Znaczenie genu ETV6 w hematopoezie i leukemogenezie
|
|
- Kacper Marciniak
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Borgis Med Rodz 2016; 19(4): Katarzyna Osmańska 1, Ewelina Łazarczyk 1, Barbara Mucha 1, Sylwia Stąpor 2 Znaczenie genu ETV6 w hematopoezie i leukemogenezie The significance of ETV6 gene in hematopoiesis and leukemogenesis 1 Katedra i Zakład Genetyki Klinicznej, Wydział Lekarski, Uniwersytet Mikołaja Kopernika Collegium Medicum w Bydgoszczy 2 Katedra i Klinika Hematologii, Nowotworów Krwi i Transplantacji Szpiku, Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu Keywords TEL(ETV6), AML1(RUNX1), fusion gene, leukemogenesis, ALL Summary Chromosomal aberrations and gene mutations play important role in hematological malignancies. Translocations involving 12p13 region are one of the most commonly observed chromosomal abnormalities in leukemias, myelodysplastic syndromes and myeloproliferative neoplasms. ETV6 (ETS translocation variant gene 6) gene, located in 12p13 band, is a member of ETS (E26 transformation-specific) transcription factors family. Members of ETS family are involved in angiogenesis and hematopoiesis, as well as growth and differentiation of cells. ETV6 is a strong transcriptional repressor, in which three domains can be distinguished: HLH (helix- -loop-helix), ETS and internal domain. 48 chromosomal bands involved in ETV6 translocations, insertions and inversions have been found so far. Moreover, 30 ETV6 partner genes have been revealed. They belong to different classes: receptor and non-receptor tyrosine kinase genes, transcription factor genes, homeobox genes and others. ETV6-RUNX1 (TEL-AML1) is the most common ETV6 rearrangement. It results from t(12;21)(p13;q22). Wstęp Do głównych zadań układu krwiotwórczego należy stałe wytwarzanie elementów morfotycznych krwi. Aby komórki krwi wytwarzane w procesie hematopoezy mogły wypełniać swoją rolę, potrzebnych jest wiele czynników, m.in. prawidłowa funkcja genomu. Białaczki są chorobami rozrostowymi, nowotworowymi, których przyczyna nie jest jednoznacznie określona. Ich cechą charakterystyczną jest klonalny rozrost wielopotencjalnej komórki macierzystej. Obecnie stosowaną klasyfikacją nowotworów układu krwiotwórczego jest klasyfikacja WHO z 2008 roku. Ważną rolę w nowotworach hematologicznych odgrywają aberracje chromosomowe i mutacje genowe. Pierwszą zidentyfikowaną aberracją chromosomową była zrównoważona wzajemna translokacja pomiędzy chromosomami par 9 i 22 [t(9;22)(q34;q11.2)], skutkująca powstaniem dwóch genów fuzyjnych BCR-ABL na der(22) oraz ABL-BCR na der(9), opisana w roku 1960 przez Petera Nowella i Davida Hungerforda. W kolejnych latach odkryto wiele innych translokacji, wyznaczających fenotyp komórek białaczkowych i przebieg kliniczny określonego typu białaczki (1). Translokacje angażujące region 12p13 są jednymi z najczęściej obserwowanych zmian chromosomowych w białaczkach i zespołach mielodysplastycznych. W regionie tym znajduje się gen ETV6 (ang. ETS-translocation variant gene 6), należący do rodziny czynników transkrypcyjnych ETS (ang. E26 transformation-specific), do której zalicza się aktywatory i represory transkrypcji. ETV6 bierze udział w angiogenezie, prawidłowym przebiegu hematopoezy, a także w procesie wzrostu i różnicowania się komórek. Jest także zaangażowany w różnorodne rearanżacje prowadzące do rozwoju nowotworów układu krwiotwórczego. Wysoka częstość, z jaką gen ETV6 angażowany jest w procesy leukemogenezy, wynika z dużej liczby genów partnerskich, przy współudziale których doprowadza on do transformacji komórek prawidłowych w komórki białaczkowe (2-4). Charakterystyka genu ETV6 Gen ETV6 zlokalizowany jest na chromosomie 12, w regionie p13.1 (1, 3, 5). Odkrywcami genu byli Golub i Gilliland, którzy w 1994 roku ogłosili wyniki swoich badań nad 223
2 Katarzyna Osmańska i wsp. translokacją t(5;12)(q33;p13). W wyniku tej translokacji, która opisana została po raz pierwszy u chorego cierpiącego na przewlekłą białaczkę mielomonocytową (ang. chronic myelomonocytic leukemia CMML), dochodzi do powstania genu fuzyjnego ETV6-PDGFRβ (3). Pierwotnie gen ETV6 nosił nazwę TEL (ang. translocation ETS leukemia). Później, aby uniknąć niejasności (skrót tel używa się do określenia telomerów chromosomów), zmieniono jego nazwę na ETV6. Obecnie w literaturze częściej stosowana jest nowsza nazwa (1, 3, 6). ETV6 należy do rodziny czynników transkrypcyjnych ETS. Białka ETS zostały po raz pierwszy opisane w ptasim wirusie erytroblastozy E26. Rodzina tych białek uważana jest za jedną z największych rodzin czynników transkrypcyjnych, o zróżnicowanych funkcjach. Można w niej wyróżnić zarówno aktywatory, jak i represory transkrypcji. Genami docelowymi rodziny ETS są geny odpowiedzialne za procesy różnicowania, proliferacji, hematopoezy, apoptozy, angiogenezy i nabywania przez komórki właściwości inwazyjnych (1, 4, 7). ETV6 zbudowany jest z ośmiu eksonów, których łączna długość wynosi ok. 40 kpz (kpz kilo par zasad = tysiąc par zasad) (8). Eksony 3 i 4 kodują domenę HLH (ang. helix-loop- -helix helisa-pętla-helisa), zwaną inaczej domeną