Spis treści. spis treści. 2 syngen.pl. Polimerazy PCR i real-time PCR

Transkrypt

1

2 spis treści Spis treści Polimerazy PCR i real-time PCR 6 Klasyczny PCR Hot Start PCR Real-time PCR i analiza HRM Polimerazy specjalne (long range, proofreading) Odwrotna transkrypcja 15 Izolacja DNA i RNA 16 Izolacja genomowego DNA Doczyszczanie wyizolowanego DNA Izolacja genomowego DNA z certyfikatem CE IVD Izolacja RNA Doczyszczanie wyizolowanego RNA Izolacja mirna Izolacja DNA i RNA wirusowego Oczyszczanie prążków z żelu Oczyszczanie produktu PCR Izolacja plazmidów na wirówce Izolacja plazmidów na złożu jonowymiennym i endofree Elektroforeza 39 Markery wielkości DNA Agaroza Barwniki do DNA w żelu Bufory syngen.pl

3 spis treści Diagnostyka 44 Diagnostyka wirusologiczna CE IVD Diagnostyka mikrobiologiczna CE IVD Diagnostyka chorób genetycznych CE IVD Onkologia CE IVD Medycyna spersonalizowana CE IVD Diagnostyka weterynaryjna Analiza żywności Standardy referencyjne 44-47, , 48 44, , Usługi 52 Sekwencjonowanie Sangera Sekwencjonowanie NGS Synteza nukleotydów, primerów, sond, genów Inne usługi z zakresu biologii molekularnej Przygotowywanie bibliotek NGS 54 Transfekcja 55 Notatki 56 kolumienki.pl 3

4 kompleksowe rozwiązania dla laboratoriów ODCZYNNIKI BIOFARMA Molecular Devices izolacja DNA i RNA nowoczesne zestawy kolumienkowe, gdna, plazmidy, wirusowe N/A, mrna, mirna polimerazy PCR i mastermiksy real-time PCR wybór enzymów do rutynowej pracy oraz do zastosowań specjalnych, mastermiksy reakcyjne diagnostyka patogenów wirusologia, bakteriologia, STI, analiza żywności, panel transplantacyjny onkologia mutacje, geny fuzyjne, medycyna spersonalizowana, onkohematologia farmakogenetyka badanie polimorfizmów sekwencjonowanie Sangera i NGS redukcja ilości BigDye, usuwanie terminatorów, przygotowywanie bibliotek NGS elektroforeza agarozy, barwniki, bufory, markery standaryzacja ludzkie genomowe standardy referencyjne do sekwencjonowania NGS oraz do walidacji urządzeń i testów diagnostycznych HCS, High Content Imaging automatyczna mikroskopia widefield i konfokalna, analiza wieloparametrowa, testy komórkowe w kontrolowanym środowisku colony pickers screening i komputerowa selekcja klonów QC kontrola jakości i monitoring zanieczyszczeń biofarmaceutyków Threshold szybkie molekularne monitorowanie wydajności bioprocesu produkcyjnego kanały jonowe klasyczny Patch Clamp i automatyczna elektrofizjologia zestawy reakcyjne GPCR, calcium assay, enzymy, neurotransmitery, potencjał błonowy, kardiotoksyczność, przeżywalność komórek, western blot, wydajność bioprocesów, monitoring zanieczyszczenia, analiza ilościowa białek transfekcja DNA, RNA, białka, peptydy, przeciwciała 4 syngen.pl

5 kompleksowe rozwiązania dla laboratoriów AUTOMATYZACJA APARATURA automatyczna izolacja DNA i RNA bioroboty do izolacji z różnych materiałów stacje pipetujące nastawianie reakcji, serie rozcieńczeń, normalizacja stężeń, kopiowanie płytek, mastermiksy automatyczne nastawianie reakcji pipetory dedykowane do PCR i real-time PCR elektroforeza kapilarna automatyczny rozdział DNA i RNA, analiza ilościowa i jakościowa, mirna ELISA automatyczne nastawianie reakcji i płukanie płytek, certy kowane czytniki ELISA NGS automatyczne przygotowywanie bibliotek NGS autoloadery magazyny próbek i automaty podające płytki reakcyjne w analizie HCS, mikromacierzach, ELISA, luorescencji, luminescencji asystent pipetowania w tablecie proste i wygodne pipetowanie w płytkach 96 i 384 dzięki podświetlanym studzienkom termocyklery PCR termocyklery SensoQuest z 5-letnią gwarancją bloki 96, 48 i potrójne niezależne termocyklery real-time PCR wielokanałowe - do 8 kanałów luorescencyjnych HRM, bloki płytkowe 96, 48 i potrójne niezależne wielodetekcyjne czytniki płytek nowoczesne czytniki absorbancji, luorescencji, luminescencji, TRF, FP, czytniki z pipetorem do calcium assay, cytometria i wizualizacja komórek mikromacierze kompletna platforma do analizy mikromacierzy, skanery konfokalne i niekonfokalne elektroforeza aparaty do elektroforezy poziomej i pionowej w pełnym zakresie, dedykowane zasilacze spektrofotometry µl spcjalistyczne spektrofometry mikrolitrowe do DNA, RNA, białek i stopnia wyznakowania wirówki pełny asortyment wirówek wysokoobrotowych oraz małych wirówek podręcznych dokumentacja żeli i western blot systemy do luorescencji i chemiluminescencji elektroporatory elektroporacja, elektrofuzja, mikromanipulacja kolumienki.pl 5

