Zakład Genetyki Medycznej OFERTA BADAŃ DIAGNOSTYCZNYCH

Transkrypt

1 Zakład Genetyki Medycznej OFERTA BADAŃ DIAGNOSTYCZNYCH 2006/2007

2 Szanowni Państwo, Działalność naukowa i diagnostyczna Zakładu Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka koncentruje się na zagadnieniach genetyki klinicznej, a w szczególności diagnostyce wad, chorób i zespołów uwarunkowanych genetycznie oraz zagadnieniach poradnictwa dla rodzin ryzyka genetycznego. Jednym z praktycznych efektów działalności Zakładu jest wprowadzenie najnowocześniejszych metod biologii molekularnej do diagnostyki rutynowej chorób genetycznie uwarunkowanych (por. Zakład jest ośrodkiem referencyjnym w Polsce w zakresie diagnostyki klinicznej i molekularnej oraz poradnictwa genetycznego wielu chorób genetycznie uwarunkowanych ( Dysponujemy nowoczesną aparaturą badawczą i sprzętem laboratoryjnym oraz wysoko wykwalifikowaną kadrą pracowników naukowo-badawczych i technicznych. Prowadzone badania naukowe i diagnostyczne odpowiadają standardom światowym co znajduje potwierdzenie w wynikach weryfikowanych w krajowych i międzynarodowych systemach oceny jakości badań diagnostycznych. Zakład współpracuje z licznymi ośrodkami genetyki medycznej w kraju i za granicą, a pracownicy Zakładu są członkami międzynarodowych zespołów badawczych oraz licznych towarzystw naukowych krajowych i zagranicznych. Pragniemy przedstawić Państwu i Państwa Pacjentom ofertę badań, które są wykonywane w Zakładzie Genetyki Medycznej: - w pracowniach genetyki molekularnej, - w pracowniach cytogenetyki oraz - w Poradni Genetycznej. 2

3 Oferta Zespołu Pracowni Molekularnych 1. Niepłodność męska Zakład Genetyki Medycznej od ponad 6 lat zajmuje się tematem niepłodności męskiej uwarunkowanej genetycznie. W około 40-60% przypadków męska niepłodność idiopatyczna uwarunkowana jest genetycznie. Badania molekularne w kierunku delecji w chromosomie Y oraz mutacji w genie CFTR są zalecane przez Światową Organizacje Zdrowia (WHO) jako niezbędne przed procedurą wspomaganego rozrodu (zapłodnienie in vitro, ICSI). a. Analiza mikrodelecji w chromosomie Y Szacuje się, że około 25% mężczyzn z zaburzeniami płodności może mieć delecje w chromosomie Y, powodujące utratę funkcji genów odpowiedzialnych za prawidłowy przebieg spermatogenezy. Jeżeli u mężczyzny analiza DNA wykaże obecność delecji w chromosomie Y, to wszyscy jego synowie odziedziczą ten sam defekt genetyczny powodujący niepłodność. W Zakładzie Genetyki Medycznej analiza delecji w chromosomie Y prowadzona jest zgodnie z zaleceniami European Molecular Genetics Quality Network i European Academy of Andrology. Czas oczekiwania na wynik analizy tygodnie b. Analiza najczęstszych mutacji w genie CFTR Obustronny brak lub niedrożność przewodów nasiennych (ang. congenital bilateral absence of vas deferens, CBAVD) jest obecnie traktowany jako łagodna postać mukowiscydozy (ang. cystic fibrosis, CF). Udowodniono, że przyczyną choroby są mutacje genu CFTR. W Zakładzie Genetyki Medycznej wykonujemy analizę 7 najczęściej występujących mutacji w genie CFTR odpowiedzialnych za obraz kliniczny CBAVD. Czas oczekiwania na wynik analizy: 2-3 tygodnie. 2. Mukowiscydoza Mukowiscydoza jest najczęściej występującą w populacji kaukaskiej chorobą genetycznie uwarunkowaną dziedziczoną jako cecha autosomalna recesywna. Mukowiscydoza jest chorobą wieloukładową, o wysoce hetrogennej manifestacji klinicznej obejmującej zmiany w układzie oddechowym, trzustce, wątrobie i układzie rozrodczym męskim. Nosicielem mutacji odpowiedzialnej za wystąpienie choroby jest 1 osoba na 25. Diagnostyka molekularna mukowiscydozy polega na identyfikacji mutacji w genie CFTR. Celem badania diagnostycznego jest weryfikacja rozpoznania klinicznego oraz określenie nosicielstwa zmutowanego genu CFTR wśród krewnych chorego. Rodzinom, dla których zidentyfikowano mutacje w obu homologicznych genach CFTR, oferowana może być diagnostyka prenatalna choroby. Od 1997 roku Zakład uczestniczy w European Quality Network Cystic Fibrosis (CF) i posiada certyfikaty jakości wykonywanych analiz molekularnych. Czas oczekiwania na wynik analizy: 2-6 tygodni. 3. Zapalenie trzustki Zapalenie trzustki przejawia się klinicznie w dwóch postaciach: ostrej i przewlekłej. Cechą wspólną obu postaci choroby jest autodegradacja trzustki w przebiegu schorzenia. W Zakładzie Genetyki Medycznej u pacjentów z rozpoznaniem zapalenia trzustki prowadzi się analizę najczęstszych mutacji w genach CFTR, PRSS1 (gen kodujący kationowy trypsynogen), których defekty prowadzą do powstania klinicznego obrazu zapalenia trzustki. 3

