Streszczenie. Edyta Makuch, Janusz Matuszyk. Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; 66: e-issn Słowa kluczowe:
|
|
- Magdalena Cybulska
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; 66: e-issn Review Received: Accepted: Published: Fosfodiesterazy rodziny 3 sprzęgają szlaki sygnałowe zależne od kinaz białkowych i cyklicznego GMP z metabolizmem cyklicznego AMP* Phosphodiesterase 3 mediates cross-talk between the protein kinase- and cgmp- dependent pathways and cyclic AMP metabolism Edyta Makuch, Janusz Matuszyk Laboratorium Białek Sygnałowych, Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN im. L. Hirszfelda we Wrocławiu Streszczenie PDE3 są fosfodiesterazami dwusubstratowymi, hydrolizującymi i cgmp. Jednocześnie ich aktywność katalityczna jest hamowana kompetycyjnie przez cgmp. Jest to związane z obecnością 44-aminokwasowego insertu w domenie katalitycznej, który warunkuje różny mechanizm wprowadzania cyklicznych nukleotydów do miejsca katalitycznego enzymu. Podczas gdy wiązanie cgmp do miejsca hydrolizy ma charakter bezpośredni, wprowadzane jest przez insert. cgmp związane z enzymem stanowi zawadę steryczną dla. Natomiast domena regulatorowa, za pośrednictwem hydrofobowych regionów NHR1 i NHR2, determinuje subkomórkowe umiejscowienie PDE3, a przez to udział w ściśle określonych kaskadach sygnałowych. Właściwości PDE3 warunkują szczególną rolę w łączeniu metabolizmu cyklicznego AMP z innymi kaskadami sygnałowymi. Opisano dwa odmienne mechanizmy działania PDE3 w szlakach sygnałowych komórki. W wielu kaskadach sygnałowych niezbędne jest utworzenie makromolekularnego kompleksu PDE3 z białkami sygnałowymi, w którym dochodzi do aktywacji PDE3 przez fosforylację. W szlakach indukowanych niektórymi hormonami lub czynnikami wzrostu PDE3 łączy metabolizm z kaskadami sygnałowymi zależnymi od kinaz białkowych. Z kolei w przypadku stymulacji peptydami natriuretycznymi PDE3 reguluje stężenie w odpowiedzi na zmieniające się stężenie cgmp. Słowa kluczowe: fosfodiesteraza PDE fosfodiesterazy rodziny 3 PDE3 PDE3A PDE3B budowa i regulacja aktywności PDE3 szlaki sygnałowe zależne od kinaz białkowych sprzęganie szlaków sygnałowych i cgmp szlaki sygnałowe peptydów natriuretycznych Summary PDE3 is a dual-substrate phosphodiesterase responsible for hydrolyzing both and cgmp whilst being simultaneously inhibited by cgmp. This feature is related to presence of the 44 amino acid insert in the catalytic domain, which determines the mechanism of introduction of the cyclic nucleotide into the catalytic pocket of the enzyme. Once bound in the catalytic site cgmp results in steric hindrance for to enter the site. The regulatory domain of PDE3 consists * Praca finansowana z grantu MNiSW numer N N Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; 66
2 Makuch E. i Matuszyk J. Fosfodiesterazy rodziny 3 sprzęgają szlaki sygnałowe of two hydrophobic regions: NHR1 and NHR2. Their presence defines the enzyme s intracellular localization, thus determining its participation in particular signaling cascades. Due to the properties of PDE3 this enzyme has exceptional importance for the cross-talk between - -dependent signaling and other cascades. There are two different mechanisms of action of PDE3 enzymes in cell signaling pathways. In many signaling cascades assembly of a signalosome is necessary for phosphorylation and activation of the PDE3 proteins. In response to certain hormones and growth factors, PDE3 merges the metabolism of with protein kinase-dependent signaling pathways. PDE3 also controls the level of with regard to the alternating concentration of cgmp. This effect occurs in signaling cascades activated by natriuretic peptide. Key words: phosphodiesterase PDE phosphodiesterase 3 family PDE3 PDE3A PDE3B structure and regulation of the activity of PDE3 protein kinase-dependent pathways and cgmp signaling cross-talk natriuretic peptide signaling Full-text PDF: Word count: 3094 Tables: 2 Figures: 3 References: 63 Adres autora: Wykaz skrótów: dr hab. Janusz Matuszyk, prof. PAN, Instytut Immunologii i Terapii Doświadczalnej PAN im. L. Hirszfelda, ul. Weigla 12, Wrocław; matuszyk@iitd.pan.wroc.pl cykliczny 3,5 -adenozynomonofosforan; cgmp cykliczny 3,5 -guanozynomonofosforan; CREB czynnik transkrypcyjny wiążący element odpowiedzi na ; EGF naskórkowy czynnik wzrostu; EPAC wymieniacze cgmp zależne od ; ERK1/2 kinazy białkowe aktywowane przez sygnały zewnątrzkomórkowe; ICER wczesny represor indukowany ; K M stała Michaelisa- Mentena; NGF nerwowy czynnik wzrostu; NHR1, NHR2 regiony hydrofobowe znajdujące się w domenie regulatorowej PDE3; NPR-A, NPR-B receptory peptydów natriuretycznych sprzężone z cyklazą guanylanową; PC12 linia komórkowa wyprowadzona z guza chromochłonnego rdzenia nadnerczy szczura; PDE fosfodiesterazy; PDE3 fosfodiesterazy rodziny 3; PI3K kinaza-3- fosfatydyloinozytolu; kinaza białkowa A; PKB kinaza białkowa B; PKC kinaza białkowa C; PKG kinaza białkowa G; Raf-1 kinazy serynowo-treoninowe rodziny Raf; V max maksymalna szybkość reakcji. Wstęp Cykliczny 3,5 -adenozynomonofosforan () oraz cykliczny 3,5 -guanozynomonofosforan (cgmp) pełnią ważne funkcje w procesach biologicznych. Jako tzw. drugorzędowe przekaźniki uczestniczą w transdukcji sygnału wewnątrz komórki. Za regulację ich poziomu odpowiedzialne są fosfodiesterazy cyklicznych nukleotydów (PDE), które katalizują reakcję hydrolizy wiązania 3 -fosfodiestrowego w cyklicznych nukleotydach, w wyniku czego powstaje nukleozydo-5 -fosforan [31]. Enzymy te są szeroko rozpowszechnione w różnych tkankach ssaczych. Wiąże się to z ich funkcją, gdyż przez modulację wewnątrzkomórkowych stężeń i cgmp wpływają na regulację różnych kaskad sygnałowych [59]. Niezwykle znaczącymi, ze względu na dwusubstratowość oraz mechanizm regulacji aktywności katalitycznej, są fosfodiesterazy i cgmp regulowane przez cgmp, które pełnią główną rolę w sprzęganiu (cross-talk) szlaków sygnałowych cyklicznych nukleotydów. Do tej grupy należą m.in. PDE3, które są kompetycyjnie hamowane przez cgmp, co skutkuje zahamowaniem hydrolizy. Cechę tę oraz inne własności PDE3, związane z uczestnictwem w ściśle określonych kaskadach sygnałowych, warunkuje swoista budowa domen białkowych. W przeciwieństwie do fosfodiesteraz rodziny 2, również należących do tej grupy, PDE3 w większości przypadków funkcjonują jako fosfodiesterazy, które po aktywacji przez swoistą kinazę białkową są odpowiedzialne za hydrolizę bez udziału cgmp. Tak dzieje się na przykład w odpowiedzi na niektóre hormony. Zdecydowanie rzadziej obserwuje się funkcjonowanie PDE3 jako łącznika między szlakami cyklicznych nukleotydów, jak to się zdarza w kaskadach sygnałowych aktywowanych przez peptydy natriuretyczne. Stąd PDE3 może pełnić dwie odmienne funkcje w komórce, takie jak sprzęganie szlaków sygnałowych cyklicznych nukleotydów, bądź łączenie kaskad sygnałowych kinaz białkowych z metabolizmem. Warunkuje to uczestnictwo PDE3 w transdukcji sygnału w różnorodnych procesach komórkowych. Warianty PDE3 i stopień podobieństwa izoform między gatunkami Fosfodiesterazy rodziny 3 pierwotnie nazywane były fosfodiesterazami hamowanymi przez cgmp. Po raz pierwszy wyizolowane zostały z ludzkich płytek krwi [18]. Badania 493
