REGULACJA STABILNOŚCI mrna KODUJĄCYCH RECEPTORY BŁONOWE SPRZĘŻONE Z BIAŁKAMI G. Czas trwania
|
|
- Beata Skiba
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Kosmos Tom 46, 1997 Numer 2 (235) Strony PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Lil ia n a S u r m a c z, J o l a n t a W ie j a k, E l ż b ie t a W y r o b a Zakład Biologii Komórki, Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN ul. Pasteura 3, Warszawa REGULACJA STABILNOŚCI mrna KODUJĄCYCH RECEPTORY BŁONOWE SPRZĘŻONE Z BIAŁKAMI G Receptory sprzężone z białkami G należące do klasy tak zwanych receptorów R7G (czyli posiadających siedem hydrofobowych domen transbłonowych) kontrolują różnorodne funkcje komórek. Rodzina tych receptorów reguluje wewnątrzkomórkowe stężenie ważnych wtórnych przekaźników takich jak: camp, wapń i diacyloglicerol. Aktywacja receptora może stymulować lub inhibować rozmaite procesy komórkowe począwszy od podstawowych aktywności metabolicznych po wyspecjalizowane funkcje w tkankach zróżnicowanych. Receptory regulując aktywność komórek same podlegają bardzo skomplikowanej regulacji. Liczba receptorów na powierzchni błony jest regulowana na kilku poziomach. Ciągła stymulacja powoduje osłabienie odpowiedzi receptora na bodziec czyli nie receptora od efektora i ostatecznie stopniowy ubytek receptorów, tak zwaną down-regulacją (P e p p e rl i R e g a n 1994, V e tu la n i 1997, W y r o b a i S u rm a cz 1996). Nasza wiedza i większość hipotez dotyczących procesu desensytyzacji jest oparta na badaniach receptora (32-adrenergicznego. Próbę klasyfikacji poszczególnych etapów procesu desensytyzacji tego receptora przedstawiono w tabeli 1 uwzględniając czas trwania każdego z nich, spadek wydajności sygnalizacyjnej receptora oraz zależność od stężenia agonisty izoproterenolu (L o h s e 1993). Poza regulacją zachodzącą na poziomie białka w wyniku aktywacji receptora może być modulowana także ekspresja genu kodującego tenże receptor. Jednym z poziomów tej regulacji jest kontrola ilości mrna kodującego dany receptor w komórce. Ilość mrna jest kontrolowa- Tabela 1. Proces desensytyzacji receptora p2-adrenergicznego (wg Lo hse 1993) Mechanizm Rozprzęganie Czas trwania Zachowana funkcja receptora (%) Wrażliwość (EC50 dla izoproterenolu) Specyficzność PARK/p-arestyna 0,2-2 min nm homologiczna PKA 2-6 min nm heterologiczna sekwestracja min nm homologiczna Down-regulacja degradacja receptora specyficzna dla agonisty 0,5-24 godz nm homologiczna wywołana przez PKA 0,5-24 godz nm heterologiczna destabilizacja mrna 0,5-24 godz. 50? heterologiczna desensytyzację, która obejmuje cały szereg procesów, takich jak: fosforylacja (przez specyficzne kinazy białkowe), sekwestracja receptora (co doprowadza do zmniejszenia ilości cząsteczek receptora na powierzchni komórki) i rozprzężena z kolei przez szybkość transkrypcji i/albo stabilność mrna (P en d e i współaut. 1996). Dla receptorów sprzężonych z białkami G po raz pierwszy opisano ten ostatni typ regulacji w roku 1988 (H a d c o c k i M a lb o n 1988) i dotyczył Praca finansowana przez Instytut Biologii Doświadczalnej z funduszy statutowych oraz Komitet Badań Naukowych. Numer projektu badawczego 6P04A
2 238 L il ia n a S u r m a c z i w s p ó ła u t o r z y on receptora beta-adrenergicznego najczęściej badanego modelu działania R7G. Okazało się, że po przedłużonej stymulacji spada ilość mrna kodującego receptor, co prowadzi do zmniejszenia całkowitej liczby receptorów w komórce poprzez zmniejszenie syntezy białka receptorowego. Cały ten proces jest uzależniony od określonych sekwencji mrna i różnych białek je wiążących, co zostanie omówione w poniższym artykule. STABILNOŚĆ mrna KODUJĄCYCH RECEPTORY R7G Kontrola ekspresji genów kodujących receptory błonowe sprzężone z białkami G poprzez regulację stabilności mrna została opisana niedawno (tab. 2) i stanowi przedmiot intensywnych badań. Wskazują one, że ten mechanizm potranskiypcyjnej regulacji dotyczy różnych receptorów błonowych, niezależnie od typu wtórnego przekaźnika informacji generowanego w procesie przekazywania sygnałów, a więc zarówno receptora (te-adrenergicznego (H a d c o c k i współaut. 