Do stosowania w diagnostyce in vitro. P0205(02) Do stosowania z systemem BD MAX Polski

Wielkość: px
Rozpocząć pokaz od strony:

Download "Do stosowania w diagnostyce in vitro. P0205(02) Do stosowania z systemem BD MAX Polski"

Transkrypt

1 MAX MRSA XT Do stosowania w diagnostyce in vitro P0205(02) Do stosowania z systemem BD MAX Polski PRZEZNACZENIE Oznaczenie BD MAX MRSA XT służące do przeprowadzania testów z użyciem systemu BD MAX to zautomatyzowany test diagnostyczny in vitro do bezpośredniego jakościowego wykrywania DNA Staphylococcus aureus (gronkowca złocistego) opornego na metycylinę (MRSA) w wymazach z nosa u pacjentów zagrożonych kolonizacją nosa. W teście wykorzystywana jest reakcja łańcuchowa polimerazy (PCR) w czasie rzeczywistym do amplifikacji DNA MRSA oraz fluorogenne swoiste dla substancji docelowych sondy hybrydyzacyjne do wykrywania amplifikowanego DNA. Oznaczenie BD MAX MRSA XT służy do pomocy w zapobieganiu zakażeniom MRSA w placówkach opieki zdrowotnej i kontrolowaniu ich. Nie służy ono do diagnozowania zakażeń MRSA ani wspomagania czy monitorowania leczenia zakażeń MRSA. Ujemny wynik badania nie wyklucza możliwości kolonizacji nosa. Jednoczesne prowadzenie hodowli jest niezbędne, aby uzyskać organizmy do typowania epidemiologicznego lub dalszych badań wrażliwości. STRESZCZENIE I OBJAŚNIENIE PROCEDURY MRSA jest główną przyczyną zakażeń w placówkach opieki zdrowotnej. Bakterię tę przenoszą na dłoniach pracownicy placówek opieki zdrowotnej; jest ona również przenoszona w środowisku przez pacjentów zakażonych MRSA. Choć MRSA może wywoływać infekcje z objawami klinicznymi od krost po posocznicę i zgon, 1 to może on znajdować się także w nosie lub na skórze osób będących bezobjawowymi nosicielami. Leczenie zakażeń MRSA jest niezwykle trudne, ponieważ gronkowiec ten jest często oporny na wiele różnych środków przeciwdrobnoustrojowych. Szczepy Staphylococcus aureus oporne na metycylinę są często spotykane w placówkach opieki zdrowotnej i w niektórych szpitalach Ameryki Północnej stanowią ponad 50% izolatów Staphylococcus aureus pozyskanych od osób zarażonych w szpitalach. Czynnikami ryzyka zakażenia MRSA w placówkach opieki zdrowotnej są między innymi: przedłużająca się hospitalizacja, bliskość pacjentów zakażonych bądź skolonizowanych MRSA, kolonizacja innymi opornymi organizmami, takimi jak Enterococci oporne na wankomycynę (VRE) i Clostridium difficile, liczne lub przedłużające się cykle leczenia antybiotykami o szerokim spektrum działania, przebywanie w obszarach zagrożonych występowaniem MRSA w placówce opieki zdrowotnej, a także wcześniejsze zakażenie MRSA lub bycie nosicielem (z kolonizacją nosa). Wczesne wykrywanie pacjentów z nosowym nosicielstwem MRSA może stanowić element programu skutecznego zapobiegania zakażeniom MRSA. Wykrywanie MRSA w hodowlach wymaga izolacji czystych kolonii, poddawanych następnie badaniom wrażliwości na oksacylinę lub cefoksytynę, badaniom pod kątem obecności genu meca lub białka wiążącego penicylinę (PBP 2a) kodowanego przez gen meca. Proces identyfikacji MRSA oparty na hodowli trwa co najmniej 24 godziny (mediana do uzyskania wyniku to niemal 48 godzin). Ze względu na szybkość rozprzestrzeniania się zakażeń MRSA, szczególnie w placówkach opieki zdrowotnej, w których często znajdują się nosiciele, uzyskiwanie wyników nosicielstwa nosowego MRSA w dniu pobrania próbki stanowi zaletę, jeśli chodzi o programy zapobiegania zakażeniom. Sprawdzoną strategią ograniczenia przenoszenia zakażeń w placówkach opieki zdrowotnej i zapobiegania zakażeniom u pacjentów wrażliwych jest aktywna obserwacja przy użyciu testów molekularnych do szybkiego wykrywania MRSA. Nieprawidłowości w wykrywaniu mogą prowadzić do niekontrolowanego przenoszenia MRSA i niewłaściwego wykorzystania zasobów opieki zdrowotnej. 2 Inne dostępne w sprzedaży oznaczenia dają do 17,9% wyników dodatnich na obecność MRSA, które są nieprawidłowe z uwagi na nieobecność genu meca organizmy te zwane są dropout mutants, mutantami niezawierającymi genu docelowego. 3 Te fałszywie dodatnie wyniki mogą prowadzić do niepotrzebnej, kosztownej izolacji i leczenia pacjentów. 1 Szczepy MRSA z nowo wykrytym genem mecc odpowiadają za 3 4% wszystkich nowych przypadków MRSA, 4 ale nie są wykrywane w oznaczeniach nieukierunkowanych na gen mecc. 5 Niewykrywanie genu mecc może prowadzić do uzyskania fałszywie ujemnych wyników, które mogą przyczyniać się do niekontrolowanego rozprzestrzeniania się niewykrytych szczepów MRSA. Sposób działania oznaczenia ma krytyczne znaczenie dla poprawnego wykrywania MRSA i zagwarantowania odpowiedniej interwencji mającej na celu kontrolę zakażeń. W oznaczeniu BD MAX MRSA XT wykorzystywana jest rozszerzona kombinacja primerów i sond w celu wykrywania nowych szczepów MRSA, w tym szczepów z genami meca lub mecc, i zmniejszenia liczby fałszywie dodatnich wyników dla organizmów pozbawionych genów meca lub mecc. 1

2 Wymaz z nosa jest pobierany i transportowany do laboratorium z wykorzystaniem zalecanej wymazówki [patrz części Equipment (Sprzęt) i Materials Required But Not Provided (Materiały wymagane, ale niedostarczane)]. Wymazówkę umieszcza się w probówce na bufor próbki BD MAX MRSA XT. Probówka na bufor próbki jest worteksowana w celu przeniesienia komórek z wymazówki do buforu. Probówkę na bufor próbki umieszcza się w systemie BD MAX i zachodzą następujące zautomatyzowane czynności: komórki bakterii są poddawane lizie, DNA jest ekstrahowane na koralikach magnetycznych i zatężane, a następnie podpróbkę wymytego DNA dodaje się do odczynników do PCR zawierających swoiste dla MRSA primery służące do amplifikacji genów docelowych, o ile są obecne. Test zawiera również próbkę kontrolną. Próbka kontrolna znajduje się w probówce ekstrakcyjnej; przeprowadzane są na niej etapy ekstrakcji, zatężania i amplifikacji w celu wykrycia inhibitorów jak również braku wydajności procesu z powodu nieprawidłowości w działaniu aparatów lub odczynników. Po umieszczeniu w systemie BD MAX próbki klinicznej oraz BD MAX Unitized Reagent Strip (scalonego paska z odczynnikami) i BD MAX PCR Cartridge (kasety do PCR) interwencja operatora nie jest już potrzebna. System BD MAX umożliwia automatyzację lizy próbki, ekstrakcji i zatężania DNA, ponownego nawadniania odczynników, amplifikacji kwasów nukleinowych oraz wykrywania docelowych sekwencji kwasów nukleinowych przy wykorzystaniu reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR) w czasie rzeczywistym. Docelowe związki po amplifikacji wykrywane są sondami hydrolizy znakowanymi wygaszonymi fluoroforami. Amplifikacja, wykrywanie i interpretacja sygnałów zachodzą w systemie BD MAX automatycznie. ZASADY PROCEDURY W systemie BD MAX wykorzystywana jest kombinacja odczynników litycznych i ekstrakcyjnych w celu przeprowadzenia lizy komórek i ekstrakcji DNA. Po enzymatycznej lizie komórek w podwyższonej temperaturze uwolnione kwasy nukleinowe są wychwytywane na koralikach magnetycznych. Koraliki wraz z przyczepionymi do nich kwasami nukleinowymi są płukane, a kwasy nukleinowe ulegają wymywaniu w buforze do wymywania pod wpływem wysokiej temperatury. Wymyte cząsteczki DNA neutralizuje się z wykorzystaniem bufora zobojętniającego i przenosi do probówki z mieszaniną wzorcową w celu nawodnienia odczynników do PCR. Rekonstytuowane odczynniki do amplifikacji umieszcza się w kasecie do PCR BD MAX. Mikrozastawki w kasecie do PCR BD MAX są zamykane przez system przed rozpoczęciem PCR, aby zapobiec parowaniu i skażeniu amplikonów. Docelowe sekwencje DNA po amplifikacji wykrywane są przy pomocy sond hydrolitycznych (TaqMan) znakowanych z jednej strony fluorescencyjnym barwnikiem sygnałowym (fluoroforem), a z drugiej - grupą wygaszającą. Do wykrywania swoistego amplikonu połączenia prawego ramienia SCCmec (MREJ) i genów oporności na metycylinę meca i mecc, w trzech różnych kanałach optycznych systemu BD MAX wykorzystywane są sondy znakowane różnymi fluoroforami. Amplikony w połączeniu prawego ramienia SCCmec (MREJ) wykrywane są w kanale 475/520, amplikony genów oporności na metycylinę meca i mecc wykrywane są w kanale 585/630, a amplikony próbki kontrolnej wykrywane są w kanale 680/715. Gdy sondy są w stanie natywnym, fluorofor jest wygaszony wskutek bliskości grupy wygaszającej. Jednak w obecności docelowego DNA sondy hybrydyzują do swoich sekwencji komplementarnych i ulegają hydrolizie w wyniku aktywności egzonukleazy 5 3, jaką wykazuje polimeraza DNA, gdy syntetyzuje powstającą nić wzdłuż istniejącej nici DNA. W efekcie fluorofory pozostają odseparowane od cząsteczek wygaszających i emitowana jest fluorescencja. Intensywność fluorescencji zarejestrowanej w trzech kanałach optycznych wykorzystywanych w oznaczeniu BD MAX MRSA XT jest wprost proporcjonalna do ilości cząsteczek odpowiedniej sondy ulegających hydrolizie. W systemie BD MAX sygnały te są mierzone pod koniec każdego cyklu amplifikacji i na podstawie interpretacji danych podawany jest wynik. ODCZYNNIKI NR KAT. Zawartość Ilość BD MAX MRSA XT Master Mix (C7) (mieszanina wzorcowa) Sucha mieszanina wzorcowa do PCR zawierająca polimerazę, nukleotydy, swoiste sondy molekularne i primery 24 testy oraz sondę molekularną swoistą wobec próbki kontrolnej. BD MAX MRSA XT Unitized Reagent Strip (scalony pasek z odczynnikami) Scalony pasek z odczynnikami zawierający wszystkie ciekłe odczynniki oraz jednorazowe końcówki pipet 24 testy potrzebne do przetwarzania próbki i ekstrakcji DNA. BD MAX MRSA XT Extraction Tube (B8) (probówka ekstrakcyjna) Suchy odczynnik ekstrakcyjny zawierający koraliki magnetyczne z powinowactwem do DNA, achromopeptydazę 24 testy oraz próbkę kontrolną. BD MAX MRSA XT Sample Buffer Tube (probówka na bufor próbki) 24 testy (z 25 korkami z przegrodą) SPRZĘT I MATERIAŁY WYMAGANE, ALE NIEZNAJDUJĄCE SIĘ W ZESTAWIE Wymazówka BD BBL CultureSwab Liquid Stuart pojedyncza lub podwójna (BD, nr kat lub ), wymazówka Copan (Venturi) Transystem* Liquid Stuart pojedyncza lub podwójna (Copan, nr kat. 141C lub 139C) VWR Multi-Tube Vortexer (mieszadło wieloprobówkowe) (VWR, nr kat ) NALGENE Cryogenic Vial Holder (stojak do probówek kriogenicznych) (VWR, nr kat ) Rękawiczki jednorazowe, bez talku Sterylne nożyczki (opcjonalne) Sterylne gaziki Stoper lub czasomierz BD MAX PCR Cartridges (kasety do PCR) (nr kat. BD ) 2

