Karta modułu/przedmiotu Informacje ogólne o module/przedmiocie 1. Kierunek studiów:. Poziom : STUDIA DRUGIEGO STOPNIA BIOTECHNOLOGIA MEDYCZNA 3. Forma studiów: STACJONARNE 4. Rok: II 5. Semestr: III 6. Nazwa modułu/przedmiotu: DIAGNOSTYKA MIKROBIOLOGICZNA Z ELEMENTAMI MIKROBIOLOGII MEDYCZNEJ 7. Status modułu/przedmiotu: OBOWIĄZKOWY 8. Jednostka realizująca moduł/przedmiot: KATEDRA I ZAKŁAD MIKROBIOLOGII I WIRUSOLOGII 9. Prowadzący moduł/przedmiot (imię, nazwisko, adres e-mail): Dr hab. n. med. Tomasz Wąsik, prof. nadzw. SUM; twasik@sum.edu.pl 10. Cel : Zdobycie przez studentów wiedzy z zakresu źródeł i zagrożeń zdrowotnych spowodowanych przez mikroorganizmy chorobotwórcze oraz umiejętnści praktycznego badania mikrobiologicznego próbek materiału klinicznego 11. Wymagania wstępne w zakresie wiedzy, umiejętności i innych kompetencji: znajomość zagadnień z mikrobiologii i wirusologii; znajomość technik biologii molekularnej; umiejętność posługiwania się sprzętem laboratoryjnym; 1. Efekty Numer efektu 01 0 Efekty Student, który zaliczył moduł/przedmiot: Ma ugruntowaną i poszerzoną wiedzę z zakresu prowadzenia diagnostyki mikrobiologicznej i wirusologicznej Ma wiedzę na temat błędów w wykonywaniu prowadzonych badań i oznaczeń Zna nowoczesne laboratoryjne techniki diagnostyczne 03 i identyfikacyjne stosowane w diagnostyce mikrobiologicznej i wirusologicznej Potrafi przekazywać wiedzę o istocie wykonywanych przez siebie czynności laboratoryjnych sprzętem i aparaturą 05 stosowanymi w mikrobiologicznej i wirusologicznej Potrafi analizować uzyskiwane wyniki badań i formułować odpowiednie wnioski 13. Formy zajęć w odniesieniu do efektów Numer efektu wykład seminarium 01 x x x 0 x x x 03 x x x x x x 05 x x x x x x 14. Treści programowe 14.1. Forma zajęć: Wykłady Forma zajęć dydaktycznych ćwiczenia ćwiczenia laboratoryjne praktyczne Odniesienie do efektów dla programu K_W11 K_W19 K_W7 K_U0 K_U03 K_U0 inne Odniesienie do efektów dla obszaru M_W03 M_W07 M_W10 M_U01 M_U0 M_U13 M_U14 e-learning W1 Zasady diagnostyki wirusologicznej W Zasady diagnostyki bakteriologicznej Liczba godzin 1
W3 Etiopatogeneza i diagnostyka WZW W4 Etiopatogeneza i diagnostyka zakażenia HIV W5 Etiopatogeneza i diagnostyka wirusowych zakażeń układu oddechowego W6 Etiopatogeneza i diagnostyka zakażeń herpeswirusowych W7 Etiopatogeneza i diagnostyka odwirusowych gorączek krwotocznych W8 Teoria prionu - choroby wywołane przez priony 1 Łącznie 15 14.. Forma zajęć: Seminarium Liczba godzin S1 Metody ilościowe w wirusologii, mianowanie. S Zakaźne czynniki subwirusowe 3 S3 Diagnostyka zakażenia WZW typu C S4 Diagnostyka wirusowych zakażeń wertykalnych S5 Diagnostyka zakażeń HPV, profilaktyka raka szyjki macicy S6 Bakteriofagi - możliwości zastosowania w medycynie S7 Metody oznaczania lekooporności wirusów na przykładzie HIV-1 Łącznie 15 14.3. Forma zajęć: Ćwiczenia C1 Organizacja laboratorium mikrobiologicznego. Regulamin BHP. Zasady bezpiecznej pracy z drobnoustrojami. Klasyfikacja czynników biologicznych. Stopnie hermetyczności laboratoriów mikrobiologicznych. Wyposażenie laboratorium mikrobiologicznego. Zasady funkcjonowania laboratorium mikrobiologicznego. C Zasady diagnostyki bakteriologicznej. Rodzaje materiałów pobieranych do badań bakteriologicznych. Zasady pobierania i przesyłania materiałów do badań. Tok badania bakteriologicznego z uwzględnieniem metod: mikroskopowych, hodowlanych, biochemicznych, serologicznych, biologicznych, molekularnych i określania lekowrażliwości. C3 Badanie lekowrażliwości drobnoustrojów Metody jakościowe i ilościowe (krążkowo dyfuzyjna, kolejnych rozcieńczeń w bulionie lub podłożu stałym, E-testów, automatyczne, molekularne). C4 Rodzaje: Staphylococcus, Micrococcus Systematyka. Występowanie, morfologia, fizjologia i podział gronkowców. Wymagania wzrostowe i podłoża różnicujące. Czynniki odpowiedzialne za chorobotwórczość gronkowców (enzymy i toksyny). Chorobotwórczość gronkowców i jej uwarunkowania, nosicielstwo. Zasady diagnostyki gronkowców. C5 Rodzaje: Streptococcus, Enterococcus Systematyka. Występowanie, morfologia i fizjologia paciorkowców. Wymagania wzrostowe i podłoża różnicujące. Zasady diagnostyki bakteriologicznej i serologicznej. Odczyn Dicków, próba Schultza-Charltona, ASO i ich interpretacja. Cechy warunkujące chorobotwórczość paciorkowców. Schorzenia wywoływane przez paciorkowcowe, powikłania, leczenie i profilaktyka. C6 Rodzaj: Neisseria, Moraxella Systematyka. Występowanie, morfologia i fizjologia. Wywoływane schorzenia, diagnostyka, leczenie i profilaktyka. C7 Rodzaje: Corynebacterium, Listeria, Erysipelothrix, Lactobacillus Systematyka. Występowanie, morfologia i fizjologia. Chorobotwórczość i profilaktyka. Diagnostyka bakteriologiczna i serologiczna (próba Eleka, odczyn Schicka) C8 Laseczki tlenowe i beztlenowe (rodzaje: Bacillus, Clostridium) Występowanie, morfologia i fizjologia. Schorzenia wywoływane przez laseczki tlenowe i beztlenowe. Charakterystyka produkowanych przez nie egzotoksyn. Diagnostyka bakteriologiczna i serologiczna schorzeń wywoływanych przez laseczki tlenowe i beztlenowe. C9 Pałeczki gramujemne z rodziny Enterobacteriaceae, cz. I Rodzaje: Escherichia, Klebsiella, Proteus, Enterobacter - systematyka. Systematyka, występowanie, morfologia i fizjologia. Chorobotwórczość, leczenie i profilaktyka. Diagnostyka bakteriologiczna i serologiczna, szczepy ESBL. C10 Pałeczki gramujemne z rodziny Enterobacteriaceae, cz. II
Rodzaje: Salmonella, Shigella. Systematyka, występowanie, morfologia i fizjologia. Chorobotwórczość, leczenie i profilaktyka. Diagnostyka bakteriologiczna i serologiczna, ESBL, odczyn Widala. C11 Pałeczki gramujemne niefermentujące: Pseudomonas, Stenotrophomonas, Acinetobacter Systematyka. Występowanie, morfologia i fizjologia. Chorobotwórczość, leczenie i profilaktyka. Diagnostyka bakteriologiczna. C1 Pałeczki auksotroficzne Haemophilus, Brucella, Legionella Systematyka. Występowanie, morfologia i fizjologia. Chorobotwórczość, leczenie i profilaktyka. Diagnostyka bakteriologiczna. C13 Grzyby (Candida, Cryptococcus, Trichophyton, Epidermophyton, Aspergillus, Penicillium, Mucor, Geotrichum, Fusarium, Cladosporium, Alternaria,) promieniowce (Actinomyces i Nocardia) Systematyka. Występowanie, morfologia i fizjologia w/w drobnoustrojów. Chorobotwórczość (grzybice powierzchniowe i głębokie) i schorzenia. Diagnostyka mikrobiologiczna i serologiczna, leczenie i profilaktyka. C14 Repetytorium i egzamin praktyczny 4 Łącznie 30 Łączna liczba godzin z przedmiotu 60 15. Metody 15.1. Wykład Metoda podająca: wykład informacyjny 15.. Seminarium Metoda problemowa: dyskusja dydaktyczna 15.. Ćwiczenia Metoda praktyczna: ćwiczenia laboratoryjne 16. Sposoby weryfikacji efektów i sposoby oceny Numer efektu Sposoby weryfikacji