future prospects. Prenat. Diagn. 2009; 29: Hromadnikova I., Vechetova L., Vesela K., Benesova B., Doucha J., Vlk R. Non-invasive fetal RHD and RHCE genotyping using real- -time PCR testing of maternal plasma in RhD-negative pregnancies. J. Histochem. Cytochem. 2005; 53: Gautier E., Benachi A., Giovangrandi Y. i wsp. Fetal RhD genotyping by maternal serum analysis: a two year experience. Am. J. Obstet. Gynecol. 2005; 192: Hromadnikova I., Vechetova L., Vesela K. i wsp. Non-invasive fetal RHD exon 7 and exon 10 genotyping using real-time PCR testing of fetal DNA in maternal plasma. Fetal Diagn. Ther. 2005; 20: Gonzalez-Gonzalez C., Garcia-Hoyos M., Trujillo-Tiebas M. i wsp. Application of fetal DNA detection in maternal plasma: a prenatal diagnosis unit experience. J. Histochem. Cytochem. 2005; 53: Zhou L., Thorson J., Nugent C., Davenport R.D., Butch S.H., Judd W.J. Noninvasive prenatal RHD genotyping by real-time polymerase chain reaction using plasma from D-negative pregnant women. Am. J. Obstet. Gynecol. 2005; 193: Clausen F., Krog G., Rieneck K. i wsp. Reliable test for prenatal prediction of fetal RhD type using maternal plasma from RhD negative women. Prenat. Diagn. 2005; 25: Grootkerk-Tax M.G., Soussan A.A., de Haas M., Maaskant-van Wijk P.A., van der Schoot C.E. Evaluation of prenatal RHD typing strategies on cell-free fetal DNA from maternal plasma. Transfusion 2006; 46: Machado I., Castilho L., Pellegino J., Barini R. Fetal RHD genotyping from maternal plasmain a population with a highly diverse ethnic background. Rev. Assoc. Med. Bra. 2006; 52: Daniels G., Finning K., Martin P., Summers J. Fetal blood group genotyping: present and future. Ann. NY Acad. Sci. 2006; 1075: Chan K., Ding C., Gerovassili A. i wsp. Hypermethylated RASSF1A in maternal plasma: A universal fetal DNA marker that improves the reliability of noninvasive prenatal diagnosis. Clin. Chem. 2006; 52: van der Schoot C., Soussan A., Koelewijn J., Bonsel G., Paget- -Christiaens LG., de Haas M. Non-invasive antenatal RHD typing. Trans. Clin. Biol. 2006; 13: Minon J.M., Gerard C., Senterre J.M., Schaaps J.P., Foidart J.M. Routine fetal RHD genotyping with maternal plasma: a four- -year experience in Belgium. Transfusion 2008; 48: Rouillac-Le Sciellour C., Sérazin V., Brossard Y. i wsp. Noninvasive fetal RHD genotyping from maternal plasma. Use of a new developed Free DNA Fetal Kit RhD. Transfus. Clin. Biol. 2007; 14: Finning K., Martin P., Summers J., Daniels G. Fetal genotyping for the K (Kell) and Rh C, c and E blood groups on cell-free fetal DNA in maternal plasma. Transfusion 2007; 47: Li Y., Finning K., Daniels G., Hahn S., Zhong X., Holzgreve W. Noninvasive genotyping fetal Kell blood group (KEL1) using cell-free fetal DNA in maternal plasma by MALDI-TOF mass spectrometry. Prenat. Diagn. 2008; 28: Kimura M., Sato C., Hara M., Ishihara O., Ikebuchi K. Non- -invasive fetal RHD genotyping by maternal plasma with capillary electrophoresis. Transfusion 2008; 48: Wang X.D., Wang B.L., Ye S.L., Liao Y.Q., Wang L.F., He Z.M. Non-invasive foetal RHD genotyping via real-time PCR of foetal DNA from Chinese RhD-negative maternal plasma. Eur. J. Clin. Invest. 2009; 39: Hyland C.A., Gardener G.J., Davies H. i wsp. Evaluation of non- -invasive prenatal RHD genotyping of the fetus. Med. J. Aust. 2009; 191: Chinen P.A., Nardozza L.M., Martinhago C.D. i wsp. Non-invasive determination of fetal Rh blood group, D antigen status by cell-free DNA analysis in maternal plasma: experience in a brazilian population. Am. J. Perinatol. 