Interaction between model peptides and lecithin



Podobne dokumenty
THEORETICAL AND EXPERIMENTAL NMR STUDIES ON CARBAZOLES

The influence of N-methylation on conformational properties of peptides with Aib residue. Roksana Wałęsa, Aneta Buczek, Małgorzata Broda

Liposomy nośniki leków przeciwnowotworowych

Lipidy budowa i znaczenie. Liposomy

Badanie oddziaływań związków biologicznie aktywnych z modelowymi membranami lipidowymi


Molekularna organizacja komórki

Ryc. 1. Mozaikowy model budowy błony

Wpływ heterocyklicznego ugrupowania na natywną konformację naturalnych peptydów

Nowe technologie w produkcji płynnych mieszanek paszowych uzupełniających

Lipidy (tłuszczowce)

Biomolekuły (3) Bogdan Walkowiak. Zakład Biofizyki Instytut Inżynierii Materiałowej Politechnika Łódzka. piątek, 7 listopada 2014 Biofizyka

NANOMEDYCYNA - PRZYSZŁOŚĆ

Komputerowe wspomaganie projektowanie leków

System błon w komórkach eukariotycznych. Transport przez błony plazmatyczne. Błona komórkowa - model płynnej mozaiki

Projekt SONATA BIS 4, Wydział Chemii UJ, Kraków

Termodynamika fazy powierzchniowej Zjawisko sorpcji Adsorpcja fizyczna: izoterma Langmuira oraz BET Zjawiska przylegania

Funkcje błon biologicznych

POLITECHNIKA ŁÓDZKA INSTRUKCJA Z LABORATORIUM W ZAKŁADZIE BIOFIZYKI. Ćwiczenie 3 ANALIZA TRANSPORTU SUBSTANCJI NISKOCZĄSTECZKOWYCH PRZEZ

Lek od pomysłu do wdrożenia

Mechanizm działania terapii fotodynamicznej w diagnozowaniu i leczeniu nowotworów. Anna Szczypka Aleksandra Tyrawska

Ryc. 2. Amfifilowa cząsteczka fosfolipidu i fragment dwuwarstwy lipidowej. Ryc. 3. Budowa liposomów

Znamy tylko kilka typów monomerów, ale z nich powstają miliony. Poza wodą, biomolekuły dzielimy na cztery klasy:

Właściwości błony komórkowej

UNIWERSYTET O P O L S K I

CORAZ BLIŻEJ ISTOTY ŻYCIA WERSJA A. imię i nazwisko :. klasa :.. ilość punktów :.

Błona komórkowa - model płynnej mozaiki

Sterydy (Steroidy) "Chemia Medyczna" dr inż. Ewa Mironiuk-Puchalska, WChem PW

TERAPIA GENOWA. dr Marta Żebrowska

Opis efektów kształcenia dla modułu zajęć

Chemiczne składniki komórek

Eukariota - błony wewnątrzkomórkowe. Błony wewnętrzne stanowiące granice poszczególnych. przedziałów komórki i otaczające organelle komórkowe

HARMONOGRAM EGZAMINÓW Sesja zimowa Termin I: Termin II (poprawkowy):

Izoenzymy. Katalizują te same reakcje, ale różnią się właściwościami fizycznymi lub kinetycznymi. Optimum ph. Powinowactwo do substratu

Transport przez błony

Błona komórkowa - funkcje a struktura? Błony komórki jako bariery

Aromatic or Not? An Insight from the Calculated Magnetic Indexes

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Patrycji Kozub pt.

Program Wydziałowej Konferencji Sprawozdawczej w dniach lutego 2013r. 11 lutego 2013 r.

