Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
|
|
- Fabian Janowski
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Kosm os Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika A n n a F il ip e k Zakład Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN Pasteura 3, Warszawa anfil@nencki.gov.pl CYTOSZKIELET A BIAŁKA WIĄŻĄCE WAPŃ Z RODZINY S I00 WSTĘP CHARAKTERYSTYKA BIAŁEK S I00 Jony wapnia oraz białka wiążące wapń odgrywają ważną rolę w wielu procesach zachodzących w komórce, takich jak przekazywanie informacji między komórkami, egzocytoza, en- Tabela 1. Oddziaływania białek wiążących wapń z rodziny S I00 z białkami cytoszkieletu. Białko z rodziny S I00 S100A1 S100A2 S100A S100A4 S100A5 S100A6 S100A7 S100A8 S100A9 CP-10 S100A10 S100A11 S100A12 S100A13 S100B SI OOP Kalbindyna Profilagryna Trychoialina Repetina Białka cytoszkieletu tubulina, desmina, GFAP kaldesmon, kalponina, CapZa F-aktyna, aneksynavi tropomiozyna F-aktyna, tropomiozyna, miozyna tropomiozyna, kaldesmon, kalponina tubulina, keratyna, wimentyna tubulina, keratyna, wimentyna keratyna, aneksyna II keratyna, aneksyna I tubulina, desmina, GFAP, wimentyna, kaldesmon, kalponina, CapZa keratyna keratyna keratyna docytoza, skurcz mięśni, ruchliwość komórek niemięśniowych. Działanie jonów wapnia zachodzi między innymi poprzez wiązanie się tych kationów z wewnątrzkomórkowymi receptorami, zwanymi białkami wiążącymi wapń. Białka wiążące wapń, w zależności od struktury i funkcji, można podzielić na kilka grup. Jedną z nich stanowią białka określane mianem EFhand. Są to białka posiadające wyspecjalizowane motywy strukturalne odpowiedzialne za wiązanie jonów wapnia, tzw. motywy EFhand. Z grupy białek EF-hand, liczącej ponad 200 różnych białek wyodrębnić można rodzinę białek S I00 posiadających dwa motywy EFhand. Nazwa S100 pochodzi stąd, że dwa pierwsze poznane białka z tej rodziny (według obecnej nomenklatury są to białka S100A1 i S100B), nie wytrącały się w 100% roztworze siarczanu amonu. Obecnie znanych jest 20 białek należących do rodziny S100. Geny trzynastu z nich ułożone są kolejno jeden za drugim na chromosomie 1 u człowieka w odcinku 21, dlatego też produktom białkowym tych genów nadano nazwy od S100A1 do S100A13 (S c h a f f e r i współaut. 1995). Geny kodujące pozostałe białka, należące do rodziny S I00 i występujące u człowieka, znajdują się na innych chromosomach, a ich produkty białkowe noszą różne nazwy (Tabela 1). Monomer białka S I00 składa się z dwóch motywów EF-hand oraz dwóch fragmentów hydrofobowych (Ryc. 1). Jeden motyw wiążący jony wapnia w białkach S I00 ma budowę typową i zawiera dwa odcinki a-helikalne oraz pętlę koordynującą jon wapnia, składającą się z 12 reszt aminokwasowych. Takie typowe motywy Praca finansowana w ramach grantu Komitetu Badań Naukowych nr 6P04 A05415 oraz działalności statutowej Instytutu Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN.
2 310 A n n a F il ip e k EF-hand występują między innymi w kalmodulinie i troponinie C białkach wiążących cztery jony wapnia i pełniących funkcje regulacyjne. Drugi motyw wiązania jonu wapnia w białkach S I00 jest nietypowy, gdyż zawiera 14 zano, że dwa białka z rodziny S100, tj. S100A8 i S100A9, wiążą nienasycone kwasy tłuszczowe w sposób zależny od stężenia jonów cynku. Wiązanie jonów cynku ma też wpływ na aktywność białka S100A1, które tylko w konformacji Ryc. 1. Schemat cząsteczki monomeru białka wiążącego wapń z rodziny S100. reszt aminokwasowych w pętli koordynującej jon wapnia i wiąże ten jon z niższym powinowactwem. Monomer każdego z białek S100 ma niską masą cząsteczkową, wynoszącą około 10 kda. W roztworze białka S I00 występują w formie dimerów, w których cząsteczki połączone są wiązaniami niekowalencyjnymi (wyjątek stanowi kalbindyna 3, która występuje w formie monomeru). Niektóre z białek S I00, posiadające reszty cysteinowe, mogą tworzyć dimery poprzez mostki dwusiarczkowe S-S. Występowanie białek S100 w postaci dimerów może mieć znaczenie funkcjonalne. Wykazano, że w warunkach in vitro tylko dimer białka S100B utworzony poprzez mostek S-S wykazuje aktywność biologiczną. Związanie jonów wapnia w cząsteczce białka S I00 prowadzi zazwyczaj do zmiany konformacji, co ma wpływ na jego oddziaływanie z różnymi białkami efektorowymi. Niektóre z białek wiążących wapń z rodziny S 100 wiążą także jony cynku (Heizmann i Cox 1998). Konformacja tych białek po związaniu jonów wapnia jest inna niż po związaniu obu kationów tj. jonów wapnia i cynku. Wskazuje to, iż miejsca wiązania tych kationów w białkach S I00 są różne. Również związanie jonów cynku zwiększa powinowactwo względem jonów wapnia w cząsteczce białka S 100. Wykapo związaniu Ca2+ i Zn2+ aktywuje twiczynę - białko występujące u bezkręgowców i związane z miozyną (Heierhorst i współaut. 1997). Cechą białek S 100 jest też komórkowo specyficzna ekspresja, co oznacza, że występują one w określonych typach komórek. Sugeruje się, że białka wiążące wapń z rodziny S100 pełnią wiele różnych funkcji w komórce oraz mogą uczestniczyć w procesach związanych z komunikacją międzykomórkową (Fano i współaut. 1995, Zimmer i współaut. 