4 Czas oczekiwania na wynik analizy: 2-4 tygodnie. 4. Zespół łamliwego chromosomu X Zespół łamliwego chromosomu X (FraX) jest druga po zespole Downa przyczyną upośledzenia umysłowego. FraX dziedziczy się jako cecha sprzężoną z płcią. W populacji białej występuje z częstością 1/4000 u mężczyzn i 1/8000 u kobiet. Za większość przypadków zespołu odpowiada ekspansja trójnukleotydowych powtórzeń w pierwszym eksonie genu FMR1. Czas oczekiwania na wynik analizy: I etap (badanie przesiewowe) 1 tydzień, II etap (hybrydyzacja): 1 miesiąc 5. Izolowana postać głuchoty wrodzonej Głuchota jest najczęstszym obserwowanym defektem w obrębie narządów zmysłów, który dotyczy około 10% społeczeństwa. Szacuje się, że w populacji kaukaskiej głębokie uszkodzenie słuchu obecne jest u 1,3-2,3 na 1000 żywo urodzonych dzieci. W tej grupie około 70% przypadków stanowią formy głuchoty rodzinnej dziedziczonej w sposób autosomalny recesywny. Badania prowadzone nad molekularnymi podstawami słyszenia oraz jego uszkodzeń doprowadziły do identyfikacji części genów odpowiedzialnych za wystąpienie głuchoty. W tej puli, gen GJB2 odpowiada za znaczny odsetek przypadków rodzinnej głuchoty odbiorczej. Badanie nosicielstwa najczęściej wykrywanej mutacji w tym genie w populacji ogólnej pozwoliło oszacować jej częstość na 2%. Czas oczekiwania na wynik analizy: 1-2 tygodnie. 6. Rdzeniowy zanik mięśni Ksobny dziecięcy rdzeniowy zanik mięśni jest chorobą uwarunkowaną genetycznie, dziedziczoną jako cecha autosomalna recesywna. Częstość występowania choroby szacuje się na 1/ urodzeń. Wystąpienie objawów choroby jest uwarunkowane uszkodzeniem genu SMN1. Czas oczekiwania na wynik analizy: 1-2 tygodnie. 7. Choroba Freidreicha Choroba Friedreicha określana również jako ataksja Friedreicha, zwyrodnienie rdzeniowomóżdżkowe lub bezwład dziedziczny rdzeniowo-móżdżkowy, jest skutkiem postępującego procesu zwyrodnieniowego w obrębie układu nerwowego (głównie struktur rdzenia kręgowego i móżdżku), mięśnia sercowego, mięśni szkieletowych, wątroby i trzustki. Choroba dziedziczy się jako cecha autosomalnie recesywna. Jak wykazują dotychczasowe badania, ekspansję powtórzeń (GAA)n stwierdza się u ponad 95% osób z chorobą Friedreicha. Populacyjna częstość nosicielstwa zmutowanego genu wynosi około 1%. Czas oczekiwania na wynik analizy: 1-2 tygodnie. 8. Zespól Pradera-Wiliego i zespół Angelmana W obu zespołach obserwuje się zjawisko rodzicielskiego piętna genomowego. Rodzicielskie piętno genomowe jest mechanizmem specyficznej ekspresji genu zależnej od jego pochodzenia. W zespole Pradera-Wiliego defekt molekularny polega na braku regionu 15q11q13 pochodzącego od ojca, natomiast 4

