Laboratorium Technik Obrazowania

Podobne dokumenty
Tomografia emisyjna pojedynczych fotonów (SPECT) w medycynie nuklearnej: technika skanowania i rekonstrukcji obrazu.

TECHNIKI MEDYCYNY NUKLEARNEJ. TOMOGRAFIA PET Wykład 12

Techniki Jądrowe w Diagnostyce i Terapii Medycznej

Tomografia emisyjna pojedynczych fotonów (SPECT) w medycynie nuklearnej: technika skanowania i rekonstrukcji obrazu.

Sprzęt stosowany w pozytonowej tomografii emisyjnej

Wyznaczanie profilu wiązki promieniowania używanego do cechowania tomografu PET

Laboratorium Technik Obrazowania

FIZYKA III MEL Fizyka jądrowa i cząstek elementarnych

Charakterystyka detektorów i kolimatorów dla gamma kamer SPECT w medycynie nuklearnej

Laboratorium Technik Obrazowania

STATYSTYKA

Komputerowa Analiza Danych Doświadczalnych

Spis treści 3 SPIS TREŚCI

Pomiar energii wiązania deuteronu. Celem ćwiczenia jest wyznaczenie energii wiązania deuteronu

Testowanie hipotez statystycznych.

Statystyka i opracowanie danych Podstawy wnioskowania statystycznego. Prawo wielkich liczb. Centralne twierdzenie graniczne. Estymacja i estymatory

Definicja 1 Statystyką nazywamy (mierzalną) funkcję obserwowalnego wektora losowego

γ6 Liniowy Model Pozytonowego Tomografu Emisyjnego

Stanisław Cichocki Natalia Nehrebecka. Wykład 7

J-PET. modułowy detektor szerokiego zastosowania,

WYDZIAŁ BUDOWNICTWA LĄDOWEGO I WODNEGO

WYMAGANIA WSTĘPNE W ZAKRESIE WIEDZY, UMIEJĘTNOŚCI I INNYCH KOMPETENCJI

PET. Positron Emission Tomography. Tomograf PET. Wytwórnia radiofarmaceutyków linia technologiczna. Wytwórnia radiofarmaceutyków centrum sterowania

Wykład Centralne twierdzenie graniczne. Statystyka matematyczna: Estymacja parametrów rozkładu

Wnioskowanie statystyczne. Statystyka w 5

Rozkłady statystyk z próby

KADD Metoda najmniejszych kwadratów funkcje nieliniowe

Uogolnione modele liniowe

Własności statystyczne regresji liniowej. Wykład 4

Spis treści. Przedmowa... XI. Rozdział 1. Pomiar: jednostki miar Rozdział 2. Pomiar: liczby i obliczenia liczbowe... 16

Weryfikacja hipotez statystycznych, parametryczne testy istotności w populacji

Wykład 1 Próba i populacja. Estymacja parametrów z wykorzystaniem metody bootstrap

Estymacja punktowa i przedziałowa

Rozdział 2: Metoda największej wiarygodności i nieliniowa metoda najmniejszych kwadratów

Matematyka z el. statystyki, # 6 /Geodezja i kartografia II/

Badania możliwości jednoczesnego dokonywania pomiarów za pomocą tomografu Jagiellonian-PET oraz tomografu komputerowego.

Metody probabilistyczne

Wyznaczanie bezwzględnej aktywności źródła 60 Co. Tomasz Winiarski

Scyntygrafia, Tomografia Emisyjna Pojedynczego Fotonu, Pozytonowa Tomografia Emisyjna

Estymacja parametrów, przedziały ufności etc

Komputerowa analiza danych doświadczalnych

Matematyka ubezpieczeń majątkowych r.

Komputerowa analiza danych doświadczalnych

Wykład 4. Plan: 1. Aproksymacja rozkładu dwumianowego rozkładem normalnym. 2. Rozkłady próbkowe. 3. Centralne twierdzenie graniczne

Prawdopodobieństwo i statystyka r.

LABORATORIUM Populacja Generalna (PG) 2. Próba (P n ) 3. Kryterium 3σ 4. Błąd Średniej Arytmetycznej 5. Estymatory 6. Teoria Estymacji (cz.

