PCR w czasie rzeczywistym (Real Time PCR) qpcr (PCR ilościowy) (Quantitative PCR)
|
|
|
- Martyna Wrona
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 PCR w czasie rzeczywistym (Real Time PCR) czyli qpcr (PCR ilościowy) (Quantitative PCR) Michał Koper, IGiB UW
2 Pionierskie prace o qpcr (zwanym także kinetycznym PCR) Higuchi R., Dollinger G., Walsh P.S., Griffith R. (1992). Simultaneous amplification and detection of specific DNA sequences. Biotechnology 10: Higuchi R., Fockler C., Dollinger G., Watson R. (1993). Kinetic PCR analysis: real-time monitoring of DNA amplification reactions. Biotechnology 11:
3 Zastosowania qpcr: Badanie ekspresji genów (RT-qPCR) Wykrywanie kwasów nukleinowych patogenów: wykrywanie obecności i określanie stężenia wirusów i bakterii w surowicy Genotypowanie: analizy SNP lub HRM Wykrywanie GMO w paszach i żywności
4 qpcr oparty jest o detekcję przyrostu ilości produktu PCR w czasie Metoda wyznacza stężenie DNA dla każdego cyklu reakcji, wykorzystująca fluorescencję Barwniki fluorescencyjne wiążące dsdna lub sprzęgnięte z sondami hybrydyzującymi z wybraną nicią badanego amplikonu Wymaga układu wzbudzającego: lampa halogenowa, układ LED lub laser Wymaga układu detekcji: oddzielne elementy CCD, matryca CCD lub układy fotopowielacza
5 Przykłady cyklerów qpcr Roche LightCycler 480 QIAGEN Rotor-Gene Q BioRad CFX96/ CFX384 Appliedbiosystems 7900HT
6 Schemat aparatu qpcr 1. halogen tungsten lamp 2b. emission filters 3. intensifier 5. ccd detector 350,000 pixels 2a. excitation filters 4. sample plate
7 Sposoby detekcji produktów w qpcr
8 Barwniki wiążące DNA: SYBR Green Należy do barwników cyjaninowych (zawierających pierścienie heterocykliczne z wiązaniami C=) Wiąże dsdna, słabo ssdna Wzbudzany światłem niebieskim (λmax = 488 nm) SYBR Green I, za: Wikipedia Emituje światło zielone (λmax = 522 nm)
9 SYBR Green Wykrywa wszelkie dsdna Wykrywanie na etapie ELONGACJI Startery nie mogą tworzyć DIMERÓW Wielkość produktu najlepiej w przedziale bp Wielkość wykrywanych produktów dla różnych genów musi być BARDZO ZBLIŻONA Umożliwia analizę KRZYWYCH TOPNIENIA Metoda NAJTAŃSZA
10 Projektowanie starterów do qpcr Długość ampkikonu najlepiej mniej niż 150 bp Unikać komplementarności sekwencji w obrębie startera lub pomiędzy starterami = primer dimer Unikać niesparowanych zasad Najlepiej G lub C na 3 końcu, nigdy T Długość starterów nt Zawartość GC 40-60% Tm = (A+T)x2 C + (G+C)x4 C Stosować przynajmniej 2 programy i porównywać wyniki!!!
11 Sondy hybrydyzacyjne
12 Sondy TaqMan - hydrolizowane DNA Pol Exo +!!! ABI, Roche (UPL)
13 Zasady projektowania sond TaqMan Krótkie ampkikony: bp Tm sondy = C Zawartość GC 30-60% Nigdy G na 5 końcu, (naturalny wygaszacz) Długość sond maks. 30 nt Unikać ciągów identycznych zasad Unikać struktur II-rzędowych Unikać komplementarności ze starterami Wybierać nić z większą zawartością C
14 Złożony qpcr (ang. multiplex ) Różne formaty detekcji i różne barwniki pozwalją na wykrywanie więcej jak 1 produktu w pojedynczej reakcji (po za SYBR Green!!!)