2010; 27 (10): Mohammed N., Kakal F., Somani M., Zafar W. Non-invasive prenatal determination of fetal RhD genotyping from maternal plasma: a preliminary study in Pakistan. J. Coll. Physicians Surg. Pak. 2010; 20: Cardo L., García B.P., Alvarez F.V. Non-invasive fetal RHD genotyping in the first trimester of pregnancy. Clin. Chem. Lab. Med. 2010; 48: Scheffer P., de Haas M., van der Schoot C., Bossers B., Ligthart P., Schuitemaker L. Non-invasive feal blood group genotyping with DNA from maternal plasma: a seven-year clinical experience. Vox Sang. 2010; 99 (supl. 1): Amaral D.R., Castillo L. Fetal RHD genotyping by analysis of maternal plasma in a mixed population. Vox Sang. 2010; 99 (supl. 1): Wikman A., Tiblad E., Karlsson A., Westgren M., Lundahl J. Detection of fetal RHD DNA in maternal plasma in early pregnancy in an antenatal screening program. Vox Sang. 2010; 99 (supl. 1): Orzińska A., Engel K., Łakomy M. i wsp. RHD variant in RhD/-/ mother with anti-d makes noninvasive fetal RHD genotyping impossible. Ginekol. Pol. 2009; 80: Legler T., Lynen R., Maas J. i wsp. Prediction of fetal RhD and RhCcEe phenotype from maternal plasma with real-time polymerase chain reaction. Transfus. Apher. Sci. 2002; 27: Scheffer P., de Haas M., Oepkes D., AitSoussan A., Page-Christiiaens G., van der Schoot C. Noninvasive fetal genotyping of 153
11 Journal of Transfusion Medicine 2010, tom 3, nr 4 human platelet antigen HPA 1a using cell-free fetal DNA isolated from maternal blood. Vox Sang. 2010; 99 (supl. 1): Chan K., Zhang J., Hui A. i wsp. Size distributions of maternal and fetal DNA in maternal plasma. Clin. Chem. 2004; 50: Li Y., Zimmermann B., Rusterholz C., Kang A., Holzgreve W., Hahn S. Size separation of circulatory DNA in maternal plasma permits ready detection of fetal DNA polymorphisms. Clin. Chem. 2004; 50: Bischoff F., Lewis D., Simpson J. Cell-free fetal DNA in maternal blood: kinetics, source and structure. Human Reproduction Update 2005; 11: Hromadnikova I., Zejskova L., Doucha J., Codl D. Quantification of fetal and total circulatory DNA in maternal plasma samples before and after size fractionation by agarose gel electrophoresis. DNA Cell Biol. 2006: 25: Hahn T., Drese K., O Sullivan C. Microsystem for isolation of fetal DNA from maternal plasma by preparative size separation. Clin. Chem. 2009; 55: Raymond F., Whittaker J., Jenkins L., Lench N., Chitty L. Molecular prenatal diagnosis: the impact of modern technologies. Prenat. Diagn. 2010; 30: Bellido M.L., Radpour R., Lapaire O. i wsp. MALDI-TOF mass array analysis of RASSF1A and SERPINB5 methylation patterns in human placenta and plasma. Biol. Reprod. 2010; 82: Lun F., Chiu R., Chan K., Leung T., Lau T., Lo Y. Microfluidics digital PCR reveals a higher than expected fraction of fetal DNA in maternal plasma. Clin. Chem. 2008; 54: Voelkerding K., Dames S., Durtschi J. Next-generation sequencing: from basic research to diagnostics. Clin. Chem. 2009; 55:
Katarzyna Guz. Instytut Hematologii i Transfuzjologii w Warszawie
Katarzyna Guz Instytut Hematologii i Transfuzjologii w Warszawie Nieinwazyjne badania molekularne antygenów komórek krwi Dlaczego są ważne? Dzięki czemu są możliwe? Jakimi metodami prowadzimy je w Polsce
DIAGNOSTYKA IMMUNOHEMATOLOGICZNA KONFLIKTU SEROLOGICZNEGO MATCZYNO-PŁODOWEGO. Katarzyna Szczudło Dział Immunologii Transfuzjologicznej RCKiK Katowice
DIAGNOSTYKA IMMUNOHEMATOLOGICZNA KONFLIKTU SEROLOGICZNEGO MATCZYNO-PŁODOWEGO Katarzyna Szczudło Dział Immunologii Transfuzjologicznej RCKiK Katowice Badania immunohematologiczne u kobiet w ciąży grupa
ObecnoÊç niemego genu RHD u RhD ujemnej kobiety ci arnej z przeciwciałami anty-rhd uniemo liwia okreêlenie genotypu RHD płodu metodà nieinwazyjnà
ObecnoÊç niemego genu RHD u RhD ujemnej kobiety ci arnej z przeciwciałami anty-rhd uniemo liwia okreêlenie genotypu RHD płodu metodà nieinwazyjnà RHD variant in RhD/-/ mother with anti-d makes noninvasive
Zapytaj swojego lekarza.
