Charakterystyka potencjału inwazyjnego enteroagregacyjnych szczepów Escherichia coli izolowanych od osób z zespołem jelita nadwrażliwego
|
|
- Piotr Urbański
- 9 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 diagnostyka laboratoryjna Journal of Laboratory Diagnostics 2012 Volume 48 Number Praca oryginalna Original Article Charakterystyka potencjału inwazyjnego enteroagregacyjnych szczepów Escherichia coli izolowanych od osób z zespołem jelita nadwrażliwego Characteristics of invasive potential of enteroaggregative Escherichia coli strains isolated from individuals with irritable bowel syndrome Anna Krystyna Duda, Beata Sobieszczańska Katedra i Zakład Mikrobiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu Streszczenie Zespół jelita nadwrażliwego (IBS, ang. irritable bowel syndrome) jest przewlekłym, czynnościowym zaburzeniem funkcji jelit. Chociaż wśród czynników predysponujących do rozwoju IBS wymienia się m.in. przebyte, bakteryjne zakażenia przewodu pokarmowego, dokładna rola bakterii w patomechanizmie tej jednostki chorobowej jest nieznana. Opisana zdolność inwazji enteroagregacyjnych szczepów E. coli (EAEC) do komórek nabłonka jelita oraz częsta izolacja tych bakterii od osób z IBS dały podstawę niniejszym badaniom, których celem była ocena zdolności inwazyjnych EAEC izolowanych od osób z IBS oraz genów kodujących inwazyny u tych szczepów. Ponadto w pracy oceniano aktywność mucynolityczną badanych szczepów EAEC. Zdolności inwazyjne EAEC oceniono w teście inwazji in vitro do komórek nabłonka jelita cienkiego linii Int407, natomiast obecność genów kodujących inwazyny oznaczano w reakcji PCR. Większość badanych szczepów EAEC była internalizowana in vitro przez komórki nabłonka jelita oraz posiadała geny inwazji. Jedna trzecia badanych szczepów EAEC wykazała aktywność mucynolityczną. Zdolność inwazji do komórek nabłonka szczepów EAEC może odpowiadać za przewlekły charakter zakażeń wywoływanych przez te patogeny. Summary Irritable bowel syndrome is a chronic, functional intestinal disorder. Despite the fact that among the factors predisposing to the development of IBS a history of bacterial gastrointestinal infections is mentioned, the exact role of bacteria in the pathogenesis of this disease is unknown. Invasive abilities of enteroaggregative E. coli (EAEC) to the intestinal epithelial cells and frequent isolation of these strains from individuals with IBS was the basis of this research. The purpose of the study was to assess the invasion ability and the presence of invasion genes among EAEC isolated from individuals with IBS. Moreover, in the study the mucinase activity was examined. The invasive capability of EAEC was evaluated by an in vitro invasion assay into the intestinal epithelial cells Int407 whereas the genes involved in the invasiveness were determined by PCR. Most of EAEC strains showed invasion capability and invasion genes determined. About one third of these strains showed mucinolytic activity. Invasion capability of EAEC strains examined may account for the chronic nature of infections caused by these pathogens. Słowa kluczowe: enteroagregacyjne E. coli, inwazja, mucynaza, zespół jelita nadwrażliwego Key words: enteroaggregative E. coli, invasion, mucinase, irritable bowel syndrome Wstęp Enteroagregacyjne szczepy Escherichia coli (E. coli; EAEC) są grupą patogennych szczepów E. coli odpowiedzialnych za ostre i przewlekłe zakażenia jelit u dzieci i osób dorosłych na całym świecie. Charakterystyczny sposób adhezji do komórek nabłonka jelit, w postaci agregatów przypominających stosy cegieł, jest cechą swoistą EAEC, różniącą je od innych patogennych szczepów E. coli. EAEC są niezwykle zróżnicowane pod względem prezentowanych czynników wirulencji, które z łatwością nabywają na drodze horyzontalnego transferu genów od innych patogenów przewodu pokarmowego. Kilkuetapowy patomechanizm zakażenia wywoływanego przez EAEC obejmuje: a) adhezję do komórek nabłonka jelita za pośrednictwem swoistych dla tej grupy 393
2 Charakterystyka potencjału inwazyjnego enteroagregacyjnych szczepów Escherichia coli izolowanych od osób... E. coli fimbrii agregacyjnych; b) stymulację gruczołów błony śluzowej jelita do sekrecji śluzu, w którym EAEC tworzą biofilm; c) wydzielanie enterotoksyn i/lub cytotoksyn, które modulują aktywność sekrecyjną enterocytów lub powodują ich uszkodzenie [1]. Ważnym czynnikiem wirulencji niektórych szczepów EAEC, a także pałeczek Shigella spp. jest proteaza serynowa Pic (ang. protease involved in intestinal colonization) o aktywności mucynazy. Mucynaza Pic indukuje sekrecję śluzu przez komórki kubkowe błony śluzowej jelita, co odpowiada za śluzowy charakter biegunek oraz degraduje mucyny zawarte w śluzie, co z kolei ułatwia tym patogenom osiąganie powierzchni nabłonka i przewlekłą kolonizację jelit [2]. Ponadto, niektóre szczepy EAEC wykazują zdolność inwazji do komórek nabłonka jelita [1]. Przebieg zakażenia w dużej mierze zależy więc od czynników wirulencji jakimi dysponują szczepy EAEC. Zespół jelita nadwrażliwego (IBS) jest czynnościowym zaburzeniem funkcji jelit o nieznanej etiologii, które dotyczy ok. 3-10% populacji. Wśród potencjalnych czynników mogących indukować rozwój IBS wymieniane są: płeć, długotrwała antybiotykoterapia, stres, zabiegi chirurgiczne w obrębie jamy brzusznej, nadwrażliwość mięśni jelit, nadużywanie alkoholu, mocnej kawy i herbaty oraz zakażenia bakteryjne. Objawy kliniczne, towarzyszące IBS obejmują kurczowe bóle brzucha, dyskomfort, uczucie niepełnego wypróżnienia, zaburzenia rytmu wypróżnień [3, 4]. Po-zakaźna postać IBS, której dominującym objawem klinicznym jest uporczywa biegunka, najczęściej jest skutkiem przebytego zakażenia przewodu pokarmowego, choć dotychczas nie zidentyfikowano żadnego, konkretnego drobnoustroju, mogącego indukować rozwój tej postaci IBS. Po-zakaźna postać IBS łączona jest z przebytym zakażeniem wywołanym przez bakterie (np.: E. coli., Campylobacter jejuni, Shigella spp.,) lub pasożyty (np.: Giardia lamblia, Entamoeba histolytica, Trichinella spp.) pomimo, że nie udowodniono roli żadnego z tych patogenów w rozwoju IBS [5]. Z biegunkową postacią IBS łączone są również szczepy EAEC, które izolowano od ponad 80% osób cierpiących na IBS i tylko od ok. 32% dorosłych osób zdrowych [6]. Celem badań była charakterystyka potencjału inwazyjnego tj., ocena częstości występowania genów kodujących inwazyny rozpowszechnione wśród patogennych szczepów E. coli oraz zdolności inwazji do ludzkich komórek nabłonka jelita linii Int407 szczepów EAEC izolowanych od osób z IBS. Ponadto, w pracy oceniano zdolność badanych szczepów EAEC do degradacji mucyny. Materiały i metody Szczepy bakterii. Badania przeprowadzono na 47 archiwalnych szczepach E. coli: 36 szczepów pochodziło z próbek kału osób dorosłych (średni wiek 43 lata) z biegunkową postacią IBS (grupa EAEC-IBS), rozpoznaną na podstawie Kryteriów Rzymskich II w Klinice Gastroenterologii i Hepatologii Akademii Medycznej we Wrocławiu; 11 szczepów uzyskano od osób zdrowych (ochotników nie zgłaszających żadnych dolegliwości ze strony przewodu pokarmowego w okresie uzyskania materiału), w tym samym przedziale wiekowym (grupa EAEC-zdrowi). Badane szczepy E. coli zakwalifikowano do grupy EAEC na podstawie testu adhezji in vitro do komórek nabłonka linii HEp-2 (Ryc. 1). Przyna- Rycina 1. leżność badanych szczepów do gatunku E. coli potwierdzono komercyjnymi zestawami biochemicznymi (API32GN, BioMerieux). Jako kontrole dodatnie do oznaczenia genów inwazji oraz w teście inwazji in vitro wykorzystano następujące szczepy referencyjne: enteroagregacyjny szczep E. coli 17-2 aggb dodatni; ipah dodatni szczep Shigella flexneri (ATCC TM 12022); tia dodatni enterotoksynogenny szczep E. coli (ETEC) (ATCC TM 35401); afad dodatni szczep E. coli o rozsianym typie adhezji (DAEC) izolowany od dziecka z biegunką. Jako kontrolę ujemną we wszystkich wykonanych oznaczeniach użyto niepatogennego, nieinwazyjnego szczepu E. coli K12 C600. Wszystkie badane szczepy przechowywano w bulionie Luria (LB) z 15% glicerolem w temp C. Przed wykonaniem badań szczepy wysiewano na podłoże wybiórczo-różnicujące MacConkeya. Test inwazji. Zdolność ludzkich komórek nabłonka jelita cienkiego linii Int407(ATCC CCL6) do internalizacji in vitro badanych szczepów E. coli określano powszechnie stosowanym testem z gentamycyną wg Boudeau i wsp. [7]. Gentamycyna nie penetruje do komórek, więc pałeczki E. coli, które wnikają do komórek (wewnątrzkomórkowe) przeżywają ekspozycję na wysokie stężenia gentamycyny, w przeciwieństwie do bakterii zlokalizowanych zewnątrzkomórkowo. Komórki nabłonka linii Int407 hodowano do czasu uzyskania jednowarstwowej hodowli (monolayer) w podłożu MEM (minimal essential medium; Gibco BRL) wzbogaconym 10% surowicą płodową bydlęcą (FBS; Gibco BRL) oraz roztworem antybiotyków (penicylina 100U, streptomycyna 100 μg/ml, amfoterycyna B 0,25 μg/ml; Sigma-Aldrich) w 37 0 C, w wilgotnej atmosferze wzbogaconej 5% CO 2. Przed wykonaniem testu inwazji komórki płukano, trypsynizowano 394
3 i po odwirowaniu (1000 rpm; 10 min) zawieszano w świeżym podłożu MEM. Zawiesinę komórek (o gęstości 4x10 5 komórek/ml) wsiewano (po 0,5 ml) do dołków 24-dołkowej płytki do hodowli komórek (NUNC) i inkubowano do następnego dnia. Przed zakażeniem komórki płukano dwukrotnie roztworem soli fizjologicznej (0,9% roztwór NaCl) w celu odpłukania antybiotyków. Badane szczepy E. coli do zakażenia komórek przygotowywano w następujący sposób: całonocne hodowle szczepów w LB (Luria broth) odwirowywano (16400 rpm; 5 min), uzyskane osady bakterii zawieszano w podłożu MEM z 2% FBS bez antybiotyków do uzyskania gęstości optycznej OD 1,5x10 8 cfu/ml. Tak przygotowywanymi zawiesinami szczepów E. coli zakażano komórki nabłonka linii Int407 (0,5 ml zawiesiny E. coli na dołek). Płytki z zakażonymi komórkami wirowano (1200 rpm, 10 min) w celu ułatwienia kontaktu bakterii z powierzchnią komórek i inkubowano 4 godz. w temp C w atmosferze 5% CO 2. Po inkubacji komórki płukano trzykrotnie roztworem soli fizjologicznej, aby usunąć niezwiązane z komórkami bakterie i dodawano świeże podłoże MEM z 2% FBS i gentamycyną w stężeniu 100 μg/ml w celu zabicia zewnątrzkomórkowych bakterii przylegających do komórek. Płytki ponownie inkubowano w temp C w atmosferze 5% CO 2 przez 1 godz. Po inkubacji komórki płukano trzykrotnie i lizowano, dodając do każdego dołka 0,5 ml wodnego roztworu 1% Triton X-100 w celu uwolnienia wewnątrzkomórkowych bakterii. Po 10 min. Inkubacji z wytrząsaniem z każdego dołka płytki pobierano 100 µl lizatu komórek, który rozcieńczano solą fizjologiczną w postępie geometrycznym w szeregu probówek i posiewano na podłoże MacConkeya. Po całonocnej inkubacji liczono wyrosłe kolonie bakteryjne. Liczbę bakterii w 1 ml lizatu obliczano ze wzoru: gdzie: cfu/ml liczba bakterii w 1 ml lizatu n - liczba wyrosłych kolonii 10 -x rozcieńczenie lizatu posiewane na podłoże stałe 0,1 ml objętość wysiewanego lizatu Za zdolne do inwazji przyjmowano szczepy, dla których średnia liczba wewnątrzkomórkowych bakterii była większa lub równa liczbie kolonii referencyjnego, inwazyjnego szczepu Shigella flexneri (ATCC TM 12022) tj. wartości 10 4 cfu/ml. Wykrywanie genów inwazji. Geny kodujące inwazyny występujące u chorobotwórczych szczepów E. coli tj.: gen ipah, kodujący inwazynę enteroinwazyjnych E. coli (EIEC) i pałeczek Shigella, gen tia, odpowiedzialny za ekspresję inwazyny enterotoksynogennych E. coli (ETEC), gen afad, kodujący inwazynę szczepów DAEC oraz gen aggb, kodujący inwazynę swoistą dla EAEC oznaczano w reakcji PCR. Sekwencje starterów zastosowanych w reakcji PCR oraz warunki reakcji podano w Tabeli I. Do oznaczenia genów afad i aggb zastosowano startery zaprojektowane w naszym laboratorium za pomocą programu Web Primers. Sekwencję starterów dla genu afad (Forward: pozycje 7479 do 7498 i Reverse: pozycje 7853 do 7870) opracowano na podstawie sekwencji klastera afa-3 szczepu E. coli A30 izolowanego od chorego z zapaleniem pęcherza moczowego (Gen-Bank accession number: X76688). Natomiast sekwencję starterów dla genu aggb (Forward: pozycje 3460 do 3480 i Reverse: pozycje 3857 do 3880) opracowano na podstawie sekwencji klastera AAF/I referencyjnego enteroagregacyjnego szczepu E. coli 17-2 (Gen-Bank accession number: U12894). Matrycę DNA do testu PCR stanowił supernatant z lizatów bakterii gotowanych przez 10 minut w łaźni wodnej, a następnie odwirowanych (1200 rpm, 10 min, 4 0 C). Ujemne lub wątpliwe wyniki testu PCR powtarzano z oczyszczonym DNA genomowym lub plazmidowym. DNA genomowe izolowano metodą fenolowo-chloroformową wg Wilson [8] z modyfikacjami. Osad uzyskany z całonocnych hodowli bulionowych (LB) badanych szczepów zawieszano w 1ml buforu S (1 M Tris-HCl, ph=8; 0,5 M EDTA, ph=8, 5 M NaCl, 10% CTAB tj. bromek heksadecylotrimetyloamonowy), dodawano 5 µl proteinazy K (10 mg/ml), mieszano i dodawano 100 µl 20% dodecylosiarczanu sodu (SDS). Mieszaninę inkubowano 1 godz. w 65 0 C, a następnie dodawano 500 µl mieszaniny fenolu i chloroformu (1:1) i po wymieszaniu wirowano (6000 rpm; 10 min). Uzyskany supernatant przenoszono do nowej probówki Eppendorf, dodawano 0,6 objętości wodnego 99% roztworu izopropanolu (Isopropanol; Sigma-Aldrich) i wirowano (3600 rpm; 5 min). Do uzyskanego osadu DNA dodawano 1 µl RNA-zy (10 mg/ml) i inkubowano 30 min w 37 0 C. Po dodaniu 25 µl roztworu fenolu w 10 mmtris-hcl, próbki mieszano i wirowano (6000 rpm; 10 min). Uzyskany supernatant przenoszono do nowej probówki Eppendorf i dodawano 1/10 objętości 3 M octanu sodu oraz 2 objętości 96% Tabela I Sekwencje starterów dla oznaczanych genów inwazji. Gen Startery 5-3 Produkt (bp) Warunki reakcji PCR Piśmiennictwo afad GTCACCTGCGGGATGTTACT GCTCCGCCAACCGAAAAC C1 min; 72 0 C 45 s 60 0 C 45 s; (34 cykle) [badania własne] tia ACCAGCGCTTCCGTCAGG GCCAGATTCATTCCAGGAGG C1 min; 72 0 C 1 min 55 0 C 1 min; (30 cykli) [19] ipah GCTGGAAAAACTCAGTGCCT CCAGTCCGTAAATTCATTCT C 1 min; 72 0 C 1 min; 56 0 C 2 min; (29 cykli) [20] aggb GCATATTACCGATGTCCTGCG CCTCTTGATATTAGACATTCA C 1 min; 62 0 C 45 s; 58 0 C 30 s; (29 cykli) [badania własne] 395
4 Charakterystyka potencjału inwazyjnego enteroagregacyjnych szczepów Escherichia coli izolowanych od osób... etanolu. Po odwirowaniu (4600 rpm; 5 min) osad zawierający DNA zawieszano w 20 µl H 2 O (miliq). DNA plazmidowe izolowano metodą lizy alkalicznej wg Birnboim [9] z modyfikacjami. Osady z całonocnych hodowli badanych szczepów EAEC zawieszano w 100 µl roztworu GTE (50 mm glukoza, 25 mm Tris-HCl; ph=8, 10 mm EDTA) z dodatkiem 10 µl lizozymu (10 mg/ml). Mieszaniny inkubowano w temperaturze pokojowej przez 15 minut, a następnie dodawano 200 µl roztworu NaOH/SDS (0,2 M NaOH, 1% SDS) i inkubowano na lodzie przez 5 min. Po inkubacji próbki mieszano ze 150 µl 3 M roztworu octanu potasu i wirowano (16400 rpm; 5 min). Uzyskany supernatant przenoszono do nowej probówki Eppendorf, dodawano 0,8 ml 96% zimnego etanolu i wirowano (16400 rpm; 2 min). Uzyskany osad DNA płukano w 0,5 ml 70% etanolu i zawieszano w 30 µl H 2 0 (miliq). Amplifikację DNA przeprowadzono w termocyklerze MJ Research, PTC- 200 (Peltier Thermal Cycler). Oznaczanie aktywności mucynolitycznej. Aktywność mucynolityczną badanych szczepów E. coli, świadczącą o ich zdolności wytwarzania mucynazy Pic, oznaczano na podłożu Luria agar z 0,28% mucyną (LA/M) (Bovine Mucin; Sigma-Aldrich) wg Gessner [10] z modyfikacjami. Całonocne hodowle badanych szczepów EAEC wkłuwano punktowo w agar LA/M i inkubowano w temp C przez 48 godz. Wyrosłe punktowo hodowle EAEC na podłożu LA/M zalewano 2 ml 1% roztworu CaCl 2. Statystyczna analiza wyników. Do statystycznej analizy wyników zastosowano test χ2 Pearsona. Wartości p 0,05 przyjmowano za statystycznie znamienne. Wyniki Test inwazji. Wśród przebadanych 36 szczepów EAEC-IBS, 23 (63,8%) szczepy wnikały do komórek linii Int407 na poziomie równym lub większym niż referencyjny szczep Shigella flexneri, tj cfu/ml. W grupie 11 szczepów EAEC od osób zdrowych, 10 (90,9%) szczepów wykazało zdolność inwazji na poziomie porównywalnym do szczepu referencyjnego. Nie wykazano różnic statystycznych w zdolności inwazji szczepów EAEC izolowanych od osób z IBS i zdrowych (p=0,08). Jednakże istotne statystyczne różnice dotyczyły ilości szczepów obu grup, które wnikały do komórek nabłonka w ilości 10 4 cfu/ml. W grupie szczepów EAEC-IBS było to 16 (44,4%) izolatów, natomiast w grupie EAEC-zdrowi 2 (18,2%) szczepów (p=0,006). Podobnie, W grupie EAECzdrowi znacznie więcej szczepów było internalizowanych w liczbie 10 5 cfu/ml niż w grupie EAEC-IBS (p=0,005) (Tabela II). Geny inwazji. Wyniki oznaczeń genów inwazji przedstawiono w Tabeli III. Analiza statystyczna nie wykazała różnic w częstości występowania oznaczanych genów inwazji wśród badanych szczepów obu grup tj. EAEC-IBS i EAECzdrowi (p>0,05). Nie wykazano również korelacji pomiędzy poziomem inwazji badanych EAEC a obecnością oznaczanych genów inwazyn. Cztery (8,5%) spośród 47 badanych szczepów EAEC (2 szczepy od osób z IBS i 2 szczepy od osób zdrowych), które nie posiadały żadnego z oznaczanych genów inwazji również wnikały do komórek nabłonka na poziomie cfu/ml. W grupie EAEC-IBS 8 (22,2%) szczepów, natomiast w grupie EAEC-zdrowi 5 (45,4%) Tabela II Porównanie liczby szczepów EAEC-IBS i EAEC-zdrowi internalizowanych przez komórki nabłonka Int407. Liczba szczepów (%) IBS n=36 Zdrowi n=11 Brak internalizacji 7 (20,4) 1 (9,1) p=0,4 Internalizacja (cfu/ml) Średnia liczba internalizowanych bakterii 6 (16,7) 16 (44,4) 7 (20,4) 0 8,2 x (18,2) 7 (63,6) 1 (9,1) 3,8 x 10 5 p=0,1 p=0,006 p=0,005 p=0,06 IBS, zespół jelita nadwrażliwego; cfu, liczba kolonii bakteryjnych (colony forming units) Tabela III Częstość występowania oznaczanych genów inwazji wśród badanych szczepów EAEC. IBS, zespół jelita nadwrażliwego Liczba szczepów (%) Grupa aggb afad ipah tia 2 geny 3 geny IBS n=36 (47,3) (27,8) (19,4) (22,2) (19,4) (2,8) Zdrowi n=11 (27,3) (45,4) (36,4) (27,3) (36,4) (9,1) Razem n=47 (42,5) (31,9) (23,4) (23,4) (23,4) (4,2) 396
5 szczepów, wykazało dwa lub trzy różne geny inwazji (np.: aggb+afad lub ipah+afad+aggb). Ilość wykrywanych genów inwazji nie korelowała jednak ze zdolnością i poziomem inwazji badanych szczepów. Aktywność mucynolityczna. Zdolność degradacji mucyny na podłożu LA/M (tj. obecność strefy przejaśnienia wokół kolonii) wykazało 13 (36,1%) szczepów EAEC-IBS oraz 2 (18,2%) szczepy z grupy EAEC-zdrowi (p=0,2) (Ryc. 2). Rycina 2. Dyskusja Inwazja do komórek nabłonka jelita stanowi podstawę patomechanizmu zakażeń wywoływanych przez inwazyjne patogeny przewodu pokarmowego m.in. Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia spp. oraz EIEC. Wewnątrzkomórkowa lokalizacja zapewnia ochronę przed układem immunologicznym gospodarza, a także niesprzyjającymi warunkami panującymi w świetle jelita (np.: niekorzystnym wpływem metabolitów flory komensalnej jelit). Poza tym, wewnątrzkomórkowa lokalizacja zapewnia patogenom dostęp do składników odżywczych i możliwość okresowego wysiewania się do światła jelita lub inwazji do sąsiednich komórek nabłonka [11]. Pereira i wsp. [12] wykazali in vitro zdolność szczepów EAEC izolowanych od dzieci z biegunką do inwazji spolaryzowanych oraz niespolaryzowanych komórek nabłonka, a także namnażanie się tych szczepów wewnątrz komórek przez wiele godzin. Zlokalizowane w obrębie komórek nabłonka drobnoustroje mogą stanowić niebezpieczne źródło przewlekłych zakażeń przewodu pokarmowego i utrzymującego się stanu zapalnego błony śluzowej jelit, który ostatecznie może doprowadzić do rozwoju zaburzenia funkcji jelit m.in. IBS. W wykonanym teście inwazji większość badanych szczepów EAEC (niezależnie od tego czy szczepy te pochodziły od osób zdrowych, czy osób z IBS) wykazała zdolność inwazji in vitro do komórek nabłonka jelita. Częściej cecha inwazji związana była ze szczepami EAEC od osób zdrowych, co wskazuje, że osoby te nosiciele, mogą stanowić źródło tych szczepów dla osób wrażliwych. Inwazyjny potencjał patogenów jelitowych u osób z prawidłową florą jelit jest zwykle hamowany przez metabolity mikroflory m.in. krótkołańcuchowe kwasy tłuszczowe oraz szczepy probiotyczne, co może tłumaczyć brak objawów klinicznych zakażenia u osób zdrowych [13]. Inwazja patogenów przewodu pokarmowego takich jak: Salmonella spp., Shigella spp., Yersinia spp. do komórek gospodarza kodowana jest przez zespoły genów chromosomalnych i/lub plazmidowych, które mogą rozprzestrzeniać się wśród pałeczek jelitowych na drodze koniugacji lub transdukcji [14]. Inwazyną swoistą dla EAEC jest białko AggB, które na podstawie podobieństw strukturalnych do rodziny inwazyn AfaD, charakterystycznych dla szczepów DAEC, uważane jest za inwazynę promującą internalizację szczepów EAEC do komórek nabłonka [15, 16]. Gen kodujący inwazynę AggB był najczęściej wykrywanym genem inwazji wśród badanych szczepów EAEC. Obecność genu kodującego białko AggB u prawie połowy szczepów EAEC izolowanych od osób z IBS oraz 27% osób zdrowych, wskazuje na jego szerokie rozpowszechnienie wśród tej grupy patogennych E. coli. Jednakże brak statystycznie istotnych różnic w częstości występowania inwazyny AggB oraz brak korelacji pomiędzy obecnością tego antygenu a zdolnością i poziomem inwazji badanych szczepów EAEC, wskazują, że inwazyna ta może odgrywać rolę pomocniczą w procesie internalizacji AggB-dodatnich EAEC do komórek nabłonka, natomiast za proces inwazji odpowiedzialna jest inna, nieznana inwazyna. Ponadto, obecność genu, wykryta w reakcji PCR, niekoniecznie oznacza jego ekspresję, co mogłoby tłumaczyć brak korelacji pomiędzy obecnością tego genu a poziomem inwazji u badanych szczepów EAEC. Nieustalona ostatecznie funkcja białka AggB w procesie inwazji EAEC oraz nieznana częstość jego rozpowszechnienia wśród tych szczepów izolowanych na świecie utrudniła analizę uzyskanych wyników oznaczeń. Dodatkowo, wiele badanych szczepów EAEC prezentowało obok inwazyny AggB, obecność innych genów inwazji, co mogło wpłynąć na wynik testu inwazji. Poza inwazyną AggB, drugim najczęściej występującym genem inwazji wśród badanych szczepów EAEC był gen afad, kodujący inwazynę swoistą dla DAEC. Białko AfaD jest składnikiem osłonki adhezyn afimbrialnych syntetyzowanych przez uropatogenne szczepy E. coli (UPEC), odpowiedzialne za zakażenia układu moczowego oraz biegunki u małych dzieci [17]. Według badań Jouve i wsp. [18] geny kodujące adhezyny Afa posiada 11 32% UPEC. W wykonanych badaniach gen afad częściej występował u szczepów EAEC od osób zdrowych, niż wśród szczepów od osób z IBS, co można wytłumaczyć faktem, że UPEC często kolonizują jelita osób zdrowych. Wykonane badania wykazały po raz pierwszy obecność wśród EAEC genów kodujących inwazyny swoiste dla ETEC, EIEC i pałeczek Shigella spp. tj. geny tia i ipah. Brak danych na temat występowania tych inwazyn wśród EAEC izolowanych na świecie uniemożliwił analizę częstości rozprzestrzeniania tych inwazyn wśród badanych szczepów. Tym niemniej, ich obecność u części badanych szczepów EAEC potwierdza fakt łatwego nabywania przez nie różnych genów wirulencji 397
6 Charakterystyka potencjału inwazyjnego enteroagregacyjnych szczepów Escherichia coli izolowanych od osób... od innych patogenów przewodu pokarmowego. Analiza korelacji pomiędzy inwazją a obecnością oznaczonych genów inwazji nie wykazała jednak żadnego związku z konkretnym, oznaczanym genem. Co więcej, niektóre badane szczepy prezentowały więcej niż jeden gen inwazji, co również nie korelowało ze zdolnością inwazji tych szczepów. Uzyskane wyniki wskazują na konieczność dalszych badań ekspresji genów inwazji zlokalizowanych wewnątrzkomórkowo szczepów EAEC, co umożliwi wyjaśnienie roli wykrytych inwazyny w procesie internalizacji EAEC przez nabłonek jelita. Piśmiennictwo: 1. Nataro JP, Steiner T, Guerrant RL. Enteroaggregative Escherichia coli. Emerg Infect Dis 1998; 4: Navarro-Garcia F, Gutierrez-Jimenez J, Garcia-Tovar C. Pic, an autotransporter protein secreted by different pathogens in the Enterobacteriaceae family, is a potent mucus secretagogue. Infect Immun 2010; 78: Olden KW. The challenge of diagnosing irritable bowel syndrome. Rev Gastroenterol Disord 2003; 3: Locke GR. Natural history of irritable bowel syndrome and durability of the diagnosis. Rev Gastroenterol Disord 2003; 3: Morgan DR, Benshoff M, Cáceres M, et al. Irritable bowel syndrome and gastrointestinal parasite infection in a developing nation environment. Gastroenterol Res Pract 2012, 2012: Sobieszczańska BM, Osek J, Waśko-Czopnik D, et al. Association of enteroagreggative Escherichia coli with irritable bowel syndrome. Clin Microbiol Infect 2007; 13: Boudeau J, Glasser AL, Masseret E, et al. Invasive ability of an Escherichia coli strain isolated from the ileal mucosa of a patient with Crohn s disease. Infect Immun 1999; 67: Wilson K. Preparation of genomic DNA from bacteria. Ausubel FM & Brent R eds. Current Protocols in Molecular Biology, New York: Greene Publ. Assoc. and Wiley Interscience, 1990: Birnboim HC. A rapid alkaline extraction method for the isolation of plasmid DNA. Methods Enzymol 1983; 100: Gessner AR, Mortensen JE. Pathogenic factors of Pseudomonas cepacia isolates from patients with cystic fibrosis. J Med Microbiol 1990; 33: Huang DB, Dupont HL. Enteroaggregative Escherichia coli: an emerging pathogen in children. Semin Pediatr Infect Dis 2004; 15: Pereira AC, Britto-Filho JD, de Carvalho JJ, et al. Enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) strains enter and survive within cultured intestinal epithelial cells. Microb Pathog 2008; 45: Tuohy KM, Rouzaud GC, Bruck WM, et al. Modulation of the human gut microflora towards improved health using prebiotics assesment of efficacy. Curr Pharm Des 2005; 11: Włodarczyk M. Różnorodność cech fenotypowych bakterii kodowanych przez plazmidy. Kosmos 2002; 51: Sobieszczańska BM. Agregacyjne E. coli nowa grupa szczepów E. coli odpowiedzialnych za biegunki. Post Mikrobiol 2003; 42: Garcia MI, Jouve M, Nataro JP, et al. Characterization of the AfaD-like family of invasins encoded by pathogenic Escherichia coli associated with intestinal and extra-intestinal infections. FEBS Lett 2000; 479: Servin AL. Pathogenesis of Afa/Dr diffusely adhering Escherichia coli. Clin Microbiol Rev 2005; 18: Jouve M, Garcia MJ, Courcoux P, et al. Adhesion to and invasion of HeLa cells by pathogenic Escherichia coli carrying the afa-3 gene cluster are mediated by the AfaE and AfaD proteins, respectively. Infect Immun 1997; 65: Darfeuille-Michaud A, Boudeau J, Bulois P, et al. High Prevalence of Adherent-invasive Escherichia coli associated with ileal mucosa in Crohn s disease. Gastroenterol 2004; 127: Dutta S, Chatterjee A, Dutta P, et al. Sensitivity and performance characteristics of a direct PCR with stool samples in comparison to conventional techniques for diagnosis of Shigella and enteroinvasive Escherichia coli infection in children with acute diarrhoea in Calcutta, India. J Med Microbiol 2001; 50: Finansowanie badań: wykonane badania finansowane były z grantu uczelnianego Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu nr 1278 Adres do korespondencji: mgr Anna Krystyna Duda Katedra i Zakład Mikrobiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu Wrocław, ul. Chałubińskiego 4 Tel anna.krystyna.duda@gmail.com Zaakceptowano do publikacji:
w kale oraz innych laboratoryjnych markerów stanu zapalnego (białka C-reaktywnego,
1. Streszczenie Wstęp: Od połowy XX-go wieku obserwuje się wzrost zachorowalności na nieswoiste choroby zapalne jelit (NChZJ), w tym chorobę Leśniowskiego-Crohna (ChLC), zarówno wśród dorosłych, jak i
E.coli Transformer Kit
E.coli Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli. Metoda chemiczna. wersja 1117 6 x 40 transformacji Nr kat. 4020-240 Zestaw zawiera komplet odczynników
Genomic Midi AX Direct zestaw do izolacji genomowego DNA (procedura bez precypitacji) wersja 1215
Genomic Midi AX Direct zestaw do izolacji genomowego DNA (procedura bez precypitacji) wersja 1215 20 izolacji Nr kat. 895-20D Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 100 µg 1 Skład zestawu Składnik
Zespół jelita drażliwego u dzieci i młodzieży
52 Zespół jelita drażliwego u dzieci i młodzieży Irritable bowel syndrome in children Mieczysława Czerwionka-Szaflarska, Bartosz Romańczuk Pediatr Pol 2010; 85 (1): 52 56 2010 by Polskie Towarzystwo Pediatryczne
woda do 1000 ml ph=6,9-7,1. Po sterylizacji dodać nystatynę (końcowe stężenie ok. 50 μg/ml). Agar z wyciągiem glebowym i ekstraktem drożdżowym (YS)
Ćwiczenie 1, 2, 3, 4 Skrining ze środowiska naturalnego: selekcja promieniowców zdolnych do produkcji antybiotyków. Testowanie zdolności do syntezy antybiotyków przez wyselekcjonowane szczepy promieniowców
E.coli Transformer Zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli
E.coli Transformer Zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli Wersja 0211 6x40 transformacji Nr kat. 4020-240 Zestaw zawiera komplet odczynników do przygotowania sześciu
Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia
1 Zakład Mikrobiologii UJK Instrukcje do ćwiczeń oraz zakres materiału realizowanego na wykładach z przedmiotu Inżynieria bioprocesowa na kierunku biotechnologia 2 Zakład Mikrobiologii UJK Zakres materiału
INTESTA jedyny. oryginalny maślan sodu w chronionej patentem matrycy trójglicerydowej
INTESTA jedyny oryginalny maślan sodu w chronionej patentem matrycy trójglicerydowej Dlaczego INTESTA? kwas masłowy jest podstawowym materiałem energetycznym dla nabłonka przewodu pokarmowego, zastosowanie,
Ampli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
Rekomendacje 2015. Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii Klinicznej, Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. Lekowrażliwości Drobnoustrojów (KORLD) 2
Test Carba NP i CarbAcineto - szybkie testy do wykrywania nabytych karbapenemaz u pałeczek Enterobacteriaceae, Pseudomonas spp. oraz Acinetobacter spp. Rekomendacje 2015 Elżbieta Literacka 1, Dorota Żabicka
Genomic Maxi AX Direct
Genomic Maxi AX Direct Uniwersalny zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. Procedura bez etapu precypitacji. wersja 0517 10 izolacji Nr kat. 995-10D Pojemność kolumny
Genomic Maxi AX zestaw do izolacji genomowego DNA wersja 0616
Genomic Maxi AX zestaw do izolacji genomowego DNA wersja 0616 10 izolacji Nr kat. 995-10 Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 500 µg 1 Skład zestawu Składnik Ilość Temp. Przechowywania Kolumny
Prezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów w Katedry Mikrobiologii UJCM
Prezentacja Pracowni Ekologii Drobnoustrojów w Katedry Mikrobiologii UJCM Informacja o Katedrze Rozwój j naukowy młodej kadry naukowców w w kontekście priorytetów badawczych: W 2009 roku 1 pracownik Katedry
Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna.
Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna. wersja 0916 6 x 20 transformacji Nr kat. 4010-120 Zestaw zawiera
Genomic Midi AX. 20 izolacji
Genomic Midi AX Uniwersalny zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. Procedura z precypitacją DNA. wersja 0517 20 izolacji Nr kat. 895-20 Pojemność kolumny do oczyszczania
Plasmid Mini AX Gravity
!"# Plasmid Mini AX Gravity zestaw do izolacji ultraczystego plazmidowego DNA (plazmidy wysokokopijne) wersja 0515/I 100 izolacji Nr kat. 015-100 1 Skład zestawu Składnik Ilość Temp. Przechowywania Kolumny
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH
PROBLEMY TERAPEUTYCZNE WTÓRNYCH ZAKAŻEŃ KRWI POWODOWANE PRZEZ PAŁECZKI Enterobacterales W PRAKTYCE ODDZIAŁÓW ZABIEGOWYCH I ZACHOWAWCZYCH DOROTA ROMANISZYN KATEDRA MIKROBIOLOGII UJCM KRAKÓW Zakażenie krwi
Genomic Mini AX Bacteria+ Spin
Genomic Mini AX Bacteria+ Spin Zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z bakterii Gram-dodatnich. wersja 1017 100 izolacji Nr kat. 060-100MS Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi
ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN
ĆWICZENIE 5 MECHANIZMY PROMUJĄCE WZROST ROŚLIN CZĘŚĆ TEORETYCZNA Mechanizmy promujące wzrost rośli (PGP) Metody badań PGP CZĘŚĆ PRAKTYCZNA 1. Mechanizmy promujące wzrost roślin. Odczyt. a) Wytwarzanie
Protokoły do zajęć praktycznych z mikrobiologii ogólnej i żywności dla studentów kierunku: Dietetyka
Protokoły do zajęć praktycznych z mikrobiologii ogólnej i żywności dla studentów kierunku: Dietetyka Protokół I, zajęcia praktyczne 1. Demonstracja wykonania preparatu barwionego metodą Grama (wykonuje
SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20005/11858/09
SPRAWOZDANIE MOŻE BYĆ POWIELANE TYLKO W CAŁOŚCI. INNA FORMA KOPIOWANIA WYMAGA PISEMNEJ ZGODY LABORATORIUM. SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20005/11858/09 BADANIA WŁASNOŚCI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH
Ostra biegunka u dzieci
Ostra biegunka u dzieci Antybiotyki ja na TAK Prof. dr hab. n med. Piotr Albrecht Klinika Gastroenterologii i Żywienia Dzieci WUM Generalnie jestem na nie! Definicja WHO Karmione sztucznie Trzy lub więcej
Novabeads Food DNA Kit
Novabeads Food DNA Kit Novabeads Food DNA Kit jest nowej generacji narzędziem w technikach biologii molekularnej, umożliwiającym izolację DNA z produktów spożywczych wysoko przetworzonych. Metoda oparta
Probiotyki, prebiotyki i synbiotyki w żywieniu zwierząt
.pl Probiotyki, prebiotyki i synbiotyki w żywieniu zwierząt Autor: dr inż. Barbara Król Data: 2 stycznia 2016 W ostatnich latach obserwuje się wzmożone zainteresowanie probiotykami i prebiotykami zarówno
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Ponad 60% zakażeń w praktyce klinicznej jest wywołana przez wirusy. Rodzaj i jakość materiału diagnostycznego (transport!) oraz interpretacja wyników badań
Genomic Mini. 50 izolacji, 250 izolacji. Uniwersalny zestaw do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. wersja Nr kat.
Genomic Mini Uniwersalny zestaw do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. wersja 0517 50 izolacji, 250 izolacji Nr kat. 116-50, 116-250 Zestaw do izolacji DNA z tkanek, bakterii, hodowli komórkowych.
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Psychosomatyczne podłoże nieswoistych chorób zapalnych jelit
Psychosomatyczne podłoże nieswoistych chorób zapalnych jelit Paweł Maroszek Opiekun: dr n. med. Beata Mrozikiewicz-Rakowska, dr n. med. Przemysław Krasnodębski Kierownik: Prof. dr hab. n. med. Waldemar
Wpływ Lactobacillus casei na tworzenie biofilmu przez enteroagregacyjne szczepy Escherichia coli izolowane od osób z zespołem jelita nadwrażliwego
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 11-17 Wpływ Lactobacillus casei na tworzenie biofilmu przez enteroagregacyjne szczepy Escherichia coli izolowane od osób z zespołem jelita nadwrażliwego Influence of Lactobacillus
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
Kontrola pożywek mikrobiologicznych. Sekcja Badań Epidemiologicznych
Kontrola pożywek mikrobiologicznych Sekcja Badań Epidemiologicznych 27.04.2015 Zgodnie z ISO 17025 oraz ISO 15189 jednym z czynników istotnie wpływających na jakość wyników badań w przypadku badań mikrobiologicznych,
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN - POLONIA VOL.LX, SUPPL. XVI, 7 SECTIO D 2005
ANNALES UNIVERSITATIS MARIAE CURIE-SKŁODOWSKA LUBLIN - POLONIA VOL.LX, SUPPL. XVI, 7 SECTIO D 5 1 Państwowa Wyższa Szkoła Zawodowa w Białej Podlaskiej Instytut Pielęgniarstwa Higher State Vocational School
PL 208422 B1. INSTYTUT BIOTECHNOLOGII SUROWIC I SZCZEPIONEK BIOMED SPÓŁKA AKCYJNA, Kraków, PL 14.04.2008 BUP 08/08
RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 208422 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 380804 (22) Data zgłoszenia: 10.10.2006 (51) Int.Cl. C12N 1/20 (2006.01)
WYKRYWANIE OBECNOŚCI BAKTERII Z RODZAJU LISTERIA W ŻYWNOŚCI
ĆWICZENIE IV Autor i główny prowadzący dr Dorota Korsak WYKRYWANIE OBECNOŚCI BAKTERII Z RODZAJU LISTERIA W ŻYWNOŚCI Wstęp Rodzaj Listeria należy do typu Firmicutes wspólnie z rodzajem Staphylococcus, Streptococcus,
Genomic Mini AX Body Fluids zestaw do izolacji DNA z płynów ustrojowych wersja 1115
Genomic Mini AX Body Fluids zestaw do izolacji DNA z płynów ustrojowych wersja 1115 20 izolacji Nr kat. 052-20M tel: +48 58 7351194, fax: +48 58 6228578 info@aabiot.com www.aabiot.com 1 Skład zestawu Składnik
Epidemia EHEC. Po burzy? Dr hab. Beata Sobieszczańska, prof. nadzw.
Artykuł ten, który wprowadzamy na stronę internetową Wydziału Nauk Medycznych w dniu 6 lipca 2011 r. stanowi cenny aneks do poprzedniego artykułu Profesor Beaty Sobieszczańskiej na ten sam, ciągle jeszcze
Zestaw SIT Szybki Identyfikacyjny Test Szczepów Salmonella Enteritidis i Typhimurium
Zestaw SIT Szybki Identyfikacyjny Test Szczepów Salmonella Enteritidis i Typhimurium W związku z wprowadzeniem w 2011 roku przez Komisję UE zmian w rozporządzeniach nr 2160/3003 i 2073/2005 w odniesieniu
SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09
SPRAWOZDANIE MOŻE BYĆ POWIELANE TYLKO W CAŁOŚCI. INNA FORMA KOPIOWANIA WYMAGA PISEMNEJ ZGODY LABORATORIUM. SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09 BADANIA WŁASNOŚCI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH
Gdańsk 10.10.2015 r.
Celiakia- czy nadążamy za zmieniającymi się rekomendacjami Gdańsk 10.10.2015 r. prof. dr hab. n. med. Barbara Kamińska Katedra i Klinika Pediatrii, Gastroenterologii, Hepatologii i Żywienia Dzieci Gdański
ROCZN. PZH, 1998, 49, 73-86
ROCZN. PZH, 1998, 49, 73-86 74 wane narzędzia i sprzęt medyczny. Przeniesienie grzybów Candida m oże nastąpić przez ręce personelu, bieliznę, pościel, sprzęt do pielęgnacji i leczenia. C elem pracy było
Genomic Mini AX Plant Spin
Genomic Mini AX Plant Spin Zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z materiału roślinnego. wersja 1017 100 izolacji Nr kat. 050-100S Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 15 μg.
Genomic Mini AX Milk Spin
Genomic Mini AX Milk Spin Zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z próbek mleka. wersja 1017 100 izolacji Nr kat. 059-100S Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 15 μg. Produkt
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r.
Narodowy Instytut Leków ul. Chełmska 30/34, 00-725 Warszawa Tel. 022 851-46-70, Fax. 022 841-29-49 www.korld.edu.pl Warszawa, dn. 21.10.2009r. Wytyczne postępowania w przypadku wykrycia szczepów pałeczek
RAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA R.
RAPORT 1.1/SRM/2017 Z BADAŃ PRZEWIDZIANYCH W UMOWIE Z DNIA 25.04.2017 R. OCENA SKUTECZNOŚCI MIKROBIOBÓJCZEJ URZĄDZENIA INDUCT 750 FIRMY ACTIVTEK WOBEC PAŁECZEK KLEBSIELLA PNEUMONIAE W POWIETRZU Wykonawcy:
RAPORT Z BADAŃ 01369/2015/D/AGST. Blirt S.A Gdańsk, ul. Trzy Lipy 3/1.38. Dział DNA-Gdańsk. Nr zlecenia
Strona1/7 Blirt S.A. 80-172 Gdańsk, ul. Trzy Lipy 3/1.38 RAPORT Z BADAŃ Dział DNA-Gdańsk Nr zlecenia 01369/2015/D/AGST NAZWA I ADRES KLIENTA Zenon Koszorz Ground-Therm Sp z o.o. Ul. Stepowa 30 44-105 Gliwice
Obecność laktoferyny w kale jako wskaźnik zakażenia Clostridium difficile u dzieci
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 1-8 Obecność laktoferyny w kale jako wskaźnik zakażenia Clostridium difficile u dzieci Presence of lactoferrin in faeces as the indicator of Clostridium difficile in pediatric
Oznaczenie sprawy AE/ZP-27-41/13 Załącznik Nr 1 Formularz Cenowy
Ozczenie sprawy AE/ZP-27-41/13 Załącznik Nr 1 Formularz Cenowy Ce brutto zamówienia - każdego pakietu powin stanowić sumę wartości brutto wszystkich pozycji ujętych w pakiecie, tomiast wartość brutto poszczególnych
Genomic Micro AX Swab Gravity Plus
Genomic Micro AX Swab Gravity Plus Zestaw do izolacji genomowego DNA z wymazów metodą grawitacyjną. W skład zestawu wchodzą wymazówki. wersja 0517 100 izolacji Nr kat. 105-100P Pojemność kolumny do oczyszczania
Krętki: Brachyspira spp
Krętki: Brachyspira spp Taksonomia Krętki (łac. Spirochaetes) długie i cienkie bakterie Gram-ujemne, przypominające korkociągi Poruszają się ruchami rotacyjnymi przy pomocy jedynych w swoim rodzaju wewnętrznych
Analysis of infectious complications inf children with acute lymphoblastic leukemia treated in Voivodship Children's Hospital in Olsztyn
Analiza powikłań infekcyjnych u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną leczonych w Wojewódzkim Specjalistycznym Szpitalu Dziecięcym w Olsztynie Analysis of infectious complications inf children with
Brucella sp. Małe pałeczki Gram ujemne
Brucella sp Małe pałeczki Gram ujemne Charakterystyka Brucella- małe Gramujemne ziarniakopałeczki Rosną szybko na podłożach bogatych w erytrytol, który obficie występuje również w łożysku ssaków. Wykazują
Zestaw przeznaczony jest do całkowitej izolacji RNA z bakterii, drożdży, hodowli komórkowych, tkanek oraz krwi świeżej (nie mrożonej).
Total RNA Mini Plus Zestaw do izolacji całkowitego RNA. Procedura izolacji nie wymaga użycia chloroformu wersja 0517 25 izolacji, 100 izolacji Nr kat. 036-25, 036-100 Zestaw przeznaczony jest do całkowitej
Plasmid Mini. 50 izolacji, 250 izolacji. Zestaw do izolacji plazmidów wysokokopijnych wersja Nr kat ,
Plasmid Mini Zestaw do izolacji plazmidów wysokokopijnych wersja 1016 50 izolacji, 250 izolacji Nr kat. 020-50, 020-250 Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 20 µg. 1 Skład zestawu Składnik 50 izolacji
GeneMATRIX Bacterial & Yeast Genomic DNA Purification Kit
GeneMATRI Bacterial & Yeast Genomic DNA Purification Kit Uniwersalny zestaw do oczyszczania DNA z bakterii Gram +, Gram - oraz drożdży kat. nr E3580 Wersja zestawu 1.1 Wrzesień, 2008 Uwaga: Minikolumny
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Oznaczenie sprawy AE/ZP-27-49/14 Załącznik Nr 1 Formularz Cenowy
Ozczenie sprawy AE/ZP-7-9/ Załącznik Nr Formularz Cenowy Ce brutto zamówienia - każdego pakietu powin stanowić sumę wartości brutto wszystkich pozycji ujętych w pakiecie, tomiast wartość brutto poszczególnych
Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
ĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI
ĆWICZENIE I BADANIE WRAŻLIWOŚCI BAKTERII NA ANTYBIOTYKI I CHEMIOTERAPEUTYKI Autor i główny prowadzący dr Dorota Korsak Wstęp Jednym z najważniejszych etapów rutynowej diagnostyki mikrobiologicznej zakażeń
VII. Pałeczki Gram-dodatnie: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus - ćwiczenia praktyczne
VII. Pałeczki Gram-dodatnie: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus - ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Wykonanie barwionych preparatów mikroskopowych preparat barwiony metodą Grama z
Krętki: Leptospira spp
Krętki: Leptospira spp Taksonomia Spirochaetes; Spirochaetes (klasa); Spirochaetales; Leptospiraceae Gatunki fenotypowe: L. alexanderi, L. alstoni, L. biflexa sp., L. borgpetersenii sp., L. fainei, L.
Recenzja E.ozprawy doktoe.skiej
Wrocław 2018-05-07 Recenzja E.ozprawy doktoe.skiej Mgr MaH ty Książczyk Pt" OkE eślenie czymmików wirueencji oraz analiza fieogenetyczna p zajeeitowych pat genmych oraz komensaemych szczepów E cftgffg
TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Badania kału wirusologiczne, bakteriologiczne i parazytologiczne
Badania kału wirusologiczne, bakteriologiczne i parazytologiczne PRZYJMOWANIE PRÓBEK KAŁU Badania wirusologiczne i parazytologiczne od poniedziałku do piątku od godz. 8 00 do godz. 11 00 Badania bakteriologiczne
Ocena rozprawy doktorskiej Pani lek. wet. Iwony Kozyry p.t. Molekularna charakterystyka zoonotycznych szczepów rotawirusa świń
Prof. dr hab. Zbigniew Grądzki Katedra Epizootiologii i Klinika Chorób Zakaźnych Wydział Medycyny Weterynaryjnej Uniwersytet Przyrodniczy w Lublinie Ocena rozprawy doktorskiej Pani lek. wet. Iwony Kozyry
Polimeraza Taq (1U/ l) 1-2 U 1 polimeraza Taq jako ostatni składniki mieszaniny końcowa objętość
Ćwiczenie 6 Technika PCR Celem ćwiczenia jest zastosowanie techniki PCR do amplifikacji fragmentu DNA z bakterii R. leguminosarum bv. trifolii TA1 (RtTA1). Studenci przygotowują reakcję PCR wykorzystując
Probiotyk świadomy wybór w oparciu o najnowsze badania naukowe
Probiotyk świadomy wybór w oparciu o najnowsze badania naukowe dr hab. n. med. Lucyna Ostrowska Kierownik Zakładu Dietetyki i Żywienia Klinicznego Uniwersytet Medyczny w Białymstoku Klasyfikacja probiotyków
Badanie na obecność pałeczek CPE Informacje dla pacjentów
Badanie na obecność pałeczek CPE Informacje dla pacjentów Uwaga: z pytaniami dotyczącymi informacji zawartych w tej ulotce, należy zwracać się do lekarza prowadzącego lub pielęgniarki. Czym jest CPE W
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11
PL 214501 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 214501 (13) B1 (21) Numer zgłoszenia: 391458 (51) Int.Cl. C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/29 (2006.01) Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej
WYTWARZANIE ŚLUZU POZAKOMÓRKOWEGO, A ADHEZJA PAŁECZEK ESCHERICHIA COLI DO POLISTYRENU
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 33-40 Patrycja Zalas-Więcek 1, Eugenia Gospodarek 1, Katarzyna Piecyk 2 WYTWARZANIE ŚLUZU POZAKOMÓRKOWEGO, A ADHEZJA PAŁECZEK ESCHERICHIA COLI DO POLISTYRENU 1 Katedra
PROBIOTYKI panaceum dla noworodka ZALECAĆ CZY NIE
PROBIOTYKI panaceum dla noworodka ZALECAĆ CZY NIE Dr hab.n.med. Andrea Horvath Klinika Pediatrii WUM Czy to są probiotyki? Żywe bakterie kiszonki jogurt naturalny kwas chlebowy Mikroorganizmy Organizm
Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM.
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: TERAPIA GENOWA Plan ćwiczeń Ćwiczenie 1: Przygotowanie warsztatu terapii genowej 1. Kontrola jakościowa preparatów plazmidowych paav/lacz,
Izolowanie DNA i RNA z komórek hodowlanych. Ocena jakości uzyskanego materiału
II ROK KIERUNEK WETERYNARIA UJCM INSTRUKCJA DO ĆWICZEŃ LABORATORYJNYCH VIII Izolowanie DNA i RNA z komórek hodowlanych. Ocena jakości uzyskanego materiału 2013/2014 2 ĆWICZENIE VIII Preparatyka całkowitego
Interpretacja wyników analiz ilości i obecności drobnoustrojów zgodnie z zasadami badań mikrobiologicznych żywności i pasz?
Wydział Biotechnologii i Nauk o Żywności Seminarium STC 2018 Interpretacja wyników analiz ilości i obecności drobnoustrojów zgodnie z zasadami badań mikrobiologicznych żywności i pasz? Dr inż. Agnieszka
Multilac Baby synbiotyk krople 5 ml
Multilac Baby synbiotyk krople 5 ml Cena: 9,98 PLN Opis słownikowy Postać Producent Promocje Rodzaj rejestracji Substancja czynna Krople USP ZDROWIE wakacyjna apteczka Suplement diety -, Fruktooligosacharydy,
Zakład Biologii Molekularnej, Wydział Farmaceutyczny, WUM.
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: TERAPIA GENOWA Plan ćwiczeń Ćwiczenie 1: Przygotowanie warsztatu terapii genowej 1. Kontrola jakościowa preparatów plazmidowych paav/lacz,
Zestaw do izolacji genomowego DNA z bakterii
Nr kat. EM02 Wersja: 1.2018 Zestaw do izolacji genomowego DNA z bakterii EXTRACTME jest zarejestrowanym znakiem towarowym BLIRT S.A. www.blirt.eu Nr kat. EM02 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME
StayRNA bufor zabezpieczający RNA przed degradacją wersja 0215
StayRNA bufor zabezpieczający RNA przed degradacją wersja 0215 100 ml, 250 ml, 500 ml Nr kat. 038-100, 038-250, 038-500 Nietosyczny roztwór wodny do przechowywania i zabezpieczania różnego rodzaju tkanek
Bakterie helikalne: Campylobacter sp.
Bakterie helikalne: Campylobacter sp. Rodzaj Campylobacter Campylobacter - bakterie należący do klasy epsilon- Proteobacteria. Gram-ujemne, mikroaerofilne Rosną w obecności 10% dwutlenku węgla, Spiralne,
WNOZ - DIETETYKA 13.10.2014 PODSTAWOWE METODY STOSOWANE W BAKTERIOLOGII METODY MIKROSKOPOWE MORFOLOGIA BAKTERII BAKTERIE GRAM-UJEMNE
WNOZ - DIETETYKA 13.10.2014 ĆWICZENIE 1 PODSTAWOWE METODY STOSOWANE W BAKTERIOLOGII PODŁOśA I WARUNKI HODOWLANE METODY MIKROSKOPOWE MORFOLOGIA BAKTERII BAKTERIE GRAM-UJEMNE 1. Cel badań mikrobiologicznych
Raport z badania Działanie wirusobójcze środka dezynfekującego wobec Feline calicivirus. 25 października 2006
Raport z badania Działanie wirusobójcze środka dezynfekującego wobec Feline calicivirus 25 października 2006 Dr Tobias J. Tuthill Wydział Nauk Biologicznych Uniwersytet Leeds Leeds LS2 9JT www.fbs.leeds.ac.uk
II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne. Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową
II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową Zasada metody: Krążki bibułowe nasycone odpowiednimi ilościami antybiotyków
X. Pałeczki Gram-dodatnie. Rodzaje: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus
X. Pałeczki Gram-dodatnie. Rodzaje: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothtix, Lactobacillus Gramujemne pałeczki auksotroficzne. Rodzaj: Haemophilus, Brucella, Legionella Ćwiczenie 1. Wykonanie preparatu
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Estabiom junior x 20 kaps + kredki ołówkowe GRATIS!!!
Estabiom junior x 20 kaps + kredki ołówkowe GRATIS!!! Cena: 21,65 PLN Opis słownikowy Dostępność Dostępny w aptece w 24h Opakowanie 20 kaps Postać Kapsułki Producent USP ZDROWIE Rodzaj rejestracji Suplement
Podsumowanie danych o bezpieczeństwie stosowania produktu leczniczego Demezon
VI.2 VI.2.1 Podsumowanie danych o bezpieczeństwie stosowania produktu leczniczego Demezon Omówienie rozpowszechnienia choroby Deksametazonu sodu fosforan w postaci roztworu do wstrzykiwań stosowany jest
Zestaw do izolacji plazmidowego DNA. Nr kat. EM01 Wersja zestawu:
Zestaw do izolacji plazmidowego DNA Nr kat. EM01 Wersja zestawu: 1.2012 www.dnagdansk.com Nr kat. EM01 I. PRZEZNACZENIE ZESTAWU Zestaw EXTRACTME PLASMID DNA przeznaczony jest do szybkiej i wydajnej izolacji
II. OZNACZANIE LICZBY BAKTERII Z GRUPY COLI I BAKTERII Z GRUPY COLI TYP FEKALNY METODĄ PŁYTKOWĄ W ŻYWNOŚCI I INNYCH PRODUKTACH wg PN-ISO 4832: 2007
Katedra i Zakład Mikrobiologii i Wirusologii Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Mikrobiologia ogólna Biotechnologia medyczna II rok / I o Temat: Żywność jako środowisko życia mikroorganizmów.
Katarzyna Jachna-Sawicka, Maja Kleszczyńska, Eugenia Gospodarek
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 221-228 Adhezja oraz wytwarzanie śluzu zewnątrzkomórkowego przez dzikie i kliniczne szczepy pałeczek Acinetobacter baumannii Adhesion and slime production by wild and clinical
Dostawy
Strona 1 z 5 Dostawy - 347310-2019 24/07/2019 S141 - - Dostawy - Dodatkowe informacje - Procedura otwarta I. II. VI. VII. Polska-Wałbrzych: Odczynniki laboratoryjne 2019/S 141-347310 Sprostowanie Ogłoszenie
Zakażenia szpitalne układu pokarmowego.
Zakażenia szpitalne układu pokarmowego. Fizjologiczna mikroflora układu pokarmowego Jama ustna i gardło Przełyk i żołądek Jelito cienkie Jelito grube Actinomyces Paciorkowce (S. mutans) Pałeczki beztlenowe
Gel-Out. 50 izolacji, 250 izolacji. Nr kat , Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617
Gel-Out Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617 50 izolacji, 250 izolacji Nr kat. 023-50, 023-250 Pojemność kolumny do izolacji DNA - do 20 µg DNA, minimalna pojemność - 2 µg DNA (przy zawartości
ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW
UNIWERSYTET MARII CURIE-SKŁODOWSKIEJ WYDZIAŁ BIOLOGII I BIOTECHNOLOGII ZAKŁAD BIOLOGII MOLEKULARNEJ ĆWICZENIA Z MECHANIZMÓW DZIAŁANIA WYBRANYCH GRUP LEKÓW dla studentów I roku II 0 biotechnologii medycznej
Estabiom baby krople 5 ml + kredki ołówkowe GRATIS!!!
Estabiom baby krople 5 ml + kredki ołówkowe GRATIS!!! Cena: 27,55 PLN Opis słownikowy Postać Krople Producent USP ZDROWIE Promocje Wybór Farmaceuty Rodzaj rejestracji Suplement diety Substancja czynna
PL B1. ZACHODNIOPOMORSKI UNIWERSYTET TECHNOLOGICZNY W SZCZECINIE, Szczecin, PL BUP 08/12. EDYTA BALEJKO, Mierzyn, PL
PL 217389 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217389 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 392559 (22) Data zgłoszenia: 04.10.2010 (51) Int.Cl.
CZĘŚĆ IV METODY BIOTECHNOLOGICZNE W OCHRONIE ŚRODOWISKA ZASTOSOWANIE WIRUSÓW BAKTERYJNYCH DO OCENY JAKOŚCI I CZYSTOŚCI WODY
CZĘŚĆ IV METODY BIOTECHNOLOGICZNE W OCHRONIE ŚRODOWISKA ĆWICZENIE: ZASTOSOWANIE WIRUSÓW BAKTERYJNYCH DO OCENY JAKOŚCI I CZYSTOŚCI WODY PROWADZĄCY: dr Agnieszka Kwiatek CEL Celem ćwiczeń jest zapoznanie
Zalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase
Zalecenia dotyczące postępowania w przypadku identyfikacji w zakładach opieki zdrowotnej szczepów bakteryjnych Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy typu KPC * * KPC - ang: Klebsiella pneumoniae
Anna Zmelonek, Przemys³aw Znamirowski, Karolina Ziaja, Ma³gorzata Nowak
Studia Medyczne Akademii Œwiêtokrzyskiej tom 4 Kielce 2006 Anna Zmelonek, Przemys³aw Znamirowski, Karolina Ziaja, Ma³gorzata Nowak Klinika Neonatologii Katedry Ginekologii i Po³o nictwa Collegium Medicum