Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika. Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony
|
|
- Zofia Marek
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Kosm os Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika JOANNA MORACZEWSKA Akademia Bydgoska im. K. Wielkiego, Instytut Biologii i Ochrony Środowiska Chodkiewicza 30, Bydgoszcz moraczjo@ab-byd.edu.pl Zakład Biochemii Mięśni, Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN Pasteura 3, Warszawa TROPOMIOZYNA BIAŁKO REGULATOROWE FILAMENTÓW AKTYNOWYCH Cykliczne oddziaływania aktyny z miozyną oraz dynamiczna polimeryzacja i depolimeryzacja filamentów aktynowych leżą u podstaw tak różnych procesów, jak skurcz komórek mięśniowych, cytokineza, przemieszczanie się komórek ameboidalnych, fagocytoza czy transport pęcherzyków wewnątrzkomórkowych. Procesy te podlegają precyzyjnej regulacji przy udziale licznych białek wiążących aktynę. Tropomiozyna (TM) należy do grupy białek regulujących, ściśle związanych z filamentami aktynowymi (zwanymi też filamentami cienkimi w komórkach mięśniowych, mikrofilamentami w pozostałych komórkach, lub F-aktyną). STRUKTURA TROPOMIOZYNY TM została odkryta w 1948 r. przez Baileya w komórkach mięśni szkieletowych (B a ile y 1948). Do dziś zidentyfikowano kilkanaście izoform tego białka, występujących nie tylko w mięśniach, ale praktycznie we wszystkich badanych pod tym kątem komórkach eukariotycznych (L e e s - M ille r i H e lfm a n 1991). Izoformy TM są do siebie bardzo zbliżone pod względem budowy. Są to dimery utworzone z a-helikalnych łańcuchów, które na prawie całej swej długości splatają się w strukturę superhelisy (HlTCHCOCK-DeGREGORi 1994). Do niedawna sądzono, że N- i C-końcowe części cząsteczki TM są nieustruktuiyzowane, jednak jak wykazały badania z zastosowaniem spektroskopii NMR nad syntetycznym peptydem odpowiadającym dziewięciu N-końcowym resztom aminokwasowym TM a również ten odcinek cząsteczki tworzy typową superhelisę (G r e e n fie ld i współaut. 1998). Cechą charakterystyczną TM są powtórzenia odcinków siedmiu reszt aminokwasowych, z których pierwsza i czwarta są silnie hydrofobowe. W a-helikalnie zwiniętym łańcuchu polipeptydowym hydrofobowe reszty tworzą płaszczyznę oddziaływań pomiędzy dwoma łańcuchami tropomiozyny i silnie stabilizują superhelisę (G r e e n fie ld i H itc h c o c k -D e G r e - g o r i 1995). Cząsteczki TM układają się jako dwa sznury wzdłuż filamentu aktynowego (Rye. 1). Powtórzenia sekwencji wzdłuż cząsteczki TM odpowiadają periodycznie rozmieszczonym miejscom wiązania TM z aktyną. Zależnie od długości, każda cząsteczka TM oddziałuje z sześcioma lub siedmioma podjednostkami aktyny, a w komórkach drożdży występują izoformy tropomiozyny, których długość odpowiada czterem lub pięciu podjednostkom aktyny (H itc h c o c k - DeGREGORi 1994). Pomiędzy sąsiadującymi cząsteczkami TM zachodzi kontakt typu głowa-ogon, przy czym C-końcowy fragment jednej cząsteczki tworzy zakładkę z N-końcowym odcinkiem następnej. Z analiz strukturalnych wynika, że zakładkę tworzą odcinki dziewięciu reszt aminokwasowych z każdego końca (P h illip s i współaut. 1979). GENETYCZNE PODSTAWY RÓŻNORODNOŚCI TROPOMIOZYN Analiza porównawcza sekwencji aminokwasowych łańcucha polipeptydowego TM oraz sekwencji nukleotydów genów TM z mięśni szkieletowych, gładkich, mięśni serca i wielu komó
2 264 J o a n n a M o r a c z e w s k a rek rdemięśniowych wykazuje, że białka te są silnie konserwatywne. Zróżnicowanie wśród tropomiozyn jest pochodną istnienia kilku genów kodujących to białko, alternatywnego składania eksonów oraz wyboru alternatywnego promotora. U zwierząt kręgowych tropomiozyny są kodowane przez cztery geny: a, (3, TPM3 (zwany też y lub htmnm) oraz TPM4 (zwany dla TM z mięśni gładkich, podczas gdy 2b występuje we wszystkich pozostałych izoformach TM. Ekson 6a jest rzadszy niż 6b i ulega ekspresji tylko w dwóch formach TM niemięśniowej TM-3 itm-5b z fibroblastów. Największa zmienność sekwencji występuje na końcu C, który jest kodowany przez cztery alternatywne eksony. Ekson 9ajest specyficzny dla komórek Ryc. 1. Schemat budowy filamentu cienkiego z mięśni poprzecznie prążkowanych. również genem 8 (Ryc. 2A). Nie wyjaśniono do końca, czy wszystkie zwierzęta posiadają pełen zestaw genów (Lees-Miller i Helfman 1991). Największa liczba izoform, co najmniej dziewięć, jest generowana przez gen a (Ryc. 2B). Istnienie dwóch alternatywnych promotorów w obrębie tego genu prowadzi do powstania (np. w fibroblastach, w komórkach nabłonka i mózgu) izoform ciężkich, zawierających 284 reszt aminokwasowych, bądź lekkich o długości 248 reszt. W izoformach ciężkich koniec N cząsteczki jest kodowany przez ekson la. W izoformach lekkich N-końcowy rejon kodowany przez eksony la i 2 jest zastępowany sekwencją kodowaną przez ekson lb. Alternatywne składanie eksonów prowadzi do dalszego zróżnicowania izoform, które oprócz zmiennych końców N, różnią się między sobą sekwencjami C-końcowymi kodowanymi przez ekson 9 oraz dwoma sekwencjami wewnętrznymi kodowanymi przez eksony 2 i 6. Zarówno ekson 2, jak i 6 występują w dwóch wariantach. Ekson 2a jest specyficzny mięśni. Podobna specyficzność dotyczy eksonów 9b i 9c, które ulegają ekspresji tylko w mózgu. Natomiast ekson 9d koduje sekwencję konstytutywną typową dla izoformy TM z mięśni gładkich i dla wielu izoform niemięśniowych (Pittenger i współaut. 