15 Określanie ilości RNA
16 Klasyczna technika northern-blot control expt target gene internal control gene actin, GAPDH, RPLP0 etc Corrected fold increase = 10/2 = 5 Ratio target gene in experimental/control = fold change in target gene fold change in reference gene Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
17 Teoretyczne podstawy qpcr
18 CYCLE NUMBER AMOUNT OF DNA , , , , , , , , , , ,048, ,097, ,194, ,388, ,777, ,554, ,108, ,217, ,435, ,870, ,073,741, ,400,000, ,500,000, ,550,000, ,580,000,000 AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA Krzywa teoretyczna PCR CYCLE NUMBER Przekształcona w skali logarytmicznej PCR CYCLE NUMBER Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
19 4 fazy reakcji qpcr 1 faza: fluorescencja na poziomie tła, reakcja zachodzi wykładniczo ale nie możliwa detekcja 2 faza: przyrost wykładniczy możliwy do wykrycia, fluorescencja powyżej tła 3 faza: stromy przyrost fluorescencji pozwala wykryć, że reakcja zachodzi liniowo 4 faza plateau: załamania i wysycenia reakcji M. W. Pfaffl: Quantification strategies in real-time PCR w A-Z of quantitative PCR (Edytor: S.A. Bustin)
20 AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA PCR CYCLE NUMBER PCR CYCLE NUMBER Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
21 AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA PCR CYCLE NUMBER PCR CYCLE NUMBER Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
22 Reakcja liniowa w przedziale ~20 do ~1500 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
23 Reakcja liniowa w przedziale ~20 do ~1500 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
24 SERIES OF 10-FOLD DILUTIONS Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
25 threshold Ct SERIES OF 10-FOLD DILUTIONS Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
26 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine threshold = 300
27 threshold SERIES OF 10-FOLD DILUTIONS 15 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
28 Czułość i powtarzalność reakcji qpcr vs semi-qpcr Zakres dynamiczny: do 9 rzędów wielkośći (10 9 ) w qpcr a w półilościowym-pcr najwyżej 2 (10 2 ) Warinacje wewnątrz eksperymentu qpcr- do kilku % a w semi-qpcr do 30-40% Warinacje pomiędzy eksperymentami qpcr- do kilkunastu % a w semi-qpcr do 50-70% Poziom detekcji w qpcr: ok. 10 cząsteczek przy powtarzalności 50% i ok. 100 przy powtarzalności 100%. M. W. Pfaffl: Quantification strategies in real-time PCR w A-Z of quantitative PCR (Edytor: S.A. Bustin)
29 Różne algorytmy dla określenia wartość cyklu przegięcia (odcięcia; oznaczenia) Ct = Cp = Cq Threshold cycle odcięcia; progowy Maksimum 2-giej pochodnej (Roche) Quantification cycle oznaczenia ilościowego
30 Dwie metody kwantyfikacji ABSOLUT QUANTIFICATION czyli metoda krzywych standardowych RELATIVE QUANTIFICATION Obie metody są w istocie proporcjonalne!
31 Metoda krzywych standardowych
32 dilutions target DNA triplicates cdna target primers dilutions reference DNA triplicates cdna reference primers Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
33 copy number target gene control copy number target gene experimental Dilution curve target gene NORTHERN control expt target gene fold change in target gene= copy number experimental copy number control internal control gene actin, GAPDH, RPLP0 etc Ratio experimental/control = fold change in target gene fold change in reference gene 4 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
34 copy number reference gene experimental Dilution curve reference gene copy number reference gene control NORTHERN control expt target gene internal control gene actin, GAPDH, RPLP0 etc Ratio experimental/control = fold change in target gene fold change in reference gene Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
35 Znajomość wydajności reakcji PCR jest kluczowa
36 CYCLE AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA 100% EFFICIENCY 90% EFFICIENCY 80% EFFICIENCY 70% EFFICIENCY , ,048 1, ,096 2,213 1, ,192 4,205 2, ,384 7,990 3,748 1, ,768 15,181 6,747 2, ,536 28,844 12,144 4, ,072 54,804 21,859 8, , ,127 39,346 14, , ,842 70,824 23, ,048, , ,482 40, ,097, , ,468 69, ,194,304 1,356, , , ,388,608 2,578, , , ,777,216 4,898,763 1,338, , ,554,432 9,307,650 2,408, , ,108,864 17,684,534 4,335, , ,217,728 33,600,615 7,804,726 1,667, ,435,456 63,841,168 14,048,506 2,835, ,870, ,298,220 25,287,311 4,819, ,073,741, ,466,618 45,517,160 8,193,466 AFTER 1 CYCLE 100% = 2.00x 90% = 1.90x 80% = 1.80x 70% = 1.70x Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