B. Domena ETS (domena wiążąca DNA) kodowana jest przez eksony 6, 7 i 8. Źródła literaturowe wyróżniają dodatkowo domenę wewnętrzną (ang. internal domain), kodowaną przez ekson 5. Pierwsze dwa introny genu, mierzące 100 i 82 kpz, są najdłuższymi intronami w całym genie. Długość pozostałych pięciu intronów (od intronu 3 do 7) waha się w granicach 1,3-15 kpz. Sekwencja zwana wyspą CpG zlokalizowana jest na końcu 5 genu (ryc. 1). Obecność sekwencji tego typu w formie niezmienionej (niezmetylowanej) jest istotna dla ekspresji genu (1, 9). Najbardziej zbliżony do genu ETV6 pod względem budowy jest gen ETS1 (ang. v-ets erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1 (avian)), należący do tej samej rodziny czynników transkrypcyjnych. Obydwa geny zbudowane są z ośmiu eksonów i mają długi pierwszy intron (10). Ryc. 1. Struktura genu oraz białka ETV6. GEN prostokąty oznaczają kolejne eksony (od 1 do 8). Odcinki proste oznaczają introny. Poszczególne eksony kodujące odpowiednie domeny (eksony 3 i 4 domena HLH; ekson 5 domena wewnętrzna, eksony 6, 7 i 8 domena ETS) oznaczono różnymi teksturami. BIAŁKO poszczególne domeny (domena HLH, domena wewnętrzna oraz domena ETS) oznaczono różnymi teksturami (analogicznie do oznaczeń zastosowanych do eksonów je kodujących). Liczby 1, 43 i 452 oznaczają kolejne aminokwasy w strukturze białka Struktura białka ETV6 Na białko ETV6 składają się 452 aminokwasy. ETV6 jest jądrową fosfoproteiną, której ekspresja zachodzi w zdrowych tkankach pochodzących z układu krwiotwórczego i spoza tego układu, jak również w wielu nowotworach. W obrębie ETV6 znajdują się trzy miejsca fosforylacji kinaz aktywowanych mitogenami (ang. mitogen activated protein kinase MAPK; kinazy aktywowane mitogenami). Końce 5 i 3 białka ETV6 zbudowane są analogicznie do końców pozostałych białek z rodziny ETS. Fosfoproteina ETV6 może występować w komórkach w jednej z dwóch izoform. Masy cząsteczkowe izoform wynoszą odpowiednio 50 i 57 kda. Izoformy ETV6 powstają na drodze alternatywnego splicingu pre-mrna mechanizmu zwiększającego różnorodność białek. Izoforma o masie 57 kda zawiera o 42 aminokwasy więcej od izoformy krótszej. Jest to wynik obecności dwóch kodonów startowych: Met1 i Met43. Pierwszy kodon startowy zlokalizowany jest na początku genu w obrębie eksonu 1a. Natomiast drugi, alternatywny kodon startowy znajduje się na początku eksonu 1b zlokalizowanego tuż przed eksonem 3. Rozpoczęcie translacji od drugiego kodonu startowego prowadzi do utraty jednego z miejsc fosforylacji MAPK, zlokalizowanego w obrębie dwudziestego drugiego aminokwasu kodującego serynę (Ser22). Różna liczba miejsc fosforylacji MAPK w poszczególnych izoformach jest odpowiedzialna za różnice w ich aktywności (2, 11). Domeny HLH i ETS, występujące w białku ETV6, są charakterystyczne dla białek z rodziny ETS. Domena HLH zlokalizowana jest w regionie N-terminalnym ETV6, a jej obecność jest powszechna w białkach wiążących DNA. Domena ta odpowiada za powstawanie homo- albo heterodimerów z innymi białkami ETS (np. FLI1 ang. friend leukemia virus integration 1 białko uczestniczące w erytropoezie). Domenę znajdującą się w regionie C-terminalnym stanowi domena ETS, której zadaniem jest wiązanie specyficznych sekwencji DNA oraz interakcje białko-białko. Pomiędzy domenami HLH i ETS zlokalizowana jest domena wewnętrzna (1). Funkcja genu ETV6 i białka ETV6 ETV6 należy do silnych represorów transkrypcji genów. Odpowiada za wiązanie białek na drodze deacetylacji histonów. Jest to możliwe dzięki domenie HLH oraz domenie wewnętrznej (1, 6). Białko ETV6 odgrywa kluczową rolę w rozwoju embrionalnym i regulacji hematopoezy. Odpowiada za powstawanie naczyń krwionośnych w pęcherzyku żółtkowym oraz za przeżycie różnych typów komórek w rozwijającym się zarodku. Zarodki mysie bez prawidłowego genu ETV6 (ETV6 / ) obumierały między 10. a 11. dniem rozwoju embrionalnego. Stwierdzono w nich zaburzenia angiogenezy w woreczku żółtkowym oraz apoptozę komórek mezenchymalnych i nerwowych. Nie stwierdzono natomiast zaburzeń w przebiegu samej hematopoezy (1, 10). Stąd wniosek, że we wczesnym rozwoju embrionalnym 224
3 Znaczenie genu ETV6 w hematopoezie i leukemogenezie gen ETV6 niezbędny jest w procesie angiogenezy w pęcherzyku żółtkowym. Rearanżacje w obrębie tego genu powodują uszkodzenie pęcherzyka żółtkowego, zaburzenia w rozwoju mezenchymy i śmierć komórek nerwowych. Defekty wywołane rearanżacjami genu ETV6 wskazują na jego rolę w tworzeniu sieci naczyń krwionośnych pęcherzyka żółtkowego i w przeżyciu wybranych linii komórkowych (12). Ekspresja tego genu nie jest natomiast niezbędna w przebiegu hematopoezy w woreczku żółtkowym i w wątrobie, lecz dopiero w procesie hematopoezy w szpiku kostnym. Zmutowany gen ETV6 uniemożliwia przeniesienie procesu hematopoezy z wątroby do szpiku kostnego, powodując tym samym zahamowanie rozwoju układu krwiotwórczego (1, 12). Do prawidłowego przebiegu hematopoezy potrzebna jest konstytutywna ekspresja genu ETV6. Nie jest on głównym regulatorem tego procesu, ale odpowiada za przeżycie hematopoetycznych komórek macierzystych (ang. hematopoietic stem cells