5 zespół Angelmana może być spowodowany brakiem regionu 15q11q13 na chromosomie pochodzącym od matki lub mutacją w genie UBE3A. Czas oczekiwania na wynik analizy: 1-4 tygodni. 9. Izolacja i bankowanie DNA Głównym celem izolacji jest uzyskanie z maksymalną wydajnością preparatu wysokocząsteczkowego DNA koniecznego do analiz molekularnych w diagnostyce chorób genetycznie uwarunkowanych. Izolacja powinna być przeprowadzona metoda pozwalającą na otrzymanie preparatu pozbawionego białek i inhibitorów enzymów, które mogą utrudniać następne etapy diagnostyki molekularnej. W naszym Zakładzie DNA izolowane jest z krwi obwodowej oraz plam krwi z bibuły. Oferujemy również bankowanie preparatów DNA, które nawet po wielu latach mogą być wykorzystane do diagnostyki molekularnej. Ma to szczególne znaczenie w przypadku chorób, których diagnostyka nie jest możliwa z wykorzystaniem obecnej wiedzy medycznej, co może się zmienić w ciągu najbliższych lat. Uwagi organizacyjne Wszystkie badania molekularne wykonywane są z próbek pełnej krwi, pobranych na EDTA (ok. 5 ml krwi µl 0,5 M EDTA ph 8,0). Probówki z krwią przechowywane w 4 C należy szybką pocztą dostarczyć do Zakładu Genetyki Medycznej. Kontakt: W przypadku Państwa zainteresowania możliwością wykonania badań genetycznych oferowanych przez Zespół Pracowni Genetyki Molekularnej prosimy o kontakt telefoniczny ( , ) lub poprzez pocztę elektroniczna: Dr Agnieszka Sobczyńska-Tomaszewska, agnieszka.sobczynska@imid.med.pl Mgr Magdalena Nawara, m.nawara@imid.med.pl 5

6 Oferta Pracowni Cytogenetycznych Badania cytogenetyczne stanowią podstawę pre- i postnatalnej diagnostyki specyficznych chorób i zespołów klinicznych uwarunkowanych aberracjami chromosomowymi. Umożliwiają one weryfikację rozpoznania klinicznego oraz określenie ryzyka powtórzenia się choroby w rodzinie. Pracownia Cytogenetyczna zajmuje się między innymi oznaczaniem kariotypu w limfocytach krwi obwodowej oraz komórkach płynu owodniowego. Badania wykonywane są zgodnie z zaleceniami Brytyjskiego systemu jakości w cytogenetyce klinicznej UK NEQAS (National External Quality Assessment Schemes). Zasadniczymi wskazaniami do badania kariotypu są: - podejrzenie określonego zespołu chromosomowego na podstawie cech klinicznych - mnogie wady rozwojowe (u dziecka żyjącego lub zmarłego np. martwo urodzonego płodu) - niektóre izolowane wady rozwojowe u dziecka (np. w zakresie narządów płciowych) - niepowodzenia rozrodu - przypadki niepłodności Czas oczekiwania na wynik kariotypu z limfocytów do 14 dni. Badania cytogenetyczne wykonywane są z próbek pełnej krwi, pobranych na heparynę (minimum 3 ml krwi). Probówki z krwią należy szybką pocztą dostarczyć do Pracowni Cytogenetycznej Zakładu Genetyki Medycznej. Czas oczekiwania na wynik kariotypu z amniocytów (diagnostyka prenatalna) ok dni. W laboratorium wykonuje się również badania w celu identyfikacji aberracji submikroskopowych, złożonych translokacji oraz chromosomów markerowych oparte na technice hybrydyzacji in situ (FISH) oraz CGH. Technika FISH jest metodą z wyboru w diagnostyce zespołów mikrodelecyjnych, umożliwia też identyfikację aberracji chromosomowych, których pochodzenie chromosomowe nie może być ustalone w standardowej ocenie kariotypu. W badaniach prenatalnych pełna identyfikacja aberracji warunkuje możliwość określenia skutków klinicznych jej obecności dla dziecka. Metoda CGH umożliwia analizę całego genomu w jednym badaniu z dużą rozdzielczością. Umożliwia identyfikację niezrównoważonych aberracji chromosomowych, które nie mogły by być rozpoznane klasycznymi metodami cytogenetycznymi. Służy też do pełnej identyfikacji aberracji, których pochodzenie chromosomowe nie może być ustalone w standardowej ocenie kariotypu. Test subtelomerowy służy rozpoznaniu submikroskopowych aberracji regionów subtelomerowych chromosomów. Wykonywany jest u pacjentów z cechami niepełnosprawności intelektualnej oraz innymi cechami fenotypowymi sugerującymi aberrację chromosomową, u których kariotyp oceniony metodą konwencjonalną jest prawidłowy. Czas oczekiwania na wynik w zależności od rodzaju i metody badania wynosi do 2 do 6 tygodni. Ze względu na procedurę badań cytogenetycznych konieczne jest uzgadnianie terminu i warunków każdego badania. Kontakt W przypadku zainteresowania możliwością wykonania badań genetycznych prosimy o kontakt telefoniczny (22) lub pocztą elektroniczną: Krystyna Jakubów (tel ) Katarzyna Borg (kasia_borg@imid.med.pl) Oferta Poradni Genetycznej 6