37 CYCLE AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA 100% EFFICIENCY 90% EFFICIENCY 80% EFFICIENCY 70% EFFICIENCY , ,048 1, ,096 2,213 1, ,192 4,205 2, ,384 7,990 3,748 1, ,768 15,181 6,747 2, ,536 28,844 12,144 4, ,072 54,804 21,859 8, , ,127 39,346 14, , ,842 70,824 23, ,048, , ,482 40, ,097, , ,468 69, ,194,304 1,356, , , ,388,608 2,578, , , ,777,216 4,898,763 1,338, , ,554,432 9,307,650 2,408, , ,108,864 17,684,534 4,335, , ,217,728 33,600,615 7,804,726 1,667, ,435,456 63,841,168 14,048,506 2,835, ,870, ,298,220 25,287,311 4,819, ,073,741, ,466,618 45,517,160 8,193,466 AFTER 1 CYCLE 100% = 2.00x 90% = 1.90x 80% = 1.80x 70% = 1.70x AFTER N CYCLES: fold increase = (efficiency) n Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
38 CYCLE AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA AMOUNT OF DNA 100% EFFICIENCY 90% EFFICIENCY 80% EFFICIENCY 70% EFFICIENCY , ,048 1, ,096 2,213 1, ,192 4,205 2, ,384 7,990 3,748 1, ,768 15,181 6,747 2, ,536 28,844 12,144 4, ,072 54,804 21,859 8, , ,127 39,346 14, , ,842 70,824 23, ,048, , ,482 40, ,097, , ,468 69, ,194,304 1,356, , , ,388,608 2,578, , , ,777,216 4,898,763 1,338, , ,554,432 9,307,650 2,408, , ,108,864 17,684,534 4,335, , ,217,728 33,600,615 7,804,726 1,667, ,435,456 63,841,168 14,048,506 2,835, ,870, ,298,220 25,287,311 4,819, ,073,741, ,466,618 45,517,160 8,193,466 AMOUNT OF DNA 1,200,000,000 1,000,000, ,000, ,000, ,000, ,000, ,000,000,000 1,000,000, ,000,000 10,000,000 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine AMOUNT OF DNA 1,000, ,000 10,000 1, % EFF 90% EFF 80% EFF 70% EFF PCR CYCLE NUMBER 100% EFF 90% EFF 80% EFF 70% EFF PCR CYCLE NUMBER
39 AMOUNT OF DNA 10,000,000,000 1,000,000, ,000,000 10,000,000 1,000, ,000 10,000 1, % EFF 90% EFF 80% EFF 70% EFF PCR CYCLE NUMBER Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
40 SERIES OF 10-FOLD DILUTIONS Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
41 threshold SERIES OF 10-FOLD DILUTIONS 15 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
42 Wyznaczanie wydajności reakcji qpcr 4 metody wyznaczania E qpcr: 1. Wyliczana z nachylenia krzywej wzorcowej (kalibracyjnej), często E zawyżone Możliwe dla każdej reakcji z osobna: 2. Wyliczana na podstawie historii przyrostu fluorescencji przy pomocy regresji liniowej metoda ręczna, często E zaniżone 3. Dopasowanie krzywej wg założonego modelu do wartości fluorescencji od 1 do ostatniego cyklu często E zaniżone 4. Wyliczana na podstawie wielomianowego dopasowania krzywej do danych fluorescencji tylko z 2 fazy qpcr wartości pośrednie M. W. Pfaffl: Quantification strategies in real-time PCR w A-Z of quantitative PCR (Edytor: S.A. Bustin)
43 Wyznaczanie wydajności reakcji qpcr na podstawie krzywych wzorcowych Seryjne rozcieńczenia, min. 5, lepiej 6 do 8 Za TATA Biocenter
44 Równanie reakcji qpcr N Ct = N 0 (1+E) Ct N Ct : ilość cząsteczek po Ct cyklach amplifikacji N 0 : początkowa ilość cząsteczek E: wydajność reakcji PCR Ct: wartość cyklu przegięcia
45 Metoda PFAFFLa czyli Realtive Quantification M.W. Pfaffl, Nucleic Acids Research, 2001, 29: NORTHERN target gene internal control gene actin, GAPDH, RPLP0 etc ratio = fold increase in target gene fold increase in reference gene Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine 4
46 triplicates cdna triplicates cdna target primers reference primers Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
47 IL1-b vit RPLP0 con RPLP0 vit IL1-b con Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
48 IL1-beta IL1-b vit av =18.03 av =29.63 IL1-b con AFTER N CYCLES: change = (efficiency) n AFTER N CYCLES: ratio vit/con = (1.93) = = 2053 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
49 RPLP0 RPLP0 con RPLP0 vit av =19.80 av =19.93 AFTER N CYCLES: change = (efficiency) n AFTER N CYCLES: ratio vit/con = (1.87) = = 1.08 Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
50 ratio = change in IL1-B = 2053/1.08 = 1901 change in RPLP0 ratio = (E target ) DCt target (control-treated) (E ref ) DCt ref (control-treated) Microbiology and Immunology On-line; University of South Carolina School of Medicine
51 Znajomość wydajności reakcji jest konieczna!
52 Znajomość wydajności reakcji jest konieczna!
53 Znajomość wydajności reakcji jest konieczna!
54 Błąd w reakcji qpcr akumuluje się wykładniczo!
55 Równanie mrna η wydajność RT E wydajność PCR CT wartość (cykl) Ct K RS względna czułość qpcr
56 Kwantyfikacja: 2 próby, 2 geny
57 garbage in, garbage out Real-time quantitative RT-PCR is a wonderful method for fast, accurate, sensitive and cost-effective gene expression analysis. However, the simplicity of the technology itself makes it vulnerable for abuse in experiments in which the operator does not perform the required quality control throughout the entire procedure. Derveaux S. et al., Methods 50 (2010)
58 RT-qPCR w praktyce
59 Jakość RNA to podstawa!!! Inkubacja z DNazą, 1h 37 C - + Jakość RNA = czystość + integralność Czystość oznaczana spektrofotometryczne (OD 260/230 >2,0; OD 260/280 >1,8) Konieczna kontrola jakości RNA po izolacji! Zawsze konieczne DNazowanie prób! 20% ludzkich genów posiada 1 egzon, lub występują eksprymowane retropseudogeny lub kopie pozbawione intronów!!! Zalecane stosowanie inhibitorów RNaz przy RT!