6 polimerazy DNA barwny wskaźnik dodania mastermiksu (wersja LOAD) gotowa do nakładania na żel bezpośrednio po reakcji (wersja LOAD) rutynowe reakcje PCR klonowanie TA primer extension Silver Taq DNA Polymerase Silver Taq DNA Polymerase to rekombinowana termostabilna polimeraza Taq pochodząca z Thermus aquaticus. Odznacza się wysoką aktywnością katalizującą syntezę DNA w kierunku od 5' do 3' oraz brakiem aktywności egzonukleazowej w kierunku od 3' do 5'. Enzym dodaje do amplifikowanych fragmentów zakończenie poli-a, dzięki czemu nadają się one do bezpośredniego klonowania TA lub oczyszczania opartego o sondy oligo-dt. Bufor reakcyjny Silver optymalizuje przebieg reakcji, a zastosowanie (NH ) SO znacząco zwiększa specyficzność amplifikacji Transport polimeraz Silver przebiega w temperaturze pokojowej, a przechowywanie w temperaturze -20 C. y uzupełniające Daily Agarose (100g) SY Daily Agarose (500g) SY GreenDNA Gel Stain SY EtBr Gel Stain SY Blue Loading Dye SY Orange Loading Dye SY Synteza primerów str. 53 Warianty Klasyczny PLUS MIX LOAD polimeraza w komplecie z buforem reakcyjnym i MgCl 2 zestaw zawiera dodatkowo dntp Mix 10 mm gotowy mastermiks reakcyjny miks zawiera bufor obciążający oraz barwniki żółty i niebieski migrujące w żelu przy ok. 40 bp i 4 kb Stężenie Silver Taq DNA Polymerase (500U) 5 U/µl 500 U SY Silver Taq DNA Polymerase (1000U) 5 U/µl 1000 U SY Silver Taq DNA Polymerase (2000U) 5 U/µl 2000 U SY Silver Taq DNA Polymerase PLUS (500U) 5 U/µl 500 U SY550311P Silver Taq DNA Polymerase PLUS (1000U) Silver Taq PCR MIX (250rx) 5 U/µl 5 x 1000 U 1 ml, 250 rx w 20 µl SY550312P SY Silver Taq PCR MIX LOAD (250rx) 5 x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY syngen.pl

7 polimerazy DNA Gold Taq DNA Polymerase Gold Taq DNA Polymerase to rekombinowana termostabilna polimeraza Taq pochodząca z Thermus aquaticus. Odznacza się bardzo wysoką aktywnością katalizującą syntezę DNA w kierunku od 5' do 3' oraz brakiem aktywności egzonukleazowej w kierunku od 3' do 5'. Enzym dodaje do amplifikowanych fragmentów zakończenie poli-a, dzięki czemu nadają się one do bezpośredniego klonowania TA lub oczyszczania opartego o sondy oligo-dt. Bufor reakcyjny Gold optymalizuje przebieg reakcji, a zastosowanie (NH ) SO znacząco zwiększa specyficzność amplifikacji Warunki transportu i przechowywania: Polimerazy i miksy Gold są niewrażliwe na transport i okresowe przechowywanie w temperaturze pokojowej nawet do 30 dni. Miksy Gold można przechowywać do 6 miesięcy w warunkach chłodniczych +4 C, co ułatwia codzienną pracę. Długotrwałe przechowywanie produktów Gold przebiega w temperaturze -20 C. barwny wskaźnik dodania mastermiksu (wersja LOAD) gotowa do nakładania na żel bezpośrednio po reakcji (wersja LOAD) stabilność do 30 dni na stole dodatkowy chlorek magnezu ważne reakcje PCR klonowanie TA primer extension y uzupełniające dntp Mix, 10 mm, 1 ml SY dntp Set, 100mM, 4 400µl SY Woda PCR, 10 1,7 ml SY Woda PCR, 25 1,7 ml SY Woda PCR, 5 10 ml SY Synteza primerów str. 53 Stężenie Gold Taq DNA Polymerase (500U) 5 U/µl 500 U SY Gold Taq DNA Polymerase (1000U) 5 U/µl 1000 U SY Gold Taq DNA Polymerase (2000U) 5 U/µl 2000 U SY Gold Taq DNA Polymerase PLUS (500U) 5 U/µl 500 U SY550111P Gold Taq DNA Polymerase PLUS (1000U) Gold Taq PCR MIX (250rx) 5 U/µl 5 x 1000 U 1 ml, 250 rx w 20 µl SY550112P SY Gold Taq PCR MIX LOAD (250rx) 5 x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY kolumienki.pl 7