Spektroskopia oscylacyjna w farmakologii śródbłonka

Ryc. 2. Amfifilowa cząsteczka fosfolipidu i fragment dwuwarstwy lipidowej

Agnieszka Markowska-Radomska

BADANIA WŁAŚCIWOŚCI LIPOFILOWYCH ZWIĄZKÓW PRZECIWUTLENIAJĄCYCH

Katedra i Zakład Technologii Chemicznej Środków Leczniczych. Prace Magisterskie 2018/2019

Plan prezentacji. Wprowadzenie Metody Wyniki Wnioski Podziękowania. Yaghi et al. Nature 2003, 423, 705 2

Podstawy biogospodarki. Wykład 7

Fizjologia nauka o czynności żywego organizmu

Budowa i klasyfikacja lipidów

Małe, średnie i... nano. Modelowanie molekularne w Opolu (i nie tylko) Teobald Kupka, Małgorzata A. Broda

Badanie przejść fazowych w błonach biologicznych metodą pomiaru anizotropii fluorescencji 1. Wstęp

Definicja immobilizacji

Podstawy projektowania leków wykład 12

Lipidy OLEJ. Kwasy t uszczowe. Kwasy t uszczowe Omega6 COOH COOH CH3. Schéma acides gras omega 6 COOH

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH

Budowa i klasyfikacja lipidów

Błona komórkowa - funkcje a struktura?

Błona komórkowa - funkcje a struktura? Błony komórki jako bariery

Obliczanie Dokładnych Parametrów NMR Charakterystyka struktury i parametrów spektroskopowych wybranych układów molekularnych

Przegląd budowy i funkcji białek

Kierunek: Chemia, rok I Rok akademicki 2016/2017

UNIWERSYTET W BIAŁYMSTOKU WYDZIAŁ BIOLOGICZNO CHEMICZNY. Joanna Kotyńska

Mikrokapsułki CS. Prof. dr hab. Stanisław Ignatowicz Konsultacje Entomologiczne Warszawa

Profil metaboliczny róŝnych organów ciała

BIOTECHNOLOGIA W KOSMETOLOGII SŁAWOMIR WIERZBA

SPEKTROSKOPIA NMR. No. 0

Dr hab. Rafał Luchowski Lublin, 8 sierpnia 2016 r.

Program studiów II stopnia dla studentów kierunku chemia od roku akademickiego 2015/16

ENZYMY W CHEMII. Michał Rachwalski. Uniwersytet Łódzki, Wydział Chemii, Katedra Chemii Organicznej i Stosowanej

Kierunek: Chemia, rok I Rok akademicki 2015/2016

Kierunek: Chemia, rok I

Modelowanie molekularne w projektowaniu leków

Chemiczne składniki komórek

Chemia bionieorganiczna / Rosette M. Roat-Malone ; red. nauk. Barbara Becker. Warszawa, Spis treści

Biochemia zadymionych komórek

Linie produktów do ciała: Maska CO2 na ciało Linia pielęgnacyjna szyi i dekoltu Linia przeciw rozstępom

Funkcjonalne nano- i mikrocząstki dla zastosowań w biologii, medycynie i analityce

UNIWERSYTET w BIAŁYMSTOKU Wydział Biologiczno-Chemiczny INSTYTUT CHEMII

Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko. Syllabus przedmiotowy 2016/ /2019

Program studiów II stopnia dla studentów kierunku chemia od roku akademickiego 2016/2017. Semestr 1M

Substancje powierzchniowo czynne

QSAR i związki z innymi metodami. Karol Kamel Uniwersytet Warszawski

BIOTECHNOLOGIA MEDYCZNA

Nanokapsuły polielektrolitowe z ciekłym rdzeniem do kontrolowanego podawania leków lipofilowych

Chemia lipidów i białek SYLABUS

Moduły kształcenia. Efekty kształcenia dla programu kształcenia (kierunku) MK_06 Krystalochemia. MK_01 Chemia fizyczna i jądrowa

Antyoksydanty pokarmowe a korzyści zdrowotne. dr hab. Agata Wawrzyniak, prof. SGGW Katedra Żywienia Człowieka SGGW

Effective Skin Care 5D L ARISSE innowacyjne kremy przeciwzmarszczkowe 5D Laboratorium Kosmetycznego AVA

PRZEBIEG EGZAMINU LICENCJACKIEGO DLA KIERUNKU ZASTOSOWANIA FIZYKI W BIOLOGII I MEDYCYNIE specjalność BIOFIZYKA MOLEKULARNA

