MOLEKULARNE PODSTAWY CHORÓB NOWOTWOROWYCH
|
|
- Rafał Jasiński
- 6 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Polskie 1995, 44 (2): Towarzystwo PL ISSN S S S KOSMOS J a n u s z A. S ie d l e c k i Centrum Onkologii-Instytut im. Mani Curie-Skłodowskiej Zakład Biologii Komórki i Terapii Doświadczalnej Wawelska 15, Warszawa MOLEKULARNE PODSTAWY CHORÓB NOWOTWOROWYCH Badania nad molekularnymi podstawami chorób nowotworowych absorbują naukowców od wielu lat. Powoli zaczyna się kształtować obraz zmian molekularnych, którym musi podlegać komórka na drodze do fenotypu nowotworowego. Większość współczesnych danych wskazuje na brak zasadniczych zmian różnicujących komórki normalne od nowotworowych (tab. 1). Najpoważniejsze wydają się zmiany prowadzące do częściowej lub całkowitej utraty inhibicji kontaktowej w tym inhibicji kontaktowej ruchu. Inne zmiany (na zmiany w poziomie lub aktywności niektórych enzymów) mają raczej charakter ilościowy. Czasami zmianom ilościowym towarzyszą pewne zmiany jakościowe, na przykład pojawianie się produktów zmienionych ale zachowujących właściwości produktu podstawowego lub zmiany w czasie ich trwania w komórce. O komórkach, które nabierają wyżej wspomnianych cech, mówi się, że nabyły fenotyp komórki nowotworowej, czyli uległy transformacji. Dwie cechy czynią komórki nowotworowe szczególnie niebezpiecznymi dla całego organizmu. Niepohamowany wzrost związany z dużą niestabilnością genetyczną oraz zdolność do inwazji i kolonizacji obszarów normalnie zajmowanych przez inne rodzaje komórek (A lb e r t s i współaut. 1989). Tabela 1 Niektóre zmiany towarzyszące transformacji Zmiany w błonach komórkowych Zwiększenie transportu metabolitów Zwiększenie tworzenia pęcherzyków błonowych Wzrost mobilności białek błonowych Zmiany adhezyjne Zmniejszenie adhezji powierzchniowej Przyjmowanie bardziej okrągłych kształtów Brak prawidłowej organizacji fllamentów aktynowych Zanik zewnętrznych struktur fibronektynowych Nadprodukcja aktywatora plazm inogenu Zmiany we wzroście i podziałach komórek Wzrost do nienaturalnie wysokich gęstości Obniżenie wymagań dla czynników wzrostu Nabycie zdolności do nieograniczonej proliferacji Nabycie zdolności do wzrostu w zawiesinie DNA izolowane z tych komórek może powodować transformację
2 312 J a n u s z A. S ie d le c k i ETAPY KARCYNOGENEZY Proces przekształcania się komórki normalnej w nowotworową można podzielić na trzy etapy (St e f f e n 1993) (rye. 1). W pierwszym etapie, nazwanym pre-inicjacją, mamy przede wszystkim do czynienia z kontaktem komórek normalnych z pre-karcynogenem lub karcynogenem. W tym etapie istotną rolę odgrywają predyspozycje genetyczne. Są one przede wszystkim związane z polimorfizmem genów kodujących enzymy uczestniczące w metabolizowaniu i detoksyfikacji czynników rakotwórczych. Sprawność w metabolizowaniu karcynogenów oraz szybkość detoksykacji determinuje czas ekspozycji komórki na działanie czynników uszkadzających, w tym w szczególności uszkadzających jej DNA. Ponadto predyspozycje genetyczne są związane również z polimorfizmem genów kodujących enzymy systemu reperacyjnego. Polimorfizm w obszarze systemu reperacyjnego w zdecydowany sposób może wpłynąć na częstość mutacji, a co za tym idzie, sprzyjać procesowi karcynogenezy. ETAP I - > ETAP II ETAP III PRE-INICJACJA INICJACJA PROGRESJA Ekspozycja na Nagromadzanie Selekcja klonalna karcynogeny chemiczne i mutacji prowadzących Nabycie zdolności fizyczne do transformacji do przerzutowania Ryc. 1. Etapy karcynogenezy Drugi etap to proces właściwej inicjacji. Rozpoczyna się on wraz z pojawieniem się pierwszej mutacji. Gromadzenie się kolejnych mutacji w istotnych ze względu na funkcję komórki genach musi w konsekwencji doprowadzić do powstania komórki stransformowanej. Kolejne mutacje mogą wystąpić spontanicznie, ale też mogą być wywołane przez pewne związki chemiczne, czynniki fizyczne oraz mogą być wynikiem infekcji komórki przez tak zwane wirusy onkogenne. Mutacje niezbędne do przeprowadzenia komórki normalnej w nowotworową tworzą tak zwany szlak mutacyjny. Nie wszystkie mutacje w tym szlaku mają jednakową wagę, na przykład w raku jelita grubego mutacje w genie p53 występują w prawie 80%, podczas gdy mutacje w genie ras jedynie w kilku procentach nowotworów. Wydaje się, że i na tym etapie predyspozycje genetyczne odgrywają istotną rolę. Jeśli jedna z mutacji szlaku jest odziedziczona to czas niezbędny do transformacji komórki w nowotworową jest skrócony o czas jednego wydarzenia mutacyjnego. Jest to szczególnie dobrze widoczne w nowotworach dziecięcych i w zespołach na przykład Li-Fraumeni czy Blooma. Ostatnim etapem jest progresja nowotworu, czyli nabywanie przez komórki zdolności do nieograniczonego wzrostu, a w wypadku nowotworów złośliwych do tworzenia przerzutu. Na tym etapie zdecydowaną rolę wydają się odgrywać zjawiska związane ze zmianami w błonach komórkowych, a w szczególności z nabywaniem nowych cech przez białka adhezyjne błony. Ponadto zmianom ulegają też poziomy enzymów lizujących tak zwaną błonę podstawną w tym