8 polimerazy DNA nastawianie reakcji w temperaturze pokojowej miejsce aktywne enzymu modyfikowane chemicznie barwny wskaźnik dodania mastermiksu (wersja LOAD) gotowa do nakładania na żel bezpośrednio po reakcji (wersja LOAD) rutynowe reakcje PCR hot start PCR klonowanie TA primer extension y uzupełniające Woda PCR, 10 1,7 ml SY Woda PCR, 25 1,7 ml SY Woda PCR, 5 10 ml SY Syngen Daily Agarose SY GreenDNA Gel Stain SY EtBr Gel Stain SY Synteza primerów str. 53 Silver Hot Start DNA Polymerase Silver Hot Start DNA Polymerase to rekombinowana termostabilna polimeraza Taq pochodząca z Thermus aquaticus. Odznacza się wysoką aktywnością katalizującą syntezę DNA w kierunku od 5' do 3' oraz brakiem aktywności egzonukleazowej w kierunku od 3' do 5'. Enzym dodaje do amplifikowanych fragmentów zakończenie poli-a, dzięki czemu nadają się one do bezpośredniego klonowania TA lub oczyszczania opartego o sondy oligo-dt. Polimeraza Silver Hot Start jest inaktywowana poprzez unikalną modyfikację chemiczną miejsca aktywnego, dzięki czemu wykazuje całkowitą nieaktywność w temperaturze pokojowej przed procesem standardowej aktywacji termicznej. Bufor reakcyjny Silver optymalizuje przebieg reakcji, a zastosowanie (NH ) SO znacznie zwiększa specyficzność amplifikacji. Transport polimeraz Silver przebiega w temperaturze pokojowej, a przechowywanie w temperaturze -20 C. Warianty Klasyczny PLUS MIX LOAD polimeraza w komplecie z buforem reakcyjnym i MgCl 2 zestaw zawiera dodatkowo dntp Mix 10 mm gotowy mastermiks reakcyjny miks zawiera bufor obciążający oraz barwniki żółty i niebieski migrujące w żelu przy ok. 40 bp i 4 kb Stężenie Silver Hot Start DNA Polymerase (500U) 5 U/µl 500 U SY Silver Hot Start DNA Polymerase (1000U) 5 U/µl 1000 U SY Silver Hot Start DNA Polymerase PLUS (500U) 5 U/µl 500 U SY550411P Silver Hot Start DNA Polymerase PLUS (1000U) 5 U/µl 1000 U SY550412P Silver Hot Start PCR MIX LOAD (250rx) 5 x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY syngen.pl

9 polimerazy DNA Gold Hot Start DNA Polymerase Gold Hot Start DNA Polymerase to rekombinowana termostabilna polimeraza Taq pochodząca z Thermus aquaticus. Odznacza się bardzo wysoką aktywnością katalizującą syntezę DNA w kierunku od 5' do 3' oraz brakiem aktywności egzonukleazowej w kierunku od 3' do 5'. Enzym dodaje do amplifikowanych fragmentów zakończenie poli-a, dzięki czemu nadają się one do bezpośredniego klonowania TA lub oczyszczania opartego o sondy oligo-dt. Polimeraza Gold Hot Start jest inaktywowana poprzez unikalną modyfikację chemiczną miejsca aktywnego, dzięki czemu wykazuje całkowitą nieaktywność w temperaturze pokojowej przed procesem standardowej aktywacji termicznej. Bufor reakcyjny Gold optymalizuje przebieg reakcji, a zastosowanie (NH ) SO znacznie zwiększa specyficzność amplifikacji. Warunki transportu i przechowywania: Polimerazy i miksy Gold są niewrażliwe na transport i okresowe przechowywanie w temperaturze pokojowej nawet do 30 dni. Miksy Gold można przechowywać do 6 miesięcy w warunkach chłodniczych +4 C, co ułatwia codzienną pracę. Długotrwałe przechowywanie produktów Gold przebiega w temperaturze -20 C. unikalny modyfikator GC do trudnych matryc nastawianie reakcji w temperaturze pokojowej miejsce aktywne enzymu modyfikowane chemicznie barwny wskaźnik dodania mastermiksu (wersja LOAD) gotowa do nakładania na żel bezpośrednio po reakcji (wersja LOAD) stabilność do 30 dni na stole ważne reakcje PCR hot start PCR klonowanie TA primer extension y uzupełniające dntp Mix, 10 mm, 1 ml SY dntp Set, 100mM, 4 400µl SY Blue Loading Dye SY Orange Loading Dye SY Stężenie Gold Hot Start DNA Polymerase (500U) 5 U/µl 500 U SY Gold Hot Start DNA Polymerase (1000U) 5 U/µl 1000 U SY Gold Hot Start DNA Polymerase PLUS (500U) 5 U/µl 500 U SY550211P Gold Hot Start DNA Polymerase PLUS (1000U) 5 U/µl 1000 U SY550212P Gold Hot Start PCR MIX LOAD (250rx) 5 x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY kolumienki.pl 9