3 OSTRZE ENIA I ŚRODKI OSTRO NOŚCI Oznaczenie BD MAX MRSA XT przeznaczone jest do stosowania w diagnostyce in vitro. Produkt może być używany tylko w systemie BD MAX. Nie stosować przeterminowanych odczynników ani materiałów. Nie używać zestawu, jeśli w chwili dostarczenia etykieta stanowiąca zamknięcie zewnętrznego pudełka jest uszkodzona. Nie używać odczynników, jeśli w chwili dostarczenia woreczki ochronne są otwarte lub uszkodzone. Nie używać odczynników, jeśli brak środka osuszającego lub jeśli jest on otwarty wewnątrz woreczka z odczynnikiem. Nie wyjmować środka osuszającego z woreczka z odczynnikiem. Po każdym użyciu odczynnika niezwłocznie szczelnie zamykać woreczki ochronne. Przed zamknięciem woreczka usunąć nadmiar powietrza. Chronić odczynniki przed wysoką temperaturą i wilgotnością. Przedłużone narażenie na działanie wilgotnego środowiska wpływa na działanie produktu. Nie używać odczynników, jeśli folia jest przerwana lub uszkodzona. Nie mieszać odczynników z różnych woreczków, zestawów lub serii. Nie należy zamieniać ani ponownie używać korków, gdyż może to spowodować ich zanieczyszczenie i negatywnie wpłynąć na wyniki testu. Odpowiednie napełnienie płynami można sprawdzić na scalonych paskach z odczynnikami (należy dopilnować, by płyny znajdowały się na dnie probówek [patrz Rysunek 1]). Sprawdzić na scalonych paskach z odczynnikami, czy wszystkie końcówki pipet są obecne (patrz Rysunek 1). Zachować ostrożność przy używaniu roztworów chemicznych, ponieważ kody kreskowe dla mieszaniny wzorcowej i probówki ekstrakcyjnej mogą stać się nieczytelne. Dla odpowiedniego działania tego testu zasadnicze znaczenie ma zachowanie dobrych praktyk laboratoryjnych. Z uwagi na wysoką czułość analityczną tego testu należy dołożyć szczególnych starań w kierunku zachowania czystości wszystkich materiałów i odczynników. Jeśli w tych samych obszarach laboratorium wykonywane są inne testy PCR, należy dopilnować, aby zestaw oznaczenia BD MAX MRSA XT, wszelkie dodatkowe odczynniki potrzebne do badania oraz system BD MAX nie uległy skażeniu. Należy bezwzględnie unikać skażenia odczynników mikroorganizmami i deoksyrybonukleazą (DNazą). Przed manipulacjami odczynnikami i kasetami konieczna jest zmiana rękawiczek. Aby uniknąć skażenia otoczenia amplikonami, nie otwierać kaset do PCR BD MAX po ich użyciu. Uszczelnienia kaset do PCR BD MAX zaprojektowane są tak, by zapobiegać skażeniu. W laboratorium należy rutynowo przeprowadzać monitorowanie środowiska w celu zminimalizowania ryzyka skażenia krzyżowego. Kasety mikroprzepływowe BD MAX przeznaczone są do użycia w maksymalnie dwóch cyklach. Wykonanie oznaczenia BD MAX MRSA XT poza zalecanymi ramami czasowymi może dać nieprawidłowe wyniki. Oznaczenia niewykonane w określonych ramach czasowych należy powtórzyć. W zależności od wytycznych lub wymogów wynikających z przepisów lokalnych, stanowych, wojewódzkich lub federalnych lub zaleceń organizacji akredytujących można zbadać dodatkowe próbki kontrolne. Należy zawsze postępować z próbkami jak z materiałem zakaźnym, zgodnie z wytycznymi dotyczącymi bezpiecznych procedur laboratoryjnych, takimi jak opisane w dokumentach CLSI M29 6 oraz Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories. 7 Pracując z odczynnikami, zawsze nosić odzież ochronną i rękawiczki jednorazowe. Po wykonaniu oznaczenia dokładnie umyć ręce. Nie pipetować ustami. Nie palić papierosów, nie spożywać płynów, nie jeść ani nie żuć w strefach pracy z próbkami lub odczynnikami zestawu. Niewykorzystane odczynniki i odpady zutylizować zgodnie z przepisami miejscowymi, stanowymi, wojewódzkimi lub ogólnokrajowymi. Dodatkowe ostrzeżenia, środki ostrożności i procedury można znaleźć w podręczniku użytkownika systemu BD MAX. 10 PRZECHOWYWANIE I STABILNOŚĆ Podczas transportu próbki powinny być przechowywane w temperaturze do 2 C do 2 C. Chronić przed ich zamrożeniem i zbyt wysoką temperaturą. Próbki można przechowywać w temperaturze 25 ± 2 C przez maksymalnie 48 godzin lub w temperaturze 2 8 C przez maksymalnie 120 godzin (5 dni) przed badaniem. Odczynniki i elementy testu BD MAX MRSA XT pozostają stabilne w temperaturze 2 25 C do upływu podanego terminu ważności. Nie należy używać odczynników i elementów, których termin ważności upłynął. Probówki z mieszaniną wzorcową BD MAX MRSA XT oraz probówki ekstrakcyjne dostarczane są w zamkniętych woreczkach. Aby chronić produkt przed działaniem wilgoci, należy niezwłocznie zamknąć woreczek ponownie po jego otwarciu. Probówki z odczynnikami są stabilne przez okres do 14 dni w temperaturze 2 25 C po otwarciu i ponownym zamknięciu woreczka. Nierekonstytuowane probówki z odczynnikami ekstrakcyjnymi i mieszaniny wzorcowej są stabilne do 5 godzin w temperaturze 2 25 C po ich wyjęciu z woreczka ochronnego. 3

4 INSTRUKCJE STOSOWANIA Pobieranie/transport próbek Używając zalecanych urządzeń do transportu wymazówek, (patrz część Materiały wymagane, lecz niedostarczane) wymazy z nosa należy pobrać zgodnie ze standardową procedurą postępowania w instytucji i laboratorium lub: 1. Zwilżyć wymazówki dwiema kroplami (około 50 µl) jałowej soli fizjologicznej lub pozostawić suche. 2. Ostrożnie wprowadzić wymazówki do nozdrza pacjenta [koniec wymazówki powinien być wprowadzony na głębokość do 2,5 cm (1 cala) od brzegu nozdrza]. 3. Obrócić wymazówkę wzdłuż błony śluzowej wewnątrz nozdrza pięciokrotnie. 4. Wprowadzić tę samą wymazówkę do drugiego nozdrza i powtórzyć kroki 2 i Umieścić wymazówki w probówce transportowej. 6. Oznaczyć etykietę na probówkę transportową. 7. Przetransportować wymazówki do laboratorium zgodnie ze standardową procedurą postępowania w instytucji i laboratorium (patrz część Przechowywanie i stabilność). Przygotowanie próbek UWAGA: jedna (1) probówka na bufor próbki, jeden (1) korek z przegrodą, jedna (1) probówka z mieszaniną wzorcową (C7), jedna (1) probówka ekstrakcyjna (B8) oraz jeden (1) scalony pasek z odczynnikami to materiały wymagane do przetestowania każdej próbki i każdej zewnętrznej próbki kontrolnej. UWAGA: w kwestii wykonywania posiewu z próbek klinicznych przed wykonaniem oznaczenia BD MAX MRSA XT należy odnieść się do części Posiew próbek materiałów klinicznych. 1. Pozyskać taką liczbę probówek na bufor próbki (z bezbarwnym korkiem), jaka odpowiada liczbie próbek i próbek kontrolnych, które mają być przebadane. 2. Oznakować każdą probówkę na bufor próbki odpowiednimi danymi pacjenta, dopilnowując, aby nie zasłonić kodu kreskowego, nie pisać na nim ani nie nakleić na nim etykiety. 3. Zdjąć korek z probówki na bufor próbki. 4. Wyjąć wymazówkę z próbówki do transportu próbki i umieścić wymazówkę w odpowiedniej probówce na bufor próbki. 5. Trzymać wymazówkę za patyczek w pobliżu brzegu probówki na bufor próbki (użyć sterylnego gazika, aby zminimalizować ryzyko skażenia). Unieść wymazówkę o około 1 (jeden) centymetr z dna probówki na bufor próbki i zagiąć patyczek na krawędzi probówki, aby go złamać. Metoda alternatywna: do odcięcia patyczka użyć sterylnych nożyczek. 6. Zamknąć probówkę na bufor próbki korkiem z przegrodą. 7. Umieścić probówkę na bufor próbki w statywie do próbówek kriogenicznych NALGENE i worteksować z maksymalną prędkością przez 1 (jedną) minutę mieszadłem wieloprobówkowym. W mieszadle wieloprobówkowym można przetwarzać jednocześnie do 24 probówek. Obsługa systemu BD MAX UWAGA: szczegółowe instrukcje znajdują się w podręczniku użytkownika systemu BD MAX (patrz część Obsługa ). UWAGA: oznaczenie BD MAX MRSA XT należy przeprowadzić niezwłocznie po wyżej wymienionym kroku worteksowania (patrz Przygotowanie próbek, krok 7). W razie konieczności ponownego wykonania testu należy ponownie wykonać worteksowanie próbek. 1. Włączyć system BD MAX (jeśli nie jest już włączony) i zalogować się, wprowadzając <user name> (nazwę użytkownika) i <password> (hasło). 2. Przed manipulacjami odczynnikami i kasetami konieczna jest zmiana rękawiczek. 3. Wyjąć pożądaną liczbę scalonych pasków z odczynnikami z zestawu BD MAX MRSA XT. Delikatnie postukać każdym scalonym paskiem z odczynnikami o twardą powierzchnię, tak aby wszystkie porcje płynu znalazły się na dnie probówek. 4. Wyjąć pożądaną liczbę probówek ekstrakcyjnych i probówek z mieszaniną wzorcową z woreczków zabezpieczających. Usunąć nadmiar powietrza i zamknąć szczelnie woreczki. 5. Dla każdej badanej próbki umieścić 1 (jeden) scalony pasek z odczynnikami w statywie systemu BD MAX, zaczynając od pozycji 1 na statywie A. 6. Wcisnąć 1 (jedną) probówkę ekstrakcyjną (biała folia) do każdego scalonego paska z odczynnikami w pozycję 1, jak pokazano na Rysunku Wcisnąć 1 (jedną) probówkę z mieszaniną wzorcową (zielona folia) do każdego scalonego paska z odczynnikami w pozycję 2, jak pokazano na Rysunku 1. 4

5 Rysunek 1: Wcisnąć probówki ekstrakcyjne z zestawu BD MAX MRSA XTi probówki z mieszaniną wzorcową do scalonych pasków z odczynnikami. 8. Kliknąć ikonę Run (Uruchom) i wprowadzić numer serii zestawu BD MAX MRSA XT (do celów śledzenia serii), skanując kod kreskowy (znajdujący się na zewnętrznym pudełku) albo ręcznie. UWAGA: krok 8 powtarzać za każdym razem, gdy używana jest nowa partia zestawów. 9. Przejść do Worklist (Listy roboczej). Z menu rozwijanego wybrać <BD MAX MRSA XT 54>. 10. Wprowadzić identyfikator probówki na bufor próbki, identyfikator pacjenta i numer akcesyjny (jeśli ma zastosowanie) do Worklist (Listy roboczej), odczytując kod kreskowy skanerem lub ręcznie. 11. Wybrać odpowiedni numer serii zestawu (znajdujący się na zewnętrznym pudełku) z menu rozwijanego. 12. Powtórzyć kroki 9 11 dla wszystkich pozostałych probówek na bufor próbki. 13. Umieścić probówki na bufor próbki w statywach systemu BD MAX odpowiadających scalonym paskom z odczynnikami zebranym w krokach 5 do 7. UWAGA: umieścić probówki na bufor próbki w statywie na próbki etykietą z kodem kreskowym 1D na zewnątrz (ułatwia to skanowanie probówek na bufor próbki podczas rejestracji próbki). 14. Umieścić wymaganą liczbę kaset do PCR BD MAX w systemie BD MAX (patrz Rysunek 2). Każda kaseta do mieści maksymalnie 24 próbki. System BD MAX automatycznie wybierze pozycję i rząd na kasecie do PCR BD MAX dla każdego cyklu. Kaset do PCR BD MAX można używać wielokrotnie, do wykorzystania wszystkich ścieżek. Aby zmaksymalizować wykorzystanie kaset do PCR BD MAX przy użyciu trybu 2000 Sample Mode, wybrać Run Wizard (Uruchom kreator) z karty Worklist (Lista robocza) do zadań dla ścieżki. Więcej informacji można znaleźć w podręczniku użytkownika systemu BD MAX. 10 Rysunek 2: Wkładanie kaset do PCR BD MAX 5