1994). W porównaniu z genem a pozostałe trzy geny są mniej skomplikowane. Gen (3koduje dwie izoformy ciężkiej TM, które ulegają ekspresji w mięśniach szkieletowych oraz gładkich i w komórkach niemięśniowych (Pittenger i współaut. 1994). Produktami genu TPM3 są następujące izoformy: ciężka, z tzw. wolnych mięśni szkieletowych, która u człowieka ulega też ekspresji w mięśniu sercowym, lekka, wytwarzana w fibroblastach (Lin i współaut. 1997), oraz wykryte niedawno izoformy specyficzne dla komórek nerwowych (Gunning i współaut. 1998). Gen TPM4 koduje jedną izoformę lekkiej tropomiozyny niemięśniowej (Lees-Miller i Helfman 1991, Pittenger i współaut. 1994). POWINOWACTWO IZOFORM TM DO AKTYNY Wspólną cechą tropomiozyn jest kooperatywne wiązanie z aktyną, choć izoformy izolowane z różnych źródeł różnią się znacznie powinowactwem do aktyny. Wielu informacji na ten temat dostarczyły badania poszczególnych izoform TM wytwarzanych w bakteriach przy użyciu technik rekombinacji DNA. To podejście pozwoliło na otrzymanie czystych izoform TM, co w przypadku tropomiozyn izolowanych z tkanek nie zawsze jest możliwe ze względu na trudności w rozdzielaniu licznych naturalnie występujących izoform, często tworzących trudne do rozdzielenia heterodimery. Jak wynika z tych badań, główną rolę w definiowaniu powinowactwa TM do aktyny ma struktura końców N i C tropomiozyny. Bardzo
3 Tropomiozyna białko regulatorowe 265 Ryc. 2. A) Schemat budowy genów kodujących tropomiozynę u kręgowców. Eksony przedstawiono jako prostokąty, a introny jako linie łączące prostokąty. Prostokąty wypełnione odmiennymi wzorami reprezentują alternatywne eksony. B) Schemat budowy izoform tropomiozyny. Prostokąty reprezentują rejony cząsteczki kodowane przez alternatywne eksony. Wzór wypełniający prostokąt odpowiada rodzajowi kodującego eksonu. (Wg P it t e n g e - r a i współaut. 1994). istotna dla wiązania aktyny jest acetylacja N- końcowej reszty metioniny (H itc h c o c k -D e G re - GORI 1994). Tropomiozyny wytwarzane w komórkach bakteryjnych nie ulegają acetylacji. Otrzymywana w bakteriach TM mięśni szkieletowych, w porównaniu z jej odpowiednikiem izolowanym z mięśni, wiąże się z aktyną około 50 razy słabiej (M o r a c z e w s k a i współaut. 1999). Acetylacja końca N znacząco zwiększa asocjację z aktyną niemięśniowej TM-1, która jest produktem genu p, ale ma niewielki wpływ na drugi produkt tego genu szkieletową formę TM p. Sekwencja końców N obu tych izoform jest taka sama, ale różnią się one sekwencją końca C i wewnętrznego rejonu cząsteczki (Pitt e n g e r i współaut. 1995). Sugeruje to, że dla osiągnięcia wysokiego powinowactwa do aktyny konieczne jest współdziałanie obu końców sąsiadujących cząsteczek.
4 266 J oanna M oraczew ska O kluczowej roli N-końcowego regionu TM a w wiązaniu tego białka z aktyną świadczy fakt, że delecja dziewięciu pierwszych reszt aminokwasowych powoduje całkowitą utratę zdolności TM do wiązania aktyny. Silny wpływ ma również usunięcie C-końcowej części cząsteczki, jednak, w przeciwieństwie do delecji końca N, dodanie troponiny (Tn) częściowo przywraca wiązanie tak zmutowanej cząsteczki z aktyną. Wśród tropomiozyn kodowanych przez gen a wyższym powinowactwem do aktyny charakteryzują się te formy, których C-końcowa część cząsteczki jest kodowana przez ekson 9d (TM mięśni gładkich, liczne TM niemięśniowe), niż TM mięśni szkieletowych o końcu C kodowanym przez ekson 9cl Tropomiozyny krótkie, w których N-końcowe sekwencje są kodowane przez ekson 1 b, wiążą się silniej z aktyną niż ich długie odpowiedniki. Wyjątkiem są tropomiozyny mózgowe, w których C-końcowa sekwencja kodowana jest przez ekson 9c. Zamiana sekwencji la na lb w tych białkach nie ma znaczącego wpływu na powinowactwo TM do aktyny (M o r a c z e w s k a i współaut. 1999). Różnice w powinowactwie do aktyny pomiędzy izoformami kodowanymi przez geny (3są definiowane przez sekwencje C-końcowego rejonu cząsteczki. TM (3 z mięśni szkieletowych wiąże się około cztery razy silniej z aktyną, niż TM-1 z fibroblastów. Chimera skonstruowana przez zamianę końcowego eksonu i 1 w cdna dla TM-1 na ekson 10, specyficzny dla TM (3mięśni szkieletowych, prowadzi do powstania cząsteczki, która wiąże się z aktyną z powinowactwem zbliżonym do TM (3mięśni szkieletowych (P it t e n g e r i współaut. 1995). TKANKOWA SPECYFICZNOŚĆ EKSPRESJI IZOFORM TM Różne typy komórek charakteryzują się specyficznym wzorem ekspresji izoform TM. W mięśniach poprzecznie prążkowanych i gładkich występują ciężkie izoformy tropomiozyny tworzące homo- i heterodimery. W mięśniach szkieletowych szybkich, odpowiedzialnych między innymi za ruchy kończyn, wytwarzane są TM a i TM (3, w stosunku 2,5:1 (P ie p le s i W ie c z o r e k 2000), zatem w komórkach tego typu TM występuje w postaci homodimeru a/a i heterodimeru oc/f3. W mięśniach gładkich heterodimery również powstają z jednego polipeptydu typu a i jednego typu (3, specyficznych dla tych mięśni. Funkcjonalne znaczenie takich połączeń sugerują wyniki badań nad właściwościami TM a i (3z mięśni gładkich, według których heterodimery a/(3 wiążą się silniej z aktyną, niż homodimery a/a i (3/(3(J a n sco i G r a c e f f a 1991). W mięśniach szkieletowych typu wolnego, odpowiedzialnych za utrzymywanie postawy ciała, oprócz izoform a i (3wytwarzana jest izoforma TPM3, która stanowi około 1/3 całkowitej ilości tropomiozyny (P ie p le s i W ie c z o r e k 2000). Jej funkcja nie została dokładnie poznana, ale o istotnym znaczeniu tej izoformy świadczy fakt, że u człowieka punktowa mutacja w N-końcowej części cząsteczki TPM3 jest odpowiedzialna za powstanie miopatii nemalinowej, dziedzicznej choroby objawiającej się m.in. osłabieniem zdolności motorycznych osób dotkniętych tym schorzeniem. W mięśniu sercowym dużych ssaków formą dominującą jest TM a (L ew is i S m illie 1980), podczas gdy u małych ssaków formy a i 3występują w przybliżeniu w równych ilościach (Tobacm an 1996). Badania na myszach transgenicznych dały pewne pojęcie o funkcjonalnych różnicach pomiędzy tymi formami TM. Nadprodukcja TM 3u tych zwierząt powodowała zwiększoną wrażliwość mięśnia sercowego na stężenie jonów wapnia i zmniejszony stopień skurczu i relaksacji (W o ls k a i współaut. 