1995; Donato 1999). Białka S100 wpływają między innymi na aktywność wielu enzymów, procesy endocytozy i egzocytozy, transkrypcję genów, fosfoiylację białkowych substratów niektórych kinaz oraz na reorganizację struktur tworzących cytosźkielet. Białka S I00 mogą bezpośrednio oddziaływać z białkami tworzącymi cytosźkielet, bądź pośrednio, poprzez wiązanie się z innymi białkami oddziałującymi z cytoszkieletem. Uzyskane dotychczas wyniki wskazują, że białka S 100 wpływają na dynamikę wszystkich trzech głównych struktur tworzących cytoszkielet, tj. mikrotubul, filamentów pośrednich i mikrofilamentów. Zagadnieniu dotyczącemu roli białek S I00 w tworzeniu i funkcjonowaniu cytoszkieletu poświęcona jest pozostała część niniejszego artykułu. ODDZIAŁYWANIA BIAŁEK S I00 Z BIAŁKAMI TWORZĄCYMI STRUKTURY CYTOSZKIELETU BIAŁKA S I00 A TWORZENIE MIKROTUBUL Wykazano, że białka S100A1 i S100B, w obecności mikromolowych stężeń Ca2+, hamują polimeryzację tubuliny, a w przypadku już istniejących mikrotubul powodują ich szybką depolimeryzację (Endo i H idaka 1983). Stosując metodę immunocytochemiczną wykazano, że białko S 100B występuje w mikrotubulach wrzeciona mitotycznego w czasie mitozy oraz w mikrotubulach cytoplazmatycznych. Uzyskane wyniki sugerują również, że w sposób zależny od stężenia jonów wapnia białko S100B może brać udział w regulacji aktywności ATPazy zależnej od białek MAP (ang. microtubule associated proteins). Może to zachodzić wtedy, gdy mikrotubule znajdują się w bliskim sąsiedztwie błony plazmatycznej, lub też w pobliżu błon wewnętrznych, tj. w miejscach, gdzie stężenie jonów wapnia jest wyższe niż w cytoplazmie. Występowanie S100B w pobliżu ośrodków nu-
3 Cytoszkielet a białka SI kleacji mikrotubul wskazuje na bezpośredni udział tego białka w powstawaniu takich struktur. Wykazano, że w warunkach in vitro S100A1 i S100B hamują nie tylko nukleację, ale również wydłużanie mikrotubul, chociaż nie wykazano współwystępowania S100A1 z zarodziami nukleacji tych struktur. Najnowsze wyniki wskazują, że zahamowanie syntezy S100A1 w komórkach PC 12 prowadzi do wzrostu poziomu wolnej tubuliny i liczby neuiytów oraz spadku proliferacji po podaniu tym komórkom NGF (czynnika wzrostu nerwów). Wzrost poziomu tubuliny jest wynikiem zmniejszonej polimeryzacji tego białka i potwierdza, że S100A1 hamuje proces tworzenia mikrotubul (Zimmer i współaut. 1998). Nowsze wyniki wskazują, że z mikrotubulami związane są też białka S100A8 i S100A9, ale ich rola w tworzeniu mikrotubul pozostaje nieznana. WPŁYW BIAŁEK S 100 NA FILAMENTY POŚREDNIE Wiązanie S100A1 i S100B z białkami tworzącymi filamenty pośrednie, takimi jak desmina i białko GFAP (ang. glial fibrilary acidic protein) hamuje tworzenie i wydłużanie filamentów oraz stymuluje ich rozpad (Ryc. 2) w S 100A1 i filamenty desminowe pozostają w bliskim sąsiedztwie, i że S 100A1 może mieć wpływ na tworzenie tych filamentów poprzez oddziaływanie z monomerami desminy. Wykazano, że białko S100B współwystępuje z filamentami pośrednimi w komórkach Schwanna, astrocytach, mioblastach i miotubach (Rambotti i współaut. 1990, SORCI i współaut. 1998, 1999). Reasumując, białka S100A1 i S100B mogą pełnić ważną rolę w zachowaniu właściwej ilości i orientacji filamentów pośrednich. Białka S I00 mogą też uczestniczyć w reorganizacji tych filamentów podczas mitozy, pełnić funkcję w ruchliwości komórek i zmianie ich kształtu oraz w cyklu skurczowo-rozkurczowym. W warunkach, w których zahamowane zostaje tworzenie filamentów pośrednich, np. pod wpływem białka S100A1 lub S100B, właściwy ich poziom może być utrzymywany dzięki białku S100A10, które w kompleksie z aneksyną II wiąże się z GFAP i wpływa na formowanie filamentów pośrednich (Bianchi i współaut. 1994) Przeciwstawne efekty S100A1 i S100B oraz S100A10 mogą być wynikiem wiązania wyżej wymienionych białek S I00 z różnymi domenami w GFAP. Jak dotąd, nie wyjaśniono, czy S100A10 w kompleksie z aneksyną II wiąże się Ryc. 2. Wpływ białka S100B na depolimeryzację filamentów utworzonych z GFAP. obecności mikromolowych stężeń jonów wapnia, podobnie jak ma to miejsce w przypadku mikrotubul (Bianchi i współaut. 1993). Wykazano, że astrocyty pochodzące z mózgu mutanta myszy, u którego zahamowano ekspresję S100B, wykazują zwiększoną ilość filamentów utworzonych z GFAP, co potwierdza wpływ S100B na rozpad filamentów pośrednich w tych komórkach. Hamujący wpływ S100A1 i S100B na tworzenie filamentów utworzonych z desminy lub z GFAP może być zniesiony w wyniku wiązania się S100A1 lub S100B z aneksyną VI (aneksyna VI jest jednym z 13 białek wiążących jony wapnia i fosfolipidy i uczestniczących między innymi w oddziaływaniu cytoszkieletu z błoną komórkową). Wykazano, że białka S100A1 i S100B wiążą się z końcami aminowymi cząsteczek desminy lub GFAP w warunkach in vitro i współwystępują z filamentami desminowymi w komórce. Te wyniki sugerują, że z GFAP w warunkach in vivo. S100A10 zidentyfikowano też w otoczce keratynowej komórek hodowanych in vitro (R obinson i współaut. 1997). Jednak w tych komórkach S100A10 nie występuje w kompleksie z aneksyną II, co sugeruje, że w otoczce keratynowej białko S100A10 może oddziaływać z białkami efektorowymi innymi niż aneksyna II. Innym składnikiem otoczki keratynowej jest kompleks białka S100A11 z aneksyną I. Sugeruje się, że kompleks ten może oddziaływać w sposób zależny od stężenia jonów wapnia z błoną keratynocytów i powodować tworzenie multimerów białka S100A11 w warunkach in vivo. Przemawia za tym fakt, że otrzymano multimery S100A11z otoczki keratynowej komórek hodowanych in vitro. Ponadto stwierdzono, że S100A11 poprzez tworzenie kompleksu z aneksyną I przyłącza się do endosomów. Nie potwierdzono jednak, czy w warunkach in vivo