1989) stymulującego cyklazę adenylanową (P e p p e rl i R e g a n 1994), jak i receptora oc2-adrenergicznego hamującego ten enzym (Sakaue i H o ffm a n 1991), czy też receptora muskarynowego mi aktywującego fosfolipazę C (L e e i współaut. 1994). Tabela 2. mrna kodujące receptory sprzężone z białkami G podlegające potranskiypcyjnej regulacji (wg P e n d e i współaut. 1996). mrna kodujące receptor Gatunek Data fh-adrenergiczny chomik 1989 P i -adrenergiczny szczur 1992 p i -adrenergiczny człowiek 1996 (X2- adrenergiczny człowiek 1991 aib-adrenergiczny szczur 1994 m 1-muskarynowy szczur HT2A-serotoniowy szczur 1994 trombinowy człowiek 1995 ATl-angiotensyny II 1994 CZYNNIKI DETERMINUJĄCE STABILNOŚĆ mrna Głównym czynnikiem determinującym ilość mrna w różnych organizmach od bakterii do ssaków jest szybkość rozpadu mrna (okres półtrwania). Związek pomiędzy ilością mrna, ich okresem półtrwania oraz ekspresją genów jest szczególnie istotny w przypadku krótkożyjących mrna, ponieważ niewielkie zmiany w ich okresie półtrwania mogą wywołać krotne (lub większe) zmiany w ich ilości w krótkim okresie czasu (Ross 1995). Przy stałym poziomie transkrypcji ilość mrna może ulec bardzo znacznym wahaniom na skutek zmiany jego stabilności, co z kolei wpływa na to jak komórka rośnie, różnicuje się i reaguje na zmiany środowiska (Ross 1996). U bakterii niemal połowa wszystkich zsyntetyzowanych cząstek mrna jest degradowana przez nukleazy w ciągu kilku minut, a u Eukaryota okres półtrwania różnych mrna wykazuje znaczną zmienność od kilku godzin (lub mniej) do kilku dni, średnio około 10 godzin (K ły s z e jk o - S t e fa n o w ic z 1995). Okres półtrwania wielu mrna ulega zmianie pod wpływem cytokin, hormonów, infekcji wirusowej, głodzenia lub niedotlenienia. Czynnikami determinującymi stabilność mrna są określone struktury i sekwencje w jego cząsteczce (czyli tak zwane determinanty cis) oraz różne białka wiążące się z tymi regionami (nazywane determinantami trans). Determinanty cis są ulokowane głównie w niekodującym odcinku mrna przy końcu 3 i tylko w przypadku nielicznych typów mrna (np. (3-tubuliny, FOS, MYC) znajdują się one w regionie kodującym (Ross 1995, 1996). Determinanty strukturalne w cząsteczce mrna odpowiedzialne za zachowanie jej stabilności powstają w wyniku tak zwanego procesu dojrzewania prekursowego mrna (tzw. heteronuclear mrna = hnrna) Prekursorowy mrna powstaje w komórce w wyniku transkrypcji i następnie ulega dalszej skomplikowanej obróbce (tzw. dojrzewaniu), która, najogólniej rzecz ujmując, obejmuje wiele różnych procesów, wśród których wyróżnić można takie jak: 1) modyfikacja 5 -końca; 2) poliadenylacja 3 -końca; 3) usunięcie intronów w procesie składania (splicing). Etap 1i 2 powodują zwiększenie stabilności pre-mrna, chroniąc go przed degradacją ze strony nukleaz. Modyfikacja 5 -końca to tworzenie tak zwanej czapeczki (lub kapturka cap), czyli metylowanego oligonukleotydu co : chroni mrna przed działaniem 5 -egzonukleaz; przekształca mrna w substrat do reakcji składania; pomaga w rozpoznaniu mrna przez CBP (cap binding proteins białka kapturkowe )
