Pułapki mikrobiologiczne w pneumonologii

Transkrypt

1 Pułapki mikrobiologiczne w pneumonologii Ewa Augustynowicz Kopeć Zakład Mikrobiologii IGiCHP II KONFERENCJA PUŁAPKI W PNEUMONOLOGII GDYNIA 2018

2 Przypadek I Pacjentka 68 letnia Suchy kaszel od roku, stany podgorączkowe, chudnięcie Rozpoznanie przy przyjęciu promienica Rak piersi lewej - stan po operacji oszczędzającej, chemioterapii AC (4 kursy) i radioterapii uzupełniające /2011r Stan po immunoterapii /2012r./. Nadciśnienie tętnicze. Stan po leczeniu guza pęcherza moczowego o podłożu mnogiej metaplazji płaskonabłonkowej metoda TURBT /2005r./ wlewki BCG W posiewie plwociny wyhodowano Klebsiella pneumoniae i Pseudomonas aeruginosa Augmentin, Klarytromycyna Utrzymujące się stany podgorączkowe

3 Przypadek I Wydzielina oskrzelowa pobrana na badanie mikrobiologiczne w kierunku gruźlicy i mykobakterioz AFB (-) Genetyka (-) Posiew - prątki kwasooporne Identyfikacja TBC ID (-) MOTT Test na antygen MPT-64 wydzielany przez bakterie wywołujące gruźlicę???????. Obecność sznurów jest znana jako kryterium wstępnej identyfikacji kompleksu Mycobacterium tuberculosis Identyfikacja metodą molekularną - Mycobacterium bovis BCG

4 2 metody PCR test na antygen MPT-64 dały różne wyniki

5 dwa szczepy prątków BCG stosowane we wlewkach dopęcherzowych : TICE (preparat Onco-Tice firmy Organon Technika) i BCG Moreou (preparat Onco BCG Lubelskiej Wytwórni Szczepionek wykrywanie antygenu MPT-64 w tym teście sugeruje obecność organizmu kompleksu MTB, który obejmuje M. tuberculosis, M. bovis, M. microti i M. africanum niektóre szczepy M. bovis BCG, takie jak Kopenhaga, Glaxo, Pasteura i Tice, nie zachodzi ekspresja genu MPB-64 Nieobecność antygenu MPT-64 u naszego pacjenta można wytłumaczyć faktem, że szczep Tice BCG został wstrzyknięty do pęcherza pacjenta

6 Leczenie dopęcherzowe za pomocą BCG wydaje się stosunkowo bezpieczne. W grupie leczonych chorych działania niepożądane<5% wczesne około 1 roku późne >3lat w tym ziarniniakowe zapalenie gruczołu krokowego, zakażenie układu oddechowego, zapalenie wątroby

7 powikłanie leczenia BCG czy gruźlica? 72 letni mężczyzna leczonego z powodu powierzchownego raka pęcherza moczowego. Pacjent miał wykonaną elektroresekcję zmian w pęcherzu, następnie otrzymywał dopęcherzowe wlewki BCG. Z powodu zmian obserwowanych w najądrzu i jądrze prawym wykonano resekcję. Badanie hist-pat ziarninę z martwicą serowatą w ogonie najądrza. Nie wykonano badań mikrobiologicznych z resekowanego materiału. Podejrzewając zakażenie BCG skierowano chorego do diagnostyki w Instytucie Gruźlicy. Dalsza diagnostyka obejmowała badania radiologiczne i bronchoskopię, które poza stwierdzeniem w oskrzelach blizn po przebiciach węzłowych sugerujących przebytą gruźlicę, nie przyczyniły się ustalenia rozpoznania. Odczyn tuberkulinowy wynosił 21mm. O rozpoznaniu przesądziło stwierdzenie metodą molekularną obecności prątków należących do M. tuberculosis w mat.operacyjnym utrwalonym w bloczku parafinowym. zastosowanie badania genetycznego umożliwiło potwierdzenie infekcji i identyfikację patogenu, oraz zastosowanie adekwatnego leczenia.

8 Badania molekularne materiałów tkankowych utrwalonych w parafinie W preparatach histopatologicznych uzyskanych z materiałów 166 chorych stwierdzono : 1. organizujące się ziarniniaki, 2. zwłóknienia 3. inne zmiany charakterystyczne dla procesu zapalnego.