4 312 A n n a F il ip e k przyłączanie się S100A11do błony plazmatycznej i do endosomów ma wpływ na struktury tworzące cytoszkielet oraz czy obserwowane w warunkach in vitro sieciowanie S100A11z aneksyną I pod wpływem transglutaminazy zachodzi w otoczce keratynowej. A zatem, rola S100A11 w tworzeniu filamentów keratynowych nie jest w pełni wyjaśniona, chociaż sugeruje się, że wiązanie się kompleksu S100A11 z aneksyną i z endosomami może mieć znaczenie w łączeniu się błon podczas transportu pęcherzykowego. Białka z rodziny S I00: profilagryna, trychohialina i repetina, występują w keratynocytach i sugeruje się, że mogą one regulować tworzenie filamentów keratynowych w komórkach nabłonkowych w trakcie ich różnicowania (Lee i współaut. 1993, Markova i współaut. 1993). Ponieważ w komórkach nabłonkowych występuje też wiele innych białek z rodziny S I 00, wydaje się być interesujące zbadanie ich wpływu na regulację filamentów keratynowych w tych komórkach. Białka z rodziny S100, takie jak S100A8, S100A9 i S100A12, ulegają przemieszczaniu do błony komórkowej i filamentów pośrednich w monocytach i granulocytach (Kerkhoff i współaut. 1998). S100A8 i S100A9 ulegają też przemieszczaniu do filamentów keratynowych w komórkach nabłonkowych. W obydwu przypadkach taka translokacja białek S 100 zachodzi na skutek wzrostu stężenia jonów wapnia, a w przypadku S100A9 i S100A12 proces ten jest regulowany poprzez fosforylację. Translokacja S100A8 i S100A9 do błony plazmatycznej i cytoszkieletu w granulocytach i monocytach może mieć znaczenie w ruchliwości tych komórek, chemotaksji, fagocytozie, egzocytozie i tworzeniu wolnych rodników. Chociaż sugeruje się, że S100A8 i S100A9 mogą oddziaływać w sposób zależny od stężenia jonów wapnia z filamentami pośrednimi i z błoną plazmatyczną, nie wiadomo, czy białka te wpływają na dynamikę i oddziaływanie tych filamentów z błoną plazmatyczną w warunkach in vivo. WIĄZANIE BIAŁEK S100 Z MIKROFIŁAMENTAMI Wykazano, że białko S100A10 w kompleksie z aneksyną II wiąże się z F-aktyną i wpływa na tworzenie wiązek filamentów aktynowych (Ikebuchi i W aisman 1990). Sugeruje się, że kompleks SlOOAlO-aneksyna II (znany też jako lipokortyna) może pośredniczyć w przyłączaniu F-aktyny do błony plazmatycznej oraz wpływać na proces egzocytozy. Z białkami wiążącymi aktynę oddziałuje też białko S100A1 i S100B. I tak np. wykazano, że wiązanie S100A1 i S100B z kaldesmonem i kalponiną znosi hamujący wpływ tych białek na aktywność ATPazy aktomiozynowej w warunkach in vitro (FUJII i współaut. 1994, Polyakow i współaut. 1998). S100A1 i S100B wiążą się z fragmentem kaldesmonu, z którym wiążą się również inne białka wiążące wapń, np. kalmodulina. Fragment ten posiada sekwencję TRTK-12, występującą też w białku CapZ, GFAP, desminie, wimentynie, białku p53, neuromodulinie czy neurograninie. Niektóre białka z rodziny S I00 wiąże się z tropomiozyną i miozyną. Wykazano, że w warunkach in vitro, S100A4 wiąże się z łańcuchem ciężkim miozyny mięśniowej i niemięśniowej oraz tropomiozyną niemięśniową (Barraclough 1998). Obserwacje w mikroskopie fluorescencyjnym wskazują, że w fibroblastach 3T3 oraz innych komórkach, białko S100A4 współwystępuje z tropomiozyną. A zatem, oddziaływanie białka S100A4 z tropomiozyną może wpływać na aktywność ATPazy aktomiozynowej w warunkach in vivo. Ostatnio wykazano, że S100A4 poprzez wiązanie się z łańcuchem ciężkim miozyny obniża stopień ufosforylowania miozyny przez kinazę białkową C (Kriajevska i współaut. 1998). Stwierdzono też oddziaływanie i współwystępowanie białka S100A4 z F- aktyną, co może potwierdzać udział białka S 100A4 w regulacji dynamiki mikrofilamentów. W warunkach in vitro i w obecności jonów wapnia z tropomiozyną, kaldesmonem i kalponiną wiąże się białko S100A6 (kalcyklina) (Wills i współaut 1994, Filipek i współaut. 1996, Golitsina i współaut. 1996). Brak jest jednak danych literaturowych dotyczących fizjologicznego znaczenia kompleksów S100A6 z tymi białkami. Z tropomiozyną wiąże się białko S100A2 (Gimona i współaut. 1997). Wykazano, że białko to ulega translokacji w trakcie różnicowania się komórek nabłonkowych hodowanych in vitro. Stwierdzono też, że współwystępowanie S100A2 z tropomiozyną w tych komórkach jest przejściowe i zależne od stężenia jonów wapnia. A zatem, można sugerować, że S100A2 poprzez oddziaływanie z tropomiozyną wpływa na organizację filamentów aktynowych. Struktury mikrofilamentów mogą też być regulowane przez białko S100A1 i S100B. I tak np. w komórkach glejaka C6, w których zahamowano ekspresję S 100B, zaobserwowano bardziej zorganizowaną sieć mikrofilamentów, niż w komórkach kontrolnych, co wskazuje, że S 100B wywiera hamujący wpływ na powstawanie mikrofilamentów. Brak jest jednak dowodów dotyczących wiązania się białka S100B z G- i F-aktyną. Wykazano też, że S100A1 i S100B wiążą się z podjednostką białka CapZ (pełniącego ważną rolę w nukleacji mikrofila-
5 Cytosźkielet a białka SI mentow) (Ivan en k o v i współaut. 1995, 1996). Brak jest jednak wyników dotyczących współwystępowania białek S100A1 i S100B z białkiem CapZ i znaczenia powstawanie ewentualnego kompleksu tych białek w warunkach in vivo. Sugeruje się, że F-aktyna wiąże też białko S100A1 oraz że S100A1 ulega translokacji do włókien mięśniowych na skutek wzrostu stężenia jonów wapnia w komórkach mięśni gładkich hodowanych irt vitro. Jednak w innych modelach doświadczalnych oraz w warunkach irt vivo nie potwierdzono translokacji białka S 100A1 do włókien mięśniowych. PODSUMOWANIE Rodzinę S I00 stanowią niskocząsteczkowe białka wiążące jony wapnia i posiadające dwa motywy EF-hand. Białka S I00 pełnią wiele różnych funkcji w komórkach oraz mogą odgrywać rolę w komunikacji międzykomórkowej. Jednym z ważnych procesów regulowanych przez białka S I00 jest reorganizacja i regulacja dynamiki cytoszkieletu w komórkach prawidłowych oraz w takich, w których procesy życiowe są zaburzone (Heizm ann 1996; S c h a fe r i Heizmann 1996). W niniejszym artykule przedstawiono wpływ białek S I00 na regulację struktur tworzących cytosźkielet komórkowy, to jest mikrotubul, filamentów pośrednich i mikrofilamentów. W warunkach irt vitro białka S I00 mogą bezpośrednio wiązać się z białkami cytoszkieletu, bądź pośrednio poprzez inne ligandy białkowe. Niewiele jest jednak danych literaturowych dotyczących wpływu białek S I00 na struktury tworzące cytosźkielet w warunkach irt vivo. CYTOSKELETON AND THE S100 FAMILY OF CALCIUM BINDING PROTEINS The family of S I00 consists of twenty low molecular weight calcium binding proteins with two EF-hand motifs. Many data indicate that S I00 proteins might perform various functions within the cell and also in cell-cell communication. The reorganization and functioning of the