Proste, bezpieczne badanie krwi, zapewniające wysoką czułość diagnostyczną Nieinwazyjne badanie oceniające ryzyko wystąpienia zaburzeń chromosomalnych, takich jak zespół Downa; opcjonalnie umożliwia również
NIPT Nieinwazyjny Test Prenatalny (ang. Non-Invasive Prenatal Test)
NIPT Nieinwazyjny Test Prenatalny (ang. Non-Invasive Prenatal Test) Nieinwazyjne badanie krwi kobiety ciężarnej w kierunku wykluczenia najczęstszych trisomii u płodu Cel testu NIPT Celem testu NIPT jest
Wybrane zagadnienia dotyczące nieinwazyjnych badań antygenów krwinkowych płodu
ARTYKUŁ POGLĄDOWY Journal of Transfusion Medicine 2015, tom 8, nr 3, 109 113 Copyright 2015 Via Medica ISSN 1689 6017 Wybrane zagadnienia dotyczące nieinwazyjnych badań antygenów krwinkowych płodu w świetle
Diagnostyka serologiczna i molekularna
Małgorzata Uhrynowska, Agnieszka Orzińska, Katarzyna Guz, Patrycja Łopacz, Agnieszka Gierszon, Ewa Brojer Zakład Immunologii Hematologicznej i Transfuzjologicznej, Instytut Hematologii i Transfuzjologii
Badanie obecności fragmentów genu RHD u dawców RhD ujemnych z zastosowaniem minipulowania i technologii real-time PCR
PRACA ORYGINALNA Journal of Transfusion Medicine 2008, tom 1, nr 1, 40 45 Copyright 2008 Via Medica ISSN 1689 6017 Badanie obecności fragmentów genu RHD u dawców RhD ujemnych z zastosowaniem minipulowania
NIFTY TM Nieinwazyjny, Genetyczny Test Prenataly określający ryzyko wystąpienia zespołu Downa, Edwardsa i Patau
NIFTY TM Nieinwazyjny, Genetyczny Test Prenataly określający ryzyko wystąpienia zespołu Downa, Edwardsa i Patau Nieinwazyjne badania prenatalne, polegające na ocenia parametrów biochemicznych, takie jak
Nowa generacja nieinwazyjnych badań prenatalnych. www.neobona.pl
Nowa generacja nieinwazyjnych badań prenatalnych www.neobona.pl Aberracje chromosomowe występują u około 1% wszystkich płodów. Diagnostyka prenatalna obejmuje testy opracowane w celu badania prawidłowego
Jedyny nieinwazyjny test prenatalny wykonywany w Polsce
Jedyny nieinwazyjny test prenatalny wykonywany w Polsce Od 6 września 2018 test NIFTY TM nie jest już dostępny w Polsce. Genomed zastępuje go Testem Prenatalnym SANCO. Genomed S.A. od maja 2015 roku, jako
Jedyny nieinwazyjny test prenatalny wykonywany w Polsce
Jedyny nieinwazyjny test prenatalny wykonywany w Polsce Od 6 września 2018 test NIFTY TM nie jest już dostępny w Polsce. Genomed zastępuje go Testem Prenatalnym SANCO. Genomed S.A. od maja 2015 roku, jako
DIAGNOSTYKA IMMUNOHEMATOLOGICZNA KONFLIKTU SEROLOGICZNEGO MATCZYNO-PŁODOWEGO. Katarzyna Szczudło Dział Immunologii Transfuzjologicznej RCKiK Katowice
DIAGNOSTYKA IMMUNOHEMATOLOGICZNA KONFLIKTU SEROLOGICZNEGO MATCZYNO-PŁODOWEGO Katarzyna Szczudło Dział Immunologii Transfuzjologicznej RCKiK Katowice Badania immunohematologiczne w diagnostyce ChHPN grupa
Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna trisomii 21,18 i 13 z wykorzystaniem wolnego pozakomórkowego DNA płodu
Ginekol Pol. 2013, 84, 714-719 Nieinwazyjna diagnostyka prenatalna trisomii 21,18 i 13 z wykorzystaniem wolnego pozakomórkowego DNA płodu Noninvasive prenatal diagnosis of trisomy 21, 18 and 13 using cell
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
ZAKŁAD DIAGNOSTYKI LABORATORYJNEJ I IMMUNOLOGII KLINICZNEJ WIEKU ROZOJOWEGO AM W WARSZAWIE.
