OCENA MOŻLIWOŚCI ZASTOSOWANIA METOD MOLEKULARNYCH DO DIAGNOSTYKI NOSICIELSTWA ORAZ ANALIZY PODOBIEŃSTWA IZOLATÓW STREPTOCOCCUS AGALACTIAE *
|
|
- Bronisław Michalik
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: Monika Brzychczy-Włoch 1, Magdalena Strus 1, Dorota Pawlik 2, Tomasz Gosiewski 1, Krzysztof Rytlewski 3, Artur Drzewiecki 1, Ryszard Lauterbach 2, Piotr B. Heczko 1 OCENA MOŻLIWOŚCI ZASTOSOWANIA METOD MOLEKULARNYCH DO DIAGNOSTYKI NOSICIELSTWA ORAZ ANALIZY PODOBIEŃSTWA IZOLATÓW STREPTOCOCCUS AGALACTIAE * 1 Katedra Mikrobiologii Collegium Medicum UJ Kraków Kierownik: Prof. dr hab. med. P. B. Heczko 2 Katedra Ginekologii i Położnictwa, Klinika Neonatologii Collegium Medicum UJ Kraków Kierownik: Prof. dr hab. med. R. Lauterbach 3 Katedra Ginekologii i Położnictwa, Klinika Ginekologii, Położnictwa i Onkologii Collegium Medicum UJ Kraków Kierownik: Prof. dr hab. med. Ai Basta Potwierdzono, że metody PCR i FISH mogą być skutecznie wykorzystywane w szybkiej diagnostyce S. agalactiae (GBS) w materiałach pobranych z przedsionka pochwy ciężarnych. Dzięki metodzie RAPD wykazano, że dzieci urodzone przez kobiety skolonizowane szczepami GBS, ulegały kolonizacji szczepami matczynymi bez względu na rodzaj i przebieg porodu. Ponadto, wykryto kolonizację S. agalactiae u dzieci urodzonych przez matki nieskolonizowane GBS w wyniku przeniesienia szczepów w środowisku szpitalnym. Przy użyciu metody PCR-multiplex wykazano obecność genów oporności na erytromycynę (erma, ermb, ermc) u izolatów z fenotypowo potwierdzonym mechanizmem oporności typu MLS B. Zalecenia Center for Disease Control and Prevention (CDC) dotyczące sposobu wykrywania kolonizacji ciężarnych przez Streptococcus agalactiae (Group B Streptococcus, GBS) obejmują konieczność wykonywania badań przesiewowych w kierunku obecności GBS wśród wszystkich kobiet powyżej 35 tygodnia ciąży, a także pobieranie próbek materiału z dwóch miejsc równolegle, to jest z pochwy i odbytu oraz ich preinkubację w odpowiednim podłożu namnażającym (12). W Polsce najbardziej dotychczas rozpowszechnioną metodą wykrywania nosicielstwa GBS jest bezpośrednia hodowla posiewu z wymazu na wzbogaconym podłożu agarowym z krwią, a następnie identyfikacja przy użyciu lateksowych testów aglutynacyjnych (8, 14). * Praca finansowana w ramach grantu numer 3PO5E08425 z Ministerstwa Nauki i Informatyzacji.
2 92 M. Brzychczy-Włoch i inni Nr 2 Metody tradycyjne oparte na hodowli są jednak czasochłonne, dlatego też prowadzi się badania nad możliwością zastosowania w diagnostyce GBS metod molekularnych, cechujących się znacznie większą czułością i skracających czas oczekiwania na wynik badania do zaledwie kilku godzin (1, 7). Z tego powodu, prowadząc badania nad nosicielstwem GBS u ciężarnych oparte na metodzie zalecanej przez CDC, a opisane w poprzedniej pracy (4), równolegle w wybranych przypadkach zastosowano także niektóre metody molekularne, zarówno do wykrywania nosicielstwa GBS jak i do prowadzenia analizy epidemiologicznej. W związku z tym w poniższej pracy dokonano: - oceny wartości metod PCR oraz FISH (fluorescencyjna hybrydyzacja in situ) zastosowanych do szybkiego wykrywania GBS w wymazach w porównaniu z metodą hodowli opartą na zaleceniach CDC. - analizy genotypowego podobieństwa pomiędzy izolatami GBS z zastosowaniem metody RAPD wykorzystanej do typowania epidemiologicznego. - wykazania obecności genów erm A, erm B, erm C kodujących oporność na erytromycynę u szczepów GBS z zastosowaniem metody PCR-multiplex. MATERIAŁ I METODY Materiałem do badań były wymazy z pochwy i odbytu pobrane w latach w dniu porodu od 563 kobiet oraz wymazy z ucha i jamy ustnej noworodków. Materiały były diagnozowane w kierunku GBS metodą hodowli, a także przy użyciu metody PCR oraz techniki FISH. Badania metodą PCR z użyciem gatunkowo specyficznych starterów Sag59 i Sag190 (EUROGENTEC) przeprowadzono zgodnie z metodyką Ke i wsp. (7). Chromosomalne DNA izolowano przy użyciu kolumienkowego zestawu zgodnie z zaleceniami producenta (DNA Gdańsk). Typowa mieszanina reakcyjna zawierała: bufor do polimerazy (końcowe stężenia: 10 mm Tris HCl, ph 8,8; 50 mm KCl; 0.1% Triton X-100), 200 µm każdego dntp, 2,5 mm MgCl 2, 1µM starterów, 50 ng bakteryjnego DNA i 1U polimerazy Pwo - Delta2 (DNA Gdańsk). Program amplifikacji był następujący: 94 C przez 3min, następnie 40 cykli (95 C przez 1 sek, 55 C przez 30 sek i 72 C przez 2 min) oraz 72 C przez 5 min. Otrzymane produkty amplifikacji (153 pz) analizowano w 1% żelu agarozowym w obecności bromku etydyny (Bio-Rad). Badania