3 Molekularne podstawy chorób nowotworowych 313 w szczególności kolagenaz. Dotychczasowe dane dotyczące etapu progresji nie pozwalają w pełni uzasadnić roli predyspozycji genetycznych na tym etapie. Przyczyny transformacji, jak z powyższego wynika, leżą w zmianach w materiale genetycznym komórki. Pierwszą osobą, która potwierdziła prawidłowość powyższych rozważań był uczony norweski, A. Knutson. Na podstawie badań epidemiologicznych nad siatkówczakiem wysunął hipotezę, że komórka może ulec transformacji, jeśli zajdą w jej genomie co najmniej dwie niezależne mutacje. W większości przypadków zmiany te są skutecznie usuwane albo na poziomie pojedynczej komórki przez system reperacyjny, albo na poziomie organizmu przez system immunologiczny. Istnieje jeszcze jedno dodatkowe zabezpieczenie. Komórka może zostać skierowana na drogę programowanej śmierci zwanej apoptozą (patrz dalej). Jeśli zawiodą wszystkie wspomniane powyżej zabezpieczenia powstaje komórka stransformowana. GENY SZLAKU MUTACYJNEGO Geny komórkowe związane z transformacją nowotworową mogą oddziaływać w różny sposób: po pierwsze mogą zmienić swoją normalną funkcję poprzez: a. mutacje, które powodują zmiany w funkcji białek, b. translokacje chromosomowe, które prowadzą do zmian w ekspresji genu lub do jego strukturalnych zmian, c. poprzez amplifikację, wwyniku której następuje selektywny wzrost liczby kopii określonego genu; po drugie poprzez całkowitą utratę komórkowych genów. Może to nastąpić poprzez: a. mutację, która inaktywuje prawidłową funkcję danego genu, i b. delecje z genomu. Liczbę genów w genomie człowieka można ocenić na około W przeciętnej komórce jedynie genów jest aktywnych; z nich prawdopodobnie najwyżej kilkaset może oddziaływać znacząco, bezpośrednio lub pośrednio w procesie karcynogenezy. Geny aktywnie uczestniczące w szlaku mutacyjnym można podzielić na cztery główne grupy: 1. geny, których produkty białkowe uczestniczą w przekazywaniu informacji pomiędzy zewnętrzną częścią błony komórkowej a jej wnętrzem i pomiędzy wnętrzem a jądrem komórkowym onkogeny; 2. geny, których produkty białkowe uczestniczą w procesach związanych z ekspresją innych genów czyli są czynnikami transkrypcyjnymi onkogeny i antyonkogeny; 3. geny, których produkty białkowe mają wpływ na prawidłowy przebieg proliferacji komórek antyonkogeny; 4. geny, których produkty białkowe wpływają na wierność replikacji/reperacji podnoszące częstość mutacji kilkadziesiąt do kilkuset razy geny mutator owe. Z przedstawionego powyżej podziału widać, że geny te, z wyjątkiem ostatniej grupy, uczestniczą przede wszystkim w przekazywaniu informacji o stanie komórki na różnych szczeblach jej organizacji. Każda komórka jest w stanie odbierać cały szereg sygnałów z zewnątrz. Docierają one do jądra komórki poprzez zakotwiczone na powierzchni komórki białka, które nazywamy receptorami. Sygnały te to nie tylko tak zwane hormony wzrostu czy też czynniki
4 314 J a n u s z A. S ie d le c k i depolaryzujące błonę komórkową ale również zmiany w istotnych dla funkcjonowania komórki stężeniach kationów, takich jak sód czy wapń. Poprzez receptory oddziaływują one na wnętrze komórki. Wiele z tych receptorów może przekazać dalej informację. Mówimy wówczas o uruchomieniu tak zwanych przekaźników drugiego rodzaju. One to pośrednio lub bezpośrednio przekazują informacje o warunkach zewnętrznych do jądra komórkowego. Informacja ta docierając do jądra zostaje przetłumaczana na język aktywatorów transkrypcji. O tym, które geny w danej komórce zostaną uaktywnione, decyduje przede wszystkim obecność tak zwanych czynników transkrypcyjnych. To one, łącząc się z promotorem genu, rozpoczynają proces jego uaktywnienia a w połączeniu z innymi białkami regulują również jego ekspresję. Jest to bardzo skomplikowany i subtelny system równowagi decydujący o prawidłowym przebiegu szlaków metabolicznych w komórce. Każde zaburzenie w tej regulacji może prowadzić do destabilizacji komórki, a co za tym idzie, mieć dla niej poważne konsekwencje (A lb e r ts i współaut. 1989). ONKOGENY I ANTYONKOGENY Wirusy onkogenne mogą zawierać materiał genetyczny w postaci DNA tak jak normalne komórki, ale mogą też posiadać RNA zamiast DNA. Tego typu onkogenne wirusy noszą nazwę retrowirusów. Badania nad transformującymi mechanizmami wirusów onkogennych doprowadziły do wyodrębnienia fragmentów genomu, bez których wirus traci swoje własności onkogenne. Te fragmenty nazwano właśnie onkogenami. Wkrótce okazało się, że normalna komórka posiada bardzo wiele, choć nie wszystkie, odpowiedników onkogenów (tabela 2). Dla odróżnienia ich od onkogenów znalezionych w wirusach nazwano je protoonkogenami lub komórkowymi onkogenami. W literaturze fachowej stosuje się określenia v-onc i c-onc na oznaczenie wirusowych i komórkowych onkogenów. Funkcja onkogenów i ich komórkowych odpowiedników Tabela 2 Funkcja produktu onkogenu Kinazy białkowe tyrozyny seryny/treoniny Czynniki wzrostu i ich receptoiy PDGF EGF-Rec Tyroid horm-rec M-CSF-Rec Białka wiążące GTP Czynniki transkrypcyjne Nazwa onkogenu src, yes,fgr, ablfps, erb-b, kit, sea, ros raf, mos sis erb-b erb-a fms H-ras K-ras N-ras myb, myc, fos, jun, ets, rei, ski Badania wirusowych onkogenów i ich komórkowych analogów pozwoliły na ustalenie roli tych genów w procesach transformacyjnych. Wiele znanych proto-onkogenów zalicza się do przekaźników zaangażowanych w przenoszenie