1999). W komórkach fibroblastów wytwarzanych jest co najmniej 8 izoform TM, które u małych ssaków tworzą w większości homodimery. In vitro wiązanie niemięśniowej TM-1 (produktu genu 3) z aktyną zwiększało się w obecności TM-2 i TM-3, które są produktami genu a (P itt e n g e r i współaut. 1995). Doświadczenia in vivo na kardiomiocytach szczurów poddanych transfekcji wektorem zawierającym cdna tropomiozyny wykazały, że izoforma lekka TM-4, która jest produktem genu y jest zdolna do wiązania z sarkomerami tylko wspólnie z innymi lekkimi izoformami TM. Efektu tego nie obserwowano, gdy komórki poddawano kotransfekcji DNA TM-4 i ciężkiej izoformy a szkieletowej (H e lfm a n i współaut. 1999). Powyższe dane wskazują na synergiczne działanie niektórych izoform TM, polegające prawdopodobnie na tworzeniu heterodimerów lub na oddziaływaniach głowa-ogon pomiędzy różnymi izoformami wzdłuż tego samego filamentu aktynowego.
5 Tropomiozyna białko regulatorowe 267 REGULACJA ODDZIAŁYWAŃ AKTYNA-MIOZYNA FUNKCJE TROPOMIOZYNY Funkcje TM najlepiej poznano w komórkach mięśniowych, w których TM reguluje oddziaływania pomiędzy aktyną i miozyną. W mięśniach poprzecznie prążkowanych każda cząsteczka TM jest związana z kompleksem troponiny (Tn), na który składają się: wiążąca wapń Tn-C, inhibitorowa podjednostkatn-i oraz wiążąca tropomiozynę podjednostka Tn-T (Rye. 1). Wydłużona cząsteczka Tn-T tworzy rodzaj mostka pomiędzy tropomiozynami, wiążąc się z C- i N- końcowymi fragmentami sąsiadujących cząsteczek. Obecność Tn nadaje układowi regulacji filamentu cienkiego wrażliwość na jony wapnia (Z o t i P o t t e r 1987). Wiązanie jonów wapnia do Tn-C powoduje przesunięcie TM na filamencie aktynowym i częściowe odsłonięcie miejsc wiązania główek miozyny do aktyny. W pozbawionych Tn mięśniach gładkich i komórkach niemięśniowych funkcjonują dwa zależne od wapnia białka kontrolujące oddziaływania aktyny z miozyną kaldesmon, związany z frlamentem aktynowym, i kinaza lekkich łańcuchów miozyny (A d e ls te in i E is e n b e r g 1980, Y a m ash iro- M atsu m u ra i M a tsu m u ra 1988). Jedną z metod analizy cyklicznych oddziaływań aktyny z miozyną in vitro jest pomiar aktywności ATPazy aktomiozynowej. W obecności TM interakcje aktyna-miozyna przybierają charakter kooperatywny. TM wyizolowana z mięśni szkieletowych reguluje aktywność ATPazy aktomiozynowej w dwojaki sposób: aktywność ATPazy jest hamowana przy niskim stosunku molowym miozyny do aktyny, a zwiększana przy wysokich stężeniach miozyny w stosunku do aktyny (L e h r e r i M o r r is 1982). Obecność Tn wzmaga podwójną regulatorową właściwość TM. W nieobecności jonów wapnia zaznacza się silniejszy wpływ hamujący, podczas gdy związanie Ca2+ przez Tn powoduje silniejszą, w porównaniu z samą TM, aktywację ATPazy aktomiozynowej (Ryc. 3). Nieco odmiennie zachowuje się TM z mięśni gładkich, która nawet przy niskich stężeniach miozyny aktywuje ATPazę powyżej wartości osiąganej dla nieregulowanej aktyny w tych samych warunkach (M a rs to n i R e d w o o d 1992). Różnicę w regulacji aktywności aktomiozyny zaobserwowano też dla dwóch tropomiozyn niemięśniowych, TM lekkiej (TM-5) i ciężkiej (TM-3). TM-5 aktywowała ATPazę 5-krotnie silniej (Novy i współaut. 1993). Podobną stymulację aktywności ATPazy przez lekką TM obserwowano przy porównaniu właściwości tropomiozyny lekkiej, pochodzącej z Xenopus, i ciężkich izoform kurzej TM mięśniowej i niemięśniowej (Fanning i współaut. 1994). Dodatkowe zróżnicowanie właściwości izoform TM polega na tym, że o rodzaju regulacji decyduje nie tylko typ TM, ale również rodzaj miozyny. TM mięśni szkieletowych stymuluje Ryc. 3. Regulacja aktywności ATPazy aktomiozynowej przez tropomiozynę. Przy stałym stężeniu aktyny (1) aktywność ATPazy jest liniową funkcją stężenia miozyny. W obecności TM na filamencie aktynowym (2) proces ten staje się kooperatywny. Tn w obecności Ca2+ (3) zwiększa aktywację, a w nieobecności Ca2+ (4) hamowanie ATPazy (Lehrer i M orris 1982). aktywność ATPazy miozyny wyizolowanej z mięśni gładkich w warunkach, w których hamuje aktywność miozyny szkieletowej (B r e m e l i współaut. 1973, E a to n i współaut. 1975). Wspomniana TM Xenopus hamuje aktywność jednogłówkowej miozyny wyizolowanej z kosmków jelitowych, ale działa przeciwnie w stosunku do jednogłówkowego fragmentu proteolitycznego miozyny szkieletowej (Fanning i współaut. 1994). Fakt, że w komórkach eukariotycznych ulegają ekspresji liczne izoformy TM oraz białek motorycznych z rodziny miozyn, skłania do przypuszczenia, że w toku ewolucji niektóre izoformy TM zostały przystosowane do wybiórczej regulacji aktywności różnych izoform miozyny.