3 Regulacja stabilności mrna 239 (W a h le 1991, W a h le i K e l l e r 1996, P o r t i w s p ó ła u t. 1992, K ły s z e jk o - S t e fa n o w ic z 1995). Najistotniejszym obszarem mrna warunkującym jego stabilność jest nie ulegający translacji koniec 3 (tzw. 3 -UTR) bogaty w reszty urydynowe i adenylowe. Reszty adenylowe tworzą bardzo długi odcinek poli(a) na końcu 3, za którym występuje region AU (rye. 1). Wyróżnić Wszystkie zbadane dotąd podtypy receptorów beta-adrenergicznych posiadały 1 pentamer AUUUA, lecz ilość reszt uiydyny w regionie flankującym była różna (tab. 4). Badania nad receptorami muskarynowymi m ici i m2c2 wykazały, że ilość mrna kodujących te receptory znacznie spadała po przedłużonym działaniu agonisty karbacholu. Skomplikowane badania genetyczne i tworzenie Rye. 1. Schemat wiązania białek regulujących stabilność m RNA (zmodyfikowane wg C hen i Shyu 1995). a białka wiążące się do regionu bogatego w reszty AU (AU RE); b białka wiążące poli(a); c 3 -wkońcowy odcinek mrna nie ulegający translacji. w nim można pentamery AUUUA oraz nonamery UUAUUUA(U/A)(U/A) rozdzielone pojedynczymi nukleotydami, przy czym zarówno ilość powtórzonych sekwencji wielokrotnych, jak i pojedynczych ma najprawdopodobniej istotne znaczenie w rozpoznawaniu i wiązaniu specyficznych białek regulujących stabilność mrna (C h en i Shyu 1995). W poniższych 6 typach mrna kodujących różne receptory sprzężone z białkami G (tab. 3) znaleziono od 1 do 5 sekwencji pentamerowych w nie ulegającym translacji 3 -końcu. Tabela 3. Obecność pentamerów AUUUA w nie ulegającym translacji regionie 3 mrna kodujących receptory sprzężone z białkami G (wg T h o lanikunnel i współaut. 1995). Receptor sprzężony z białkiem G Adrenergiczny p2 1 Adrenergiczny pi 1 Angiotensyny II 4 Dopaminowy Di 5 Muskaiynowy M2 2 Muskarynowy M3 4 Serotoninowy 3 Trombiny 5 Liczba pentamerów AUUUA w regionie 3 -UTR Wykazano, że motyw AUUUA ułatwia degradację cząsteczki mrna, podczas gdy domena bogata w urydynę wywołuje proces deadenylacji i wzmacnia destabilizującą rolę pentamerów (C h en i Shyu 1995). W przypadku mrna kodującego c-fos delecja regionu bogatego w reszty AU powoduje przekształcenie protoonkogenu w onkogen. cząsteczek tych receptorów z mutacjami delecyjnymi w obrębie nie ulegającego translacji regionu 3 pozwoliły na ustalenie, że odcinek obejmujący 261 zasad warunkuje destabilizację mrna (L e e i współaut. 1994), lecz nie jest znane białko wiążące się z tym regionem cząsteczki mrna. Stabilność mrna jest uwarunkowana wiązaniem specyficznych białek do określonych sekwencji mrna, przy czym interakcja ta może zarówno stabilizować mrna, jak i destabilizować go, a okres półtrwania mrna jest wypadkową działania różnych czynników (Ross 1995, B o h ja n e n i współprac. 1992, R an gan atan i współaut. 1997). W przypadku receptorów sprzężonych z białkami G, najistotniejsze są białka wiążące się z regionem 3 UTR, jak wykazały to dotychczasowe badania nad mechanizmem regulacji ich ekspresji. Najlepiej poznano białka oddziaływujące z odcinkiem poli(a) oraz regionem bogatym w reszty AU. Tabela 4. Zawartość uiydyny (U) w nie ulegającym translacji regionie 3 flankującym pentamer AUUUA w różnych podtypach p-ar m R N A (wg T holan iku nnel i współaut. 1995). Liczba % U w 50 i 100 mrna AUUUA w nukleotydach 3 UTR flankujących P2 -AR (chomiczy) P2-AR (ludzki) p2-ar (szczurzy) Pi-AR (szczurzy)* i *Szczurzy [ij -AR nie posiada regionu poły(u) flankującego pentamer AUUUA
4 240 L il ia n a S u r m a c z i w s p ó ła u t o r z y BIAŁKA WIĄŻĄCE SIĘ Z REGIONEM POLI(A) Region poli(a) wpływa na dojrzewanie premrna, transport RNA, translację i stabilność cytoplazmatycznego mrna. Z różnych doświadczeń wynika, że region poli(a) chroni mrna przed szybką degradacją (Ross, 1995). Pierwszym krokiem w rozpadzie wielu mrna jest jego deadenylacja. Kompleks, białko wiążące odcinek poli(a) PABP, i poli(a) w 3 -końcu chroni mrna przed szybką destrukcją in vitro. Poliadenylowane mrna ulegają szybkiej degradacji, kiedy są inkubowane w ekstraktach komórkowych pozbawionych PABP, ale ulegają stabilizacji kiedy dodany zostanie egzogenny PABP. mrna pozbawiony regionu poli(a) jest niestabilny zarówno w obecności, jak i nieobecności PABP (Ross, 1996). PABP (Mr kda) wykryto w aktywowanych komórkach T i sklonowano. Białko to występuje u wielu gatunków i jest konserwatywne (B lo b e l 1973, W ilu s z i S h en k 1988). Kolejne wykryte białka z tej rodziny to PAB II (W a h le 1991) oraz ipabp (Y a n g i współaut. 