9 BADANIE GENETYCZNE Materiały utrwalone w parafinie poddane badaniu metodą genetyczną 166 Ujemny wynik badania genetycznego 102/ 60 % Dodatni wynik badania genetycznego 64 / 40%

10 Przypadek III Pacjentka 75 letnia, diagnostyka poszerzenia wnęki płuca prawego - podejrzenie zmiany rozrostowe Materiały do diagnostyki gruźlicy i mykobakteroiz Plwocina AFB (+) Plwocina AFB (++) Plwocina AFB (+) Wyniki posiewów prątki kwasooporne Identyfikacja TBc ID (-) MOTT

11 Przypadek III Podczas obchodu obserwacja higieny protezy Kontaminacja protezy zębowej przez prątki atypowe Dochodzenie epidemiologiczne wykazało identyczny wzór molekularny szczepu hodowanego z materiału od chorej i pobranego z protezy Rozpoznanie : Limfadenopatia śródpiersia z rozsianymi zmianami drobnoguzkowymi płuc

12 Przypadek IV Oddział pulmonologiczny Pacjenci z różnymi jednostkami chorobowymi (sarkoidoza, POCHP, rozstrzenie oskrzeli) W ciągu dwóch miesięcy obserwacja - w 90% materiałów przesyłanych do diagnostyki gruźlicy i mykobakterioz stwierdzano obecność prątków kwasoopornych w preparatach bezpośrednich W kolejnych dniach uzyskiwano dodatnie wyniki posiewów Wstępna identyfikacja TBC ID MOTT Uzyskiwane wyniki badań w kierunku gruźlicy i mykobakterioz nie odpowiadają obrazowi klinicznemu chorych

13 Przypadek IV Przeprowadzono badania środowiskowe na oddziale Pobrano wymazy z wylewek i próbki wody wodociągowej W posiewach uzyskano wyniki dodatnie Wstępna identyfikacja TBC ID MOTT Identyfikacja gatunkowa szczepów wyhodowanych od chorych i z prób środowiskowych - Mycobacterium kansasii

14 Przypadek IV Analiza polimorfizmu genu hsp65 pozwala podzielić M.kansasii na siedem podtypów: Podtyp I uważany za typowy patogen człowieka i czynnik etiologiczny mykobakteriozy podtyp II: izolowany od ludzi z immunosupresją, podtypy: III, IV, V, VI i VII najczęściej izolowane ze środowiska. Podtypy M.kansasii Materiały od pacjentów Próby środowiskowe I 43 0 II 2 0 III 2 1 IV 36 8

15 Mycobacterie MOTT Rozpowszechnione w przyrodzie około 150 gat. Gatunki chorobotwórcze dla ludzi 25 gat. (częste 10) Drobnoustroje szeroko rozpowszechnione w środowisku Zbiornikach wodnych, wodzie wodociągowej, glebie Clinical Tuberculosis, wyd. 5, red. Davies P.D.O., Gordon S.B., Davies G. 2014

16 Przyczyny wzrostu zachorowań na mykobakteriozy Starzenie społeczeństw: ryzyko MB - wiek 50 do 70 lat Więcej osób z zaburzeniami odporności cukrzyca, sterydoterapia, leczenie biologiczne Więcej chorych na POChP czynnik ryzyka MB Popularność prysznicy narażenie na aerozole wodne Lepsza wykrywalność MB powszechność MGIT 960, metody molekularne, Semin Respir Crit Care Med. 2013; 34: Clinical Tuberculosis, wyd. 5, red. Davies P.D.O., Gordon S.B., Davies G. 2014;

17 Z badań ankietowych prowadzonych w latach 90. XX wieku w polskich laboratoriach prątka stwierdzono, że M. kansasii był gatunkiem najczęściej izolowanym z materiałów przysłanych do diagnostyki Badania środowiskowe w Instytucie Gruźlicy i Chorób Płuc wykazały, że z wymazów wylewek wody wodociągowej, gdzie tworzy się biofilm, izoluje się kilka gatunków prątków niegruźliczych, przy czym najczęściej jest to M. kansasii. W Polsce M. kansasii jest też najczęstszą przyczyną mykobakteriozy a następnie MAC

18 Mikrobiologiczne kryteria diagnostyczne wg ATS i BTS do analizy mikrobiologicznej powinny być wysłane co najmniej trzy materiały pochodzące z dróg oddechowych okres pobierania próbek powinien wynosić do kilku tygodni Krótkie przerwy między pobieraniem próbek stwarzają ryzyko interpretacji tymczasowej przypadkowej obecność NTM w drogach oddechowych po ekspozycji chorego w środowisku