7 W Poradni Genetycznej istnieje możliwość uzyskania kompetentnej porady genetycznej dla osób i rodzin, w których rozpoznano lub istnieje podejrzenie choroby uwarunkowanej genetycznie. Poradnictwo genetyczne oferowane pacjentom i ich rodzinom obejmuje: - ustalenie (weryfikację) rozpoznania choroby genetycznej na podstawie cech klinicznych (analizy cech fenotypowych) oraz wyników badań specjalistycznych, - analizę i interpretację rodowodu, - zaplanowanie oraz przeprowadzenie specjalistycznych badań diagnostycznych ujętych w ofercie Pracowni Genetyki Molekularnej oraz Pracowni Cytogenetycznej oraz innych niezbędnych badań diagnostycznych (np. biochemicznych, badań wizualizacyjnych) niezbędnych do udzielenia wiarygodnej porady genetycznej, - omówienie wskazań (jeśli istnieją) do diagnostyki prenatalnej i poradnictwo w tym zakresie, - konsultacje małżeństw z niepowodzeniami rozrodu, - interpretację ryzyka genetycznego w kontekście typu uwarunkowania choroby Kontakt Zespół Poradni Genetycznej pracuje codziennie oprócz sobót i wolnych dni w godz W przypadku Państwa zainteresowania możliwością uzyskania porady genetycznej prosimy o kontakt telefoniczny, tel. (22) , (22) lub przez pocztę elektroniczną: Dr med. Ewa Obersztyn, eobersztyn@imid.med.pl lub sekgen@imid.med.pl Cena porady genetycznej zależy od tytułu naukowego oraz stopnia specjalizacji lekarza konsultującego i wynosi: zł. Termin wizyty: po uzgodnieniu telefonicznym Zespół Pracowni Genetyki Molekularnej 7