ZAKŁAD DIAGNOSTYKI LABORATORYJNEJ I IMMUNOLOGII KLINICZNEJ WIEKU ROZOJOWEGO AKADEMII MEDYCZNEJ W WARSZAWIE. ZAKŁAD DIAGNOSTYKI LABORATOTORYJNEJ WYDZIAŁU NAUKI O ZDROWIU AKADEMII MEDYCZNEJ W WARSZAWIE Przykładowe
Profilaktyka konfliktu serologicznego w zakresie antygenu D z układu Rhesus (Rh) Informacje dla kobiet w ciąży
- Profilaktyka konfliktu serologicznego w zakresie antygenu D z układu Rhesus (Rh) Informacje dla kobiet w ciąży 2 Spis treści Historia profilaktyki konfliktu serologicznego w zakresie antygenu D z układu
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Informacje na temat badań prenatalnych
Informacje na temat badań prenatalnych PODSTAWOWE INFORMACJE Z ZAKRESU BIOLOGII BIOLOGIA Nasz organizm zbudowany jest z miliardów komórek. W każdej z nich zawarty jest materiał genetyczny, czyli DNA (ang.
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
DIAGNOSTYKA SEROLOGICZNA
DIAGNOSTYKA SEROLOGICZNA PACJENTÓW W OKRESIE OKOŁOPRZESZCZEPOWYM Katarzyna Popko Zakład Diagnostyki Laboratoryjnej i Immunologii Klinicznej Wieku Rozwojowego WUM ZASADY DOBORU DAWCÓW KOMÓREK KRWIOTWÓRCZYCH
Jednoznaczne ODPOWIEDZI na ważne pytania
Jednoznaczne ODPOWIEDZI na ważne pytania TEST PRENATALNY HARMONY to nowy test DNA z krwi matki określający ryzyko zespołu Downa. Test Harmony jest bardziej dokładny niż tradycyjne testy i można go wykonywać
Wybrane zagadnienia dotyczące badań antygenów krwinki czerwonej metodami biologii molekularnej
ARTYKUŁ POGLĄDOWY Journal of Transfusion Medicine 2015, tom 8, nr 3, 114 118 Copyright 2015 Via Medica ISSN 1689 6017 Wybrane zagadnienia dotyczące badań antygenów krwinki czerwonej metodami biologii molekularnej
Najbardziej Wiarygodny, Nieinwazyjny Test Prenatalny wykonywany w Polsce Test NIFTY : tylko mała próbka krwi ciężarnej
Najbardziej Wiarygodny, Nieinwazyjny Test Prenatalny wykonywany w Polsce Test NIFTY : To nieinwazyjny, genetyczny test prenatalny nowej generacji, który określa ryzyko trisomii chromosomów 21, 18 i 13
INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH W CHOROBIE HUNTINGTONA
XX Międzynarodowa konferencja Polskie Stowarzyszenie Choroby Huntingtona Warszawa, 17-18- 19 kwietnia 2015 r. Metody badań i leczenie choroby Huntingtona - aktualności INTERPRETACJA WYNIKÓW BADAŃ MOLEKULARNYCH
NIFTY nieinwazyjny test prenatalny wykorzystujący sekwencjonowanie nowej generacji mgr inż. Łukasz Brejnakowski Country Sales Manager www.