HSCs). Dzięki temu reguluje liczbę komórek o ustalonej liczbie podziałów. ETV6 uczestniczy w późnym rozwoju linii komórkowej megakariocytów. Angażuje się w regulację transkrypcji wcześniej rozpoczętej megakariopoezy i wiąże się z promotorami megakariocytów poprzez domenę ETS (13). Rearanżacje angażujące gen ETV6 Rearanżacje regionu 12p13 są częstymi zmianami genetycznymi, zarówno w nowotworach układu krwiotwórczego, jak i rakach piersi, płuc, jajnika i prostaty (3, 14, 15). Rearanżacje z udziałem genu ETV6 są jednym z ciekawszych przykładów aberracji w hematoonkologii, z uwagi na zidentyfikowanie dużej liczby partnerów translokacyjnych tego genu (podobnie jak w przypadku genów KMT2A i RUNX1) (1, 16). Znaleziono dotychczas 48 regionów chromosomowych zaangażowanych w translokacje, insercje i inwersje obejmujące gen ETV6. Zidentyfikowano także 30 genów partnerskich tego genu (1). Partnerami fuzyjnymi genu ETV6 są geny z różnych grup funkcjonalnych i strukturalnych. Wśród nich wyróżnić można: geny receptorowych kinaz tyrozynowych (m.in. PDGFRB, NTRK3, FLT3), geny niereceptorowych kinaz tyrozynowych (m.in. ABL1, ABL2, JAK2), geny czynników transkrypcyjnych (m.in. RUNX1, MN1, EVI1), geny homeoboksowe (m.in. CDX2, PAX5, MNX1) oraz geny niesklasyfikowane w żadnej z powyższych grup (m.in. CHIC2, MDS2, TTL) (1, 3, 17). Analiza fuzji ETV6 wykazała, że w nowo powstały gen mogą być zaangażowane różne regiony tego genu. W fuzję zaangażowany może być zarówno region 5, jak i region 3 genu ETV6. W zależności od punktu złamania w obrębie ETV6, eksony kodujące domeny HLH i ETS mogą wchodzić w skład genu fuzyjnego bądź też zostać z niego usunięte. W konsekwencji funkcjonalność genów fuzyjnych, w które zaangażowany jest ETV6, może być różna. W przypadku fuzji z genami receptorowych bądź niereceptorowych kinaz tyrozynowych punkt złamania genu ETV6 znajduje się w regionie 3, pomiędzy intronami 4 i 7. Natomiast jeżeli genami partnerskimi są geny z innych grup, złamanie ETV6 w większości przypadków następuje w regionie 5, pomiędzy intronami 1 i 3. Tak więc ETV6 może stanowić element transkryptów różnego typu, prowadzących do leukemogenezy (1). Fuzja ETV6-RUNX1 najczęstsza rearanżacja genu ETV6 Najczęstszą rearanżacją genu ETV6 jest fuzja ETV6- -RUNX1 (TEL-AML1), powstająca w wyniku submikroskopowej translokacji t(12;21)(p13;q22). Występuje ona głównie u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną (ang. acute lymphoblastic leukemia ALL). ETV6-RUNX1 występuje u około 20-25% dzieci z ALL i kojarzy się z dobrym rokowaniem, jeśli występuje jako izolowana aberracja w co najmniej 50-80% komórek (18, 19). Obecność ETV6-RUNX1 jest najczęściej stwierdzana u dzieci między 1. a 12. rokiem życia, zwłaszcza w wieku 2-5 lat. Natomiast obecności tego genu fuzyjnego nie stwierdza się prawie w ogóle u niemowląt i u dorosłych z ALL (pojedyncze opisane przypadki) (20-22). Budowa genu RUNX1 Gen RUNX1 (ang. runt-related transcription factor 1) zlokalizowany jest na długim ramieniu chromosomu 21 (21q22.12). Gen ten, znany również pod nazwami AML1 i CBFA2, ma długość ponad 261 kpz. RUNX1 ulega ekspresji we wszystkich liniach komórkowych układu krwiotwórczego i poprzez białko RUNX1 reguluje m.in. ekspresję genów takich jak gen czynnika stymulującego powstanie kolonii granulocytarno-makrofagowych (GM- -CSF), gen interleukiny 3 (IL-3), gen receptora β limfocytów T (TCRB) i gen peroksydazy krwinek białych (MPO). Jego obecność jest niezbędna w embriogenezie do powstawania HSCs. Na N-końcu białka RUNX1 zlokalizowana jest, zbudowana ze 118 aminokwasów, domena RUNT, która wchodzi w interakcje z DNA. Domena RUNT jest homologiem sekwencji Runt występującej u Drosophila, dlatego w literaturze funkcjonuje też jej inna nazwa RHD (ang. runt homology domain). Natomiast na C- końcu znajduje się domena transaktywująca TA. RUNX1 należy do genów najczęściej ulegających mutacjom lub rearanżacjom w ludzkich białaczkach. Po raz pierwszy został zidentyfikowany jako składnik fuzji z genem ETO (RUNX1T1), powstającej w wyniku translokacji t(8;21) (q22;q22) w ostrej białaczce szpikowej (8, 23, 24). Analiza molekularna genu fuzyjnego ETV6-RUNX1 W badaniach molekularnych analizujących fuzję ETV6- -RUNX1 zlokalizowano miejsce złamania genu ETV6 w obrębie fragmentu o długości 15 kb, pomiędzy eksonami 5 i 6. Opisano tylko dwa przypadki innej lokalizacji, w intronie 4 (5, 21). Złamania genu RUNX1 lokalizują się albo w intronie 1 (pomiędzy eksonami 1 i 2), albo w intronie 2. Rezultatem translokacji t(12;21) jest fuzja końca 5 genu 225