1995). PAB II jest białkiem jądrowym o m.cz. 49 kda wyizolowanym z komórek ludzkich i jego sekwencja nie jest homologiczna do PABP (Yan g i współaut. 1995). ipabp akumuluje się głównie w cytoplazmie i ulega raptownej indukcji w aktywowanych ludzkich komórkach T (Y a n g i współaut. 1995). Dane uzyskane ostatnio sugerują, że białko to odgrywa większą rolę w translacji niż w regulacji stabilności mrna, przy czym w tej pierwszej jego funkcji jest istotna interakcja z regionem czapeczki oraz długość odcinka 3 -UTR (Tan- GUAY i współaut. 1996). BIAŁKA WIĄŻĄCE SIĘ Z REGIONEM AURE W mrna Nie ulegające translacji regiony 3 wielu ssaczych mrna zawierają regiony bogate w adenozynę i urydynę (ang. AURE, adenylate/uridylate rich elements). Regiony te najczęściej składają się z dwóch domen. Domena I zawiera nukleotydów, jest bogata w AU i zawiera kilkanaście pentamerów AUUUA. Domena II, przyległa do I, zawiera 20-nukleotydowy region bogaty w U (Ross 1996). Związek AURE ze stabilnością mrna jest następujący; mrna zawierający AURE wykazuje tendencję do niestabilności; jeśli AURE z nie ulegającego translacji 3 -końca niestabilnego mrna jest umieszczony w obrębie 3 -końca stabilnego mrna, to powstały chimeryczny transkrypt ulega destabilizacji. Opisano całą rodzinę białek wiążących się do regionu AURE (tzw. AUBP = A + U binding proteins); są wśród nich zarówno białka cytoplazmatyczne, jak i jądrowe oraz białka przemieszczające się pomiędzy kompartmentami komórkowymi (Ross 1996). Ich ciężar cząsteczkowy waha się od 32 do 45 kda (C h en i Shyu 1995). Następujące obserwacje sugerują wpływ AUBP na stabilność mrna: ilość lub aktywność AUBP zwiększa się lub zmniejsza przy zmianie szybkości rozpadu mrna; AUBP wpływa na stabilność mrna w układach pozakomórkowych. W 1993 roku oczyszczono białko AUF1 [A+U-rich element RNA-binding/degradation factor] (Zhang i współaut. 1993) wykryte przez Brewera (1991), który scharakteryzował je jako dwa polipeptydy o m.cz. 37 kda i 40 kda. Sklonowanie cdna dla komponenty 37 kda wykazało, że koduje on białko zawierające 2 motywy rozpoznające mrna i domeny, które mogą uczestniczyć w interakcjach typu białkobiałko (Z h an g i współaut. 1993). AUF1 wiąże się z 3 UTR kilkunastu mrna podlegających bardzo ścisłej regulacji (c-myc, c-fos) i selektywnie przyspiesza degradację c-myc mrna in vitro. Delecja regionu wiążącego AUF1z niekodującego (3 UTR) odcinka mrna genu c-myc stabilizuje to mrna. Do doświadczeń nad rolą AUF1 użyto też stabilnego mrna kodującego [3-globinę króliczą: jego odcinek 3 UTR nie destabilizuje mrna i nie wiąże się z AUF 1. Natomiast kiedy w obszar ten wbudowano region wiążący AUF 1 z mrna kodującego GM-CSF, nastąpił szybki rozpad tak skonstruowanego mrna (1-globiny in vivo. W literaturze trwa spór o to, w jaki sposób AUF1 uczestniczy w degradacji mrna. Uważa się, że proces ten jest skutkiem interakcji zarówno z AURE, jak i innymi białkami ( ), które mogą przyłączać się do łańcucha poli(a) lub PAB. To mogłoby powodować wzrost powinowactwa nukleazy poli(a) do łańcucha poli(a) w mrna zawierąjacym AURE. Być może wiązanie AUF 1 do AURE i jego inter-