5 Molekularne podstawy chorób nowotworowych 315 informacji dla komórki o jej podziale lub różnicowaniu. Inne kodują czynniki wzrostu, receptory dla czynników wzrostu, tak zwane białka G, cytoplazmatyczne kinazy białkowe oraz czynniki transkrypcyjne (tabela 2). Wirusowe onkogeny cechuje duże podobieństwo do ich komórkowych analogów. Ich homologia waha się w granicach od 20% do 80%. Są więc one odpowiednikami komórkowych przekaźników sygnałów, ale takimi, które uciekają spod normalnych komórkowych mechanizmów kontrolnych. Podobnie, mutacje proto-onkogenów powodują, że ich produkty białkowe upodabniają się w swoim działaniu do produktów onkogenów wirusowych. W komórce normalnej produkt genu jest niewątpliwie włączony w zapewnienie jej prawidłowego rozwoju. Jeżeli utrata jakiegoś genu jest ściśle związana z transformacją komórki normalnej do nowotworowej, to taki gen nazywamy genem supresorowym transformacji nowotworowej, lub antyonkogenem (ang. tumor su pressor gene). Geny te pełnią w komórce bardzo wiele istotnych funkcji, ale przede wszystkim są zaangażowane w kontrolę procesu proliferacji komórkowej (tabela 3). Tabela 3 Geny supresorowe transformacji nowotworowej Gen supresorowy Lokalizacja chromosomalna Funkcja produktu genu p53 17pl3.1 czynnik transkrypcyjny, kontroler prawidłowego przebiegu proliferacji, strażnik genomu Rbl 13ql4 kontroler prawidłowego przebiegu proliferacji, czynnik transkrypcyjny APC 5q21? WT1 1lp l3? czynnik transkrypcyjny NF1 17ql 1 cytoplazmatyczne białko aktywujące GTP NF2 22q białko cytoszkieletu VHL 3p25? MTS1 9p21 inhibitor kinazy cdk4 GENY MUTATOROWE Mniej więcej cztery lata temu grupa fińsko-ameiykańska pod kierunkiem A. de la Chapelle z Uniwersytetu w Helsinkach i B. Vogelsteina z Uniwersytetu Johna Hopkinsa w Nowym Jorku rozpoczęła pracę mającą na celu ustalenie odziedziczanego defektu genowego w rodzinnym raku jelita grubego, w którym nie występuje polipowatość jelit. Wbrew oczekiwaniom, u członków badanych rodzin nie stwierdzono dziedzicznego defektu żadnego spośród przebadanych onkogenów, jak i genów supresorowych. Zespół De la Chapelle a i Vogelstein a podjął więc bardzo żmudne badania polegające na poszukiwaniu związku pomiędzy zachorowaniem a dziedziczeniem polimorficznych markerowych sekwencji DNA. Jako markery wykorzystano sekwencje tak zwanego mikrosatelitarnego DNA. W wyniku badań z zastosowaniem około 350 tego typu sond udało się ustalić taką korelację z dziedzicznym polimorfizmem sekwencji zlokalizowanym 5 Kosmos
6 316 J a n u s z A. S ie d le c k i w ramieniu krótkim chromosomu 2 w pozycji 2p W dalszych badaniach prowadzonych na komórkach nowotworowych pobranych od chorych zespół kierowany przez De la Chapelle a i Vogelstein a nie stwierdził utraty heterozygotyczności w analizowanym fragmencie co wskazuje, że w komórkach nowotworowych prawidłowy allel tego genu nie podlega delecji, jak to ma miejsce w przypadku genów supresorowych transformacji nowotworowej (na przykład genu p53). W badaniach tych zaobserwowano również, że zmianie w prążku pl5-16 chromosomu 2 towarzyszą ogromne zmiany w całym genomie. Autorzy postawili więc hipotezę, że fragment ten zawiera prawdopodobnie pojedynczy gen, który jest albo częścią aparatu replikującego DNA odpowiedzialnego za wierność kopiowania, albo też za tak zwaną reperację poreplikacyjną (M a r x 1993a). W pół roku po odkryciu pierwszego genu mutatorowego ogromny zespół (pod publikacją podpisało się 35 osób z dwunastu ośrodków naukowych całego świata) ustalił, że gen ten koduje białko będące homologiem drożdżowego białka msh2. W drożdżach białko to jest elementem poreplikacyj nego systemu naprawy błędnie sparowanych zasad (ang. mismatch repair), a jego rola w tym systemie naprawczym polega na rozpoznaniu i związaniu się z błędnie sparowanymi zasadami. Produkt zdefektowanego genu nie rozpoznaje lub rozpoznaje w ograniczonym zakresie źle sparowane zasady, co prowadzi do narastania liczby mutacji rozproszonych w sposób przypadkowy po całym genomie. Do rozwoju nowotworu dochodziłoby wówczas, gdy takie mutacje wystąpiłyby w genach, których defekty są istotne z punktu widzenia procesu transformacji. W drożdżach, w sytemie naprawy błędnie sparowanych zasad z produktem genu msh2 współdziałają dodatkowo dwa inne białka. Ich poszukiwania u ludzi doprowadziły w maju tego roku do zlokalizowania na chromosomie 3p obu ludzkich homologów. Wstępne dane wydają się sugerować, że podobnie jak w przypadku genu msh2, mutacje w obu pozostałych genach są zasocjowane z rodzinnym rakiem jelita grubego (F is h e l i współaut. 1993, C l e a v e r 1994, J ir ic n y 1994). TRANSFORM ACJA NOWOTWOROWA A ZABURZENIA W PRZEBIEGU CYKLU KOMÓRKOWEGO Prawidłowość przebiegu cyklu komórkowego jest gwarantowana przez istnienie dwóch tak zwanych punktów restrykcyjnych. Punkt pierwszy to granica faz Gl i S. Tu przede wszystkim odbywa się kontrola integralności materiału genetycznego. Wykrycie uszkodzenia w DNA powoduje zatrzymanie procesu replikacji i uruchomienie systemów naprawczych. Drugi punkt to granica faz G2 i M, gdzie odbywa się kontrola tworzenia się funkcjonalnego wrzeciona podziałowego przed mitozą. Obecnie dysponujemy już sporą liczbą danych na temat mechanizmów kontrolujących oba punkty restrykcyjne. ROLA rbl I p53 Dwa antyonkogeny wydają się szczególnie istotne z punktu widzenia ich wpływu na przebieg cyklu komórkowego, a co za tym idzie proliferacji. Jeden z nich to produkt genu oznaczonego rbl, a drugi genu p53. Białkowe produkty tych genów odgrywają kluczową rolę w regulacji cyklu komórkowego. Produkt