3 Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; tom 66: a) PDE3A NHR1 NHR2 b) PDE3B PKB NHR1 NHR2 PKB PKB PKC insert domena katalityczna insert domena katalityczna mrna PDE3A1 (136 kda) PDE3B (135 kda) PKB PKC NHR2 domena katalityczna DNA mrna PDE3A3 (94 kda) insert PDE3A2 (118 kda) DNA Ryc. 1. Struktura genów kodujących ludzką PDE3 oraz budowa izoform białkowych z zaznaczeniem wariantów wynikających z alternatywnego składania mrna (na podstawie [38, 39], zmodyfikowano) wykazały, iż są to fosfodiesterazy dwusubstratowe o dużym powinowactwie względem obu cyklicznych nukleotydów. Zidentyfikowano dwa geny kodujące fosfodiesterazy rodziny 3: PDE3A i PDB3B [56]. Z transkryptu genu ludzkiej PDE3A, w wyniku alternatywnego składania mrna powstają dwa mrna i trzy izoformy białkowe, PDE3A1/2/3. PDE3A1 powstaje z pełnej długości mrna, stąd jest najdłuższą z izoform. PDE3A2 powstaje dzięki obecności w sekwencji kodującej alternatywnego miejsca startu transkrypcji. Natomiast izoforma PDE3A3 powstaje z mrna PDE3A2 przez rozpoczęcie translacji poniżej pierwszego kodonu startu AUG (ryc. 1) [56]. W sekwencji genu PDE3B nie znaleziono alternatywnych miejsc startu transkrypcji ani translacji, stąd uważa się, że różnice w długości sekwencji aminokwasowej białka PDE3B są raczej wynikiem częściowej proteolizy zachodzącej podczas izolacji tej izoformy (ryc. 1). Dlatego też przyjęto, iż gen PDE3B koduje tylko jedną izoformę białkową. Najnowsze badania donoszą o istnieniu polimorfizmów w obrębie genów kodujących obie izoformy PDE3. Polimorfizm PDE3B wynika z pojedynczej lub podwójnej substytucji w eksonie 4 lub w obrębie intronów 5 i 12 [37,51]. Natomiast w przypadku genu PDE3A obserwuje się insercję zasady w pozycji w promotorze genu PDE3A, co prawdopodobnie tłumaczy lekooporność niektórych pacjentów wobec leków zawierających inhibitory PDE3 [4]. Sekwencje nukleotydowe i aminokwasowe tych samych izoform PDE3 u różnych gatunków ssaków charakteryzują się wysokim stopniem podobieństwa. Dla szczura, myszy i człowieka obserwuje się zgodność powyżej 80% (tabela 1, wartości zaznaczone na zielono), przy czym sekwencje szczurze i mysie wykazują podobieństwo na poziomie prawie 95%, co tłumaczyć można pokrewieństwem filogenetycznym tych gatunków (tabela 1, wartości zaznaczone na żółto). Nie obserwuje się natomiast tej zależności między izoformami PDE3A i PDE3B w obrębie jednego gatunku. Stopień podobieństwa sekwencji wynosi prawie 60% (tabela 1). Mimo tych różnic, dane doświadczalne wykazują, że PDE3A i PDE3B cechują się bardzo podobnymi właściwościami kinetycznymi, choć na podstawie wartości V max uznaje się, że PDE3A wolniej hydrolizuje cgmp niż PDE3B (tabela 2). Wzór ekspresji tkankowej poszczególnych izoform PDE3 Wysoka ekspresja PDE3A charakterystyczna jest dla tkanek układu krwionośnego, np. płytek krwi oraz miocytów 494 sercowych [29,54]. Obserwuje się prawie 15-krotnie wyższy poziom ekspresji tej fosfodiesterazy w sercu w porównaniu do innych tkanek oraz około 10-krotnie wyższy poziom w porównaniu z innymi fosfodiesterazami. Pokazuje to niezwykłą swoistość umiejscowienia w tkance organizmu, a co za tym idzie selektywną funkcję PDE3A. Ponadto obecność tej fosfodiesterazy stwierdzono w tkankach trzustki, pęcherza moczowego, żołądka oraz w oocytach [19,29]. Natomiast izoforma PDE3B występuje w płucach, hepatocytach, spermatocytach, limfocytach T i makrofagach [29,58]. Wysoką ekspresję PDE3B obserwuje się w ludzkich i szczurzych tkankach tłuszczowych oraz w wątrobie [29]. W dużych ilościach transkrypt PDE3B obecny jest także w zarodkowym nabłonku czuciowym [48]. W rozwiniętym ośrodkowym układzie nerwowym względnie wysokim poziomem ekspresji obu genów PDE3 cechuje się móżdżek oraz ciało prążkowane, w innych częściach mózgu ekspresja utrzymuje się na niskim poziomie [29,60]. Ta mnogość występowania PDE3 w różnych tkankach możliwa jest dzięki istnieniu licznych izoform, które mimo znacznych różnic w sekwencji mają podobne właściwości. Unikalna budowa domeny katalitycznej PDE3 Selektywność działania PDE3 jest ściśle związana ze swoistą budową domeny katalitycznej. Cechą charakterystyczną PDE3 jest 44-aminokwasowy insert znajdujący się w tej domenie, niespotykany w fosfodiesterazach należących do innych rodzin. Umiejscowiony jest między helisami 6 i 7, lecz nie przyjmuje żadnej uporządkowanej struktury drugorzędowej (ryc. 2) [25]. Podobieństwo sekwencji aminokwasowej insertów w PDE3A i PDE3B wynosi tylko 38,6%, mimo to na obu końcach i w środku insertów znajdują się silnie konserwowane trójaminokwasowe sekwencje. Substytucje aminokwasów w ich obrębie prowadzą do znaczącego obniżenia aktywności PDE3, natomiast usunięcie insertu całkowicie znosi aktywność katalityczną, co wskazuje na ważną rolę insertu w aktywacji enzymu [55]. Późniejsze badania zespołu Hunga z 2006 r. dowodzą, iż insert odpowiedzialny jest za wiązanie w domenie katalitycznej PDE3, gdzie odbywa się hydroliza wiązania fosfodiestrowego w cyklicznym nukleotydzie. Przypuszcza się, że oddziaływanie z resztami aminokwasowymi insertu skutkuje przyjęciem przez insert konformacji ułatwiającej wprowadzenie do miejsca aktywnego
4 Makuch E. i Matuszyk J. Fosfodiesterazy rodziny 3 sprzęgają szlaki sygnałowe Tabela 1. Porównanie sekwencji nukleotydowej i aminokwasowej izoform PDE3 u myszy, szczura i człowieka. Porównanie sekwencji wykonano w programie ClustalW, natomiast stopień podobieństwa obliczono wykorzystując jedną z funkcji programu JalView Izoforma (gatunek) długość sekwencji [pz] Sekwencje nukleotydowe stopień podobieństwa [%] długość sekwencji [aa] PDE3A1 (człowiek) ,10% PDE3B (człowiek) PDE3A2 (człowiek) ,59% PDE3B (człowiek) PDE3A (mysz) ,65% PDE3B (mysz) PDE3A (szczur) ,23% PDE3B (szczur) PDE3A (mysz) ,54% PDE3A (szczur) 3426 PDE3A2 (człowiek) ,69% PDE3A (szczur) 3426 PDE3A2 (człowiek) ,62% PDE3A (mysz) 3167 PDE3A1 (człowiek) ,96% PDE3A (szczur) 3426 PDE3A1 (człowiek) ,66% PDE3A (mysz) 3167 PDE3B (szczur) ,94% PDE3B (mysz) PDE3B (człowiek) ,77% PDE3B (szczur) PDE3B (mysz) ,49% PDE3B (człowiek) Tabela 2. Wartości kinetyczne dla poszczególnych izoform PDE3 Sekwencje aminokwasowe stopień podobieństwa [%] 43,14% 48,58% 42,86% 42,99% 96,14% 85,7% 84,85% 84,29% 83,68% 94,17% 79,20% 80,50% Izoforma PDE3 * [18]; ** [10]. K m [μm] w fosfodiesterazie [25]. PDE3 są fosfodiesterazami dwusubstratowymi o wysokim powinowactwie względem obu cyklicznych nukleotydów, jednak mechanizm ułatwiający wprowadzenie do miejsca aktywnego sprawia, że V max dla jest 4 18 razy wyższe niż dla cgmp V max [μmol/min/mg] cgmp cgmp Gatunek PDE3A* 0,02 0,15 0,18 0,34 3,0 6,0 człowiek PDE3B** 0,28 0,38 2,0 8,5 szczur (tabela 2). W związku z tym uważa się, iż cgmp jest inhibitorem kompetycyjnym hydrolizy [3]. Stałą inhibicji (K i ) wyznaczono w warunkach in vitro i wynosi ona 0,06 µm [21], potwierdzono także, że inhibicja ta zachodzi w układzie in vivo [35]. 495