60 Ocena integralności RNA Test integralności końców 5-3 RNA Analizatory mikrocieczowe Biorad: Experion Agilent: Bioanalyzer Elektroforeza kapilarna
61 Jakość wpływa na wyniki!!! RIN: RNA Integrity Number, min. 7 (wg Bioanalyzer, Agilent Tech.) Becker C. et al., Methods 50 (2010)
62 Zawsze KONTROLE!!! Kontrole negatywne: -RT: kontrola kontaminacji DNA genomowym, konieczna! NTC: no template controle : kontrola czystości odczynników!!! Kontrola pozytywna: min. 2-3 próbki np. z krzywej standardowej kontrola wydajności reakcji! (IRC = ang. inter-run calibrators )
63 Dobra praktyka laboratoryjna TO PODSTAWA!!! Nie pipetować ręcznie mniej jak 2µl na raz! Oddzielne miejsce dla przygotowywania reakcji bez matrycy i oddzielne dla dodawania DNA! Rękawiczki bez talku! Składanie reakcji w MIXach a nie oddzielenie! Nie otwierać probówek/płytek po reakcji w pomieszczeniach do ich przygotowywania! Komory z przepływem laminarnym!
64 Podstawowa analiza reakcji qpcr
65 Krzywe amplifikacji surowe dane
66 Odjęcie linii podstawowej
67 1 qpcr = 3 powtórzenia reakcji!!! X
68 Inspekcja krzywych amplifikacji Gen badany
69 Inspekcja krzywych amplifikacji Gen referencyjny
70 Analiza krzywych topnienia Możliwa głównie dla SYBR Green
71 Analiza krzywych topnienia Tm wypadkowa długości i zawartości GC/AT
72 Analiza krzywych topnienia Czysty produkt qpcr
73 Analiza krzywych topnienia Problem primer-dimer
74 Analiza krzywych topnienia Problem niespecyficznych produktów
75 Analiza krzywych topnienia Nie wierzyć ślepo krzywym topnienia!! Dłuższy produkt bogaty w pary AT może mięć tą samą Tm co krótszy bogaty w GC!! Produkty dla każdej nowej pary starterów zawsze sprawdzić na wysokorozdzielczym żelu! Przynajmniej raz, na etapie ustawiania reakcj.
76 Standaryzacja
77 Wybór genu referencyjnego NIE ISTNIEJE DOSKONAŁY GEN REFERENCYJNY!!! Równa ilość kopii RNA we wszystkich komórkach Eksprymowany we wszystkich komórkach Eksprymowany na średnim poziomie Należy stosować przynajmniej 2 różne geny referencyjne! Lepiej 3 do nawet 5!!! Standaryzujemy względem średniej geometrycznej dla referencji. Geny należy wybrać EKSPERYMENTALNIE z większej grupy!! Vandesompele et al., Genome Biology, 2002,
78 Analiza statystyczna wariacji wartości Ct dla genów referencyjnych Vandesompele et al., Genome Biology, 2002,
79 Wybór genu referencyjnego Ewentaulanie Zaufać opublikowanym danym, np. dla komórek ludzkich: GAPDH, albumina, aktyny, tubuliny, cyklofilina, mikroglobuliny, 18S lub 28S rrna choć ryzykowne np. lub wykorzystać komercyjne panele starterów (możliwe tylko dla niektórych organizmów modelowych)
80 Projektowanie układu doświadczenia
81 Akumulacja błędu
82 2 schematy układu doświadczeń Metoda maksymalizacji prób : jak najwięcej różnych prób analizowanych w tej samej reakcji. Czyli różne geny analizowane w różnych reakcjach. (preferowana w rutynowej pracy badawczej) Metoda maksymalizacji genów : jak najwięcej różnych par starterów w jednej reakcji. (preferowana w komercyjnych zestawach diagnostycznych) Bez względu na wybór metody należy stosować IRC Hellemans et al., Genome Biology, 2007,
83 Ile powtórzeń biologicznych, RT, qpcr?
84 Najbardziej kluczowym elementem qpcr jest reakcja odwrotnej transkrypcji!!!
85 Przykłady zastosowania w badaniu ekspresji genów
86 Actin QPCR Za: David Barras m2_f L_F I_F E_F L_R I_R (m2_r) m_r E_R I_F E_F I_R m_r E_R L_F L_R E_F E_R m2_f E_F L_F m_r E_R L_R