5 Regulacja stabilności mrna 241 akcja z innymi białkami zmienia powinowactwo PAB do poli(a), zwiększając tym samym podatność na RN-azę (-y). Sekwencja cdna dla AUF1 zawiera polipeptyd bogaty w glutaminę (Z h a n g i współaut. 1993): KEQYQQQQQWGSRGG Takie regiony mogą pośredniczyć w interakcjach typu białko-białko i są one obecne w innych białkach wiążących RNA i DNA (B a n - d z u il is i współaut. 1989). AUF 1 występuje w jądrze i cytoplazmie tam uczestniczy w obrocie RNA (turnover), albo też wiąże się z AURE w jądrze i ułatwia transport mrnp do cytoplazmy, gdzie jego degradacja również byłaby kontrolowana przez AUF1. Ostatnio wykryto, że białko AUF1 występuje w sercu człowieka: w przypadku pacjentów cierpiących na chorobę niedokrwienną serca (heart failure) jego ilość była znacznie zwiększona, a ilość receptora (3i-adrenergicznego, jak i kodującego go mrna była znacznie obniżona. Co ciekawe, proces ten pogłębiał się w miarę nasilania się objawów chorobowych wynikających głównie z nadprodukcji adrenaliny agonisty receptora (3i i postępującego w związku z tym procesu jego desensytyzacji (P e n d e i współaut. 1996). W 1992 roku opisano białko (3ARB wiążące się z mrna kodującym receptor (te-adrenergiczny. Wykazano, że pojawia sie ono w trakcie przedłużonej stymulacji (3-receptora agonistami. Typową sekwencję zdarzeń, jakie zachodzą w wyniku stymulacji receptora opisał C o l l in s i współautorzy (1989). Krótkotrwała (do 90 minut) stymulacja agonistą komórek DDTi MF-2 (mięśni gładkich chomika) powodowała początkowo zwiększenie szybkości transkrypcji genu dla receptora (32-adrenergicznego, co wywołało 3-4-krotny wzrost poziomu mrna. Przedłużająca się stymulacja spowodowała kolejno: zmniejszenie się ilości receptora; obniżenie aktywności cyklazy adenylanowej; spadek ilości mrna, aż o 50% po 24-godzinnej inkubacji komórek z agonistą. Dalsze badania wykazały, że po 12-godzinnej stymulacji agonistą poziom białka (3ARB wiążącego mrna kodujący receptor (h-adrenergiczny stopniowo wzrastał osiągając po 24 godz. 150%, a po 48 godz. 275% w porównaniu z kontrolą (P o r t i współaut. 1992). (3ARB wiąże się selektywnie z mrna kodującym receptoiy (31 i (32, czyli z tymi podtypami receptorów adrenergicznych, które ulegają desensytyzacji uwarunkowanej obecnością agonisty, natomiast nie stwierdzono jego wiązania ani do mrna dla receptora am nie ulegającego downregulacji ani do mrna [3-globiny, któiy służył jako dodatkowa próba kontrolna, gdyż ten ostatni typ mrna jest bardzo stabilny (P o r t i współaut. 1992). Ciężar cząsteczkowy [3ARB wynosi 35 kda i jest zbliżony do innego niedawno opisanego białka AUF 1, jak i innych białek wiążących RNA (P o r t i współaut. 1992). Wiązanie (3ARB do mrna jest znoszone stechiometrycznie i kompetycyjnie przez homopolimery poli(u), lecz nie przez homopolimery typu poli(a), poli(c), czy poli(g) RNA (P o r t i współaut. 1992). Dalsze badania nad tym białkiem wykazały, że rozpoznaje ono nie tylko mrna kodujące receptor typu beta lecz także transkiypt receptora trombinowego (T h o l a n ik u n n e l i współaut. 1995), czyli kolejnego receptora również sprzężonego z białkiem G (G u a n 1994). Porównanie sekwencji różnych receptorów wykazało, że białko to rozpoznaje pentamery AUU- UA wraz z odcinkiem poli(u) ograniczającym (flankującym) tę sekwencję (T h o l a n ik u n n e l i współaut. 1995). Przeprowadzone badania mutagenetyczne ujawniły, że obie te cechy są niezbędne do interakcji mrna-białko i pozwoliły na ustalenie następującej preferencji wiązania: chomiczy receptor (32 > szczurzy receptor (31 > ludzki receptor [33 > szczurzy receptor (33. Wykazano, że (3ARB wiąże się też z c-myc i c-fos (Z h a n g i współaut. 1993). Tak więc nieoczekiwanie okazało się, że (3ARB jest najbardziej uniwersalnym z dotychczas poznanych białek wiążących się z mrna w procesie potranskrypcyjnej regulacji ekspresji różnych genów. ZAKO ŃCZE NIE Badania ostatnich lat wskazują, że istotnym elementem regulacji ekspresji genów kodujących receptory sprzężone z białkami G jest kontrola stabilności informacyjnych kwasów rybonukleinowych powstałych w trakcie ich transkrypcji (P o r t i współaut. 1992) Wykrycie określonych sekwencji mrna oraz białek wiążących się do nich pozwala na stopniowe wyjaśnienie molekularnych podstaw desensytyzacji oraz down-regulacji receptorów błonowych procesów leżących u podstaw wielu reakcji fizjologicznych.