6 15. Umieścić statywy w systemie BD MAX (patrz Rysunek 3). Strona A Strona B Rysunek 3: Wkładanie statywów do systemu BD MAX 16. Zamknąć pokrywę systemu BD MAX i kliknąć <Start>, aby rozpocząć przetwarzanie. 17. Pod koniec cyklu można sprawdzić wyniki od razu lub przechowywać probówki na bufor próbki w temperaturze 2 8 C do 5 dni LUB w temperaturze 25 ± 2 C przez maksymalnie 48 godzin do sprawdzenia wyników. UWAGA: w razie uszkodzenia korka z przegrodą podczas cyklu należy wymienić go na nowy przed odłożeniem próbki do przechowywania. UWAGA: przygotowane probówki na bufor próbki oznaczenia BD MAX MRSA XT można przechowywać w temperaturze 2 8 C przez maksymalnie 120 godzin (5 dni) LUB w temperaturze 25 ± 2 C przez maksymalnie 36 godzin po umieszczeniu próbki w probówce na bufor próbki. W razie uzyskania wyniku nieokreślonego (IND), nierozstrzygającego (UNR) lub niepełnego (INC) lub w razie niepowodzenia testu zewnętrznej próbki kontrolnej test materiału z probówki na bufor próbki musi być powtórzony w tych ramach czasowych (patrz część Procedura powtarzania testu). KONTROLA JAKOŚCI Procedury kontroli jakości służą do monitorowania działania oznaczenia. Laboratoria ustalają liczbę, rodzaj i częstotliwość wykonywania testów materiałów kontrolnych zgodnie z wytycznymi lub wymogami przepisów lokalnych, wojewódzkich, stanowych, federalnych lub krajowych lub organizacji akredytujących. W zakresie ogólnych wytycznych dotyczących kontroli jakości użytkownik może odnieść się do dokumentów CLSI MM3 i EP12. 8,9 1. Materiały do zewnętrznych próbek kontrolnych nie są dostarczane przez BD. Zewnętrzne próbki kontrolne dodatnie i ujemne nie są wykorzystywane przez oprogramowanie systemu BD MAX do celów interpretacji wyniku badania próbki. Zewnętrzne próbki kontrolne traktowane są tak, jak próbki pochodzące od pacjentów. (W kwestii interpretacji wyników badania zewnętrznych próbek kontrolnych należy odnieść się do tabeli w części Interpretacja wyników). 2. W każdym laboratorium należy co najmniej raz dziennie wykonywać badanie 1 (jednej) zewnętrznej próbki kontrolnej dodatniej i 1 (jednej) zewnętrznej próbki kontrolnej ujemnej, do momentu uzyskania odpowiedniej walidacji procesu wykonywanego przy użyciu systemu BD MAX. Częstotliwość testów kontrolnych można zmniejszyć zgodnie z mającymi zastosowanie przepisami. 3. Celem badania zewnętrznych próbek kontrolnych dodatnich jest monitorowanie pod kątem znacząco nieprawidłowego działania odczynników. Celem badania zewnętrznych próbek kontrolnych ujemnych jest wykrywanie skażenia odczynników lub otoczenia docelowymi kwasami nukleinowymi (lub ich przeniesienia na próbkę). 4. Szczepy kontrolne należy badać zgodnie z wytycznymi lub wymogami przepisów lokalnych, stanowych lub federalnych lub organizacji akredytujących, w celu monitorowania skuteczności całej procedury analitycznej. 5. Zaleca się stosowanie różnych rodzajów zewnętrznych próbek kontrolnych, aby umożliwić użytkownikowi wybranie najbardziej odpowiednich dla programu kontroli jakości w danym laboratorium. a. Zewnętrzna kontrola ujemna: Materiał kontrolny dostępny w sprzedaży [np. szczep Staphylococcus epidermidis (ATCC 12228)] lub uprzednio scharakteryzowana próbka ujemna. Firma BD zaleca przygotowanie zewnętrznej próbki kontrolnej ujemnej przed zewnętrzną próbką kontrolną dodatnią, aby zmniejszyć ryzyko skażenia podczas przygotowywania próbki kontrolnej. b. Zewnętrzna kontrola dodatnia: Materiały kontrolne dostępne w sprzedaży [np. szczep referencyjny MRSA (ATCC 43300)] lub uprzednio scharakteryzowana próbka dodatnia. W celu przygotowania zawiesin próbek kontrolnych zewnętrznych przeprowadzić izolaty ponownie w zawiesinę w soli fizjologicznej do uzyskania mętności 0,5 w skali McFarlanda (~1 X 10 8 CFU/mL). Przygotować serię rozcieńczeń w soli fizjologicznej, aby uzyskać ostateczną zawiesinę o mętności ~1,0 x 10 4 CFU/mL. Zanurzyć wymazówkę w rozcieńczonej zawiesinie bakteryjnej, odcisnąć nadmiar płynu i umieścić wymazówkę w odpowiedniej probówce na bufor próbki. Przetwarzać i testować jak próbkę (patrz części Przygotowanie próbek i Obsługa systemu BD MAX). 6. Wszystkie zewnętrzne próbki kontrolne powinny dawać oczekiwane wyniki (dodatnie dla zewnętrznej kontroli dodatniej, ujemne dla zewnętrznej kontroli ujemnej) i nie powinny wystąpić niepowodzenia kontroli zewnętrznej (wyniki nierozstrzygające lub nieokreślone). 6

7 7. Jeśli dla zewnętrznej kontroli ujemnej wynik testu okaże się dodatni, oznacza to nieprawidłowości lub skażenie przy przygotowywaniu próbki. Należy sprawdzić technikę manipulacji próbką tak, by uniknąć pomyłek i skażenia. Jeśli dla zewnętrznej dodatniej próbki kontrolnej wynik testu okaże się ujemny, oznacza to nieprawidłowości przy manipulacji lub przygotowaniu próbki. Należy sprawdzić technikę manipulacji próbką i jej przygotowania. 8. Nierozstrzygający, nieokreślony lub niepełny wynik testu dla zewnętrznej próbki kontrolnej wskazuje na nieprawidłowości w odczynnikach lub w działaniu systemu BD MAX. Sprawdzić, czy na monitorze systemu BD MAX nie ma komunikatów o błędach. Informacje dotyczące interpretacji kodów ostrzeżeń i błędów można znaleźć w części Podsumowanie błędów systemowych podręcznika użytkownika systemu BD MAX. 10 Jeśli problem powtarza się, należy użyć odczynników z nieotwartego woreczka lub nowego zestawu testowego. 9. Każda probówka ekstrakcyjna zawiera próbkę kontrolną będącą plazmidem zawierającym syntetyczną sekwencję DNA docelowego. Próbka kontrolna służy do monitorowania skuteczności wychwytywania DNA, jego płukania i wymywania podczas przetwarzania próbki, jak również skuteczności amplifikacji i wykrywania DNA podczas analizy PCR. Jeśli wynik badania dla próbki kontrolnej nie spełni kryteriów dopuszczalności, wynik badania dla próbki zostanie podany jako nierozstrzygający; jednak wyniki dodatnie (POS) oznaczenia zostaną również podane, a ponadto żadna z próbek nie dostanie kwalifikacji ujemnej (NEG). Wynik nierozstrzygający wskazuje na obecność inhibitorów w próbce lub nieprawidłowe działanie odczynnika. Testy dla wszelkich próbek, dla których podano wyniki nierozstrzygające, należy powtórzyć zgodnie z Procedurą powtarzania testu. INTERPRETACJA WYNIKÓW Wyniki są dostępne na karcie Results (Wyniki) w okienku Results na monitorze systemu BD MAX. Oprogramowanie BD MAX automatycznie interpretuje wyniki testu. Wynik testu może być MRSA NEG (negative ujemny), MRSA POS (positive dodatni) lub MRSA UNR (unresolved nierozstrzygający) w zależności od statusu substancji docelowej po amplifikacji i próbki kontrolnej. Wyniki IND (indeterminate nieokreślony) lub INC (incomplete niepełny) związane są z nieprawidłowym działaniem systemu BD MAX. Wyniki są interpretowane na podstawie poniższego algorytmu decyzyjnego. Tabela 1: Interpretacja wyników testu BD MAX MRSA XT Podany wynik oznaczenia MRSA POS MRSA NEG MRSA UNR IND INC Interpretacja wyniku Wykryto DNA MRSA Nie wykryto DNA MRSA Wynik nierozstrzygający obecność inhibitorów w próbce lub nieprawidłowe działanie odczynnika, brak amplifikacji organizmów docelowych lub próbki kontrolnej Wynik nieokreślony w związku z nieprawidłowym działaniem systemu BD MAX (z kodami ostrzeżeń lub błędów a ) Niepełny cykl (z kodami ostrzeżeń lub błędów a ) a Informacje dotyczące interpretacji kodów ostrzeżeń i błędów można znaleźć w części Rozwiązywanie problemów podręcznika użytkownika systemu BD MAX. 10 MRSA POS (wykryto DNA MRSA) Wykryto sygnał fluorescencji zarówno dla MREJ (swoisty dla Staphylococcus aureus) i genów docelowych meca lub mecc oraz Próbka kontrolna jest ignorowana, ponieważ amplifikacja docelowego MRSA jest nadrzędna wobec tej procedury kontrolnej. MRSA NEG (nie wykryto DNA MRSA) Nie wykryto sygnału fluorescencji w oznaczeniu BD MAX MRSA XT dla żadnego genu docelowego (meca, mecc ani MREJ) oraz wykryto sygnał fluorescencji dla próbki kontrolnej lub Wykryto sygnał fluorescencji tylko dla genu meca lub mecc [geny meca i mecc nie występują tylko w Staphylococcus aureus; są obecne również w innych bakteriach (np. S.epidermidis)] lub Wykryto sygnał fluorescencji tylko dla MREJ (organizm pozbawiony genów meca lub mecc). MRSA UNR (wynik nierozstrzygający) Nie wykryto sygnału fluorescencji dla genu docelowego meca, mecc ani MREJ oraz Nie wykryto sygnału fluorescencji dla próbki kontrolnej (obecność inhibitorów lub nieprawidłowe działanie odczynnika). IND (Wynik nieokreślony) Błąd systemu BD MAX z kodami ostrzeżeń lub błędów. Informacje dotyczące interpretacji kodów ostrzeżeń i błędów można znaleźć w części Rozwiązywanie problemów podręcznika użytkownika systemu BD MAX. 10 INC (niepełny cykl) Błąd systemu BD MAX z kodami ostrzeżeń lub błędów. Informacje dotyczące interpretacji kodów ostrzeżeń i błędów można znaleźć w części Rozwiązywanie problemów podręcznika użytkownika systemu BD MAX. 10 PROCEDURA POWTARZANIA TESTU UWAGA: w probówce na bufor próbki znajduje się objętość wystarczająca na wykonanie jednego powtórzenia testu. Jeśli probówki na bufor próbki były przechowywane w temperaturze 25 ± 2 C, ponowne badanie należy wykonać w ciągu 36 godzin po wykonaniu kroków opisanych w części Przygotowanie próbek. Jeśli jednak probówki na bufor próbki były przechowywane w temperaturze 2 8 C, ponowne badanie należy wykonać w ciągu 120 godzin (5 dni) po wykonaniu kroków opisanych w części Przygotowanie próbek. 7