NIFTY nieinwazyjny test prenatalny wykorzystujący sekwencjonowanie nowej generacji mgr inż. Łukasz Brejnakowski Country Sales Manager www. test-nifty.com.pl BGI Beijing Genomics Institute Największe centrum
Test Prenatalny Harmony. przesiewowe badanie prenatalne nowej generacji w kierunku trisomii chromosomowych
Test Prenatalny Harmony przesiewowe badanie prenatalne nowej generacji w kierunku trisomii chromosomowych Test Harmony Co wykrywa Dla kogo jest przeznaczony Zasada działania testu Jak i gdzie można wykonać
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Grupy krwi i przeciwciała na czerwone krwinki w czasie ciąży
Grupy krwi i przeciwciała na czerwone krwinki w czasie ciąży Podczas ciąży przeprowadzane są badania mające na celu rozpoznanie grupy krwi oraz wykrycie istnienia przeciwciał na czerwone krwinki. Badania
Streszczenia badań klinicznych
Streszczenia badań klinicznych Test Harmony to nieinwazyjny test prenatalny (NIPT), który pozwala ocenić ryzyko wystąpienia trisomii poprzez analizę pozakomórkowego DNA (cfdna) z krwi matki. Od stycznia
WYCIECZKA DO LABORATORIUM
WYCIECZKA DO LABORATORIUM W ramach projektu e-szkoła udaliśmy się do laboratorium w Krotoszynie na ul. Bolewskiego Mieliśmy okazję przeprowadzić wywiad z kierowniczką laboratorium Panią Hanną Czubak Oprowadzała
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych
Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych Dr n. med. Joanna Walczak- Sztulpa Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Diagnostyka
Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków.
Zmienność genu UDP-glukuronozylotransferazy 1A1 a hiperbilirubinemia noworodków. Katarzyna Mazur-Kominek Współautorzy Tomasz Romanowski, Krzysztof P. Bielawski, Bogumiła Kiełbratowska, Magdalena Słomińska-
Pracownia Zgodności Tkankowej / Immunogenetyczna LIiTK UCML UCK
Pracownia Zgodności Tkankowej / Immunogenetyczna LIiTK UCML UCK Kontakt: Kierownik: dr n. med. Grażyna Moszkowska Tel.: (058) 349-21-89 Fax: (058) 349-21-91 mail: gramos@gumed.edu.pl Laboratorium Immunologii
Diagnostyczna przydatność detekcji genu RHD w osoczu ciężarnych w profilaktyce konfliktu matczyno-płodowego na tle antygenu D z układu Rh
Diagnostyczna przydatność detekcji genu RHD w osoczu ciężarnych w profilaktyce konfliktu matczyno-płodowego na tle antygenu D z układu Rh Diagnostic utility of RHD-gene detection in maternal plasma in
Instytut prowadzi działalność: diagnostyczną,
Zakład Immunologii Hematologicznej i Transfuzjologicznej w Instytucie Hematologii i Transfuzjologii Instytut Hematologii i Transfuzjologii, utworzony w 1951 r., jest głównym w kraju ośrodkiem naukowym
Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
Tranquility. Najdokładniejszenieinwazyjnebadanietrisomii Pozwalauniknądryzykaamniopunkcji
Tranquility Najdokładniejszenieinwazyjnebadanietrisomii Pozwalauniknądryzykaamniopunkcji BezpieczneiwysoceczułebadanieDNAzkrwiwykonywane przyużyciusekwencjonowanianastępnejgeneracji Wystarczyproste pobraniekrwi,aby
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Przeciwcia a anty-k u kobiet ci arnych oraz badania genu kodujàcego antygen K u p odów
Przeciwcia a anty-k u kobiet ci arnych oraz badania genu kodujàcego antygen K u p odów Anti-K antibodies in pregnant women and genotyping of K antigen in foetuses upaƒska Barbara, Nowaczek-Migas Maria,
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników Wojciech Śmietana Co to jest monitoring genetyczny? Monitoring genetyczny to regularnie
CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG
REGIONALNE CENTRUM KRWIODAWSTWA I KRWIOLECZNICTWA W LUBLINIE CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG Od 01 maja 2018 roku Obowiązuje od: 01 maja 2018 roku Strona 1 / 6 SPIS TREŚCI I. Badania laboratoryjne
Anita Olejek. Katedra i Oddział Kliniczny Ginekologii, Położnictwa i Ginekologii Onkologicznej w Bytomiu