4 Katarzyna Osmańska i wsp. ETV6 z prawie całym genem RUNX1. Na białko fuzyjne składają się domeny: domena HLH, domena wewnętrzna (obydwie z białka ETV6) oraz domena RHD i domena TA (domeny z białka RUNX1) (ryc. 2). Ekspresja genu ETV6-RUNX1 jest zależna od promotora ETV6. W większości przypadków długość transkryptu jest wynikiem połączenia eksonu 5 (nukleotyd 1033) genu ETV6 i eksonu 2 (nukleotyd 503) genu RUNX1. Zdarzają się przypadki, w których na skutek zajścia alternatywnego splicingu omijany jest ekson 2 genu RUNX1 i powstaje krótszy transkrypt. W tym wariancie, który powstaje zdecydowanie rzadziej, następuje połączenie eksonu 5 genu ETV6 z eksonem 3 genu RUNX1. Chory z t(12:21) może mieć obydwa transkrypty jednocześnie (1, 8, 25). Uważa się, że sam wyżej przedstawiony gen fuzyjny nie jest wystarczający do zapoczątkowania ALL. U około 1-2% zdrowych noworodków stwierdza się obecność transkryptu ETV6-RUNX1, a tylko u 1% z nich rozwija się ALL. Potwierdzają to także badania na bliźniętach monozygotycznych, u których fuzja ETV6-RUNX1 powstała w okresie życia Ryc. 2. Struktura białka fuzyjnego ETV6-RUNX1. ETV6 poszczególne domeny: domena HLH, domena wewnętrzna oraz domena ETS oznaczono różnymi teksturami (analogicznie do ryciny 1). RUNX1 domena RHD oraz domena TA oznaczone zostały różnymi teksturami. ETV6-RUNX1 poszczególne tekstury oznaczają odpowiednie domeny białek ETV6 i RUNX1. Strzałki wskazują punkty złamań na poziomie genu prenatalnego. Okres utajenia choroby u każdego z bliźniąt był różny, co wskazywałoby na udział postnatalnego czynnika wymaganego w indukcji białaczki. Przypuszczalnie ETV6-RUNX1 generuje powstanie klonalnych komórek przedbiałaczkowych, które mogą nie ujawniać się klinicznie przez wiele lat (25-27). Zmiany genetyczne towarzyszące t(12;21)(p13;q22) U 83% chorych z ALL, mających translokację t(12;21) (p13;q22), stwierdza się obecność dodatkowych aberracji chromosomowych. Zmiany te dostarczają istotnych informacji na temat rozwoju choroby i stanowią ważny czynnik prognostyczny. Do najczęstszych wtórnych aberracji zalicza się: delecję krótkiego ramienia niezaangażowanego w translokację chromosomu 12 u 70% pacjentów, dodatkowe kopie genu RUNX1 u 23% pacjentów i dodatkowy chromosom pochodny der(21)t(12;21) u 10% pacjentów. Więcej niż jedna dodatkowa aberracja jest obserwowana u 20% pacjentów (8, 27, 28). Poza ww. zmianami spotyka się wiele innych wtórnych aberracji: monosomie (-18, -10), trisomie (+4, +5, +6, +14, +17, +18, +20), delecje [(del(3)(q26), del(6)(q23)], translokacje [t(1;3)(p34;p21), t(2;14)(p11;q32)] oraz chromosomy markerowe. Translokacja t(12;21)(p13;q22) może mieć również postać translokacji wariantowej, z zaangażowaniem dodatkowych chromosomów, np. t(3;12;21), t(4;12;21;16), t(6;12;21) (27, 29-31). Podsumowanie Gen ETV6, którego produkt białkowy jest silnym represorem transkrypcji, jest jednym z kluczowych genów w przebiegu hematopoezy. Uważa się, że jest on bardzo często zaangażowany w proces leukemogenezy, głównie z uwagi na dużą liczbę genów partnerskich, z którymi wchodzi w rearanżacje. Dalsze badania pozwolą na identyfikację kolejnych genów partnerskich i pomogą pogłębić wiedzę na temat roli, jaką gen ETV6 odgrywa w procesie leukemogenezy. Konflikt interesów Conflict of interest Brak konfliktu interesów None Piśmiennictwo 1. de Braekeleer E, Douet-Guibert N, Morel F et al.: ETV6 fusion genes in hematological maligancies: A review. Leuk Res 2012; 36: Bohlander SK: ETV6: A versatile player in leukemogenesis. Semin Cancer Biol 2005; 15: Haferlach C, Bacher U, Schnittger S et al.: ETV6 rearrangements are recurrent in myeloid malignancies and are frequently associated with other genetic events. Genes Chromosomes Cancer 2012; 51: Kralik JM, Kranewitter W, Boesmueller H et al.: Characterization of a newly identified ETV6-NTRK3 fusion transcript in acute myeloid leukemia. Diagn Pathol 2011; 6: Zaliova M, Meyer C, Cario G et al.: TEL/AML1-positive patients lacking TEL exon 5 resemble canonical TEL/AML1 cases. Pediatr Blood Cancer 2011; 56: Barjesteh van Waalwijk van Doorn- -Khosrovani S, Spensberger D, de Knegt Y et al.: Somatic heterozygous mutations in ETV6 (TEL) and frequent absence of ETV6 protein in acute myeloid leukemia. Oncogene 2005; 24: Lesiak K, Sztiller-Sikorska M, Czyż M: Czynniki transkrypcyjne w powstawaniu i progresji czerniaka. Postepy Hig Med Dosw 2007; 61: Sawińska M, Ładoń D: Mechanism, detection and clinical significance 226
5 Znaczenie genu ETV6 w hematopoezie i leukemogenezie Adres do korespondencji Katarzyna Osmańska Katedra i Zakład Genetyki Klinicznej Wydział Lekarski Uniwersytet Mikołaja Kopernika Collegium Medicum w Bydgoszczy ul. Marii Skłodowskiej-Curie Bydgoszcz tel. +48 (52) kosmanska@wp.pl nadesłano: zaakceptowano do druku: of the reciprocal translocation t(12;21)(p12;q22) in the children suffering from acute lymphoblastic leukaemia. Leuk Res 2004; 28: Eguchi-Ishimae M, Eguchi M, Maki K et al.: Leukemia-related transcription factor TEL/ETV6 expands erythroid precursors and stimulates hemoglobin synthesis. Cancer Sci 2009; 100: Beans M, Peeters P, Guo C et al.: Genomic organization of TEL: the human ETS- -variant gene 6. Genome Res 1996; 6: van Rompaey L, Potter M, Adams C, Grosveld G: Tel induces a G1 arrest and suppresses Ras-inducted transformation. Oncogene 2000; 19: Wang LC, Swat W, Fujiwara Y et al.: The TEL/ ETV6 gene is required specifically for hematopoiesis in bone marrow. Genes Dev 1998; 12: Hock H, Meade E, Medeiros S et al.: Tel/Etv6 is an essential and selective regulator of adult hematopoietic stem cell survival. Genes Dev 2004; 18: Montpetit A, Wilson MD, Chevrette M et al.: Analysis of the conservation of synteny