5 Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; tom 66: pozostałe izoformy PDE3A spotyka się zarówno w postaci związanej z błonami, jak i w postaci rozpuszczalnej w cytosolu, co związane jest z częściowym lub całkowitym brakiem regionów NHR1 i NHR2 [56]. Domena regulatorowa determinując subkomórkowe umiejscowienie PDE3 zawęża jej funkcjonowanie do konkretnego przedziału komórkowego. Warunkuje to działalność PDE3 na skalę lokalną, w ściśle określonym miejscu w komórce, a przez to uczestnictwo w konkretnych kaskadach sygnałowych. Na przykład zarówno PDE3B, jak i receptor insuliny związane są z błoną komórkową w obrębie kaweoli, niewielkich wklęśnięć błony komórkowej, nie dziwi więc uczestnictwo PDE3B w szlakach sygnałowych insuliny [40]. Fosforylacje PDE3 w domenach regulatorowych wzmagają aktywność katalityczną enzymu Ryc. 2. Molekularny model ludzkiej PDE3A z zaznaczonym insertem. Analog, Sp-S-BDB wskazuje na umiejscowienie kieszeni wiążącej (na podstawie [25], zmodyfikowano) W przeciwieństwie do mechanizm wiązania cgmp do miejsca aktywnego enzymu nie jest wyjaśniony. Nie stwierdzono oddziaływania cgmp z insertem, co w połączeniu z wysokim powinowactwem tego nukleotydu do miejsca aktywnego PDE3 [24] i niewielkim tempem jego hydrolizy sugerować może mechanizm inhibicji kompetycyjnej, w którym związanie cgmp uniemożliwia wprowadzenie do miejsca katalitycznego związanego z insertem. Opisany mechanizm inhibicji kompetycyjnej wskazuje na ważną funkcję PDE3 w sprzęganiu szlaków sygnałowych cyklicznych nukleotydów. Regulacja aktywności fosfodiesteraz rodziny 3 Domena regulatorowa determinuje umiejscowienie PDE3 w komórce Domena regulatorowa znajdująca sie na N-końcu PDE3 zapewnia, podobnie jak i domena katalityczna, swoiste własności PDE3 m.in. determinując wewnątrzkomórkowe umiejscowienie białka, za co odpowiedzialne są dwa regiony hydrofobowe. Większy region, NHR1, znajdujący się bliżej końca N białka tworzy sześć hydrofobowych helis pozwalających na zakotwiczenie PDE3 w błonach. Natomiast mniejszy region, NHR2, odpowiedzialny jest za kierowanie enzymu w odpowiednią lokalizację komórkową [52] oraz uczestniczy w oddziaływaniach z białkami błonowymi [56]. Badania wykazują, że usunięcie regionu NHR1 skutkuje pojawieniem się PDE3 we frakcji cytosolowej, natomiast brak obu hydrofobowych regionów powoduje całkowitą rozpuszczalność izoform [27]. Izoformy PDE3, ze względu na alternatywne składanie mrna, charakteryzują się różnymi długościami domeny N-końcowej (ryc. 1), co warunkuje zróżnicowaną lokalizację subkomórkową [56]. Izoformy PDE3A1 i PDE3B, mające oba regiony NHR, występują w komórce głównie w postaci nierozpuszczalnej. Związane są nie tylko z błoną komórkową, ale również z siateczką śródplazmatyczną [52], aparatem Golgiego, endosomami [16] oraz z błoną jądrową [32]. Natomiast dwie 496 PDE3 mimo unikalnego mechanizmu wprowadzania do miejsca katalitycznego wykazują małą aktywność katalityczną w porównaniu z fosfodiesterazami m.in. rodziny 1 i 2. Stąd też aktywność PDE3 wzmagana jest w wyniku modyfikacji białka przez swoiste kinazy. Jednocześnie taki mechanizm aktywacji determinuje udział PDE3 w kaskadach sygnałowych, gdzie niezbędne jest połączenie sygnału przekazywanego przez kinazy białkowe z metabolizmem. Aktywacja PDE3 przez swoiste kinazy białkowe wiąże się z fosforylacją określonych reszt seryny znajdujących się w domenie regulatorowej PDE3 między domenami hydrofobowymi [41]. In vivo PDE3 fosforylowana jest głównie w odpowiedzi na insulinę, glukagon, trombinę oraz hormony wzrostu [16,42], jednak nie każda fosforylacja w odpowiedzi na te czynniki prowadzi do aktywacji fosfodiesterazy [30]. W zależności od izoformy PDE3 i gatunku organizmu, z którego pochodzi, fosforylacji ulegają różne reszty seryny [28,47]. Ponadto, zależnie od pozycji reszty seryny, reakcję fosforylacji katalizuje kinaza białkowa A (), kinaza białkowa B (PKB) [19,42] lub kinaza białkowa C (PKC) [26]. Niedawne doniesienie opublikowane przez zespół Rybalkina sugeruje także zaangażowanie kinazy białkowej G (PKG) w fosforylację PDE3A [50]. Aktywacja PDE3 w wyniku fosforylacji, ze względu na działalność fosfataz, przynosi jedynie krótkotrwały efekt. Może on zostać przedłużony przez wiązanie się białka do niektórych fosforylowanych reszt seryny. Pełni ono funkcję ochronną, zapobiegając szybkiej defosforylacji PDE3, przez co przedłuża aktywność enzymu. Związanie białka do obu izoform PDE3 zależne jest, podobnie jak i sama fosforylacja PDE3, od wielu czynników, m.in. fosforylowania odpowiedniej reszty seryny, typu kinazy katalizującej reakcję fosforylacji oraz czynnika zewnętrznego wywołującego fosforylację PDE3 [26,42,45]. Na przykład w odpowiedzi na trombinę i prostaglandynę E1 dochodzi do fosforylacji tych samych reszt serynowych, jednakże tylko w odpowiedzi na trombinę obserwuje się wiązania białka do PDE3A [26]. Transdukcja sygnału zależy od utworzenia makromolekularnego kompleksu PDE3 z białkami sygnałowymi Fosforylacja określonych reszt serynowych znajdujących się w domenie regulatorowej PDE3 wpływa nie tylko na
6 Makuch E. i Matuszyk J. Fosfodiesterazy rodziny 3 sprzęgają szlaki sygnałowe a) mechanizm negatywnego sprzężenia zwrotnego PDE3 AKAP PDE3 P AKAP PDE3 AMP AKAP P AMP b) mechanizm pozytywnego sprzężenia zwrotnego CREB PDE3 ICER apoptoza Ryc. 3. Regulacja aktywności PDE3 przez sprzężenia zwrotne: (a) negatywne (na podstawie [17], zmodyfikowano) oraz (b) pozytywne (na podstawie [13], zmodyfikowano); szczegółowy opis w tekście aktywację enzymu, ale także sprzyja tworzeniu oddziaływań z innymi białkami. Obserwuje się asocjację fosforylowanej PDE3 z aktywowanymi receptorami insuliny [49] oraz leptyny [14]. Natomiast izoformy PDE3 zakotwiczone w błonie komórkowej, w raftach lipidowych mogą asocjować z kaweoliną 1 [40]. Oddziaływania te spełniają ważną rolę zarówno w aktywacji PDE3, jak i w transdukcji odpowiedniego sygnału, zwłaszcza w przypadku sprzęgania przez PDE3 szlaków sygnałowych z udziałem kinaz białkowych i. W wielu przypadkach aktywacja swoistej kinazy białkowej nie jest wystarczająca do aktywacji PDE3, wymagane jest natomiast utworzenie makromolekularnego kompleksu z udziałem PDE3. Na przykład w adipocytach aktywacja PDE3B w odpowiedzi na insulinę wymaga utworzenia makromolekuły, w skład której wchodzą m.in. receptor insuliny oraz PKB. Kinaza białkowa B jest niezbędnym elementem kompleksu, gdyż prawdopodobnie rekrutuje PDE3B do makromolekuły, a następnie ją fosforyluje [1]. Podobną zależność obserwuje się w kardiomiocytach mysich, gdzie w skład makromolekuły wchodzi m.in. PI3K odpowiedzialna za aktywację kinazy fosforylującej PDE3B oraz za rekrutację PDE3B do kompleksu makromolekularnego [43]. Podkreślić należy, że makrokompleksy, w skład których wchodzi PDE3, są ważnym elementem wielu kaskad sygnałowych. W komórkach śródbłonka kompleks tworzony przez PDE3B, EPAC1 oraz PI3K uczestniczy w szlakach sygnałowych prowadzących do angiogenezy. Udowodniono, że PDE3B zabezpiecza przed niepożądaną aktywacją EPAC1 przez chwilowe fluktuacje w podstawowej puli. Dzięki temu tylko silny wzrost stężenia, przewyższający wydajność PDE3B, doprowadza do aktywacji EPAC1, co z kolei wpływa na aktywację PI3K i prowadzi do aktywacji dalszej kaskady sygnałowej [57]. Złożone mechanizmy regulacji aktywności PDE3 O ile aktywacja PDE3 jest głównie związana z jej fosforylacją w odpowiedzi na różne czynniki zewnątrzkomórkowe, o tyle regulacja aktywności PDE3 jest procesem o wiele bardziej skomplikowanym, w którym istotną rolę odgrywa cgmp jako inhibitor kompetycyjny hydrolizy, ale także mechanizmy zwane sprzężeniami zwrotnymi. Na przykładzie komórek PC12 zasugerowano, że aktywność PDE3 może być regulowana przez negatywne sprzężenie zwrotne. W komórkach tych PDE3 wchodzi w skład złożonej makromolekuły. Wzrost stężenia wpływa na aktywację (także należącej do kompleksu), która fosforyluje i aktywuje PDE3, co objawia się wzmożoną hydrolizą. Lokalne obniżenie stężenia powoduje osłabienie, a w końcu całkowite zatrzymanie aktywacji. W konsekwencji dochodzi do defosforylacji PDE3 i zahamowania aktywności enzymu. Podsumowując, jeśli wysoki poziom nie jest stale utrzymywany, dochodzi do szybkiej dezaktywacji PDE3 (ryc. 3a) [17]. Opisany został również proces nieprawidłowego zmniejszania aktywności PDE3 oparty na mechanizmie pozytywnego sprzężenia zwrotnego. U ludzi z niewydolnością serca obserwuje się obniżoną ekspresję PDE3B oraz zmniejszenie ilości funkcjonalnego białka, a jednocześnie podniesienie ekspresji wczesnego represora indukowanego (ICER inducible early repressor) [12]. Za aktywację genu kodującego ICER odpowiedzialny jest czynnik transkrypcyjny CREB, jednocześnie represor ICER powoduje wyciszenie ekspresji genów aktywowanych przez CREB. Badania wykazały, że ICER hamuje również ekspresję genu PDE3B prowadząc do wzmożonej aktywacji szlaku /, który bezpośrednio ( stabilizuje strukturę białka ICER) lub pośrednio przez fosforylację i aktywację CREB wpływa na zwiększenie ekspresji ICER (ryc. 3b). W ten sposób następuje zapętlenie, niski poziom PDE3B wpływa na podwyższenie ekspresji ICER, który z kolei hamuje ekspresję PDE3B [13]. W rezultacie długotrwały, wysoki poziom represora ICER powoduje wyciszenie ekspresji genów antyapoptotycznych i prowadzi do apoptozy kardiomiocytów. Rola fosfodiesteraz typu 3 w transdukcji sygnału wewnątrz komórki Rola PDE3 jako fosfodiesterazy hydrolizującej Komercyjna dostępność i mnogość selektywnych inhibitorów PDE3 sprzyja ich powszechnemu wykorzystaniu 497
