Nazwa modułu: Genetyka molekularna Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB-2-206-BN-s Punkty ECTS: 3 Wydział: Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej Kierunek: Inżynieria Biomedyczna Specjalność: Bionanotechnologie Poziom studiów: Studia II stopnia Forma i tryb studiów: Stacjonarne Język wykładowy: Polski Profil kształcenia: Ogólnoakademicki (A) Semestr: 2 Strona www: Osoba odpowiedzialna: prof. dr hab. Rokita Hanna (hanna.rokita@uj.edu.pl) Osoby prowadzące: prof. dr hab. Rokita Hanna (hanna.rokita@uj.edu.pl) dr Horwacik Irena (irena.horwacik@uj.edu.pl) mgr Durbas Małgorzata (malgorzata.durbas@uj.edu.pl) Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć Kod EKM Student, który zaliczył moduł zajęć wie/umie/potrafi Powiązania z EKK Sposób weryfikacji efektów kształcenia (forma zaliczeń) Wiedza M_W001 Student zna budowę i właściwości kwasów nukleinowych oraz mechanizmy syntezy, naprawy i rekombinacji DNA, mechanizmy kontroli potranskrypcyjnej ekspresji genów (składanie mrna, redagowanie, degradacja i interferencja RNA), proces translacji, budowę genomów i podstawowe metody ich badania oraz molekularne podstawy dziedziczenia. IB2A_W01, IB2A_W03, IB2A_W06 Kolokwium, Udział w dyskusji 1 / 6
M_W002 Zna technologie rekombinacji DNA (PCR, sekwencjonowanie DNA, klonowanie DNA, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, technologia macierzy i mikromacierzy DNA, PCR w czasie rzeczywistym, technologia irna), klonowanie zwierząt oraz podstawy genetyki molekularnej człowieka (choroby genetyczne, terapia genowa). IB2A_W01, IB2A_W03, IB2A_W06 Kolokwium, Udział w dyskusji M_W003 Student posiada praktyczną znajomość metod izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych, w tym izolacji plazmidowego DNA, technik transformacji bakterii wybranymi plazmidami, potrafi przeprowadzić elektroforetyczny rozdział RNA i DNA, potrafi posługiwać się enzymami restrykcyjnymi, zna podstawy hybrydyzacji kwasów nukleinowych oraz reakcji łańcuchowej polimerazy - PCR IB2A_W01, IB2A_W02, IB2A_W03, IB2A_W06 Kolokwium, Sprawozdanie, Udział w dyskusji, Zaliczenie Umiejętności M_U001 Student potrafi przedstawić budowę kwasów nukleinowych i ich biologię. Wie jakie metody stosuje się w badaniu procesów genetycznych. IB2A_U01, IB2A_U02, IB2A_U03, IB2A_U04, IB2A_U06, IB2A_U13 Kolokwium, Sprawozdanie, Wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych, Zaliczenie Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. Kompetencje społeczne M_K001 Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. IB2A_K01, IB2A_K03, IB2A_K04 Kolokwium, Sprawozdanie, Udział w dyskusji, Wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych, Zaliczenie M_K002 Student umie współpracować (w grupach 2-osobowych) w celu wykonania ćwiczenia w oparciu o instrukcję i pod nadzorem prowadzącego, potrafi analizować i ocenić przebieg ćwiczenia i uzyskane wyniki oraz przygotować raport z ćwiczeń IB2A_K01, IB2A_K03, IB2A_K04 Sprawozdanie, Udział w dyskusji, Wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych, Zaangażowanie w pracę zespołu, Zaliczenie M_K003 Student zapoznaje się z obsługą sprzętu laboratoryjnego używanego w czasie ćwiczeń i zasadami bezpiecznego wykonywania doświadczeń IB2A_K01, IB2A_K04 Sprawozdanie, Udział w dyskusji, Wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych Matryca efektów kształcenia w odniesieniu do form zajęć 2 / 6
Kod EKM Student, który zaliczył moduł zajęć wie/umie/potrafi Forma zajęć Wykład Ćwiczenia audytoryjne Ćwiczenia laboratoryjne Ćwiczenia projektowe Konwersatori um seminaryjne praktyczne terenowe warsztatowe Inne E-learning Wiedza M_W001 M_W002 M_W003 Umiejętności Student zna budowę i właściwości kwasów nukleinowych oraz mechanizmy syntezy, naprawy i rekombinacji DNA, mechanizmy kontroli potranskrypcyjnej ekspresji genów (składanie mrna, redagowanie, degradacja i interferencja RNA), proces translacji, budowę genomów i podstawowe metody ich badania oraz molekularne podstawy dziedziczenia. Zna technologie rekombinacji DNA (PCR, sekwencjonowanie DNA, klonowanie DNA, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, technologia macierzy i mikromacierzy DNA, PCR w czasie rzeczywistym, technologia irna), klonowanie zwierząt oraz podstawy genetyki molekularnej człowieka (choroby genetyczne, terapia genowa). Student posiada praktyczną znajomość metod izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych, w tym izolacji plazmidowego DNA, technik transformacji bakterii wybranymi plazmidami, potrafi przeprowadzić elektroforetyczny rozdział RNA i DNA, potrafi posługiwać się enzymami restrykcyjnymi, zna podstawy hybrydyzacji kwasów nukleinowych oraz reakcji łańcuchowej polimerazy - PCR + - - - - - - - - - - 3 / 6