metodą FISH z wykorzystaniem gatunkowo specyficznej sondy Saga 67 a/b (EUROGENTEC) zostały wykonane według zmodyfikowanej metody Artz i wsp. (1) oraz Harmsen i wsp. (6). Wacik z wymazem umieszczano w 1 ml NaCl i energicznie mieszano przez 1 min., a następnie zawiesinę wirowano przy obrotów/minutę przez 5 min. Płyn znad osadu odrzucano, zaś osad rozprowadzano w 10 µl jałowej wody destylowanej. Następnie 10 µl zawiesiny nanoszono na powierzchnię specjalnego szkiełka mikroskopowego do hybrydyzacji SuperFrost Plus (Menzel-Glaser). Wyschnięty preparat zalewano 500 µl roztworu 4% paraformaldehydu (SIGMA) i umieszczano na okres 20 min w temp. 4 C. Całość przepłukiwano PBS (IITD, PAN) i zalewano 1 ml 96 % metanolu (POCh) na 15 min w temp. -20 C. Następnie przepłukiwano ciepłym (50 C) PBS i zalewano 20 µl rozcieńczonego roztworu lizozymu (8 mg/ml) z lizostafiną (1 mg/ml) (Bio-Rad). Całość inkubowano przez 3 min w temp 37 C, po czym dwukrotnie płukano ciepłym PBS. W celu
3 Nr 2 Molekularna diagnostyka nosicielstwa S. agalactiae 93 przeprowadzenia hybrydyzacji, mieszano 5 µl roztworu (50ng/µl) sondy Sag 67 a/b z 45 µl buforu do hybrydyzacji: 20 mm Tris HCl, ph 7,2 (SIGMA); 0,9 M NaCl (SERVA); 0,1 % SDS (SERVA) ogrzanego do temperatury około 50 C. Gotowy roztwór (50 µl) nanoszono na preparat i całość umieszczano w wilgotnej komorze na 1,5 godz. w temp. 56 C. Po dokładnym płukaniu wodą, preparat dobarwiano 50 µl roztworu DAPI (Sigma) (5 µl DAPI i 45 µl wody jałowej, destylowanej) przez 2 min w temp. pokojowej. Wybarwiony preparat dokładnie płukano i suszono w ciemności, a następnie oglądano w mikroskopie fluorescencyjnym BX51 (Olympus) wyposażonym w obiektyw immersyjny 100x z lampą UV oraz kamerę F-Viev. Uzyskany obraz analizowano przy użyciu programu komputerowego AnalySYS (Soft Imaging). W celu porównania liczb uzyskanych metodą FISH z populacjami GBS określanymi w jednostkach tworzących kolonie/ml, a tym samym wyznaczenia progu detekcji metody FISH, z pobranego od pacjentki materiału wykonywano posiew metodą dziesiętnych rozcieńczeń na stałe podłoże Columbia Blood Agar (Difco) z 5% krwią baranią, które inkubowano w 37 o C w warunkach tlenowych przez 24 godz. Analizę porównawczą szczepów GBS przeprowadzono posługując się metodą RAPD (losowa amplifikacja polimorficznych fragmentów DNA) z wykorzystaniem startera OPB17 (9). Metoda ta posłużyła do analizowania genotypowego podobieństwa pomiędzy wybranymi szczepami GBS pochodzącymi od matek i ich dzieci. Szczepy GBS przechowywane w temp. 70 o C, namnażano w bulionie zwykłym (Biocorp) w 37 C przez 24 godz. Chromosomalne DNA izolowano przy użyciu kolumienkowego zestawu zgodnie z zaleceniami producenta (DNA Gdańsk). Mieszanina reakcyjna zawierała: bufor do polimerazy (końcowe stężenia: 10 mm Tris HCl, ph 8,8; 50 mm KCl; 0,1% Triton X-100), 200 µm każdego dntp, 2,5 mm MgCl 2, 1 µm starterów, 50 ng bakteryjnego DNA i 2 U polimerazy Pwo Delta2 (DNA Gdańsk). Program amplifikacji był następujący: 94 C przez 5min, następnie 35 cykli (94 C przez 30 sek, 35 C przez 30 sek i 72 C przez 1 min) oraz 72 O C przez 5 min. Otrzymane produkty amplifikacji ( pz) analizowano w 1% żelu agarozowym w obecności bromku etydyny (Bio-Rad). Do porównawczej analizy pasków rozkładów elektroforetycznych zastosowano program Molecular Analyst (Bio-Rad). Oznaczenie genów oporności erma, ermb, ermc wykonano przy użyciu metody PCRmultiplex z odpowiednio dobranymi trzema parami zdegenerowanych starterów ErmA1, ErmA2, ErmB1, ErmB2; ErmC1, ErmC2 (13). Badaniu poddano szczepy GBS wyizolowane od matek i ich dzieci z fenotypowo wykazanym mechanizmem oporności typu MLS B. Szczepy przechowywane w temp. 70 o C, namnażano w bulionie zwykłym (Biocorp) w 37 C przez 24 godz. Chromosomalne DNA izolowano przy użyciu kolumienkowego zestawu zgodnie z zaleceniami producenta (DNA Gdańsk). Mieszanina reakcyjna zawierała: bufor do polimerazy (końcowe stężenia: 10 mm Tris HCl, ph 8,8; 50 mm KCl; 0,1% Triton X-100), 200 µm każdego dntp, 2,5 mm MgCl 2, 1 µm odpowiednich starterów, 50 ng bakteryjnego DNA i 1 U polimerazy Pwo Delta2 (DNA Gdańsk). Program amplifikacji był następujący: 93 C przez 3min, następnie 40 cykli (93 C przez 1 min, 52 C przez 1 min i 72 C przez 1 min) oraz 72 O C przez 5min. Otrzymane produkty amplifikacji analizowano w 1% żelu agarozowym w obecności bromku etydyny (Bio-Rad). Wynik badania uznawano za wiarygodny, jeśli na żelu agarozowym uzyskano przynajmniej jeden prążek, reprezentujący fragment genu: erma (645 pz) lub ermb (639 pz) lub ermc (642 pz).