7 Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; tom 66: w badaniach. Pozwoliło to na poznanie roli PDE3 w wielu procesach fizjologicznych, w których fosfodiesteraza, aktywowana przez swoistą kinazę białkową, odpowiedzialna jest głównie za hydrolizę w nieobecności cgmp. PDE3 pełni taką funkcję w agregacji płytek krwi [15], powstawaniu stanów zapalnych wywołanych endotoksyną [8] lub niedotlenieniem mięśnia sercowego [11] oraz prawdopodobnie w procesach związanych z uczeniem się i zapamiętywaniem [62]. Izoforma PDE3A jest niezwykle istotna w prawidłowym rozwoju, dojrzewaniu i owulacji oocytów. Nokaut genu PDE3A skutkuje wzmocnieniem sygnału przekazywanego przez szlak / i zahamowaniem Cdc25B, fosfatazy aktywującej Cdc2, białka wymaganego do przejścia cyklu komórkowego z fazy G2 do fazy M. Prowadzi to do całkowitej bezpłodności myszy płci żeńskiej [2,34]. Podobna sytuacja zdarza się w komórkach mięśni gładkich naczyń, gdzie brak funkcjonalnego białka PDE3A rozregulowuje szlak / oraz szlak kinaz białkowych ERK1/2, powodując zatrzymanie cyklu komórkowego w fazie G0/G1 [2]. Ponadto PDE3 uczestniczy w regulacji kurczliwości mięśnia sercowego, w którym aktywowana jest w odpowiedzi na związanie agonisty do receptora b-adrenergicznego zależnie od PI3Kg [33] oraz w regulacji kurczliwości naczyniowych mięśni gładkich, gdzie ekspresja tej fosfodiesterazy jest zmienna i zależna od stadium rozwoju komórki [36]. Również w kaskadach sygnałowych aktywowanych przez insulinę PDE3 pełni ważną rolę. Zaangażowana jest mianowicie w regulację transportu glukozy z krwi do komórek, co związane jest z efektem antylipolitycznym insuliny [63]. Jednak fosfodiesteraza ta, modulując stężenie, odpowiedzialna jest za kontrolę uwalniania insuliny. Badania wykazują, że już niewielka nadekspresja izoformy PDE3B w komórkach b znacznie osłabia sekrecję insuliny w odpowiedzi na wzrost stężenia glukozy we krwi oraz prowadzi do zaburzeń w szkielecie komórkowym wysepek Langerhansa, co objawia się nietolerancją glukozy i skutkować może rozwojem cukrzycy typu 2 [9,20]. Badania na komórkach PC12 potwierdzają także zaangażowanie PDE3 w regulację odpowiedzi na nerwowy czynnik wzrostu (NGF) i naskórkowy czynnik wzrostu (EGF). Wzrost stężenia w wyniku zahamowania aktywności tej fosfodiesterazy skutkuje aktywacją i zwiększeniem fosforylacji kinaz białkowych ERK1/2, w konsekwencji prowadząc do różnicowania komórek PC12 [17,22]. Natomiast w komórkach mezangium (tkanki łącznej umiejscowionej między naczyniami w ciałkach nerkowych) zahamowanie aktywności PDE3 i w konsekwencji wzrost stężenia prowadzi do zależnej od fosforylacji swoistych reszt serynowych w kinazie białkowej Raf- 1 uniemożliwiając aktywację tego białka, co prowadzi do zahamowania aktywacji szlaku kinaz białkowych ERK1/2 i objawia się zatrzymaniem proliferacji tych komórek [7]. Rola PDE3 w łączeniu szlaków sygnałowych cyklicznych nukleotydów w odpowiedzi na peptydy natriuretycznye Dwusubstratowość PDE3, a zarazem hamowanie ich aktywności przez cgmp, umożliwia połączenie szlaków 498 sygnałowych cyklicznych nukleotydów. Jest to druga, oprócz sprzęgania sygnału przekazywanego przez kinazy białkowe ze szlakami zależnymi od, funkcja PDE3 w transdukcji sygnału. Łączenie kaskad sygnałowych cyklicznych nukleotydów przez PDE3 jest dobrze scharakteryzowane w szlakach sygnałowych peptydów natriuretycznych. Zarówno receptory peptydów natriuretycznych [6], jak i izoforma PDE3B zakotwiczone są w błonie komórkowej w obrębie raft lipidowych zwanych kaweolami [40]. Ponieważ struktury te wprowadzają przedziałowość wewnątrz komórki, PDE3 uczestniczyć może także w odpowiedzi na inne czynniki zewnątrzkomórkowe, których receptory znajdują się w obrębie kaweoli [40]. Rola PDE3 w szlakach sygnałowych peptydów natriuretycznych związana jest z kontrolą poziomu w odpowiedzi na zmieniające się stężenie cgmp. Peptydy natriuretyczne aktywując receptory sprzężone z cyklazami guanylanowymi, NPR-A i NPR-B, wpływają na wzrost wewnątrzkomórkowego stężenia cgmp. Powoduje to kompetycyjne hamowanie aktywności PDE3 [53] i w następstwie wzrost stężenia oraz aktywację [46]. W miocytach sercowych kaskada ta prowadzi do fosforylacji przez kanałów wapniowych typu L [61], co skutkuje zwiększonym napływem jonów wapnia do wnętrza komórki [53]. Fizjologicznym efektem tej kaskady sygnałowej jest zwiększenie częstości skurczu mięśnia sercowego w sposób bezpośredni [53] lub pośredni przez wzmocnienie sygnału pochodzącego z aktywowanych receptorów b-adrenergicznych [46]. Jednakże do niedawna powszechnie uważano, iż hamowanie aktywności PDE3 przez peptydy natriuretyczne skutkuje zmniejszeniem częstości skurczu mięśnia sercowego, a więc efektem odwrotnym. Przekonanie to potwierdzają badania wykonane na komórkach prawego nerwu błędnego, w którym peptydy natriuretyczne wpływają na podwyższenie stężenia cgmp i zahamowanie aktywności PDE3. To skutkuje aktywacją szlaku / i fosforylacją kanałów wapniowych typu L i N powodując napływ jonów wapniowych z przestrzeni synaptycznej do komórki. W konsekwencji prowadzi to do uwolnienia acetylocholiny do przestrzeni synaptycznej i objawia się zwolnieniem częstości akcji serca oraz zmniejszeniem siły skurczu mięśnia sercowego [23]. Jak można zaobserwować, w następstwie aktywacji receptorów natriuretycznych i kaskady sygnałowej: wzrost stężenia cgmp-> hamowanie aktywności PDE3-> wzrost stężenia, w różnych typach komórek obserwuje się odmienny efekt biologiczny. Najnowsze badania wykazują, że zahamowanie aktywności PDE3 w odpowiedzi na peptydy natriuretyczne pobudza uwalnianie katecholamin zarówno z zakończeń nerwów współczulnych, jak i z komórek PC12 różnicowanych NGF. Sugeruje się także, że PDE3 nie jest bezpośrednio hamowana przez cgmp, lecz przez kinazę białkową G, aktywowaną podwyższonym stężeniem tego cyklicznego nukleotydu. Obniżenie aktywności PDE3 skutkuje, tak jak opisano wyżej, aktywacją szlaku / i w konsekwencji wzrostem wewnątrzkomórkowego stężenia jonów wapnia, co przekłada się na uwalnianie katecholamin z komórki [5]. W warunkach fizjologicznych zahamowanie uwalniania katecholamin w odpowiedzi na peptyd natriuretyczny, poprzez oddziaływanie na aktywność PDE3,