10 real-time PCR gotowe mastermiksy miejsce aktywne enzymu modyfikowane chemicznie nastawianie reakcji w temperaturze pokojowej stabilność do 30 dni na stole zestaw QUANTUM Probe PCR Kit jest kompatybilny z każdym rodzajem sond zestaw QUANTUM EvaGreen PCR Kit zawiera nowoczesny barwnik większa czułość odczytu i wydajność reakcji Zestawy QUANTUM mastermiksy do real-time PCR QUANTUM Probe PCR Kit oraz QUANTUM EvaGreen PCR Kit to gotowe do użycia miksy do ilościowej reakcji PCR, zawierające wszystkie składniki reakcji w optymalnych stężeniach, poza matrycą, primerami/sondą i wodą. Zestawy zawierają Gold Hot Start Polymerase, rekombinowaną termostabilną polimerazę Taq pochodzącą z Thermus aquaticus, odznaczającą się bardzo wysoką aktywnością. Polimeraza Gold Hot Start jest inaktywowana poprzez unikalną modyfikację chemiczną miejsca aktywnego, dzięki czemu wykazuje całkowitą nieaktywność w temperaturze pokojowej przed procesem standardowej aktywacji termicznej. Aby ułatwić codzienną pracę zestawy QUANTUM są niewrażliwe na okresowe przechowywanie w temperaturze pokojowej do 30 dni. Warunki standardowego przechowywania to -20 C. Stężenie QUANTUM Probe PCR Kit (250rx) 5x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY QUANTUM Probe PCR Kit (1000rx) 5x 4 ml, 1000 rx w 20 µl SY QUANTUM Probe +ROX PCR Kit (250rx) 5x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY QUANTUM Probe +ROX PCR Kit (1000rx) 5x 4 ml, 1000 rx w 20 µl SY QUANTUM EvaGreen PCR Kit (250rx) 5x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY QUANTUM EvaGreen PCR Kit (1000rx) 5x 4 ml, 1000 rx w 20 µl SY QUANTUM EvaGreen +ROX PCR Kit (250rx) 5x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY QUANTUM EvaGreen +ROX PCR Kit (1000rx) 5x 4 ml, 1000 rx w 20 µl SY syngen.pl

11 real-time PCR QUANTUM Probe PCR Kit Zestaw QUANTUM Probe PCR Kit jest zoptymalizowany do ilościowej reakcji PCR z zastosowaniem sond. Podstawowe wykorzystanie zakłada reakcję prowadzoną w monopleksie oraz po wstępnej optymalizacji także w multipleksach. Zestawy QUANTUM Probe PCR są kompatybilne z każdym rodzajem sond oraz ze wszystkimi termocyklerami, zarówno płytkowymi, jak i rotorowymi, kapilarnymi i mikropłytkowymi. Wersja +ROX przeznaczona jest dla termocyklerów ze zmienną drogą optyczną, wykorzystujących pasywny barwnik ROX. ilościowy PCR multiplex PCR badanie ekspresji genów analiza SNP QUANTUM EvaGreen PCR Kit W zestawie QUANTUM EvaGreen PCR Kit zastosowano nowoczesny barwnik EvaGreen, który pozwala na uzyskanie wyższej czułości i lepszej wydajności reakcji, a także w zależności od wariantu barwnik ROX, wykorzystywany przez termocyklery ze zmienną drogą optyczną. Zestawy QUANTUM EvaGreen PCR są kompatybilne ze wszystkimi termocyklerami odczytującymi barwniki typu FAM i SYBR Green I, zarówno płytkowymi, jak i rotorowymi, kapilarnymi i mikropłytkowymi. ilościowy PCR badanie ekspresji genów badanie ekspresji mirna Warianty Klasyczny +ROX zestaw kompatybilny z termocyklerami niewymagającymi barwnika referencyjnego ROX, w tym: Bio-Rad CFX96, CFX384, Opticon, Opticon 2, Chromo 4, MiniOpticon, Roche LightCycler 1.5, 2.0, 480, Bioer LineGene 9600, 9600 Plus i K, Corbett Rotor-Gene 3000 i 6000, QIAGEN Rotor- Gene Q, Eppendorf MasterCycler ep realplex, Cepheid SmartCycler zestaw kompatybilny z termocyklerami wykorzystującymi barwnik referencyjny ROX, w tym: Bio-Rad icycler iq, MyiQ, iq5, ABI PRISM StepOne/Plus, GeneAmp 5700, ABI PRISM 7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900HT fast, ViiA 7, Stratagene Mx3000P, Mx3005P, Mx4000 y uzupełniające Synteza sond str. 53 Synteza primerów str. 53 Woda PCR, 10 1,7 ml SY Woda PCR, 25 1,7 ml SY Woda PCR, 5 10 ml SY kolumienki.pl 11