6 268 J oanna M oraczew ska STABILIZACJA FILAMENTÓW AKTYNOWYCH PRZEZ TROPOMIOZYNĘ Obserwacje mikroskopowe wykazują, że TM zwiększa sztywność filamentów aktynowych (Kawam ura i M aruyam a 1970). Stabilizacja F- aktyny przejawia się też w zmniejszonej szybkości oddysocjowywania podjednostek aktyny z końców filamentu (Lin i współaut. 1997). Wiążąc się z filamentami aktynowymi, TM modyfikuje działanie białek wiążących aktynę, które regulują polimeryzację i depolimeryzację, tworzenie wiązek i sieci aktyny w odpowiedzi na sygnały zewnątrzkomórkowe, przez co wpływają na dynamikę aktyny istotną dla strukturalnej integralności i ruchliwości komórkowej (Lin i współaut. 1997). TM chroni F-aktynę przed działaniem żelzoliny, wiliny, kofiliny, czynnika depolimeryzującego aktynę (ang. actin depolymerizing factor, ADF) i filaminy (Lin i współaut. 1997). Żelzolina i wilina należą do rodziny białek, które w sposób zależny od Ca + i fosforanów fosfatydyloinozytoli przecinają filamenty aktynowe i zakrywają ich szybko rosnące końce, przez co generują dużą ilość krótkich filamentów i zapobiegają ich elongacji. Wilina dodatkowo wykazuje zdolność tworzenia wiązek F-aktyny, która pojawia się przy niskim stężeniu wewnątrzkomórkowego Ca2+ (F r ie d e r ic h i L o u v a rd 1999, Yin 1999). Izoformy TM różnią się stopniem ochrony aktyny przed działaniem wspomnianych białek. TM niemięśniowa wyizolowana z płytek krwi nie różni się pod tym względem od TM z mięśni, podczas gdy izoforma mózgowa wykazuje zdecydowanie słabsze działanie ochronne (Lin i współaut. 1997). Białka należące do rodziny filaminy organizują filamenty aktynowe w ortogonalne sieci lub, przy wyższym stosunku molowym do aktyny, w wiązki (HOCK 1999). Tropomiozyny z mięśni szkieletowych i gładkich współzawodniczą z filaminą i ABP-120, innym białkiem tej rodziny, o miejsca wiązania do aktyny. TM mózgowa słabiej niż TM z mięśni szkieletowych zapobiega wiązaniu z aktyną białek sieciujących filaminy i ABP (Lin i współaut. 1997). Słaby wpływtm mózgowej na oddziaływania aktyny z białkami wiążącymi przypisuje się niskiej stałej powinowactwa tej izoformy TM do aktyny. Ekspresja TM o takich właściwościach w komórkach mózgu może być przejawem adaptacji do specyficznych funkcji mózgu, dla których istotna jest plastyczność tkanki nerwowej. Sieć filamentów aktynowych odgrywa istotną rolę w utrzymywaniu kształtu komórek i tworzeniu struktur cytoplazmatycznych, bez których komórki nie mogłyby realizować swoich funkcji życiowych. Badania na komórkach nowotworowych ujawniły, że poziom ekspresji długich izoform TM jest w nich znacznie obniżony. Wprowadzenie do tych komórek oczyszczonej TM, bądź przywrócenie ekspresji TM, zmniejsza inwazyjność i częściowo przywraca kształt właściwy zdrowym komórkom (Lin i współaut. 1997). Doświadczenia te pośrednio wskazują na udział TM w regulacji kształtu komórki, jej przylegania do podłoża i ruchliwości. UDZIAŁ TROPOMIOZYNY W CYTOKINEZIE Tropomiozyna jest jednym z białek uczestniczącym w procesie cytokinezy (R obin son i Spu dich 2000). TM drożdżowa bierze udział w tworzeniu pierścienia podziałowego. W komórkach kręgowców w pierścieniu podziałowym zlokalizowano izoformy TM-4 i TM-5 (Lin i współaut. 1997). Na istotną rolę specyficznych izoform w procesie podziału komórkowego wskazują doświadczenia na fibroblastach poddanych transfekcji genem kodującym chimeryczne TM5/2 i TM5/3, w których koniec C cząsteczki pochodził od izoform odpowiednio TM-2 i TM-3. Tak zmienione komórki wykazywały zwiększony poziom błędu w podziałach, pomimo że TM chimeryczne wiążą się silnie z aktyną (W a r re n i współaut. 1995). Specyficzny wpływ TM-5 na cytokinezę może polegać na precyzyjnej regulacji oddziaływań aktyny z miozyną II, bądź innymi białkami biorącymi udział w podziałach komórkowych. ROLA TM W TRANSPORCIE PĘCHERZYKÓW WEWNĄTRZKOMÓRKOWYCH Transport organelli wewnątrzkomórkowych odbywa się przy udziale mikrotubul i filamentów cienkich. Uważa się, że transport na dalsze odległości odbywa się wzdłuż mikrotubul, natomiast filamenty aktynowe służą jako lokalne szlaki transportowe organelli (L a n g fo r d 1995). Mikroiniekcja oczyszczonych izoform, ciężkiej TM-3 i lekkiej TM-5, do komórek nabłonkowych nerki szczura pozwoliła zaobserwować, że mają one różny wpływ na dystrybucję mitochondriów i lizosomów. TM-5 nie wpływała na rozmieszczenie organelli, zaś nadmiar TM-3 w komórce stymulował transport wsteczny, w wyniku którego organelle gromadziły się w okolicy okołojądrowej. Jednocześnie z ruchem organelli obserwowano przemieszczenie miozyny I i dyneiny w pobliże jądra, co sugeruje, że organelle przesuwały się zarówno wzdłuż filamentów aktyno