19 Testy genetyczne do identyfikacji prątków atypowych 5 h GenoType Mycobacterium CM GenoType Mycobacterium AS

20 GenoType NTM-DR identyfikacja M.avium, M.intracellulare, M.chimaera, M.chelonae i M.abscessus (3 podtypy) wykrycie oporności na amoniglikozydy (gen rrs) i makrolidy (gen rrl i emr)

21 Mycobacterium chimaera wolno rosnący gatunek prątków atypowych wyróżniony z kompleksu Mycobacterium avium (MAC) w 2004 roku odpowiedzialny za zapalenie płuc u pacjentów ze schorzeniami układu oddechowego, POCHP mukowiscydozą lub niedoborami immunologicznymi, również zakażenia kości i skóry naturalnym rezerwuar M. chimaera nie jest znany, ale badania wykazały, że jest powszechnie wykrywany w środowisku wodnym i biofilmach. Pierwsze raporty dotyczące pozapłucnych infekcji M. chimaera zostały opublikowane w 2013 w Szwajcarii chorzy poddani operacjom kardiochirurgicznym w 2011 i 2012 roku 2 chorych zmarło zidentyfikowano obecność M. chimaera w aparatach służących do regulacji temperatury krwi w czasie krążenia pozaustrojowego

22 M. chimaera zakażenia po operacjach na otwartym sercu charakteryzują się późną manifestacją kliniczną (wystąpienie objawów może nastąpić dopiero kilka lat po zabiegu od 3 m do 5 lat), słaba odpowiedź na leczenie i złe rokowanie a wskaźnik śmiertelności związany z tymi zakażeniami wynosi około 50% pomimo stosowania antybiotyków klarytromycyny, ryfabutyny i ethambutolu w połączeniu z amikacyną lub moksyfloksacyną.

23 Mycobacterium chmerae -nowe zagrożenie dla chorych kardiochirurgicznych?? zakażenia związane z operacją kardiochirurgiczną są związane ze śródoperacyjnym stosowaniem HCU do kontrolowanej hipotermii dotyczą głównie dorosłych pacjentów pierwszy przypadek takiej infekcji u noworodka z wrodzoną wadą serca, u którego wykonano operację kardiochirurgiczną, Transmisja drobnoustrojów z HCU najprawdopodobniej z powodu zastosowania materaca rozgrzewającego połączonego z HCU

24 Od 2013 r. w Europie i USA zgłoszono 100 przypadków zapalenia wsierdzia Mycobacterium chimaera, związanych z HCU stosowanym w chirurgii kardiologicznej. Analiza molekularna 250 szczepów od chorych po operacjach kardiochirurgii w Szwajcarii, Niemczech, Holandii i Wielkiej Brytaniwykazała obecność dwóch głównych grup M.chimera. Do I grupy > szczepów od chorych i szczepy z fabryki urządzeń HCU Przypuszczenie,że do zanieczyszczenie HCU M chimaera w fabryce źródłem ciężkich, zakażeń rozpoznanych w Szwajcarii, Niemczech, Holandii, Wielkiej Brytanii, USA i Australii.

25 badania epidemiologiczne wykazały szczepy M. chimaera izolowane z różnych ośrodków były identyczne, co potwierdziło hipotezę, że pochodziły ze skażonych HCU produkowanych w jednym zakładzie produkcyjnym producent HCU z własnej inicjatywy przeprowadził badania środowiskowe w zakładzie HCU w sierpniu 2014 r., potwierdzając zanieczyszczenie linii produkcyjnej i systemu zaopatrzenia w wodę M. chimaera wprowadzono procedury czyszczenia i dezynfekcji na linię produkcyjną; Urządzenia wyprodukowane po wrześniu 2014 r. są uważane za wolne od zanieczyszczenia M. chimaera zaleca dezynfekcję HCU zgodnie z określonymi procedurami.