4 94 M. Brzychczy-Włoch i inni Nr 2 WYNIKI I ICH OMÓWIENIE Potwierdzono, że metoda PCR może być skutecznie wykorzystywana w szybkiej diagnostyce S. agalactiae w wymazach pobranych z przedsionka pochwy (Ryc. 1), gdyż charakteryzuje się wysoką specyficznością i czułością oraz krótkim czasem oznaczenia, co może mieć istotne znaczenie przy profilaktyce zakażeń GBS u noworodków, których matki nie były badane w trakcie ciąży. 153 pz Ryc. 1: Produkty amplifikacji PCR otrzymane z wykorzystaniem swoistych starterów (Sag 59, Sag 150) dla gatunku S. agalactiae. Ścieżki: 1 - marker wielkości pz, badane materiały pobrane z przedsionka pochwy ciężarnych, 9 - próba pozytywna, wzorzec S. agalactiae DSMZ 2134, 10 - próba negatywna. Wykazanie prążka zamplifikowanego produktu na wysokości 153 pz wskazuje na obecność GBS w badanym materiale. Przeprowadzono porównanie czułości metody opartej na ilościowej hodowli, z metodą FISH badając równolegle 30 wybranych próbek pochodzących od kobiet ciężarnych (Tabela I). Wykrycie GBS w próbce metodą FISH było możliwe tylko wówczas, gdy populacja paciorkowców przekraczała liczbę 1x10 3 c.f.u./ml. Chociaż czułość metody FISH była niższa niż metody hodowli, może to stanowić pozytywną cechę tej techniki, Tabela I: Porównanie czułości metody hodowli oraz metody FISH przy wykrywaniu obecności GBS w wymazach pobranych przed porodem z pochwy. Liczba GBS (c.f.u./ml) w badanym materiale Wynik metody FISH Liczba badanych materiałów 2,5 x ,0-5,0 x /- 5 0,5-5,0 x ,5-5,0 x ,5 x Razem 30 - brak obecności GBS w badanym materiale +/- wynik wątpliwy + obecność GBS w badanym materiale
5 Nr 2 Molekularna diagnostyka nosicielstwa S. agalactiae 95 gdyż istnieje związek pomiędzy intensywnością nosicielstwa GBS w ciąży, a szansą ich przeniesienia na noworodka w trakcie porodu. Największe ryzyko wystąpienia wczesnej posocznicy u noworodków występuje wtedy, gdy u matki mamy do czynienia z masywną kolonizacją GBS (>10 5 c.f.u./ml) (2). Badanie metodą FISH może zatem eliminować przypadki nosicielstwa niewielkich populacji tych bakterii. Z drugiej zaś strony technika ta umożliwia przeprowadzenie badania nosicielstwa w ciągu 4-5 godzin, co również może mieć praktyczne zastosowanie przy profilaktyce zakażeń GBS u kobiet zgłaszających się do porodu, a nie badanych podczas ciąży. Ponadto zaobserwowano, iż metoda FISH dzięki wysokiej swoistości umożliwia wykrywanie zanieczyszczeń hodowli S. agalactiae innymi paciorkowcami niezauważalnymi w hodowli. Pomimo zastosowania rutynowej metody posiewu redukcyjnego w badaniach nad nosicielstwem GBS uzyskano pojedyncze kolonie paciorkowców, w których dochodziło do koagregacji komórek S. agalactiae z S. sanguis, S. pyogenes lub Enterococcus sp. (Ryc. 2), co w istotny sposób wpływało na wyniki identyfikacji genotypowej takich koagregatów, a także na ocenę interpretacji wyników oznaczenia lekooporności, szczególnie przy wykrywaniu mechanizmu oporności typu MLS B. Możliwość zastosowania techniki fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ do rozróżniania mieszanin blisko spokrewnionych drobnoustrojów była wykorzystywana już w mikrobiologii przemysłowej (5, 11). Ryc. 2: Zastosowanie metody fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ z użyciem gatunkowo specyficznej sondy Saga 67 a/b znakowanej CY3 oraz sondy EUB, do wykrywania koagregacji szczepów S. agalactiae (ziarniaki koloru białego) z innymi paciorkowcami (ziarniaki koloru szarego) nie wykrywanymi w hodowli (powiększenie 1000x, mikroskop fluorescencyjny firmy Olympus). Posługując się metodą RAPD określono stopień genotypowego podobieństwa szczepów GBS wyizolowanych od matek i ich dzieci. Wykazano, że dzieci urodzone z matek skolonizowanych paciorkowcem grupy B ulegały kolonizacji szczepami GBS pochodzącymi od nich. Ponadto zaobserwowano, iż mimo przebiegu porodu za pomocą cesarskiego cięcia bez pęknięcia błon płodowych, noworodek zostaje skolonizowany szczepami S. agalactiae (Ryc. 3). W czterech przypadkach, na pięć badanych, wykazano 100% podobieństwa po-
6 96 M. Brzychczy-Włoch i inni Nr 2 Ryc. 3. Oznaczenie metodą RAPD stopnia genotypowego podobieństwa pomiędzy szczepami GBS wyizolowanymi od matek (M), a szczepami GBS wyizolowanymi od ich dzieci (C; C1, C2- para bliźniąt) urodzonych przez cesarskie cięcie bez wcześniejszego pęknięcia błon płodowych. między szczepami GBS wyizolowanymi od matek, a szczepami GBS wyizolowanymi od ich dzieci, co może sugerować, że noworodki urodzone przez cesarskie cięcie, pomimo braku wcześniejszego pęknięcia pęcherza płodowego, ulegają jednak kolonizacji szczepami GBS pochodzącymi od matek. Takie sugestie stoją jednak w sprzeczności z wcześniejszym doniesieniem autorów włoskich, którzy nie wykazali kolonizacji noworodków w takich okolicznościach (3). Dodatkowo w trakcie badania kolonizacji GBS noworodków wyłoniono grupę 12 dzieci urodzonych na dwóch oddziałach Szpitala Uniwersyteckiego CMUJ (5 dzieci z ciąży prawidłowych i 7 dzieci z ciąży wysokiego ryzyka), u których wykryto bezpośrednio po porodzie GBS, mimo braku tej bakterii u ich matek. Stosując metodę RAPD przeanalizowano genotypowe podobieństwo powyższych izolatów, w celu ewentualnego wykrycia Ryc. 4: Badanie stopnia genotypowego podobieństwa przy użyciu metody RAPD: a. pomiędzy szczepami GBS wyizolowanymi od 5 dzieci urodzonych przez matki nie skolonizowane przez S. agalactiae z ciążą prawidłowo przebiegającą na Oddziale Położniczym Szpitala Uniwersyteckiego CMUJ w Krakowie, b. pomiędzy szczepami GBS wyizolowanymi od 7 dzieci urodzonych przez nie skolonizowane matki z ciążą wysokiego ryzyka na Oddziale Patologii Ciąży Szpitala Uniwersyteckiego CMUJ w Krakowie.