7 Tropomiozyna białko regulatorowe 269 wych, jak i mikrotubul (Pelham i współaut. 1996). Specyficzny udział izoform TM w transporcie obserwowano również u drożdży. Delecja genu kodującego ciężką TPM1 sprawiała, że pęcherzyki wydzielnicze ulegały akumulacji w komórce. Podobny fenotyp uzyskano mutując gen MY02 (niekonwencjonalnej miozyny V). Połączenie obu mutacji było letalne, co wskazuje na czynny udział obu białek w mechanizmie transportu wewnątrzkomórkowego. Specyficzną rolę TPM1 w tym procesie podkreśla fakt, że mutacje w genie lekkiej izoformy TPM2 nie wpływały na transport pęcherzyków (Lin i współaut. 1997). TROPOMYOSIN A REGULATORY PROTEIN OF ACTIN FILAMENTS Interactions between actin and myosin as well as dynamic polymerization-depolymerization of actin filaments are the mechanisms of contraction and several motility functions of various cells. Tropomyosin (TM) is a regulatory protein associated with actin filaments and is involved in regulation of the above mentioned processes. Elongated TM molecules polymerize head-to-tail along both grooves of the actin filament. The diversity among TM isoforms is a consequence of the presence of different genes (four in vertebrates), alternative promoter selection, and alternative splicing of gene transcripts. Tropomyosins can be divided into two classes: of high and low molecular weight isoforms. The former are 284-amino acid long and the latter are Summary 248-amino acid long. Although different in sequence, all TM molecules exist as homo- or heterodimers forming a coiledcoil. Most of the characterized TMs bind cooperatively to actin, however the isoforms differ in their actin affinity. These differences can be ascribed to differing sequences of specific regions, mostly oftm s ends. The affinity with which TM binds to actin is thought to be one of the mechanisms of actin filament stabilization and regulation of actin interactions with other proteins. TM is involved in regulation of such cellular functions as muscle contraction, cytokinesis, intracellular vesicle transport, fagocytosis, maintaining of cell shape, and ameboidal cell movement. LITERATURA A d e ls t e inr. s., E isenberg G., Regulation andkintetics of the actin-myosin-atp interaction. Annu. Rev. Biochem. 49, Bailey K., Tropomyosin: A new symmetric protein component of the muscle fibril Biochem. J. 43, B r e m e lr. D., M urray J. M., W eber A., Manifestations of cooperative behaviour in the regulated actinfilament during actin-activated ATP hydrolysis in the presence of calcium. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 37, Eaton B. L., K om m inz D. R., E isenberg E., Correlation between the inhibition of the acto-heavy meromyosin ATPase and the binding of tropomyosin to F-actin: effects of Mg++, KCl, troponin I, and troponin C. Biochemistry 14, M anning A. S., W olenski J. S., M ooseker M. S., Izant J. G., Differential regulation of skeletal muscle myosin-ii and brush border myosin-1 enzymology and mechanochemistry by bacterially produced tropomyosin isoforms. Cell Motil. Cytoskeleton 29, F riederich E., L ouvard D., Villin. (W:] K reis T., V ale R. (red.). Guidebook to the cytoskeletal and motor proteins. Oxford University Press, Oxford, G reenfield N. J., H itc h c o c k-d eg regori S. E., The stability of tropomyosin, a two-stranded coiled-coil protein, is primarily a function of the hydrophobicity of residues at the helix-helix interface. Biochemistry 34, G reenfield N. J., M ontelione G. T., F arid R. S., H itchcock- D eg regori S. E., The structure of the N-terminus of striated muscle alpha-tropomyosin in a chimeric peptide: nuclear magnetic resonance structure and circular dichroizm studies. Biochemistry 37, G unning P., Hardem an E., J effrey P., W einberger R., Creating intracellular structural domains: spatial segregation of actin and tropomyosin isoforms in neurons. Bioassays 20, H elfm an D. M., B e rth ier C., G rossm an J., L eu M., E hler E., E. P., P erriard J.-C., Nonmuscle tropomyosin-4 requires coexpression with other low molecular weight isoforms binding to thin filaments in cardiomyocytes. J. Cell Sci. 112, H itchcock-d eg regori S. E., Structural requirements of tropomyosin for binding to filamentous actin Adv. Exp. Med. Biol. 358, H ock R., Filamin. [W:] Guidebook to the cytoskeletal an motor proteins. K reis T., V a le R. (red.). Oxford University Press, Oxford, J ansco A., G raceffa P., Smooth muscle tropomyosin coiled-coil dimers. Subunit composition, assembly and end-toend interaction. J. Biol. Chem. 266, K awamura M., M aruyama K., Electron microscopic particle length of F-actin polymerized in Vitro. J.Biochem. (Tokyo) 67, L angford G. M., Actin- and microtubule-dependent organelle motors: Interrelationships between the two motility systems. Curr. Opin. Cell Biol. 7, L e e s-m iller J. P., H elfm an D. M., The molecular basis for tropomyosin isoform diversity. Bioessays 13, L ehrer S. S., M orris E. P., Dual effects of tropomyosin and troponin-tropomyosin on actomyosin subfragment 1 ATPase. J. Biol. Chem. 257, L ew is W. G., S m illie L.B., The amino acid sequence of rabbit cardiac tropomyosin. J. Biol. Chem. 255, L in J. J.-C., W arren K. S., W am bo ldt D. D., W ang T., L in J. L. -C., Tropomyosin isoforms in nonmuscle cells. Int. Rev. Cytol. 170, M arston S. B., R edw ood C. S., Inhibition of actin-tropomyosin activation of myosin ATPase activity by the smoth muscle regulatory protein caldesmon. J. Biol. Chem. 261, M oraczew ska J., N icholson-f ltnn K., H itchcock-d eg regori S.E., The ends of tropomyosin are major determinants of actin affinity and myosin subfragmentl-in-