Estymacja gęstości prawdopodobieństwa metodą selekcji modelu

Estymacja parametrów, przedziały ufności etc

WYKŁADY ZE STATYSTYKI MATEMATYCZNEJ wykład 11 i 12 - Weryfikacja hipotez statystycznych

WSTĘP DO REGRESJI LOGISTYCZNEJ. Dr Wioleta Drobik-Czwarno

Instytut Matematyczny Uniwersytet Wrocławski. Zakres egzaminu magisterskiego. Wybrane rozdziały anazlizy i topologii 1 i 2

Metoda największej wiarygodności

Metoda największej wiarogodności

Prawdopodobieństwo i statystyka r.

Wykład 3 Momenty zmiennych losowych.

Techniki Jądrowe w Diagnostyce i Terapii Medycznej

Wykład 3 Momenty zmiennych losowych.

STATYSTYKA MATEMATYCZNA ZESTAW 0 (POWT. RACH. PRAWDOPODOBIEŃSTWA) ZADANIA

Sterowanie napędów maszyn i robotów

UKŁADY ALGEBRAICZNYCH RÓWNAŃ LINIOWYCH

Statystyka od podstaw Janina Jóźwiak, Jarosław Podgórski

Modele i wnioskowanie statystyczne (MWS), sprawozdanie z laboratorium 1

Opis wykonanych badań naukowych oraz uzyskanych wyników

Niech X i Y będą niezależnymi zmiennymi losowymi o rozkładach wykładniczych, przy czym Y EX = 4 i EY = 6. Rozważamy zmienną losową Z =.

Podstawowe pojęcia. Własności próby. Cechy statystyczne dzielimy na

Wykład 5 Estymatory nieobciążone z jednostajnie minimalną war

PDF created with FinePrint pdffactory Pro trial version

Wykład 6 Estymatory efektywne. Własności asymptotyczne estym. estymatorów

Efekt Comptona. Efektem Comptona nazywamy zmianę długości fali elektromagnetycznej w wyniku rozpraszania jej na swobodnych elektronach

WYKŁADY ZE STATYSTYKI MATEMATYCZNEJ wykład 13 i 14 - Statystyka bayesowska

Badanie schematu rozpadu jodu 128 J

Testowanie hipotez statystycznych.

WYKŁADY ZE STATYSTYKI MATEMATYCZNEJ wykład 4 - zagadnienie estymacji, metody wyznaczania estymatorów

Kontrola jakości gamma kamery z użyciem fantomu Jaszczaka

Badanie własności kolimatorów gamma kamery przy wykorzystaniu źródeł: Co-57, Ba-133 i Cs-137

3. Zależność energii kwantów γ od kąta rozproszenia w zjawisku Comptona

zadania z rachunku prawdopodobieństwa zapożyczone z egzaminów aktuarialnych

O ŚREDNIEJ STATYSTYCZNEJ

ĆWICZENIE 2. BADANIE CHARAKTERYSTYK SOND PROMIENIOWANIA γ

PL B1. UNIWERSYTET JAGIELLOŃSKI, Kraków, PL BUP 05/15. PAWEŁ MOSKAL, Czułówek, PL WUP 03/18. rzecz. pat.

Pracownia Jądrowa. dr Urszula Majewska. Spektrometria scyntylacyjna promieniowania γ.

SPIS TEŚCI CZĘŚĆ I RACHUNEK PRAWDOPODOBIEŃSTWA

IX. TOMOGRAFIA EMISYJNA FOTONÓW I POZYTONÓW

Ważne rozkłady i twierdzenia c.d.

Próba własności i parametry

Statystyka matematyczna i ekonometria

Med-fizykadla nie-fizyków. mgr inż. Anna Kozłowska Zakład Dydaktyki Fizyki UMK

1 Podstawy rachunku prawdopodobieństwa

IX. TOMOGRAFIA EMISYJNA FOTONÓW I POZYTONÓW

IM-8 Zaawansowane materiały i nanotechnologia - Pracownia Badań Materiałów I 1. Badanie absorpcji promieniowania gamma w materiałach

Optyka kwantowa wprowadzenie. Początki modelu fotonowego Detekcja pojedynczych fotonów Podstawowe zagadnienia optyki kwantowej

Statystyka, Ekonometria

STATYSTYKA - PRZYKŁADOWE ZADANIA EGZAMINACYJNE

Wyznaczanie współczynnika rozpraszania zwrotnego. promieniowania β.