M_U001 Student potrafi przedstawić budowę kwasów nukleinowych i ich biologię. Wie jakie metody stosuje się w badaniu procesów genetycznych. Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. Kompetencje społeczne M_K001 M_K002 M_K003 Wobec ciągłego aktualizowania się wiedzy w zakresie przedmiotu student rozumie potrzebę ciągłego uczenia się. Student umie współpracować (w grupach 2-osobowych) w celu wykonania ćwiczenia w oparciu o instrukcję i pod nadzorem prowadzącego, potrafi analizować i ocenić przebieg ćwiczenia i uzyskane wyniki oraz przygotować raport z ćwiczeń Student zapoznaje się z obsługą sprzętu laboratoryjnego używanego w czasie ćwiczeń i zasadami bezpiecznego wykonywania doświadczeń - - + - - - - - - - - - - + - - - - - - - - Treść modułu zajęć (program wykładów i pozostałych zajęć) Wykład Genetyka molekularna 1.Budowa DNA i chromosomów 2 godz. 2.Transkrypcja genów 4 godz. 3.Translacja 2 godz. 4.Replikacja DNA 2 godz. 5.Regulacja ekspresji genów u Prokaryota i Eukaryota 4 godz. 6.Genomy prokariotyczne 1 godz. 7.Genom człowieka 1 godz. 8.Mutacje DNA i naprawa DNA 2 godz. 9.Rekombinacja DNA 2 godz. 10.Technologia rekombinacji DNA (PCR, sekwencjonowanie DNA, klonowanie DNA, hybrydyzacja kwasów nukleinowych, technologia macierzy i mikromacierzy DNA, PCR w czasie rzeczywistym, technologia irna) 6 godz. 11.Klonowanie zwierząt 2 godz. 12.Genetyka człowieka (choroby genetyczne, terapia genowa) 2 godz. 4 / 6
Ćwiczenia laboratoryjne Laboratoria 1.Metody izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych. Izolacja RNA 4 godz. 2.Ilościowe oznaczanie i elektroforetyczny rozdział RNA 5 godz. 3.Izolacja plazmidowego DNA 4 godz. 4.Enzymy restrykcyjne. Elektroforeza DNA 5 godz. 5.Wektory pro- i eukariotyczne. Przygotowanie kompetentnych bakterii 4 godz. 6.Transformacja bakterii wybranymi plazmidami 4 godz. 7.Hybrydyzacja kwasów nukleinowych. PCR- reakcja łańcuchowa polimerazy 4 godz. Sposób obliczania oceny końcowej Metody sprawdzania i kryteria oceny efektów kształcenia: Wykład kolokwium zaliczeniowe Laboratoria prawidłowe wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych. 3 pisemne sprawdziany, prawidłowe przygotowanie sprawozdań z ćwiczeń laboratoryjnych. Warunki zaliczenia: Wykład pozytywna ocena z kolokwium zaliczeniowego. Laboratoria wykonanie ćwiczeń laboratoryjnych, pozytywna ocena z trzech sprawdzianów pisemnych, zaliczenie sprawozdań. Ocena końcowa jest średnią z ocen ze sprawdzianów pisemnych. Wymagania wstępne i dodatkowe Podstawowa wiedza w zakresie biochemii i chemii. Zalecana literatura i pomoce naukowe Wykaz literatury do wykładów: 1. Genetyka, PC. Winter, GI. Hickey, HL. Fletcher, tłumaczenie pod red. W. Prus-Głowackiego: Krótkie wykłady, wydanie drugie poprawione, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2006. 2. Podstawy biologii komórki: wprowadzenie do biologii molekularnej, B. Alberts i in., Wydawnictwo Naukowe PWN, 2005. 3. Genomy, TA. Brown, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2009. 4. Molecular biology of the gene, JD Watson I in., wyd. 5, CSHL Press, 2004, wyd. 6, 2008. Wykaz literatury do : 1. Podstawowe techniki biologii molekularnej i biotechnologii, M. Bugno, H. Rokita, red., Seria Wydawnicza UJ, 1999. 2.Analiza DNA. Teoria i praktyka. Pod red. Ryszarda Słomskiego, Wyd. Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, 2011. 3. Molecular cloning. A laboratory manual. J. Sambrook, E.F. Fritsch, T. Maniatis, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2nd ed., 1989. Publikacje naukowe osób prowadzących zajęcia związane z tematyką modułu Nie podano dodatkowych publikacji Informacje dodatkowe odbywają się w wyłacznie w semestrze letnim (do wyboru semestr 1 lub 3). Ćwiczenia laboratoryjne obywają się w blokach 4-5 godzinnych. 5 / 6
Nakład pracy studenta (bilans punktów ECTS) Forma aktywności studenta Samodzielne studiowanie tematyki zajęć Egzamin lub kolokwium zaliczeniowe Udział w ćwiczeniach laboratoryjnych Przygotowanie do zajęć Przygotowanie sprawozdania, pracy pisemnej, prezentacji, itp. Sumaryczne obciążenie pracą studenta Punkty ECTS za moduł Obciążenie studenta 40 godz 31 godz 30 godz 10 godz 9 godz 120 godz 3 ECTS 6 / 6