8 UWAGA: nowe próbki można przetestować w tym samym cyklu, co próbki badane ponownie. Wynik nierozstrzygający Wynik nierozstrzygający uzyskuje się w przypadku, gdy obecność inhibitora w próbce lub nieprawidłowe działanie odczynnika uniemożliwia odpowiednią amplifikację substancji docelowej lub próbki kontrolnej. Testy dla próbek można powtórzyć przy użyciu materiału pozostałego w odpowiednich probówkach na bufor próbki w czasie określonym powyżej. Próbki należy worteksować przez 1 (jedną) minutę i wykonać test ponownie, postępując zgodnie z częścią Obsługa systemu BD MAX. Wynik nieokreślony Wynik nieokreślony można uzyskać w przypadku nieprawidłowego działania systemu. Testy dla próbek można powtórzyć przy użyciu materiału pozostałego w odpowiednich probówkach na bufor próbki w czasie określonym powyżej. Próbki należy worteksować przez 1 (jedną) minutę i wykonać test ponownie, postępując zgodnie z częścią Obsługa systemu BD MAX. Informacje dotyczące interpretacji kodów ostrzeżeń i błędów można znaleźć w podręczniku użytkownika systemu BD MAX, 10 (część Rozwiązywanie problemów ). Wynik niepełny Wyniki niepełne można uzyskać w przypadku wystąpienia ostrzeżenia powodującego przerwanie testu lub kodu błędu lub w przypadku, gdy procedura przygotowywania próbki lub PCR nie zakończy się w oczekiwanym czasie. Wyniki niepełne mogą dotyczyć cyklu lub ścieżki. Testy dla próbek można powtórzyć przy użyciu materiału pozostałego w odpowiednich probówkach na bufor próbki w czasie określonym powyżej. Próbki należy worteksować przez 1 (jedną) minutę i wykonać test ponownie, postępując zgodnie z częścią Obsługa systemu BD MAX. Informacje dotyczące interpretacji kodów ostrzeżeń i błędów można znaleźć w podręczniku użytkownika systemu BD MAX, 10 część Rozwiązywanie problemów. Niepowodzenie testu zewnętrznej próbki kontrolnej Wyniki testu dla zewnętrznej próbki kontrolnej powinny być zgodne z oczekiwanymi. Jeśli badanie dla próbek należy powtórzyć z powodu nieprawidłowego wyniku testu dla kontroli zewnętrznej, należy wykonać ponowne testy próbek, korzystając z materiału w probówkach na bufor próbki oraz świeżo przygotowanych zewnętrznych próbek kontrolnych w wyżej zdefiniowanych ramach czasowych. Próbki należy worteksować przez 1 (jedną) minutę i wykonać test ponownie, postępując zgodnie z częścią Obsługa systemu BD MAX. POSIEW PRÓBEK KLINICZNYCH Aby wykonać testy wrażliwości na leczenie przeciwdrobnoustrojowe lub typowanie epidemiologiczne, posiew z próbek klinicznych można wykonać z wyrobu do pobierania (wymazówki) przed procedurą przygotowywania próbki (z wykorzystaniem metody Streak- Plate) lub po procedurze przygotowywania próbki (z wykorzystaniem metody Enrichment-Broth). Bezpośrednio po zakończeniu wstępnego cyklu PCR wymazówki można przechowywać w temperaturze 2 8 C przez maksymalne 36 godzin w probówkach na bufor próbki przed przeprowadzeniem posiewu, zgodnie z procedurami obowiązującymi w szpitalu. OGRANICZENIA PROCEDURY Produkt jest przeznaczony do użycia z wymazami z nosa pobranymi za pomocą wyrobów do pobierania i transportu próbek wymienionych w części Sprzęt i materiały wymagane, lecz niedostarczone. Nie oceniono działania oznaczenia BD MAX MRSA XT przy użyciu wyrobu do transportu pojedynczych lub podwójnych wymazówek Liquid Amies. Produktu należy używać tylko z systemem BD MAX. Wystąpienie nieprawidłowych wyników testu może także być spowodowane nieprawidłowym pobieraniem próbki, obchodzeniem się z nią lub jej przechowywaniem, obecnością inhibitorów, błędem technicznym, wymieszaniem próbki lub liczbą drobnoustrojów w próbce poniżej czułości analitycznej testu. Aby uniknąć uzyskania błędnych wyników, należy starannie przestrzegać instrukcji podanych na ulotce dołączonej do opakowania oraz w podręczniku użytkownika systemu BD MAX. 10 Badania przesiewowe określają status kolonizacji w danym momencie. Kolonizacja zależy od sposobu leczenia pacjenta (np. schematu leczenia mającego na celu dekolonizację), stanu pacjenta (np. przejściowa kolonizacja MRSA) lub narażenia na przebywanie w środowisku o podwyższonym ryzyku (np. kontakt z nosicielem MRSA lub przedłużająca się hospitalizacja). Status kolonizacji należy monitorować zgodnie z zasadami obwiązującymi w instytucji. Wynik dodatni w teście BD MAX MRSA XT nie musi oznaczać niepowodzenia leczenia mającego na celu usunięcie MRSA, ponieważ DNA może się utrzymywać w ustroju. Wynik ujemny po uprzednim uzyskaniu dodatniego wyniku testu może wskazywać na powodzenie leczenia mającego na celu wyeliminowanie bakterii lub może być wynikiem przejściowej kolonizacji. Dodatni wynik oznaczenia niekoniecznie wskazuje obecność żywych drobnoustrojów. Wynik dodatni wskazuje na obecność DNA MRSA. W oznaczeniu BD MAX MRSA XT jednocześnie wykrywany jest gen meca lub mecc w kasecie SCCmec oraz sekwencja swoista dla Staphylococcus aureus znajdująca się na połączeniu kasety SCCmec z genem orfx (MREJ). Oznaczenie BD MAX MRSA XT opracowane jest do wykrywania genotypów MREJ i, ii, iii, iv, v, vi, vii, ix, xiii, xiv i xxi, które reprezentują większość szczepów MRSA z genami meca i mecc (należących do różnych typów SCCmec/MREJ), które stanowią ponad 98% szczepów na świecie przebadanych dotąd przez BD. Nieznana jest zdolność oznaczenia BD MAX MRSA XT do wykrywania innych genotypów MREJ. W oznaczeniu BD MAX MRSA XT nie jest wykrywany gronkowiec złocisty o zwiększonej oporności na oksacylinę [Borderline Oxacillin Resistant Staphylococcus aureus (BORSA)] (podanym wynikiem będzie NEG). Mechanizm oporności na oksacylinę w szczepach BORSA związany jest ze zwiększoną produkcją β-laktamaz, nie z obecnością genu meca czy mecc. Szczepy BORSA występują rzadko. Nie jest znana skuteczność oznaczenia BD MAX MRSA XT w wykrywaniu zmodyfikowanych szczepów Staphylococcus aureus (MOD-SA), ponieważ szczepy te nie były oceniane. Mechanizm oporności szczepów MOD-SA na oksacylinę związany jest ze zmianami powinowactwa do oksacyliny białek wiążących penicylinę. Szczepy MOD-SA występują rzadko. 8

9 W oznaczeniu BD MAX MRSA XT wynik testu pod kątem MRSA będzie fałszywie dodatni, jeśli badana będzie próbka z nosa z jednoczesną kolonizacją, zawierająca zarówno koagulazoujemny, oporny na metycylinę szczep Staphylococcus (MRCoNS), jak i wariant SA z pustą kasetą podatny na metycylinę. Jednoczesna kolonizacja MRCoNS i wrażliwym na metycylinę wariantem SA z pustą kasetą występuje rzadko. Podobnie jak w przypadku wszystkich testów diagnostycznych in vitro opartych na PCR, przy bardzo niskim stężeniu substancji docelowej poniżej LoD (granicy wykrywalności) oznaczenia substancja może być wykryta, ale wyniki mogą nie być powtarzalne. Tobramycyna może zakłócać działanie oznaczenia BD MAX MRSA XT (więcej informacji podano w części Substancje zakłócające). Fałszywie ujemne wyniki mogą wystąpić z powodu utraty kwasów nukleinowych wskutek nieodpowiedniego sposobu pobrania, transportu lub przechowywania próbek lub niewystarczającej lizy komórek bakterii. Test zawiera próbkę kontrolną mającą na celu wspomaganie identyfikacji próbek zawierających inhibitory amplifikacji PCR oraz kontrolę prawidłowego składu odczynników i działania systemu oznaczenia jako całości. Badanie próbki kontrolnej nie pozwala na ustalenie, czy doszło do utraty kwasów nukleinowych wskutek nieodpowiedniej techniki pobrania, transportu lub przechowywania próbek, czy też komórki bakterii nie uległy lizie w odpowiednim stopniu. W przypadku hodowli mieszanej skuteczność wykrywania MRSA jest zmienna w obecności dużych stężeń MRSE. Zaobserwowano zakłócanie kompetycyjne ze strony MRSE przy stosunku MRSA:MRSE 1: 1x10 2. W przypadku hodowli mieszanej skuteczność wykrywania MRSA jest zmienna w obecności dużych stężeń MSSA. Zaobserwowano zakłócanie kompetycyjne ze strony MSSA przy stosunku MRSA:MSSA 1: 1x10 3. Wyniki oznaczenia BD MAX MRSA XT mogą czasami być nierozstrzygające z powodu nieprawidłowego wyniku dla próbki kontrolnej, lub też nieokreślone albo niepełne z powodu usterki aparatu; wymaga to ponownego przeprowadzenia testu, co może spowodować opóźnienie uzyskania ostatecznych wyników. Mutacje lub polimorfizm w regionie wiążącym primer lub sondę mogą wpłynąć na wykrywanie nowych lub nieznanych wariantów MRSA, co może spowodować fałszywie ujemny wynik badania w oznaczeniu BD MAX MRSA XT. Podobnie jak w przypadku wszystkich testów diagnostycznych in vitro, przewidywalne wartości dodatnie i ujemne zależą w dużym stopniu od częstości występowania. Skuteczność oznaczenia BD MAX MRSA XT może być różna w zależności od częstości występowania i badanej populacji. Oznaczenie BD MAX MRSA XT oznaczeń wymaga użycia 3 (trzech) kanałów optycznych systemu BD MAX: kanału 475/520, kanału 585/630 oraz kanału 680/715. Działania pozostałego kanału optycznego nie określono w tym oznaczeniu. WARTOŚCI OCZEKIWANE W badaniu klinicznym oznaczenia BD MAX MRSA XT uzyskano łącznie 2391 wyniki nadające się do analizy w 3 ośrodkach o różnym położeniu geograficznym w testach próbek spełniających wymogi badania co do próbek oraz co do wyniku PCR i porównano z hodowlą bezpośrednią oraz wzbogaconą. Badaną populację podzielono na kategorie pacjentów hospitalizowanych i ambulatoryjnych. Liczbę i odsetek przypadków z dodatnim wynikiem badania przy użyciu oznaczenia BD MAX MRSA XT podano w Tabeli 2. Tabela 2: Zestawienie włączonych do badania, spełniających kryteria próbek według grupy pacjentów Grupa Liczba próbek łącznie a Liczba wyników dodatnich w kierunku MRSA Pacjenci hospitalizowani Pacjenci ambulatoryjni Łącznie a a Łączna liczba próbek w oparciu o zgodne wyniki PCR. Odsetek wyników dodatnich względem MRSA 10,2% (172/1681) 3,9% (28/710) 8,4% (200/2391) CHARAKTERYSTYKA WYDAJNOŚCIOWA Wydajność kliniczna Charakterystykę kliniczną działania testu BD MAX MRSA XT określono w drodze wieloośrodkowego, prospektywnego badania klinicznego. W badaniu uczestniczyły 3 (trzy) ośrodki badawcze. Próbki zakwalifikowane do badania musiały pochodzić od pacjentów kwalifikujących się do badania pod kątem MRSA zgodnie z zasadami w danej instytucji. Wymogi kwalifikacji do badań przesiewowych zgodnie z zasadami w danych ośrodkach klinicznych obejmowały między innymi: pacjenci przyjęci do konkretnej placówki medycznej; pacjenci przyjęci na oddział intensywnej terapii; pacjenci przeniesieni na oddział intensywnej terapii; pacjenci oczekujący na planową operację oraz pacjenci przyjęci z placówek zapewniających długotrwałą opiekę. Próbki pochodzące od pacjentów wcześniej włączonych do badania wykluczono. Referencyjna metoda porównawcza obejmowała bezpośrednią hodowlę uzupełnioną przez hodowlę wzbogaconą. Dla wszystkich próbek, dla których stwierdzono wynik ujemny badania na obecność MRSA w wyniku hodowli bezpośredniej, przeprowadzono analizę hodowli wzbogaconej. Z domniemanych kolonii Staphylococcus aureus obserwowanych na selektywnym (dla Staphylococcus aureus) podłożu chromogennym przeprowadzono hodowle pochodne na agarze z krwią (BA). Identyfikację potwierdzono za testem aglutynacji, a oporność na metycylinę badaniem wrażliwości polegającym na dyfuzji krążka cefoksytyny (30 μg). W przypadku niepotwierdzenia MRSA we wstępnej hodowli bezpośredniej przeprowadzono wzbogacanie w bulionie tryptozowo-sojowym z dodatkiem 6,5% NaCl (TSB 6,5% NaCl). Mętnego bulionu TSB zawierający NaCl w stężeniu 6,5% użyto do inokulacji dodatkowego podłoża chromogennego i płytek BA; obecność MRSA potwierdzono zgodnie z opisem powyżej. 9

