Zadanie 19. Wyposażenie stanowiska do namnażania fragmentów DNA w czasie rzeczywistym

Transkrypt

1 Zadanie 19. Wyposażenie stanowiska do namnażania fragmentów DNA w czasie rzeczywistym Termin realizacji 12 tygodni od daty podpisania (zawarcia) umowy. Koszty transportu, instalacji oraz instruktażu, trwającego minimum10 godzin szkoleniowych, z zakresu obsługi urządzenia oraz analizy danych dla 4 osób, u Zamawiającego w terminie 2 miesięcy od daty protokolarnego odbioru, pokrywa Wykonawca. Gwarancja minimum 24 miesiące od daty protokolarnego odbioru urządzenia w miejscu instalacji u Kupującego. Warunki gwarancji w załączniku. CPV Łańcuchowa reakcja polimeryzacji katalizowana przez polimerazę (PCR) w czasie rzeczywistym CPV Maszyny i aparatura badawcza i pomiarowa 1. Aparat RealTime PCR z funkcją HRM, z wyposażeniem (m.in.: zestaw startowy odczynników do wszystkich aplikacji, zestaw plastików (płytki, probówki) (1 sztuka przydzielona do Pracowni Markerów Molekularnych) - Wymagania ogólne: Urządzenie umożliwiające przeprowadzanie reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) z pomiarem ilości powstającego produktu w czasie rzeczywistym, z użyciem barwników fluorescencyjnych (RT-PCR). Aparat powinien mieć możliwość przeprowadzenia analizy wysokorozdzielczej topnienia produktów (high resolution melt). Jednoczesna amplifikacja minimum 96 prób na standardowych przezroczystych i białych płytkach 96-dołkowych o pojemności 0,2ml i paskach (tzw. stripach) po 8 probówek 0.2ml. Możliwość pracy na odczynnikach tj.: gotowych mieszaninach reakcyjnych, polimerazach, fluorescencyjnych barwnikach interkalujących np. SYBR Green I lub podobnych, sondach hydrolizujących typu TaqMan itp., oferowanych przez innych wytwórców niż producent aparatu. Urządzenie nie może wymagać żadnych okresowych kalibracji systemu optycznego związanych z wykorzystaniem różnych barwników fluorescencyjnych czy stosowanych rodzajów analiz (w tym HRM), ani normalizacji reakcji za pomocą barwnika referencyjnego. Urządzenie powinno umożliwiać pracę również bez pośrednictwa komputera. Sterowanie, programowanie i śledzenie reakcji w trakcie jej trwania za pomocą dużego ekranu dotykowego (przynajmniej 800 x 600 pikseli). - Wymagania dotyczące parametrów bloku: Dopuszczalny zakres objętości mieszaniny reakcyjnej w probówce: 10-50µl. Maksymalna prędkość nagrzewania bloku przynajmniej 4 C/sek. Maksymalna prędkość chłodzenia bloku przynajmniej 2 C/sek. 1

2 Zakres temperatur bloku przy zachowaniu homogenności termicznej na poziomie przynajmniej: ±0,3 C oraz dokładności termicznej przynajmniej: ±0,2 C: pomiędzy C, Materiał z jakiego wykonana jest powierzchnia bloku o przewodności cieplnej co najmniej takiej jak srebro Możliwość ustawienia gradientu temperatur pomiędzy skrajnymi studzienkami bloku o wielkości przynajmniej 20 C. Temperatura pokrywy grzejnej bloku: 105 C ±3 C - Wymagania dotyczące systemu wzbudzania i detekcji barwników: Wzbudzenie: brak ruchomych elementów mechanicznych pojedyncza dioda LED o żywotności minimum godzin. Detekcja za pomocą kamery CCD wykonującej jednoczesny pomiar fluorescencji wszystkich prób w czasie maksymalnie do 1s. w trybie dynamicznym i do 4 s w trybie manualnym. Analiza krzywej topnienia przez ciągły, nieprzerwany i jednoczesny pomiar fluorescencji wszystkich prób w ustalonym zakresie temperatur. Wyposażenie przynajmniej w cztery kanały detekcji z filtrami wzbudzającymi/detekcyjnymi dla fal światła o długościach, odpowiednio: 470/514, 533/572, 577/620 oraz 645/697,5 nm. - Wymagania dotyczące aplikacji do programowania reakcji, sterowania urządzeniem i analizy wyników eksperymentów: Aparat powinien posiadać możliwość sterowania bez podłączania do komputera, w zakresie: tworzenia i zapisywania danych z co najmniej 50 eksperymentów w pamięci wewnętrznej urządzenia, sortowania plików (wg nazwy, daty i statusu), możliwości edycji protokołu oraz kontroli stanu reakcji, możliwości dodawania cykli w czasie trwania reakcji, możliwości otrzymania informacji o zakończeniu reakcji drogą elektroniczną, możliwości wprowadzania protokołów reakcji poprzez wbudowany w urządzenie port USB. Oprogramowanie do zewnętrznego komputera sterującego powinno umożliwiać: pomiar ilości kopii DNA w badanej próbie, pomiar poziomu ekspresji genu badanego w stosunku do genu referencyjnego, genotypowanie typu end-point przy pomocy sond hydrolizujących do wykrywania mutacji (analiza dyskryminacji alleli), analizę krzywej topnienia, analizę wysokorozdzielczą topnienia produktów reakcji (HRM), podgląd wyników wykonanego eksperymentu pod postacią mapy ciepła z szybką oceną rozkładu wyników w obrębie analizowanych prób (próby pozytywne/negatywne, wartości Cq, genotypy), eksport plików z danymi eksperymentów w formacie uniwersalnym dla tego typu urządzeń (np..rdml), wybór typu przeprowadzanej reakcji PCR (standardowa, gradientowa, Touchdown PCR), obserwowanie przeprowadzanej reakcji PCR na bieżąco podczas jej trwania (również online), powiadomienie o zakończeniu reakcji PCR i otrzymanie pliku zawierającego wyniki przeprowadzonego eksperymentu na adres . - Wymagania dotyczące zewnętrznego komputera sterującego: Obudowa typu laptop Procesor o parametrach nie gorszych niż: - cache 3.0 MB - szybkość zegaraz 2.90 GHz - 2 rdzenie - pamięć DDR3L-1333,1600 -kompatybilny z grafiką HD 4600 Dysk twardy: co najmniej 500 GB Zewnętrzny dysk przenośny 2TB LAN zgodna z: RJ45 Ethernet (100 MBit) Nagrywarka DVD 2

3 Port USB: 2.0 Rozdzielczość ekranu przynajmniej: 1280/1024 pikseli. System operacyjny: współpracujący z urządzeniami i nie wymagający aktywacji za pomocą telefonu lub Internetu Minimalne wymagania dotyczące systemu operacyjnego: System operacyjny w języku polskim, posiadający funkcje: - udostępnianie plików i drukarek w sieci domowej - szybki dostęp do ulubionych plików, witryn www i dokumentów Minimalne wymagania pakietu: Pakiet oprogramowania w języku polskim, zawierający: - edytor tekstów - arkusz kalkulacyjny - program do tworzenia prezentacji - szybka wyszukiwarka plików - pełna obsługa architektury 64 bitowej - rozbudowane narzędzia administracyjne - możliwość tworzenia kont użytkowników - możliwość personalizacji wyglądu systemu za pomocą kompozycji oraz gadżetów - wbudowana ochrona przed oprogramowaniem szpiegującym i innym złośliwym oprogramowaniem - nawiązywanie bezpiecznego połączenia z sieciami firmowymi, - narzędzie do uruchamiania aplikacji niekompatybilnych z bieżącym systemem operacyjnym - współpraca w domenie - rozbudowane opcje automatycznych kopi zapasowych. Pakiet biurowy - narzędzie do tworzenia notatek i gromadzenia informacji - narzędzie poczty i kalendarza - program do śledzenia i raportowania ważnych informacji za pomocą łatwych w obsłudze narzędzi bazy danych - narzędzie do tworzenia profesjonalnych publikacji materiałów marketingowych Certyfikaty i standardy komputera: Certyfikat ISO9001:2000 dla producenta sprzętu (należy załączyć do oferty) lub równoważny Certyfikat ISO dla producenta sprzętu (należy załączyć do oferty) lub równoważny Deklaracja zgodności CE (załączyć do oferty) Potwierdzenie spełnienia kryteriów środowiskowych, w tym zgodności z dyrektywą RoHS Unii Europejskiej o eliminacji substancji niebezpiecznych w postaci oświadczenia producenta jednostki Weryfikację konfiguracji fabrycznej wraz z wersją fabrycznie dostarczonego oprogramowania (system operacyjny, szczegółowa konfiguracja sprzętowa - CPU, HDD, pamięć) czasu obowiązywania i typ udzielonej gwarancji Możliwość aktualizacji i pobrania sterowników do oferowanego modelu komputera w najnowszych certyfikowanych wersjach przy użyciu dedykowanego darmowego oprogramowania producenta lub bezpośrednio z sieci Internet za pośrednictwem strony www producenta komputera po podaniu numeru seryjnego komputera lub modelu komputera - Wymagania dotyczące wyposażenia w zestaw startowy odczynników i plastików reakcyjnych zawierających co najmniej: 100 płytek 96 dołkowych, 0,2ml, białych, wraz z foliami optycznymi, 240 pasków (strip ów) 8 dołkowych, 0,2ml, z zatyczkami optycznymi, 3

4 25 x 1ml gotowych mieszanin reakcyjnych z barwnikiem interkalującym (na min reakcji w 20ul), 5 x 1ml gotowych mieszanin reakcyjnych do sond hydrolizujących (na min. 500 reakcji w 20ul), 10 x 1ml gotowych mieszanin reakcyjnych do HRM (na około 1000 reakcji w 20ul). Darmowa aktualizacja oprogramowania. Gwarancja minimum 24 miesiące. Instrukcja obsługi w języku polskim Koszty transportu, instalacji i szkolenia ponosi sprzedawca Wyposażenie aparatu Real time: - Spektrofotometr UV/VIS do pomiaru DNA, RNA i białka w kropli oraz w kuwecie (1szt.) (1 sztuka przydzielona do Pracowni Markerów Molekularnych) Spektrofotometr o parametarach nie gorszych niż: Długość drogi optycznej w granicach 0.03, do 0,5 mm Długość drogi optycznej ustawiana automatycznie w zależności od stężenia próbki Objętość mierzonej próbki: od minimum 0,5 µl niezależnie od stężenia próbki Długość fali w granicach: nm, Pełny zakres skanowania w podanych długościach fali Źródło światła błyskowa lampa ksenonowa Typ detektora: matryca CCD co najmniej 2048 elementów Pomiar bezpośrednio w próbce bez użycia kuwet, mikrokuwet, końcówek pomiarowych, nakrywek cups Precyzja pomiaru absorbancji:max. 0,001 Dokładność pomiaru absorbancji: max. 2% Zakres absorbancji w granicach: 0, Abs Zakres pomiaru stężenia dsdna: ng/µl Zakres stężenia BSA od 0,10mg/ml do 750 mg/ml bez potrzeby powtarzania pomiaru próbki o nieznanym stężeniu, bez konieczności zagęszczania lub rozcieńczania Czas całego cyklu pomiarowego mniej niż 4 sek łącznie z czyszczeniem Statyw pomiarowy instrumentu nie może być elementem wymiennym instrumentu Pomiar wydajności wyznakowania sond fluorescencyjnych w nanokropli Wymiary zewnętrzne urządzenia nie większe niż: 20 x 33 cm Urządzenie wyposażone w wbudowany dotykowy, kolorowy ekran Ekran o przekątnej co najmniej 7 cali do sterowania urządzeniem. Urządzenie powinno posiadać wewnętrzny mikroprocesor do pełnej obsługi oprogramowania. Pomiar nie wymaga zewnętrznego komputera. Oprogramowanie sterujące mobilne z interfejsem graficznym. Możliwość tworzenia własnych krzywych standardowych (kalibracji, wzorcowych) Możliwość pomiaru białka metodą metodami kolorymetrycznymi: metoda Bradforda, Lowry`ego, Pierca, BCA, spektrofotometryczna przy długości fali 280 nm, Metody pomiarowe dla ds. DNA, ss DNA, RNA, oligonukletorydów, mikromacierzy Możliwość wybierania grup długości fali przy jakiej ma być pomiar w aplikacji UV/VIS Oprogramowanie musi pozwalać na eksport wyników do programu Excel Oprogramowanie musi pozwalać na tworzenie własnych metod z lub bez użycia krzywych standardowych 4

5 Oprogramowanie musi automatycznie wyświetlać pełne spektrum UV-Vis od nm Oprogramowanie posiadające przycisk automatycznego pomiaru kolejnej próbki Moduł pozwalający na automatyczne przeliczanie stężeń Urządzenie wyposażone w Wi-Fi, Urządzenie wyposażone w port Ethernet Urządzenie wyposażone w 3 porty USB Urządzenie wyposażone w moduł pomiaru w kuwecie do pomiarów kinetycznych i stężenia kultur komórkowych OD600 Wbudowany inkubator z możliwością podgrzewania kuwety w zakresie do 37ºC do 45 Co dokładności +-0,5ºC Długość drogi optycznej 10,5,2,1 mm Limit detekcji dla modułu kuwetowego nie gorszy niż 0,4 ng/µl (dsdna) Stężenie próbki dla modułu kuwetowego co najmniej 750 ng/µl (dsdna) Możliwość podłączenia do urządzenia skanera kodów kreskowych probówek 1D i 2D Gwarancja minimum 24 miesiące od daty protokolarnego odbioru urządzenia w miejscu instalacji u Zamawiającego Czas reakcji serwisu 48 godz. Czas naprawy w przypadku sprowadzenia części z zagranicy 14 dni roboczych 5