87 Należy trzymac się standardów!!!
88 Optymalizacja reakcji qpcr
89 Optymalizacja reakcji qpcr Optymalizacja warunków reakcji: stężeń dntp, Mg 2+, starterów, SYBR Green obecnie trudna bo większość mix ów jest gotowa do użycia i 2X stężona. Optymalizacja programu: temperatury i czasu przyłączania starterów i syntezy. PCR 4-stopniowy (pomiar fluorescencji SYBR Green pow. Tm dla produktu) lub 2-stopniowy (tylko 95 i 72 C wspólna temp. przyłączania starterów i syntezy) PCR touch-down, Taq Pol typu hot-start Najszybciej optymalizować przez przeprojektowanie oligonukletodów
90 RÓŻNICA Tm STARTERÓW: PRZEWIDZIANA A WYZNACZONA DOŚWIADCZALNIE
91 Ciekawostki qpcr
92 Sondy QuantiProbe MGB (Minor Groove Binder) tripeptyd zwiększający siłę wiązania, stabilność i zapobiegający hydrolizie sondy QIAGEN
93 Sondy FRET FRET: ang. fluorescence resonance energy transfer
94 Sondy Molecular Beacon
95 Immuno-qPCR Za: M. Niemeyer; qpcr 2007
96 qpcr z zawartości pojedynczej komórki Bengtsson M, Stahlberg A, Rorsman P, Kubista M. Genome Res Oct;15(10):
97 Analiza wysokorozdzielczych krzywych topnienia Za Roche
98 Analiza HRM = High Resolution Melting Zamiast SYBR Green barwniki SATURUJĄCE DNA!!! Rozdzielczość do 50 pomiarów / 1ºC Amplikony różnej długości Wydajność nie ma znaczenia: analiza end-point! Standaryzacja stężeń matrycy mniej istotna
99 Analiza HRM = High Resolution Melting
100 Metylacja DNA wycisza transkrypcję
101 Traktowanie DNA dwusiarczkiem sodu Dwusiarczek sodu zmienia CYTOZYNĘ w URACYL Nie modyfikuje metylowanej CYTOZYNY Wady: - niewydajna konwersja - degradacja DNA
102 Traktowanie DNA dwusiarczkiem sodu Za: Wikipedia, Bisulfite sequencing
103 Analizy Met-DNA Za: Wikipedia, Bisulfite sequencing
104 Analizy Met-DNA Za: Wikipedia, Bisulfite sequencing
105 Analiza statusu metylacji za pomocą wysokorozdzielczych krzywych topnienia czyli MS-HRM
106
107 PODSUMOWANIE qpcr to bardzo wydajna, szybka i dokładna metoda kwantyfikacji kwasów nukleinowych Umożliwia nisko i średnioprzepustowe badania ekspresji genów Oparta o detekcje DNA barwnikami fluorescyncyjnymi w czasie rzeczywistym reakcji (1+E) n, czyli 2 n jeżeli E=100% (2 DDCt ) Bardzo istotona kontrola jakosci wykonania i poprawne zaprojektowanie eksperymentu!!!
108 Dziękuje za uwagę
PCR w czasie rzeczywistym (Real Time PCR) qpcr (PCR ilościowy) (Quantitative PCR)
PCR w czasie rzeczywistym (Real Time PCR) czyli qpcr (PCR ilościowy) (Quantitative PCR) Michał Koper, IGiB UW Pionierskie prace o qpcr (zwanym także kinetycznym PCR) Higuchi R., Dollinger G., Walsh P.S.,
PCR w czasie rzeczywistym (Real Time PCR) qpcr (PCR ilościowy) (Quantitative PCR)
PCR w czasie rzeczywistym (Real Time PCR) czyli qpcr (PCR ilościowy) (Quantitative PCR) Michał Koper, IGiB UW Pionierskie prace o qpcr (zwanym także kinetycznym PCR) Higuchi R., Dollinger G., Walsh P.S.,
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Kolokwium (14pkt) Część II Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
WYBRANE RODZAJE REAKCJI PCR. RAPD PCR Nested PCR Multipleks PCR Allelo-specyficzny PCR Real Time PCR
RAPD PR Nested PR Allelo-specyficzny PR Real Time PR RAPD PR (Random Amplification of Polymorphic DNA) wykorzystywany gdy nie znamy sekwencji starterów; pozwala namnożyć losowe fragmenty o różnej długości;
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym
Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym Rynek aparatury laboratoryjnej pęka w szwach od ilości różnych aparatów przeznaczonych
Pakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time PCR część 67
Pakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time część 7 L.p. Przedmiot zamówienia Wymagania jakościowe Producent i nr katalogowy dla produktu równowaŝnego Ilość
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6
RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie
Ilość TAK TAK TAK TAK TAK TAK
Postępowanie WB.2420.6.2013.NG ZAŁĄCZNIK NR 5 L.p. Nazwa asortymentu parametry techniczne Ilość Nazwa wyrobu, nazwa producenta, określenie marki, modelu, znaku towarowego Cena jednostkowa netto (zł) Wartość
TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Parametr Wymagany parametr Oferowany parametr 1. 2. 3. a) z wbudowaną pompą membranową PTEE, b) kondensorem par, System
Załącznik nr 1A do SIWZ. PARAMETRY TECHNICZNE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Zadanie nr 1. TERMOSTAT CYRKULACYJNY Termostat cyrkulacyjny Z grzaniem i chłodzeniem Zakres temperatury roboczej 25 o C do + 200 o C
AmpliTest TBEV (Real Time PCR)
AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
Projektowanie reakcji multiplex- PCR
Projektowanie reakcji multiplex- PCR Dzięki nowoczesnym, wydajnym zestawom do PCR, amplifikacja DNA nie jest już takim wyzwaniem, jak w latach 80-tych i 90-tych. Wraz z poprawą metodyki, pojawiły się ciekawe
PCR w czasie rzeczywistym. Metody analizy danych
PRACE PRZEGLĄDOWE PCR w czasie rzeczywistym. Metody analizy danych Jarosław Tyburski^ Anna Studzińska^ Patrycja Daca^, Andrzej Tretyn ^Zakład Biotechnologii, Instytut Biologii Ogólnej i Molekularnej, Uniwersytet
OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Zadanie 1 - ZAMRAŻARKA LABORATORYJNA Z ZABEZPIECZENIEM ANTYISKROWYM szt. 1 Pojemność brutto/ netto 310/284L +/-3% Wymiary zewn. w mm. ( SxGxW) 600/615/1840 +/-3% Wymiary wewn.
Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
Przetarg nieograniczony na zakup specjalistycznej aparatury laboratoryjnej Znak sprawy: DZ-2501/280/18
CZĘŚĆ 1: aparat do real time PCR - 1 SZT Określenie przedmiotu zamówienia zgodnie ze Wspólnym Słownikiem Zamówień (CPV): 38500000-0 aparatura kontrolna i badawcza Nazwa urządzenia: Model, typ aparatu,
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
AmpliTest BVDV (Real Time PCR)
AmpliTest BVDV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla wirusa BVD (Bovine Viral Diarrhea Virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Ampli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji
AmpliQ 5x HOT EvaGreen HRM Mix (ROX)
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com AmpliQ 5x HOT EvaGreen HRM Mix (ROX) Gotowy premix zawierający
Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKNIA RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji DNA z surowego materiału
ZZ/480/008/D/15 Gdańsk, dnia OGŁOSZENIE O UDZIELANYM ZAMÓWIENIU
ZZ/480/008/D/15 Gdańsk, dnia 23.02.2015 OGŁOSZENIE O UDZIELANYM ZAMÓWIENIU 1. Politechnika Gdańska Wydział Chemiczny na podstawie art.4.8a ustawy z dnia 29 stycznia 2004r. Prawo zamówień publicznych (Dz.
Platforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification
1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym
Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
Laboratorium Wirusologiczne
Laboratorium Wirusologiczne Krzysztof Pyrd Pracownia wirusologiczna: Powstanie i wyposażenie całkowicie nowego laboratorium w ramach Zakładu Mikrobiologii WBBiB Profil: laboratorium molekularno-komórkowe
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
OGŁOSZENIE Zapytanie ofertowe nr 25
Dąbrowa Górnicza, 09.08.2018r. Zamawiający: CENTRUM DIAGNOSTYKI LABORATORYJNEJ TOMASZ WIELKOSZYŃSKI I MARCIN FURMAŃSKI SPÓŁKA JAWNA 41-300 Dąbrowa Górnicza, ul. Aleja Józefa Piłsudskiego 10 NIP: 6292477745
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKOWANIA JEDNOSTK OWA VAT % RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji
Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
Prowadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II)
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią ============================================================================
Adres strony internetowej, na której Zamawiający udostępnia Specyfikację Istotnych Warunków Zamówienia: www.imp.sosnowiec.pl
Page 1 of 6 Adres strony internetowej, na której Zamawiający udostępnia Specyfikację Istotnych Warunków Zamówienia: www.imp.sosnowiec.pl Sosnowiec: Dostawa aparatu do przeprowadzania ilościowej reakcji
Polska-Łódź: Maszyny i aparatura badawcza i pomiarowa 2013/S
1/5 Niniejsze ogłoszenie w witrynie TED: http://ted.europa.eu/udl?uri=ted:notice:387751-2013:text:pl:html Polska-Łódź: Maszyny i aparatura badawcza i pomiarowa 2013/S 223-387751 Instytut Medycyny Pracy
Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA
Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA 1. Metoda chemicznej degradacji DNA (metoda Maxama i Gilberta 1977) 2. Metoda terminacji syntezy łańcucha DNA - klasyczna metoda Sangera (Sanger
Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
AmpliQ 5x HOT EvaGreen qpcr Mix Plus (ROX)
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com AmpliQ 5x HOT EvaGreen qpcr Mix Plus (ROX) Gotowy premix zawierający
Instrukcja ćwiczeń Biologia molekularna dla II roku Analityki Medycznej. Reakcja odwrotnej transkrypcji. Projektowanie starterów do reakcji PCR.
INSTRUKCJA Ćwiczenie nr 5 Odczynniki: Sprzęt: 1. 5xNG cdna Buffer 2. 50 µm oligo(dt)20 3. NG dart RT mix l 4. Probówki typu Eppendorf 0,2 ml 5. Woda wolna od RNaz 6. Lód 1. Miniwirówka 2. Termocykler 3.