12 real-time PCR gotowy mastermiks nowoczesny barwnik EvaGreen większa czułość odczytu i wydajność reakcji nastawianie reakcji w temperaturze pokojowej miejsce aktywne enzymu modyfikowane chemicznie stabilność do 30 dni na stole analiza HRM badania SNP ilościowy PCR badanie ekspresji genów badanie ekspresji mirna badanie metylacji y uzupełniające Woda PCR, 10 1,7 ml SY Woda PCR, 25 1,7 ml SY Woda PCR, 5 10 ml SY Synteza primerów str. 53 QUANTUM EvaGreen HRM Kit QUANTUM EvaGreen HRM Kit to gotowy do użycia miks do analizy HRM poprzedzonej ilościową reakcją PCR. Kit zawiera wszystkie składniki reakcji w optymalnych stężeniach, poza matrycą, primerami i wodą. Zestaw wykorzystuje Gold Hot Start Polymerase, rekombinowaną termostabilną polimerazę Taq pochodzącą z Thermus aquaticus, odznaczającą się wysoką aktywnością. Polimeraza Gold Hot Start jest inaktywowana poprzez unikalną modyfikację chemiczną miejsca aktywnego, dzięki czemu wykazuje całkowitą nieaktywność w temperaturze pokojowej przed procesem standardowej aktywacji termicznej. Aby ułatwić codzienną pracę QUANTUM EvaGreen HRM Kit jest też niewrażliwy na okresowe przechowywanie w temperaturze pokojowej do 30 dni. Zestaw QUANTUM EvaGreen HRM Kit jest stosowany do analizy temperatury topnienia w wysokiej rozdzielczości, a także w standardowych ilościowych reakcjach PCR prowadzonych w termocyklerach niewykorzystujących barwnika referencyjnego ROX. W zestawie QUANTUM EvaGreen HRM Kit zastosowano nowoczesny barwnik EvaGreen, który pozwala na uzyskanie wyższej czułości i lepszej wydajności reakcji niż w przypadku standardowych barwników. Zestaw QUANTUM EvaGreen HRM jest kompatybilny ze wszystkimi termocyklerami odczytującymi HRM, zarówno płytkowymi, jak i rotorowymi, kapilarnymi i mikropłytkowymi. Stężenie QUANTUM EvaGreen HRM Kit (250rx) 5x 1 ml, 250 rx w 20 µl SY QUANTUM EvaGreen HRM Kit (1000rx) 5x 4 ml, 1000 rx w 20 µl SY syngen.pl

13 polimerazy specjalne Cloning DNA Polymerase Cloning DNA Polymerase to rekombinowana termostabilna polimeraza Pfu pochodząca z Pyrococcus furiosus. Enzym wykazuje wyjątkowo niski współczynnik popełnianych błędów podczas dołączania nukleotydów do powstającej nici DNA. Odznacza się wysoką aktywnością katalizującą syntezę DNA w kierunku od 5' do 3' oraz dodatkowo aktywnością egzonukleazową w kierunku od 3' do 5', tzw. proofreading. Enzym pozostawia amplifikowanym fragmentom tępe końce, dzięki czemu nadają się one do bezpośredniego klonowania. Bufor reakcyjny Cloning optymalizuje przebieg reakcji, a zastosowanie (NH ) SO zwiększa dodatkowo specyficzność amplifikacji. najniższy współczynnik błędów wśród polimeraz aktywność proofreading łatwe klonowanie na tępe końce klonowanie na tępe końce sekwencjonowanie Warianty Klasyczny polimeraza w komplecie z buforem reakcyjnym i MgSO 4 y uzupełniające dntp Mix, 10 mm, 1 ml dntp Set, 100mM, 4 400µl Woda PCR, 10 1,7 ml Woda PCR, 25 1,7 ml Woda PCR, 5 10 ml Synteza primerów Sekwencjonowanie SY SY SY SY SY str. 53 str. 52 Stężenie Cloning DNA Polymerase (500U) 5 U/µl 500 U SY Cloning DNA Polymerase (1000U) 5 U/µl 1000 U SY Cloning DNA Polymerase (2500U) 5 U/µl 2500 U SY kolumienki.pl 13