between Fugu and human chromosome 12. BMC Genomics 2003; 4: Deves C, Renck D, Garicochea B et al.: Analysis of select members of the E26 (ETS) transcription factors family in colorectal cancer. Virchows Arch 2011; 458: Nand R, Bryke C, Kroft SH et al.: Myeloproliferative disorder with eosinophilia and ETV6-ABL gene rearrangement: Efficacy of second-generation tyrosine kinase inhibitors. Leuk Res 2009; 33: Gancheva K, Virchis A, Howard-Reeves J et al.: Myeloproliferative neoplasm with ETV6-ABL1 fusion: a case report and literature review. Mol Cytogenet 2013; 6: Gandemer V, Rio AG, de Tayrac M et al.: Five distinct biological processes and 14 differentially expressed genes characterize TEL/AML1-positive leukemia. BMC Genomics 2007; 8: Lee DS, Kim YR, Cho HK et al.: The presence of TEL/AML1 rearrangement and cryptic deletion of the TEL gene in adult acute lymphoblastic leukemia (ALL). Cancer Genet Cytogenet 2005; 162: Ellinghaus E, Stanulla M, Richter G et al.: Identification of germline susceptibility loci in ETV6-RUNX1-rearranged childhood acute lymphoblastic leukemia. Leukemia 2012; 26: von Goessel H, Jacobs U, Semper S et al.: Cluster analysis of genomic ETV6-RUNX1 (TEL-AML1) fusion sites in childhood acute lymphoblastic leukemia. Leuk Res 2009; 33: Al-Shehhi H, Konn ZJ, Schwab CJ et al.: Abnormalities of the der(12)t(12;21) in ETV6-RUNX1 acute lymphoblastic leukemia. Genes Chromosomes Cancer 2013; 52: Fischer M, Schwieger M, Horn S et al.: Defining the oncogenic function of the TEL/AML1 (ETV6/RUNX1) fusion protein in a mouse model. Oncogene 2005; 24: Zelent A, Greaves M, Enver T: Role of the TEL-AML1 fusion gene in the molecular pathogenesis of childhood acute lymphoblastic leukaemia. Oncogene 2004; 23: Kantner HP, Warsch W, Delogu A et al.: ETV6/ RUNX1 induces reactive oxygen species and drives the accumulation of DNA damage in B cells. Neoplasia 2013; 15: Balatzenko G, Guenova M, Kalinova I et al.: Simultaneous occurrence of ETV6-RUNX1 and BCR-ABL1 (e1a2) transcripts in a child with B-cell acute lymphoblastic leukemia. Cancer Genet 2013; 206: Zakaria Z, Ahid MFM, Ismail A et al.: Chromosomal aberrations in ETV6/RUNX1- positive childhood acute lymphoblastic leukemia using 244K oligonucleotide array comparative genomic hybridization. Mol Cytogenet 2012; 5: Stams WAG, Beverloo HB, den Boer ML et al.: Incidence of additional genetic changes in the TEL and AML1 genes in DCOG and COALL-treated t(12;21)-positive pediatric ALL, and their relation with drug sensitivity and clinical outcome. Leukemia 2006; 20: Raynaud S, Cave H, Baens M et al.: The 12;21 translocation involving TEL and deletion of the other TEL allele: two frequently associated alterations found in childhood acute lymphoblastic leukemia. Blood 1996; 87: Sevilla DW, Nandulax SV, Colovai AI et al.: Diffuse large B-cell lymphoma with TEL/ETV6 translocation. Hum Pathol 2009; 40: Uphoff CC, MacLeod RAF, Denkmann SA et al.: Occurrence of TEL-AML1 fusion resulting from (12;21) translocation in human early B-lineage leukemia cell lines. Leukemia 1997; 11:
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Dr n. med. Magdalena Zawada
Dr n. med. Magdalena Zawada Szpital Uniwersytecki w Krakowie Zakład Diagnostyki Hematologicznej 04.09.2017 Nowotwory układu krwiotwórczego według klasyfikacji Światowej Organizacji Zdrowia (WHO) 1. Nowotwory
Personalizacja leczenia w hematoonkologii dziecięcej
MedTrends 2016 Europejskie Forum Nowoczesnej Ochrony Zdrowia Zabrze, 18-19 marca 2016 r. Personalizacja leczenia w hematoonkologii dziecięcej Prof. dr hab. n. med. Tomasz Szczepański Katedra i Klinika
Leki immunomodulujące-przełom w leczeniu nowotworów hematologicznych
Leki immunomodulujące-przełom w leczeniu nowotworów hematologicznych Jadwiga Dwilewicz-Trojaczek Katedra i Klinika Hematologii, Onkologii i Chorób Wewnętrznych Warszawski Uniwersytet Medyczny Warszawa
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
PRZEWLEKŁĄ BIAŁACZKĘ SZPIKOWĄ I OSTRĄ BIAŁACZKĘ SZPIKOWĄ
www.oncoindex.org SUBSTANCJE CZYNNE W LECZENIU: Białaczka szpikowa OBEJMUJE PRZEWLEKŁĄ BIAŁACZKĘ SZPIKOWĄ I OSTRĄ BIAŁACZKĘ SZPIKOWĄ Dasatinib Dasatinib jest wskazany do leczenia dorosłych pacjentów z:
lek. Jacek Krzanowski
lek. Jacek Krzanowski "Analiza ekspresji wybranych mikrorna w dziecięcej ostrej białaczce limfoblastycznej z komórek B (B-ALL) z obecnością mikrodelecji genów dla czynników transkrypcyjnych" Streszczenie
Eozynofilia w chorobach reumatycznych i chorobach krwi. Stanowisko hematologa
Eozynofilia w chorobach reumatycznych i chorobach krwi. Stanowisko hematologa Wiesław Wiktor Jędrzejczak Katedra i Klinika Hematologii, Onkologii i Chorób Wewnętrznych WUM, Warszawa Zapomnijcie o procentach!
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Test BRCA1. BRCA1 testing
Test BRCA1 BRCA1 testing 2 Streszczenie Za najczęstszą przyczynę występowania wysokiej, genetycznie uwarunkowanej predyspozycji do rozwoju raka piersi i/lub jajnika w Polsce uznaje się nosicielstwo trzech
Prof. dr hab. med. Wojciech Młynarski Klinika Pediatrii, Onkologii i Hematologii I Katedra Pediatrii UM w Łodzi ul. Sporna 36/50, Łódź.