7 Nr 2 Molekularna diagnostyka nosicielstwa S. agalactiae 97 pozamatczynego źródła kolonizacji. Na podstawie uzyskanych wyników (Ryc. 4) wykazano, że badane szczepy w większości przypadków różniły się między sobą, wykazując podobieństwo rzędu 30% do 80%. W jednym przypadku wykazano 100% podobieństwa pomiędzy dwoma badanymi szczepami: B126/C i B127/C. Szczepy te pochodziły od dwojga dzieci urodzonych w tym samym dniu na Oddziale Położniczym Szpitala Uniwersyteckiego CMUJ przez różne nie skolonizowane matki. Wynik ten może świadczyć o możliwości przeniesienia tego drobnoustroju w warunkach szpitalnych, prawdopodobnie przez personel oddziału. Takie sytuacje zostały opisane w literaturze medycznej (10). Potwierdzenie takiej hipotezy i wykrycie dróg przenoszenia wymaga jednak osobnych badań, obejmujących wykrywanie nosicielstwa GBS wśród personelu szpitalnego. Dla wszystkich wyizolowanych szczepów GBS z fenotypowo wykazaną opornością typu MLS B potwierdzono obecność sekwencji kodujących oporność na erytromycynę metodą PCR-multiplex. Zastanawiającym jest fakt, że w wybranym przypadku (Ryc. 5), w którym matka była skolonizowana dwoma klonami S. agalactiae (jeden bez mechanizmu oporności MLS B, drugi z mechanizmem oporności MLS B ), wykazano obecność genów erma, ermb, ermc u szczepów wyizolowanych od pary bliźniąt (ścieżka 4 i 5) mimo braku potwierdzenia tej oporności metodą dyfuzyjno-krążkową oraz metodą E-testów. 640 pz Ryc. 5: Wykazanie metodą PCR-multiplex obecności genów oporności na erytromycynę (erma, ermb, ermc) u wybranych szczepów GBS wyizolowanych od matki i jej dzieci (para bliźniąt). Ścieżki: 1,8- marker wielkości pz, 2- szczep od matki bez mechanizmu MLS B, 3- szczep od matki z mechanizmem MLS B, 4- szczep od pierwszego z bliźniąt bez mechanizmu MLS B, 5- szczep od drugiego z bliźniąt bez mechanizmu MLS B, 6- próba negatywna, 7- próba pozytywna. PODSUMOWANIE 1. Metody PCR i FISH mogą być skutecznie wykorzystywane w szybkiej diagnostyce S. agalactiae, gdyż charakteryzują się wysoką specyficznością i czułością oraz krótkim czasem oznaczenia.
8 98 M. Brzychczy-Włoch i inni Nr 2 2. Fluorescencyjna hybrydyzacja in situ jest skuteczną metodą weryfikującą czystość hodowli szczepów S. agalactiae, które w pojedynczych przypadkach, wykazywały silną koagregację z innymi gatunkami paciorkowców. 3. Ze względu na czułość techniki FISH małe populacje, poniżej 1x10 3 c.f.u/ml, paciorkowca grupy B były nie wykrywane, co stanowiło jeszcze jedną pozytywną cechę zastosowanej techniki, gdyż pewne, niewielkie populacje tych bakterii mogą być stale lub czasowo obecne w środowisku pochwy. 4. Metoda RAPD ujawniła, że dzieci urodzone przez kobiety skolonizowane paciorkowcem grupy B ulegały kolonizacji szczepami GBS pochodzącymi od ich matek. Mechanizm ten wykazano także w stosunku do dzieci urodzonych przez cesarskie cięcie, pomimo braku wcześniejszego pęknięcia pęcherza płodowego. 5. Wykryto kolonizację S. agalactiae u dzieci urodzonych przez matki nie skolonizowane GBS w wyniku przeniesienia szczepów w środowisku szpitalnym, przy czym, poznanie dróg transmisji wymaga osobnych badań nad nosicielstwem tych bakterii wśród personelu, które przekraczają zakres tego projektu. 6. Przy użyciu metody PCR-multiplex potwierdzono wyniki fenotypowo oznaczonej oporności typu MLS B. W wybranym przypadku wykazano obecność genów oporności erma, ermb, ermc u izolatów pochodzących od pary bliźniąt mimo braku potwierdzenia tej oporności metodą dyfuzyjno-krążkową. M. Brzychczy-Włoch, M. Strus, D. Pawlik, T. Gosiewski, K. Rytlewski, A. Drzewiecki, R. Lauterbach, P.B. Heczko STUDIES ON THE POSSIBLE APPLICATION OF MOLECULAR METHODS IN DIAGNOSING CARRIERS AND IN SIMILARITY ANALYSIS OF GROUP B STREPTOCOCCI (STREPTOCOCCUS AGALACTIAE). SUMMARY The most popular method of GBS identification in Poland currently is by culturing on enriched agar and verifying the Lancefield Group using special latex agglutination kits. However, the classical methods are time-consuming and their sensitivity is insufficient therefore it is becoming more common to try and apply molecular methods which are characterized by high sensitivity and rapid results. Moreover, molecular methods give us the possibility to carry out epidemiological investigations and gene detection, for instance for antibiotic resistance. It was confirmed that PCR and FISH procedures may be effective in rapid detection of GBS. Thanks to RAPD methods we showed that newborns born to colonized mothers were colonized by GBS strains which originated from the mother, irrespective of the way and the course of labour. Additionally, we detected GBS colonization in children who were born to mothers who were not colonized by GBS. These children were probably colonized with strains coming from hospital environment. More studies are needed to elucidate the route of transmission and the role of colonization of the medical staff. Using multiplex PCR we showed the presence of erma, ermb and ermc genes in phenotypically confirmed MLS B GBS strains.