8 270 J oanna M oraczew ska duced binding to F-actin in the open state. Biochemistry 38, N ovy R. E., S e lle r s J.R Liu L. F., Lin J. J., In vitro functional characterization o f bacterially expressed human fibroblast tropomyosin isoforms and their chimeric mutants. Cell Motil. Cytoskeleton 26, Pelham R. J. J., Lin J., J. -C., W an g Y. -L., A high molecular mass non-muscle tropomyosin isoform stimulates retrograde organelle transport. J. Cell Sci. 109, Phillips G. N., Jr., Lattman E.E., Cummins P., L ee K.Y., Cohen C., Crystal structure and molecular interactions of tropomyosin. Nature 278, Piep les K., W ie c zo re k D. F., Tropomyosin 3 increases striated muscle isoform diversity. Biochemistry 39, P itte n g e r M. F., Kazzaz J. A., H elfm an D. M., Functional properties of non-muscle tropomyosin isoforms. Curr. Opin. Cell Biol. 6, P itte n g e r M. F., K is t le r A., H elfm an D. M., Alternatively spliced exons of the b tropomyosin gene exhibit different affinities for F-actin and effects with nonmuscle caldesmon. J.Cell Sci. 108, Robinson D. N., Spudich J. A., Towards a molecular understanding of cytokinesis. Trends Cell. Biol. 10, Tobacman L.S., Thin filament-mediated regulation of cardiac contraction. Annu. Rev. Physiol. 58, W arren K. S., Lin J.L. -C., M cd erm ott J. P., Lin J. J. -C., Forced expression of chimeric human fibroblast tropomyosin mutants affects cytokinesis. J. Cell Biol. 38, W o ls k a B. M., K e l l e r R. S., Evans C. C., P a lm iter K.A., P h illip s R. M., Mathuchamy M., O e h le n s c h la g e r J., W ie c zo re k D.F., D e Tom be P.P., S o la r o R. J., Correlation between myofilament response to Ca2+ and altered dynamics of contraction and relaxation in transgenic cardiac cells that express beta-tropomyosin. Circ. Res. 84, 745r-751. Yam ashiro-matsum ura S., Matsum ura F., Characterisation of 83-kilodalton nonmuscle caldesmon from cultured rat cells: stimulation of actin binding of nonmuscle tropomyosin and periodic localization along microfilaments like tropomyosins. J. Cell Biol. 106, Yin H., Gelsolin. [W:] K reis T., V a le R. (red.). Guidebook to the cytoskeletal and motor proteins. Oxford University Press, Oxford, ZotA.S., P o t t e r J.D., Structural aspects of troponintropomyosin regulation of skeletal muscle contraction. Ann. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 16,
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET
CYTOSZKIELET Sieć włókienek białkowych; struktura wysoce dynamiczna Filamenty aktynowe Filamenty pośrednie Mikrotubule Fibroblast CYTOSZKIELET 1 CYTOSZKIELET 7nm 10nm 25nm Filamenty pośrednie ich średnica
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) Komórka eukariotyczna. cytoplazma + jądro komórkowe.
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe (układ wykonawczy) cytoplazma podstawowa (cytozol) Cytoplazma złożony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek (centrum informacyjne) organelle i kompleksy
Filamenty aktynowe ORGANIZACJA CYTOPLAZMY. komórki CHO (Chinese hamster ovary cells ) Hoechst jądra, BOPIPY TR-X phallacidin filamenty aktynowe
Filamenty aktynowe ORGANIZACJA CYTOPLAZMY komórki CHO (Chinese hamster ovary cells ) Hoechst jądra, BOPIPY TR-X phallacidin filamenty aktynowe Cytoszkielet aktynowy G-aktyna 370 aminokwasów 42 43 kda izoformy:
Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Kosm os Tom 50, 2001 Numer 4 (253) Strony 349-358 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Z e n o n G r a b a r e k Boston Biomedical Research Institute Watertown. MA
Składniki cytoszkieletu. Szkielet komórki
Składniki cytoszkieletu. Szkielet komórki aktynowe pośrednie aktynowe pośrednie 1 Elementy cytoszkieletu aktynowe pośrednie aktynowe filamenty aktynowe inaczej mikrofilamenty filamenty utworzone z aktyny
Komórka eukariotyczna organizacja
Komórka eukariotyczna organizacja Centrum informacyjne jądro Układ wykonawczy cytoplazma cytoplazma podstawowa (cytozol) organelle cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Komórka eukariotyczna organizacja
Komórka eukariotyczna organizacja
Komórka eukariotyczna organizacja Centrum informacyjne jądro Układ wykonawczy cytoplazma cytoplazma organelle podstawowa (cytozol) cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Komórka eukariotyczna organizacja
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Ruch i mięśnie. dr Magdalena Markowska
Ruch i mięśnie dr Magdalena Markowska Zjawisko ruchu Przykład współpracy wielu układów Szkielet Szkielet wewnętrzny: szkielet znajdujący się wewnątrz ciała, otoczony innymi tkankami. U kręgowców składa
Rola izoform tropomiozyny w różnicowaniu funkcji filamentów aktynowych
Rola izoform tropomiozyny w różnicowaniu funkcji filamentów aktynowych STRESZCZENIE Oddziaływania aktyny z miozyną oraz dynamiczna polimeryzacja i depolimeryzacja filamentów aktynowych stanowią podstawę
Tkanka mięśniowa. Bogdan Walkowiak. Zakład Biofizyki Instytut Inżynierii Materiałowej Politechnika Łódzka. 7 listopada 2014 Biofizyka 1
Wykład 5 Tkanka mięśniowa Bogdan Walkowiak Zakład Biofizyki Instytut Inżynierii Materiałowej Politechnika Łódzka 7 listopada 2014 Biofizyka 1 Trzy typy mięśni Mięśnie szkieletowe (Poprzecznie prążkowane)
Mięśnie. dr Magdalena Markowska
Mięśnie dr Magdalena Markowska Zjawisko ruchu 1) Jako możliwość przemieszczania przestrzennego mięśnie poprzecznie prążkowane 2) Pompa serce 3) Jako podstawa do utrzymywania czynności życiowych mięśnie
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Ruch i mięśnie. dr Magdalena Markowska
Ruch i mięśnie dr Magdalena Markowska Zjawisko ruchu Przykład współpracy wielu układów Szkielet Szkielet wewnętrzny: szkielet znajdujący się wewnątrz ciała, otoczony innymi tkankami. U kręgowców składa