10 Wyniki uzyskane w oznaczeniu BD MAX MRSA XT w porównaniu z metodą referencyjną Do badania włączono 2451 próbek. Spośród nich 94 próbki uznano za niespełniające kryteriów protokołu, a dla 6 (sześciu) próbek w pełni spełniających te kryteria uzyskano wyniki PCR nienadające się do analizy. Do oceny skuteczności klinicznej oznaczenia BD MAX MRSA XT w porównaniu z metodą referencyjną użyto łącznie wyników dla 2351 próbek (Tabela 3). W porównaniu do metody referencyjnej (hodowla bezpośrednia/wzbogacona) w oznaczeniu BD MAX MRSA XT zidentyfikowano 93,1% próbek dodatnich względem MRSA i 97,8% próbek ujemnych względem MRSA (Tabela 4). W badanej populacji daje to ujemną wartość predykcyjną (NPV) 99,5% i dodatnią wartość predykcyjną (PPV) 75,4%. Tabela 3: Wyniki dla MRSA uzyskane w oznaczeniu BD MAX MRSA XT w porównaniu z metodą referencyjną Wszystkie ośrodki Oznaczenie BD MAX MRSA XT Metoda referencyjna MRSA Dodatnie Ujemne Łącznie Dodatnie a 197 Ujemne 11 a Łącznie Czułość: 93,1% (149/160) (95% CI: 88,1%, 96,1%) Swoistość: 97,8% (2143/2191) (95% CI: 97,1%, 98,3%) PPV: 75,4% (95% CI: 70,0%, 80,5%) NPV: 99,5% (95% CI: 99,1%, 99,7%) a Dla próbek, dla których uzyskano rozbieżne wyniki w badaniu metodą referencyjną i w oznaczeniu BD MAX MRSA XT, przeprowadzono dalsze testy. Dla 11 z 48 wyników fałszywie dodatnich w oznaczeniu BD MAX MRSA XT uzyskano wynik MRSA POS po powtórzeniu badania metodą referencyjną. Dla 5 z 11 wyników fałszywie ujemnych w oznaczeniu BD MAX MRSA XT uzyskano wynik MRSA NEG po powtórzeniu badania metodą referencyjną. Tabela 4: Wyniki dla MRSA uzyskane w poszczególnych ośrodkach w oznaczeniu BD MAX MRSA XT w porównaniu z metodą referencyjną Ośrodki kliniczne Częstość występowania a Czułość (95% CI) b Swoistość (95% CI) b Ośrodek 1 4,3% (41/960) Ośrodek 2 5,8% (38/650) Ośrodek 3 10,6% (81/765) Ogółem 6,7% (160/2375 c ) a Częstość występowania w oparciu o samą metodę refrencyjną b Przedział ufności c 2375 spełniało wymogi protokołu w badaniu metodą referencyjną 92,7% (38/41) (80,6%, 97,5%) 86,8% (33/38) (72,7%, 94,2%) 96,3% (78/81) (89,7%, 98,7%) 93,1% (149/160) (88,1%, 96,1%) 99,0% (908/917) (98,1%, 99,5%) 98,6% (583/591) (97,4%, 99,3%) 95,5% (652/683) (93,6%, 96,8%) 97,8% (2143/2193) (97,1%, 98,3%) Wyniki uzyskane w oznaczeniu BD MAX MRSA XT w porównaniu z hodowlą bezpośrednią Do badania włączono 2451 próbek. Spośród nich 54 wymazy z nosa uznano za niespełniające kryteriów protokołu, a dla 8 (ośmiu) próbek w pełni spełniających te kryteria uzyskano wyniki PCR nienadające się do analizy. Do oceny zgodności procentowej dodatniej i ujemnej oznaczenia BD MAX MRSA XT w porównaniu z hodowlą bezpośrednią użyto łącznie wyników dla 2389 próbek (Tabela 5). W porównaniu do hodowli bezpośredniej w oznaczeniu BD MAX MRSA XT zidentyfikowano 96,5% próbek dodatnich względem MRSA i 97,2% próbek ujemnych względem MRSA (Tabela 6). Tabela 5: Wyniki dla MRSA uzyskane w oznaczeniu BD MAX MRSA XT w porównaniu z hodowlą bezpośrednią Wszystkie ośrodki Oznaczenie BD MAX MRSA XT Hodowla bezpośrednia Dodatnie Ujemne Łącznie Dodatnie Ujemne Łącznie Odsetek zgodności wyników dodatnich: 96,5% (137/142) (95% CI: 92,0%, 98,5%) Odsetek zgodności wyników ujemnych: 97,2% (2184/2247) (95% CI: 96,4%, 97,8%) 10

11 Tabela 6: Wyniki dla MRSA uzyskane w poszczególnych ośrodkach w oznaczeniu BD MAX MRSA XT w porównaniu z hodowlą bezpośrednią Ośrodki kliniczne Dodatnia zgodność procentowa z 95% CI a Ujemna zgodność procentowa z 95% CI a Ośrodek 1 Ośrodek 2 Ośrodek 3 Ogółem a Przedział ufności 100% (35/35) (90,1%, 100%) 93,5% (29/31) (79,3%, 98,2%) 96,1% (73/76) (89,0%, 98,6%) 96,5% (137/142) (92,0%, 98,5%) 98,7% (911/923) (97,7%, 99,3%) 98,0% (586/598) (96,5%, 98,8%) 94,6% (687/726) (92,7%, 96,0%) 97,2% (2184/2247) (96,4%, 97,8%) Spośród 2399 wymazów z nosa spełniających wymogi badania co do próbek oraz co do wyniku PCR, przebadanych przy użyciu oznaczenia BD MAX MRSA XT, dla 18 (0,8%) po wstępnym badaniu uzyskano wynik nierozstrzygający. Odsetek wyników nierozstrzygających po powtórzeniu badania wynosił 0,1% (2/2396) (patrz Tabela 7; [dla jednej próbki nie powtórzono testu]). Odsetek początkowych wyników nierozstrzygających 0,8% (18/2399) a (95% CI: 0,5%, 1,2%) Tabela 7: Odsetek wyników nierozstrzygających Odsetek końcowych wyników nierozstrzygających uzyskanych po powtórzeniu testu 0,1% (2/2396) (95% CI: 0%, 0,3%) a Liczba łączna na podstawie liczby próbek spełniających wymogi protokołu i wyników oznaczenia BD MAX MRSA XT Spośród 2399 wymazów z nosa zbadanych za pomocą oznaczenia BD MAX MRSA XT dla 14 (0,6%) wyniki były początkowo nieokreślone. Żaden z wyników nie pozostał nieokreślony po powtórzeniu testu (dla dwóch próbek nie powtórzono testu). Dla 8 (ośmiu) (0,3%) wyniki były początkowo niepełne. Po powtórzeniu badania nie odnotowano wyników niepełnych (dla jednej próbki nie powtórzono testu). Warianty z pustą kasetą Aby próbkę można było zidentyfikować jako dodatnią względem MRSA w oznaczeniu BD MAX MRSA XT, wynik musi być dodatni zarówno dla MREJ, jak i meca lub mecc. Próbka zawierająca organizmy z MREJ, ale niemające genów ani meca, ani mecc, jest ujemna względem MRSA, ponieważ organizmy te są wrażliwe na metycylinę. Sytuacja ta ma miejsce, kiedy gen meca lub mecc zostanie wyeliminowany z kasety chromosomowej SCCmec, ale skrajny prawy fragment (MREJ) pozostanie, co prowadzi do uzyskania dodatniego wyniku w kierunku MREJ. Tego rodzaju próbki czasem określa się jako wariant z pustą kasetą. Dzięki możliwości wykrywania genów meca i mecc w oznaczeniu BD MAX MRSA XT można poprawnie odróżnić i zidentyfikować ten wariant jako MRSA NEG. Spośród 2351 kwalifikujących się do badania próbek testowanych w ramach określania działania klinicznego łącznie 10 pasowało do profilu pustej kasety dawały wynik dodatni względem MREJ, ale nie wykryto w nich genów meca ani mecc. Dla tych 10 próbek uzyskano wynik prawdziwie ujemny (true negative, TN) względem MRSA w badaniach metodą referencyjną. Czułość analityczna Czułość analityczną (granicę wykrywalności, LoD) testu BD MAX MRSA XT określono następująco: próbki dodatnie przygotowano poprzez namaczanie wymazówek w wielu różnych zawiesinach bakterii MRSA przygotowanych z hodowli i scharakteryzowanych ilościowo. Badane szczepy obejmowały 11 szczepów MRSA reprezentujących 11 genotypów MREJ (i, ii, iii, iv, v, vi, vii, ix, xiii, xiv i xxi) odpowiadających 5 typom SCCmec (I, II, III, IV i XI). Wymazy zostały następnie wymyte w symulowanej wzorcowej wydzielinie z nosa. Każdy szczep MRSA był badany w 24 powtórzeniach na stężenie przez dwóch różnych operatorów przy użyciu trzech różnych serii oznaczenia BD MAX MRSA XT. Czułość analityczna (Limit of Detection, LoD granica wykrywalności) dla szczepów MRSA, zdefiniowana jako najniższe stężenie, przy którym oczekuje się, że dla nie mniej niż 95% wszystkich powtórzeń testu uzyskany zostanie wynik dodatni, mieściła się w zakresie od 71 do 454 CFU/wymaz (Tabela 8). 11