8 CENNIK BADAŃ DIAGNOSTYCZNYCH Zespół Pracowni Molekularnych, cennik ważny od: Jednostka chorobowa Rodzaj badania Zakres analizy Cena badania GEN1AE z izolacją DNA 1 mutacja np.. F508del 170 GEN1A bez izolacji DNA 110 GEN1BE z izolacją DNA F508del, R117H, G542X, G551D, R553X, dele2,3(21kb), 360 wariant IVS8-T niepłodność męska GEN1B bez izolacji DNA 300 GEN1DE z izolacją DNA 6 loci w regionie AZF zgodnie z zaleceniami EMQN (sy: ,254, 134, 127, 86, 84) mukowiscydoza GEN1D bez izolacji DNA 290 GEN2AE z izolacją DNA 1 mutacja np.. F508del 170 GEN2A bez izolacji DNA 110 GEN2BE z izolacją DNA 2 mutacje: F508del i dele,2,3(21kb) 220 GEN2B bez izolacji DNA 160 GEN2CE z izolacją DNA 19 mutacji (zestaw InnoLipa 19) 670 GEN2C bez izolacji DNA 610 GEN2DE z izolacją DNA 17 mutacji (zestaw InnoLipa 17) 670 GEN2D bez izolacji DNA 610 GEN2FE z izolacją DNA sekwencjonowanie wszystkich 27 eksonów genu CFTR 2100 GEN2F bez izolacji DNA 2040 GEN2GE z izolacją DNA 204 mutacje (we współpracy z Asper Biotech, Estonia) 1230 GEN2G bez izolacji DNA 1170 GEN2HE z izolacją DNA 14 mutacji najczęstszych w Polsce z możliwością wykrycia 570 rzadkich mutacji - w sumie 300 mutacji GEN2H bez izolacji DNA 510 GEN3AE z izolacją DNA gen CFTR : F508del, gen SPINK1 : N34S, gen PRSS1 : 370 R122H, R122C, R122poly zapalenie trzustki GEN3A bez izolacji DNA 310 GEN3BE z izolacją DNA gen CFTR : F508del, dele2,3(21kb), wariant IVS8-T, gen 560 SPINK1 : N34S, gen PRSS1 :R122H, R122C, N29I, N29T, K23R, D22G, D19A, A16V zespół łamliwego chromosomu X głuchota rdzeniowy zanik mięśni ataksja Friedreicha zespól Prader-Willi zespół Angelmana fenyloketonuria wada cewy nerwowej hemochromatoza mlpa CFTR w mukowiscydozy GEN3B bez izolacji DNA 500 GEN4AE z izolacją DNA badanie przesiewowe (Expand Long Template PCR) 170 GEN4A bez izolacji DNA 110 GEN4BE z izolacją DNA hybrydyzacja southerna 590 GEN4B bez izolacji DNA 530 GEN4CE z izolacją DNA określenie ilości powtórzeń (CGG)n w genie FMR1 (zestaw 600 GEN4C bez izolacji DNA Abbott) 540 GEN5E z izolacją DNA 3 mutacje: 35delG, 313del14, IVS1+1G>A 270 GEN5 bez izolacji DNA 210 GEN6E z izolacją DNA identyfikacja delecji eksonu 7 genu SMN1 240 GEN6 bez izolacji DNA 180 GEN7E z izolacją DNA analiza LR-PCR i TP-PCR w celu identyfikacji mutacji 360 dynamicznej genu FRDA GEN7 bez izolacji DNA 300 GEN8AE z izolacją DNA test metylacji regionu PWS 360 GEN8A bez izolacji DNA 300 GEN8BE z izolacją DNA mikrosatelity (chr. 15q) 670 GEN8B bez izolacji DNA 610 GEN9AE z izolacją DNA test metylacji regionu AS 360 GEN9A bez izolacji DNA 300 GEN9BE z izolacją DNA mikrosatelity (chr. 15q) 670 GEN9B bez izolacji DNA 610 GEN11AE z izolacją DNA mutacja R408W 170 GEN11A bez izolacji DNA 110 GEN11BE z izolacją DNA 4 mutacje: R408W, IVS10, IVS12, R158Q 290 GEN11B bez izolacji DNA 230 GEN12E z izolacją DNA 2 polimorfizmy: A1298C, C677T 240 GEN12 bez izolacji DNA 180 GEN14E z izolacją DNA 2 mutacje w genie HFE: C282Y i H63D 270 GEN14 bez izolacji DNA 210 GEN15E z izolacją DNA test P091, MRC Holland 350 GEN15 bez izolacji DNA 290 cena do uzgodnienia dowolna procedura GEN16 z izolacją lub bez izolacji DNA DNA izolacja DNA dystonia torsyjna cena do uzgodnienia izolacja DNA oparta na wysalaniu białek metodą Millera GEN13 80 GEN17E z izolacją DNA mutacja w genie DYT1 230 GEN17 bez izolacji DNA 175 8