Prof. dr hab. med. Wojciech Młynarski Klinika Pediatrii, Onkologii i Hematologii I Katedra Pediatrii UM w Łodzi ul. Sporna 36/50, 91-738 Łódź Ocena Rozprawy doktorskiej Pani mgr Bronisławy Szarzyńskiej-Zawadzkiej
Nowotwory układu krwiotwórczego
Nowotwory układu krwiotwórczego Redakcja: Krzysztof Warzocha, Monika Prochorec-Sobieszek, Krzysztof Lewandowski Zespół autorski: Jadwiga Dwilewicz-Trojaczek, Joanna Góra-Tybor, Przemysław Juszczyński,
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Aktywność fosfatazy alkalicznej w neutrofilach u pacjentów z przewlekłą białaczką szpikową
Aktywność fosfatazy alkalicznej w neutrofilach u pacjentów z przewlekłą białaczką szpikową Radosław Charkiewicz praca magisterska Zakład Diagnostyki Hematologicznej Uniwersytet Medyczny w Białymstoku Przewlekła
Patogeneza nowotworów układu krwiotwórczego
PRACA POGLĄDOWA Hematologia 2013, tom 4, nr 4, 279 290 Copyright 2013 Via Medica ISSN 2081 0768 Patogeneza nowotworów układu krwiotwórczego Pathogenesis of myeloid malignancies Maciej Szydłowski, Przemysław
Czy warto wykonywać badania cytogenetyczne i molekularne w szpiczaku mnogim?
Czy warto wykonywać badania cytogenetyczne i molekularne w szpiczaku mnogim? Jan Maciej Zaucha Gdański Uniwersytet Medyczny Gdyńskie Centrum Onkologii Kraków 19.04.2010 TAK WARTO Dziękuje za uwagę! Rola
Dotychczas brak jednoznacznych danych dotyczących ekspresji EGFL7, HIF-1α i Ob-R w ostrych białaczkach szpikowych.
Streszczenie Wprowadzenie: Ostre białaczki szpikowe stanowią zróżnicowaną grupę chorób rozrostowych układu krwiotwórczego. Klon nowotworowy w AML wywodzi się z wczesnych stadiów rozwojowych hematopoezy.
wolna od leczenia? (TFR ang. Treatment Free Remission)
Czy można bezpiecznie przerwać leczenie przewlekłej białaczki szpikowej Czym jest remisja wolna od leczenia (TFR ang. Treatment Free Remission) KILKA INFORMACJI NA POCZąTEK... Remisja wolna od leczenia
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro
DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
Epigenome - 'above the genome'
e - 'above the genome' Wydziaª Matematyki i Informatyki UJ Instytut Informatyki 14 stycznia 2013 e Rysunek: ¹ródªo: http://learn.genetics.utah.edu/content/epigenetics/nutrition/ e Plan Genom 1 Genom e
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym mgr Magdalena Brzeskwiniewicz Promotor: Prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Gdański Uniwersytet Medyczny
Nowe trendy w diagnostyce i leczeniu chorób układu krwiotwórczego
Nowe trendy w diagnostyce i leczeniu chorób układu krwiotwórczego Dr hab. Iwona Malinowska Katedra i Klinika Pediatrii, Hematologii i Onkologii Warszawski Uniwersytet Medyczny Próby poprawy wyników leczenia
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Ocena immunologiczna i genetyczna białaczkowych komórek macierzystych
Karolina Klara Radomska Ocena immunologiczna i genetyczna białaczkowych komórek macierzystych Streszczenie Wstęp Ostre białaczki szpikowe (Acute Myeloid Leukemia, AML) to grupa nowotworów mieloidalnych,
l.p. ID Kod ICD Nazwa Świadczenia Cena Jednostka organizacyjna Pracownia/grupa badań
Cennik na rok 2017 świadczeń zdrowotnych innych niż finansowane ze środków publicznych oraz udzielanych w ramach zawieranych umów DIAGNOSTYKA HEMATOLOGICZNA ul. Kopernika 17 Pracownia Cytometrii Przepływowej
Lek. Dominika Kulej. Przebieg kliniczny a wyjściowy status białek oporności wielolekowej w leczeniu ostrej białaczki limfoblastycznej u dzieci
Lek. Dominika Kulej Katedra i Hematologii Dziecięcej Uniwersytetu Medycznego im. Piastów Śląskich we Wrocławiu Przebieg kliniczny a wyjściowy status białek oporności wielolekowej w leczeniu ostrej białaczki
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Budowa rybosomu Translacja
ScienceDirect. journal homepage:
polski przeglą d otorynolaryngologiczny 3 (2014) 254 258 Dostępne online www.sciencedirect.com ScienceDirect journal homepage: www.elsevier.com/locate/ppotor Streszczenie pracy doktorskiej/summary of doctoral
DIAGNOSTYKA HEMATOLOGICZNA
Cennik opłat za świadczenia zdrowotne udzielane osobom nieubezpieczonym oraz innym osobom nieuprawnionym do świadczeń zdrowotnych finansowanych ze środków publicznych DIAGNOSTYKA HEMATOLOGICZNA ul. Kopernika
Public gene expression data repositoris
Public gene expression data repositoris GEO [Jan 2011]: 520 k samples 21 k experiments Homo, mus, rattus Bos, sus Arabidopsis, oryza, Salmonella, Mycobacterium et al. 17.01.11 14 17.01.11 15 17.01.11 16
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii?
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii? Wykorzystanie nowych technik molekularnych w badaniach nad genetycznymi i epigenetycznymi mechanizmami transformacji nowotworowej
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Praca oryginalna Original Article
diagnostyka laboratoryjna Journal of Laboratory Diagnostics Diagn Lab. 2018; 54(4): 225-232 ISSN 0867-4043 Praca oryginalna Original Article Znaczenie współpracy pomiędzy laboratorium cytogenetycznym i
Zespoły mielodysplastyczne
Zespoły mielodysplastyczne J A D W I G A D W I L E W I C Z - T R O J A C Z E K K L I N I K A H E M ATO LO G I I, O N KO LO G I I I C H O R Ó B W E W N Ę T R Z N YC H WA R S Z AW S K I U N I W E R S Y T
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
Zespoły mieloproliferacyjne. Agnieszka Szeremet
Zespoły mieloproliferacyjne Agnieszka Szeremet Zespoły mieloproliferacyjne- definicja Zespoły mieloproliferacyjne (Mieloproliferative neoplasms, MPN) to grupa chorób nowotoworych, związnana z klonalnym
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Konkurs szkolny Mistrz genetyki etap II
onkurs szkolny istrz genetyki etap II 1.W D pewnego pierwotniaka tymina stanowi 28 % wszystkich zasad azotowych. blicz i zapisz, jaka jest zawartość procentowa każdej z pozostałych zasad w D tego pierwotniaka.