cytoskeleton components are regulated by S I00 proteins. These proteins might bind directly to the cytoskeleton Summ ary structure or affect the dynamics of these structures via interactions with other proteins. Data obtained from in vitro studies suggest that S I00 proteins might regulate all three major cytoskeletal structures: microtubules, intermediate filaments and microfilaments. However, there is still little information regarding the role of S I00 proteins in vivo, either under normal or pathological conditions. LITERATURA B arraclough R., Calcium binding protein S100A4 in health and disease. Biochim. Biophys. Acta 1448, B ianchi R., G iam banco I., D onato R., S100protein, but not calmodulin, binds to the Glial Fibrillary Acidic Protein and inhibits its polimeryzation in a calcium dependent manner. J. Biol. Chem. 268, B lanch I R., Garbuglla M., V erzini M., G iam banco I., D onato R., Calpactin I binds to the glial fibrillary acidic protein (GFAP) and cosediments with glial filaments in a Ca2+-dependent manner. Implication for concerted regulatory effects of calpactin I and S100 protein on glial filaments. Biochim. Biophys. Acta, 1223, D onato R., Functional roles of S I 00 proteins, calciumbinding proteins of the EF-hand type. Biochim. Biophys. Acta 1450, E ndo T., H id aka H., Effect of SI 000 protein on microtubule assembly- dissasembly. FEBS Lett. 161, Fano G., B io cc a S., F ulle S., M ar ig g io M. A., B ella S., C a l is s a n o P., The SI 00: A protein family in search of function. Progress in Neurobiology 46, F ilipek A., Zasada A., W ojd a U., M akuch R., Dąb row ska R., Characterization of chicken gizzard calcyclin and examination of its interaction with caldesmon. Comp. Biochem. Physiol. 113B, F ujii T., O om atsuzaw a A., K uzumaki N., K ondo Y., Calcium-dependent regulation of smooth muscle calponin by S 100. J. Biochem. 116, G im ona M., L ando Z., D olginov Y., V andekerckhove J., K a - bayashi R., S obieszek A., H elfman D. M., Ca2+-dependent interaction of S100A2 with muscle and nonmuscle tropomyosins. J. Cell Sci. 110, G olitsina N. L., K ordowska J., W ang C.-L. A., Lehrer S. S., Ca2+-dependent binding of calcyclin to muscle tropomyosin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 220, H e ierhorst J., M ann R. J., K em p B. E., Interaction of the recombinant S100A1 protein with twichin kinase, and comparison with other Ca2+-binding proteins. Eur. J. Biochem. 249, H eizmann C. W., Multistep calcium signalling in health and disease. Mol. Cells 6, H eizmann C. W., Cox J. A., New perspectives on S100 proteins: a multi-functional Ca2+-, Zri2+- and Cu2+-binding protein family. BioMetals 11, I kebuchi N. W., W aism an D. M., Calcium dependent regulation of actin-filament bundling by lipocortins-85. J. Biol. Chem. 265, Ivanenkov V. V., J am ieson G. A. Jr., G ruenstein E., D imlich R. V. W., Characterization of SlOOb binding epitopes: identification of a novel target, the actin capping protein, CapZ. J. Biol. Chem., 270,
6 314 A n n a F il ip e k Ivanenkov V. V., D imlich R. V. W., J a m ieson Jr. G. A., Interaction of SlOOao protein with the actin capping protein CapZ: characterization of a putative SlOOAo binding site in a CapZd-subunit. Biochem. Biophys. Res. Commun. 221, Kerkhoff C., K lem pt M., S org C., Novel insights into structure and junction of MRP8 (S100A8) and MRP 14 (S100A9). Biochim. Biophys. Acta 1448, K riajevska M., T abarykina S., B ronstein I., M aintland N., Lom onosov M., H ansen K., G eorgiev G., L ukanidin E., Metastasis-associated Mtsl (S100A4) protein modulates protein kinase C phosphorylation of the heavy chain of nonmuscle myosin. J. Biol. Chem., 273, L ee S. C., K im I.-G., M areko v L. N., O K eefer E. J., P erry D. A. D., Ste in e r P. M., The structure of human trichohyalin. J. Biol. Chem. 268, M arkova N. G., M areko v L. N., C hipev C. C., Gan S.-Q., Idler W. W., Ste in e r t P. M., Profilaggrin is a major epidermal calcium binding protein. Mol. Cell. Biology 13, P o l ya k o va. A., H uber P. A. J., M arsto n S. B., G usev N. B., Interaction of S100 protein with smooth muscle caldesmon. FEBS Lett. 422, R ambotti M. G., S preca A., Leoncini P., E stenoz M., C ostantin o -Ceccarini E., G iam banco I., Donato R., Detection of SlOOb protein in triton-cytoskeletons: an immunocytochemical study on cultured Schwann cells. J. Histochem. Cytochem., 38, R obinson N. A., L apic S., W e lter J. F., E c k e r t L. R., S100A11, S100A10, annexin I, desmosomal proteins, small prolin- rich proteins, plasminogen activator inhibitor-2, and involucrin are componendsof the cornifiedenvelope of of cultured human epidermal keratinocytes. J. Biol. Chem., 272, S chafer B. W., H eizmann C. W., The S100 family of EF-hand calcium binding proteins: functions and pathology. Trends Biochem. Sci. 21, S orci G., A gneletti A. L., B ianchi r., D onato R., Association of SI 00B with intermediate filaments and microtubules in glial cells. Biochem. Biophys. Acta 1448, S chafer B. W., W icki R., E ngelkam p D., M attei M.-G., H eizm ann C. W., Isolation of YAC clone covering a cluster of nine S100 genes on human chromosome lq21: Rationale for a new nomenclature of the SI 00 calcium binding proteins family. Genomics 25, S orci G., B lanchi R., G iam banco I., R ambotti M. G., D onato R., Replicating myoblasts and fused myotubes express the calcium modulated proteins S100A1 and S100B. Cell Calcium 25, W ills F. L., M c c u b b inw. D., K a y C. M., Smooth muscle calponin-caltropin interaction: effect of biological activity and stability of calponin. Biochemistry 33, Z im m er D. B., C ornw all E. H., L ander A., S ong W., The S100 protein family: history, junction and expression. Brain Reseach Bulletin 37, Z im m er D. B., C ornw all E. H., R eyno lds P. D., D onald C. M., S100A1 regulates neurite organization, tubulin levels, and prolferation in PCI 2 cells. J. Biol. Chem. 273,