12 Tabela 8: Granica wykrywalności genotypów MRSA w oznaczeniu BD MAX MRSA XT Szczep MRSA Genotyp MREJ Typ SCCmec a Stężenie LoD [CFU/wymaz (95% CI b )] 1 Typ i I 91 (55, 150) 2 Typ ii II 110 (68, 176) 3 Typ iii III 181 (102, 322) 4 Typ iv III 81 (48, 136) 5 Typ v IV 128 (74, 224) 6 Typ vi ND c 454 (246, 839) 7 Typ vii II 269 (134, 538) 8 Typ ix ND c 199 (111, 356) 9 Typ xiii ND c 71 (41, 121) 10 Typ xiv ND c 96 (57, 163) 11 Typ xxi d XI 108 (64, 183) a Typ SCCmec nie koreluje z typem MREJ są to dwie różne metody typowania. b Cl: Przedziały ufności c ND = not determined (nieokreślony) d Szczepy MRSA zawierające mecc (zwane również szczepem meca LGA251 ) Zakres analityczny Przeprowadzono badanie zakresu analitycznego przy użyciu różnych szczepów MRSA, biorąc pod uwagę położenie geograficzne, genotyp MREJ (szczepy dzikie i mutanty), typ SCCmec, typ PFGE (Pulsed-Field Gel Electrophoresis elektroforeza żelowa pulsacyjna), pochodzenie z różnych okresów oraz wzorzec wrażliwości. Przebadano 77 (siedemdziesiąt siedem) szczepów MRSA z 27 krajów, w tym pochodzące ze zbiorów publicznych oraz dobrze scharakteryzowane izolaty kliniczne, w tym szczepy Staphylococcus aureus oporne na wankomycynę (VRSA) i Staphylococcus aureus częściowo wrażliwe na wankomycynę (VISA). W oznaczeniu BD MAX MRSA XT wykrywano MREJ typu i, ii, iii, iv, v, vi, vii, ix, xiii, xiv oraz xxi przy małym stężeniu bakterii (2 3 x LoD). W oznaczeniu BD MAX MRSA XT wykrywano MRSA SCCmec typu I, II, III, IV, V, VI, VII, VIII oraz XI, jak również typy MRSA PFGE USA od 100 do 800, 1000 i 1100 przy 2 3 x LoD. Wykryto również wszystkie szczepy MRSA wykazujące dodatkową oporność na wankomycynę (VRSA i VISA). Ocena dobrze scharakteryzowanego panelu szczepów do testu prowokacji Przeprowadzono dodatkową analizę w celu oceny skuteczności analitycznej oznaczenia BD MAX MRSA XT przy użyciu dobrze scharakteryzowanego panelu szczepów do testu prowokacji: Dla 17 (siedemnastu) spośród 17 szczepów MRSA charakteryzujących się dużymi i małymi minimalnymi stężeniami hamującymi (MIC) oksacyliny, w tym typów PFGE USA od 100 do 800 i 1000, typu PFGE IV/IBERIAN oraz wariantu mecc (szczep LGA251 Staphylococcus aureus zawierający meca) przebadanych przy stężeniu 2 3 x LoD uzyskano wyniki MRSA POS. Dla 4 (czterech) z 4 szczepów BORSA (Staphylococcus aureus o zwiększonej oporności na oksacylinę) przebadanych przy stężeniu 10 6 CFU/wymaz uzyskano wyniki MRSA NEG. Dla 5 (pięciu) z 5 szczepów MSSA przebadanych przy stężeniu 10 6 CFU/wymaz uzyskano wyniki MRSA NEG. Dla 1 (jednego) z 1 szczepu Staphylococcus epidermidis opornego na metycylinę (MRSE) przebadanego przy stężeniu 10 6 CFU/wymaz uzyskano wynik MRSA NEG. Swoistość analityczna Oznaczenie BD MAX XT przeprowadzono na próbkach zawierających duże stężenie organizmów innych niż docelowe w systemie BD MAX, aby wykazać swoistość badania w zakresie wykrywania MRSA. Dla 57 (pięćdziesięciu siedmiu) z 57 szczepów różnych gatunków innych niż gronkowce przebadanych przy stężeniach 10 6 CFU/ ml (z wyjątkiem Cryptococcus neoformans, przebadanego przy stężeniu 3x10 5 CFU/wymaz) uzyskano wynik MRSA NEG. 45 (czterdzieści pięć) szczepów gronkowca koagulazoujemnych (CoNS) i koagulazododatnich (CoPS) reprezentujących 28 gatunków przebadano przy stężeniu odpowiadającym 0,5 w skali McFarlanda, używając oznaczenia BD MAX XT. Dla 45 (czterdziestu pięciu) z 45 szczepów uzyskano wyniki MRSA NEG. Dla 65 (sześćdziesięciu pięciu) szczepów MSSA (w tym 15 wariantów MSSA z pustą kasetą ) przy dużych stężeniach ( 10 6 CFU/wymaz) uzyskano wynik MRSA NEG. Przebadano 17 (siedemnaście) wirusów reprezentujących 12 różnych gatunków wirusowych przy stężeniu 10 5 PFU/mL. Dla wszystkich 17 wirusów uzyskano wynik MRSA NEG. 12

MAX MDR-TB P0228(08) Polski

MAX MDR-TB P0228(08) Polski SPIS TREŚCI MAX MDR-TB 443878 P0228(08) 2019-06 Polski PRZEZNACZENIE.... 1 STRESZCZENIE I OBJAŚNIENIE PROCEDURY... 1 ZASADY PROCEDURY... 1 ODCZYNNIKI I MATERIAŁY.... 2 Sprzęt i materiały wymagane, ale

Bardziej szczegółowo

MAX Extended Enteric Bacterial Panel

MAX Extended Enteric Bacterial Panel MAX Extended Enteric Bacterial Panel 443812 Do stosowania w diagnostyce in vitro P0221(03) Do stosowania z systemem BD MAX 2017-10 Polski PRZEZNACZENIE BD MAX Extended Enteric Bacterial Panel (rozszerzony

Bardziej szczegółowo

MAX Enteric Bacterial Panel

MAX Enteric Bacterial Panel MAX Enteric Bacterial Panel 442963 Do stosowania w diagnostyce in vitro P0217(03) Do stosowania z systemem BD MAX 2018-10 Polski 4 I PRZEZNACZENIE BD MAX Enteric Bacterial Panel (panel enterobakterii)

Bardziej szczegółowo

MAX Enteric Parasite Panel

MAX Enteric Parasite Panel MAX Enteric Parasite Panel 442960 Do stosowania w diagnostyce in vitro P0219(02) Do stosowania z systemem BD MAX 2017-08 Polski PRZEZNACZENIE BD MAX Enteric Parasite Panel (panel pasożytów przewodu pokarmowego)

Bardziej szczegółowo

Historia zmian. MAX Enteric Viral Panel. Wersja/Data Sekcja Raport podsumowania zmian

Historia zmian. MAX Enteric Viral Panel. Wersja/Data Sekcja Raport podsumowania zmian MAX Enteric Viral Panel 443985 P0231(03) 2018-06 Polski Historia zmian Wersja/Data Sekcja Raport podsumowania zmian (03) 2018-06 Spis treści Zasady procedury Tabela odczynników i materiałów Ostrzeżenia

Bardziej szczegółowo

AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)

AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej

Bardziej szczegółowo

Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów

Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:

Bardziej szczegółowo

Do stosowania w diagnostyce in vitro. P0212(06) Do stosowania z systemem BD MAX Polski

Do stosowania w diagnostyce in vitro. P0212(06) Do stosowania z systemem BD MAX Polski MAX CT/GC 442969 Do stosowania w diagnostyce in vitro P0212(06) Do stosowania z systemem BD MAX 2019-05 Polski 2797 PRZEZNACZEE Oznaczenie BD MAX CT/GC wdrożone w systemie BD MAX obejmuje automatyczną

Bardziej szczegółowo

AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)

AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość

Bardziej szczegółowo

AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)

AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość

Bardziej szczegółowo

AmpliTest Babesia spp. (PCR)

AmpliTest Babesia spp. (PCR) AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:

Bardziej szczegółowo

Do stosowania w diagnostyce in vitro. P0185(06) Do stosowania z systemem BD MAX Polski

Do stosowania w diagnostyce in vitro. P0185(06) Do stosowania z systemem BD MAX Polski MAX CT/GC/TV 442970 Do stosowania w diagnostyce in vitro P0185(06) Do stosowania z systemem BD MAX 2019-05 Polski 2797 PRZEZNACZEE Oznaczenie BD MAX CT/GC/TV wykonywane w systemie BD MAX obejmuje automatyczną

Bardziej szczegółowo

Załącznik nr 4 Metodyka pobrania materiału przedstawiona jest w osobnym Instrukcja PZH

Załącznik nr 4 Metodyka pobrania materiału przedstawiona jest w osobnym Instrukcja PZH Załącznik nr 4 Metodyka pobrania materiału przedstawiona jest w osobnym Instrukcja PZH 1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań wykonywanych przez PZH Poz. Badanie Rodzaj

Bardziej szczegółowo

(Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE

(Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE 19.7.2019 PL L 193/1 II (Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE DECYZJA WYKONAWCZA KOMISJI (UE) 2019/1244 z dnia 1 lipca 2019 r. zmieniająca decyzję 2002/364/WE w odniesieniu do wymogów dotyczących

Bardziej szczegółowo

Zalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase

Zalecenia rekomendowane przez Ministra Zdrowia. KPC - ang: Klebsiella pneumoniae carbapenemase Zalecenia dotyczące postępowania w przypadku identyfikacji w zakładach opieki zdrowotnej szczepów bakteryjnych Enterobacteriaceae wytwarzających karbapenemazy typu KPC * * KPC - ang: Klebsiella pneumoniae

Bardziej szczegółowo

XIII. Staphylococcus, Micrococcus ćwiczenia praktyczne

XIII. Staphylococcus, Micrococcus ćwiczenia praktyczne XIII. Staphylococcus, Micrococcus ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Ocena wzrostu szczepów gronkowców na: a. agarze z dodatkiem 5% odwłóknionej krwi baraniej (AK) typ hemolizy morfologia kolonii.. b. podłożu

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych

Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 1. Oznaczanie wrażliwości szczepów na metycylinę

Ćwiczenie 1. Oznaczanie wrażliwości szczepów na metycylinę XI. Antybiotyki i chemioterpeutyki ćwiczenia praktyczne W przedstawionych ćwiczeniach narysuj i zinterpretuj otrzymane wyniki badań mechanizmów oporności. Opisz rodzaje krążków użytych do badań oraz sposób

Bardziej szczegółowo

E.coli Transformer Kit

E.coli Transformer Kit E.coli Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli. Metoda chemiczna. wersja 1117 6 x 40 transformacji Nr kat. 4020-240 Zestaw zawiera komplet odczynników

Bardziej szczegółowo

Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna.

Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna. Saccharomyces Transformer Kit zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Saccharomyces cerevisiae. Metoda chemiczna. wersja 0916 6 x 20 transformacji Nr kat. 4010-120 Zestaw zawiera

Bardziej szczegółowo

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności

Bardziej szczegółowo

Obszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 2019

Obszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 2019 Obszar niepewności technicznej oznaczania lekowrażliwościatu w rekomendacjach EUCAST 19 Dorota Żabicka Krajowy Ośrodek Referencyjny ds. LekowrażliwościDrobnoustrojów (KORLD) Zakład Epidemiologii i Mikrobiologii

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw

Bardziej szczegółowo

10) istotne kliniczne dane pacjenta, w szczególności: rozpoznanie, występujące czynniki ryzyka zakażenia, w tym wcześniejsza antybiotykoterapia,

10) istotne kliniczne dane pacjenta, w szczególności: rozpoznanie, występujące czynniki ryzyka zakażenia, w tym wcześniejsza antybiotykoterapia, Załącznik nr 2 Standardy jakości w zakresie mikrobiologicznych badań laboratoryjnych, w tym badań technikami biologii molekularnej, oceny ich jakości i wartości diagnostycznej oraz laboratoryjnej interpretacji

Bardziej szczegółowo

AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)

AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,

Bardziej szczegółowo

E.coli Transformer Zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli

E.coli Transformer Zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli E.coli Transformer Zestaw do przygotowywania i transformacji komórek kompetentnych Escherichia coli Wersja 0211 6x40 transformacji Nr kat. 4020-240 Zestaw zawiera komplet odczynników do przygotowania sześciu

Bardziej szczegółowo

RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6

RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6 RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy

Bardziej szczegółowo

II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne. Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową

II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne. Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową II. Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Oznaczanie lekowrażliwości metodą dyfuzyjno-krążkową Zasada metody: Krążki bibułowe nasycone odpowiednimi ilościami antybiotyków

Bardziej szczegółowo

Poniższe wytyczne dotyczą wszystkich rodzajów materiału klinicznego.