Oddziaływanie Promieniowania Jonizującego z Materią

Laboratorium Technik Obrazowania

SYMULACJA GAMMA KAMERY MATERIAŁ DLA STUDENTÓW. Szacowanie pochłoniętej energii promieniowania jonizującego

OPIS MODUŁ KSZTAŁCENIA (SYLABUS)

ANALIZA SEMANTYCZNA OBRAZU I DŹWIĘKU

Tablica Wzorów Rachunek Prawdopodobieństwa i Statystyki

Transkrypt:

Laboratorium Technik Obrazowania Krzyszto Kacperski Zakład Fizyki Medycznej, Centrum Onkologii - Instytut im. Marii Skłodowskiej-Curie

Gamma kamera

Funkcja odpowiedzi na źródło punktowe d T D Zdolność rozdzielcza: FWHM 2,35 r Detektor idealny W dobrym przybliżeniu: d 2 gdzie: 2 2 r PSF ( r, d) exp 2 2 d 0 d Detektor rzeczywisty D T 0 własna zdolność rozdzielcza detektora

Funkcja odpowiedzi na źródło punktowe 1,5 cm 9 cm 20 cm 72 cm Detektor jak najbliżej pacjenta!

Kolimator penetracja

Lokalizacja punktu oddziaływania kamera Angera Rejestracja punktu oddziaływania (kamera analogowa): X x x x L Własna zdolność rozdzielcza detektora (intrinsic resolution): 3-5 mm

Lokalizacja punktu oddziaływania Rejestracja punktu oddziaływania (kamera cyrowa): ADC ADC ADC Szybki algorytm lokalizacji (FPGA) ADC

Jednorodność pola

Kontrola jakości jednorodność pola Tablice korekcji

Kontrola jakości jednorodność pola Parametry ilościowe: Integral uniormity: Dierential uniormity: IU Max Max pixel pixel Min Min pixel pixel *100% DU Max różnica między sąsiednimi pixelami *100% Max pixel Powinno być: IU < 5%

Kontrola jakości jednorodność pola

Kontrola jakości jednorodność pola Do korekcji

Gamma kamera szybkość zliczeń Typowa dawka 99m Tc: 500 MBq Z tego w polu widzenia kamery: Absorbcja/ rozpraszanie w pacjencie Czułość kolimatora Wydajność detekcji scyntylatora + elektronika x 3 1 x 10 1 x 2 10 000 1 x 0.6 = 4 10 6 170 MBq 17 MBq 3 kbq (kcps) 2 kbq (kcps)

Gamma kamera szybkość zliczeń Pojedyncze zliczenie czas martwy: 0.5 2 ms czasowa zdolność rozdzielcza: t 5 10 ns Rejestrowana szybkość zliczeń: C R = C 0 (1 τc 0 )

Pozytonowa Tomograia Emisyjna (PET)

Pozytonowa Tomograia Emisyjna (PET) 511 kev Rejestracja par otonów anihilacyjnych 511 kev w koincydencji czasowej (Lines o Response) 511 kev Projekcje (Sinogram) Rekonstrukcja Kolimacja elektroniczna Nie trzeba kolimatora mechanicznego! Czułość 5 10 % Brak części ruchomych w skanerze Obraz 3D rozkładu aktywności (r,t)

Radioizotopy PET nuclide 11 C 13 N 15 O T 1/2 20.4 min 9.97 min 122 sec + energy (MeV) 1.98 2.22 1.73 + decay probability % 100 100 99.9 alternative decay mode - - EC 0.1% other emissions (MeV) - - - 18 F 64 Cu 110 min 12.7 hr 0.63 0.65 96.7 17.4 EC 3.3% EC 44% - 0.58-39% 68 Ga 68.3 min 1.90 89 EC 11% 1.08 3% 82 Rb 124 I 1.27 min 4.18 day 3.37 1.53 2.14 0.81 95 11.7 10.8 0.29 EC 5% EC 77% 0.78 13% 0.60 63% 0.72 10.4% 1.69 10.9% 1.51 3.1%