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) Komórka eukariotyczna. cytoplazma + jądro komórkowe.
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe (układ wykonawczy) cytoplazma podstawowa (cytozol) Cytoplazma złożony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek (centrum informacyjne) organelle i kompleksy
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET
CYTOSZKIELET Sieć włókienek białkowych; struktura wysoce dynamiczna Filamenty aktynowe Filamenty pośrednie Mikrotubule Fibroblast CYTOSZKIELET 1 CYTOSZKIELET 7nm 10nm 25nm Filamenty pośrednie ich średnica
Kosm os. PROBLEMY NAUK *BIÓI^G 1EZNY e n. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony
Kosm os PROBLEMY NAUK *BIÓI^G 1EZNY e n Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 603-608 Polskie T ow arzystw o Przyrod n ik ów im. K op ern ik a J a c e k K u ź n ic k i, A n n a F il ip e k Zakład Neurobiologii
Komórka eukariotyczna organizacja
Komórka eukariotyczna organizacja Centrum informacyjne jądro Układ wykonawczy cytoplazma cytoplazma podstawowa (cytozol) organelle cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Komórka eukariotyczna organizacja
Komórka eukariotyczna organizacja
Komórka eukariotyczna organizacja Centrum informacyjne jądro Układ wykonawczy cytoplazma cytoplazma organelle podstawowa (cytozol) cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Komórka eukariotyczna organizacja
Numer 4 (253) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tom 50, 2001 Kosm os Numer 4 (253) Strony 359-374 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Re n a t a Dą b r o w s k a i R o b e r t m a k u c h Zakład. Biochemii Mięśni
Składniki cytoszkieletu. Szkielet komórki
Składniki cytoszkieletu. Szkielet komórki aktynowe pośrednie aktynowe pośrednie 1 Elementy cytoszkieletu aktynowe pośrednie aktynowe filamenty aktynowe inaczej mikrofilamenty filamenty utworzone z aktyny
Filamenty aktynowe ORGANIZACJA CYTOPLAZMY. komórki CHO (Chinese hamster ovary cells ) Hoechst jądra, BOPIPY TR-X phallacidin filamenty aktynowe
Filamenty aktynowe ORGANIZACJA CYTOPLAZMY komórki CHO (Chinese hamster ovary cells ) Hoechst jądra, BOPIPY TR-X phallacidin filamenty aktynowe Cytoszkielet aktynowy G-aktyna 370 aminokwasów 42 43 kda izoformy:
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Udział jonów wapnia w regulacji oddziaływań aktyny z miozyną
Udział jonów wapnia w regulacji oddziaływań aktyny z miozyną STRESZCZENIE Skurcz komórek mięśniowych oraz różnorodne formy ruchliwości komórek niemięśniowych są uzależnione od cyklicznych oddziaływań pomiędzy
CYTOSZKIELET. Mikrotubule. podjednostki strukturalne. 450 aminokwasów. 13 (11-16) 55kDa i 53kDa strukturalna polarność
CYTOSZKIELET Mikrotubule podjednostki strukturalne 13 (11-16) 55kDa i 53kDa strukturalna polarność 450 aminokwasów Mikrotubule wydłuŝanie / /skracanie Mikrotubule elongacja + - in vitro in vivo - dodawanie
WITAMY NA KURSIE HISTOLOGII
KOMÓRKA WITAMY NA KURSIE HISTOLOGII www.histologia.cm-uj.krakow.pl Wielkość komórek ZróŜnicowanie komórek Jednostki: 1 µm = 10-3 mm, 1 nm = 10-3 µm kształt najmniejsze komórki (komórki przytarczyc, niektóre
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
SPEKTROSKOPIA MRJ BIAŁEK MIĘŚNIOWYCH
SPEKTROSKOPIA MRJ BIAŁEK MIĘŚNIOWYCH Genowefa Ślósarek Zakład Biofizyki Molekularnej, Instytut Fizyki Uniwersytet im. A Mickiewicza ul Umultowska 85, 61-614 Poznań Badania podstawowe nad mięśniami prowadzone
POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI. Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ
POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ BŁONĘ KOMÓRKOWĄ I. WSTĘP TEORETYCZNY Każda komórka, zarówno roślinna,
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Kosm os Tom 50, 2001 Numer 4 (253) Strony 349-358 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Z e n o n G r a b a r e k Boston Biomedical Research Institute Watertown. MA
błona zewnętrzna błona wewnętrzna (tworzy grzebienie lamelarne lub tubularne) przestrzeń międzybłonowa macierz Błona wewnętrzna: Macierz:
Mitochondria KOMÓRKA Cz. III błona zewnętrzna błona wewnętrzna (tworzy grzebienie lamelarne lub tubularne) przestrzeń międzybłonowa macierz Błona wewnętrzna: Błona zewnętrzna: białka/lipidy 1:1 poryny
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
Mięśnie. dr Magdalena Markowska
Mięśnie dr Magdalena Markowska Zjawisko ruchu 1) Jako możliwość przemieszczania przestrzennego mięśnie poprzecznie prążkowane 2) Pompa serce 3) Jako podstawa do utrzymywania czynności życiowych mięśnie
Tkanka nerwowa. neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające)
Tkanka nerwowa neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające) Sygnalizacja w komórkach nerwowych 100 tys. wejść informacyjnych przyjmowanie sygnału przewodzenie
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Ruch i mięśnie. dr Magdalena Markowska
Ruch i mięśnie dr Magdalena Markowska Zjawisko ruchu Przykład współpracy wielu układów Szkielet Szkielet wewnętrzny: szkielet znajdujący się wewnątrz ciała, otoczony innymi tkankami. U kręgowców składa
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Podział tkanki mięśniowej w zależności od budowy i lokalizacji w organizmie
Tkanka mięśniowa Podział tkanki mięśniowej w zależności od budowy i lokalizacji w organizmie Tkanka mięśniowa poprzecznie prążkowana poprzecznie prążkowana serca gładka Tkanka mięśniowa Podstawową własnością
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Tkanka mięśniowa. pobudliwość kurczliwość
Aparat kurczliwy: miofilamenty cienkie ( i białka pomocnicze) miofilamenty grube (miozyna 2) Tkanka mięśniowa troponina tropomiozyna troponina lub kaldesmon i kalponina łańcuchy lekkie miozyna 2 pobudliwość
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.