8 Makuch E. i Matuszyk J. Fosfodiesterazy rodziny 3 sprzęgają szlaki sygnałowe stwarzałoby nowe możliwości w terapii pacjentów z guzem chromochłonnym rdzenia nadnerczy [44]. Podsumowanie Fosfodiesterazy rodziny 3 są fosfodiesterazami dwusubstratowymi hydrolizującymi oba cykliczne nukleotydy, mimo to badania wykazują, że ich główną funkcją w komórce jest hydroliza. Swoiste właściwości PDE3 wynikające z budowy i złożonych sposobów regulacji decydują o szczególnej roli w łączeniu szlaków cyklicznego AMP z innymi kaskadami sygnałowymi. Opisano dwa odmienne mechanizmy działania PDE3. Niespotykany w innych fosfodiesterazach sposób wprowadzania do miejsca katalitycznego enzymu oraz wyjątkowa regulacja aktywności PDE3 przez cgmp, który kompetycyjnie hamuje hydrolizę, powoduje że PDE3 odpowiedzialne są za sprzęganie szlaków sygnałowych tych cyklicznych nukleotydów. Natomiast fosforylacja określonych reszt serynowych, powodująca wzrost aktywności katalitycznej PDE3, pozwala na zaangażowanie tej fosfodiesterazy w łączenie kaskad sygnałowych kinaz białkowych z metabolizmem. Te dwie odmienne funkcje PDE3 determinują jej udział w różnorodnych procesach komórkowych m.in. w odpowiedzi na peptydy natriuretyczne oraz niektóre hormony i czynniki wzrostu. Piśmiennictwo [1] Ahmad F., Lindh R., Tang Y., Weston M., Degerman E., Manganiello V.C.: Insulin-induced formation of macromolecular complexes involved in activation of cyclic nucleotide phosphodiesterase 3B (PDE3B) and its interaction with PKB. Biochem. J., 2007; 404: [2] Begum N., Shen W., Manganiello V.: Role of PDE3A in regulation of cell cycle progression in mouse vascular smooth muscle cells and oocytes: implications in cardiovascular diseases and infertility. Curr. Opin. Pharmacol., 2011; 11: [3] Bender A.T., Beavo J.A.: Cyclic nucleotide phosphodiesterases: molecular regulation to clinical use. Pharmacol. Rev., 2006; 58: [4] Bristow M.R., Taylor M.R., Slavov D., Blain-Nelson P.L., Nunley K.R., Medway A.M., Sucharov C.C.: A polymorphism in the Pde3a gene promoter that prevents -induced increases in transcriptional activity, and may protect against Pde3a inhibitor drug tolerance. J. Am. Coll. Cardiol., 2010; 55: A10 A13 [5] Chan N.Y., Seyedi N., Takano K., Levi R.: An unsuspected property of natriuretic peptides: promotion of calcium-dependent catecholamine release via protein kinase G-mediated phosphodiesterase type 3 inhibition. Circulation, 2012; 125: [6] Chen W., Gaßner B., Börner S., Kuhn M.: Atrial natriuretic peptide increases the albumin permeability of mouse skeletal muscle microcirculation by the caveolae-mediated transcellular pathway. BMC Pharmacology, 2011; 11(Suppl.1): P16 [7] Cheng J., Thompson M.A., Walker H.J., Gray C.E., Diaz Encarnacion M.M., Warner G.M., Grande J.P.: Differential regulation of mesangial cell mitogenesis by phosphodiesterase isozymes 3 and 4. Am. J. Physiol. Renal Physiol., 2004; 287: F940 F953 [8] Choi W.I., Kwon K.Y., Seo J.W., Beagle J., Quinn D.A., Hales C.A.: The role of phosphodiesterase 3 in endotoxin-induced acute kidney injury. BMC Infect. Dis., 2009; 9: 80 [9] Degerman E., Ahmad F., Chung Y.W., Guirguis E., Omar B., Stenson L., Manganiello V.: From PDE3B to the regulation of energy homeostasis. Curr. Opin. Pharmacol., 2011; 11: [10] Degerman E., Belfrage P., Newman A.H., Rice K.C., Manganiello V.C.: Purification of the putative hormone-sensitive cyclic AMP phosphodiesterase from rat adipose tissue using a derivative of cilostamide as a novel affinity ligand. J. Biol. Chem., 1987; 262: [11] Di Paola R., Mazzon E., Paterniti I., Impellizzeri D., Bramanti P., Cuzzocrea S.: Olprinone, a PDE3 inhibitor, modulates the inflammation associated with myocardial ischemia reperfusion injury in rats. Eur. J. Pharmacol., 2011; 650: [12] Ding B., Abe J., Wei H., Huang Q., Walsh R.A., Molina C.A., Zhao A., Sadoshima J., Blaxall B.C., Berk B.C., Yan C.: Functional role of phosphodiesterase 3 in cardiomyocyte apoptosis: implication in heart failure. Circulation, 2005; 111: [13] Ding B., Abe J., Wei H., Xu H., Che W., Aizawa T., Liu W., Molina C.A., Sadoshima J., Blaxall B.C., Berk B.C., Yan C.: A positive feedback loop of phosphodiesterase 3 (PDE3) and inducible early repressor (ICER) leads to cardiomyocyte apoptosis. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2005; 102: [14] Elbatarny H.S., Maurice D.H.: Leptin-mediated activation of human platelets: involvement of a leptin receptor and phosphodiesterase 3A-containing cellular signaling complex. Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab., 2005; 289: E695 E702 [15] Feijge M.A., Ansink K., Vanschoonbeek K., Heemskerk J.W.: Control of platelet activation by cyclic AMP turnover and cyclic nucleotide phosphodiesterase type-3. Biochem. Pharmacol., 2004; 67: [16] Geoffroy V., Fouque F., Lugnier C., Desbuquois B., Benelli C.: Characterization of an in vivo hormonally regulated phosphodiesterase 3 (PDE3) associated with a liver Golgi-endosomal fraction. Arch. Biochem. Biophys., 2001; 387: [17] Gormand A.: The crosstalk between the ERK and the signaling pathways in PC12 cells. PhD thesis, University of Glasgow, 2008 [18] Grant P.G., Colman R.W.: Purification and characterization of a human platelet cyclic nucleotide phosphodiesterase. Biochemistry, 1984; 23: [19] Han S. J., Vaccari S., Nedachi T., Andersen C.B., Kovacina K.S., Roth R.A., Conti M.: Protein kinase B/Akt phosphorylation of PDE3A and its role in mammalian oocyte maturation. EMBO J., 2006; 25: [20] Härndahl L., Wierup N., Enerbäck S., Mulder H., Manganiello V.C., Sundler F., Degerman E., Ahrén B., Holst L.S.: b-cell-targeted overexpression of phosphodiesterase 3B in mice causes impaired insulin secretion, glucose intolerance, and deranged islet morphology. J. Biol. Chem., 2004; 279: [21] Harrison S.A., Reifsnyder D.H., Gallis B., Cadd G.G., Beavo J.A.: Isolation and characterization of bovine cardiac muscle cgmp-inhibited phosphodiesterase: a receptor for new cardiotonic drugs. Mol. Pharmacol., 1986; 29: [22] Herbst K.J., Allen M.D., Zhang J.: Spatiotemporally regulated protein kinase A activity is a critical regulator of growth factor-stimulated extracellular signal-regulated kinase signaling in PC12 cells. Mol. Cell. Biol., 2011; 31: [23] Herring N., Zaman J.A., Paterson D.J.: Natriuretic peptides like NO facilitate cardiac vagal neurotransmission and bradycardia via a cgmp pathway. Am. J. Physiol. Heart. Circ. Physiol., 2001; 281: H2318 H2327 [24] Hung S.H., Liu A.H., Pixley R.A., Francis P., Williams L.D., Matsko C.M., Barnes K.D., Sivendran S., Colman R.F., Colman R.W.: A new nonhydrolyzable reactive cgmp analogue, (Rp)-guanosine-3,5 -cyclic- S-(4-bromo-2,3-dioxobutyl)monophosphorothioate, which targets the cgmp binding site of human platelet PDE3A. Bioorg. Chem., 2008; 36: [25] Hung S.H., Zhang W., Pixley R.A., Jameson B.A., Huang Y.C., Colman R.F., Colman R.W.: New insights from the structure-function analysis of the catalytic region of human platelet phosphodiesterase 3A: a role for the unique 44-amino acid insert. J. Biol. Chem., 2006; 281: [26] Hunter R.W., Mackintosh C., Hers I.: Protein kinase C-mediated phosphorylation and activation of PDE3A regulate levels in human platelets. J. Biol. Chem., 2009; 284: [27] Kenan Y., Murata T., Shakur Y., Degerman E., Manganiello V.C.: Functions of the N-terminal region of cyclic nucleotide phosphodiesterase 3 (PDE 3) isoforms. J. Biol. Chem., 2000; 275: [28] Kitamura T., Kitamura Y., Kuroda S., Hino Y., Ando M., Kotani K., Konishi H., Matsuzaki H., Kikkawa U., Ogawa W., Kasuga M.: Insulininduced phosphorylation and activation of cyclic nucleotide phosphodiesterase 3B by the serine-threonine kinase Akt. Mol. Cell. Biol., 1999; 19: [29] Lakics V., Karran E.H., Boess F.G.: Quantitative comparison of phosphodiesterase mrna distribution in human brain and peripheral tissues. Neuropharmacology, 2010; 59: [30] Lindh R., Ahmad F., Resjö S., James P., Yang J.S., Fales H.M., Manganiello V., Degerman E.: Multisite phosphorylation of adipocyte and hepatocyte phosphodiesterase 3B. Biochim. Biophys. Acta, 2007; 1773:
9 Postepy Hig Med Dosw (online), 2012; tom 66: [31] Lugnier C.: Cyclic nucleotide phosphodiesterase (PDE) superfamily: a new target for the development of specific therapeutic agents. Pharmacol. Ther., 2006; 109: [32] Lugnier C., Keravis T., Le Bec A., Pauvert O., Proteau S., Rousseau E.: Characterization of cyclic nucleotide phosphodiesterase isoforms associated to isolated cardiac nuclei. Biochim. Biophys. Acta, 1999; 1472: [33] Marcantoni A., Levi R.C., Gallo M.P., Hirsch E., Alloatti G.: Phosphoinositide 3-kinase g (PI3Kg) controls L-type calcium current (ICa,L) through its positive modulation of type-3 phosphodiesterase (PDE3). J. Cell. Physiol., 2006; 206: [34] Masciarelli S., Horner K., Liu C., Park S. H., Hinckley M., Hockman S., Nedachi T., Jin C., Conti M., Manganiello V.: Cyclic nucleotide phosphodiesterase 3A-deficient mice as a model of female infertility. J. Clin. Invest., 2004; 114: [35] Maurice D.H., Haslam R.J.: Molecular basis of the synergistic inhibition of platelet function by nitrovasodilators and activators of adenylate cyclase: inhibition of cyclic AMP breakdown by cyclic GMP. Mol. Pharmacol., 1990; 37: [36] Maurice D.H., Palmer D., Tilley D.G., Dunkerley H.A., Netherton S.J., Raymond D.R., Elbatarny H.S., Jimmo S.L.: Cyclic nucleotide phosphodiesterase activity, expression, and targeting in cells of the cardiovascular system. Mol. Pharmacol., 2003; 64: [37] Miki T., Taira M., Hockman S., Shimada F., Lieman J., Napolitano M., Ward D., Makino H., Manganiello V.C.: Characterization of the cdna and gene encoding human PDE3B, the cgip1 isoform of the human cyclic GMP-inhibited cyclic nucleotide phosphodiesterase family. Genomics, 1996; 36: [38] Movsesian M., Stehlik J., Vandeput F., Bristow M.R.: Phosphodiesterase inhibition in heart failure. Heart Fail. Rev., 2009; 14: [39] Movsesian M., Wever-Pinzon O., Vandeput F.: PDE3 inhibition in dilated cardiomyopathy. Curr. Opin. Pharmacol., 2011; 11: [40] Nilsson R., Ahmad F., Swärd K., Andersson U., Weston M., Manganiello V., Degerman E.: Plasma membrane cyclic nucleotide phosphodiesterase 3B (PDE3B) is associated with caveolae in primary adipocytes. Cell. Signal., 2006; 18: [41] Omori K., Kotera J.: Overview of PDEs and their regulation. Circ. Res., 2007; 100: [42] Palmer D., Jimmo S.L., Raymond D.R., Wilson L.S., Carter R.L., Maurice D.H.: Protein kinase A phosphorylation of human phosphodiesterase 3B promotes protein binding and inhibits phosphatase-catalyzed inactivation. J. Biol. Chem., 2007; 282: [43] Patrucco E., Notte A., Barberis L., Selvetella G., Maffei A., Brancaccio M., Marengo S., Russo G., Azzolino O., Rybalkin S.D., Silengo L., Altruda F., Wetzker R., Wymann M.P., Lembo G., Hirsch E.: PI3Kg modulates the cardiac response to chronic pressure overload by distinct kinase-dependent and -independent effects. Cell, 2004; 118: [44] Porzionato A., Macchi V., Rucinski M., Malendowicz L.K., De Caro R.: Natriuretic peptides in the regulation of the hypothalamic-pituitary-adrenal axis. Int. Rev. Cell Mol. Biol., 2010; 280: 1 39 [45] Pozuelo Rubio M., Campbell D.G., Morrice N.A., Mackintosh C.: Phosphodiesterase 3A binds to proteins in response to PMAinduced phosphorylation of Ser428. Biochem. J., 2005; 392: [46] Qvigstad E., Moltzau L.R., Aronsen J.M., Nguyen C.H., Hougen K., Sjaastad I., Levy F.O., Skomedal T., Osnes J.B.: Natriuretic peptides increase b1-adrenoceptor signalling in failing hearts through phosphodiesterase 3 inhibition. Cardiovasc. Res., 2010; 85: [47] Rahn T., Rönnstrand L., Leroy M.J., Wernstedt C., Tornqvist H., Manganiello V.C., Belfrage P., Degerman E.: Identification of the site in the cgmp-inhibited phosphodiesterase phosphorylated in adipocytes in response to insulin and isoproterenol. J. Biol. Chem., 1996; 271: [48] Reinhardt R.R., Chin E., Zhou J., Taira M., Murata T., Manganiello V.C., Bondy C.A.: Distinctive anatomical patterns of gene expression for cgmp-inhibited cyclic nucleotide phosphodiesterases. J. Clin. Invest., 1995; 95: [49] Rondinone C.M., Carvalho E., Rahn T., Manganiello V.C., Degerman E., Smith U.P.: Phosphorylation of PDE3B by phosphatidylinositol 3-kinase associated with the insulin receptor. J. Biol. Chem., 2000; 275: [50] Rybalkin S.D., Rybalkina I.G., Beavo J.A.: Phosphorylation of hydrolyzing PDE (PDE3A) by cgmp-dependent protein kinase (PKG) in human platelets. BMC Pharmacology, 2007; 7(Suppl.1): S29 [51] Sano R., Miki T., Suzuki Y., Shimada F., Taira M., Kanatsuka A., Makino H., Hashimoto N., Saito Y.: Analysis of the insulin-sensitive phosphodiesterase 3B gene in type 2 diabetes. Diabetes Res. Clin. Pract., 2001; 54: [52] Shakur Y., Takeda K., Kenan Y., Yu Z.X., Rena G., Brandt D., Houslay M.D., Degerman E., Ferrans V.J., Manganiello V.C.: Membrane localization of cyclic nucleotide phosphodiesterase 3 (PDE3). Two N-terminal domains are required for the efficient targeting to, and association of, PDE3 with endoplasmic reticulum. J. Biol. Chem., 2000; 275: [53] Springer J., Azer J., Hua R., Robbins C., Adamczyk A., McBoyle S., Bissell M.B., Rose R.A.: The natriuretic peptides BNP and CNP increase heart rate and electrical conduction by stimulating ionic currents in the sinoatrial node and atrial myocardium following activation of guanylyl cyclase-linked natriuretic peptide receptors. J. Mol. Cell. Cardiol., 2012; 52: [54] Sun B., Li H., Shakur Y., Hensley J., Hockman S., Kambayashi J., Manganiello V.C., Liu Y.: Role of phosphodiesterase type 3A and 3B in regulating platelet and cardiac function using subtype-selective knockout mice. Cell. Signal., 2007; 19: [55] Tang K.M., Jang E.K., Haslam R.J.: Expression and mutagenesis of the catalytic domain of cgmp-inhibited phosphodiesterase (PDE3) cloned from human platelets. Biochem. J., 1997; 323: [56] Wechsler J., Choi Y.H., Krall J., Ahmad F., Manganiello V.C., Movsesian M.A.: Isoforms of cyclic nucleotide phosphodiesterase PDE3A in cardiac myocytes. J. Biol. Chem., 2002; 277: [57] Wilson L.S., Baillie G.S., Pritchard L.M., Umana B., Terrin A., Zaccolo M., Houslay M.D., Maurice D.H.: A phosphodiesterase 3B-based signaling complex integrates exchange protein activated by 1 and phosphatidylinositol 3-kinase signals in human arterial endothelial cells. J. Biol. Chem., 2011; 286: [58] Witwicka H., Kobiałka M., Siednienko J., Mitkiewicz M., Gorczyca W.A.: Expression and activity of cgmp-dependent phosphodiesterases is up-regulated by lipopolysaccharide (LPS) in rat peritoneal macrophages. Biochim. Biophys. Acta, 2007; 1773: [59] Wróblewska H., Gorczyca W.A.: Fosfodiesterazy cyklicznego cgmp. Postępy Hig. Med. Dośw., 2001; 55: [60] Xu Y., Zhang H.T., O Donnell J.M.: Phosphodiesterases in the central nervous system: implications in mood and cognitive disorders. Handb. Exp. Pharmacol., 2011; 204: [61] Yan X., Gao S., Tang M., Xi J., Gao L., Zhu M., Luo H., Hu X., Zheng Y., Hescheler J., Liang H.: Adenylyl cyclase/--mediated phosphorylation of basal L-type Ca2+ channels in mouse embryonic ventricular myocytes. Cell Calcium, 2011; 50: [62] Zhao J., Harada N., Kurihara H., Nakagata N., Okajima K.: Cilostazol improves cognitive function in mice by increasing the production of insulin-like growth factor-i in the hippocampus. Neuropharmacology, 2010; 58: [63] Zmuda-Trzebiatowska E., Oknianska A., Manganiello V., Degerman E.: Role of PDE3B in insulin-induced glucose uptake, GLUT-4 translocation and lipogenesis in primary rat adipocytes. Cell. Signal., 2006; 18: Autorzy deklarują brak potencjalnych konfliktów interesów.