Udział jonów wapnia w regulacji oddziaływań aktyny z miozyną
Udział jonów wapnia w regulacji oddziaływań aktyny z miozyną STRESZCZENIE Skurcz komórek mięśniowych oraz różnorodne formy ruchliwości komórek niemięśniowych są uzależnione od cyklicznych oddziaływań pomiędzy
CYTOSZKIELET. Mikrotubule. podjednostki strukturalne. 450 aminokwasów. 13 (11-16) 55kDa i 53kDa strukturalna polarność
CYTOSZKIELET Mikrotubule podjednostki strukturalne 13 (11-16) 55kDa i 53kDa strukturalna polarność 450 aminokwasów Mikrotubule wydłuŝanie / /skracanie Mikrotubule elongacja + - in vitro in vivo - dodawanie
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Podział tkanki mięśniowej w zależności od budowy i lokalizacji w organizmie
Tkanka mięśniowa Podział tkanki mięśniowej w zależności od budowy i lokalizacji w organizmie Tkanka mięśniowa poprzecznie prążkowana poprzecznie prążkowana serca gładka Tkanka mięśniowa Podstawową własnością
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE Ewa Waszkowska ekspert UPRP Źródła informacji w biotechnologii projekt SLING Warszawa, 9-10.12.2010 PLAN WYSTĄPIENIA Umocowania prawne Wynalazki biotechnologiczne Statystyka
SPEKTROSKOPIA MRJ BIAŁEK MIĘŚNIOWYCH
SPEKTROSKOPIA MRJ BIAŁEK MIĘŚNIOWYCH Genowefa Ślósarek Zakład Biofizyki Molekularnej, Instytut Fizyki Uniwersytet im. A Mickiewicza ul Umultowska 85, 61-614 Poznań Badania podstawowe nad mięśniami prowadzone
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
Tkanka nerwowa. neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające)
Tkanka nerwowa neurony (pobudliwe) odbieranie i przekazywanie sygnałów komórki glejowe (wspomagające) Sygnalizacja w komórkach nerwowych 100 tys. wejść informacyjnych przyjmowanie sygnału przewodzenie
Numer 4 (253) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Tom 50, 2001 Kosm os Numer 4 (253) Strony 359-374 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Re n a t a Dą b r o w s k a i R o b e r t m a k u c h Zakład. Biochemii Mięśni
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
MIĘŚNIE Czynności i fizjologia mięśni
Biomechanika sportu MIĘŚNIE Czynności i fizjologia mięśni CZYNNOŚCI MIĘŚNIA W opisie czynności mięśnia i siły przez niego wyzwolonej odwołujemy się do towarzyszącej temu zmianie jego długości. Zmiana długości
FILAMENTY CIENKIE I MIKROFILAMENTY FUNKCJONALNE KOMPLEKSY AKTYNY Z TROPOMIOZYNĄ*
Tom 67 2018 Numer 1 (318) Strony 31 41 Joanna Moraczewska Zakład Biochemii i Biologii Komórki Wydział Nauk Przyrodniczych Uniwersytet Kazimierza Wielkiego Poniatowskiego 12, 85-671 Bydgoszcz E-mail: joanna.moraczewska@ukw.edu.pl
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Układ ruchu Zadanie 1. (1 pkt) Schemat przedstawia fragment szkieletu człowieka.
Układ ruchu Zadanie 1. (1 pkt) Schemat przedstawia fragment szkieletu człowieka. Podaj nazwy odcinków kręgosłupa oznaczonych na schemacie literami A, B, C i D. Zadanie 2. (1 pkt) Na rysunku przedstawiono
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
MOLEKULARNE PODSTAWY KONTROLI SKURCZU MIĘŚNI PRZEZ JONY WAPNIA WSTĘP. (EBASHI i END O 1968). Tak małe zmiany stężenia
Kosm os PROBLEMY NAU KIbIOI^GICZNYCH Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 555-562 Polskie Tow arzystw o P rzyrod n ik ów im. K op ern ik a R e n a t a D ą b r o w s k a, A n t o n i W r z o s e k Zakład.
Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Kosm os Tom 50, 2001 Numer 3 (252) Strony 309-314 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika A n n a F il ip e k Zakład Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej Instytut
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Układ ruchu, skóra Zadanie 1. (1 pkt) Schemat przedstawia fragment szkieletu człowieka.
Układ ruchu, skóra Zadanie 1. (1 pkt) Schemat przedstawia fragment szkieletu człowieka. Podaj nazwy odcinków kręgosłupa oznaczonych na schemacie literami A, B, C i D. Zadanie 2. (1 pkt) Na rysunku przedstawiono
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Geny, a funkcjonowanie organizmu
Geny, a funkcjonowanie organizmu Wprowadzenie do genów letalnych Geny kodują Białka Kwasy rybonukleinowe 1 Geny Występują zwykle w 2 kopiach Kopia pochodząca od matki Kopia pochodząca od ojca Ekspresji
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
Bezpośrednia embriogeneza somatyczna
Bezpośrednia embriogeneza somatyczna Zarodki somatyczne formują się bezpośrednio tylko z tych komórek roślinnych, które są kompetentne już w momencie izolowania z rośliny macierzystej, czyli z proembriogenicznie
(MIKROSKOP ELEKTRONOWY, ORGANELLE KOMÓRKOWE).
ĆWICZENIE 2. Temat: ULTRASTRUKTURA KOMÓRKI (1). (MIKROSKOP ELEKTRONOWY, ORGANELLE KOMÓRKOWE). 1. Podstawy technik mikroskopowo-elektronowych (Schemat N/2/1) 2. Budowa i działanie mikroskopu elektronowego
TOM 8-NR 1981 ( )
PL ISSN 0324-833X POLSKIE TOWARZYSTWO ANATOMICZNE TOM 8-NR 1981 (227-386) PWN-WARSZAWA PO STĘPY BIOLOGII KOMÓRKI TOM 8, NR 4, 1981 Kwartalnik Polskiego Towarzystwa Anatomicznego wydawany z pomocą finansową
Tkanka mięśniowa. pobudliwość kurczliwość
Aparat kurczliwy: miofilamenty cienkie ( i białka pomocnicze) miofilamenty grube (miozyna 2) Tkanka mięśniowa troponina tropomiozyna troponina lub kaldesmon i kalponina łańcuchy lekkie miozyna 2 pobudliwość
Część II: Ruch w układach biologicznych. Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż.