Sala wykładowa A, rok akademicki 2016/2017

Ferulac Peel jest to profesjonalna, nowa generacja nanopilingów chemicznych. opracowanych w nanotechnologii ułatwiającej głębszą penetracje składników

(12) TŁUMACZENIE PATENTU EUROPEJSKIEGO (19) PL (11) (96) Data i numer zgłoszenia patentu europejskiego:

TAF TEMPERATURE ADAPTED FEEDS. - Odpowiednia pasza na daną porę roku TEMPERATURE ADAPTED FEEDS TM

(19) PL (11) (13) B1 (12) OPIS PATENTOWY PL B1. (51) IntCl7 G09B 23/26 G01N 33/00. (73) Uprawniony z patentu:

Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska

ZAAWANSOWANE METODY USTALANIA BUDOWY ZWIĄZKÓW ORGANICZNYCH. Witold Danikiewicz. Instytut Chemii Organicznej PAN ul. Kasprzaka 44/52, Warszawa

Wpływ egzogennych fosfolipidów na HDL

Spis treści. Autorzy... Przedmowa Wprowadzenie. Historia i idea biofarmacji... 1 Małgorzata Sznitowska, Roman Kaliszan

Nazwa przedmiotu (w języku polskim oraz angielskim)

ROZDZIELENIE OD PODSTAW czyli wszystko (?) O KOLUMNIE CHROMATOGRAFICZNEJ

Transkrypt:

Uniwersytet polski Zakład Chemii Fizycznej i i Modelowania Molekularnego Interaction between model peptides and lecithin Roksana Wałęsa, Dawid Siodłak, Teobald Kupka, Małgorzata Broda

Lecytyny - grupa organicznych związków chemicznych zaliczanych do fosfolipidów, w których reszta fosforanowa zestryfikowana jest choliną. - lecytyny zwykle otrzymuje się z żółtek jajek kurzych, rzepaku lub ziaren soi. http://ebiolog.pl/a-7-3.html 2

Liposomy z gr. ciałka lipidowe. Są to struktury powstające samoistnie z fosfolipidów. Mają postać pęcherzyków zbudowanych z kilku lub kilkunastu przestrzeni wodnych oddzielonych od siebie zamkniętymi koncentrycznie dwuwarstwami fosfolipidowymi. Podział liposomów: Liposomy z więcej niż jedną warstwą lipidową Liposomy wielowarstwowe (ang.multillamellar vesicles) - MLV (0,4-10 µm) Pęcherzyki oligolamelarne (ang.oligolamellar vesicles) - LV (0,1-1 µm) A.Kozubek, Wstęp do technologii liposomowej,wrocław, 2004 Liposomy jednowarstwowe (ang.unilamellar vesicles) - UV (0,01-1µm) Małe liposomy jednowarstwowe (ang.small or sonicated) unilameller vesicles) - SUV (0,02-0,03µm) Duże liposomy jednowarstwowe (ang.large unilameller vesicles) - LUV (0,05-1µm) lbrzymie jednowarstwowe liposomy (ang.giant unilamellar vesicles) - GUV > 1µm Wielopęcherzykowe liposomy (ang.multivesicular vesicles) MVV > 1µm 3

Liposomy jako nośniki substancji aktywnych Liposomy: - ułatwiają penetrację substancji aktywnych w kolejnych warstwach naskórka, przez co umożliwiają uzyskanie odpowiedniego stężenia terapeutycznego w skórze, - dają możliwość umieszczania w nich związków zarówno o charakterze lipofilowym jak ihydrofilowym - minimalizują wystąpienie efektów ubocznych - izolują substancję leczniczą w swoim wnętrzu np. przed działaniem enzymów proteolitycznych 4 Pierwszy przeciwzmarszczkowy krem z liposomami powstał w 1986 r. w laboratorum Diora.