14 polimerazy specjalne namnażanie bardzo długich fragmentów, nawet do 40 kb long range PCR klonowanie T-A sekwencjonowanie Distance DNA Polymerase Distance DNA Polymerase to mieszanina dwóch rekombinowanych termostabilnych polimeraz Taq pochodzących z Thermus aquaticus. Odznacza się wysoką aktywnością katalizującą syntezę DNA w kierunku od 5' do 3' oraz brakiem aktywności egzonukleazowej w kierunku od 3' do 5'. Enzym dodaje do amplifikowanych fragmentów zakończenie poli-a, dzięki czemu nadają się one do bezpośredniego klonowania T-A lub oczyszczania opartego o sondy oligo-dt. Polimeraza Distance jest zoptymalizowana do amplifikacji długich fragmentów do 20 kb genomowego DNA i do 40 kb wirusowego DNA. Bufor reakcyjny Distance wspomaga namnażanie długich fragmentów i optymalizuje przebieg reakcji, a zastosowanie (NH ) SO znacząco zwiększa specyficzność amplifikacji y uzupełniające dntp Mix, 10 mm, 1 ml dntp Set, 100mM, 4 400µl Woda PCR, 10 1,7 ml Woda PCR, 25 1,7 ml Woda PCR, 5 10 ml Synteza primerów Sekwencjonowanie SY SY SY SY SY str. 53 str. 52 Warianty Klasyczny polimeraza w komplecie z buforem reakcyjnym i MgCl 2 Stężenie Distance DNA Polymerase (500U) 5 U/µl 500 U SY Distance DNA Polymerase (1000U) 5 U/µl 1000 U SY Distance DNA Polymerase (2500U) 5 U/µl 2500 U SY syngen.pl

15 odwrotna transkrypcja UniversalScript Reverse Transcriptase Syngen UniversalScript Reverse Transcriptase zawiera modyfikowaną genetycznie odwrotną transkryptazę M-MLV, będącą wysoce aktywną polimerazą DNA zależną od RNA. Enzym syntetyzuje komplementarną nić cdna na matrycy RNA, począwszy od specyficznego primera lub uniwersalnych primerów typu oligo-dt. Brak aktywności RNazy H pozwala na uzyskanie pełnowymiarowego cdna w dużej ilości. Bufor reakcyjny został tak skomponowany, aby zoptymalizować wydajność i specyficzność procesu RT. UniversalScript Reverse Transcriptase jest doskonała do rutynowych zastosowań takich jak badanie ekspresji genów z użyciem sond i barwników typu EvaGreen i SYBRGreen, półilościowe reakcje RT-PCR, analizy mikromacierzowe, a także znakowanie cdna. uniwersalne zastosowanie duża wydajność komplet gotowy do pracy bez dodatkowych zakupów (dot. wersji Kit) dodatkowy DTT synteza cdna mikromacierze znakowanie cdna analiza ekspresji genów Dla ułatwienia pracy UniversalScript Reverse Transcriptase jest mało wrażliwa na warunki zewnętrzne, co umożliwia jej transport w temperaturze pokojowej. Standardowe przechowywanie przebiega w temperaturze -20 C. Warianty Klasyczny odwrotna transkryptaza w komplecie z buforem reakcyjnym i DTT Kit zestaw zawiera dodatkowo dntp Mix, primery oligo-dt, inhibitory RNaz (opcja) y uzupełniające dntp Mix, 10 mm, 1 ml SY dntp Set,100mM,4 400µl SY Woda PCR, 10 1,7 ml SY Woda PCR, 25 1,7 ml SY Woda PCR, 5 10 ml SY Izolacja RNA str Synteza primerów str. 53 Stężenie UniversalScript Reverse Transcriptase (50rx) 200U/rx 50 rx SY UniversalScript Reverse Transcriptase (200rx) 200U/rx 200 rx SY UniversalScript RT Kit (50rx) 200U/rx 50 rx SY UniversalScript RT Kit (200rx) 200U/rx 200 rx SY kolumienki.pl 15