Biofizyka II przedmiot obieralny Materiały pomocnicze do wykładów prof. dr hab. inż. Jan Mazerski C Z ĘŚĆ II: RUCH W U K Ł ADACH B IOLOGICZNYCH 1. CYTOSZKIELET Zastosowania mikroskopu świetlnego do badania
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Tkanka mięśniowa. pobudliwość kurczliwość
Tkanka mięśniowa troponina tropomiozyna Aparat kurczliwy: miofilamenty cienkie ( i białka pomocnicze) miofilamenty grube (miozyna 2) białka pomocnicze łańcuchy lekkie miozyna 2 miozyna 2 pobudliwość kurczliwość
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
DNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
Metody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
2014-03-26. Analiza sekwencji promotorów
2014-03-26 Analiza sekwencji promotorów 1 2014-03-26 TFy tworzą zawiły układ regulacyjny, na który składają się różne oddziaływania białko białko poprzez wytworzenie PĘTLI Specyficzne TFy Ogólne TFy Benfey,
Wprowadzenie do biologii molekularnej.
Wprowadzenie do biologii molekularnej. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Biologia molekularna zajmuje się badaniem biologicznych
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
Budowa i funkcje komórek nerwowych
Budowa i funkcje komórek nerwowych Fizjologia Komórki nerwowe neurony w organizmie człowieka około 30 mld w większości skupione w ośrodkowym układzie nerwowym podstawowa funkcja przekazywanie informacji
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
Ruch zwiększa recykling komórkowy Natura i wychowanie
Wiadomości naukowe o chorobie Huntingtona. Prostym językiem. Napisane przez naukowców. Dla globalnej społeczności HD. Ruch zwiększa recykling komórkowy Ćwiczenia potęgują recykling komórkowy u myszy. Czy
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
UKŁAD RUCHU (UKŁAD KOSTNY, UKŁAD MIĘŚNIOWY)
Zadanie 1. (2 pkt). Na rysunku przedstawiono szkielet kończyny dolnej (wraz z częścią kości miednicznej) i kość krzyżową człowieka. a) Uzupełnij opis rysunku ( ) o nazwy wskazanych kości. b) Wybierz z
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu
Budowa i zróżnicowanie neuronów - elektrofizjologia neuronu Neuron jest podstawową jednostką przetwarzania informacji w mózgu. Sygnał biegnie w nim w kierunku od dendrytów, poprzez akson, do synaps. Neuron
Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Analityki Medycznej Badanie oddziaływania polihistydynowych cyklopeptydów z jonami Cu 2+ i Zn 2+ w aspekcie projektowania mimetyków SOD Aleksandra Kotynia PRACA DOKTORSKA
Cytoplazma. podstawowa (cytozol) Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna)
Cytoplazma złoŝony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek Cytoplazma cytoplazma podstawowa (cytozol) organelle Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) ok. 55% objętości komórki złoŝony koloid
Podział komórkowy u bakterii
Mitoza Podział komórkowy u bakterii Najprostszy i najszybszy podział komórkowy występuje u bakterii, które nie mają jądra komórkowego, lecz jedynie pojedynczy chromosom tzw. chromosom bakteryjny. Podczas
Cykl komórkowy. Rozmnażanie komórek G 1, S, G 2. (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza)
Rozmnażanie komórek (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza) G 1, S, G 2 podział komórki (faza M) Obejmuje: podwojenie zawartości komórki (skopiowanie
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Transportowane cząsteczki CO O, 2, NO, H O, etanol, mocznik... Zgodnie z gradientem: stężenia elektrochemicznym gradient stężeń
Transportowane cząsteczki Transport przez błony Transport bierny szybkość transportu gradien t stężeń kanał nośnik Transport z udziałem nośnika: dyfuzja prosta dyfuzja prosta CO 2, O 2, NO,, H 2 O, etanol,
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Dominika Stelmach Gr. 10B2
Dominika Stelmach Gr. 10B2 Czym jest DNA? Wielkocząsteczkowy organiczny związek chemiczny z grupy kwasów nukleinowych Zawiera kwas deoksyrybonukleoinowy U organizmów eukariotycznych zlokalizowany w jądrze
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE. Podstawy Bioinformatyki wykład 4
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (2) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 4 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2017/2018 MAGDA MIELCZAREK 2 GENOMY I ICH ADNOTACJE
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Tom 50, 2001 Numer 4 (253) Strony 405-410 Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika A n d r z e j a. K a s p r z a k Zakład Biochemii Mięśni Instytut Biologii Doświadczalnej
Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.
W wyniku podziału komórki powstaje komórka potomna, która ma o połowę mniej DNA od komórki macierzystej i jest o połowę mniejsza. Aby komórka potomna była zdolna do kolejnego podziału musi osiągnąć rozmiary
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Tkanka mięśniowa. pobudliwość kurczliwość
Aparat kurczliwy: miofilamenty cienkie ( i białka pomocnicze) miofilamenty grube (miozyna 2) Tkanka mięśniowa troponina tropomiozyna troponina lub kaldesmon i kalponina łańcuchy lekkie miozyna 2 pobudliwość
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE
BIOLOGICZNE BAZY DANYCH (1) GENOMY I ICH ADNOTACJE Podstawy Bioinformatyki wykład 2 PODSTAWY BIOINFORMATYKI 2018/2019 MAGDA MIELCZAREK 1 GENOMY I ICH ADNOTACJE NCBI Ensembl UCSC PODSTAWY BIOINFORMATYKI
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Cytoplazma. Cytoplazma. cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma. cytoplazma organelle podstawowa (cytozol) Kompleksy białkowe (+RNA)
Cytoplazma cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Cytoplazma cytoplazma organelle podstawowa (cytozol) złoŝony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek Kompleksy białkowe (+RNA) Cytoplazma podstawowa
Kosm os. PROBLEMY NAUK *BIÓI^G 1EZNY e n. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony
Kosm os PROBLEMY NAUK *BIÓI^G 1EZNY e n Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 603-608 Polskie T ow arzystw o Przyrod n ik ów im. K op ern ik a J a c e k K u ź n ic k i, A n n a F il ip e k Zakład Neurobiologii
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Budowa i rola części czynnej układu ruchu
Budowa i rola części czynnej układu ruchu Układ ruchu Ze względu na budowę i właściwości układ ruchu można podzielić na: część czynną układ mięśniowy część bierną układ szkieletowy Dzięki współdziałaniu