9 Nr 2 Molekularna diagnostyka nosicielstwa S. agalactiae 99 PIŚMIENNICTWO 1. Artz L A, Kempf VA, Autenrieth I B. Rapid screening for Streptococcus agalactiae in vaginal specimens of pregnant women by fluorescent in situ hybridization. J Clin Microbiol 2003; 5, Benitz W E, Gould JB, Druzin M L. Risk factors for early-onset group B streptococcal sepsis: estimation of odds ratios by critical literature review. Pediatrics 1999; 103, e Berardi A, Rossi K, Pizzi C i inni. Absence of neonatal streptococcal colonization after planned cesarean section. Acta Obstet Gynecol Scand : Brzychczy-Włoch M, Strus M, Pawlik D, Machlarz H, Gosiewski T, Drzewiecki A, Rytlewski K, Lauterbach R, Heczko P.B. Narastanie stopnia kolonizacji u kobiet w ciąży i noworodków przez Streptococcus agalactiae na obszarze Polski południowo-wschodniej - w druku. 5. Burrell PC, O Sullivan C, Song H i inni. Identification, detection, and spatial resolution of Clostridium populations responsible for cellulose degradation in a methanogenic landfill leachate bioreactor. Appl Environ Microbiol. 2004; 70: Harmsen HJM, Gibson GR, Elfferich P i inni. Comparison of viable cell counts and fluorescence in situ hybridization using specific rrna-based probes for the quantification of human fecal bacteria. FEMS Microbiol Let, 2000; 183: Ke D, Menar C, Picard FJ i inni. Development of conventional and real-time PCR assays for the rapid detection of group B streptococci. Clin Chem 2000; 46, Kowalska B, Niemiec KT, Drejewicz H i inni. Częstość występowania kolonizacji paciorkowcami hemolizującymi grupy B kobiet ciężarnych i noworodków określona na podstawie badań przesiewowych u pacjentek Polikliniki i Kliniki Położnictwa i Ginekologii Instytutu Matki i Dziecka- badania pilotażowe. Ginekol Pol 2003; 74: Martinez G, Harel J, Higgins R i inni. Characterization of Streptococcus agalactiae isolates of bovine and human origin by randomly amplified polymorphic DNA analysis. J Clin Microbiol. 2000; 38: Puopolo KM, Madoff LC, Eichenwald EC. Early-onset group B streptococcal disease in the era of maternal screening. Pediatrics 2005; 115: de los Reyes FL, Rothauszky D, Raskin L. Microbial community structures in foaming and nonfoaming full-scale wastewater treatment plants. Water Environ Res 2002; 74: Schrag S, Gorwitz R, Fultz-Butts K i inni. Prevention of perinatal group B streptococcal disease. Revised guidelines from CDC. MMWR 2002; 15: Sutcliffe J, Grebe T, Tait-Kamradt A, Wondrack L. Detection of erythromycin-resistant determinants by PCR. Antimicrob Agents Chemother. 1996; 40: Szewczyk E. Diagnostyka bakteriologiczna. PWN, W-wa, 2005; 34-36, 312. Otrzymano:26 II 2008 Adres Autora: Kraków, ul. Czysta 18, Katedra Mikrobiologii CM UJ mbrzych@cm-uj.krakow.pl
10
NARASTANIE STOPNIA KOLONIZACJI KOBIET W CIĄŻY I NOWORODKÓW PRZEZ STREPTOCOCCUS AGALACTIAE NA OBSZARZE POLSKI POŁUDNIOWO-WSCHODNIEJ *
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 5-12 Monika Brzychczy-Włoch 1, Magdalena Strus 1, Dorota Pawlik 2, Helena Machlarz 2, Tomasz Gosiewski 1, Artur Drzewiecki 1, Krzysztof Rytlewski 3, Ryszard Lauterbach
Bardziej szczegółowoROZKŁAD SEROTYPÓW PACIORKOWCÓW GRUPY B, IZOLOWANYCH Z PRZYPADKÓW NOSICIELSTWA, OZNACZONYCH METODĄ MULTIPLEKS PCR *
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 293-299 Monika Brzychczy-Włoch 1, Tomasz Gosiewski 1, Małgorzata Bodaszewska 1, Wojciech Pabian 2, Małgorzata Bulanda 1, Piotr B. Heczko 1 ROZKŁAD SEROTYPÓW PACIORKOWCÓW
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 1 Morfologia I fizjologia bakterii
Ćwiczenie 1 Morfologia I fizjologia bakterii 1. Barwienie złożone - metoda Grama Przygotowanie preparatu: odtłuszczone szkiełko podstawowe, nałożenie bakterii ( z hodowli płynnej 1-2 oczka ezy lub ze stałej
Bardziej szczegółowoAutor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Bardziej szczegółowoAmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
Bardziej szczegółowoWYKRYWANIE OBECNOŚCI BAKTERII Z RODZAJU LISTERIA W ŻYWNOŚCI
ĆWICZENIE IV Autor i główny prowadzący dr Dorota Korsak WYKRYWANIE OBECNOŚCI BAKTERII Z RODZAJU LISTERIA W ŻYWNOŚCI Wstęp Rodzaj Listeria należy do typu Firmicutes wspólnie z rodzajem Staphylococcus, Streptococcus,
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
Bardziej szczegółowoŚródporodowa profilaktyka zakażeń paciorkowcami grupy B doświadczenia własne
Śródporodowa profilaktyka zakażeń paciorkowcami grupy B doświadczenia własne Intrapartum prophylaxis against Group B Streptococcus infection own experience Kociszewska-Najman Bożena 1, Oslislo Anna 2,
Bardziej szczegółowoPCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
Bardziej szczegółowoTaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
Bardziej szczegółowoDiagnostyka molekularna w OIT
Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
Bardziej szczegółowoPL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11
PL 214501 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 214501 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 391458 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
Bardziej szczegółowoOpis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
Bardziej szczegółowoZakład Mikrobiologii Klinicznej [1]
Zakład Mikrobiologii Klinicznej [1] Dane kontaktowe: Tel. 41 36 74 710, 41 36 74 712 Kierownik: dr n. med. Bonita Durnaś, specjalista mikrobiologii Personel/Kadra: Diagności laboratoryjni: mgr Dorota Żółcińska
Bardziej szczegółowoAUTOREFERAT do Wniosku o wszczęcie postępowania habilitacyjnego
Dr n. biol. Monika Brzychczy-Włoch Collegium Medicum Uniwersytetu Jagiellońskiego Katedra Mikrobiologii Zakład Bakteriologii, Ekologii Drobnoustrojów i Parazytologii ul. Czysta 18, 31-121 Kraków e-mail:
Bardziej szczegółowoProtokoły do zajęć praktycznych z mikrobiologii ogólnej i żywności dla studentów kierunku: Dietetyka
Protokoły do zajęć praktycznych z mikrobiologii ogólnej i żywności dla studentów kierunku: Dietetyka Protokół I, zajęcia praktyczne 1. Demonstracja wykonania preparatu barwionego metodą Grama (wykonuje
Bardziej szczegółowoROCZN. PZH, 1998, 49, 73-86
ROCZN. PZH, 1998, 49, 73-86 74 wane narzędzia i sprzęt medyczny. Przeniesienie grzybów Candida m oże nastąpić przez ręce personelu, bieliznę, pościel, sprzęt do pielęgnacji i leczenia. C elem pracy było
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Bardziej szczegółowoZalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase
Zalecenia dotyczące postępowania w przypadku identyfikacji w zakładach opieki zdrowotnej szczepów bakteryjnych Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy typu KPC * * KPC - ang: Klebsiella pneumoniae
Bardziej szczegółowoSHL.org.pl SHL.org.pl
Kontrakty na usługi dla szpitali SIWZ dla badań mikrobiologicznych Danuta Pawlik SP ZOZ ZZ Maków Mazowiecki Stowarzyszenie Higieny Lecznictwa Warunki prawne dotyczące konkursu ofert Ustawa z dnia 15 kwietnia