Liposomy w leczeniu choroby nowotworowej Substancje chemiczne stosowane w chemioterapii niszczą komórki nowotworowe, jednak jednocześnie, niszczone są również komórki zdrowe. Zatem precyzyjne skierowanie leku pod wskazany adres powoduje znaczne obniżenie toksyczności oraz zmniejsza działania niepożądane. 5

Leki zamknięte w formulacjach liposomowych 6

Stabilność liposomów W lipidową dwuwarstwę pęcherzyków liposomowych mogą być wbudowywane inne cząsteczki np. cholesterol, sfingomielina, glikolipidy, glikozoaminoglikany, lipidowe pochodne polimerów. Cząsteczki te podnoszą stabilność liposomów in vivo. Inkorporacja peptydów pozwala na kierowanie liposomów do docelowej tkanki. cholesterol [1] glikozaminoglikany [2] [1] evozhay D, Kańska U, Budzyńska R, Boratyński J, Current status of research on conjugates and related drug delivery systems in the treatment of cancer and other diseases. Postepy Hig Med Dosw, 2007; 61: 350-360 [2] Wu HC, Chang DK. Peptide-Mediated Liposomal Drug Delivery SystemTargeting Tumor Blood Vessels in Anticancer Therapy, J ncol, 2010, 1-8. 7

Modyfikacje strukturalne peptydów (1) -metylowanie (2) wprowadzenie reszty, -dehydroaminokwasowej R1 C C R2 C Zalety: - wzrost stabilności enzymatycznej - wzrost selektywności działania - lepsza przenikalność przez błony biologiczne H H H (Z) ΔPhe 8

Badania EPR: sonda 16-DXYL Sondy spinowe Liposomy są diamagnetyczne (bardzo słabo oddziałują z polem magnetycznym) w ich błonach umieszcza się sondy spinowe. Sondy umieszczone w różnych rejonach błony dają cenne informacje o jej dynamice Ac-Phe-HMe Ac-Phe-Me 2 Ac-(Z)-ΔPhe-Me 2 C H 3 H H 2 C H CH 3 C H 3 H H 2 C CH 3 CH 3 C H 3 H HC CH 3 CH 3 16-DXYL 9

Techniczne aspekty obliczeń: optymalizacja geometrii Program: Gaussian 09 Metoda: M06-2X/6-31G(d) Czas obliczeń: 8 procesorów ~ 250 h Ac-Phe-HMe Ac-Phe-Me 2 Ac-(Z)- Phe-Me 2 C H 3 H 2 C H H CH 3 C H 3 H 2 C H CH 3 CH 3 C H 3 H HC CH 3 CH 3 H 3 C + H P 3 C CH 3 10

ddziaływania stabilizujące kompleksy wiązania wodorowe: -H C-H kryteria: d (A* H < 3.2 Å) D*-H A > 90 *A-akceptor (A=) *D-donor (D=,C) Steiner T., The hydrogen bond in the solid state, Angew. Chem. Int. Ed., 2002; 41: 48-76.

ddziaływania stabilizujące kompleksy

ddziaływania stabilizujące kompleksy wiązania wodorowe: -H C-H kryteria: d (A* H < 3.2 Å) D*-H A > 90 *A-akceptor (A=) *D-donor (D=,C) Steiner T., The hydrogen bond in the solid state, Angew. Chem. Int. Ed., 2002; 41: 48-76.

ΔE Wyniki:Ac-Phe-HMe kompleks φ [º] ψ [º] E oddz. [kcal/mol] 1-87.0 80.2-31.02 (5) 2.57 2.60 2-148.7 133.3-30.88 3-93.8 60.4-30.86 4-163.0 124.1-27.30 5-82.1 83.1-6.48 (4) (4) (3) (3) 1.85 C 16 H 29 C 17H 35 (2) (2) 1.93 C 16 H 29 C 17 H 35 1.82 C 16 H 29 C 17H 35 (1) 1.74 C 16 H 29 C17 H 35 14

Wyniki MR: Ac-Phe-HMe Metody obliczeniowe: VSXC, B3LYP Bazy funkcyjne: ST-3G mag aug-cc-pvtz-j 15

Wyniki: Wartości RMS dla obliczonych parametrów MR kompleksów lecytyna : Ac-Phe-HMe kompleks RMS RMS RMS VSXC B3LYP VSXC B3LYP VSXC B3LYP 1 1.22 1.20 8.79 10.36 6.91 8.18 2 1.13 1.10 8.60 10.11 6.80 7.98 3 1 H 0.96 0.96 13 C 8.95 10.77 1 H+ 13 C 7.06 8.49 4 1.13 1.05 9.04 10.45 7.14 8.25 5 0.95 0.82 9.10 10.76 7.18 8.47