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Cykliczny guanozynomonofosforan w regulacji czynności komórki Cyclic guanosine monophosphate in the regulation of the cell function
Postepy Hig Med Dosw (online), 2016; 70: 1276-1285 e-issn 1732-2693 www.phmd.pl Review Received: 2015.06.11 Accepted: 2016.03.21 Published: 2016.12.27 Cykliczny guanozynomonofosforan w regulacji czynności
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
(przekaźniki II-go rzędu)
(przekaźniki II-go rzędu) Gabriel Nowak, Małgorzata Dybała Receptory i mechanizmy przekazywania sygnału (J.Z. Nowak, J.B. Zawilska, red.) Wyd. Nauk. PWN, Warszawa, 2004 Zakład Cytobiologii i Histochemii,
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Hormony Gruczoły dokrewne
Hormony Gruczoły dokrewne Dr n. biol. Urszula Wasik Zakład Biologii Medycznej HORMON Przekazuje informacje między poszczególnymi organami regulują wzrost, rozwój organizmu efekt biologiczny - niewielkie
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Informator (przekaźnik) pierwotny czynnik fizyczny lub chemiczny będący nośnikiem
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Informator (przekaźnik) pierwotny czynnik fizyczny lub chemiczny będący nośnikiem
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa
Informator (przekaźnik) pierwotny czynnik fizyczny lub chemiczny będący nośnikiem informacji odebranej przez komórkę. Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa Receptor cząsteczka chemiczna ( peptyd
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ
mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE
Mgr Dorota Przybylska
Mgr Dorota Przybylska Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biochemia Wszczęcie: 11.12.2015 Temat: Rola oksydazy NADPH 4 oraz szlaku odpowiedzi na uszkodzenia DNA w starzeniu ludzkich komórek mięśni
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
Choroby układu sercowo-naczyniowego związane są z takimi czynnikami ryzyka jak niewłaściwa dieta, brak aktywności fizycznej, otyłość, nadciśnienie
Mgr Tomasz Bednarski Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biologia Wszczęcie: 27.06.2014 r. Temat: Rola kwasów tłuszczowych w metabolizmie mięśnia sercowego oraz patogenezie przerostu lewej komory
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII. Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro
KOŁO NAUKOWE IMMUNOLOGII Mikrochimeryzm badania w hodowlach leukocytów in vitro Koło Naukowe Immunolgii kolo_immunologii@biol.uw.edu.pl kolo_immunologii.kn@uw.edu.pl CEL I PRZEDMIOT PROJEKTU Celem doświadczenia
Wskaźniki włóknienia nerek
Wskaźniki włóknienia nerek u dzieci z przewlekłą chorobą nerek leczonych zachowawczo Kinga Musiał, Danuta Zwolińska Katedra i Klinika Nefrologii Pediatrycznej Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Terapia celowana. Część I. Mechanizmy przesyłania sygnałów przy udziale receptorów o aktywności kinazy tyrozynowej
Współczesna Onkologia (2007) vol. 11; 7 (331 336) Prawidłowe funkcjonowanie komórki jest uzależnione od ścisłej kontroli przekazywania informacji. W proces przenoszenia sygnałów zaangażowane są substancje
Fizjologia człowieka
Fizjologia człowieka Wykład 2, część A CZYNNIKI WZROSTU CYTOKINY 2 1 Przykłady czynników wzrostu pobudzających proliferację: PDGF - cz.wzrostu z płytek krwi działa na proliferację i migrację fibroblastów,
UKŁAD DOKREWNY cz. 2. Wysepki trzustkowe (Langerhansa): grupy komórek dokrewnych produkujących hormony białkowe
Wysepki trzustkowe (Langerhansa): grupy komórek dokrewnych produkujących hormony białkowe UKŁAD DOKREWNY cz. 2 Elementy składowe: komórki dokrewne kapilary okienkowe włókna nerwowe Typy komórek dokrewnych
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Mechanizmy działania i regulacji enzymów
Mechanizmy działania i regulacji enzymów Enzymy: są katalizatorami, które zmieniają szybkość reakcji, same nie ulegając zmianie są wysoce specyficzne ich aktywność może być regulowana m.in. przez modyfikacje
Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim I Błony biologiczne
Zagadnienia seminaryjne w semestrze letnim 2019 I Błony biologiczne 1. Budowa i składniki błon biologicznych - fosfolipidy - steroidy - białka - glikoproteiny i glikolipidy 2. Funkcje błony komórkowej
Cyklaza guanylanowa. Katarzyna Osytek. Warszawski Uniwersytet Medyczny
Cyklaza guanylanowa Katarzyna Osytek Warszawski Uniwersytet Medyczny Przekaźniki I-ego rzędu hormony czynniki wzrostu neurotransmitery NO Efektory enzymatyczne cyklazy nukleotydowe fosfodiesterazy fosfolipazy
Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak
Katedra Fizjologii i Biochemii Roślin Uniwersytetu Łódzkiego Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak Plan wykładu Przykłady
Fetuina i osteopontyna u pacjentów z zespołem metabolicznym
Fetuina i osteopontyna u pacjentów z zespołem metabolicznym Dr n med. Katarzyna Musialik Katedra Chorób Wewnętrznych, Zaburzeń Metabolicznych i Nadciśnienia Tętniczego Uniwersytet Medyczny w Poznaniu *W
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Dr hab. med. Aleksandra Szlachcic Kraków, Katedra Fizjologii UJ CM Kraków, ul. Grzegórzecka 16 Tel.
Dr hab. med. Aleksandra Szlachcic Kraków, 10.08.2015 Katedra Fizjologii UJ CM 31-531 Kraków, ul. Grzegórzecka 16 Tel.: 601 94 75 82 RECENZJA PRACY DOKTORSKIEJ Recenzja pracy doktorskiej mgr Michała Stanisława
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Wpływ wysiłku pływackiego na stężenie mitochondrialnego cholesterolu oraz metabolizm energetyczny w warunkach stresu oksydacyjnego
Wpływ wysiłku pływackiego na stężenie mitochondrialnego cholesterolu oraz metabolizm energetyczny w warunkach stresu oksydacyjnego mgr Damian Józef Flis Rozprawa na stopień doktora nauk o zdrowiu Promotorzy:
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Wazoprotekcyjne i antydiabetogenne działanie telmisartanu zależne od aktywacji receptora PPAR?
Wazoprotekcyjne i antydiabetogenne działanie telmisartanu zależne od aktywacji receptora PPAR? Receptory aktywowane przez proliferatory peroksysomów Wśród receptorów PPAR wyróżnić można 3 izoformy, mianowicie:
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
VITA-MIN Plus połączenie witamin i minerałów, stworzone z myślą o osobach aktywnie uprawiających sport.
Witaminy i minerały > Model : Producent : Olimp VITAMIN Plus połączenie witamin i minerałów, stworzone z myślą o osobach aktywnie uprawiających sport. DZIAŁA PROZDROWOTNIE WZMACNIA SYSTEM ODPORNOŚCIOWY
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii. Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Copyright by Wydział Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs W. H. Colledge, M. B. L. Carlton, G. B. Udy & M. J. Evans przygotowała Katarzyna Czajkowska 1 Dysrupcja (rozbicie) genu
Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF
Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.