Poniższe wytyczne dotyczą wszystkich rodzajów materiału klinicznego. Strona 1 z 5 Wytyczne dotyczące zlecania, pobierania, oznakowania, przechowywania, transportowania i rejestrowania próbek materiału klinicznego do badań w Pracowni PCR Niżej przedstawione wytyczne dotyczące

Bardziej szczegółowo

Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja

Bardziej szczegółowo

1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań

1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań Zalecenia dotyczące pobierania, przechowywania i transportu materiałów klinicznych przeznaczonych do badań diagnostycznych w Pracowni Diagnostycznej Laboratorium Zakładu Badania Wirusów Grypy (obowiązuje

Bardziej szczegółowo

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej

Bardziej szczegółowo

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji

Bardziej szczegółowo

Przedmiot zamówienia -Specyfikacja cenowa

Przedmiot zamówienia -Specyfikacja cenowa Przedmiot zamówienia -Specyfikacja cenowa Zał nr 1 do SIWZ Grupa 1: gotowe podłoża, testy i odczynniki Podłoża na płytkach petriego o średnicy 90 mm, podłoża w probówkach,testy i odczynniki mikrobiologiczne

Bardziej szczegółowo

ODPOWIEDZI NA PYTANIA

ODPOWIEDZI NA PYTANIA Kraków, 11 września 2015r. wg rozdzielnika NR POSTĘPOWANIA: DZP.272-18/15 Przetarg nieograniczony pn. " Dostawa odczynników" ODPOWIEDZI NA PYTANIA działając na podstawie art. 38 ustawy z dn. 29 stycznia

Bardziej szczegółowo

Diagnostyka molekularna w OIT

Diagnostyka molekularna w OIT Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C

Bardziej szczegółowo

1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań

1. Rodzaj materiału klinicznego w zależności od kierunku i metodyki badań Zalecenia dotyczące pobierania, przechowywania i transportu materiałów klinicznych przeznaczonych do badań diagnostycznych w Laboratorium Zakładu Badania Wirusów Grypy, Krajowy Ośrodek ds. Grypy (obowiązuje

Bardziej szczegółowo

Ampli-LAMP Babesia canis

Ampli-LAMP Babesia canis Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400

Bardziej szczegółowo

XXV. Grzyby cz I. Ćwiczenie 1. Wykonanie i obserwacja preparatów mikroskopowych. a. Candida albicans preparat z hodowli barwiony metoda Grama

XXV. Grzyby cz I. Ćwiczenie 1. Wykonanie i obserwacja preparatów mikroskopowych. a. Candida albicans preparat z hodowli barwiony metoda Grama XXV. Grzyby cz I. Ćwiczenie 1. Wykonanie i obserwacja preparatów mikroskopowych a. Candida albicans preparat z hodowli barwiony metoda Grama Opis preparatu: b. Saccharomyces cerevisiae preparat z hodowli

Bardziej szczegółowo

Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna w Poznaniu

Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna w Poznaniu Wojewódzka Stacja Sanitarno-Epidemiologiczna w Poznaniu PROGRAM WHO ELIMINACJI ODRY/RÓŻYCZKI Program eliminacji odry i różyczki został uchwalony przez Światowe Zgromadzenie Zdrowia 28 maja 2003 roku. Realizacja

Bardziej szczegółowo

Genomic Mini AX Bacteria+ Spin

Genomic Mini AX Bacteria+ Spin Genomic Mini AX Bacteria+ Spin Zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z bakterii Gram-dodatnich. wersja 1017 100 izolacji Nr kat. 060-100MS Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi

Bardziej szczegółowo

Nowoczesna diagnostyka mikrobiologiczna

Nowoczesna diagnostyka mikrobiologiczna Nowoczesna diagnostyka mikrobiologiczna 1 2 Nowoczesne laboratorium mikrobiologiczne połączenie metod manualnych i automatyzacji Nowoczesne laboratorium mikrobiologiczne To nie tylko sprzęt diagnostyczny,

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.

Bardziej szczegółowo

Genomic Mini AX Plant Spin

Genomic Mini AX Plant Spin Genomic Mini AX Plant Spin Zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z materiału roślinnego. wersja 1017 100 izolacji Nr kat. 050-100S Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 15 μg.

Bardziej szczegółowo

CZĘŚĆ 1 TEST KASETKOWY DO WYKRYWANIA KALPROTEKTYNY I LAKTOFERYNY W KALE. 53/PNP/SW/2018 Załącznik nr 1 do SIWZ formularz asortymentowo cenowy

CZĘŚĆ 1 TEST KASETKOWY DO WYKRYWANIA KALPROTEKTYNY I LAKTOFERYNY W KALE. 53/PNP/SW/2018 Załącznik nr 1 do SIWZ formularz asortymentowo cenowy CZĘŚĆ TEST KASETKOWY DO WYKRYWANIA KALPROTEKTYNY I LAKTOFERYNY W KALE sztuk na 6 Nr katal Producent pojedynczego oznaczenia Immunochromatograficzny, nieinwazyjny szybki test do jakościowego wykrycia kalprotektyny

Bardziej szczegółowo

FORMULARZ ASORTYMENTOWO CENOWY załącznik nr 7

FORMULARZ ASORTYMENTOWO CENOWY załącznik nr 7 załącznik nr 7 Pakiet. AUTOMATYCZNY SYSTEM DO IDENTYFIKACJI BAKTERII I GRZYBÓW DROŻDŻOPODOBNYCH ORAZ OZNACZANIA WRAŻLIWOŚCI NA ANTYBIOTYKI: DZIERŻAWA APARATU wraz z wyposażeniem + TESTY DIAGNOSTYCZNE TESTY

Bardziej szczegółowo

Nazwa i typ aparatu:.. Lp. Opis parametru Kryterium Parametr wymagany

Nazwa i typ aparatu:.. Lp. Opis parametru Kryterium Parametr wymagany Załącznik nr 3. Aparat do detekcji wzrostu drobnoustrojów z krwi i płynów ustrojowych Parametry graniczne. Nazwa i typ aparatu:.. Lp. Opis parametru Kryterium Parametr wymagany Parametr oferowany 1 Hodowla

Bardziej szczegółowo

1. Zamawiający: 2. Opis przedmiotu zamówienia:

1. Zamawiający: 2. Opis przedmiotu zamówienia: Zapytanie ofertowe na dostawę analizatora wraz z oprogramowaniem do automatycznej izolacji, amplifikacji i detekcji sekwencji DNA wirusów brodawczaka ludzkiego typu wysokiego ryzyka (hr-hpv) metodą PCR

Bardziej szczegółowo

Kwestionariusz wiedzy dla pracowników programów i placówek narkotykowych

Kwestionariusz wiedzy dla pracowników programów i placówek narkotykowych Inicjatywa EMCDDA na rzecz redukcji szkód Zwiększanie testowania na obecność wirusa zapalenia wątroby (WZW) typu C oraz skierowań do leczenia wśród iniekcyjnych użytkowników narkotyków w programach i placówkach

Bardziej szczegółowo

CZĘŚĆ 1 TEST KASETKOWY DO WYKRYWANIA KALPROTEKTYNY I LAKTOFERYNY W KALE. 73/PNP/SW/2018 Załącznik nr 1 do SIWZ formularz asortymentowo cenowy

CZĘŚĆ 1 TEST KASETKOWY DO WYKRYWANIA KALPROTEKTYNY I LAKTOFERYNY W KALE. 73/PNP/SW/2018 Załącznik nr 1 do SIWZ formularz asortymentowo cenowy formularz asortymentowo cenowy CZĘŚĆ TEST KASETKOWY DO WYKRYWANIA KALPROTEKTYNY I LAKTOFERYNY W KALE Ilość sztuk na 36 za sztukę Immunochromatograficzny, nieinwazyjny szybki test do jakościowego wykrycia

Bardziej szczegółowo

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną

Bardziej szczegółowo

Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB

Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie

Bardziej szczegółowo

QMS Quality in Microbiology Scheme Wydanie 14 Data wydania: czerwiec 2018

QMS Quality in Microbiology Scheme Wydanie 14 Data wydania: czerwiec 2018 Przyjęcie i przechowywanie Po otrzymaniu materiału do badań należy zapisać datę otrzymania, a następnie przechowywać w lodówce w temperaturze 2-8 º C do momentu przeprowadzenia badania. Materiał do badań

Bardziej szczegółowo

AmpliTest TBEV (Real Time PCR)

AmpliTest TBEV (Real Time PCR) AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej

Bardziej szczegółowo

ZALECENIE POBIERANIE, TRANSPORT I PRZECHOWYWANIE PRÓBKI KRWI DO BADANIA WIRUSOLOGICZNEGO/ BAKTERIOLOGICZNEGO

ZALECENIE POBIERANIE, TRANSPORT I PRZECHOWYWANIE PRÓBKI KRWI DO BADANIA WIRUSOLOGICZNEGO/ BAKTERIOLOGICZNEGO PRÓBKI KRWI / BAKTERIOLOGICZNEGO 1. Do jałowej probówki pobrać jałowo krew NA SKRZEP 3 4 ml krwi żylnej. Uwaga: W trakcie pobierania krwi nie trzeba być na czczo 5. Próbkę krwi dostarczyć do badania w

Bardziej szczegółowo

INSTRUKCJA UŻYTKOWANIA

INSTRUKCJA UŻYTKOWANIA INSTRUKCJA UŻYTKOWANIA Certyfikowany materiał referencyjny Epower PRZEZNACZENIE Certyfikowany materiał referencyjny Epower zawiera liofilizowane, standaryzowane ilościowo preparaty mikroorganizmów, które

Bardziej szczegółowo

Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym

Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym Rynek aparatury laboratoryjnej pęka w szwach od ilości różnych aparatów przeznaczonych

Bardziej szczegółowo

Elżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej

Elżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej Elżbieta Arłukowicz Streszczenie rozprawy doktorskiej Analiza zmienności ilościowej i jakościowej tlenowej flory bakteryjnej izolowanej z ran przewlekłych kończyn dolnych w trakcie leczenia tlenem hiperbarycznym

Bardziej szczegółowo

fix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 Sierpień 2018

fix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 Sierpień 2018 Sierpień 2018 fix RNA Roztwór do przechowywania i ochrony przed degradacją próbek przeznaczonych do izolacji RNA kat. nr. E0280 EURx Ltd. 80-297 Gdansk Poland ul. Przyrodnikow 3, NIP 957-07-05-191 KRS

Bardziej szczegółowo

Genomic Mini AX Milk Spin

Genomic Mini AX Milk Spin Genomic Mini AX Milk Spin Zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z próbek mleka. wersja 1017 100 izolacji Nr kat. 059-100S Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 15 μg. Produkt

Bardziej szczegółowo

IV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne

IV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne IV. Streptococcus, Enterococcus ćwiczenia praktyczne Ćwiczenie 1. Ocena wzrostu szczepów paciorkowców na: a. agarze z dodatkiem 5% odwłóknionej krwi baraniej (AK) typ hemolizy morfologia kolonii... gatunek

Bardziej szczegółowo

PRZEGLĄD: DATA WYDANIA: PRODUCENT: ROSCO Diagnostica A/S, Taastrupgaardsvej 30, DK-2630 Taastrup, Denmark.

PRZEGLĄD: DATA WYDANIA: PRODUCENT: ROSCO Diagnostica A/S, Taastrupgaardsvej 30, DK-2630 Taastrup, Denmark. Instrukcja użytkowania testu KPC/Metallo-B-Lactamase Confirm Kit (98006) Instrukcja użytkowania testu KPC/MBL and OXA-48 Confirm Kit (98015) Instrukcja użytkowania testu Triple disk (68912) PRZEGLĄD: DNZ

Bardziej szczegółowo

Oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane zaprezentowane poniżej zgromadzone zostały w ramach programu EARS-Net, który jest koordynowany przez

Oporność na antybiotyki w Unii Europejskiej Dane zaprezentowane poniżej zgromadzone zostały w ramach programu EARS-Net, który jest koordynowany przez Informacja o aktualnych danych dotyczących oporności na antybiotyki na terenie Unii Europejskiej Październik 2013 Główne zagadnienia dotyczące oporności na antybiotyki przedstawione w prezentowanej broszurze

Bardziej szczegółowo

Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych

Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych Cat. No. EM07.1 Wersja: 1.2017 NOWA WERSJA Zestaw do oczyszczania DNA po reakcjach enzymatycznych EXTRACTME jest zarejestrowanym znakiem towarowym BLIRT S.A. www.blirt.eu Nr kat. EM07.1 I. PRZEZNACZENIE

Bardziej szczegółowo

PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika

PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika PathogenFree DNA Isolation Kit Zestaw do izolacji DNA Instrukcja użytkownika Spis treści 1. Zawartość 2 1.1 Składniki zestawu 2 2. Opis produktu 2 2.1 Założenia metody 2 2.2 Instrukcja 2 2.3 Specyfikacja

Bardziej szczegółowo

Genomic Maxi AX Direct

Genomic Maxi AX Direct Genomic Maxi AX Direct Uniwersalny zestaw o zwiększonej wydajności do izolacji genomowego DNA z różnych materiałów. Procedura bez etapu precypitacji. wersja 0517 10 izolacji Nr kat. 995-10D Pojemność kolumny

Bardziej szczegółowo

AmpliTest BVDV (Real Time PCR)

AmpliTest BVDV (Real Time PCR) AmpliTest BVDV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla wirusa BVD (Bovine Viral Diarrhea Virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość

Bardziej szczegółowo

Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej

Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Ponad 60% zakażeń w praktyce klinicznej jest wywołana przez wirusy. Rodzaj i jakość materiału diagnostycznego (transport!) oraz interpretacja wyników badań

Bardziej szczegółowo

- podłoża transportowo wzrostowe..