Zaburzenia genetyczne w ostrej białaczce limfoblastycznej u dzieci i ich wykorzystanie w praktyce klinicznej
PRACA POGLĄDOWA Hematologia 2012, tom 3, nr 3, 221 230 Copyright 2012 Via Medica ISSN 2081 0768 Zaburzenia genetyczne w ostrej białaczce limfoblastycznej u dzieci i ich wykorzystanie w praktyce klinicznej
Białaczka limfatyczna
www.oncoindex.org SUBSTANCJE CZYNNE W LECZENIU: Białaczka limfatyczna OBEJMUJE PRZEWLEKŁĄ BIAŁACZKĘ LIMFOCYTOWĄ (PBL) I OSTRĄ BIAŁACZKĘ LIMFOBLASTYCZNĄ (ALL) Clofarabine Leczenie ostrej białaczki limfoblastycznej
2019 DIAGNOSTYKA HEMATOLOGICZNA
Cennik opłat za świadczenia zdrowotne udzielane w ramach umów zawartych z podmiotami zewnętrznymi (innymi niż Płatnik Publiczny) na rok 2019 DIAGNOSTYKA HEMATOLOGICZNA ul. Kopernika 17 Pracownia Cytometrii
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
Testy DNA umiarkowanie zwiększonego ryzyka zachorowania na nowotwory złośliwe
Grzegorz Kurzawski, Janina Suchy, Cezary Cybulski, Joanna Trubicka, Tadeusz Dębniak, Bohdan Górski, Tomasz Huzarski, Anna Janicka, Jolanta Szymańska-Pasternak, Jan Lubiński Testy DNA umiarkowanie zwiększonego
l.p. Kod ICD Nazwa Świadczenia Umowy Uwagi Jednostka organizacyjna Pracownia/grupa badań
Cennik opłat za świadczenia zdrowotne udzielane w ramach umów zawartych z podmiotami zewnętrznymi (innymi niż Płatnik Publiczny) na rok 2019 DIAGNOSTYKA HEMATOLOGICZNA ul. Kopernika 17 Pracownia Cytometrii
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
Możliwości diagnostyki i śledzenia skuteczności leczenia wybranych nowotworowych schorzeń hematologicznych przy pomocy markerów molekularnych
PRACA POGLĄDOWA Review Article Acta Haematologica Polonica 2011, 42, Nr 1, str. 17 30 MAGDALENA ZAWADA, SYLWIA CZEKALSKA, IZABELA FLOREK, TOMASZ SACHA, KAJETANA FORYCIARZ, ELŻBIETA PĘCEK, ALEKSANDER B.
Nowotwory mieloidalne lub limfoidalne z eozynofilią i nieprawidłowościami genów PDGFRA, PDGFRB lub FGFR1
Nowotwory mieloidalne lub limfoidalne z eozynofilią i nieprawidłowościami genów PDGFRA, PDGFRB lub FGFR1 Krzysztof Lewandowski Definicja Nowotwory mieloidalne lub limfoidalne z eozynofilią i nieprawidłowościami
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
Prace oryginalne Original papers
Prace oryginalne Original papers Borgis Wstępna ocena ekspresji antygenu CD34 na komórkach macierzystych krwi obwodowej w przebiegu leczenia ostrej białaczki limfoblastycznej u dzieci *Iwona Reszczyńska
Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy. Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję
Nukleosomy 1 Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję Metody pozwalające na wyznaczanie miejsc wiązania nukleosomów Charakterystyka obsadzenia nukleosomów
Molekularne markery nowotworowe
Molekularne markery nowotworowe Dr Marta Żebrowska Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki, Zakład Biochemii Farmaceutycznej i Diagnostyki Molekularnej Źródło ryc: http://www.utmb.edu/scccb/;
Prognostyczne i terapeutyczne implikacje zaburzeń genetycznych w dziecięcej ostrej białaczce limfoblastycznej
PRACA POGLĄDOWA Hematologia 2011, tom 2, nr 1, 43 50 Copyright 2011 Via Medica ISSN 2081 0768 Prognostyczne i terapeutyczne implikacje zaburzeń genetycznych w dziecięcej ostrej białaczce limfoblastycznej
Badania osobniczej promieniowrażliwości pacjentów poddawanych radioterapii. Andrzej Wójcik
Badania osobniczej promieniowrażliwości pacjentów poddawanych radioterapii Andrzej Wójcik Zakład Radiobiologii i Immunologii Instytut Biologii Akademia Świętokrzyska Świętokrzyskie Centrum Onkologii Fig.
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Patogeneza przewlekłej białaczki szpikowej od genu do terapii celowanej
PRACA POGLĄDOWA Hematologia 2010, tom 1, nr 3, 195 218 Copyright 2010 Via Medica ISSN 2081 0768 Patogeneza przewlekłej białaczki szpikowej od genu do terapii celowanej Pathogenesis of chronic myeloid leukemia
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
RNA jako marker molekularny
RNA jako marker molekularny RNA jako marker diagnostyczny i prognostyczny białaczek Typy białaczek Nowotwory rozrost leukocytów jednego typu w całym organizmie Komórki białaczkowe blasty Podział I: b.
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
Diagnostyka molekularna umożliwia terapie spersonalizowane. Janusz A. Siedlecki
Diagnostyka molekularna umożliwia terapie spersonalizowane. Janusz A. Siedlecki Centrum Onkologii-Instytut, Warszawa 2015 Rozwój Rozwój medycyny i nauk podstawowych w ciągu ostatnich pięćdziesięciu lat
Aneks I. Wnioski naukowe i podstawy zmiany warunków pozwolenia (pozwoleń) na dopuszczenie do obrotu
Aneks I Wnioski naukowe i podstawy zmiany warunków pozwolenia (pozwoleń) na dopuszczenie do obrotu 1 Wnioski naukowe Uwzględniając raport oceniający komitetu PRAC w sprawie okresowych raportów o bezpieczeństwie
Podstawowe techniki barwienia chromosomów
Prążek C Chromatyna nie kondensuje równomiernie! Euchromatyna-najmniej kondensująca (fragmenty helisy DNA bogate w guaninę i cytozynę) Heterochromatyna fakultatywna Jasne prążki G Ciemne prążki G Heterochromatyna
Dodatek F. Dane testowe
Dodatek F. Dane testowe Wszystkie dane wykorzystane w testach pochodzą ze strony http://sdmc.lit.org.sg/gedatasets/datasets.html. Na stronie tej zamieszczone są różne zbiory danych zebrane z innych serwisów
Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego. Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa
Onkogeneza i zjawisko przejścia nabłonkowomezenchymalnego raka jajnika Gabriel Wcisło Klinika Onkologii Wojskowego Instytutu Medycznego, CSK MON, Warszawa Sześć diabelskich mocy a komórka rakowa (Gibbs
Podłoże molekularne i perspektywy terapeutyczne ostrej białaczki limfoblastycznej BCR-ABL1-like
praca poglądowa Hematologia 2014, tom 5, nr 2, 154 161 Copyright 2014 Via Medica ISSN 2081 0768 Podłoże molekularne i perspektywy terapeutyczne ostrej białaczki limfoblastycznej BCR-ABL1-like Molecular
MUTACJE GENOMOWE- EUPLOIDIE MUTACJE GENOMOWE- ANEUPLOIDIE. MUTACJE spontaniczne indukowane. germinalne somatyczne
MUTACJE spontaniczne indukowane germinalne somatyczne genomowe chromosomowe genowe euploidie aneuploidie - delecje substytucje - nullisomie - duplikacje -monosomie - trisomie - tetrasomie - inwersje -translokacje
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
LECZENIE CHORYCH NA PRZEWLEKŁĄ BIAŁACZKĘ SZPIKOWĄ (ICD-10 C 92.1)
Załącznik B.14. LECZENIE CHORYCH NA PRZEWLEKŁĄ BIAŁACZKĘ SZPIKOWĄ (ICD-10 C 92.1) ŚWIADCZENIOBIORCY 1. Leczenie przewlekłej białaczki szpikowej dazatynibem 1.1. Kryteria kwalifikacji 1) przewlekła białaczka
Mutacje jako źródło różnorodności wewnątrzgatunkowej
Mutacje jako źródło różnorodności wewnątrzgatunkowej Zajęcia terenowe: Zajęcia w klasie: Poziom nauczania oraz odniesienie do podstawy programowej: Liceum IV etap edukacyjny zakres rozszerzony: Różnorodność
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
Diagnostyka neurofibromatozy typu I,
Diagnostyka neurofibromatozy typu I, czyli jak to się robi w XXI wieku dr n. biol. Robert Szymańczak Laboratorium NZOZ GENOMED GENOMED S.A. Neurofibromatoza typu I (choroba von Recklinghausena) częstość
Bioinformatyka. Rodzaje Mutacji
Bioinformatyka (wykład monograficzny) wykład 3. E. Banachowicz Zakład Biofizyki Molekularnej IF UAM http://www.amu.edu.pl/~ewas Rodzaje Mutacji zmienność sekwencji (sequence variation) mutacje polimorfizm
Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi
Marta Klimczak Studium Medycyny Molekularnej Warszawski Uniwersytet Medyczny Białka szoku termicznego jako pozytywne i negatywne regulatory w raku piersi Praca wykonana w Zakładzie Biologii Molekularnej
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Badanie wewnątrztandemowej duplikacji genu FLT3 u chorych z ostrą białaczką szpikową
Praca zamieszczona oryginalnie w Acta Haematologica Polonica tom 43, zeszyt nr 2b, 2012. Wszystkie prawa zastrzeżone. Jakiekolwiek kopiowanie w części lub w całości, bez uprzedniego pisemnego zezwolenia
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Choroby genetyczne na tle zmian w genomie człowieka rodzaje, fenotyp, diagnostyka genetyczna
Przedmiot: Genetyka kliniczna V Rok, Wydział Lekarski I Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu Choroby genetyczne na tle zmian w genomie człowieka rodzaje, fenotyp, diagnostyka genetyczna Opracowanie:
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Czynniki prognostyczne w ostrej białaczce szpikowej
PRACA POGLĄDOWA Review Article Acta Haematologica Polonica 2010, 41, Nr 3, str. 381 393 BEATA PIĄTKOWSKA-JAKUBAS, ALEKSANDER B. SKOTNICKI Czynniki prognostyczne w ostrej białaczce szpikowej Prognostic
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Ekspresja genów jest regulowana
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 6 BAZA DANYCH NCBI - II BAZA DANYCH NCBI 1. NCBI 2. Dane gromadzone przez NCBI 3. Przegląd baz danych NCBI: Publikacje naukowe Projekty analizy genomów OMIM: fenotypy człowieka
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
Statystyczna analiza danych
Statystyczna analiza danych ukryte modele Markowa, zastosowania Anna Gambin Instytut Informatyki Uniwersytet Warszawski plan na dziś Ukryte modele Markowa w praktyce modelowania rodzin białek multiuliniowienia
Agencja Oceny Technologii Medycznych
Agencja Oceny Technologii Medycznych Rada Konsultacyjna Stanowisko Rady Konsultacyjnej nr 24/2011 z dnia 28 marca 2011r. w sprawie usunięcia z wykazu świadczeń gwarantowanych lub zmiany poziomu lub sposobu
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
RAK JAJNIKA CZYLI RZECZ O WYBRCA-OWANYCH (WYBRAKOWANYCH) GENACH
RAK JAJNIKA CZYLI RZECZ O WYBRCA-OWANYCH (WYBRAKOWANYCH) GENACH Dr hab. n. med. Lubomir Bodnar Klinika Onkologii Wojskowy Instytut Medyczny w Warszawie PORUSZANE TEMATY Budowa genów odpowiedzialnych za
Ostra białaczka limfoblastyczna (ALL)
Ostra białaczka limfoblastyczna (ALL) ang. acute lymphoblastic leukemia Dr n. med. Monika Biernat Definicja Nowotworowy rozrost prekursorowych komórek limfoidalnych (limfoblastów) wywodzących się z linii