9 Badania wykonywane w Pracowni Cytogenetyki Zakładu Genetyki Medycznej Cennik ważny od r. Rodzaj badania Cena badania (w zł) Kod procedury Kariotyp w limfocytach 500 GEN-100 Kariotyp w amniocytach (badanie prenatalne) 995 GEN-101 Kariotyp w fibroblastach skóry i z trofoblastu 600 GEN-102 Hodowla fibroblastów skóry 241 GEN-103 Test subtelomerowy z kariotypem GEN-104 Diagnostyka zespołów mikrodelecji metodą FISH z kariotypem GEN-105 bez kariotypu 568 GEN-106 Diagnostyka strukturalnych aberracji chromosomowych metodą FISH * koszt 1 sondy centromerowej koszt 1 sondy malującej koszt 1 sondy locus specyficznej koszt 1 sondy subtelomerowej 485 GEN-107A 445 GEN-107B 545 GEN-107C 445 (sonda znakowana pośrednio) 476 (sonda komercyjna) GEN-107D GEN-107E Prenatalna diagnostyka zespołów mikrodelecji metodą FISH z kariotypem GEN-120 Diagnostyka strukturalnych aberracji chromosomowych metodą CGH GEN-121 Diagnostyka disomii jednorodzicielskiej (UDP) GEN-122 *Koszt badania zawiera się w przedziale od 445 do 2905 zł i zależy od rodzaju aberracji oraz liczby zastosowanych sond molekularnych. 9

10 PROCEDURA DIAGNOSTYCZNA ZESPOŁÓW: PRADERA-WILLIEGO (PWS) ORAZ ANGELMANA (AS) Przyczyną zespołów: Pradera-Williego (PWS) i Angelmana (AS) jest fizyczny lub funkcjonalny brak regionu 15q11-13 na chromosomie pochodzącym odpowiednio od ojca lub matki, spowodowany różnego typu mutacjami: delecjami regionu na odpowiednim ojcowskim lub matczynym chromosomie, jednorodzicielską disomią chromosomu 15, mutacjami regulatorowymi tzw. imprinting mutations. Wszystkie wyżej wymienione defekty zaburzają wzór rodzicielskiego piętna genomowego w genach, które podlegają temu mechanizmowi regulacji ekspresji i są zlokalizowane w regionie 15q W przypadku zespołu Angelmana przyczyną choroby mogą być również mutacje punktowe w genie UBE3A, które nie mają charakteru regulatorowego i nie zaburzają wzoru rodzicielskiego piętna genomowego. Markerem diagnostycznym badania rodzicielskiego piętna genomowego jest wzór metylacji DNA. Diagnostyka zespołów Pradera-Williego (PWS) oraz Angelmana (AS) jest wieloetapowa: Pierwszym etapem jest analiza wzoru metylacji DNA, który w tych zespołach ulega zaburzeniu w przypadku wszystkich rodzajów defektów molekularnych będących przyczyną tych chorób, poza mutacjami punktowymi w genie UBE3A występującymi w AS. Badanie dotyczy tylko chorego i polega na analizie metylacji DNA w genie SNRPN w oparciu o technikę M-PCR (Methylation Specific PCR) z użyciem 3 starterów (specyficznego dla kopii matczynej, ojcowskiej i dla obu kopii) po uprzedniej modyfikacji DNA kwaśnym siarczynem sodu (zestaw CpGenome DNA Modification Kit firmy Intergen). Modyfikacja DNA umożliwia rozróżnienie rodzicielskich kopii w M-PCR. Brak amplifikacji kopii ojcowskiej lub matczynej genu SNRPN stanowi potwierdzenie rozpoznania odpowiednio zespołu Pradera-Williego lub Angelmana i jest podstawą do prowadzenia dalszej diagnostyki w poszukiwaniu rodzaju defektu molekularnego będącego przyczyną choroby (rodzaj mutacji). Obecność obu rodzicielskich kopii badanego regionu w analizie metylacji DNA wyklucza rozpoznanie PWS i kończy diagnostykę molekularną w kierunku tego zespołu. Obecność obu rodzicielskich kopii w przypadku klinicznego podejrzenia AS nie potwierdza, ale i nie wyklucza rozpoznania zespołu Angelmana, ze względu na możliwość występowania mutacji punktowych w genie UBE3A, które nie zaburzają wzoru metylacji DNA w badanym regionie. Obecnie nie prowadzimy badań mających na celu poszukiwania mutacji w UBE3A. Etap II: Zaburzenie wzoru metylacji DNA w SNRPN (brak kopii ojcowskiej w PWS lub matczynej w AS) jest podstawą do kontynuowania diagnostyki w celu ustalenia rodzaju defektu molekularnego będącego przyczyną choroby (delecja, disomia, mutacja regulatorowa). Stosowana w tym celu analiza polimorfizmu mikrosatelitów z regionu 15q11-13 jest badaniem rodzinnym - wymaga materiału badawczego od rodziców i chorego dziecka. Badanie polimorfizmu mikrosatelitów z regionu 15q11-13 obejmuje analizę do 16 markerów i oparte jest o technikę PCR. Diagnostyka prowadzona jest do momentu uzyskania wyniku określającego rodzaj defektu molekularnego. W nielicznych wypadkach, mimo analizy wszystkich markerów, istnieje możliwość nie uzyskania wyniku informacyjnego, umożliwiającego określenie rodzaju defektu molekularnego. Cena badania jest niezależna od ilości analizowanych markerów (od 3-16). W przypadku podejrzenia występowania mutacji regulatorowej (nieprawidłowy wzór metylacji DNA i prawidłowe oburodzicielskie dziedziczenie regionu 15q11-13) materiał do szczegółowej analizy mutacji w centrum regulatorowym wysyłany jest do laboratorium prof. B. Horsthemke w Essen. 10