16 izolacja DNA proteinaza K w zestawie szybka i wydajna izolacja bardzo wysoka czystość wyizolowanego DNA gwarancja usunięcia inhibitorów reakcji PCR Materiał wyjściowy kultury komórkowe świeża lub mrożona krew surowica osocze płyny ustrojowe (np. płyn mózgowo-rdzeniowy) kożuszek limfocytarny wymazy PCR i real-time PCR analizy HLA NGS mikromacierze CGH badanie metylacji genotypowanie SNP badania farmakogenetyczne badania przesiewowe Southern blotting y uzupełniające Gold Taq Polymerase SY Gold Hot Start Polymerase SY QUANTUM Probe PCR Kit SY Syngen Blood/Cell DNA Kit Zestaw Syngen Blood/Cell DNA Kit służy do izolacji całkowitego DNA z różnorodnych próbek, takich jak świeża i mrożona krew, osocze, surowica, płyny ustrojowe (np. płyn mózgowo-rdzeniowy), kożuszek leukocytarny, hodowle komórkowe, czy wymazówki. Poza DNA genomowym, izolat zawiera także frakcję mitochondrialną, jak również wirusowe DNA. Wyizolowaniu ulegają fragmenty o długości do 50 kb, z przewagą fragmentów o długości kb. Wyizolowane DNA ma wysoki stopień czystości i może być użyte bezpośrednio do dalszych analiz, jak reakcje enzymatyczne z detekcją w czasie rzeczywistym, mikromacierze i inne procedury wymagające DNA wysokiej jakości. Specyfikacja Wielkość próbki Typowa wydajność Objętość elucji Typowa czystość Czas izolacji Mini 200 ul krwi lub płynów ustrojowych komórek 4-12 µg DNA z krwi µg z komórek µl A260/A280 = 1,7-1, minut Syngen Blood/Cell DNA Mini Kit (50) Syngen Blood/Cell DNA Mini Kit (100) Syngen Blood/Cell DNA Mini Kit (300) Syngen Blood/Cell DNA Maxi Kit (10) Syngen Blood/Cell DNA Maxi Kit (24) Maxi 50 izolacji 100 izolacji 300 izolacji 10 izolacji 24 izolacji 10 ml krwi lub płynów ustrojowych komórek µg DNA z krwi 1-2 ml A260/A280 = 1,7-1, minut SY SY SY SY SY syngen.pl

17 izolacja DNA Syngen Tissue DNA Kit Zestaw Syngen Tissue DNA Mini Kit służy do izolacji całkowitego DNA z różnorodnych próbek, takich jak tkanki świeże i mrożone, tkanki w bloczkach parafinowych i formalinie, bakterie G(+) i G(-), bakterie w wymazach i płynach ustrojowych, świeża i mrożona krew, osocze, surowica, kożuszek leukocytarny, hodowle komórkowe, wymazówki, drożdże i grzyby. Poza DNA genomowym, izolat zawiera także frakcję mitochondrialną, jak również wirusowe DNA. Wyizolowaniu ulegają fragmenty o długości do 50 kb, z przewagą fragmentów o długości kb. Aby ułatwić pracę zestaw został wyposażony w ręczne jednorazowe Homogenizatory H. Wyizolowane DNA ma wysoki stopień czystości i może być użyte bezpośrednio do dalszych analiz, jak reakcje enzymatyczne z detekcją w czasie rzeczywistym, mikromacierze i inne procedury wymagające DNA wysokiej jakości. Specyfikacja Wielkość próbki Typowa wydajność Objętość elucji Typowa czystość Czas izolacji Syngen Tissue DNA Mini Kit (50) Syngen Tissue DNA Mini Kit (100) Syngen Tissue DNA Mini Kit (300) 25 mg tkanki komórek 200 µl krwi lub płynów ustrojowych 1 cm mysiego ogonka grzybów/drożdży 5-50 µg DNA µl A260/A280 = 1,7-1, minut 50 izolacji 100 izolacji 300 izolacji SY SY SY homogenizatorki H oraz proteinaza K w zestawie duży wybór materiałów szybka i wydajna izolacja wysoka czystość DNA usunięcie inhibitorów PCR Materiał wyjściowy tkanki świeże i mrożone tkanki w bloczkach parafinowych i formalinie hodowle komórkowe świeża i mrożona krew surowica, osocze, płyny ustrojowe kożuszek limfocytarny bakterie G(+) i G(-) wymazy bakterie w wymazach i płynach ustrojowych PCR i real-time PCR genotypowanie SNP NGS mikromacierze CGH badania farmakogenetyczne analizy metylacyjne y uzupełniające Homogenizator H (100) SY Syngen Para fin-out Sol. SY kolumienki.pl 17