- podłoża transportowo wzrostowe.. Ćw. nr 2 Klasyfikacja drobnoustrojów. Zasady pobierania materiałów do badania mikrobiologicznego. 1. Obejrzyj zestawy do pobierania materiałów i wpisz jakie materiały pobieramy na: - wymazówki suche. -

Bardziej szczegółowo

7/PNP/SW/2015 Załącznik nr 1 do SIWZ

7/PNP/SW/2015 Załącznik nr 1 do SIWZ Część nr Testy do identyfikacji paciorkowców Testy łączne do automatycznej identyfikacji oraz oznaczania lekowrażliwości paciorkowców, w tym pneumokoków na jednym module testowym. Analiza wykonywana na

Bardziej szczegółowo

ELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI PROGRAM WHO REALIZACJA W POLSCE ZASADY INSTRUKCJE

ELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI PROGRAM WHO REALIZACJA W POLSCE ZASADY INSTRUKCJE NARODOWY INSTYTUT ZDROWIA PUBLICZNEGO - PAŃSTWOWY ZAKŁAD HIGIENY ELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI PROGRAM WHO REALIZACJA W POLSCE ZASADY INSTRUKCJE ZAKŁAD WIRUSOLOGII NIZP-PZH UL. CHOCIMSKA 24 00-791 WARSZAWA

Bardziej szczegółowo

Badania mikrobiologiczne wg PN-EN ISO 11737

Badania mikrobiologiczne wg PN-EN ISO 11737 Badania mikrobiologiczne wg PN-EN ISO 11737 mgr Agnieszka Wąsowska Specjalistyczne Laboratorium Badawcze ITA-TEST Z-ca Dyrektora ds. Badań Kierownik Zespołu Badań Mikrobiologicznych i Chemicznych Tel.022

Bardziej szczegółowo

MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ

MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ Puławy 2013 Opracowanie: Prof. dr hab. Iwona Markowska-Daniel, mgr inż. Kinga Urbaniak,

Bardziej szczegółowo

GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.

GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT

Bardziej szczegółowo

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502

Bardziej szczegółowo

Novabeads Food DNA Kit

Novabeads Food DNA Kit Novabeads Food DNA Kit Novabeads Food DNA Kit jest nowej generacji narzędziem w technikach biologii molekularnej, umożliwiającym izolację DNA z produktów spożywczych wysoko przetworzonych. Metoda oparta

Bardziej szczegółowo

ROTA-ADENO Virus Combo Test Device

ROTA-ADENO Virus Combo Test Device Kod produktu: 8.04.73.0.0020 ROTA-ADENO Virus Combo Test Device Tylko do diagnostyki in vitro Przechowywać w 2-30 C ZASTOSOWANIE Wykrywanie antygenów Rotawirusów i Adenowirusów w próbkach kału. WSTĘP Rotawirusy

Bardziej szczegółowo

Instrukcja ćwiczeń Biologia molekularna dla II roku Analityki Medycznej. Reakcja odwrotnej transkrypcji. Projektowanie starterów do reakcji PCR.

Instrukcja ćwiczeń Biologia molekularna dla II roku Analityki Medycznej. Reakcja odwrotnej transkrypcji. Projektowanie starterów do reakcji PCR. INSTRUKCJA Ćwiczenie nr 5 Odczynniki: Sprzęt: 1. 5xNG cdna Buffer 2. 50 µm oligo(dt)20 3. NG dart RT mix l 4. Probówki typu Eppendorf 0,2 ml 5. Woda wolna od RNaz 6. Lód 1. Miniwirówka 2. Termocykler 3.

Bardziej szczegółowo

Załącznik nr 1A do siwz Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli

Załącznik nr 1A do siwz Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli 1. Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli zestaw zawiera: - 50 pasków testowych, - 50 pojemników z tworzywa sztucznego,

Bardziej szczegółowo

Diagnostyka mikrobiologiczna zakażeń krwi Paweł Zwierzewicz

Diagnostyka mikrobiologiczna zakażeń krwi Paweł Zwierzewicz Diagnostyka mikrobiologiczna zakażeń krwi Paweł Zwierzewicz Diagnostyka mikrobiologiczna sepsy oferta firmy biomerieux Automatyczne analizatory do posiewów krwi Automatyczne analizatory do identyfikacji

Bardziej szczegółowo

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA

Bardziej szczegółowo

IV Kadencja XIII Posiedzenie KRDL

IV Kadencja XIII Posiedzenie KRDL IV Kadencja XIII Posiedzenie KRDL Uchwała Nr 111/IV/2017 Krajowej Rady Diagnostów Laboratoryjnych z dnia 8 grudnia 2017 roku w przedmiocie zmiany uchwały Nr 18/IV/2015 Krajowej Rady Diagnostów Laboratoryjnych

Bardziej szczegółowo

Badanie na obecność pałeczek CPE Informacje dla pacjentów

Badanie na obecność pałeczek CPE Informacje dla pacjentów Badanie na obecność pałeczek CPE Informacje dla pacjentów Uwaga: z pytaniami dotyczącymi informacji zawartych w tej ulotce, należy zwracać się do lekarza prowadzącego lub pielęgniarki. Czym jest CPE W

Bardziej szczegółowo

Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej

Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej Temat lekcji: Planowanie doświadczeń biologicznych jak prawidłowo zaplanować próbę kontrolną? Cele kształcenia IV etap edukacyjny: 1. Wymagania ogólne:

Bardziej szczegółowo

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną

Bardziej szczegółowo

Genomic Midi AX Direct zestaw do izolacji genomowego DNA (procedura bez precypitacji) wersja 1215

Genomic Midi AX Direct zestaw do izolacji genomowego DNA (procedura bez precypitacji) wersja 1215 Genomic Midi AX Direct zestaw do izolacji genomowego DNA (procedura bez precypitacji) wersja 1215 20 izolacji Nr kat. 895-20D Pojemność kolumny do oczyszczania DNA wynosi 100 µg 1 Skład zestawu Składnik

Bardziej szczegółowo

Tytuł: Kontrola glukometrów

Tytuł: Kontrola glukometrów Data obowiązywania: Wydanie: 1 Strona 1 z 6 Karta zmian 1. CEL: Nr Punktu Podpunktu rozdziału Zmiany Akapitu lub fragmentu tekstu ze strony nr Opis Data Podpis autora ZATWIERDZIŁ Dyrektor Szpitala Dr n.

Bardziej szczegółowo

Diagnostyka i monitorowanie cukrzycy i chorób nerek

Diagnostyka i monitorowanie cukrzycy i chorób nerek Diagnostyka i monitorowanie cukrzycy i chorób nerek Business Development Manager Konferencja naukowo-szkoleniowa Ryn Badania laboratoryjne w chorobach nerek Wyzwaniem dla współczesnej medycyny jest badanie

Bardziej szczegółowo

GRUPA I Lp Nazwa Jm Ilość Cena jedn netto 1. Columbia agar z 5 %krwią baranią

GRUPA I Lp Nazwa Jm Ilość Cena jedn netto 1. Columbia agar z 5 %krwią baranią GRUPA I Lp Nazwa Jm Ilość Cena jedn netto 1. Columbia agar z 5 %krwią baranią 2. Agar Colubmia CNA 3. Podłoże chromogenne do posiewu moczu ze wstępną identyfikacją i oceną bakteriurii 4. Podłoże MaConkey

Bardziej szczegółowo

Kit for rapid detection Legionella pneumophilla

Kit for rapid detection Legionella pneumophilla Kit for rapid detection Legionella pneumophilla Zestaw do szybkiej detekcji bakterii Legionella w próbkach wody opiera się na wykorzystaniu immunomagnetycznych kulek. Są to cząsteczki superparamagnetyczne,

Bardziej szczegółowo

Genomic Micro AX Swab Gravity Plus

Genomic Micro AX Swab Gravity Plus Genomic Micro AX Swab Gravity Plus Zestaw do izolacji genomowego DNA z wymazów metodą grawitacyjną. W skład zestawu wchodzą wymazówki. wersja 0517 100 izolacji Nr kat. 105-100P Pojemność kolumny do oczyszczania

Bardziej szczegółowo

Genomic Micro AX Blood Gravity 96-well

Genomic Micro AX Blood Gravity 96-well Genomic Micro AX Blood Gravity 96-well Zestaw do izolacji DNA z krwi w formacie płytek na 96 studzienek dedykowany do pracy z pipetą wielokanałową lub automatem typu liquid handler. 960 izolacji Nr kat.

Bardziej szczegółowo

Załącznik Nr 7 do SIWZ

Załącznik Nr 7 do SIWZ Załącznik Nr 7 do SIWZ Formularz asortymentowo - cenowy Nr 6 Pakiet Nr 6 Testy lateksowe, krążki antybiotykowe, testy MIC, szczepy wzorcowe, podłoża, odczynniki i testy diagnostyczne. Ilość Wartość Wielkość

Bardziej szczegółowo

DZIERŻAWA KOMPLETNEGO SYSTEMU RT-PCR (APARAT, KOMPUTER Z OPROGRAMOWANIEM, DRUKARKA, CZYTNIK KODÓW KRESKOWYCH, UPS)

DZIERŻAWA KOMPLETNEGO SYSTEMU RT-PCR (APARAT, KOMPUTER Z OPROGRAMOWANIEM, DRUKARKA, CZYTNIK KODÓW KRESKOWYCH, UPS) Załącznik do SIWZ nr D-15/N/19 ZADANIE 9 DZIERŻAWA KOMPLETNEGO SYSTEMU RT-PCR (APARAT, KOMPUTER Z OPROGRAMOWANIEM, DRUKARKA, CZYTNIK KODÓW KRESKOWYCH, UPS) Nazwa i typ aparatu :.. Producent:. ZESTAWIENIE

Bardziej szczegółowo

SPOSÓB PRZEDSTAWIANIA DOKUMENTACJI DOŁĄCZANEJ DO WNIOSKU O DOPUSZCZENIE DO OBROTU PRODUKTU LECZNICZEGO WETERYNARYJNEGO IMMUNOLOGICZNEGO

SPOSÓB PRZEDSTAWIANIA DOKUMENTACJI DOŁĄCZANEJ DO WNIOSKU O DOPUSZCZENIE DO OBROTU PRODUKTU LECZNICZEGO WETERYNARYJNEGO IMMUNOLOGICZNEGO Załącznik nr 2 SPOSÓB PRZEDSTAWIANIA DOKUMENTACJI DOŁĄCZANEJ DO WNIOSKU O DOPUSZCZENIE DO OBROTU PRODUKTU LECZNICZEGO WETERYNARYJNEGO IMMUNOLOGICZNEGO CZĘŚĆ I - STRESZCZENIE DOKUMENTACJI I A IB I B 1 I

Bardziej szczegółowo

Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP

Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP 2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych

Bardziej szczegółowo

Badanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała

Badanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała Badanie mikrobiologiczne płynów z jam ciała Dorota Olszańska Zakład Diagnostyki Mikrobiologicznej i Immunologii Infekcyjnej USK w Białymstoku Kierownik Prof. Dr hab. n. med. Elżbieta Tryniszewska Cel badań

Bardziej szczegółowo

SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09

SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09 SPRAWOZDANIE MOŻE BYĆ POWIELANE TYLKO W CAŁOŚCI. INNA FORMA KOPIOWANIA WYMAGA PISEMNEJ ZGODY LABORATORIUM. SPRAWOZDANIE Z BADAŃ MIKROBIOLOGICZNYCH Nr 20006/11859/09 BADANIA WŁASNOŚCI PRZECIWDROBNOUSTROJOWYCH

Bardziej szczegółowo

Zakład Mikrobiologii Klinicznej [1]

Zakład Mikrobiologii Klinicznej [1] Zakład Mikrobiologii Klinicznej [1] Dane kontaktowe: Tel. 41 36 74 710, 41 36 74 712 Kierownik: dr n. med. Bonita Durnaś, specjalista mikrobiologii Personel/Kadra: Diagności laboratoryjni: mgr Dorota Żółcińska

Bardziej szczegółowo