Anita Olejek Katedra i Oddział Kliniczny Ginekologii, Położnictwa i Ginekologii Onkologicznej w Bytomiu - patologia, w której na skutek niezgodności w zakresie antygenów krwinek czerwonych pomiędzy ciężarną
DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko
DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko Mini-słowniczek SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - zmienność sekwencji DNA; HET - analiza heterodupleksów; HPLC
Konflikt HPA-1a i alloimmunologiczna małopłytkowość płodów i noworodków - badania przeglądowe na świecie i w Polsce
Konflikt HPA-1a i alloimmunologiczna małopłytkowość płodów i noworodków - badania przeglądowe na świecie i w Polsce Uhrynowska M, Guz K, Orzińska A, Gierszon A, Łopacz P, Sokół E, Maślanka K, Dębska M,
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Polimorfizm +24G>del w 3 intronie genu ITGB3 w regionie diagnostycznym genotypowania allelu HPA-1a: konsekwencje i metody weryfikacji
artykuł ORYGINALNy Journal of Transfusion Medicine 2013, tom 6, nr 2, 33 40 Copyright 2013 Via Medica ISSN 1689 6017 Polimorfizm +24G>del w 3 intronie genu ITGB3 w regionie diagnostycznym genotypowania
CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG
REGIONALNE CENTRUM KRWIODAWSTWA I KRWIOLECZNICTWA W LUBLINIE CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG na 2018 rok Obowiązuje od: 01 stycznia 2018 roku SPIS TREŚCI I. Badania laboratoryjne II. III. Krew
Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA)
Badanie predyspozycji do łysienia androgenowego u kobiet (AGA) RAPORT GENETYCZNY Wyniki testu dla Pacjent Testowy Pacjent Pacjent Testowy ID pacjenta 0999900004112 Imię i nazwisko pacjenta Pacjent Testowy
CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG
REGIONALNE CENTRUM KRWIODAWSTWA I KRWIOLECZNICTWA W LUBLINIE CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG na 2015 rok Obowiązuje od: 01 stycznia 2015 roku Aneks obowiązuje od 21 października 2015 roku SPIS
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
Załącznik nr 5 do zarządzenia Nr 53/2006 Prezesa Narodowego Funduszu Zdrowia. Program badań prenatalnych
Program badań prenatalnych 1 I. UZASADNIENIE CELOWOŚCI WDROŻENIA PROGRAMU BADAŃ PRENATALNYCH, zwanego dalej Programem. 1. Opis problemu zdrowotnego W ostatnich latach wzrasta systematycznie średni wiek
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
AE/ZP-27-03/16 Załącznik Nr 6
AE/ZP--0/ Załącznik Nr Wymagania dla przedmiotu zamówienia oferowanego w Pakietach Nr - Lp Parametry wymagane Wymagania dla przedmiotu zamówienia oferowanego w Pakiecie Nr poz..... Surowica antyglobulinowa
PLAN SZKOLEŃ CIĄGŁYCH DLA DIAGNOSTÓW LABORATORYJNYCH NA ROK 2019
PLAN SZKOLEŃ CIĄGŁYCH DLA DIAGNOSTÓW LABORATORYJNYCH NA ROK 2019 Kursy ciągłe w ramach współpracy Kolegium Kształcenia Podyplomowego Wydziału Farmaceutycznego z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej w Sosnowcu
CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG
REGIONALNE CENTRUM KRWIODAWSTWA I KRWIOLECZNICTWA W LUBLINIE CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG na 2015 rok Obowiązuje od: 01 stycznia 2015 roku SPIS TREŚCI I. Badania laboratoryjne II. III. Krew
Wpływ ekspresji antygenów HPA-15 płytek krwi na wykrywanie przeciwciał anty-hpa-15
PRACA ORYGINALNA Original Article Acta Haematologica Polonica 2009, 40, Nr 3, str. 697 703 HALINA MICHUR 1, KATARZYNA GUZ 1, KRYSTYNA MAŚLANKA 1, ANDRZEJ MISIAK 2, MAŁGORZATA UHRYNOWSKA 1, ANNA EJDUK 3,
CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG
REGIONALNE CENTRUM KRWIODAWSTWA I KRWIOLECZNICTWA W LUBLINIE CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG na 2013 rok Obowiązuje od: 01 stycznia 2013 roku SPIS TREŚCI I. Badania laboratoryjne II. III. Krew
Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I dla kierunku Lekarskiego, rok I 2015/2016. Ćwiczenie nr 1 (06-07.10.
Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I dla kierunku Lekarskiego, rok I 2015/2016 Ćwiczenie nr 1 (06-07.10.2015) Temat: Wprowadzenie 1. Omówienie regulaminu zajęć Temat: Wprowadzenie
Tematyka zajęć z biologii
Tematyka zajęć z biologii klasy: I Lp. Temat zajęć Zakres treści 1 Zapoznanie z przedmiotowym systemem oceniania, wymaganiami edukacyjnymi i podstawą programową Podstawowe zagadnienia materiału nauczania
Iga Niczyporuk II rok licencjat
Iga Niczyporuk II rok licencjat jeden z płynów ustrojowych w organizmie człowieka, którego objętość wynosi ok. 5 5,5 litrów. Krew spełnia czynności transportowe, dostarcza do tkanek tlen i substancje odżywcze,
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe Marcin Kruszewski Centrum Radiobiologii i Dozymetrii Biologicznej Instytut Chemii
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Organizacja leczenia krwią i jej składnikami w podmiotach leczniczych
Organizacja leczenia krwią i jej składnikami w podmiotach leczniczych Rozporządzenie Ministra Zdrowia z dnia 16 października 2017 r. w sprawie leczenia krwią i jej składnikami w podmiotach leczniczych
Postępowanie u chorych z przeciwciałami do antygenów krwinek czerwonych w przypadku masywnego krwawienia
Postępowanie u chorych z przeciwciałami do antygenów krwinek czerwonych w przypadku masywnego krwawienia Konferencja Szkoleniowa Postępy w Immunohematologii 2016 Warszawa 24-25 listopada 2016 Beata Wojciechowska
Przegląd metod genotypowania antygenów krwinek czerwonych
artykuł poglądowy Journal of Transfusion Medicine 2013, tom 6, nr 3, 90 95 Copyright 2013 Via Medica ISSN 1689 6017 Przegląd metod genotypowania antygenów krwinek czerwonych w świetle doniesień prezentowanych
Zastosowanie nowych technologii w diagnostyce mikrobiologicznej. Ireneusz Popławski
Zastosowanie nowych technologii w diagnostyce mikrobiologicznej Ireneusz Popławski 22 biomerieux Polska partner w mikrobiologii z wieloletnim doświadczeniem 33 biomerieux Polska Sp. z o.o. biomerieux Polska
w kale oraz innych laboratoryjnych markerów stanu zapalnego (białka C-reaktywnego,
1. Streszczenie Wstęp: Od połowy XX-go wieku obserwuje się wzrost zachorowalności na nieswoiste choroby zapalne jelit (NChZJ), w tym chorobę Leśniowskiego-Crohna (ChLC), zarówno wśród dorosłych, jak i
Ultrasonograficzna ocena wzrastania płodów w I i II trymestrze ciąży w populacyjnym programie badań prenatalnych wad wrodzonych w regionie lubelskim
Lek. med. Izabela Wnuczek-Mazurek Ultrasonograficzna ocena wzrastania płodów w I i II trymestrze ciąży w populacyjnym programie badań prenatalnych wad wrodzonych w regionie lubelskim Promotor: Dr hab.
Geneza powstania Programu
Postępy w biegłości wykonywania badań przedtransfuzyjnych, ocenie i formułowaniu wyników w czasie prowadzenia Krajowego Programu Oceny Jakości dla Laboratoriów Immunologii Transfuzjologicznej Bogumiła
LEKI CHEMICZNE A LEKI BIOLOGICZNE
LEKI CHEMICZNE A LEKI BIOLOGICZNE PRODUKT LECZNICZY - DEFINICJA Art. 2 pkt.32 Ustawy - Prawo farmaceutyczne Substancja lub mieszanina substancji, przedstawiana jako posiadająca właściwości: zapobiegania
Nowa generacja nieinwazyjnych badań prenatalnych. www.synlab.pl
Nowa generacja nieinwazyjnych badań prenatalnych www.synlab.pl Daje pewność wysoce zaawansowanego badania, wraz z niezawodnością i doświadczeniem wiodącego europejskiego laboratorium. Aberracje chromosomowe
NIFTY PRO. Contact Us: Follow our latest news: 2018 BGI. All rights reserved. NIFTY is a registered trademark of BGI.
2018 BGI. All rights reserved. NIFTY is a registered trademark of BGI. Niniejsze informacje są skierowane wyłącznie do wykwalifikowanych pracowników służby zdrowia. Niniejsze informacje nie powinny być
GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii
Zawartość 139371 1. Wstęp zarys historii genetyki, czyli od genetyki klasycznej do genomiki 2. Chromosomy i podziały jądra komórkowego 2.1. Budowa chromosomu 2.2. Barwienie prążkowe chromosomów 2.3. Mitoza
Wprowadzenie do genetyki sądowej. Materiały biologiczne. Materiały biologiczne: prawidłowe zabezpieczanie śladów
Wprowadzenie do genetyki sądowej 2013 Pracownia Genetyki Sądowej Katedra i Zakład Medycyny Sądowej Materiały biologiczne Inne: włosy z cebulkami, paznokcie możliwa degradacja - tkanki utrwalone w formalinie/parafinie,
Zapobieganie alloimmunologicznej małopłytkowości płodów i noworodków (AIMPN) w Polsce program PREVFNAIT
Zapobieganie alloimmunologicznej małopłytkowości płodów i noworodków (AIMPN) w Polsce program PREVFNAIT PREVFNAIT Prevention of foetal/neonatal alloimmune thrombocytopenia (FNAIT) in Polish foetuses and
6. Uzupełnij zdanie, wstawiajac w odpowiednie miejsce wyrażenie ujawni się lub nie ujawni się :
ID Testu: 9S6C1A4 Imię i nazwisko ucznia Klasa Data 1. Allelami nazywamy A. takie same formy jednego genu. B. różne formy różnych genów. C. takie same formy różnych genów. D. różne formy jednego genu.