Radioizotopy PET nuclide + E + max range + mean range max MeV in water (mm) in water (mm) 11 C 0.959 4.1 1.1 13 N 1.197 5.1 1.5 15 O 1.738 7.3 2.5 18 F 0.633 2.4 0.6 68 Ga 1.898 8.2 2.9 82 Rb 3.40 14.1 5.9 124 I 2.13 c. 10 - Generatory izotopów PET

Skaner PET

Skaner PET 1 2 3 4 5 6

Skaner PET PET "Block" Detector Scyntylator PMTs 20-30 mm C A B Images courtesy o CTI Histogram

Scyntylatory dla PET Desirable properties NaI BGO LSO Lu 2 SiO 5 GSO GdSiO 5 LaBr 3 Good stopping power: 50 high eective Z (density g/cc) (3.67) High light output relative to NaI (%) 73 (7.13) 65 (7.35) 58 (6.71) 47 (5.3) 100 15 75 25 150 Wavelength (~400 nm) 410 480 420 430 360 Fast light decay (ns) 230 60/300 40 60/600 25 High energy resolution @ 511 kev (%) 7.5 13 11 8.5 3

PET zdolność rozdzielcza Czynniki ograniczające: skończony rozmiar detektorów; paralaksa niewspółliniowość otonów anihilacji skończony zasięg pozytonów

PET zdolność rozdzielcza Niewspółliniowość otonów anihilacji Jest skutkiem niezerowego pędu anihilującej pary e + e - (głównie elektronu) 511 kev 180 ± 0.25 511 kev

PET zdolność rozdzielcza Niewspółliniowość otonów anihilacji Rozkład kątowy par otonów anihilacyjnych jest w przybliżeniu gaussowski 180 ± 0,25 FWHM Rozmycie wynikające z niewspółliniowości w centrum pola widzenia jest w przybliżeniu dane wzorem sin(0,25 ) R 0.0022 x D D= 80 cm D= 12 cm R 180 = 0.26 mm R 180 = 1.8 mm

PET zdolność rozdzielcza Zasięg pozytonu 511 kev positron range 511 kev

PET zdolność rozdzielcza Zasięg pozytonu Rozkład wykładniczy; zasięg zależy od maksymalnej energii pozytronu luorine-18 (0.64 MeV) carbon-11 (0.97 MeV) 1 mm nitrogen-13 (1.19 MeV) oxygen-15 (1.72 MeV)

PET zdolność rozdzielcza detector 2-5 mm ~ 0,2 mm positron range colinearity FWHM total 2 = FWHM det 2 + FWHM range 2 + FWHM 180 2 ~ 2 mm FWHM total = 3-6 mm

Time o Flight (TOF) PET D r t 2r c c = 30 cm/ns Czasowa zdolność rozdzielcza: 500 ps lokalizacja 8 cm próby z BaF 2 w latach 80-tych obecnie LSO ~600 ps główna zaleta: redukcja szumu szczególnie istotne dla otyłych pacjentów r 1 c t 2 Redukcja SNR: ~ 2D/ct Czasowa zdolność rozdzielcza 500 ps 5x Redukcja Wariancji!

Tomograia SPECT (Single Photon Emission Computed Tomography) Detektor projekcje pacjent zrekonstruowany obraz Rekonstrukcja tomograiczna

Scyntygraia planarna 99m Tc- MDP (metylenodwuosonian)

Scyntygraia planarna a tomograia SPECT

Metody rekonstrukcji tomograicznej obrazów analityczne Filtrowana projekcja wsteczna (FBP) dyskretne algebraiczne statystyczne iteracyjne Metoda ML-EM, OSEM oparta na transormacji Fouriera liniowa szybka zakłada uproszczony model izyczny arteakty prążkowe przy małej liczbie zliczeń pozwala uwzględnić dokładny model izyczny znacznie lepsza jakość obrazu nieliniowa Wolna; wymaga dużej mocy obliczeniowej