6 242 L il ia n a S u r m a c z i w s p ó ła u t o r z y REGULATION OF STABILITY OF THE G-PROTEIN-COUPLED RECEPTORS mrna S u m m a ry The family of G-protein-coupled receptors regulate a number of different processes within the living cells acting via the second messenger signalling pathway. On the other hand, the receptors themselves undergo a very strict regulation at different levels. A prolonged exposure to agonists evokes receptor desensitization and sequestration which leads to a gradual decrease in the receptor number - downregulation. At the same time the posttranscriptional regulation occurs at the gene expression level: one of its elements is the regulation of mrna stability. mrna stability depends on defined structural and sequence determinants residing in its molecule (cis elements) and specific proteins binding to these regions (trans determinants). AUF1 and (3ARB proteins are the best examples of the proteins binding to 3 -untranslated region of mrna of different G-proteincoupled receptors, and their features have been discussed in detail in the article. LITERATURA B a n d z u il is R. J., S w a n s o n M. S., D r e y f u s s G., RNAbinding proteins as developmental regulators. Genes Dev. 3, B lo b e l G., A protein o f molecular weight 78,000 bound to the polyadenylate region o f eukaryotic messenger RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 70, B o h ja n e n P. R., P e t r y n ia k B., J u n e C. H., T h o m p s o n C. B., L in d s t e n T., A U RNA-binding Factors Differ in Their Binding Specificities and Affinities. J. Biol. Chem. 267, B r e w e r G., An A+U-rich element RNA binding factor regulates c-myc mrna stability in vitro. Mol. Cell. Biol. 11, C h e n C.-YA., S h yu A.-B., AU-rich elements: characterization and importance in mrna degradation. TIBS 20, C o llin s S., B o u v ie r M., B o l a n o w s k i M. A., C a r o n M. G., camp stimulates transcription o f [3-adrenergic receptor gene in response to short-term agonist exposure. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86, G u an X.-M., Miscellaneous Receptors. [W:] P e r o u t k a S. J. (red.). Handbook o f receptors and channels. G-protein coupled receptors. CRC Press, Inc. Boca Raton, Florida, H a d c o c k J. R., M a l b o n C. C., Down-regulation o f 3-adrenergic receptors: Agonist-induced reduction in receptor mrna levels. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85, H a d c o c k J. R., Ros M., M a l b o n C. C., Agonist Regulation off-adrenergic Receptor mrna. J. Biol. Chem. 264, K l y s z e j k o -S t e f a n o w ic z L., Cytobiochemia. Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, str L ee N. H., E a r l e -H u g h e s J., F r a s e r C. M., Agonistmediated destabilization o f m l muscarinic acetylcholine recepotr mrna. J. Biol. Chem. 269, L o h s e M.-J., Molecular mechanism o f membrane receptor desensitization. Biochim. Biophys. Acta 1179, P e n d e A., T r e m m e l K. D., D em a r ia Ch. T., B l a x a l l B. C., M in o b e W. A., S h e r m a n J. A., B is o g n a n o J. D., B r is t o w M. R., B r e w e r G., P o r t J. D., Regulation o f the mrna-binding protein AUF1 by activation o f the J3- adrenergic receptor signal transduction pathway. J. Biol. Chem. 271, P e p p e r l D. J., R e g a n J. W., Adrenergic receptors. [W:] P e r o u t k a S. J. (red.). Handbook o f receptors and channels. G-protein coupled receptors. CRC Press, Inc. Boca Raton, Florida, P o r t J. D., H u a n g L.-Y., M a l b o n C. C., (3-adrenergic agonists that down-regulate receptor mrna up-regulate a Mr 35,000 protein(s) that selectively binds to [3- adrenergic receptor mrnas. J. Biol. Chem. 267, R a n g a n a t a n G., V u D., K e r n P. A., Translational regulation o f lipoprotein lipase by epinephrine involves a trans-acting binding protein interacting with the 3 untranslated region. J. Biol. Chem. 272, Ross J., mrna stability in mammalian cells. Microbiol. Rev. 59, Ross J., Control o f messenger RNA stability in higher eukaryotes. Trends in Genetics 12, S akaue M., H offm an B. B., camp regulates transcription o f the a2a adrenergic receptor gene in HT-29 cells. J. Biol. Chem. 266, T a n g u a y R. L., G a l l ie D. R., Translational efficiency is regulated by the length o f the 3 untranslated region. Mol. Cell. Biol. 16, T h o l a n ik u n n e l B. G,, G r a n n e m a n J. G., M a l b o n C. C., The Mr (3-adrenergic receptor mrna-binding protein binds transcripts o f G-protein-linked receptors which undergo agonist-induced destabilization. J. Biol. Chem. 270, V e t u l a n i J., Regulacja przekaźnictwa neuronalnego. Wszechświat 98, W a h l e E., A novel poly (A)-binding protein acts as a specificity factor in the second phase o f messenger RNA polyadenylation. Cell 66, W ah le E., K eller W., The biochemistry of polyadenylation. TIBS 21, W il u s z J., S h e n k T., A 64 kd nuclear protein binds to RNA segments that include the AAUAAA polyadenylation motif. Cell 52, W y r o b a E., S u r m a c z L., Receptor beta-adrenergiczny: budowa i istotne motywy sekwencyjne. Post. Biol. Kom. 23, ; Y a n g H., D u c k e t t C. S., L in d s t e n T., ipabp, an inducible poly (A)-binding protein detected in activated human T cells. Mol. Cell. Biol. 15, Z h a n g W., W a g n e r B. J., E h r e n m a n K., S c h a e f e r A. W., D e m a r ia C. T., C r a t e r D., D e h a v e n K., L o n g L., B r e w s t e r G., Purification, characterization, and cdna cloning o f an AU-rich element RNA-binding protein, AUF1. Mol. Cell. Biol. 13,
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Informator (przekaźnik) pierwotny czynnik fizyczny lub chemiczny będący nośnikiem
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Informator (przekaźnik) pierwotny czynnik fizyczny lub chemiczny będący nośnikiem
Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa
Informator (przekaźnik) pierwotny czynnik fizyczny lub chemiczny będący nośnikiem informacji odebranej przez komórkę. Sygnalizacja międzykomórkowa i wewnątrzkomórkowa Receptor cząsteczka chemiczna ( peptyd
TRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Wykład 1. Od atomów do komórek
Wykład 1. Od atomów do komórek Skład chemiczny komórek roślinnych Składniki mineralne (nieorganiczne) - popiół Substancje organiczne (sucha masa) - węglowodany - lipidy - kwasy nukleinowe - białka Woda
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro
DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany
Bezpośrednia embriogeneza somatyczna
Bezpośrednia embriogeneza somatyczna Zarodki somatyczne formują się bezpośrednio tylko z tych komórek roślinnych, które są kompetentne już w momencie izolowania z rośliny macierzystej, czyli z proembriogenicznie
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
Metody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Zgodnie z ogólnie przyjętą konwencją, geny na schematach przedstawia się od lewej do prawej, w kierunku transkrypcji. Nić DNA z taką samą sekwencją
Zgodnie z ogólnie przyjętą konwencją, geny na schematach przedstawia się od lewej do prawej, w kierunku transkrypcji. Nić DNA z taką samą sekwencją nukleotydów jak RNA, tzw. nić kodującą, pokazuje się
Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów
Zawartość 139585 Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej
SEMINARIUM 8:
SEMINARIUM 8: 24.11. 2016 Mikroelementy i pierwiastki śladowe, definicje, udział w metabolizmie ustroju reakcje biochemiczne zależne od aktywacji/inhibicji przy udziale mikroelementów i pierwiastków śladowych,
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
HORMONY STERYDOWE I PODOBNIE DZIAŁAJĄCE
HORMONY STERYDOWE I PODOBNIE DZIAŁAJĄCE Są to związki należące do grupy steroidów, które charakteryzują się wykazywaniem istotnych aktywności biologicznych typu hormonalnego. Docierając do komórki docelowej,
Pytania Egzamin magisterski
Pytania Egzamin magisterski Międzyuczelniany Wydział Biotechnologii UG i GUMed 1. Krótko omów jakie informacje powinny być zawarte w typowych rozdziałach publikacji naukowej: Wstęp, Materiały i Metody,
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP
WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE Ewa Waszkowska ekspert UPRP Źródła informacji w biotechnologii projekt SLING Warszawa, 9-10.12.2010 PLAN WYSTĄPIENIA Umocowania prawne Wynalazki biotechnologiczne Statystyka
Politechnika Śląska w Gliwicach Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki
Politechnika Śląska w Gliwicach Wydział Automatyki, Elektroniki i Informatyki Analiza procesów regulacji ekspresji genów w komórkach poddanych działaniu promieniowania jonizującego. Roman Jaksik Rozprawa
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt wykładu Rozpoznanie antygenu
Geny, a funkcjonowanie organizmu
Geny, a funkcjonowanie organizmu Wprowadzenie do genów letalnych Geny kodują Białka Kwasy rybonukleinowe 1 Geny Występują zwykle w 2 kopiach Kopia pochodząca od matki Kopia pochodząca od ojca Ekspresji
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
Gen eukariotyczny. Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne
Gen eukariotyczny Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne Definicja genu Region DNA, który określa dziedziczoną cechę organizmu; zwykle koduje pojedyncze białko lub RNA. Zawiera całą funkcjonalną
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 4 Jak działają geny?
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
BIOINFORMATYKA. edycja 2016 / wykład 11 RNA. dr Jacek Śmietański
BIOINFORMATYKA edycja 2016 / 2017 wykład 11 RNA dr Jacek Śmietański jacek.smietanski@ii.uj.edu.pl http://jaceksmietanski.net Plan wykładu 1. Rola i rodzaje RNA 2. Oddziaływania wewnątrzcząsteczkowe i struktury
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Budowa rybosomu Translacja
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii. Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego
Joanna Bereta, Aleksander Ko j Zarys biochemii Seria Wydawnicza Wydziału Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii Uniwersytetu Jagiellońskiego Copyright by Wydział Bio chemii, Biofizyki i Biotechnologii
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska
Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych
The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes
The Mos/mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway regulates the size and degradation of the first polar body in maturing mouse oocytes TAESAENG CHOI*, KENJI FUKASAWA*, RENPING ZHOUt, LINO TESSAROLLO*,
Komórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.
Transport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Ćwiczenie 14. Maria Bełtowska-Brzezinska KINETYKA REAKCJI ENZYMATYCZNYCH
Ćwiczenie 14 aria Bełtowska-Brzezinska KINETYKA REAKCJI ENZYATYCZNYCH Zagadnienia: Podstawowe pojęcia kinetyki chemicznej (szybkość reakcji, reakcje elementarne, rząd reakcji). Równania kinetyczne prostych
Transkrypcja i obróbka RNA. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Transkrypcja i obróbka RNA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Centralny dogmat biologii molekularnej: sekwencja DNA zostaje
DNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Kolokwium (14pkt) Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
Statystyczna analiza danych
Statystyczna analiza danych ukryte modele Markowa, zastosowania Anna Gambin Instytut Informatyki Uniwersytet Warszawski plan na dziś Ukryte modele Markowa w praktyce modelowania rodzin białek multiuliniowienia
CYTOSZKIELET CYTOSZKIELET Cytoplazma podstawowa (macierz cytoplazmatyczna) Komórka eukariotyczna. cytoplazma + jądro komórkowe.