26 w Polsce nie odnotowano jeszcze zakażenia M. chimera u pacjentów poddanych zabiegom kardiochirurgicznym niemniej jednak w codziennej praktyce klinicznej należy uwzględnić potencjalne ryzyko tego powikłania nie należy dopuszczać do kontaktu powietrza z HCU z otoczeniem pola operacyjnego W Polsce 17 przypadków chorzy z POCHP

27 Mycobacterium abscessus Mycobacterium abscessus wszechobecne, szybko rosnące prątki znajdują się w wodzie, glebie i kurzu. Opisana po raz pierwszy przez Moore'a i Frerichs w 1953 r. M. abscessus jest uważany za najbardziej chorobotwórczy szybkorosnący gatunek prątków atypowych a zakażenia są trudne do wyleczenia Zakażenia najczęściej układ oddechowy, skóra i zakażenia tkanek miękkich; również infekcje oka, ucha środkowego, zapalenie węzłów chłonnych, zapalenie stawów, zapalenie kości i szpiku, zapalenie wsierdzia 3 podgatunki Mycobacterium abscessus subsp. abscessus Mycobacterium abscessus subsp. massiliense Mycobacterium abscessus subsp. bolletii Charakteryzują się wysokim stopniem oporności, zróżnicowanie w obrębie podtypów przykład klarytromycyna, lek z wyboru od 1990r: Mycobacterium abscessus subsp. massiliense wrażliwy, Mycobacterium abscessus subsp. bolletii oporny Mycobacterium abscessus subsp. abscessus oporny

28 Zakażenie prątkami atypowymi u 64-letniej chorej ze zmianami po operacji w okolicach kręgosłupa Diagnostyka w kierunku TB i MOTT ropień z okolicy kręgosłupa lędźwiowego bakterioskopia ujemna badanie genetyczne w kierunku TB - ujemne po 7 dniach uzyskano hodowlę MOTT M. abscesus subsp. massiliense wrażliwy na makrolidy i aminoglikozydy

29 Zakażenie prątkami atypowymi u chorej po wszczepieniu zastawki Chora po zabiegu wszczepienia zastawek w krótkim czasie po zabiegu skoki gorączki Pobrano krew w kierunku bakterii szybkorosnących i grzybów Izolacja M. fortuitum na podłożu Bactec Mycosis IC/F Wymiana zastawki na nową, Po 8 miesiącach nawrót gorączki, ponowna izolacja M. fortuitum z krwi

30 GenoType CMdirect ver 1.0 firmy Hain Lifescience Wykrywanie M. tuberculosis complex oraz identyfikacja prątków atypowych bezpośrednio z materiałów klinicznych

31 Zakażenie M. fortuitum w salonie kosmetycznym 110 pacjentów; Pedicure i depilacja; Elektroforeza; Kevin L., USA 2002

32 Mycobacterium fortuitum Przed leczeniem Po 4-miesięcznym leczeniu Zakładanie kolczyków

33 Mycobacterium abscessus Mycobacterium chelonae Case Rep Dermatol 2011;3:37-41 Mycobacterium chelonae tatuaże Mycobacterium avium Mycobacterium abscessus Acta Derm Venerol 2014;91:61-62 Emerg Infect Dis 2016(7):

34 Laseroterapia MOTT A) Szyja i klatka piersiowej 53-letniej kobiety 14 dni po zabiegu laserowy, zakażenie Mycobacterium abscessus B) szyi pacjenta po 5 miesiącach terapii wielolekowej

35 Mężczyzna, 70 lat, od 14 lat pacjent IGiChP Od 2004 roku leczony z powodu POChP i astmy oskrzelowej Stan stabilny, okresowo kaszel z odksztuszaniem śluzowej wydzieliny styczeń 2016 ciężka infekcja płuc trwająca kilka m-cy grudzień 2016 od 12 m-cy utrzymujący się nasilony kaszel z wykrztuszaniem śluzoworopnej wydzieliny (osłuchowo bez odchyleń, RTG płuc prawidłowe) Marzec 2017 Diagnostyka mikrobiologiczna w kierunku TB 3-krotne badanie plwociny AFB wynik ujemny Badanie genetyczne wynik ujemny (nie stwierdzono obecności materiału genetycznego MTBC) Posiew na pożywkę MGiT i LJ po 12 dniach uzyskano wzrost Mycobacterium (?) na pożywce MGiT Preparat barwiony metodą Z-N wykonany z hodowli MGiT

36 Problemy w toku dalszej diagnostyki Identyfikacja gatunkowa wyhodowanych drobnoustrojów metodami: Test chromatograficzny wykrywający obecność białka MPT64 identyfikacja MOTT GenoType Mycobacterium CM/AS (Hain Lifescience) niepowodzenie identyfikacji gatunku Posiew na Columbia agar (+5% krew barania) oraz pożywkę płynną Schaedler wzrost drobnoustroju Mc Conkey agar, podłoże z eskuliną, Sabouraud, agar czekoladowy brak wzrostu Różnicowanie Corynebacterium, Rhodococcus i Nocardia -???? Spektrometria masowa MALDI-TOF Identyfikacja gatunku Gordonia bronchialis Gordonia bronchialis Mycobacterium kansasii Mycobacterium tuberculosis complex