Rekonstrukcja analityczna Projekcje (transormacja Radona): s y l p(,s) p (, s) ( x, y) dl ( l cos, l sin) dl (x,y) x (x,y) p(,s) Założenia: Funkcje określone w R n Brak osłabienia promieniowania Brak szumu Idealny kolimator

Rekonstrukcja analityczna - sinogram s y (x 0,y 0 ) l x s x 0 sin y0 cos Asin( ) A 2 2 x 0 y0 arctan y 0 x0 s

Sinogram s

Metoda iltrowanej projekcji wstecznej (FBP) s s y l F 1 n s y (x,y) p(,s) x l F -1 [ n s P(, n s )] F 1-1 n s P(, n s ) iltr n s P(, n s ) rec (x,y) x (x,y) projekcja wsteczna, sumowanie 2 0 F 1 1 n n, ) P( d

Metody rekonstrukcji tomograicznej obrazów analityczne Filtrowana projekcja wsteczna (FBP) algebraiczne dyskretne statystyczne iteracyjne

Dyskretyzacja problem liniowy Problem: g d g H Zmierzone Macierz Rozkład projekcje (dane) systemu aktywności (niewiadoma) Układ równań liniowych i g d h id prawdopodobieństwo detekcji otonu z voksela i obiektu w pikselu d detektora N i1 d = 1,2,,D h di i Rozmiary obiektów: g: ~ 100x100x100 : ~ 100x100x100 H: ~ 10 6 x10 6

Problem liniowy metody algebraiczne g H g d N i1 h di i d = 1,2,,D Metody wprost szukanie macierzy H -1 niepraktyczne ze względu na rozmiar problemu Metody iteracyjne Metoda Kaczmarza/ART (algebraic reconstruction technique) rzuty ortogonalne na hiperpłaszczyzny ( n1) k ( n) k h dk g d N i1 N i1 h h di 2 di ( n) i

Metody algebraiczne Metody iteracyjne oparte na koncepcji POCS (projections onto convex sets) rzutów na zbiory wypukłe MART (multiplicative algebraic reconstruction technique) N i n i di i n k n k h g 1 ) ( ) ( 1) ( SIRT (simultaneous iterative reconstruction technique) D d N i di N i n i di i dk n k n k h h g h t 1 1 2 1 ) ( ) ( 1) ( t parametr relaksacji

Metody algebraiczne g d N i1 h di i d = 1,2,,D Problemy: Rozwiązanie niejednoznaczne (nieskończenie wiele rozwiązań) lub (najczęściej) brak ścisłych rozwiązań: układ niekonsystentny (sprzeczny) z powodu szumu statystycznego Zależność od początkowej estymacji (0)

Metody statystyczne Problem estymacji: g H Próba statystyczna (wektor losowy) Macierz systemu (dana stała) Parametry modelu (zmienna szukana) Znaleźć wektor parametrów ˆ - estymator, który najlepiej pasuje do zmierzonej próby losowej g Metody (kryteria) wyznaczania estymatorów: Metoda momentów Metoda najmniejszych kwadratów ˆ : ˆ g d N h i1 arg min di D d 1 ˆ i g E[ g d d N ] i1 h di i 2 Metoda największej wiarygodności (maximum likelihood ML) ˆ arg max P( g; )

Metody statystyczne Problem estymacji: g H Próba statystyczna (wektor losowy) Macierz systemu (dana stała) Parametry modelu (zmienna szukana) Znaleźć wektor parametrów ˆ - estymator, który najlepiej pasuje do zmierzonej próby losowej g Metody (kryteria) wyznaczania estymatorów: Metoda momentów Metoda najmniejszych kwadratów ˆ : ˆ g d N h i1 arg min di D d 1 ˆ i g E[ g d d N ] i1 h di i 2 FBP, ART WLS Metoda największej wiarygodności (maximum likelihood ML) ˆ arg max P( g; ) MLEM