Bardziej szczegółowoXXV. Grzyby cz I. Ćwiczenie 1. Wykonanie i obserwacja preparatów mikroskopowych. a. Candida albicans preparat z hodowli barwiony metoda Grama
XXV. Grzyby cz I. Ćwiczenie 1. Wykonanie i obserwacja preparatów mikroskopowych a. Candida albicans preparat z hodowli barwiony metoda Grama Opis preparatu: b. Saccharomyces cerevisiae preparat z hodowli
Bardziej szczegółowoII. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne. Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową
II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową Zasada metody: Krążki bibułowe nasycone odpowiednimi ilościami antybiotyków
Bardziej szczegółowoPrezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów w Katedry Mikrobiologii UJCM
Prezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów w Katedry Mikrobiologii UJCM Informacja o Katedrze Rozwój j naukowy młodej kadry naukowców w w kontekście priorytetów badawczych: W 2009 roku 1 pracownik Katedry
Bardziej szczegółowoIV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne
IV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Ocena wzrostu szczepów paciorkowców na: a. agarze z dodatkiem 5% odwłóknionej krwi baraniej (AK) typ hemolizy morfologia kolonii... gatunek
Bardziej szczegółowoAnna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
Bardziej szczegółowoĆwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
Bardziej szczegółowoDETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH
DETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH Detekcja enterowirusów Detekcja sześciu typów ludzkich herpeswirusów (HHV) Detekcja pięciu bakterii Seeplex Detekcja patogenów powodujących
Bardziej szczegółowoAnaliza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych
Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych Dr n. med. Joanna Walczak- Sztulpa Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Diagnostyka
Bardziej szczegółowoObecność paciorkowców grupy B (GBS) u noworodków w aspekcie profilaktyki śródporodowej
Perinatologia, Neonatologia i Ginekologia, tom 7, zeszyt 1, 31-36, 2014 Obecność paciorkowców grupy B (GBS) u noworodków w aspekcie profilaktyki śródporodowej MARTA SIBILSKA 1, MARTA SZYMANKIEWICZ 1, JANUSZ
Bardziej szczegółowoAmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
Bardziej szczegółowoAnaliza badań przesiewowych w kierunku Streptococcus agalactiae u kobiet w ciąży z regionu Pomorza Zachodniego
! " # $ % $ DOI: 10.17772/gp/57858 & ' ( ) * +, - +,. Analiza badań przesiewowych w kierunku Streptococcus agalactiae u kobiet w ciąży z regionu Pomorza Zachodniego Analysis of screening tests for Streptococcus
Bardziej szczegółowoEvaluation of ITS-PCR and PCR MP techniques for Streptococcus agalactiae genetic differentiation
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 149-160 Ocena przydatności metod: ITS-PCR i PCR MP w genotypowaniu Streptococcus agalactiae Evaluation of ITS-PCR and PCR MP techniques for Streptococcus agalactiae genetic
Bardziej szczegółowoBadanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara
Bardziej szczegółowoDIAGNOSTYKA BEZPOŚREDNIA. Joanna Kądzielska Katedra Mikrobiologii Lekarskiej Warszawski Uniwersytet Medyczny
DIAGNOSTYKA BEZPOŚREDNIA Joanna Kądzielska Katedra Mikrobiologii Lekarskiej Warszawski Uniwersytet Medyczny BADANIA MIKROBIOLOGICZNE CHORZY OZDROWIEŃCY BEZOBJAWOWI NOSICIELE OSOBY Z KONTAKTU PERSONEL MEDYCZNY
Bardziej szczegółowoWYSTĘPOWANIE I ZRÓŻNICOWANIE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA OPORNOŚĆ NA TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW ENTEROCOCCUS FAECALIS IZOLOWANYCH W REGIONIE GDAŃSKIM.
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 13-17 Tomasz Jarzembowski 1), Aleksandra Dybikowska 2) Maria Dąbrowska-Szponar 1) WYSTĘPOWANIE I ZRÓŻNICOWANIE GENÓW ODPOWIEDZIALNYCH ZA OPORNOŚĆ NA TETRACYKLINĘ SZCZEPÓW
Bardziej szczegółowoSPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09
SPRAWOZDANIE MOŻE BYĆ POWIELANE TYLKO W CAŁOŚCI. INNA FORMA KOPIOWANIA WYMAGA PISEMNEJ ZGODY LABORATORIUM. SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09 BADANIA WŁASNOŚCI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH
Bardziej szczegółowoTaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Bardziej szczegółowoInstrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Mikrobiologia na kierunku chemia kosmetyczna
1 Zakład Mikrobiologii UJK Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Mikrobiologia na kierunku chemia kosmetyczna 2 Zakład Mikrobiologii UJK Zakres materiału (zagadnienia)
Bardziej szczegółowoAmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Bardziej szczegółowo1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz:
Ćwiczenie 2 2018/19 1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz: obecność nabłonków, leukocytów, pałeczek Gram(+),
Bardziej szczegółowoOznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Bardziej szczegółowoPolimeraza Taq (1U/ l) 1-2 U 1 polimeraza Taq jako ostatni składniki mieszaniny końcowa objętość
Ćwiczenie 6 Technika PCR Celem ćwiczenia jest zastosowanie techniki PCR do amplifikacji fragmentu DNA z bakterii R. leguminosarum bv. trifolii TA1 (RtTA1). Studenci przygotowują reakcję PCR wykorzystując
Bardziej szczegółowoAmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
Bardziej szczegółowoWystępowanie genów kodujących białka z rodziny Alp u Streptococcus agalactiae *
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 5-14 Monika Brzychczy-Włoch 1, Tomasz Gosiewski 1, Małgorzata Bodaszewska 1, Katarzyna Talaga 1, Joanna Natkaniec 1, Paweł Adamski 2, Piotr B. Heczko 1 Występowanie genów
Bardziej szczegółowoBiologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Bakteriologia
Mikrobiologia - Bakteriologia 5050 Bezpośrednie barwienie bakteriologiczne Kwiecień, październik 3-9 zdjęć cyfrowych wybarwionych bezpośrednio preparatów, prezentowane na stronie internetowej Labquality
Bardziej szczegółowoHARMONOGRAM ZAJĘĆ dla studentów Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Weterynaryjnej UJ-UR Mikrobiologia weterynaryjna II rok 2016/2017 semestr letni
HARMONOGRAM ZAJĘĆ dla studentów Uniwersyteckiego Centrum Medycyny Weterynaryjnej UJ-UR Mikrobiologia weterynaryjna II rok 2016/2017 semestr letni Seminaria sala wykładowa Katedry Mikrobiologii (II piętro),
Bardziej szczegółowoPL 208422 B1. INSTYTUT BIOTECHNOLOGII SUROWIC I SZCZEPIONEK BIOMED SPÓŁKA AKCYJNA, Kraków, PL 14.04.2008 BUP 08/08
RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 208422 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 380804 (22) Data zgłoszenia: 10.10.2006 (51) Int.Cl. C12N 1/20 (2006.01)
Bardziej szczegółowo- podłoża transportowo wzrostowe..