7 Molekularne podstawy chorób nowotworowych 317 genu rbl białko p i 10 posiada zdolność do wiązania się z czynnikami transkrypcyjnymi, gdy jest w formie u fosfory lowanej. Na przykład, gdy jego częściowo ufosforylowana postać jest związana z czynnikiem transkrypcyjnym E2F, to ten kompleks inaktywuje procesy transkrypcji pewnych genów. W fazie G1 następuje dysocjacja E2F od białka p l 10 i rozpoczyna się proces aktywnej transkrypcji. PI 10 zostaje przekształcone w białko p 107, które po połączeniu się z cykliną A i p34 wyłącza produkt genu rbl. W fazie S białko pl 10 jest w postaci w pełni ufosforylowanej i przebywa w niej aż do końca fazy G2. Podczas fazy M następuje częściowa defosforylacja, która uaktywnia pl 10 do tworzenia kompleksu z E2F. Wyłączenie transkrypcji sprzyja wyprowadzeniu komórki do fazy GO. Wyjściu komórki z fazy GO towarzyszy defosforylacja i dysocjacja E2F od pllo (N e v in s 1992). Produkt genu p53 białko p53 jest jednym z najistotniejszych, jeśli nie najistotniejszy, regulatorem cyklu komórkowego. Jego rolę w cyklu determinuje przede wszystkim jego udział w kontroli integralności genomu. Stąd też białko p53 jest nazywane często strażnikiem molekularnym lub strażnikiem genomu (L a n e 1992). Biologicznie aktywną formą białka jest odpowiednio u fosfory lowany homotetramer. Rozpoznaje on ściśle określoną sekwencję DNA, czyli zachowuje się jak czynnik transkiypcyjny. Pod koniec fazy G1 ilość białka p53 rośnie. Z cytoplazmy przedostaje się do jądra. Jego wniknięcie do jądra powoduje zatrzymanie wzrostu komórek w fazie w G l. W przypadku stwierdzenia uszkodzeń w DNA jego ilość w jądrze rośnie powodując zatrzymanie cyklu komórkowego. Białko p53jest również fosforylowane w zależności od cyklu komórkowego. Stopień fosforylacji może mieć wpływ na zdolność do tworzenia homotetrameru a zatem i na zdolność do aktywacji określonych genów. Maksymalny poziom fosforylacji jest osiągany w fazie M cyklu. Gen p53 zawiera cztery obszary sekwencji o znacznej homologii międzygatunkowej. Większość mutacji w genie p53 występuje właśnie w tych obszarach. Są to przeważnie delecje fragmentu lub całego genu oraz mutacje punktowe prowadzące do zmiany jednego aminokwasu na drugi. Zmutowane białko cechuje znacznie przedłużony czas życia w komórce. Normalne białko p53 ma okres półtrwania min, podczas gdy jego zmutowany odpowiednik potrafi pozostawać w komórce nawet do 12 godzin. W większości przypadków zmutowane białko nie traci zdolności do tworzenia tetramerów z prawidłowym białkiem p53. Taki heteromer traci jednak zdolność do specyficznego wiązania się z DNA, przez co nie może pełnić funkcji regulatora transkrypcji. Podobnie jak zmutowane białko p53 zachowują się niektóre białka kodowane przez onkogeny wirusowe, na przykład antygen T wiursa SV40, białko E6 wirusa HPV czy białko Elb adenowirusa. Wiążą się one z prawidłowym białkiem p53. Powstały heteromer białka p53 i białka wirusowego jest również nieaktywny jako regulator transkrypcji. Konsekwencją powstałego połączenia jest obniżenie ilości normalnego białka p53. Zmniejszenie poziomu prawidłowego p53 przez połączenie ze zmutowaną wersją białka czy też z białkiem wirusowym prowadzi do przedwczesnego zwolnienia bloku proliferacyjnego. Rozpoczyna się wówczas runda replikacji DNA, co może doprowadzić do utrwalenia zmiany mutacyjnej w przypadku, gdy nie został zakończony proces naprawy uszkodzonego DNA. Utrata kontroli nad proliferacją komórki prowadzi do gromadzenia się komórek genetycznie niestabilnych z różnymi mutacjami i aberra-
8 318 J a n u s z A. S ie d le c k i cjami chromosomalnymi. To z kolei do szybkiej selekcji komórek stransformowanych (CuLOTTAi K o s h l a n d Jr. 1993, S ie d l e c k i 1993a). Ze. względu na dużą rolę białka p53 w procesach metabolicznych jego funkcja musi być precyzyjnie regulowana. Poszukiwania regulatorów funkcji białka p53 zakończyły się pomyślnie dwa lata temu z chwilą odkrycia genu nazwanego mdm2. Bliższa analiza tego genu zlokalizowanego na chromosomie 12ql3-14 wskazuje, że dzięki alternatywnemu splicingowi (złożenie genu) powstają cztery różne transkrypty. Produkty białkowe trzech z nich łączą się bezpośrednio z prawidłowym białkiem p53, podczas gdy czwarty produkt, pozbawiony N-końcowej części białka, nie wykazuje zdolności do łączenia z p53. Sugeruje to jednocześnie, że ten region białka odpowiada za oddziaływanie z białkiem p53. Sekwencja aminokwasowa białek mdm2 ujawnia, że białko to posiada miejsce wiążące się z metalem oraz tak zwane palce cynkowe, które są miejscem oddziaływania z DNA. Wydaje się więc, że białko mdm2 spełnia również dodatkową funkcję czynnika transkrypcyjnego dla pewnych genów. Ze względu na te właściwości białko mdm2 może być zaliczone do klasy onkogenów. Białko mdm2 tworzy z cząsteczką p53 heterodimer analogiczny do tego, jaki tworzy z białkami wirusowymi lub zmutowanym białkiem p53. Dane białko mdm2 poprzez połączenie z białkiem p53 moduluje aktywność transkiypcyjną p53 prawdopodobnie na zasadzie ujemnego sprzężenia zwrotnego. Jest również możliwe, że z punktu widzenia regulacji transkrypcji istotny jest ilościowy stosunek między obu białkami mdm2/p53. Wydaje się, że heterodimer p53-mdm2 blokuje ekspresję genów dla których białko p53 jest czynnikiem transkrypcyjnym. Ponadto powstanie kompleksu białkowego p53-mdm2 prowadzi do zmniejszenia stężenia wolnego białka p53, i co za tym idzie do zwolnienia boku proliferacyjnego (Ha in e s i współaut. 