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
2. Rozdział materiału genetycznego w czasie podziałów komórkowych - mitozy i mejozy
Program ćwiczeń z przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA I GENETYKA, część I (GENETYKA) dla kierunku Lekarskiego, rok I 2017/2018 Ćwiczenie nr 1 (09-10.10.2017) Temat: Wprowadzenie 1. Omówienie regulaminu zajęć
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE Ewa Waszkowska ekspert UPRP Źródła informacji w biotechnologii projekt SLING Warszawa, 9-10.12.2010 PLAN WYSTĄPIENIA Umocowania prawne Wynalazki biotechnologiczne Statystyka
Marzena Woźniak Temat rozprawy: Ocena, monitorowanie i leczenie zakrzepicy żylnej w okresie ciąży i połogu Streszczenie
Marzena Woźniak Rozprawa doktorska na stopień doktora nauk medycznych Temat rozprawy: Ocena, monitorowanie i leczenie zakrzepicy żylnej w okresie ciąży i połogu Streszczenie Okresy ciąży i połogu są wymieniane
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie
CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG
REGIONALNE CENTRUM KRWIODAWSTWA I KRWIOLECZNICTWA W LUBLINIE CENNIK KRWI I JEJ SKŁADNIKÓW ORAZ USŁUG na 2016 rok Obowiązuje od: 01 stycznia 2016 roku SPIS TREŚCI I. Badania laboratoryjne II. III. Krew
1. Zamawiający: 2. Opis przedmiotu zamówienia:
Zapytanie ofertowe na dostawę analizatora wraz z oprogramowaniem do automatycznej izolacji, amplifikacji i detekcji sekwencji DNA wirusów brodawczaka ludzkiego typu wysokiego ryzyka (hr-hpv) metodą PCR
SPRAWOZDANIE Z BADAŃ DNA W KIERUNKU USTALENIA POKREWIEŃSTWA BIOLOGICZNEGO DO CELÓW PRYWATNYCH
SPRAWOZDANIE Z BADAŃ DNA W KIERUNKU USTALENIA POKREWIEŃSTWA BIOLOGICZNEGO DO CELÓW PRYWATNYCH RAPORT TESTU DNA W KIERUNKU USTALENIA POKREWIEŃSTWA BIOLOGICZNEGO Data wydania wyniku: 15-01-2016 WYNIK TESTU
Załącznik nr 1A do SIWZ SZCZEGÓŁOWY OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
I. PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA: SZCZEGÓŁOWY OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Przedmiotem zamówienia jest dzierżawa w pełni zautomatyzowanego analizatora do badań z zakresu immunologii transfuzjologicznej metodą mikrokolumnową,
Projektowanie reakcji multiplex- PCR
Projektowanie reakcji multiplex- PCR Dzięki nowoczesnym, wydajnym zestawom do PCR, amplifikacja DNA nie jest już takim wyzwaniem, jak w latach 80-tych i 90-tych. Wraz z poprawą metodyki, pojawiły się ciekawe
Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Warszawa, dnia 3 sierpnia 2016 r. Poz. 1173
Warszawa, dnia 3 sierpnia 2016 r. Poz. 1173 ROZPORZĄDZENIE MINISTRA ŚRODOWISKA 1) z dnia 18 lipca 2016 r. w sprawie określenia wzorów wniosków oraz zgłoszeń związanych z zamkniętym użyciem mikroorganizmów
Dr hab. n. med. Aneta Gawlik
Dr hab. n. med. Aneta Gawlik Katedra i Klinika Endokrynologii i Pediatrii SUM Dr hab. n. med. Iwona Maruniak- Chudek Klinika Intensywnej Terapii i Patologii Noworodka SUM Konsultant wojewódzki ds. Neonatologii