Pożądane cechy estymatorów: Metody statystyczne nieobciążoność zgodność ˆ E[ˆ] g d ^ 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 g eektywność e(ˆ) var( ˆ max var( ˆ) e ) 1 Twierdzenie (nierówność) Cramera-Rao: Wariancja dowolnego estymatora nieobciążonego var( ˆ ) i 1 ln P( g, E i i ) 1 I( var( ˆ i ) 2 max e i ˆ spełnia nierówność: Estymator maksymalnej wiarygodności jest estymatorem nieobciążonym, zgodnym, o maksymalnej eektywności ) I() inormacja Fishera

Statystyka rozpadów promieniotwórczych g d Średnia liczba zliczeń w pikselu d detektora: N g d = h di i i=1 Rozkład Poissona prawdopodobieństwa zliczeń : i Funkcja wiarygodności : Pr(g; ) = = Pr(g d ; g d ) = g d g d exp ( g d ) g d! D d=1 N i=1 D d=1 h di i g d g d exp ( gd ) g d! g d exp ( g d! N i=1 hdi i ) ˆ arg max P( g; ) MLEM

Metoda ML-EM Jak obliczyć estymator maksymalnej wiarygodności? Algorytm EM (expectation maximisation): (Dempster, Laird, Rubin 1977) Estymacja na podstawie niekompletnych danych statystycznych krok E: s di liczba otonów wyemitowanych z voksela i zarejestrowanych w pikselu d detektora dane kompletne Oblicz wartość oczekiwaną unkcji wiarygodności: krok M: Kolejną estymację wybierz jako: ˆ ( n1) arg max E[ Można pokazać, że algorytm EM zwiększa unkcję wiarygodności w każdym kroku, tzn. P( g; ˆ ) P( g; ˆ ( n1) ( n) N g i s di E[ i1 ln( P( s; ) s g; ˆ ( n) ) ] s g; ˆ E[ s ] h di ln( P( s; ) ( n) ] di i

Metoda ML-EM Zastosowanie do statystyki zliczeń w tomograii emisyjnej: Model Poissona rozkładu zliczeń: N g d s di i1 E[ s ] h di di i Pr( s; ) N D N D sdi di Pr( sdi; ) i1 d 1 i1 d 1 sdi! E[ s ] exp( E[ s di ]) krok E: Oblicz wartość oczekiwaną unkcji wiarygodności: E[ ln( P( s; ) s g; ˆ ( n) ] krok M: Kolejną estymację wybierz jako: ˆ ( n1) arg max E[ s g; ˆ ln( P( s; ) ( n) ]

Metoda ML-EM Rozwiązanie - wzór iteracyjny: ( n1) ( n) 1 k k D d 1 h dk D d 1 h dk N j1 h g dj d ( n) j Nowa estymacja obrazu Poprzednia estymacja obrazu 1 Norma Zmierzona projekcja Estymowana projekcja Średnia ważona po wszystkich projekcjach

Rekonstrukcja iteracyjna ML-EM Obraz początkowy n-ta estymacja Projekcje estymacji Projekcja nie Zbieżność? Projekcja wsteczna Porównanie N j1 h g dj d ( n) j tak Obraz zrekonstruowany Zmierzone projekcje

Rekonstrukcja iteracyjna ML-EM Iteracje: 1 2 3 5 10 20 50 Funkcja wiarygodności: Pr( g; ˆ ( n) ) E[ g D ] d 1 Pr( g D gd d d 1 gd! d ; ˆ exp( E[ g ( n) d ]) ) log[pr(g )] -1.0E+06-1.5E+06-2.0E+06 0 10 20 30 40 50 E[ g d ] N i1 h di n ˆ ( ) i -2.5E+06 iteracja

MLEM vs FBP analityczne Filtrowana projekcja wsteczna (FBP) oparta na transormacji Fouriera liniowa szybka zakłada uproszczony model izyczny arteakty prążkowe przy małej liczbie zliczeń statystyczne (iteracyjne) Metoda ML-EM uwzględnia statystyczny charakter zmierzonych danych pozwala uwzględnić dokładny model izyczny znacznie lepsza jakość obrazu mniejszy szum nieliniowa Wolna; wymaga dużej mocy obliczeniowej

MLEM vs FBP FBP MLEM FBP + iltr MLEM + iltr 30 min 9 iter. 25 iter. 5 min