1994). Tak więc konsekwencje nadekspresji genu mclm2 są podobne do tych jakie wywołuje mutacja w genie p53. Ostatnio wykazano w niektórych nowotworach zwiększoną ekspresję genu mdm2. Takie przypadki obserwowano w mięsakach tkanek miękkich i kości oraz w glejakach i gwiaździakach (R e in - f e r b e r g e r i współaut. 1993). W ciągu ostatnich kilku lat stało się jasne, że utrata aktywności supresorowej genu p53 prawie zawsze jest etapem prowadzącym do transformacji nowotworowej. KINAZY CYKLIN I ICH INHIBITORY Najnowsze badania prowadzone przez Kamba, Skolnicką i ich współpracowników, poszukujących w komórkach czerniaka genu szczególnie istotnego w szlaku mutacyjnym prowadzącym do transformacji nowotworowej (ang. susceptibility gene), ujawniły istnienie nowego antyonkogenu, którego udział w tym procesie może być nawet większy niż genów p53 i rbl (M a r x 1994). Ku swemu zdziwieniu badacze ci stwierdzili, że delecje i mutacje w tym genie towarzyszą nie tylko komórkom czerniaka, ale również komórkom wielu innych typów nowotworów. Z dotychczasowych danych doświadczalnych wynikało, że najczęściej spotykaną zmianą w większości nowotworów jest zmiana w genie p53. Dotyczy ona bowiem ponad 50% wszystkich typów nowotworów. Według wstępnych danych opublikowanych w jednym z ostatnich numerów Science K a m b i współautorzy (1994) stwierdzili zmiany w obrębie badanego genu w ponad 75%
9 Molekularne podstawy chorób nowotworowych 319 przebadanych komórek nowotworowych. W 50% były to delecje całego lub części genu a w około 25% mutacje punktowe. Gen ten, nazwany MTS1 (ang. multiple tumor supressor), zlokalizowano na chromosomie 9p21. Koduje on niskocząsteczkowe białko o ciężarze dal to nów (p 16). Jest ono inhibitorem tak zwanej cdk-4 kinazy, enzymu fosforylującego cyklinę D. Cykliny to grupa białek odgrywająca czołową rolę w cyklu komórkowym. Ich fosforylacja przez odpowiednie kinazy jest motorem wprawiającym w ruch mechanizmy cyklu komórkowego. Ufosforylowane cykliny tworzą kompleks białkowy zwany MPFI (ang. maturation promoting factor) z kinazą białkową zwaną p34. Brak fosforylacji cyklin uniemożliwia utworzenie kompleksu MPF I i rozpoczęcie syntezy DNA. Fosforylacja cyklin jest konieczna również w fazie podziałowej. Gen MTS1 wykazuje 93% podobieństwa do drugiego genu znajdującego się w bezpośrednim sąsiedztwie, który nazwany został MTS2. Produkt tego genu jest o kilka aminokwasów krótszy niż p l6. Funkcja MTS2 nie jest znana, ale podobieństwo sekwencji do MTS1 sugeruje, że może to być również inhibitor kinaz typu cdk. Nie można też wykluczyć, że jest to skrócony, nie funkcjonalny gen, w oparciu o który nie może powstać prawidłowy produkt (ang. trunkated gene) (M a r x 1994). Białko p l 6 jest już kolejnym opisanym w ciągu ostatniego półrocza inhibitorem kinaz białkowych typu cdk. W połowie 1993 roku Vogelstein opisał regulowany przez białko p53 produkt genu WAF 1 (E l -D e ir y i współaut. 1993). Białko to, zwane p21, również hamuje aktywność kinaz fosforylujących cykliny w szczególności kinazę cdk2 uczestniczącą w fosforylacji cykliny E. Zupełnie niedawno okazało się, że białko p2 1 może również bezpośrednio oddziaływać z innym białkiem, elementem składowym kompleksu replikacyjnego, zwanym PCNA (ang. proliferating cell nuklear antigen). Nawiasem mówiąc PCNA nazwany był przez pewien czas również cykliną. Wydaje się więc, że funkcja białka p21 nie ogranicza się jedynie do zablokowania wejścia w fazę S cyklu komórkowego przez inhibicję fosforylacji kinazy cdk 2 w przypadku stwierdzenia uszkodzeń w DNA przed replikacja. W przypadku bowiem gdy uszkodzenie wystąpiło podczas replikacji, p21 jest w stanie zatrzymać maszynerię replikującą DNA wskutek połączenia się do PCNA. Uniemożliwia to utworzenie kompleksu białkowego PCNA/ polimeraza DNA, który jest głównym składnikiem kompleksu replikacyjnego zaangażowanego w syntezę DNA (P in e s 1994). Dla pełnego obrazu należy wspomnieć o co najmniej dwu innych inhibitorach kinaz cdk p24 i p27. O obu tych białkach niewiele jeszcze wiadomo. Białko p24 wykazuje homologię do kinaz białkowych. O białku p27 wiadomo, że blokuje cykl komórkowy w odpowiedzi na stymulację czynnikiem transformującym (H u n t e r 1993, P in e s 1994). Niedawno opisano jeszcze jedno biedko, nazwane p l 8, które okazało się być inhibitorem kinazy p34. Jak już wspomniano powyżej, kinaza p34 jest elementem składowym kompleksu MPF i odgrywa istotną rolę w przebiegu cyklu komórkowego. Z przedstawionych danych wynika, że zaburzenie w procesie fosforylacji cyklin, białek zaangażowanych w regulację cyklu komórkowego, jest jedną z najpoważniejszych przyczyn zaburzeń w jego przebiegu. W konsekwencji prowadzić to może do zaburzeń proliferacji a więc do transformacji nowotworowej.