UKŁAD DOKREWNY cz. 2. beta. delta. alfa
Wysepki trzustkowe (Langerhansa): grupy komórek dokrewnych produkujących hormony białkowe, zlokalizowane na terenie zrazików, otoczone przez struktury części zewnątrzwydzielniczej UKŁAD DOKREWNY cz. 2
Pozaanestetyczne działanie anestetyków wziewnych
Pozaanestetyczne działanie anestetyków wziewnych Wojciech Dąbrowski Katedra i I Klinika Anestezjologii i Intensywnej Terapii Uniwersytetu Medycznego w Lublinie e-mail: w.dabrowski5@gmail.com eter desfluran
Akademia Wychowania Fizycznego i Sportu WYDZIAŁ WYCHOWANIA FIZYCZNEGO w Gdańsku ĆWICZENIE III. AKTYWNOŚĆ FIZYCZNA, A METABOLIZM WYSIŁKOWY tlenowy
Akademia Wychowania Fizycznego i Sportu WYDZIAŁ WYCHOWANIA FIZYCZNEGO w Gdańsku ĆWICZENIE III AKTYWNOŚĆ FIZYCZNA, A METABOLIZM WYSIŁKOWY tlenowy AKTYWNOŚĆ FIZYCZNA W ujęciu fizjologicznym jest to: każda
Bioinformatyka wykład 9
Bioinformatyka wykład 9 14.XII.21 białkowa bioinformatyka strukturalna krzysztof_pawlowski@sggw.pl 211-1-17 1 Plan wykładu struktury białek dlaczego? struktury białek geometria i fizyka modyfikacje kowalencyjne
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH. KANAŁY UWALNIAJĄCE JONY WAPNIA Z BŁON WEWNĘTRZNYCH. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony
Kosm os PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 515-522 Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika W ie s ł a w a L e ś n ia k Zakład Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej
ARCH. MED. SĄD. KRYM., 2006, LVI, 144-148
ARCH. MED. SĄD. KRYM., 6, LVI, 144-148 PRACE ORYGINALNE Elżbieta Bloch-Bogusławska Wpływ czasu zgonu na reaktywność tętnic ogonowych szczura wyzwalaną przez fenylefrynę (PHE) z równoczesnym zastosowaniem
Źródła energii dla mięśni. mgr. Joanna Misiorowska
Źródła energii dla mięśni mgr. Joanna Misiorowska Skąd ta energia? Skurcz włókna mięśniowego wymaga nakładu energii w postaci ATP W zależności od czasu pracy mięśni, ATP może być uzyskiwany z różnych źródeł
SEMINARIUM 8:
SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
Wykład 9: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład 9: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (UE) / z dnia r.
KOMISJA EUROPEJSKA Bruksela, dnia 29.5.2018 C(2018) 3193 final ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (UE) / z dnia 29.5.2018 r. zmieniające rozporządzenie (WE) nr 847/2000 w odniesieniu do definicji pojęcia podobnego
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni Gurgul A., Jasielczuk I., Semik-Gurgul E., Pawlina-Tyszko K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M. Instytut Zootechniki PIB Zakład Biologii
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem.
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Streszczenie Ogólnym celem niniejszej pracy było lepsze zrozumienie funkcjonowania szlaku
Projektowanie Procesów Biotechnologicznych
Projektowanie Procesów Biotechnologicznych wykład 14 styczeń 2014 Kinetyka prostych reakcji enzymatycznych Kinetyka hamowania reakcji enzymatycznych 1 Enzymy - substancje białkowe katalizujące przemiany
Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek
Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek Model tworzenia mikrokapilar na podłożu fibrynogenowym eksponencjalny wzrost tempa proliferacji i syntezy DNA wraz ze wzrostem stężenia
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Kosmos PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH. REGULACJA EKSPRESJI GENÓW PRZEZ JONY WAPNIA. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony
Kosmos PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH. Tom 46, 1997 Numer 4 (237) Strony 523-528 Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Ir e n e u s z W. B ie d e r m a n n, L e s z e k K a c z m a r e k Zakład.
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Wydalanie ZAKŁAD FIZJOLOGII ZWIERZĄT, INSTYTUT ZOOLOGII WYDZIAŁ BIOLOGII, UNIWERSYTET WARSZAWSKI
Wydalanie DR MAGDALENA MARKOWSKA ZAKŁAD FIZJOLOGII ZWIERZĄT, INSTYTUT ZOOLOGII WYDZIAŁ BIOLOGII, UNIWERSYTET WARSZAWSKI Wydalanie Środowisko odla ZWIERZĘCIA jest nim OTOCZENIE, w którym żyje odla KOMÓREK
Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu
nauka o czynności żywego organizmu Stanowi zbiór praw, jakim podlega cały organizm oraz poszczególne jego układy, narządy, tkanki i komórki prawa rządzące żywym organizmem są wykrywane doświadczalnie określają
Część V: Przekazywanie sygnałów. DO WYKŁADÓW Z PODSTAW BIOFIZYKI IIIr. Biotechnologii prof. dr hab. inż. Jan Mazerski
MATERIAŁY PMCNICZE D WYKŁADÓW Z PDSTAW BIFIZYKI IIIr. Biotechnologii prof. dr hab. inż. Jan Mazerski PRZEKAZYWANIE SYGNAŁÓW Cechą charakterystyczną układów żywych jest zdolność do zachowywania wewnętrznej
Immunoterapia w praktyce rak nerki
Immunoterapia w praktyce rak nerki VII Letnia Akademia Onkologiczna dla Dziennikarzy Warszawa 09 sierpień 2018 Piotr Tomczak Uniwersytet Medyczny Poznań Katedra i Klinika Onkologii Leczenie mrcc - zalecenia
Kompartmenty wodne ustroju
Kompartmenty wodne ustroju Tomasz Irzyniec Oddział Nefrologii, Szpital MSWiA Katowice Zawartość wody w ustroju jest funkcją wieku, masy ciała i zawartości tłuszczu u dzieci zawartość wody wynosi około
FIZJOLOGIA CZŁOWIEKA
FIZJOLOGIA CZŁOWIEKA Daniel McLaughlin, Jonathan Stamford, David White FIZJOLOGIA CZŁOWIEKA Daniel McLaughlin Jonathan Stamford David White Przekład zbiorowy pod redakcją Joanny Gromadzkiej-Ostrowskiej
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Mateusz Adamiak. Rozprawa doktorska na tytuł doktora nauk o zdrowiu.
Mateusz Adamiak ROLA SFINGOZYNO-1-FOSFORANU W PROCESACH ZASIEDLANIA SZPIKU KOSTNEGO ORAZ FARMAKOLOGICZNEJ MOBILIZACJI KRWIOTWÓRCZYCH KOMÓREK MACIERZYSTYCH. The role of sphingosine-1-phosphate in the process
Czy jest możliwe skuteczne leczenie cukrzycy w grupie chorych otyłych ze znaczną insulinoopornością?
Jerzy Maksymilian Loba Klinika Chorób Wewnętrznych i Diabetologii Uniwersytet Medyczny w Łodzi Czy jest możliwe skuteczne leczenie cukrzycy w grupie chorych otyłych ze znaczną insulinoopornością? Definicja
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
kardiolog.pl 2000-2016 Activeweb Medical Solutions. Wszelkie prawa zastrzeżone. str. 2/5
Rola czynników immunologicznych w indukcji apoptozy kardiomiocytów u pacjentów w czasie operacji na otwartym sercu i ich wpływ na powstanie uszkodzenia niedokrwienno-reperfuzyjnego W czasie operacji na
KARTA PRZEDMIOTU CYTOFIZJOLOGIA/SYLABUS
KARTA PRZEDMIOTU CYTOFIZJOLOGIA/SYLABUS Wydział Kierunek studiów Jednostka organizacyjna prowadząca kierunek Poziom kształcenia Forma studiów Profil kształcenia Jednostka organizacyjna prowadząca przedmiot
Przekazywanie sygnałów w mechanizmach działania fitohormonów. Przekazywanie sygnałów w komórkach zwierzęcych. Stężenie kinetyny (mg/litr)
Stężenie kinetyny (mg/litr) 2015-11-03 Przekazywanie sygnałów w komórkach zwierzęcych Przekazywanie sygnałów w mechanizmach działania fitohormonów Literatura: www.umk.pl/~kesy/mechanizmy_wzrostu/ligazy_ubikwitynowo-bialkowe.pdf
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK
Model Poissona-Nernsta-Plancka w predykcji struktury kanałów białkowych
Model Poissona-Nernsta-Plancka w predykcji struktury kanałów białkowych mgr inż. Witold Dyrka Opiekun: dr hab. inż. Małgorzata Kotulska Instytut Inżynierii Biomedycznej i Pomiarowej Plan wystąpienia Nanopory
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt wykładu Rozpoznanie antygenu
Wykład 2. Kinetyka reakcji enzymatycznych.
Wykład 2 Kinetyka reakcji enzymatycznych. Kofaktory enzymów wd_2 2 Ryboflawina witamina B 2 Ryboflawina wit. B 2 FAD dinukleotyd flawinoadeninowy wd_2 3 Niacyna witamina PP (B 3 ) NAD + dinukleotyd nikotynamidoadeninowy
z Hsp90 w sposób bezpośredni. Ponadto pokazano, iż pomimo podobieństwa sekwencji CacyBP/SIP i Sgt1, białka te nie współzawodniczą ze sobą o wiązanie
Mgr Agnieszka Góral Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biologia Otwarcie: 28.06.2013 r. Temat: Białko CacyBP/SIP: oddziaływanie z białkiem szoku cieplnego Hsp90 oraz rola w odpowiedzi komórek na
Farmakodynamika. Podstawowym zagadnieniem farmakodynamiki jest odpowiedź na pytanie w jaki sposób dany lek wywiera określony efekt farmakologiczny.
Farmakodynamika Podstawowym zagadnieniem farmakodynamiki jest odpowiedź na pytanie w jaki sposób dany lek wywiera określony efekt farmakologiczny. Receptor: składnik systemu biologicznego, który ma zdolność
Nowe terapie w cukrzycy typu 2. Janusz Gumprecht
Nowe terapie w cukrzycy typu 2 Janusz Gumprecht Dziś już nic nie jest takie jak było kiedyś 425 000 000 Ilość chorych na cukrzycę w roku 2017 629 000 000 Ilość chorych na cukrzycę w roku 2045 International