Wyniki: Wartości RMS dla obliczonych parametrów MR kompleksów lecytyna : Ac-Phe-HMe kompleks RMS RMS RMS VSXC B3LYP VSXC B3LYP VSXC B3LYP 1 1.22 1.20 8.79 10.36 6.91 8.18 2 1.13 1.10 8.60 10.11 6.80 7.98 3 1 H 0.96 0.96 13 C 8.95 10.77 1 H+ 13 C 7.06 8.49 4 1.13 1.05 9.04 10.45 7.14 8.25 5 0.95 0.82 9.10 10.76 7.18 8.47

Wyniki: Wartości RMS dla obliczonych parametrów MR kompleksów lecytyna : Ac-Phe-HMe kompleks RMS RMS RMS VSXC B3LYP VSXC B3LYP VSXC B3LYP 1 1.22 1.20 8.79 10.36 6.91 8.18 2 1.13 1.10 8.60 10.11 6.80 7.98 3 1 H 0.96 0.96 13 C 8.95 10.77 1 H+ 13 C 7.06 8.49 4 1.13 1.05 9.04 10.45 7.14 8.25 5 0.95 0.82 9.10 10.76 7.18 8.47

Wyniki: Wartości RMS dla obliczonych parametrów MR kompleksów lecytyna : Ac-Phe-HMe kompleks RMS RMS RMS VSXC B3LYP VSXC B3LYP VSXC B3LYP 1 1.22 1.20 8.79 10.36 6.91 8.18 2 1.13 1.10 8.60 10.11 6.80 7.98 3 1 H 0.96 0.96 13 C 8.95 10.77 1 H+ 13 C 7.06 8.49 4 1.13 1.05 9.04 10.45 7.14 8.25 5 0.95 0.82 9.10 10.76 7.18 8.47

E Wyniki:Ac-Phe-Me 2 (5) 2.42 3.06 kompleks φ [º] ψ [º] E oddz. [kcal/mol] 1-163.8 145.9-23.39 2 51.8 38.9-32.59 3-165.0 69.9-28.68 4-102.1-109.1-15.79 5-127.3 81.8-14.71 (3) (4) 2.18 2.30 (2) 2.08 2.08 (1) 1.99 1.99 20

E Wyniki:Ac-(Z)- Phe-Me 2 (6) 3.07 2.46 2.36 kompleks φ [º] ψ [º] E oddz. [kcal/mol] 1-33.9 113.8-34.75 2-22.0 109.7-29.06 (5) 2.22 3-29.4 112.7-26.95 4 0.9 92.1-26.87 5-31.6 118.7-15.52 6-26.7 114.1-9.12 (3) (4) 1.90 (1) (2) 2.07 1.89 1.85

Wnioski bliczenia teoretyczne wskazują, że wszystkie diamidy Ac-Phe-HMe, Ac-Phe-Me 2, Ac-(Z)- Phe-Me 2, oddziałują z polarną częścią lipidu główką. ajwyższa wartość energii stabilizacji -35.0 kcal/mol obliczona została dla diamidu zawierającego resztę, -dehydrofenyloalaniny. Energia oddziaływania diamidu Ac-Phe-Me 2 z hydrofobowym łańcuchem kwasu tłuszczowego jest najwyższa i wynosi -14.71 kcal/mol, co wskazuje na to, że obecność grupy metylowej powoduje większe powinowactwo diamidu do niepolarnej części lecytyny. bliczone wartości RMS wskazują, że metoda VSXC daje lepsze wyniki w obliczaniu parametrów widm 1 H oraz 13 C MR niż metoda B3LYP (przesunięcia chemiczne wyższe o 1-1.5 ppm)

Dziękuję za uwagę! Roksana Wałęsa jest stypendystką projektu "Stypendia doktoranckie - inwestycja 23 w kadrę naukową województwa opolskiego współfinansowanego przez Unię Europejską w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego