Kosm os. PROBLEMY NAUK BIO LOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
|
|
- Sabina Barańska
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Tom 48, 1999 Numer 2 (243) Strony Kosm os PROBLEMY NAUK BIO LOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Ew a J a r u g a Pracownia Molekularnych Podstaw Starzenia Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN Pasteura 3, Warszawa karla@nencki.gou.pl. Są rzeczy, które się dostrzega tylko dlatego, że do niczego nie pasują Canetti UDZIAŁ TELOMERÓW W REGULACJI PODZIAŁÓW KOMÓRKOWYCH I STARZENIU Naukowcy tworzą teorię stawiając i weryfikując doświadczalnie kolejne hipotezy. Z niepokojem spodziewają się odkrycia czegoś, co zupełnie do tej teorii nie pasuje. Bywa, że wierni do końca posuwają się wręcz do paradoksalnych wyjaśnień istnienia wyjątków. Czasem jednak, te zaskakujące odkrycia stymulują tak bardzo, że odważają się wyznaczać nowe kierunki badań. Tak było w 1961 roku, kiedy H a yflic k i M o o rh ea d obalili mit o nieśmiertelności prawidłowych komórek hodowanych in vitro. Wykazali, że komórki w hodowli starzeją się, czego odzwierciedleniem jest zanik ich zdolności replikacyjnych. Co ciekawsze, długość życia komórki w hodowli nie zależy od rzeczywistego czasu prowadzenia hodowli, lecz najwyraźniej jest odmierzana liczbą podziałów komórkowych (H a yflick i M o o rh ea d 1961, H a yflic k 1965)! Jakiż więc mechanizm odpowiada za liczenie podziałów w komórce? W 1973 roku, O lo v n ik o v zwrócił uwagę na problem replikacji końca w liniowym DNA. Zauważył, że każda potomna cząsteczka DNA ma niekompletny koniec 5. Wynika to z właściwości polimerazy DNA, która syntetyzując wyłącznie w kierunku 5-3 nie może wypełniać luki po usuniętym starterze RNA (Ryc. 1). Prowadzi to do obserwowanego w komórkach somatycznych zjawiska skracania terminalnych fragmentów chromosomów (tzw. telomerów) i to w tempie par zasad na rundę replikacyjną (G re id e r i H a rle y 1996)! Jednakże, założenie przekazywania zygocie pełnej informacji genetycznej w komórkach rozrodczych wykluczało możliwość skracania tam telomerów. Zasugerowano więc istnienie mechanizmu przeciwdziałającego systematycznej utracie DNA. Spodziewano się go znaleźć nie tylko w komórkach rozrodczych, ale także w Ryc. 1. Zjawisko niepełnej replikacji liniowego DNA. A. Synteza potomnego DNA (szary) w kierunku 5-3 zachodzi równocześnie na obu niciach macierzystego DNA (czarny). Widełki replikacyjne rozchodzą się w przeciwnych kierunkach od miejsca rozpoczęcia replikacji, co oznacza, że każda nić potomna jest syntetyzowana po części w sposób ciągły i po części za pomocą fragmentów Okazaki. B. Rozpoczynanie syntezy DNA od krótkich fragmentów RNA (starter) i jej przebieg wyłącznie w kierunku 5-3 uniemożliwia wypełnienie luki po usunięciu końcowych starterów z nici potomnych.
2 256 E w a J a r u g a tych, gdzie nie obserwuje się skracania telomerów na przykład w drożdżach czy orzęskach. W 1985 roku G r e id e r i B l a c k b u r n zidentyfikowały u jednego z gatunków orzęska, Tetrahymena thermophila, terminalną transferazę telomerową, w skrócie telomerazę. Enzym o aktywności odwrotnej transkiyptazy specyficznie wydłuża wystający koniec 3 DNA na podstawie wewnętrznej matrycy RNA (Ryc. 2). Aktywność telomerazową stwierdzono także w komórkach nowotworowych wiążąc z tym ich cechę nieśmiertelności, czyli zdolności do nieograniczonych podziałów w hodowli (S h a y 1997). podziałów (limit Hayflicka) powoduje zatrzymanie proliferacji. Oczywiście możliwe jest przekroczenie limitu podziałów na drodze mutacji czy ekspresji genów białek onkogennych lub genów supresorów nowotworu. Jednak bez wyłączenia licznika podziałów przez aktywację telomerazy, prowadziłoby to do dalszego skracania telomerów, a w następstwie do kolejnej blokady podziałów i śmierci. Immortalizacja (unieśmiertelnienie) komórek wymaga więc stałego sygnału do proliferacji, zatrzymania sygnału do kontrolowanej śmierci komórki (apoptozy) oraz aktywacji telomerazy. Ryc. 2. Mechanizm przeciwdziałania skracaniu telomerów. A. Przed replikacją, do końca 3 macierzystego DNA dołącza telomeraza enzym o aktyw n ości odw rotnej transkryptazy z wbudowaną matrycą RNA. B. Na podstawie wewnętrznej matrycy RNA, telomeraza syntetyzuje fragment DNA (szara, przerywana linia). C. Luka po usuniętym starterze znajduje się na wysokości fragmentu DNA syntetyzowanego przez telomerazę, nie zaś macierzystego DNA. W 1992 roku H a r l e y i współautorzy sformułowali telomerową hipotezę starzenia komórek somatycznych. Założyli oni, że aktywna w komórkach płciowych telomeraza utrzymuje stałą długość telomerów i zapewnia przekazanie zygocie pełnej informacji genetycznej. Represja aktywności telomerazy w komórkach somatycznych przyczynia się do skracania telomerów z każdą rundą replikacyjną. Uzyskanie krytycznej długości telomerów po określonej liczbie Nadal bez odpowiedzi pozostają pytania dotyczące mechanizmów kontroli długości telomerów, ich udziału w regulacji cyklu komórkowego podczas starzenia in vitro i immortalizacji. Artykuł ten ma na celu przybliżenie molekularnych podstaw telomerowej teorii starzenia ze szczególnym uwzględnieniem możliwości przekazywania sygnałów od skracanych telomerów do białek regulujących cykl komórkowy. CYKL CYKLOWI NIERÓWNY? W świetle telomerowej teorii starzenia wydaje się, że metabolizm telomerów wyznacza etapy życia komórki przez określenie tempa proliferacji, limitu podziałów czy możliwości immortalizacji. W jaki sposób systematyczne skracanie telomerów mogłoby wpływać na regulację cyklu
3 Udział telomerów w podziałach komórkowych 257 komórkowego? Możliwe są następujące odpowiedzi: zatrzymanie podziałów stanowi blokadę cyklu w określonym punkcie kontrolnym (restrykcyjnym) w odpowiedzi na skrócenie telomerów poniżej pewnej krytycznej długości (starzenie komórkowe in vitro jako proces nieliniowy), zatrzymanie podziałów jest końcowym etapem ciągłego procesu w czasie hodowli, kiedy molekularne mechanizmy zaangażowane w regulację cyklu komórkowego ulegają zmianie z cyklu na cykl wraz ze skracającymi się telomerami (starzenie komórkowe in vitro jako proces liniowy). Podstawą w rozwiązaniu tego problemu jest ustalenie modelu cyklu komórkowego. Powszechnie akceptowany model Pardee zakłada, że komórki zwykle są w fazie spoczynkowej Go, a proliferacja jest zjawiskiem przejściowym, indukowanym mitogenem i zachodzącym po przejściu punktów restrykcyjnych cyklu. Starzenie komórkowe w świetle tego modelu, polega na zatrzymaniu cyklu w punkcie restrykcyjnym Gi/S mimo obecności w pożywce mitogenów. Konkurencyjny model cyklu przedstawił Baisch. Uważa on, że proliferacja jest ciągłym procesem modyfikowanym w czasie w ten sposób, że poszczególne fazy cyklu to znaczy Gi, S, G2 ulegają wydłużaniu, a komórki starzejąc się przechodzą z wydłużonej fazy Gi do fazy spoczynkowej Go (Shackney i Shankey 1999). Dzięki analizie cytometrycznej tempa proliferacji wykazano, że komórka starzejąc się in vitro rzeczywiście zmniejsza szybkość syntezy DNA. Obserwowano, bowiem heterogenną, pod względem długości poszczególnych faz cyklu, pulę komórek w hodowli. Odpowiadałoby to modelowi cyklu komórkowego Baisch a, w którym utrata zdolności do proliferacji jest końcowym etapem wydłużania faz cyklu, nie zaś raptownym zatrzymaniem podziałów (Baisch i O t t o 1993). W związku z tym rodzą się pytania: - Co powoduje wydłużanie poszczególnych faz cyklu wraz z kolejnymi podziałami? - Czy te same mechanizmy odpowiadają za wydłużanie faz i zatrzymanie proliferacji? - Czy są to mechanizmy odwracalne i w związku z tym prowadzą do immortalizacji komórek? REGULACJA TEMPA PROLIFERACJI Na decyzję komórki o proliferacji ma wpływ szereg czynników, które można uporządkować w podstawowe trzy szlaki: (1) szlak przekazywania sygnału do proliferacji, (2) szlak przekazywania sygnału wyłączającego proliferację, (3) szlak do apoptozy. Centralnym punktem podejmowania decyzji jest białko Rb będące produktem genu supresoru nowotworu (recesywna mutacja Rb odpowiada za powstawanie nowotworu siatkówki oka retinoblastomy). Z jednej strony, Rb leży na drodze przekazywania sygnału do proliferacji przez oddziaływanie z niezbędnym dla syntezy DNA czynnikiem transkrypcyjnym E2F, a z drugiej strony niesie informację o wyłączeniu sygnału do proliferacji za pośrednictwem białka p l6 INK4a (kompetycyjnego inhibitora kinaz CDK4 i CDK6 zależnych od cyklin D). Ten układ (Ryc. 3), jeśli działa poprawnie, gwarantuje przekazanie sygnału od mitogenu przez białka Ras/Raf, kompleks cykliny D z kinazami CDK4 lub CDK6 (CDK4/6) i prowadzi do zależnej od mitogenu fosforylacji białka Rb. Ufosforylowane białko Rb przestaje już być aktywnym inhibitorem czynnika transkrypcyjnego E2F. Uwolniony czynnik E2F uruchamia transkrypcję genów Ryc. 3. Schemat regulacji proliferacji. Sygnał od mitogenu przekazywany jest na drodze Ras/Raf i kinaz zależnych od cykliny D do czynnika transkrypcyjnego E2F. Z chwilą aktywacji transkrypcji genu dla cykliny E, sygnał do proliferacji uniezależnia się od mitogenu. Jednocześnie, w obecności ufosforylowanego białka Rb wzrasta poziom transkryptów dla białka pl6, które jest inhibitorem cyklino-zależnych kinaz CDK4/6. Dodatkowo, w sytuacji uszkodzenia DNA, sygnał do proliferacji może być zatrzymany przez białko p21 zależne od p53.
4 258 E w a J a r u g a niezbędnych dla syntezy DNA. E2F powoduje także wzrost poziomu cykliny E, która w kompleksie z kinazą CDK2 wspomaga kompleksy cykliny D z CDK4/6 w fosforylacji (inaktywacji) Rb. Tym razem jednak, fosforylacja Rb jest niezależna od mitogenu, a sygnał do proliferacji zostaje spotęgowany. Z drugiej strony, w obecności ufosforylowanej formy Rb obserwuje się wzrost poziomu białka p l6 K4a, będącego inhibitorem kinaz CDK4/6. Następuje sprzężenie zwrotne - hamowanie fosforylacji białka Rb, co przerywa sygnał do proliferacji. Jednocześnie, zachodzi defosforylacja białka Rb przywracająca stan wyjściowy komórce i umożliwiająca ponowne odebranie sygnału do proliferacji w obecności mitogenu. W regulacji cyklu komórkowego, prócz węzła Rb, istotną rolę odgrywa także system p53. Stanowi on strażnicę genomu, gdyż w obecności uszkodzonego DNA zatrzymuje proliferację, uruchamia mechanizmy naprawcze, a w przypadku niemożliwości naprawy przekazuje sygnał włączający apoptozę. Białka zaangażowane w te procesy są koordynowane właśnie przez czynnik transkrypcyjny p53. Jego poziom w normalnych warunkach jest bardzo niski. Pod wpływem uszkodzenia DNA, wzrasta ilość białka p53 oraz jego zdolność wiązania DNA i aktywacji transkrypcji genów. Białko p53 zwiększa ekspresję między innymi białka p21cipl będącego produktem genu WAF1 /Cipi. Białko p21cip jest inhibitorem cyklino-zależnych kinaz między innymi CDK4/6 i należy do grupy negatywnych regulatorów proliferacji,podobnie jak wcześniej opisywane białko p l6 (dokładny opis regulacji cyklu komórkowego podczas starzenia znaleźć można w artykule Ewy R adziszew sk iej w tym numerze KOSMOSU). Warto zauważyć, że ten sam efekt zatrzymania podziałów może nastąpić zarówno w wyniku braku czynników wzrostowych, uszkodzenia, jak i starzenia komórki. Jednak mechanizmy wywołujące ten efekt wydają się być różne. Obserwuje się bowiem podstawowe różnice w odwracalności blokad proliferacyjnych i możliwości wywołania programu apoptozy (o apoptozie: patrz Cummings i współaut. 1997). 1. Molekularnym podłożem zatrzymania podziałów komórek głodzonych jest aktywne (nieufosforylowane) białko Rb. Dostarczenie czynników wzrostowych prowadzące do inaktywacji (fosforylacji) Rb zwalnia blokadę. Generalnie, włączenie sygnału do proliferacji przez mitogen, a więc aktywacja drogi Ras/Raf, chroni komórkę przed apoptozą. Aktywowane są bowiem antyapoptotyczne białka z rodziny Bcl-2 (K elek a r i Thompson 1998). Brak czynników wzrostowych często prowadzi natomiast do programowanej śmierci komórki (S ik ora 1994, Pandey i W ang 1995, Evan i współaut. 1995). 2. Zatrzymanie proliferacji komórek w wyniku uszkodzenia DNA odbywa się przez wzrost poziomu i aktywności czynnika transkrypcyjnego p53 oraz indukowany przezeń wzrost poziomu białka p21cipl. Jednocześnie, przekazywany jest sygnał do apoptozy między innymi przez inaktywację antyapoptotycznych białek z rodziny Bcl-2 (H a rris 1996, K ou zarid es 1995). 3. W starych komórkach obserwuje się podwyższony poziom i aktywność białka p53 oraz podwyższony J poziom ubiałek i i p21 o i Cip ^ 1 i Lp 1cINK4a 16 (Bond i współaut. 1996, Sekiguchi i H u n ter 1998, R o b le s i Adami 1998). Co ciekawe, zwiększanie poziomu tych białek nie zachodzi równocześnie! Komórki w stadium tuż przed zatrzymaniem podziałów (ang. pre-senescence) wykazują wysoki poziom białka p53 o wysokiej zdolności wiązania DNA i transaktywacji genu WAF/Cipl. Aktywność ta zaczyna spadać po wejściu komórek w etap blokady proliferacji (ang. senescence). W tym czasie obserwuje się także przejściowy wzrost poziomu białka p21cipl. Dopiero gdy ten ostatni zaczyna spadać, jako trzeci w kolejności wzrasta poziom białka pl6ink4a. W przeciwieństwie do p53 i p21cipl, białko pl6* 4a utrzymuje wysoki poziom podczas trwania nieproliferacyjnej fazy hodowli komórek (R o b les i Adami 1998). Ciekawe, że komórki stare, w porównaniu z młodymi, mniej chętnie włączają program apoptozy (Sikora 1993, 1994). W świetle tych wyników, starzenie replikacyjne prawidłowych komórek w hodowli jest nieodwracalnym zatrzymaniem podziałów, czemu towarzyszy między innymi wzrost poziomu białek p53, p21cipl i p l6 IN 4a. To rodzi kolejne pytania: - Co powoduje wzrost poziomu białek p53, p21 pl i pl6ink4a w późnej fazie replikacyjnego życia komórek? _,. c o m Cip 1. c INK4a - Czy wzrost poziomu p53, p21 H ip l6 ma związek ze skracaniem telomerów? PIERWOTNA PRZYCZYNA MOLEKULARNYCH OBJAWÓW STARZENIA USZKODZENIE DNA CZY ZMIANA STRUKTURY CHROMATYNY? Niewątpliwie niedoskonałość procesu replikacji DNA sugestywnie wskazuje na skracanie telomerów, jako pierwotną przyczynę procesu starzenia komórek. Wiemy, że telomery pełnią
5 Udział telomerów w podziałach komórkowych 259 istotne funkcje w życiu komórki takie jak ochrona przed fuzją i degradacją chromosomów, zakotwiczenie ich w otoczce jądrowej, udział w segregacji chromosomów podczas mitozy i regulacja aktywności genów (M cc l in t o c k 1940, B l a c k b u r n 1991, K u r e n o w a i M a s o n 1997). O ile pierwsze trzy zadania sugerują jedynie mechaniczne znaczenie zakończeń chromosomów, o tyle ostatnie podnosi sprawę ich aktywnego wpływu na geny. W jaki sposób komórka odbiera informację o długości telomerów? Czy mechanizm wyczuwający zmiany długości może także przekazać sygnał do wzrostu aktywności białka p53? Czy na poinformowaniu jedynie się kończy, czy też ten sam mechanizm potrafi przeciwdziałać skracaniu telomerów (np. przez aktywację telomerazy)? Odpowiedź na te pytania określiłaby udział telomerów w zjawiskach zarówno prawidłowego zatrzymania proliferacji po czasie wyliczonym podziałami jak i w nieprawidłowym przekroczeniu limitu Hayflicka i unieśmiertelnianiu komórek. Dane literaturowe wskazują na dwa sposoby zatrzymywania proliferacji przez skracające się telomery: (1) na drodze przekazywania sygnału o uszkodzeniu DNA oraz (2) poprzez zmianę stanu funkcjonalnego chromatyny z transkiypcyjnie nieaktywnego w aktywny (W r ig h t i S h a y 1995). Nie jest wykluczone, że oba te mechanizmy w rzeczywistości współdziałają ze sobą (Ryc. 4). W pierwszym przypadku, mechanizm wyczuwający zmianę długości telomerów generowałby sygnał o uszkodzeniu DNA, który prowadziłby do aktywacji czynnika transkrypcyjnego p53. Ekspresja zależnego od p53 białka p2 l Cipl uniemożliwiłaby przeprowadzenie fosforylacji białka Rb, a tym samym zablokowałaby syntezę DNA (Ryc. 3). Cykl komórkowy zatrzymałby się w fazie Gi. Tymczasem, p53 powodowałoby także wzrost ekspresji białek uczestniczących w procesach naprawczych DNA (np. GADD45, ang. growth arrest and DNA damage inducible) (M a r x 1994, H a r r is 1996). O ile wydarzenia zależne od p53 są dość znane, nadal otwartym pozostaje pytanie, co znajduje się pomiędzy uszkodzeniem DNA (tu: skróconym telomerem) a białkiem p53? Poszukiwane białko powinno mieć domenę rozpoznającą uszkodzony fragment DNA oraz domenę wiążącą DNA. Powinno także wykazywać aktywność katalityczną umożliwiającą post-translacyjną modyfikację na Rys. 4. Molekularne podstawy telomerowej hipotezy starzenia komórek. Skracanie telomerów w wyniku niepełnej replikacji liniowego DNA może być odbierane jako sygnał o uszkodzeniu DNA lub jako sygnał o zmianie struktury chromatyny. Elementy obu tych szlaków oddziaływują na siebie, przy czym białkiem na rozdrożu jest Ku.
6 260 Ew a J aruga przykład fosforylację, rozpoczynającą kaskadę sygnałów do efektora (np. p53, Rb). Sądzi się, że w rozpoznawaniu uszkodzeń DNA i przekazywaniu sygnału do p53 biorą udział co najmniej dwa białka: ATM (ang. AT mutated, produkt genu ATM, którego mutacja prowadzi do zespołu ataxia telangiectasia) oraz PARP (ang. poły ADP-ribose polymerase, enzym przenoszący grupę ADP-iybozy z NAD+ na substrat). Oba występują w jądrach komórkowych u większości Eukaiyota, z wyjątkiem drożdży, które nie posiadają PARP. Produkt genu ATM wykazuje aktywność kinazy białkowej zależnej od DNA. W komórkach ssaczych, stanowi katalityczną podjednostkę dużego kompleksu enzymatycznego, w skład którego wchodzi białko Ku, rozpoznające w DNA miejsca podwójnych pęknięć. Za sprawą białka Ku, kompleks wiąże się z tępymi lub wystającymi końcami DNA oraz ze strukturami szpilki do włosów. Uczestniczy w procesach naprawy i rekombinacji DNA chroniąc je przed nukleolityczną degradacją (Jackson i J e g g o 1995, S h o re 1998, B e rtu c h i Lundblad 1997). ATM, będąc kinazą białkową, może fosforylować substrat związany z DNA na przykład czynnik transkiypcyjny czy polimerazę. Niestety, brak bezpośrednich dowodów na to, że p53 jest dlań substratem. O regulacyjnej funkcji ATM względem p53 wnosi się zatem na podstawie doświadczeń przeprowadzonych na fibroblastach ze zmutowanym genem ATM (w skrócie: fibroblasty AT). Fibroblasty AT wykazują upośledzenie mechanizmów naprawczych, niestabilność genomu, nadwrażliwość na promieniowanie jonizujące, przyśpieszony proces starzenia komórkowego i równie przyśpieszone tempo skracania telomerów! Nie wykazano w nich typowej odpowiedzi na podwójne pęknięcia DNA zamiast szybkiego wzrostu poziomu i aktywności białka p53, obserwowano opóźnioną i zredukowaną reakcję. Wyniki te sugerują, że uszkodzenie genu ATM wpływa na upośledzenie punktu kontrolnego cyklu, w którym p53 odgrywa kluczową rolę (Enoch i N o rb u ry 1995). Z drugiej strony, starzejące się fibroblasty AT wykazują podwyższoną aktywność transkrypcyjną p53, mimo niskiego poziomu tego białka. Powodem wzrostu aktywności bez akumulacji p53 może być jego post-translacyjna modyfikacja. Zwiększony okres półtrwania wykazuj e także białko p21 ip 1. Oba te fakty wskazują na nieprawidłową regulację białek p53 i p21cipl przyśpieszającą starzenie komórek ze zmutowanym genem ATM. O zależności białek p53 i p21 ipl od ATM podczas starzenia in vitro świadczy także to, że fibroblasty AT pozbawione ekspresji białek p53 lub p21cipl nie wykazują cech przyśpieszonego starzenia i proliferują w tym samym tempie, co normalne fibroblasty (Vaziri i współaut. 1997, Xu i współaut. 1998). Drugim z proponowanych białek uczestniczących w przekazywaniu informacji o uszkodzeniu DNA jest PARP. Występuje ono w ją drach większości komórek eukaryotycznych z wyjątkiem drożdży. PARP wiąże się z uszkodzonym DNA i przeprowadza syntezę polimerów ADP-rybozy. Tworzą one ujemnie naładowane łańcuchy, które rozpychają nici DNA i eksponują miejsca przeznaczone do naprawy (Lindahl i współaut. 1995). Rola PARP nie ogranicza się tylko do zmian struktury chromatyny. Pokazano, że zarówno in vitro jak i in vivo możliwe jest tworzenie kompleksów p53 z PARP. Zasugerowano, że poli ADP-rybozylacja zwiększa aktywność p53 w odpowiedzi na uszkodzenia DNA i przyczynia się do zahamowania proliferacji. Potwierdzeniem tej hipotezy był fakt, że inhibitory PARP znosiły zależną od p53 ekspresję białka p21cipl, czemu towarzyszyło zwiększenie liczby podziałów komórki (Vaziri i współaut. 1997). Drugim wspomnianym sposobem zatrzymywania proliferacji przez skracający się telomer jest, jak się sugeruje, aktywacja genów leżących w subtelomerowym obszarze chromosomu (Ryc. 4). Obszar ten stanowi część wysoce skondensowanej, a więc transkiypcyjnie nieaktywnej struktury zwanej heterochromatyną, która ulega replikacji pod koniec fazy S (upakowanie DNA w komórce: K ły s z e jk o -S ta fa n o w ic z 1995a). Wywołane skracaniem telomeru rozluźnienie chromatyny prowadziłoby do aktywacji wyciszonych genów kodujących na przykład kinazy czy fosfatazy białek regulatorowych cyklu komórkowego. Poparcie tej hipotezy znaleziono obserwując drożdże Saccharomyces cerevisiae. Okołotelomerowy obszar ich genomu utrzymywany jest w stanie transkrypcyjnie nieaktywnym dzięki współdziałaniu histonów i białek Sir (ang. silent information regulatory proteins), które wiążą dwuniciowy obszar telomerowego DNA (Kure- NO W AiM ASO N 1997). Histony H4, H3, PI2A i H2B tworzą oktamer, przypominający dodatnio naładowaną szpulkę, na którą nawinięta jest ujemnie naładowana nić DNA. Za upakowanie chromatyny w struktury wyższego rzędu odpowiada kompleks białek Sir. Zaobserwowano, że represja aktywności genów nie zależy od rodzaju, ale od położenia tych genów (ang telomere position effect). Gen wprowadzony w subtelomerowy obszar DNA ulega wyciszaniu, a najciekawsze jest to, że zasięg wyciszania (obszar heterochromatynowy) zależy od długości telomeru (G o tts c h lin g i współaut. 1990)!
7 Udział telomerów w podziałach komórkowych 261 Warto zwrócić uwagę na fakt, że białka Sir nie posiadają domeny wiążącej DNA (G runstein 1997). Wymagają więc platformy, na której mogłyby spełniać swoje funkcje. Histony wiążąc DNA i tworząc kompleksy z białkami Sir stanowią miejsce regulacji struktury chromatyny. Na przykład acetylacja histonu H4, neutralizuje pozytywny ładunek białka, przyczyniając się do odłączenia par H2A z H2B z oktameru i osłabienia wiązania histon-dna, co w rezultacie rozluźnia chromatynę odsłaniając miejsca regulatorowe dla czynników transkrypcyjnych (G runstein 1992). Ale histony nie są jedynymi białkami, z którymi białka Sir tworzą kompleksy. Rolę platformy mogą bowiem spełniać cząsteczki białka Raplp (ang. repressor-activator protein 1) uznane za podstawowy element mechanizmu określającego długość telomerów (M arcand i współaut. 1997). Oznacza to, że istnieje związek między wyczuwaniem długości telomeru a kontrolą aktywności genów położonych w subtelomerowym obszarze. Uważa się, że właśnie białko Raplp warunkuje istnienie heterochromatyny na terenie telomeru, gdyż na platformie Raplp budowany jest wielobiałkowy kompleks białek Sir (Sir2, Sir 3, Sir4) stabilizowany histonami (H4, H3) (G runstein 1997). Wraz ze skracaniem telomerów, obserwuje się zmniejszanie liczby związanych z DNA cząsteczek białka Raplp, co ogranicza możliwość wiązania cząsteczek białka Sir, a tym samym wpływa na rozluźnianie struktury chromatyny. Chyba najbardziej zaskakującym odkryciem z dziedziny metabolizmu telomerów było pokazanie możliwości powstawania kompleksu między białkami Sir i Ku (Tsukam oto i współaut. 1997)! Znaleziono więc wspólne elementy szlaku wiodącego do zmian struktury chromatyny i szlaku naprawy podwójnych pęknięć DNA (Jackson 1997). Pokazano, że nie ma pełnego efektu wyciszania genów przez białka Sir bez funkcjonalnego Ku i nie ma optymalnych warunków do naprawy podwójnych pęknięć DNA przez białko Ku, gdy nie towarzyszą mu białka Sir (Tsukam oto i współaut. 1997, B o u l to n i Jackson 1998). Zasugerowano, że białko Ku rekrutuje białka Sir do telomerowęgo DNA i w ten sposób wywołuje lokalną zmianę struktury chromatyny. Wydaje się, że pełny efekt wyciszania genów przez białka Sir możliwy jest dopiero po upakowaniu końca telomeru w heterochromatynową strukturę za sprawą kompleksu białek Sir i Ku. Z drugiej strony, zlokalizowane unieruchomienie DNA w miejscu rozpoznanego uszkodzenia ułatwia naprawę, gdyż eksponuje pęknięcia na działanie enzymów naprawczych, a przy tym hamuje niesprzyjające naprawie procesy jak na przykład transkrypcja (Jackson 1997). U drożdży Saccharomyces cerevisiae, białka Raplp, Sir i Ku wydają się być pierwszymi efektorami zmian długości telomerów w związku z niepełną replikacją DNA. Na tym poziomie rozchodzą się drogi sygnału do naprawy DNA lub aktywacji wyciszonych genów. Czy te same mechanizmy zaangażowane są w regulację aktywności telomerazy? Dzięki zachowaniu równowagi między skracaniem telomerów w wyniku niepełnej replikacji a syntezą nowych odcinków po aktywacji telomerazy, długość telomerów drożdży utrzymywana jest na stałym poziomie (czego nie można powiedzieć o komórkach ssaczych!). Informacja o długości telomerów zawarta jest w liczbie cząsteczek białka Raplp związanych z DNA. Te z nich, które nie są zaangażowane w tworzenie heterochromatyny z białkami Sir, tworzą kompleksy z białkami Riflp i Rif2p (ang. Raplp interacting factor proteins) pełniąc funkcję inhibitora telomerazy. Zmniejszenie liczby cząsteczek Raplp na telomerowym DNA znosi blokadę enzymu. Telomeraza dosyntetyzowuje powtórzenia TG 1-3 serwując miejsca dla wiązania brakujących Raplp. Pod tym względem, komórka drożdżowa jest nieśmiertelna... Ciekawe, czy analogiczny proces aktywacji telomerazy można zaobserwować w przypadku unieśmiertelniania komórek ssaczych? W komórkach ssaczych funkcję białka Rap 1 pełni białko TRF1. Wspomniane wcześniej białko Ku nie działa niezależnie, ale jest podjednostką dużego kompleksu kinazy białkowej zależnej od DNA, będącej produktem genu z rodziny ATM. Nie stwierdzono natomiast w komórkach ssaczych obecności białek odpowiadających kompleksom Sir, choć znaleziono pewną homologię między białkiem Sir 4 a laminem blaszki jądrowej. MOLEKULARNE PODSTAWY TELOMEROWEJ HIPOTEZY STARZENIA LUDZKICH KOMÓREK PODSUMOWANIE W świetle przedstawionych prac, metabolizm telomerów wpływa na regulację proliferacji. Dynamiczna równowaga między efektem niepełnej replikacji a aktywacją telomerazy określa w życiu komórki różne fazy: (1) fazę podziałów komórkowych kontrolowanych sprawnymi sy
8 262 E w a J a r u g a stemami Rb/pl6INK4a i p53/p21cipl (2) fazę starzenia replikacyjnego z nadmiernymi aktywnościami p53, p21clp, p l6 INK4a oraz (3) fazę immortalizacji z zablokowaną drogą Rb/ p 16INK4a i aktywną telomerazą. Długie telomery młodych, prawidłowych komórek somatycznych są miejscem wiązania dużej liczby cząsteczek TRF1 hamujących aktywność telomerazy (S te e n s e l i Lange 1997). Negatywnym regulatorem telomerazy jest także funkcjonalne białko Rb (Xu i współaut. 1997). Rzeczywiście, w prawidłowych komórkach somatycznych aktywność telomerazy ulega represji lub jest utrzymywana na niskim poziomie (Buchkovich i G re id e r 1996, Pan i współaut. 1997), przez co dynamiczna równowaga pomiędzy niepełną replikacją a syntezą DNA przesuwa się w stronę skracania telomerów. Do wystających końców 3 DNA dołączają cząsteczki białka Ku z resztą kompleksu kinazy białkowej. Sugeruje się, że białko Ku lokalnie wycisza transkrypcję (inaktywacja polimerazy RNA II) i uczestniczy w tworzeniu obszarów heterochromatynowych unieruchamiających uszkodzone fragmenty DNA. Niewykluczone, że rolę drożdżowych białek Sir w komórkach ludzkich odgrywają białka blaszki jądrowej, które zakotwiczają domeny chromatynowe i są niezbędne do inicjacji replikacji DNA (o laminach patrz: K ły s z e jk o -S ta fa n o w ic z 1995b). Proliferacja trwa. Swoisty mecz na granicy Gi/S rozgrywają acetylazy i deacetylazy histonowe, których zadaniem jest kontrola upakowania chromatyny. Aktywne, nieufosforylowane białko Rb utrzymuje przy chromatynie deacetylazę histonową, która uszczelnia strukturę chromatyny czyniąc ją transkrypcyjnie nieaktywną (Luo i współaut. 1998). Pod wpływem kinaz, Rb ulega inaktywacji i zwalnia deacetylazę. Teraz możliwe jest przeprowadzenie acetylacji histonów przez białka z rodziny p300/cbp (Shikama i współaut. 1997, G ile s i współaut. 1998). Niewykluczone, że kinazą aktywującą białka p300/cbpjest właśnie ATM. Chromatyna staje się transkrypcyjnie aktywna (Ait-Si-Ali i współaut. 1998). Ale z cyklu na cykl telomery skracają się. Towarzyszy temu zmniejszanie liczby związanych z DNA cząsteczek białka TRF1. Zmniejsza się także zapotrzebowanie na enzymy acetylujące histony (p300/cbp). Warto w tym miejscu zauważyć, że od stężenia dostępnych aktywnych cząsteczek p300/cbp zależy efekt aktywacji p53, a tym samym szybkość proliferacji (A it-si-a li i współaut. 1998, A van taggiati i współaut. 1997, L i l l i współaut. 1997). Rzeczywiście, obserwuje się zależny od ATM wzrost aktywności białka p53, co może odpowiadać za wydłużanie fazy syntezy DNA z każdą rundą replikacyjną. Dodatkowo, nakłada się efekt akumulacji stabilnych transkryptów pl6ink4a w obecności ufosforylowanej, nieaktywnej formy Rb (R o b les i Adami 1998). Wraz ze skracaniem telomerów zmienia się ich oddziaływanie z laminami blaszki jądrowej, co prowadzi do zaburzeń struktury heterochromatyny telomerowej, a być może także sposobu zakotwiczenia chromosomów. ATM, dzięki aktywności kinazy białkowej, hamuje polimerazę RNA wyciszając lokalnie transkrypcję. Białko Ku rekrutuje enzymy naprawy podwójnych pęknięć DNA. Prawdopodobnie na tym etapie do telomerowego DNA dołącza także białko PARP. Syntetyzuje polimery ADP-rybozy eksponujące uszkodzone miejsca. Równocześnie modyfikacje post-translacyjne białka p53 (fosforylacja, ADP-rybozylacja, kompleksowanie z ko-aktywatorem p300) stabilizują je i uaktywniają. Wzrasta poziom zależnego od p53 białka p21cipl. Trwa akumulacja białka p l6 INK4a. Komórka przestaje się dzielić. Na starzeniu jednak rola telomerów się nie kończy. Wymuszenie dalszych podziałów na komórce przez na przykład inaktywację białka p53 za pomocą białka onkogennego HPV E6 oraz białka Rb za pomocą HPV E7, prowadzi do dalszego skracania telomerów, gdyż nadal występuje efekt niepełnej replikacji. Dochodzi do licznych aberracji chromosomowych w związku z łączeniem końców skróconych telomerów i ich niewłaściwą segregacją podczas mitozy. Znacznie wzrasta śmiertelność wśród komórek. Do immortalizacji bowiem potrzebna jest oprócz inaktywacji drogi Rb/p 16INK4a także aktywacja telomerazy (Kiyono i współaut. 1998). A biorąc pod uwagę fakt, że pierwszy warunek spełniają białka onkogenne czy produkty genów supresorów nowotworu, a drugi jest możliwy do spełnienia, gdyż liczba cząsteczek TRF1 określających długość telomeru i blokujących aktywność telomerazy istotnie spadła spełnienie snu o nieśmiertelności jest tuż tuż... Regulacja aktywności telomerazy przez zmianę ilości cząsteczek TRF1 związanych z DNA, realizowana jest dzięki tankyrazie, enzymowi katalizującemu ADP-iybozylację (Pennisi 1998, Smith i współaut. 1998). Tankyraza wiąże TRF1 i przenosi cząsteczkę ADP-rybozy z NAD+ na niego i siebie. Wtedy TRF1 po prostu odpada od DNA umożliwiając telomerazie wydłużenie końca 3 telomerowego DNA przed rozpoczęciem replikacji (Ryc. 2). Niekontrolowany syg-
9 Udział telomerów w podziałach komórkowych 263 nał do proliferacji przy włączonej ochronie genomu w postaci aktywnej telomerazy sprawia, że komórka staje się nieśmiertelna! I pomyśleć, że przed Barbarą McClintock telomery uważano za nikomu niepotrzebne, za przeproszeniem, końcówki chromosomów... TELOMERES IN REGULATION OF PROLIFERATION AND CELL AGEING Cellular senescence is defined as the limited capacity of normal somatic cells to divide beyond a finite number of population doublings. The telomere hypothesis of cellular ageing provides a model of molecular clock that counts cell divisions. It is assumed that incomplete replication of linear DNA molecules causes progressive loss of chromosome termini (telomeres) and activates the pathway that results in cell exit from the cycle. The p53, p21cip, Rb, p jgink4a prcqejns ancj their downstream effectors are likely to be involved in the pathway of telomere length response. Sum m ary The telomere length sensing mechanism has been shown to share components that are common with the machinery of chromatin organization and DNA repair. The linkage of proteins counting telomere length, Raplp (S. cerevisiae) or TRF1 (human), to proteins that are upstream of p53 and Rb, namely ATM, PARP and Ku, is discussed. The review presents a hypothetical transduction of the signal induced by shortened telomeres to the cell cycle regulators, pointing out the particular role played by chromatin organization established by histones. LITERATURA A it -S i-a li S., R a m ir e z S., B a r r e F. X., D k h is s i F., M a g n a g h i- J a u l in L., G ir a u l t J. A., R o b in P., K n ib ie h l e r M., Pritchard L. L., D u c o m m u n B., T r o u c h e D., H a r e l -B e l la n A., Histone acetyltransferase activity o f CBP is controlled hy cycle-dependent kinases and oncoprotein E1A. Nature 396, A v a n t a g g ia t i M. L., O g r y z k o V., G a r d n e r K., G io r d a n o A., L e v in e A. S., K e l l y K., Recruitmentof p300/cbp inp53-dependent signalpahways. Cell 89, B a is c h H., O t t o U., Intratumoral heterogeneity o f S phase transition in solid twnours determined by bromodeoxyuridine labellinq and flow cytometry. Cell Prolif. 26, B e r t u c h A., L u n d b l a d V Telomeres and double-strand breaks: trying to make ends meet. Trends in Cell Biol. 8, B l a c k b u r n E. H Structure and function o f telomeres. Nature 350, B o n d J., H a u g h t o n M., B l a y d e s J., G i r e V., W y n f o r d - T h o m a s D., W y l l ie F., Evidence that transcriptional activation by p53 plays a direct role in the induction o f cellular senescence. Oncogene 13, B o u l t o n S. J., J a c k s o n S. P., Components o f the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing. E M B O J. 17, B u c h k o v ic h K. J., G r e id e r C. W., Telomerase regulation during entry into the cell cycle in normal human T cells. Molec. Biol. Cell 7, C u m m in g s M. C., W in t e r f o r d C. M., W a l k e r N. I., Apoptosis. Am. J. Surgical Pathol. 21, E n o c h T., N o r b u r y C., Cellular responses to DNA damage: cell-cycle checkpoints, apoptosis and the roles o f p53 and ATM. TIBS 20, E van G., B row n L., W hyte M., H arrington E., Apoptosis and the cell cycle. Curr. Opinion in Cell Biol. 7, G ile s R. H., P e t e r s D. J., M., B r e u n in g M. H., Conjunction dysfunction: CBP/p300 in human disease. TIG 14, G o t t s c h l in g D. E., A p a r ic io O. M., B il l in g t o n B. L., Z a k ia n V. A., Position effect at S. cerevisiae telomeres: reversible represion ofpolii transcription. Cell 63, G r e id e r C. V., B l a c k b u r n E. H., Identfication of specfic terminal transferase activity in Tetrahymena extracts. Cell 43, G r e id e r C. V., H a r l e y C. V., Telomeres and telomerase in Cell Senescence and immortalization. [W:] Cellular Aging and Cell Death. Willey-Lyss, Inc., str G r u n s t e in M., Histones as regulators o f genes. Scientific American (October), G r u n s t e in M., Molecular models fo r heterochromatin in yeast. Curr. Opinion in Cell Biol. 9, H a r l e y C. B., V a z ir i H., C o u n t e r C. M., A l l s o p R. C., The telomere hypothesis o f cellular aging. Exp. Gerontol. 27, H a r r is C. C., Structure and function o f the p53 tumor suppressor gene: clues fo r rational cancer therapeutic strategies. J. Natl. Cancer Inst. 88, H a y f l ic k L., The limited in vitro Ifetime o f human diploid cell strains. Exp. Cell Res. 37, H a y f l ic k L., M o o r h e a d P. S., The serial cultivation o f human diploid cell strains. Exp. Cell Res. 25, J a c k s o n S. P., J e g g o P. A., DNA double-strand break repair and D(V)J recombination: involvement o f DNA-PK. TIBS 20, J a c k s o n S. P., Silencing and DNA repair connect. Nature 388, K e l e k a r A. i T h o m p s o n C. B., Bcl-2 family proteins: the role o f the BH3 domain in apoptosis. Trends in Cell Biol. 8, K iy o n o T., F o s t e r S., K o o p J. I., M c D o u g a l l J. K., G a l l o w a y D. A., K l in g e l h u t z A. J., Both Rb/p 16?NK4a inactivation and telomerase activity are required to immortalize human epithelial cells. Nature 96, K l y s z e j k o -S t e f a n o w ic z L., 1995a. Rozdz. 13 Chromatyna je j struktura oraz DNA [W:] Cytobiochemia. Biochemia niektórych struktur komórkowych. PWN, Warszawa, str K l y s z e j k o -S t e f a n o w ic z L., 1995b. Rozdz. 10 Otoczkajądrowa [W:] Cytobiochemia. Biochemia niektórych struktur komórkowych, PWN, Warszawa, str K o u z a r id e s T., Functions o f prb and p53: whats the connection? Trends in Cell Biol. 5, K u r e n o w a E. W., M a s o n D. M., O funkcjach telomerów. Biochimija 62, L i l l N. L., G r o s s m a n S. R., G in s b e r g D., D ec a p r io J., L iv in g s t o n D. M., Binding and modulation o f p53 by p300/cbp coactivators. Nature 387, L in d a h l T., S a t o h M. S., P o ir ie r G. G., K l u n g l a n d A., Post-translational m odfication o f poly (ADP-ribose) polymerase induced by DNA strand breaks. TIBS 273,
10 264 E w a J a r u g a L u o R. X., PoSTiGO A. A., D e a n D. C., Rb interacts with histoine deacetylase to repress transcription. Cell 92, L y d a l l D., W e in e r t T., Yeast Checkpoint Genes in DNA Damage Processing: Implications fo r Repair and Arrest. Science 270, M a r c a n d S., G ils o n E., S h o r e D., A protein-counting mechanism fo r telomere length regulation in yeast. Science 275, M a r x J., New linkfound betweenp53 anddna repair. Science 266, M cc l in t o c k B., The stability o f broken ends o f chromosomes in zea mays. Genetics 26, O l o v n ik o v A. M., A theory ofmarginotomy. J. Theoret. Biol. 14, P a n C., X u e B-H., E l lis T. M., P e a c e D. J., D i a z M. O., Changes in telomerase activity and telomere length during human T lymphocyte senescence. Exp. Cell Res. 231, P a n d e y S. i W a n g E., Cells en route to apoptosis are characterized by the upregulation o f cfos, c-myc, c-jun, cdc2 and Rb phosphorylation, resembling events o f early cell cycle traverse. J. Cellul. Biochem. 58, P e n n isi E., A possible new partner fo r telomerase. Science 282, R o b l e s S. J., A d am i G. R., Agents that cause double strand breaks lead to p l d N 4a enrichment and the premature senescence o f normal fibroblasts. Oncogene 16, S e k ig u c h it., H u n t e r T., Induction o f growth arrest and cell death by overexpression o f the cyclin-cdk inhibitor p21 in hamster BHK21 cells. Oncogene 16, S h a c k n e y S. E., S h a n k e y V., Cell cycle models fo r molecular biology and molecular oncology: Exploring new dimensions. Cytometry 35, S h ay J. W., Telomerase in human development and cancer. J. Cellul. Physiol. 173, S h ik a m a N., L y o n J., L a T h a n g u e B., The p300/cbp family: integrating signals with transcriptionfactors and chromatin. Trends in Cell Biol. 7, S h o r e D., Telomeres-unsticky ends. Science 2 8 1, S ik o r a E., Nieśmiertelność starzenie i śmierć komórek. Rola protoonkogenów, onkogenów i antyonkogenów. Post. Biochem. 39, S ik o r a E., 1994a. Transcriptionfactors in cellular senescence and death. Acta Biochim. Polon. 40, S ik o r a E., 1994b. Apoptoza. Post. Biochem. 40, S m ith S., G ir ia t I., S c h m it t A., D e L a n g e T., Tankyrase, a poly (ADP-ribose) polymerase at human telomeres. Science 2 8 2, S t e e n s e n V a n B., D e L a n g e T., Control o f telomere lenqth by the human telomeric protein TRF1. Nature T s u k a m o t o Y., K a t o J., Ik e d a H., Silencing factors participate in DNA repair and recombination in Saccharomyces cerevisiae. Nature 388, V a z ir i H., W e s t M. D., A l l s o p p R. C., D a v is o n T. S., Wu Y. S., A r r o w s m it h C. H., P o ir ie r G. G, B e n c h im o l S., ATM-dependent telomere loss in aging human diploid fibroblasts and DNA damage lead to the post-translational activation o f p53 protein involving poly (ADP-ribose) polymerase. EMBO J. 16, Xu H. J., Z h o u Y., Ji. W., P er n g G. S., K r u z e l o c k R., K o n g C. T., B a s t R. C., M ill s G. B., L i. J., Hu. S. X., Reexpression o f the retinoblastoma protein in tumor cells induces senescence and telomerase inhibition. Oncogene 15, X u Y., Y a n g E. M., B r u g a r o l a s J., J a c k s T., B a l t im o r e D., Involvement o f p53 and p21 in cellular defects and tumorigenesis in Atm ^ mice. Molec. Cellul. Biol. 18, W rig ht W. E., S hay J. W., Time, telomeres and tumours is cellular senescence more than an anticancer mechanism? Trends in Cell Biol. 5,
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń
Prokariota i Eukariota
Prokariota i Eukariota W komórkach organizmów żywych ilość DNA jest zazwyczaj stała i charakterystyczna dla danego gatunku. ILOŚĆ DNA PRZYPADAJĄCA NA APARAT GENETYCZNY WZRASTA WRAZ Z BARDZIEJ FILOGENETYCZNIE
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
Komórka stuktura i funkcje. Bogusław Nedoszytko. WSZPIZU Wydział w Gdyni
Komórka stuktura i funkcje Bogusław Nedoszytko WSZPIZU Wydział w Gdyni Jądro komórkowe Struktura i funkcje Podziały komórkowe Jądro komórkowe 46 chromosomów 2,6 metra DNA 3 miliardy par nukleotydów (A,T,G,C)
Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy. Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję
Nukleosomy 1 Plan wykładu: Budowa chromatyny - nukleosomy Wpływ nukleosomów na replikację i transkrypcję Metody pozwalające na wyznaczanie miejsc wiązania nukleosomów Charakterystyka obsadzenia nukleosomów
Replikacja DNA. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Replikacja DNA Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Replikacja DNA jest bardzo złożonym procesem, w którym biorą udział setki
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika
Kosm os Tom 48, 1999 Numer 2 (243) Strony 245-253 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika Ew a Ra d z is z e w s k a Instytut Biologii Doświadczalnej im. M Nenckiego
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Budowa histonów rdzeniowych
Histony rdzeniowe Budowa histonów rdzeniowych Histon H4 Silnie dodatnio naładowany N-koniec białka Globularna hydrofobowa domena odpowiedzialna za oddziaływania histon-histon oraz histon-dna Domena histonowa
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Ekspresja genów jest regulowana
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
REPLIKACJA, NAPRAWA i REKOMBINACJA DNA
REPLIKACJA, NAPRAWA i REKOMBINACJA DNA 1) Replikacja DNA 2) Replikacja całych chromosomów 3) Replikacja telomerów 4) Naprawa DNA przy jego syntezie 5) Naprawa DNA poza jego syntezą 6) Naprawa DNA system
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Jak działają geny. Podstawy biologii molekularnej genu
Jak działają geny Podstawy biologii molekularnej genu Uniwersalność życia Podstawowe mechanizmy są takie same u wszystkich znanych organizmów budowa DNA i RNA kod genetyczny repertuar aminokwasów budujących
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
Cykl komórkowy. Rozmnażanie komórek G 1, S, G 2. (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza)
Rozmnażanie komórek (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza) G 1, S, G 2 podział komórki (faza M) Obejmuje: podwojenie zawartości komórki (skopiowanie
Badanie procesu starzenia komórkowego indukowanego przez chemoterapeutyki w komórkach nowotworowych i prawidłowych
Wydział Chemiczny Politechniki Gdańskiej Katedra Technologii Leków i Biochemii Biologia komórki nowotworowej: Ćwiczenie D Badanie procesu starzenia komórkowego indukowanego przez chemoterapeutyki w komórkach
Mgr Dorota Przybylska
Mgr Dorota Przybylska Dziedzina: nauki biologiczne Dyscyplina: biochemia Wszczęcie: 11.12.2015 Temat: Rola oksydazy NADPH 4 oraz szlaku odpowiedzi na uszkodzenia DNA w starzeniu ludzkich komórek mięśni
TRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Cykl komórkowy i nowotwory. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Cykl komórkowy i nowotwory Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Kilka podstawowych informacji Komórki wielokomórkowego organizmu
Biologia molekularna genu - replikacja
Biologia molekularna genu - replikacja Funkcje informacji genetycznej Replikacja powielanie genomu, utrzymywanie stabilności genomu Ekspresja Odczytywanie informacji, niezbędne do funkcjonowania komórki
Biologia molekularna genu. Replikacja i stabilność genomu
Biologia molekularna genu Replikacja i stabilność genomu Lektura Allison, rozdziały 2 i 6 Brown, rozdział 15 Replikacja Model semikonserwatywny: w każdej cząsteczce potomnej jedna nić rodzicielska i jedna
Komórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji?
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej 1 Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 2 3 4 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
Toruń, dnia r.
dr hab. Dariusz Jan Smoliński Zakład Biologii Komórki Wydział Biologii i Ochrony Środowiska Uniwersytetu Mikołaja Kopernika w Toruniu Toruń, dnia 24.06.2013 r. RECENZJA rozprawy doktorskiej Pana magistra
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
Podstawy genetyki molekularnej
Podstawy genetyki molekularnej Materiał genetyczny Materiałem genetycznym są kwasy nukleinowe Materiałem genetycznym organizmów komórkowych jest kwas deoksyrybonukleinowy (DNA) 5 DNA zbudowany jest z nukleotydów
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Materiały dydaktyczne do kursów wyrównawczych z przedmiotu biologia
Człowiek najlepsza inwestycja Materiały dydaktyczne do kursów wyrównawczych z przedmiotu biologia Autor: dr inż. Anna Kostka Projekt współfinansowany ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Rola starzenia komórkowego w kancerogenezie i terapii przeciwnowotworowej
Rola starzenia komórkowego w kancerogenezie i terapii przeciwnowotworowej Grażyna Mosieniak Anna Strzeszewska Pracownia Molekularnych Podstaw Starzenia, Instytut Biologii Doświadczalnej im. Marcelego Nenckiego
Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.
W wyniku podziału komórki powstaje komórka potomna, która ma o połowę mniej DNA od komórki macierzystej i jest o połowę mniejsza. Aby komórka potomna była zdolna do kolejnego podziału musi osiągnąć rozmiary
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Dominika Stelmach Gr. 10B2
Dominika Stelmach Gr. 10B2 Czym jest DNA? Wielkocząsteczkowy organiczny związek chemiczny z grupy kwasów nukleinowych Zawiera kwas deoksyrybonukleoinowy U organizmów eukariotycznych zlokalizowany w jądrze
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals
The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals autorstwa Sugako Ogushi Science vol 319, luty 2008 Prezentacja Kamil Kowalski Jąderko pochodzenia matczynego jest konieczne
Prezentuje: Magdalena Jasińska
Prezentuje: Magdalena Jasińska W którym momencie w rozwoju embrionalnym myszy rozpoczyna się endogenna transkrypcja? Hipoteza I: Endogenna transkrypcja rozpoczyna się w embrionach będących w stadium 2-komórkowym
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Zarys biologii molekularnej genu Replikacja DNA
1 Zarys biologii molekularnej genu Replikacja DNA Pionierskie doświadczenia Griffiths Bakterie zawerają czynnik transformujący, zdolny do przekazania informacji z żywych bakterii do martwych Avery, McLeod,
DNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
POLIMERAZY DNA- PROCARYOTA
Enzymy DNA-zależne, katalizujące syntezę DNA wykazują aktywność polimerazy zawsze w kierunku 5 3 wykazują aktywność polimerazy zawsze wobec jednoniciowej cząsteczki DNA do utworzenia kompleksu z ssdna
Starzenie się skóry Limit Hayflicka. Limit Hayflicka
Starzenie się skóry Limit Hayflicka Proces starzenia się od dawna interesował nie tylko badaczy, ale przede wszystkim ludzi, którym nie jest obca dziedzina kosmetologii. Ostatnio obserwuje się znaczny
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
POLIMERAZY DNA- PROCARYOTA
Enzymy DNA-zależne, katalizujące syntezę DNA wykazują aktywność polimerazy zawsze w kierunku 5 3 wykazują aktywność polimerazy zawsze wobec jednoniciowej cząsteczki DNA do utworzenia kompleksu z ssdna
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
Reakcje enzymatyczne. Co to jest enzym? Grupy katalityczne enzymu. Model Michaelisa-Mentena. Hamowanie reakcji enzymatycznych. Reakcje enzymatyczne
Reakcje enzymatyczne Enzym białko katalizujące reakcje chemiczne w układach biologicznych (przyśpieszają reakcje przynajmniej 0 6 raza) 878, Wilhelm uehne, użył po raz pierwszy określenia enzym (w zaczynie)
Fragment cząsteczki DNA stanowiący matrycę dla syntezy cząsteczki lub podjednostki białka nazywamy GENEM
KONTROLA EKSPRESJI GENU PRZEKAZYWANIE INFORMACJI GENETYCZNEJ Informacja genetyczna - instrukcje kierujące wszystkimi funkcjami komórki lub organizmu zapisane jako określone, swoiste sekwencje nukleotydów
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
Zarys biologii molekularnej genu. Replikacja i stabilność genomu
Zarys biologii molekularnej genu Replikacja i stabilność genomu 1 Pionierskie doświadczenia Griffiths Bakterie zawerają czynnik transformujący, zdolny do przekazania informacji z żywych bakterii do martwych
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)
Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 (skrajne daty) 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Epigenetyczna regulacja ekspresji genów w trakcie rozwoju zwierząt i roślin
Epigenetyczna regulacja ekspresji genów w trakcie rozwoju zwierząt i roślin Rozwój jest z natury epigenetyczny te same geny w różnych tkankach i komórkach utrzymywane są w stanie aktywnym lub wyciszonym
WYKŁAD: 4. Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr)
WYKŁAD: 4 Sirtuiny - eliksir młodości nowej generacji? Prof. dr hab. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Dieta niskokaloryczna (calorie restriction,cr) 1 2 3 Zdjęcie 2. Stuletnia mieszkanka
Prof. dr hab. Grzegorz Bartosz Katedra Biofizyki Molekularnej Uniwersytetu Łódzkiego
Prof. dr hab. Grzegorz Bartosz Katedra Biofizyki Molekularnej Uniwersytetu Łódzkiego Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Doroty Przybylskiej pt. Rola oksydazy NADPH4 oraz szlaku odpowiedzi na uszkodzenia
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Biologia molekularna genu. Replikacja i stabilność genomu c. d.
Biologia molekularna genu Replikacja i stabilność genomu c. d. Replikacja Model semikonserwatywny: w każdej cząsteczce potomnej jedna nić rodzicielska i jedna nowa doświadczenie Meselsona i Stahla (Brown,
Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów
Zawartość 139585 Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
Regulacja ekspresji genów. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Regulacja ekspresji genów Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Problem: jak sprawić aby z jednej komórki powstał wielokomórkowy
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Transport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Badanie funkcji genu
Badanie funkcji genu Funkcję genu można zbadać różnymi sposobami Przypadkowa analizy funkcji genu MUTACJA FENOTYP GEN Strategia ukierunkowanej analizy funkcji genu GEN 1. wprowadzenie mutacji w genie 2.
Mechanizmy kontroli rozwoju roślin. Rafał Archacki
Mechanizmy kontroli rozwoju roślin Rafał Archacki Drzewo życia pozycja roślin i zwierząt http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399 Ewolucja roślin ewolucja procesu rozmnażania i rozwoju http://5e.plantphys.net/article.php?ch=t&id=399
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma Jądro komórkowe
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
Imię i nazwisko...kl...
Gimnazjum nr 4 im. Ojca Świętego Jana Pawła II we Wrocławiu SPRAWDZIAN GENETYKA GR. A Imię i nazwisko...kl.... 1. Nauka o regułach i mechanizmach dziedziczenia to: (0-1pkt) a) cytologia b) biochemia c)
Spis treści CYKL KOMÓRKOWY
Spis treści 1 CYKL KOMÓRKOWY 1.1 Faza M 1.2 Faza G1 (część interfazy) 1.3 Faza S (część interfazy) 1.4 Faza G2 (część interfazy) 1.5 Faza G0 2 MITOZA (podział pośredni) 2.1 Profaza 2.2 Metafaza 2.3 Anafaza
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem.
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Streszczenie Ogólnym celem niniejszej pracy było lepsze zrozumienie funkcjonowania szlaku
KARTA PRZEDMIOTU. 1. Nazwa przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA. 2. Numer kodowy BIO04c. 3. Język, w którym prowadzone są zajęcia polski
Projekt OPERACJA SUKCES unikatowy model kształcenia na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu Medycznego w Łodzi odpowiedzią na potrzeby gospodarki opartej na wiedzy współfinansowany ze środków Europejskiego
Uniwersytet Łódzki. prof. dr hab. Wanda M. Krajewska Katedra Cytobiochemii Łódź 20 lipca 2016 r.
Uniwersytet Łódzki prof. dr hab. Wanda M. Krajewska Katedra Cytobiochemii Łódź 20 lipca 2016 r. Opinia pracy doktorskiej mgr Jolanty Zięby Senescencja komórek glejaka wielopostaciowego in vitro poszukiwanie
MOLEKULARNE PODSTAWY CHORÓB NOWOTWOROWYCH
Polskie 1995, 44 (2): 311-321 Towarzystwo PL ISSN 0023-4249 S S S KOSMOS J a n u s z A. S ie d l e c k i Centrum Onkologii-Instytut im. Mani Curie-Skłodowskiej Zakład Biologii Komórki i Terapii Doświadczalnej
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011
OPTYMALNY POZIOM SPOŻYCIA BIAŁKA ZALECANY CZŁOWIEKOWI JANUSZ KELLER STUDIUM PODYPLOMOWE 2011 DLACZEGO DOROSŁY CZŁOWIEK (O STAŁEJ MASIE BIAŁKOWEJ CIAŁA) MUSI SPOŻYWAĆ BIAŁKO? NIEUSTAJĄCA WYMIANA BIAŁEK
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
PCR - ang. polymerase chain reaction
PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Dr hab. Marta Koblowska, prof. UW Zakład Biologii Systemów, Wydział Biologii UW Pracownia Analiz Mikromacierzy i Sekwencjonowania UW/IBB PAN Klasyczne wyobrażenie
APOPTOZA A ONKOGENEZA
1995, 44 (2): 353-363 T ow arzystw o PL ISSN 0023-4249 Polskie isnassss KOSMOS Ew a S ik o r a Instytut Biologii Doświadczalnej im. M.Nenckiego Pasteura, 3, 02-093 Warszawa Praca dedykowana Pani Profesor
Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii
Życie jest procesem chemicznym. Jego podstawą są dwa rodzaje cząsteczek kwasy nukleinowe, jako nośniki informacji oraz białka, które tę informację wyrażają w postaci struktury i funkcji komórek. Arthur
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
Cykl życiowy komórki. Kariokineza mitotyczna i mejotyczna. Molekularne aspekty cyklu komórkowego. Cykl życiowy komórki
Cykl życiowy komórki Ćwiczenie: 2 Kariokineza mitotyczna i mejotyczna Cykl życiowy komórki obejmuje: podwojenie swojej zawartości podział na dwie nowe komórki Molekularne aspekty cyklu komórkowego Czas
Podział komórkowy u bakterii
Mitoza Podział komórkowy u bakterii Najprostszy i najszybszy podział komórkowy występuje u bakterii, które nie mają jądra komórkowego, lecz jedynie pojedynczy chromosom tzw. chromosom bakteryjny. Podczas