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe (układ wykonawczy) cytoplazma podstawowa (cytozol) Cytoplazma złożony koloid wodny cząsteczek i makrocząsteczek (centrum informacyjne) organelle i kompleksy
Scenariusz lekcji przyrody/biologii (2 jednostki lekcyjne)
Joanna Wieczorek Scenariusz lekcji przyrody/biologii (2 jednostki lekcyjne) Strona 1 Temat: Budowa i funkcje kwasów nukleinowych Cel ogólny lekcji: Poznanie budowy i funkcji: DNA i RNA Cele szczegółowe:
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Gen eukariotyczny. Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne
Gen eukariotyczny Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne 1 Definicja genu } Region DNA, który określa dziedziczoną cechę organizmu; zwykle koduje pojedyncze białko lub RNA. } Zawiera całą funkcjonalną
Gen eukariotyczny. Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne
Gen eukariotyczny Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne 1 Klasyczne wyobrażenie genu fragment DNA, który koduje funkcjonalny mrna Wszystkie transkrypty mrna mają niekodujące fragmenty 5 i 3 końcowe
Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD. 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17
Rozkład materiału z biologii dla klasy III AD zakres rozszerzony LO 7 godz / tyg rok szkolny 2016/17 Biologia na czasie 2 zakres rozszerzony nr dopuszczenia 564/2/2012 Biologia na czasie 3 zakres rozszerzony
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
6. Z pięciowęglowego cukru prostego, zasady azotowej i reszty kwasu fosforowego, jest zbudowany A. nukleotyd. B. aminokwas. C. enzym. D. wielocukier.
ID Testu: F5679R8 Imię i nazwisko ucznia Klasa Data 1. Na indywidualne cechy danego osobnika ma (maja) wpływ A. wyłacznie czynniki środowiskowe. B. czynniki środowiskowe i materiał genetyczny. C. wyłacznie
Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF
Agnieszka Gładysz Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF Katedra i Zakład Biochemii i Chemii Klinicznej Akademia Medyczna Prof.
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Transgeneza - genetycznie zmodyfikowane oraganizmy 2. Medycyna i ochrona zdrowia 3. Genomika poznawanie genomów Przełom XX i
Wielofunkcyjne bialko CBC dynamika wiazania konca 5 mrna
Wielofunkcyjne bialko CBC dynamika wiazania konca 5 mrna Ryszard Stolarski UNIWERSYTET WARSZAWSKI Wydzial Fizyki, Instytut Fizyki Doswiadczalnej, Zaklad Biofizyki ul. Zwirki i Wigury 93, 02-089 Warszawa
FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach
FOCUS Plus - Silniejsza ryba radzi sobie lepiej w trudnych warunkach FOCUS Plus to dodatek dostępny dla standardowych pasz tuczowych BioMaru, dostosowany specjalnie do potrzeb ryb narażonych na trudne
TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
Instytut Sportu. Biochemiczne wskaźniki przetrenowania. Zakład Biochemii. mgr Konrad Witek
Instytut Sportu Zakład Biochemii Biochemiczne wskaźniki przetrenowania Przetrenowanie (overtraining)- długotrwałe pogorszenie się dyspozycji sportowej zawodnika, na skutek kumulowania się skutków stosowania
Badanie funkcji genu
Badanie funkcji genu Funkcję genu można zbadać różnymi sposobami Przypadkowa analizy funkcji genu MUTACJA FENOTYP GEN Strategia ukierunkowanej analizy funkcji genu GEN 1. wprowadzenie mutacji w genie 2.
Gen eukariotyczny. Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne
Gen eukariotyczny Działanie i regulacja etapy posttranskrypcyjne 1 Geny eukariotyczne Procesy transkrypcji i translacji są rozdzielone w przestrzeni i czasie Każdy gen ma własny promotor, nie występują
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Ekspresja genów jest regulowana
Wprowadzenie. DNA i białka. W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej.
Wprowadzenie DNA i białka W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej. Białka: łańcuchy złożone z aminokwasów (kilkadziesiąt kilkadziesiąt
części określano skrótem vrna8. Cząsteczka ta, o długości 875 nukleotydów, koduje dwa białka, białko niestrukturalne (NS1, ang.
STRESZCZENIE Grypa corocznie wywołuje epidemie i sporadycznie pandemie. Światowa Organizacja Zdrowia podaje, że każdego roku na grypę choruje 5-15% populacji ludzkiej, w tym u 3-5 milionów ludzi obserwuje