Metody badania ekspresji genów
Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego
(wypełnia Wykonawca) (wypełnia Wykonawca) (wypełnia Wykonawca)
Załącznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/192/18 CZĘŚĆ 1: TERMOCYKLER DO REAL-TIME PCR, ILOŚĆ: 1 SZT Określenie przedmiotu zamówienia zgodnie ze Wspólnym Słownikiem Zamówień (CPV): 38500000-0 aparatura kontrolna
PL 208956 B1. Sposób wykrywania i różnicowania chorób należących do grupy hemoglobinopatii, zwłaszcza talasemii
RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 208956 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 381219 (22) Data zgłoszenia: 05.12.2006 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01)
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
Zestawy do izolacji DNA i RNA
Syngen kolumienki.pl Gotowe zestawy do izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych Zestawy do izolacji DNA i RNA Katalog produktów 2012-13 kolumienki.pl Syngen Biotech Sp. z o.o., 54-116 Wrocław, ul. Ostródzka
Inżynieria Genetyczna ćw. 3
Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
PCR - ang. polymerase chain reaction
PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu
The best custom qpcr assay development service in the World. Kontrola jakości: Certyfikaty ISO9001:2008, ISO 13485:2003 & EN ISO 13485:2012
The best custom qpcr assay development service in the World PrimerDesign Ltd The Mill Yard, Nursling Street Southampton, United Kingdom http://www.primerdesign.co.uk Kontrola jakości: Certyfikaty ISO9001:2008,
TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
Lista produktów / BLIRT S.A. wyłączny dytrybutor BIOLINE Ltd. w Polsce
Lista produktów / 2018 BLIRT S.A. wyłączny dytrybutor BIOLINE Ltd. w Polsce 2 3 CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE / 2018 SPIS PRODUKTÓW Master Mixy Real-Time PCR 4 Master Mixy Real-Time PCR 4 Jednoetapowe zestawy
ODCZYNNIKI DO BIOLOGII MOLEKULARNEJ
www.cytogen.com.pl ODCZYNNIKI DO BIOLOGII MOLEKULARNEJ 3 Spis treści 4 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 22 22 Stabilność technologii TAG Specifikacja qpcr Mix-ów Kompatybilność kitów qpcr
Ampli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
KŁOPOTY Z POLIMERAZĄ KŁOPOTY Z POLIMERAZĄ KŁOPOTY Z POLIMERAZĄ. SPECYFICZNOŚĆ (Specificity)
- Specyficzność (specyficzne wiązanie się TYLKO do startera- wcześniej związanego z matrycą) - Termostabilność (utrzymanie aktywności pomimo powtarzającego się cyklicznie wzrostu temperatury) - Wierność
Polska-Łódź: Aparatura do analizowania 2013/S
1/6 Niniejsze ogłoszenie w witrynie TED: http://ted.europa.eu/udl?uri=ted:notice:341594-2013:text:pl:html Polska-Łódź: Aparatura do analizowania 2013/S 198-341594 Instytut Medycyny Pracy im. prof. dra
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE WSTĘP 1. Mikromacierze ekspresyjne tworzenie macierzy przykłady zastosowań 2. Mikromacierze SNP tworzenie macierzy przykłady zastosowań MIKROMACIERZE EKSPRESYJNE
Zadanie 19. Wyposażenie stanowiska do namnażania fragmentów DNA w czasie rzeczywistym
Zadanie 19. Wyposażenie stanowiska do namnażania fragmentów DNA w czasie rzeczywistym Termin realizacji 12 tygodni od daty podpisania (zawarcia) umowy. Koszty transportu, instalacji oraz instruktażu, trwającego
SPECYFIKACJA WYMAGAŃ UŻYTKOWNIKA URZĄDZENIA (URS) System do reakcji łańcuchowej polimerazy w czasie rzeczywistym PCR (Propozycja zakupu)
Str.1/9 1. Wstęp (system do Real-Time PCR) dla potrzeb Centrum Badawczo-Rozwojowego Produktów Biotechnologicznych w IBSS S.A. tworzonego w ramach projektu: Utworzenie Centrum Badawczo-Rozwojowego Produktów
CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2015
RNA PROBE RNA SYBR DNA PROBE DNA SYBR CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2015 MASTER MIXY REAL-TIME PCR MASTER MIXY REAL-TIME PCR Najnowszej Generacji SensiFAST SYBR No-ROX m.in. SmartCycler (Cepheid), Rotor-Gene
Przetarg nieograniczony na zakup specjalistycznej aparatury laboratoryjnej Znak sprawy: DZ-2501/280/18
CZĘŚĆ 1: aparat do real time PCR - 1 SZT Określenie przedmiotu zamówienia zgodnie ze Wspólnym Słownikiem Zamówień (CPV): 38500000-0 aparatura kontrolna i badawcza Nazwa urządzenia: Model, typ aparatu,
GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu
GENOMIKA FUNKCJONALNA Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu Adnotacja (ang. annotation) pierwszy etap po uzyskaniu kompletnej sekwencji nukleotydyowej genomu analiza bioinformatyczna
DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko
DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko Mini-słowniczek SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - zmienność sekwencji DNA; HET - analiza heterodupleksów; HPLC
GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu
GENOMIKA FUNKCJONALNA Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu Adnotacja (ang. annotation) pierwszy etap po uzyskaniu kompletnej sekwencji nukleotydyowej genomu analiza bioinformatyczna
OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
Załącznik nr 1 Znak sprawy DG-2501/9989/821/09 OPIS PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA Zadanie nr 1 cieplarka laboratoryjna szt. 1 budowa Wymiary i pojemność Wentylacja i kontrola pracy Zakres temperatur pracy - Wnętrze
GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu
GENOMIKA FUNKCJONALNA Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu Adnotacja (ang. annotation) pierwszy etap po uzyskaniu kompletnej sekwencji nukleotydyowej genomu analiza bioinformatyczna
Zastosowanie transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET) w ilościowej metodzie oznaczania ekspresji genów na przykładzie sondy TaqMan
Anna KOZIOROWSKA, Maria ROMEROWICZ-MISIELAK Uniwersytet Rzeszowski, Polska Zastosowanie transferu energii rezonansu fluorescencji (FRET) w ilościowej metodzie oznaczania ekspresji genów na przykładzie
Załacznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/157/15/1 FORMULARZ OPISU PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA - FORMULARZ CENOWY lp. nazwa jedn. miary. wartość netto.