10 320 J a n u s z A. S ie d le c k i APOPTOZA A TRANSFORMACJA NOWOTWOROWA Dla wielu genów białko p53 jest bezpośrednim lub pośrednim aktywatorem bądź inhibitorem transkrypcji. Między innymi reguluje ono ekspresję rodziny genów bel bezpośrednio zaangażowanych w proces apoptozy. W skład tej rodziny wchodzą geny bcl2, baxi bcl-x. Gen bcl2 zwany jest też genem przeżycia (ang. survival gene) (M a r x 1993b). Wysoki poziom ekspresji genu bcl2 sprzyja przeżyciu komórki. Obniżenie poziomu białka bcl2 jest równoznaczne ze skierowaniem komórki na drogę tak zwanej śmierci programowanej. W formie aktywnej produkt genu bcl2 występuje jako dimer. Może też tworzyć dimery z pozostałymi członkami rodziny czyli z produktami genów bax i bcl-x. Odpowiednie heterodimery mają różny wpływ na przebieg apoptozy. Stanowi to obecnie przedmiot intensywnych badań. W niewątpliwy jednak sposób wykazano, że obniżenie zdolności uszkodzonej komórki do umierania (supresja apoptozy) prowadzi do gromadzenia się komórek, które w normalnych warunkach byłyby wyeliminowane na drodze apoptozy (Ca r s o n i R ib e ir o 1993, S ie d l e c k i 1993b). Gromadzenie się komórek z różnymi mutacjami i aberracjami chromosomalnymi prowadzi do szybkiej selekcji komórek o fenotypie nowotworowym. Z apoptozą są związane też zmiany w ekspresji onkogenu c-myc. Jak wykazano, produkt genu c-myc bierze udział nie tylko w regulacji proliferacji ale i apoptozy. PODSUMOWANIE Z powyższych rozważań wynika, że jedną z głównych przyczyn przemiany komórki normalnej w nowotworową jest utrata kontroli nad jej proliferacją. Dotychczasowe badania wskazywały, że kluczową rolę w kontoli tego procesu odgrywają produkty kilku genów, w tym szczególną produkty genów p53 i rbl. W ciągu ostatnich lat stało się jasne, że utrata aktywności supresorowej prawie zawsze jest etapem prowadzącym do transformacji nowotworowej. Badania zmian towarzyszących nabywaniu przez komórkę normalną fenotypu nowotworowego toczą się obecnie bardzo szerokim frontem. Niewątpliwie przyczynią się one do lepszego poznania mechanizmu/ów transformacji nowotworowej. Pozwolą też na skuteczniejsze diagnozowanie i prognozowanie przebiegu choroby. W niezbyt odległej przyszłości powinny też mieć wpływ na metody leczenia i skuteczność terapii. MOLECULAR BASIS OF CANCER DISEASE This article is an attempt to present carcinogenesis as a multi-step process. The growing number of evidences accumulated during the last few years shows that cancer is a consequence of genetic or epigenetic alterations in a variety of genes that are fundamental for growth, proliferation, differentiation and programmed cell death.these genes have been divided into four different groups each of which has been discussed. The role of some oncogenes and tumor suppressor genes in controling the cell cycle is underlined.
11 Molekularne podstawy chorób nowotworowych 321 LITERATURA A l b e r t s B., B r a y D., L e v is J., R a f f M., R o b e r t s K., W a ts o n J. D., Molecular Biology of the Cell Second edition, Garland Publishing Inc. New York, London. C arson D. A, R ib eiro J. M., Apoptosis and disease. Lancet 341, C le a v e r J. E., It was a very good year fordna repair. Cell, 76, 1-4. C u l o t t a E., K o s h la n d Jr. D. E., p53 Sweeps through cancer research. Science 262, E l- D e ir y W. S., T o r in o T., V e lc u le s c u V. E., L e v y D.B., P a rs o n R., T r e n t J. M., Lin D., M e r c e r E. W., K in z le r K. W., V o g e ls t e in B., WAF1, a potential mediator of p53 tumor suppression. Cell 75, H a in es D. S., L a n d e rs J. E., E n g le L. J., G e o r g e D. L., Physical and functional interaction between wild-type p53 and mdm2 proteins. Molec. Cell. Biol. 14, F is h e l, R, L e s c o e, M. K., R a o, M. R. S., Human mutator gene homolog msh2 and its association with hereditary nonpolyposis colon cancer. Cell 75, H u n t e r T., Braking the cycle. Cell 75, J iricn y J., Colon cancer and DNA repair: have mismatches met their match? TIG 10, K a m b A., G r u is N. E., W e o v e r -F e l d h a u s J., Liu Q., H o r s h a m n K., T o r t ig ia n S. V., S t o c h e r t E., D a y R. S., J o hnson B. E., S kolnicka M. H., Science 264, L a n e D. P., p53, Guardian of the genome. Nature 358, M a r x J., 1993a. New colon cancer gene discovered. S cien ce,260, M a r x J., 1993b. Cell death studies yield cancer clues. Science 259, M a r x J., New tumor suppressor may rival p53. Science 264, N e v in s J. R., E2F: a link between the rb tumor suppressor protein and viral oncoproteins. Science 258, P in es J., p21 Inhibits cyclin shock. Nature 369, R e in f e r b e r g e r G., Liu L., Ich im u ra K., Amplification and overexpression of mdm2 gene in subset of human malignant gliomas without p53 mutation. Cancer Res S ie d le c k i J. A., 1993a. p53 strażnik genomu. Nowotwory 43, S ie d le c k i J. A., 1993b. Geny śmierci kontra nowotwór. Nowotwory 43, S t e f f e n J., Postępy w badaniach nad dziedzicznymi predyspozycjami do rozwoju nowotworów złośliwych. Nowotwory 43,
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
Materiał i metody. Wyniki
Abstract in Polish Wprowadzenie Selen jest pierwiastkiem śladowym niezbędnym do prawidłowego funkcjonowania organizmu. Selen jest wbudowywany do białek w postaci selenocysteiny tworząc selenobiałka (selenoproteiny).
Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów
Zawartość 139585 Wstęp 1. Historia wirusologii 2. Klasyfikacja wirusów 3. Struktura cząstek wirusowych 3.1. Metody określania struktury cząstek wirusowych 3.2. Budowa cząstek wirusowych o strukturze helikalnej
Cykl komórkowy i nowotwory. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.