Ćw. nr 2 Klasyfikacja drobnoustrojów. Zasady pobierania materiałów do badania mikrobiologicznego. 1. Obejrzyj zestawy do pobierania materiałów i wpisz jakie materiały pobieramy na: - wymazówki suche. -
Bardziej szczegółowoCARRIER-STATE OF GROUP B STREPTOCOCCUS IN PREGNANT WOMEN PERFORMANCE STANDARDS
PRZEGL EPIDEMIOL 2012; 66: 33 - ost.str Problemy zakażeń Karol Szwabowicz, Anatol Panasiuk NOSICIELSTWO PACIORKOWCA GRUPY B U KOBIET CIĘŻARNYCH - STANDARDY POSTĘPOWANIA CARRIER-STATE OF GROUP B STREPTOCOCCUS
Bardziej szczegółowoCENNIK - DIAGNOSTYKI MIKROBIOLOGICZNEJ
(obowiązuje od 01 czerwca 2015 roku) załącznik nr 4 do regulaminu organizacyjnego CENNIK - DIAGNOSTYKI MIKROBIOLOGICZNEJ Zakład Diagnostyki Mikrobiologicznej - siedziba ul. Św. Józefa 53-59 oraz ul. Konstytucji
Bardziej szczegółowoZastosowanie metod PCR i FISH w szybkiej diagnostyce bakteryjnych zakażeń krwi
PRACA ORYGINALNA Zastosowanie metod PCR i FISH w szybkiej diagnostyce bakteryjnych zakażeń krwi Use of PCR and FISH methods for rapid identification of bacterial bloodstream infections Tomasz Gosiewski,
Bardziej szczegółowoZestawy do izolacji DNA i RNA
Syngen kolumienki.pl Gotowe zestawy do izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych Zestawy do izolacji DNA i RNA Katalog produktów 2012-13 kolumienki.pl Syngen Biotech Sp. z o.o., 54-116 Wrocław, ul. Ostródzka
Bardziej szczegółowoZałącznik nr 1A do siwz Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli
Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli 1. Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli zestaw zawiera: - 50 pasków testowych, - 50 pojemników z tworzywa sztucznego,
Bardziej szczegółowoWIEDZA. Zna podstawy prawne realizacji programu kontroli zakażeń.
Załącznik nr 7 do zarządzenia nr 12 Rektora UJ z 15 lutego 2012 r. Opis zakładanych efektów kształcenia na studiach podyplomowych Nazwa studiów: Kontrola zakażeń w jednostkach opieki zdrowotnej Typ studiów:
Bardziej szczegółowoprof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Bakteriologia
Mikrobiologia - Bakteriologia 5050 Bezpośrednie barwienie bakteriologiczne (sprawdzian wirtualny) Kwiecień, październik 3-9 zdjęć cyfrowych preparatów bezpośrednio wybarwionych, prezentowane na stronie
Bardziej szczegółowoPL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL
PL 220315 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 220315 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 400252 (22) Data zgłoszenia: 06.08.2012 (51) Int.Cl.
Bardziej szczegółowoElżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej
Elżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej Analiza zmienności ilościowej i jakościowej tlenowej flory bakteryjnej izolowanej z ran przewlekłych kończyn dolnych w trakcie leczenia tlenem hiperbarycznym
Bardziej szczegółowoĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)
ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków) Celem ćwiczenia jest wprowadzenie mutacji punktowej do genu
Bardziej szczegółowoProblematyka negatywnych okołoporodowych wymazów w kierunku GBS u pacjentek z wcześniejszym dodatnim wynikiem testu przesiewowego
Perinatologia, Neonatologia i Ginekologia, tom 7, zeszyt 1, 22-30, 2014 Problematyka negatywnych okołoporodowych wymazów w kierunku GBS u pacjentek z wcześniejszym dodatnim wynikiem testu przesiewowego
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
Bardziej szczegółowo10) istotne kliniczne dane pacjenta, w szczególności: rozpoznanie, występujące czynniki ryzyka zakażenia, w tym wcześniejsza antybiotykoterapia,
Załącznik nr 2 Standardy jakości w zakresie mikrobiologicznych badań laboratoryjnych, w tym badań technikami biologii molekularnej, oceny ich jakości i wartości diagnostycznej oraz laboratoryjnej interpretacji
Bardziej szczegółowoTETRACYKLINA STREPTOMYCYNA
FAKULTET - FIZJOLOGIA BAKTERII Koordynator - dr hab. Magdalena Popowska, prof. UW ĆWICZENIE: IDENTYFIKACJA GENÓW OPORNOŚCI NA TETRACYKLINĘ, STREPTOMYCYNĘ I ERYTROMYCYNĘ W WYBRANYCH BAKTERIACH GLEBOWYCH
Bardziej szczegółowoAmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
Bardziej szczegółowoZASADY BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH
ZASADY BADAŃ BAKTERIOLOGICZNYCH Joanna Kądzielska Katedra Mikrobiologii Lekarskiej Warszawski Uniwersytet Medyczny METODY HODOWLI BAKTERII METODY MIKROSKOPOWE MORFOLOGIA BAKTERII TOK BADANIA DIAGNOSTYCZNEGO
Bardziej szczegółowoRekomendacje diagnostyczne inwazyjnych zakażeń bakteryjnych nabytych poza szpitalem M. Kadłubowski, A. Skoczyńska, W. Hryniewicz, KOROUN, NIL, 2009
Opracowanie: Marcin Kadłubowski, Anna Skoczyńska, Waleria Hryniewicz Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Diagnostyki Bakteryjnych Zakażeń Ośrodkowego Układu Nerwowego (KOROUN) Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoBD Group B Streptococcus Differential Agar (Granada Medium)
PODŁOŻE NA PŁYTKACH GOTOWE DO UŻYCIA INSTRUKCJA UŻYTKOWANIA PA-257079.05 Wersja poprawiona: Kwi 2013 PRZEZNACZENIE jest przeznaczone do izolacji i identyfikacji Streptococcus agalactiae (Streptococcus
Bardziej szczegółowoRAPORT Z BADAŃ 01369/2015/D/AGST. Blirt S.A Gdańsk, ul. Trzy Lipy 3/1.38. Dział DNA-Gdańsk. Nr zlecenia
Strona1/7 Blirt S.A. 80-172 Gdańsk, ul. Trzy Lipy 3/1.38 RAPORT Z BADAŃ Dział DNA-Gdańsk Nr zlecenia 01369/2015/D/AGST NAZWA I ADRES KLIENTA Zenon Koszorz Ground-Therm Sp z o.o. Ul. Stepowa 30 44-105 Gliwice
Bardziej szczegółowoOcena wpływu zastosowanych odczynników na szybkość uzyskania wyniku identyfikacji laseczki wąglika w teście RSI-PCR dla genu plcr
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 321-326 Aleksandra A. Zasada Ocena wpływu zastosowanych odczynników na szybkość uzyskania wyniku identyfikacji laseczki wąglika w teście RSI-PCR dla genu plcr Zakład Bakteriologii
Bardziej szczegółowoEWA HELWICH Instytut Matki i Dziecka w Warszawie
VI KONGRES Polskiego Towarzystwa Medycyny Perinatalnej Poznań, 26 28 września 2013 Polska Sieć Neonatologiczna EWA HELWICH Instytut Matki i Dziecka w Warszawie Nadzór celowany w odniesieniu do najważniejszych
Bardziej szczegółowoMetody badania ekspresji genów
Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego
Bardziej szczegółowoSaccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna.
Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna. wersja 0916 6 x 20 transformacji Nr kat. 4010-120 Zestaw zawiera
Bardziej szczegółowoSPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20005/11858/09
SPRAWOZDANIE MOŻE BYĆ POWIELANE TYLKO W CAŁOŚCI. INNA FORMA KOPIOWANIA WYMAGA PISEMNEJ ZGODY LABORATORIUM. SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20005/11858/09 BADANIA WŁASNOŚCI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM.
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: TERAPIA GENOWA Plan ćwiczeń Ćwiczenie 1: Przygotowanie warsztatu terapii genowej 1. Kontrola jakościowa preparatów plazmidowych paav/lacz,
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM.
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: TERAPIA GENOWA Plan ćwiczeń Ćwiczenie 1: Przygotowanie warsztatu terapii genowej 1. Kontrola jakościowa preparatów plazmidowych paav/lacz,
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Analityka Medyczna 2016
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Analityka Medyczna 2016 Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa Analiza
Bardziej szczegółowoZałącznik Nr 7 do SIWZ
Załącznik Nr 7 do SIWZ Formularz asortymentowo - cenowy Nr 6 Pakiet Nr 6 Testy lateksowe, krążki antybiotykowe, testy MIC, szczepy wzorcowe, podłoża, odczynniki i testy diagnostyczne. Ilość Wartość Wielkość
Bardziej szczegółowoGenetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa
Markery genetyczne: definicja Marker genetyczny jest to cecha, która może być wykorzystana do identyfikacji osobników lub gatunków. Cechy markerów genetycznych Monogeniczny: warunkowany przez jeden gen
Bardziej szczegółowoZałącznik nr 4 Metodyka pobrania materiału przedstawiona jest w osobnym Instrukcja PZH
Załącznik nr 4 Metodyka pobrania materiału przedstawiona jest w osobnym Instrukcja PZH 1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań wykonywanych przez PZH Poz. Badanie Rodzaj
Bardziej szczegółowoĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI
ĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI Autor i główny prowadzący dr Dorota Korsak Wstęp Jednym z najważniejszych etapów rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej zakażeń
Bardziej szczegółowoXIII. Staphylococcus, Micrococcus ćwiczenia praktyczne
XIII. Staphylococcus, Micrococcus ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Ocena wzrostu szczepów gronkowców na: a. agarze z dodatkiem 5% odwłóknionej krwi baraniej (AK) typ hemolizy morfologia kolonii.. b. podłożu
Bardziej szczegółowoRAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA R.
RAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA 25.04.2017 R. OCENA SKUTECZNOŚCI MIKROBIOBÓJCZEJ URZĄDZENIA INDUCT 750 FIRMY ACTIVTEK WOBEC PAŁECZEK KLEBSIELLA PNEUMONIAE W POWIETRZU Wykonawcy:
Bardziej szczegółowofix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 Sierpień 2018
Sierpień 2018 fix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 EURx Ltd. 80-297 Gdansk Poland ul. Przyrodnikow 3, NIP 957-07-05-191 KRS
Bardziej szczegółowoHybrydyzacja kwasów nukleinowych
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych Jaka jest lokalizacja genu na chromosomie? Jakie jest jego sąsiedztwo? Hybrydyzacja - powstawanie stabilnych struktur dwuniciowych z cząsteczek jednoniciowych o komplementarnych
Bardziej szczegółowoOznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Bardziej szczegółowoMetody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
Bardziej szczegółowoKlebsiella pneumoniae New Delhi alert dla polskich szpitali
Klebsiella pneumoniae New Delhi alert dla polskich szpitali Jak zatrzymać falę zakażeń powodowanych przez drobnoustrój o skrajnej oporności na antybiotyki? Tomasz Ozorowski Analiza faktów FAKT 1. SKRAJNA
Bardziej szczegółowoProjekt Alexander w Polsce w latach
Projekt Alexander w Polsce w latach 1996-2008 NaduŜywanie antybiotyków i chemioterapeutyków oraz ich niewłaściwe stosowanie doprowadziło do globalnego zagroŝenia, jakim jest powstawanie i szerzenie się
Bardziej szczegółowoMATERIAŁY Z GÓRNYCH DRÓG ODDECHOWYCH - badanie bakteriologiczne + mykologiczne
CENNIK ZAKŁADU DIAGNOSTYKI LABORATORYJNEJ PRACOWNIA MIKROBIOLOGII OBOWIĄZUJĄCY OD DNIA (zgodnie z treścią zarządzenia) (badania prywatne) Lp USŁUGA MATERIAŁ CZAS OCZEKIWANIA CENA BADANIA PODSTAWOWEGO SKIEROWANIE
Bardziej szczegółowoNazwa studiów: KONTROLA ZAKAŻEŃ W JEDNOSTKACH OPIEKI ZDROWOTNEJ Typ studiów: doskonalące WIEDZA
Załącznik nr 8 do zarządzenia nr 68 Rektora UJ z 18 czerwca 2015 r. Opis zakładanych efektów kształcenia na studiach podyplomowych Nazwa studiów: KONTROLA ZAKAŻEŃ W JEDNOSTKACH OPIEKI ZDROWOTNEJ Typ studiów:
Bardziej szczegółowoTechniki biologii molekularnej Kod przedmiotu
Techniki biologii molekularnej - opis przedmiotu Informacje ogólne Nazwa przedmiotu Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu 13.9-WB-BMD-TBM-W-S14_pNadGenI2Q8V Wydział Kierunek Wydział Nauk Biologicznych
Bardziej szczegółowo