37 Gordonia spp. bakterie tlenowe szeroko rozpowszechnionymi w środowisku (gleba i woda),wyizolowana w 1971 roku z plwociny (zakażenia naczyń, skóry, ukł. kostno-stawowego, nerwowego i oddechowego dorosłych i dzieci) Odpowiedzialna za rzadkie zakażenia u chorych z obniżoną odpornością immunologiczną Do chwili obecnej opisano około 30 przypadków zakażeń u dorosłych zdolność do wytwarzania biofilmu - długotrwałe infekcje leczenie : brak wytycznych opisana oporność na wankomycynę amonoglikozydy w połączniu z penicylinami, karbapenemami i fluorochinolonami czas leczenia w zależności od przypadku od 6 do 12 tygodni

38 bakteriemia 52-letnia kobieta z historią chłoniaka Hodgkina, wszczepiony rozrusznik, przeszła obustronną mastektomię raka sutka Obustronne zapalenie opłucnej, płyn opłucnowy ujemny w badaniach bakteriologicznych,cytologia komórek nowotworowych ujemna, na podstawie tych badań etiologia choroby opłucnej była niejasna - po 6 miesiącach hospitalizacja,pogorszenie czynności układu oddechowego, z krwi wyhodowano Gordonia bronchialis Przewlekłe zakażenie opłucnej spowodowane ekspozycją na G. bronchialis (praca w ogrodzie ) lub infekcja spowodowana cewnikiem opłucnowym Rokowanie w zakażeniach krwi Gordonia zależą od choroby podstawowej, czynników klinicznych związanych z infekcją i czasu rozpoznania czynnika etiologicznego zakażenia

39 niepotwierdzona aspergiloza? Choremu pobrano popłuczyny oskrzelowo - pęcherzykowe (BALF) na badanie serologiczne (antygen galaktomannan) w kierunku aspergilozy. W trakcie bronchoskopii pobrano oddzielne próbki BALF na badanie bakteriologiczne i mikologiczne. Oznaczony galaktomann z próbki BALF na badanie serologiczne - wynik negatywny. Posiew próbki BALF pobranej na badanie mikologiczne - hodowla Aspergillus fumigatus, preparat bezpośredni strzępki grzybów. oznaczony z tej próbki galaktomannan - wynik pozytywny!!!! Próbka materiału (BALF) na badanie serologiczne - prawdopodobnie sól fizjologiczna. Gdyby nie wykonano posiewu mikologicznego a rozpoznanie choroby oparto tylko na badaniu serologicznym -???????

40 GALAKTOMANNAN W diagnostyce serologicznej aspergilozy wykorzystuje się oznaczenie antygenu krążącego w surowicy krwi i popłuczynach oskrzelowo-pęcherzykowych (BALF) galaktomannanu. Galaktomannan wykrywa się testem immunoenzymatycznym (ELISA) Platelia Aspergillus - wykrywa 1 ng/ml galaktomannanu w płynach ustrojowych. W przypadku aspergillusowego zapalenia płuc poziom wykrywaniam krążącego antygenu w surowicy krwi jest wyraźnie niższy w porównaniu do postaci uogólnionej. Czułość testu GM w BALF-u od 80-90%; w niektórych doniesieniach nawet 100%. surowicy szacuje się od 20-40%. W przypadku inwazyjnej aspergilozy czułość GM dla surowicy wyższa (60-90%). Należy pamiętać, - antygeny krążące grzybów w ustroju człowieka występują w małych ilościach i szybko eliminowane. Dlatego oznaczenia antygenów należy powtarzać kilkakrotnie. Wyniki fałszywie dodatnie u pacjentów otrzymujących antybiotyki betalaktamowe (np. piperacylina z tazobaktamem czy amoksycylina z kwasem klawulanowym

41 Nadinterpretacja? Dziecku pobrano wydzielinę oskrzelową w kierunku Pneumocistis jiroveci. Równocześnie pobrano próbkę na posiew w kierunku grzybów. W preparacie mikroskopowym hist- pat bezpośrednim wykonanym z próbki w kierunku pneumocystozy stwierdzono obecność strzępek grzybów. Informację przekazano lekarzowi najprawdopodobniej aspergiloza. Z materiału wysłanego na badania mikologiczne wyhodowano drożdżaki i w preparacie mikroskopowym bezpośrednim stwierdzono obecność pseudomycelium. Niepoprawnie zinterpretowano preparat bezpośredni aspergiloza. (widoczne było pseudomycelium).