Cykl komórkowy i nowotwory Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego. Kilka podstawowych informacji Komórki wielokomórkowego organizmu
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń
ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE
Uniwersytet Medyczny w Lublinie Katedra i Zakład Patomorfologii Klinicznej ROZPRAWA DOKTORSKA STRESZCZENIE Lek. Joanna Irla-Miduch WERYFIKACJA HISTOPATOLOGICZNA I OCENA EKSPRESJI BIAŁKA p16 INK4A ORAZ
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Anna Markowska Klinika Perinatologii i Chorób Kobiecych
Anna Markowska Klinika Perinatologii i Chorób Kobiecych Epidemiologia zachorowalności na raka endometrium Na świecie W Polsce 2008 >288.000 4820 2012 >319.000 5426 Globocan 2012 Krajowy Rejestr Nowotworów
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości
Czynniki genetyczne sprzyjające rozwojowi otyłości OTYŁOŚĆ Choroba charakteryzująca się zwiększeniem masy ciała ponad przyjętą normę Wzrost efektywności terapii Czynniki psychologiczne Czynniki środowiskowe
Molekularne markery nowotworowe
Molekularne markery nowotworowe Dr Marta Żebrowska Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki, Zakład Biochemii Farmaceutycznej i Diagnostyki Molekularnej Źródło ryc: http://www.utmb.edu/scccb/;
KARTA PRZEDMIOTU. 1. Nazwa przedmiotu BIOLOGIA MOLEKULARNA. 2. Numer kodowy BIO04c. 3. Język, w którym prowadzone są zajęcia polski
Projekt OPERACJA SUKCES unikatowy model kształcenia na Wydziale Lekarskim Uniwersytetu Medycznego w Łodzi odpowiedzią na potrzeby gospodarki opartej na wiedzy współfinansowany ze środków Europejskiego
Diagnostyka molekularna umożliwia terapie spersonalizowane. Janusz A. Siedlecki
Diagnostyka molekularna umożliwia terapie spersonalizowane. Janusz A. Siedlecki Centrum Onkologii-Instytut, Warszawa 2015 Rozwój Rozwój medycyny i nauk podstawowych w ciągu ostatnich pięćdziesięciu lat
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Geny, a funkcjonowanie organizmu
Geny, a funkcjonowanie organizmu Wprowadzenie do genów letalnych Geny kodują Białka Kwasy rybonukleinowe 1 Geny Występują zwykle w 2 kopiach Kopia pochodząca od matki Kopia pochodząca od ojca Ekspresji
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Cykl komórkowy. Rozmnażanie komórek G 1, S, G 2. (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza)
Rozmnażanie komórek (powstanie 2 identycznych genetycznie komórek potomnych): podwojenie zawartości (interfaza) G 1, S, G 2 podział komórki (faza M) Obejmuje: podwojenie zawartości komórki (skopiowanie
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
Prokariota i Eukariota
Prokariota i Eukariota W komórkach organizmów żywych ilość DNA jest zazwyczaj stała i charakterystyczna dla danego gatunku. ILOŚĆ DNA PRZYPADAJĄCA NA APARAT GENETYCZNY WZRASTA WRAZ Z BARDZIEJ FILOGENETYCZNIE
PROGRAM NAUCZANIA PRZEDMIOTU FAKULTATYWNEGO NA WYDZIALE LEKARSKIM I ROK AKADEMICKI 2015/2016 PRZEWODNIK DYDAKTYCZNY
PROGRAM NAUCZANIA PRZEDMIOTU FAKULTATYWNEGO NA WYDZIALE LEKARSKIM I ROK AKADEMICKI 2015/2016 PRZEWODNIK DYDAKTYCZNY 1. NAZWA PRZEDMIOTU : Zbadaj się sam, czyli predyspozycje genetyczne do częstych chorób
GENY SUPRESOROWE MOLEKULARNE MECHANIZMY DZIAŁANIA I ICH ZNACZENIE W KONTROLI PROLIFERACJI KOMÓREK
Polskie 1995, 44 (2): 323-352 Towarzystwo PL ISSN 0023-4249 Ä KOSMOS Ba r b a r a G r z e l a k o w s k a -Sz t a b e r t Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego, PAN Pasteura 3, 02-093 Warszawa
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Choroby genetyczne o złożonym
The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals
The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals autorstwa Sugako Ogushi Science vol 319, luty 2008 Prezentacja Kamil Kowalski Jąderko pochodzenia matczynego jest konieczne
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Gdzie chirurg nie może - - tam wirusy pośle. czyli o przeciwnowotworowych terapiach wirusowych
Gdzie chirurg nie może - - tam wirusy pośle czyli o przeciwnowotworowych terapiach wirusowych Wirusy zwiększające ryzyko rozwoju nowotworów HBV EBV HCV HTLV HPV HHV-8 Zmniejszenie liczby zgonów spowodowanych
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs W. H. Colledge, M. B. L. Carlton, G. B. Udy & M. J. Evans przygotowała Katarzyna Czajkowska 1 Dysrupcja (rozbicie) genu
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem.
Właściwości szlaku sygnalizacyjnego białka p53 ujawnione podczas analizy skutków traktowania komórek rezweratrolem. Streszczenie Ogólnym celem niniejszej pracy było lepsze zrozumienie funkcjonowania szlaku
Interfaza to niemal 90% cyklu komórkowego. Dzieli się na 3 fazy: G1, S i G2.
W wyniku podziału komórki powstaje komórka potomna, która ma o połowę mniej DNA od komórki macierzystej i jest o połowę mniejsza. Aby komórka potomna była zdolna do kolejnego podziału musi osiągnąć rozmiary
PRODUKTY GENÓW PRZECIWNOWOTWOROWYCH
Polskie 1 9 9 4, 4 3 (3 /4 ): 5 2 3-5 3 6 Towarzystwo PL ISSN 0023-4249 S S S l KOSMOS ANTONI HORST Zakład Genetyki Człowieka PAN, Strzeszyńska 32, 60-479 Poznań PRODUKTY GENÓW PRZECIWNOWOTWOROWYCH Choroby
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
Szczegółowy harmonogram ćwiczeń Biologia medyczna w Zakładzie Biologii w roku akademickim 2017/2018 Analityka Medyczna I rok
Szczegółowy harmonogram ćwiczeń Biologia medyczna w Zakładzie Biologii w roku akademickim 2017/2018 Analityka Medyczna I rok Przedmiot Wykłady Ćwiczenia Poniedziałek 8.00 10.15 grupa V Wtorek 11.00 13.15
IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO
IMMUNOHISTOCHEMICZNA OCENA MERKERÓW PROLIFERACJI KOMÓRKOWEJ W RAKU JELITA GRUBEGO EWA STĘPIEŃ ZAKŁAD PATOMORFOLOGII OGÓLNEJ AKADEMII MEDYCZNEJ W BIAŁYMSTOKU KIEROWNIK I OPIEKUN PRACY: Dr KATARZYNA GUZIŃSKA-USTYMOWICZ
Do moich badań wybrałam przede wszystkim linię kostniakomięsaka 143B ze względu na jej wysoki potencjał przerzutowania. Do wykonania pracy
Streszczenie Choroby nowotworowe stanowią bardzo ważny problem zdrowotny na świecie. Dlatego, medycyna dąży do znalezienia nowych skutecznych leków, ale również rozwiązań do walki z nowotworami. Głównym
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)
Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 (skrajne daty) 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym
Analiza mutacji genów EGFR, PIKCA i PTEN w nerwiaku zarodkowym mgr Magdalena Brzeskwiniewicz Promotor: Prof. dr hab. n. med. Janusz Limon Katedra i Zakład Biologii i Genetyki Gdański Uniwersytet Medyczny
Biologia molekularna
Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne i niestacjonarne
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ
dr hab. prof. AWF Agnieszka Zembroń-Łacny DOPING GENOWY 3 CIEMNA STRONA TERAPII GENOWEJ KOMÓRKI SATELITARNE (ang. stem cells) potencjał regeneracyjny mięśni HIPERTROFIA MIĘŚNI University College London,
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza
dr hab. Beata Schlichtholz Gdańsk, 20 października 2015 r. Katedra i Zakład Biochemii Gdański Uniwersytet Medyczny ul. Dębinki 1 80-211 Gdańsk Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza pt.