BIAŁKO CACYBP/SIP I JEGO ROLA W ORGANIZACJI CYTOSZKIELETU*
Tom 67 2018 Numer 1 (318) Strony 131 137 Anna Filipek, Agnieszka Góral Pracownia Białek Wiążących Wapń Zakład Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN
Tkanki. Tkanki. Tkanka (gr. histos) zespół komórek (współpracujących ze sobą) o podobnej strukturze i funkcji. komórki. macierz zewnątrzkomórkowa
Tkanki Tkanka (gr. histos) zespół komórek (współpracujących ze sobą) o podobnej strukturze i funkcji komórki Tkanki macierz zewnątrzkomórkowa komórki zwierzęce substancja międzykomórkowa protoplasty roślin
Tkanka mięśniowa. pobudliwość kurczliwość
Aparat kurczliwy: miofilamenty cienkie ( i białka pomocnicze) miofilamenty grube (miozyna 2) Tkanka mięśniowa troponina tropomiozyna troponina lub kaldesmon i kalponina łańcuchy lekkie miozyna 2 pobudliwość
z Hsp90 w sposób bezpośredni. Ponadto pokazano, iż pomimo podobieństwa sekwencji CacyBP/SIP i Sgt1, białka te nie współzawodniczą ze sobą o wiązanie
Mgr Agnieszka Góral Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biologia Otwarcie: 28.06.2013 r. Temat: Białko CacyBP/SIP: oddziaływanie z białkiem szoku cieplnego Hsp90 oraz rola w odpowiedzi komórek na
TOM 8-NR 1981 ( )
PL ISSN 0324-833X POLSKIE TOWARZYSTWO ANATOMICZNE TOM 8-NR 1981 (227-386) PWN-WARSZAWA PO STĘPY BIOLOGII KOMÓRKI TOM 8, NR 4, 1981 Kwartalnik Polskiego Towarzystwa Anatomicznego wydawany z pomocą finansową
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
6.1. MI ånie POPRZECZNIE PR ØKOWANE SZKIELETOWE
TKANKA MI åniowa 6 Wywodzi się z mezodermy zorganizowanej w miotomy. Proces różnicowania polega przede wszystkim na tworzeniu wydłużonych komórek zdolnych do wytwarzania białek kurczliwych. Na podstawie
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
SEMINARIUM 8:
SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
MECHANIZM DZIAŁANIA HERBICYDÓW
Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu Grzegorz Skrzypczak MECHANIZM DZIAŁANIA HERBICYDÓW metabolizm herbicydów Nowe technologie uprawy wymagają aby herbicyd był: - skuteczny biologicznie i efektywny ekonomicznie
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek
Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek Model tworzenia mikrokapilar na podłożu fibrynogenowym eksponencjalny wzrost tempa proliferacji i syntezy DNA wraz ze wzrostem stężenia
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Podział tkanki mięśniowej. Tkanka mięśniowa. Poprzecznie prążkowana
Tkanka mięśniowa Podział tkanki mięśniowej Tkanka mięśniowa Poprzecznie prążkowana Gładka Szkieletowa Sercowa Szkieletowe Mięsień sercowy Mięśnie gładkie Cytoplazma z miofibryllami sarkoplazma SER siateczka
Tkanka mięśniowa. Bogdan Walkowiak. Zakład Biofizyki Instytut Inżynierii Materiałowej Politechnika Łódzka. 7 listopada 2014 Biofizyka 1
Wykład 5 Tkanka mięśniowa Bogdan Walkowiak Zakład Biofizyki Instytut Inżynierii Materiałowej Politechnika Łódzka 7 listopada 2014 Biofizyka 1 Trzy typy mięśni Mięśnie szkieletowe (Poprzecznie prążkowane)
CZY ANEKSYNY BIO RĄ UDZIAŁ W REGULACJI HOM EOSTAZY W APNIA W KOM ÓRCE? WPROWADZENIE. P o l l a r d 1994, Moss 1997). Niektóre z aneksyn
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 625-633 Polskie T ow arzystw o Przyrodników im. K opernika J o a n n a Ba n d o r o w ic z -P ik u ł a Zakład Biochemii Komórki Instytut
Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
Tkanki. Tkanki. Tkanka (gr. histos) zespół komórek współpracujących ze sobą (o podobnej strukturze i funkcji) komórki
Tkanki Tkanka (gr. histos) zespół komórek współpracujących ze sobą (o podobnej strukturze i funkcji) komórki Tkanki macierz (matrix) zewnątrzkomórkowa komórki zwierzęce substancja międzykomórkowa protoplasty
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Komórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
BIOLOGIA KOMÓRKI. Ocena końcowa z kursu będzie liczona jako: 20% oceny z ćwiczeń 80% oceny z egzaminu
BIOLOGIA KOMÓRKI Ocena końcowa z kursu będzie liczona jako: 20% oceny z ćwiczeń 80% oceny z egzaminu Charakterystyka kursu: 30 godzin wykładów 60 godzin ćwiczeń Ćwiczenia - zasady zaliczenia: uczestniczenie
PIERWOTNIAKI W BADANIACH BIOCHEMICZNYCH I GENETYCZNYCH. b o n s 1963, 1965) doprowadziły do ustalenia, że
Kosm os Tom 49, 2000 Numer 4 (249) Strony 583-587 PROBLEMY NAUKBIÓLOGICZNYĆH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Ma r ia J o l a n t a R ę d o w ic z Zakład Biochemii Mięśni Instytut Biologii
Budowa i funkcje komórek nerwowych
Budowa i funkcje komórek nerwowych Fizjologia Komórki nerwowe neurony w organizmie człowieka około 30 mld w większości skupione w ośrodkowym układzie nerwowym podstawowa funkcja przekazywanie informacji
Transportowane cząsteczki CO O, 2, NO, H O, etanol, mocznik... Zgodnie z gradientem: stężenia elektrochemicznym gradient stężeń
Transportowane cząsteczki Transport przez błony Transport bierny szybkość transportu gradien t stężeń kanał nośnik Transport z udziałem nośnika: dyfuzja prosta dyfuzja prosta CO 2, O 2, NO,, H 2 O, etanol,
Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika. Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony
Kosm os Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony 263-270 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika JOANNA MORACZEWSKA Akademia Bydgoska im. K. Wielkiego, Instytut Biologii i Ochrony
Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD Aleksandra Kotynia PRACA DOKTORSKA
Ruch i mięśnie. dr Magdalena Markowska
Ruch i mięśnie dr Magdalena Markowska Zjawisko ruchu Przykład współpracy wielu układów Szkielet Szkielet wewnętrzny: szkielet znajdujący się wewnątrz ciała, otoczony innymi tkankami. U kręgowców składa
BIOLOGIA KOMÓRKI. Techniki generowania heterokariontów
BIOLOGIA KOMÓRKI Techniki generowania heterokariontów Zjawisko fuzji łączenia dwóch lub więcej komórek w jedną strukturę występuje w przyrodzie w czasie wielu procesów fizjologicznych. Dotyczy ono głównie
Public gene expression data repositoris
Public gene expression data repositoris GEO [Jan 2011]: 520 k samples 21 k experiments Homo, mus, rattus Bos, sus Arabidopsis, oryza, Salmonella, Mycobacterium et al. 17.01.11 14 17.01.11 15 17.01.11 16
Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu
nauka o czynności żywego organizmu Stanowi zbiór praw, jakim podlega cały organizm oraz poszczególne jego układy, narządy, tkanki i komórki prawa rządzące żywym organizmem są wykrywane doświadczalnie określają
etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Temat: Białka Aminy Pochodne węglowodorów zawierające grupę NH 2 Wzór ogólny amin: R NH 2 Przykład: CH 3 -CH 2 -NH 2 etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Materiały dydaktyczne do kursów wyrównawczych z przedmiotu biologia
Człowiek najlepsza inwestycja Materiały dydaktyczne do kursów wyrównawczych z przedmiotu biologia Autor: dr inż. Anna Kostka Projekt współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego
KOMÓRKA. Cz. II. Egzocytoza. Endocytoza: fagocytoza. pinocytoza - niezależna od klatryny - zależna od klatryny (endocytoza receptorowa)
KOMÓRKA Egzocytoza Cz. II transport pęcherzyków zawierających substancje do wydzielenia fuzja pęcherzyków z błoną komórkową - wydzielenie substancji Fuzja błon Dwa rodzaje egzocytozy: konstytutywna: ciągła
Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.
W wyniku podziału komórki powstaje komórka potomna, która ma o połowę mniej DNA od komórki macierzystej i jest o połowę mniejsza. Aby komórka potomna była zdolna do kolejnego podziału musi osiągnąć rozmiary
Cytoplazma. podstawowa (cytozol) Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna)
Cytoplazma złoŝony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek Cytoplazma cytoplazma podstawowa (cytozol) organelle Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) ok. 55% objętości komórki złoŝony koloid
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
POWSTAWANIE KOMÓREK M. SZKIELETOWEGO ORAZ KOMÓREK SATELITOWYCH
Tkanka mięśniowa Pre-mioblasty POWSTAWANIE KOMÓREK M. SZKIELETOWEGO ORAZ KOMÓREK SATELITOWYCH 1. Komórki mezenchymalne miotomów różnicują się w wydłużone pre-mioblasty. - powstają miotubule 5. Różnicują
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
SESJA 5 STRUKTURA, MODYFIKACJE I FUNKCJE BIAŁEK WYKŁADY
SESJA 5 STRUKTURA, MODYFIKACJE I FUNKCJE BIAŁEK WYKŁADY 90 SESJA 5 WYKŁADY W05-01 ROZPOZNANIE LIGANDÓW BIAŁKOWYCH PRZEZ RECEPTORY INTEGRYNOWE Czesław Cierniewski Zaklad Biofizyki Akademii Medycznej, Łódź
Chemiczne składniki komórek
Chemiczne składniki komórek Pierwiastki chemiczne w komórkach: - makroelementy (pierwiastki biogenne) H, O, C, N, S, P Ca, Mg, K, Na, Cl >1% suchej masy - mikroelementy Fe, Cu, Mn, Mo, B, Zn, Co, J, F
MECHANIZMY RUCHÓW KOMÓRKOWYCH - DZIAŁANIE ANESTETYKÓW NA KOMÓRKI
MECHANIZMY RUCHÓW KOMÓRKOWYCH - DZIAŁANIE ANESTETYKÓW NA KOMÓRKI Zakres materiału, który naleŝy przygotować do ćwiczeń: 1) Budowa błony komórkowej 2) Mechanizm działania anestetyków 3) Aktywność ruchowa
Bioinformatyka wykład 10.I.2008
Bioinformatyka wykład 10.I.2008 Przewidywanie struktur białek krzysztof_pawlowski@sggw.pl 2008-01-10 1 Plan wykładu pole siłowe - opis energetyczny struktur białka proces zwijania się białek przewidywanie
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH. KANAŁY UWALNIAJĄCE JONY WAPNIA Z BŁON WEWNĘTRZNYCH. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 515-522 Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika W ie s ł a w a L e ś n ia k Zakład Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej
Podział tkanki mięśniowej. Tkanka mięśniowa. Poprzecznie prążkowana
Tkanka mięśniowa Podział tkanki mięśniowej Włókna mięśniowe Tkanka mięśniowa Komórki Komórki Poprzecznie prążkowana Gładka Szkieletowa Sercowa Szkieletowe Mięsień sercowy Mięśnie gładkie Cytoplazma z miofibryllami
Fizjologia człowieka
Fizjologia człowieka Wykład 2, część A CZYNNIKI WZROSTU CYTOKINY 2 1 Przykłady czynników wzrostu pobudzających proliferację: PDGF - cz.wzrostu z płytek krwi działa na proliferację i migrację fibroblastów,
Substancje o Znaczeniu Biologicznym
Substancje o Znaczeniu Biologicznym Tłuszcze Jadalne są to tłuszcze, które może spożywać człowiek. Stanowią ważny, wysokoenergetyczny składnik diety. Z chemicznego punktu widzenia głównym składnikiem tłuszczów
Część II: Ruch w układach biologicznych. Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż.
Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż. Jan Mazerski C Z ĘŚĆ II: RUCH W U K Ł ADACH B IOLOGICZNYCH 1. CYTOSZKIELET Zastosowania mikroskopu świetlnego do badania
Ćwiczenie 14. Maria Bełtowska-Brzezinska KINETYKA REAKCJI ENZYMATYCZNYCH
Ćwiczenie 14 aria Bełtowska-Brzezinska KINETYKA REAKCJI ENZYATYCZNYCH Zagadnienia: Podstawowe pojęcia kinetyki chemicznej (szybkość reakcji, reakcje elementarne, rząd reakcji). Równania kinetyczne prostych
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Transport pęcherzykowy
Transport pęcherzykowy sortowanie przenoszonego materiału zachowanie asymetrii zachowanie odrębności organelli precyzyjne oznakowanie Transport pęcherzykowy etapy transportu Transport pęcherzykowy przemieszczanie
KOMÓRKA. Wielkość komórek. Zróżnicowanie komórek. Elementy składowe komórki: Mikroskop świetlny:
Wielkość komórek Jednostki: 1 μm = 10-3 mm, 1 nm = 10-3 μm KOMÓRKA najmniejsze komórki (komórki przytarczyc, niektóre komórki nerwowe) przeciętne komórki 4-5 μm 20 μm największe komórki (oocyty, niektóre
(MIKROSKOP ELEKTRONOWY, ORGANELLE KOMÓRKOWE).
ĆWICZENIE 2. Temat: ULTRASTRUKTURA KOMÓRKI (1). (MIKROSKOP ELEKTRONOWY, ORGANELLE KOMÓRKOWE). 1. Podstawy technik mikroskopowo-elektronowych (Schemat N/2/1) 2. Budowa i działanie mikroskopu elektronowego
Wprowadzenie do biologii molekularnej.
Wprowadzenie do biologii molekularnej. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Biologia molekularna zajmuje się badaniem biologicznych
Transport pęcherzykowy i plazmodesmy
Transport pęcherzykowy i plazmodesmy 1 Rola plazmodesmów (desmosomy, złącza szczelinowe) Zambryski & Crawford 2000 PD kanały ciągłości cytoplazmatyczno-jądrowej w ścianie komórkowej zapewniające komunikację
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Kosm os. PROBLEMY NAUK Ti i ó LOGICZNYCH KALRETIKULINA BIAŁKO O WIELU OBLICZACH. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony
Kosm os PROBLEMY NAUK Ti i ó LOGICZNYCH Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 635-640 Polskie Tow arzystw o P rzyrodników im. K opernika K o n r a d S. F a m u l s k i Molecular Oncology Program, Cross Cancer
Podstawy projektowania leków wykład 12
Podstawy projektowania leków wykład 12 Łukasz Berlicki Projektowanie wspomagane komputerowo Ligand-based design QSAR i 3D-QSAR Structure-based design projektowanie oparte na strukturze celu molekularnego
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Tkanka mięśniowa. pobudliwość kurczliwość
Tkanka mięśniowa troponina tropomiozyna Aparat kurczliwy: miofilamenty cienkie ( i białka pomocnicze) miofilamenty grube (miozyna 2) białka pomocnicze łańcuchy lekkie miozyna 2 miozyna 2 pobudliwość kurczliwość
AUTOREFERAT ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. The role of Sdf-1 in the migration and differentiation of stem cells during skeletal muscle regeneration
mgr Kamil Kowalski Zakład Cytologii Wydział Biologii UW AUTOREFERAT ROZPRAWY DOKTORSKIEJ The role of Sdf-1 in the migration and differentiation of stem cells during skeletal muscle regeneration Wpływ chemokiny
Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim I Błony biologiczne
Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim 2019 I Błony biologiczne 1. Budowa i składniki błon biologicznych - fosfolipidy - steroidy - białka - glikoproteiny i glikolipidy 2. Funkcje błony komórkowej
Streszczenie Przedstawiona praca doktorska dotyczy mobilizacji komórek macierzystych do uszkodzonej tkanki mięśniowej. Opisane w niej badania
Streszczenie Przedstawiona praca doktorska dotyczy mobilizacji komórek macierzystych do uszkodzonej tkanki mięśniowej. Opisane w niej badania koncentrowały się na opracowaniu metod prowadzących do zwiększenia
KOMÓRKA. Cz. II. Egzocytoza. Endocytoza: fagocytoza. pinocytoza - niezależna od klatryny - zależna od klatryny (endocytoza receptorowa)
KOMÓRKA Egzocytoza Cz. II błona komórkowa wydzielina pęcherzyk wydzielniczy transport pęcherzyków zawierających substancje do wydzielenia fuzja pęcherzyków z błoną komórkową - wydzielenie substancji Fuzja
Informacje dotyczące pracy kontrolnej
Informacje dotyczące pracy kontrolnej Słuchacze, którzy z przyczyn usprawiedliwionych nie przystąpili do pracy kontrolnej lub otrzymali z niej ocenę negatywną zobowiązani są do dnia 06 grudnia 2015 r.