42 Chory na gruźlicę lekooporną????

43 Pacjent AB z podejrzeniem gruźlicy. Pobrano materiały: 1. Wydzielina oskrzelowa w dniu AFB Plwocina w dniu AFB Plwocina w dniu AFB ++ Ze wszystkich materiałów po 4 tygodniach wyhodowano prątki kwasooporne, test TBC ID (+), test niacynowy (+) do wyboru który. Wykonano dwa testy wrażliwości: z wydzieliny oskrzelowej oraz plwociny. Wynik testu lekowrażliwości z wydzieliny oskrzelowej szczep MDR, oporny na izoniazyd i rifampicynę Wynik testu lekowrażliwości z plwociny szczep wrażliwy. Szczepy przysłano do potwierdzenia oporności na IR w laboratorium referencyjnym oba szczepy wrażliwe. Szczep z wydzieliny oskrzelowej zanieczyszczony M.avium. Wskazane: Dokładna identyfikacja szczepu w przypadku szczepu M.tuberculosis opornego na leki oraz potwierdzenie oporności w laboratorium referencyjnym.

44 Ultra Xpert MTB / RIF Jednoczesne wykrycie zarówno obecności materiału genetycznego M. tuberculosis Identyfikacja mutacji w genie rpob związanych z opornością na ryfampicynę Brak reakcji krzyżowych z innymi gatunkami bakterii Wysoka czułość wykrywania M. tuberculosis ULTRA Cztery nowo zaprojektowane sondy wykrywające mutacje w genie rpob Wykrywalność 10 CFU / ml Rekomendowany dla AFB ( - )

45 BD Max BD MAX wysoce zintegrowany, zautomatyzowane urządzenie do izolacji, amplifikacji w czasie rzeczywistym i wykrywanie kwasów nukleinowych M.tbc Analiza maksymalnie 24 próbek w ciągu około 2,5 godziny. System otwarty pozwalający na wykorzystanie własnych starterów i sond Jednoczesne wykrywanie oporności na RMP i INH Czułość 91,9% ( %), swoistość 97,9% ( %), W trakcie ewaluacji w Zakładzie Mikrobiologii IGiCHP Aparat BD MAX Kaseta ekstrakcyjna Kaseta amplifikacyjna

46 5-miesięczne dziecko hospitalizowane kaszel,gorączka, utrata masy ciała, senność, poty przez 2 miesiące, kontakt z dorosłymi TB S Xpert - leczony empirycznie 2 tyg. po rozpoczęciu leczenia TB stan dziecka dalej pogarszał się waga 7kg Xpert + AFB Hodowla + Oporność na RMP, INH, SM Po miesiącu leczenia MDR-TB plwocina ujemna po 6 miesiącach poprawa objawów klinicznych i radiologicznych waga wzrosła do 12 kg

47 Kontaminacje podczas zabiegów medycznych 2 przypadki zakażenia prątkami lekoopornymi Niewłaściwa dekontaminacja bronchoskopów Zanieczyszczenie materiału klinicznego Zakażenie osoby poddanej zabiegowi W Polsce potwierdzono 4 przypadki kontaminacji materiału bronchoskopowego (wśród kilkunastu przebadanych) Ognisko kontaminacji Nr badania Data wykonania bronchoskopii Istotne informacje kliniczne AFB Lekooporność szczepu Genotypowanie szczepów A B TB w RTG +++ SI T4_CEU Zmiany nowotworowe - SI T4_CEU TB w RTG +++ wrażliwy T Podejrzenie sarkoidozy - wrażliwy T2 52 C Brak danych MDR (SIRE) Beijing Brak danych MDR (SIRE) Beijing Przebyta TB w wrażliwy T1 53 D Rozsiane zmiany drobnoguzkowe - wrażliwy T1 53

48 Wyniki badań mikrobiologicznych stanowią tylko jeden z elementów umożliwiających lekarzowi postawienie prawidłowej diagnozy Ale przed wszystkim!!!!! Współpraca klinicysty i mikrobiologa oraz Właściwie zaplanowana, przeprowadzona i zinterpretowana diagnostyka mikrobiologiczna umożliwia zidentyfikowanie drobnoustroju odpowiedzialnego za rozwój choroby, a co za tym idzie dobór antybiotyku o dużej skuteczności wobec drobnoustroju