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe Marcin Kruszewski Centrum Radiobiologii i Dozymetrii Biologicznej Instytut Chemii
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
Podział komórkowy u bakterii
Mitoza Podział komórkowy u bakterii Najprostszy i najszybszy podział komórkowy występuje u bakterii, które nie mają jądra komórkowego, lecz jedynie pojedynczy chromosom tzw. chromosom bakteryjny. Podczas
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii?
Czym jest medycyna personalizowana w kontekście wyzwań nowoczesnej onkologii? Wykorzystanie nowych technik molekularnych w badaniach nad genetycznymi i epigenetycznymi mechanizmami transformacji nowotworowej
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
DNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
WIEDZA. wskazuje lokalizacje przebiegu procesów komórkowych
Załącznik nr 7 do zarządzenia nr 12 Rektora UJ z 15 lutego 2012 r. Opis zakładanych efektów kształcenia na studiach podyplomowych Nazwa studiów: Medycyna Molekularna w Praktyce Klinicznej Typ studiów:
Molekularne podstawy karcynogenezy i ścieżki sygnałowe niektórych nowotworów ośrodkowego układu nerwowego
ISSN 1734 5251 Molekularne podstawy karcynogenezy i ścieżki sygnałowe niektórych nowotworów ośrodkowego układu nerwowego Wenancjusz Domagała Zakład Patomorfologii Pomorskiej Akademii Medycznej w Szczecinie
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Dominika Stelmach Gr. 10B2
Dominika Stelmach Gr. 10B2 Czym jest DNA? Wielkocząsteczkowy organiczny związek chemiczny z grupy kwasów nukleinowych Zawiera kwas deoksyrybonukleoinowy U organizmów eukariotycznych zlokalizowany w jądrze
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) 3. Podstawy genetyki I nformacje ogólne Kod F3/A modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu Podstawy
Genetyka człowieka II. Dziedziczenie wieloczynnikowe. Zmiany somatyczne - nowotwory
Genetyka człowieka II Dziedziczenie wieloczynnikowe. Zmiany somatyczne - nowotwory Dziedziczenie Mendlowskie - jeden gen = jedna cecha np. allele jednego genu decydują o chorobie Huntingtona Bardziej złożone
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Podstawy biologii. Informacja, struktura i metabolizm.
Podstawy biologii Informacja, struktura i metabolizm. Informacje Kontakt: Paweł Golik Instytut Genetyki i Biotechnologii, Pawińskiego 5A pgolik@igib.uw.edu.pl Informacje, materiały: http://www.igib.uw.edu.pl/
Kosm os. PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika. Tom 48, 1999 Numer 3 (244) Strony
Kosm os Tom 48, 1999 Numer 3 (244) Strony 353-358 PROBLEMY NAUK BIOLOGICZNYCH Polskie Towarzystwo Przyrodników im. Kopernika PIOTR POLACZEK Division of Biology 147-75, California Institute of Technology
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
Dopasowanie sekwencji (sequence alignment)
Co to jest alignment? Dopasowanie sekwencji (sequence alignment) Alignment jest sposobem dopasowania struktur pierwszorzędowych DNA, RNA lub białek do zidentyfikowanych regionów w celu określenia podobieństwa;
Sesja sponsorowana przez Olympus Optical Polska SESJA 8 DIAGNOSTYKA GENETYCZNA. TERAPIA GENOWA WYKŁADY
Sesja sponsorowana przez Olympus Optical Polska SESJA 8 DIAGNOSTYKA GENETYCZNA. TERAPIA GENOWA WYKŁADY 180 SESJA 8 WYKŁADY W08-01 DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA-METODY WYKRYWANIA MUTACJI W GENACH Włodzimierz
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Przemiana materii i energii - Biologia.net.pl
Ogół przemian biochemicznych, które zachodzą w komórce składają się na jej metabolizm. Wyróżnia się dwa antagonistyczne procesy metabolizmu: anabolizm i katabolizm. Szlak metaboliczny w komórce, to szereg
Spis treści 1 Komórki i wirusy Budowa komórki Budowa k
Spis treści 1 Komórki i wirusy.......................................... 1 1.1 Budowa komórki........................................ 1 1.1.1 Budowa komórki prokariotycznej.................... 2 1.1.2
Disruption of c-mos causes parthenogenetic develepment of unfertilized mouse eggs. W.H Colledge, M.B.L. Carlton, G.B. Udy & M.J.
Disruption of c-mos causes parthenogenetic develepment of unfertilized mouse eggs. W.H Colledge, M.B.L. Carlton, G.B. Udy & M.J.Evans Partenogeneza-dzieworództwo, to sposób rozmnażania polegający na rozwoju
Streszczenie wykładu AUTOSTOPEM DO JĄDRA KOMÓRKOWEGO CZYLI MECHANIZMY ZAKAŻENIA WIRUSEM HPV16
Dr n. biol. Małgorzata Bieńkowska-Haba Streszczenie wykładu AUTOSTOPEM DO JĄDRA KOMÓRKOWEGO CZYLI MECHANIZMY ZAKAŻENIA WIRUSEM HPV16 Podstawowym celem każdego wirusa jest bezpieczne dostarczenie genomu
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Kolokwium (14pkt) Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
SYLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) Informacje ogólne
SYLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) Informacje ogólne Nazwa modułu: Moduł E Biologia molekularna Rodzaj modułu/przedmiotu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok, semestr studiów
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
Informacje dotyczące pracy kontrolnej
Informacje dotyczące pracy kontrolnej Słuchacze, którzy z przyczyn usprawiedliwionych nie przystąpili do pracy kontrolnej lub otrzymali z niej ocenę negatywną zobowiązani są do dnia 06 grudnia 2015 r.
OBLICZENIA ZA POMOCĄ PROTEIN
OBLICZENIA ZA POMOCĄ PROTEIN KODOWANIE I PRZETWARZANIE INFORMACJI W ORGANIZMACH Informacja genetyczna jest przechowywana w DNA i RNA w postaci liniowych sekwencji nukleotydów W genach jest przemieniana
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Genetyka kliniczna - opis przedmiotu
Genetyka kliniczna - opis przedmiotu Informacje ogólne Nazwa przedmiotu Genetyka kliniczna Kod przedmiotu 12.9-WL-Lek-GK Wydział Wydział Lekarski i Nauk o Zdrowiu Kierunek Lekarski Profil praktyczny Rodzaj