Załacznik nr 1, znak sprawy DZ-2501/157/15/1 FORMULARZ OPISU PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA - FORMULARZ CENOWY lp. nazwa jedn. miary maks. ilość min. ilość nr katalogowy/ okres gwarancji Zadanie 12.2.5 Polimerazy/odwrotne
Ana n l a i l za z a i ns n tru r men e t n al a n l a
Analiza instrumentalna rok akademicki 2014/2015 wykład: prof. dr hab. Ewa Bulska prof. dr hab. Agata Michalska Maksymiuk pracownia: dr Marcin Wojciechowski Slide 1 Analiza_Instrumentalna: 2014/2015 Analiza
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2015-2021 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej
ZAPYTANIE OFERTOWE. Huta Krzeszowska r. Dotyczy: PCR real time (znak sprawy: AS/9/7/2018).
Huta Krzeszowska 24.07.2018 r. ZAPYTANIE OFERTOWE Dotyczy: PCR real time (znak sprawy: AS/9/7/2018). 1. Tryb udzielenia zamówienia: Zamówienie udzielane w trybie zapytania ofertowego na podstawie art.
Color Compensation Set (FAM, HEX, Texas Red, Cy5)
Color Compensation Set (FAM, HEX, Texas Red, Cy5) Zestaw do wykonania kompensacji kolorów na urządzeniach LightCycler 480 System I/II Nr kat.: OTH02 Wielkość zestawu: 2 procedury kompensacji koloru Objętość
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Przetarg nieograniczony na zakup specjalistycznej aparatury laboratoryjnej Znak sprawy: DZ-2501/6/17
Część nr 2: SEKWENATOR NASTĘPNEJ GENERACJI Z ZESTAWEM DEDYKOWANYCH ODCZYNNIKÓW Określenie przedmiotu zamówienia zgodnie ze Wspólnym Słownikiem Zamówień (CPV): 38500000-0 aparatura kontrolna i badawcza
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII Opracowanie zestawu do wykrywania DNA Aspergillus flavus za pomocą specjalistycznego sprzętu medycznego. Jednym
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 10 Wykrywanie GMO metodą ilościowego PCR F. Weighardt WORLD HEALTH ORGANIZATION REGIONAL OFFICE FOR EUROPE ORGANISATION
Mikroskopia konfokalna: techniki obrazowania i komputerowa analiza danych.
Mikroskopia konfokalna: techniki obrazowania i komputerowa analiza danych. Pracownia Mikroskopii Konfokalnej Instytut Biologii Doświadczalnej PAN Jarosław Korczyński, Artur Wolny Spis treści: Co w konfokalu
Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP
2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych
ZAPYTANIE OFERTOWE nr 18/2019/G/CELONKO z dnia dla firmy CELON PHARMA SA z siedzibą w Kiełpinie.
ZAPYTANIE OFERTOWE nr 8/209/G/CELONKO z dnia 20.05.209 dla firmy CELON PHARMA SA z siedzibą w Kiełpinie. W ramach STRATEGICZNEGO PROGRAMU BADAŃ NAUKOWYCH I PRAC ROZWOJOWYCH PROFILAKTYKA I LECZENIE CHORÓB
Spektrofotometryczna analiza jakościowa i ilościowa DNA i RNA za pomocą urządzenia NanoDrop protokół
Spektrofotometryczna analiza jakościowa i ilościowa DNA i RNA za pomocą urządzenia NanoDrop protokół Wiele laboratoriów ma problem z izolacją RNA. Ten wstępny etap może zaważyć na powodzeniu lub klęsce
JAK WYZNACZA SIĘ PARAMETRY WALIDACYJNE
JAK WYZNACZA SIĘ PARAMETRY WALIDACYJNE 1 Granica wykrywalności i granica oznaczalności Dr inż. Piotr KONIECZKA Katedra Chemii Analitycznej Wydział Chemiczny Politechnika Gdańska ul. G. Narutowicza 11/12
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Kolokwium (14pkt) Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
* PROMOCJA 25% OFF NA WSZYSTKIE ZESTAWY SensiFAST DO KOŃCA 2014 ROKU
RNA PROBE RNA SYBR DNA PROBE DNA SYBR CENNIK PRODUKTÓW BIOLINE 2014 MASTER MIXY REAL-TIME PCR MASTER MIXY REAL-TIME PCR Najnowszej Generacji SensiFAST SYBR No-ROX m.in. SmartCycler (Cepheid), Rotor-Gene