11 Procedura diagnostyczna w przypadku podejrzenia zespołu łamliwego chromosomu X (FraX) Diagnostyka molekularna zespołu FraX polega na identyfikacji mutacji dynamicznej w genie FMR1. Tok postępowania diagnostycznego złożony jest z dwóch etapów. Pierwszy zakłada analizę DNA metodą PCR jako wstępne badanie przesiewowe na obecność prawidłowych alleli. Drugi etap postępowania polega na przeprowadzeniu analizy mutacji metodą hybrydyzacji genomowej z zastosowaniem techniki Southerna. Metoda ta pozwala na precyzyjne określenie defektu molekularnego, identyfikując pełne mutacje i premutacje, jak również ostatecznie weryfikuje wynik nieinformacyjny uzyskany w badaniu przesiewowym. Schemat organizacji postępowania diagnostycznego: Etap I: Przesiew metodą Expand Long Template PCR System. Genotyp (-/-) wynik prawidłowy koniec diagnostyki Genotyp (-) Genotyp (-/?) wynik nieinformacyjny! wskazanie do Genotyp (?) rozszerzenia diagnostyki (etap II) Etap II: Hybrydyzacja genomowa (techniką Southerna). Genotyp (-/-) wynik prawidłowy koniec diagnostyki Genotyp (-) Genotyp (p/-), (m/-) FraX Genotyp (p), (m) wynik potwierdzający rozpoznanie zespołu koniec diagnostyki Oznaczenia: (-/-) prawidłowy wzór alleli dla kobiety, (-) prawidłowy wzór alleli dla mężczyzny, (p/-) premutacja u kobiety, (p) premutacja u mężczyzny, (m/-) pełna mutacja u kobiety, (m) pełna mutacja u mężczyzny, (?) wynik nieinformacyjny dla mężczyzny (brak produktu PCR), (-/?) wynik nieinformacyjny dla kobiety. 11

12 Mukowiscydoza (CF) Procedura diagnostyczna Identyfikacja delf508 Wynik: m/m Wynik: m/- Wynik: -/- CF KONIEC DIAGNOSTYKI Identyfikacja dele2,3(21kb) Wynik: m/m Wynik: m/- Wynik: -/- InnoLipa19 + InnoLipa17 Wynik: m/m Wynik: m/- Wynik: -/- Sekwencjonowanie eksonu13 Wynik: m/m Wynik: m/- Wynik: -/- Sekwencjonowanie 27 eksonów Wynik: m/m Wynik: m/- Wynik: -/- Analiza dużych delecji w genie CFTR metodą MLPA 12

13 Płatność Opłaty za wszystkie badania przedstawione w ofercie, zgodnie z cennikiem, można uiszczać w Informacji Instytutu Matki i Dziecka (niebieski budynek, parter) lub bezpośrednio na rachunek: Instytut Matki i Dziecka Bank BPH IX Oddział Warszawa Tytuł płatności: Płatne badanie molekularne lub cytogenetyczne. Zakład Genetyki Medycznej. Istnieje również możliwość wystawienia faktury po przesłaniu z próbką krwi odpowiednich danych. 13

14 14

15 15