18 izolacja DNA kolumienki klarujące KL w zestawie wysoka czystość wyizolowanego DNA gwarancja usunięcia inhibitorów reakcji PCR brak konieczności używania rozpuszczalników organicznych Syngen Plant DNA Kit Zestawy Syngen Plant DNA Mini i Maxi służą do izolacji całkowitego DNA z tkanek roślinnych zarówno świeżych, jak i suszonych, liofilizowanych i mrożonych. Poza DNA genomowym, izolat zawiera także frakcję mitochondrialną, jak również plastydowe DNA (w tym chloroplastowe). Wyizolowaniu ulegają fragmenty o długości do 50 kb, z przewagą fragmentów długości kb. Zestaw został wyposażony w dodatkowe kolumienki klarujące KL, których zastosowanie zapobiega zatykaniu kolumny i zwiększa czystość otrzymanego DNA. Materiał wyjściowy świeże tkanki roślinne suszone tkanki roślinne hodowle in vitro Wyizolowane DNA ma wysoki stopień czystości i może być użyte bezpośrednio do dalszych analiz, jak reakcje enzymatyczne z detekcją w czasie rzeczywistym, mikromacierze i inne procedury wymagające DNA wysokiej jakości. PCR i real-time PCR multiplex PCR RAPD, RFLP, AFLP Specyfikacja Mini Maxi Southern blotting Wielkość próbki 100 mg tkanki świeżej 1 g tkanki świeżej 20 mg tkanki suszonej 100 mg tkanki suszonej Typowa wydajność 5-40 µg DNA µg DNA Objętość elucji µl µl Typowa czystość A260/A280 = 1,7-1,9 A260/A280 = 1,7-1,9 Czas izolacji minut minut y uzupełniające Gold Taq Polymerase SY Syngen Plant DNA Mini Kit (50) 50 izolacji SY Gold Hot Start Polymerase SY Syngen Plant DNA Mini Kit (100) 100 izolacji SY QUANTUM Probe PCR Kit SY Syngen Plant DNA Maxi Kit (10) 10 izolacji SY QUANTUM EvaGreen Kit SY Syngen Plant DNA Maxi Kit (24) 24 izolacji SY syngen.pl

19 izolacja DNA Syngen Fungi DNA Kit Zestaw Syngen Fungi DNA Mini służy do izolacji całkowitego DNA z komórek grzybów i drożdży. Poza DNA genomowym, izolat zawiera także frakcję mitochondrialną, jak również wirusowe DNA. Wyizolowaniu ulegają fragmenty o długości do 50 kb, z przewagą fragmentów długości kb. Zestaw został wyposażony w enzymy proteinazę i litykazę oraz w kulki szklane ułatwiające homogenizację. Zawiera też specjalne bufory do obróbki komórek grzybów i drożdży. Zastosowanie dodatkowych jednorazowych plastikowych Homogenizatorków H pomaga w izolacji DNA z twardych tkanek grzybów. Wyizolowane DNA ma wysoki stopień czystości i może być użyte bezpośrednio do dalszych analiz, jak reakcje enzymatyczne z detekcją w czasie rzeczywistym i inne procedury wymagające DNA wysokiej jakości. Specyfikacja Wielkość próbki Typowa wydajność Objętość elucji Typowa czystość Czas izolacji komórek grzybów komórek drożdży 5-50 µg DNA µl A260/A280 = 1,7-1, minut litykaza, proteinaza i kulki szklane w zestawie protokoły zoptymalizowane dla grzybów i drożdży bardzo wysoka czystość wyizolowanego DNA gwarancja usunięcia inhibitorów reakcji PCR Materiał wyjściowy kultury drożdżowe kultury grzybowe tkanki grzybów PCR, real-time PCR biotransformacje RAPD, RFLP y uzupełniające Homogenizator H (100) SY Probówki 1,5 ml (50) SY Syngen Fungi DNA Mini Kit (100) 100 izolacji SY Probówki 2,0 ml (100) SY kolumienki.pl 19

20 izolacja DNA kulki szklane w zestawie protokoły zoptymalizowane dla gleby brak konieczności używania rozpuszczalników organicznych gwarancja usunięcia inhibitorów reakcji PCR Materiał wyjściowy gleba Syngen Soil DNA Kit Zestawy Syngen Soil DNA Mini i Midi służą do izolacji całkowitego DNA z próbek gleby. Izolacji ulega całkowite DNA zawarte w glebie, pochodzące od organizmów wyższych i niższych, w tym bakterii i pierwotniaków, a także DNA wirusowe. Wyizolowaniu ulegają fragmenty o długości do 50 kb, z przewagą fragmentów długości kb. Wyizolowane DNA ma wysoki stopień czystości i może być użyte bezpośrednio do dalszych analiz, jak reakcje enzymatyczne z detekcją w czasie rzeczywistym, mikromacierze i inne procedury wymagające DNA wysokiej jakości. PCR i real-time PCR badania przesiewowe wykrywanie zakażeń Specyfikacja Mini Midi Wielkość próbki 0,2-1 g gleby 10 g gleby Typowa wydajność do 30 µg DNA do 300 µg DNA Objętość elucji µl 2 ml Typowa czystość A260/A280 = 1,7-1,9 A260/A280 = 1,7-1,9 Czas izolacji minut minut y uzupełniające Gold Taq Polymerase SY Gold Hot Start Polymerase SY QUANTUM Probe PCR Kit SY Syngen Soil DNA Mini Kit (50) 50 izolacji SY QUANTUM EvaGreen Kit SY Syngen Soil DNA Mini Kit (100) 100 izolacji SY Analiza żywności str. 49 Syngen Soil DNA Midi Kit (24) 24 izolacji SY syngen.pl