Warunki zaliczenia 01 Kolokwium pisemne (zadania otwarte) i egzamin pisemny 0 Kolokwium pisemne (zadania otwarte) i egzamin pisemny 03 Kolokwium pisemne (zadania otwarte) i egzamin pisemny 05 17. Obciążenie pracą studenta Forma aktywności Przeciętna liczba godzin na zrealizowanie aktywności udział w wykładach 15h Godziny kontaktowe z nauczycielem akademickim: Samodzielna praca studenta udział w seminariach udział w ćwiczeniach obecność na egzaminie konsultacje łącznie przygotowanie do ćwiczeń przygotowanie do seminarium przygotowanie do kolokwiów z ćwiczeń przygotowanie do egzaminu łącznie Łącznie Sumaryczna liczba punktów ECTS dla przedmiotu 4 18. Sumaryczne wskaźniki charakteryzujące przedmiot Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje na zajęciach wymagających bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich Liczba punktów ECTS, którą student uzyskuje w ramach zajęć o charakterze praktycznym 15h 30h 1h 4h 10h 10h 0h 5h 65h 65h 130h 3
19. Literatura 19.1. Podstawowa 1. Szewczyk E. M. Diagnostyka bakteriologiczna, PWN, Warszawa 013.. Heczko P.B., Wróblewska M., Pietrzyk A. Mikrobiologia lekarska, PZWL, 014, 3. Murray P., Rosenthal K., Pfaller M. Mikrobiologia. Elsevier, Urban and Partner, 011. 4. Kayser F., Bienz K., Eckert J., Zinkernagel R. Mikrobiologia lekarska, PZWL, 007 5. Collier L., Oxford J.: Wirusologia. PZWL, Warszawa 001. 19.. Uzupełniająca 1. Gołąb J., Jakubisiak M., Lasek W.: Immunologia. PWN. 0. Piekarowicz A.: Podstawy wirusologii molekularnej. Wydawnictwo Naukowe PWN, 0. 3. Salyers A.A., Whitt D.D. Mikrobiologia: różnorodność, chorobotwórczość i środowisko. PWN, Warszawa 005. 4. Singelton P. Bakterie w biologii, biotechnologii i medycynie. PWN, Warszawa 000. 0. Inne przydatne informacje o module/przedmiocie 0.1. Liczebność grup 10 osób 0.. Materiały do zajęć Instrukcje, zeszyt, długopis, kalkulator 0.3. Miejsce odbywania się zajęć Wykład: sala wykładowa (Nr 1) - ul. Jagiellońska 4, Sosnowiec Ćwiczenia: sala ćwiczeniowa (nr 1), Katedra i Zakład Mikrobiologii i Wirusologii - ul. Jagiellońska 4, Sosnowiec Seminaria: sala seminaryjna (Nr 05) ul. Jedności 8, Sosnowiec 0.4. Miejsce i godzina konsultacji Katedra i Zakład Mikrobiologii i Wirusologii (Nr 4.3), ul. Jedności 8, Sosnowiec. Środy: 10.00-1.00 0.5. Inne 4
1. Formy oceny szczegóły Efekt Na ocenę Na ocenę 3 Na ocenę 4 Na ocenę 5 Wymienia podstawowe etapy Wymienia etapy diagnostyki Wymienia podstawowe etapy diagnostyki mikrobiologicznej z mikrobiologicznej z podaniem i 01 diagnostyki mikrobiologicznej bez podaniem i omówieniem ich omówieniem ich oraz podania ich podstawowej procedurą wykonania 0 03 05 Ma podstawową wiedzę na temat błędów w wykonywaniu prowadzonych badań bez podania ich przyczyn i Wymienia podstawowe techniki diagnostyczne i identyfikacyjne stosowane w diagnostyce mikrobiologicznej i wirusologicznej bez podania ich Potrafi zrelacjonować w sposób ogólny wykonywane przez siebie czynności laboratoryjne bez ich mikrobiologicznej i wirusologicznej bez znajomości ich funkcjonowania Potrafi analizować uzyskiwane wyniki badań bez formułowania odpowiednich Ma wiedzę na temat błędów w wykonywaniu prowadzonych badań z ogólnym podaniem ich przyczyn i Wymienia techniki diagnostyczne i identyfikacyjne stosowane w diagnostyce mikrobiologicznej i wirusologicznej z podaniem i omówieniem ich podstawowej Potrafi zrelacjonować wykonywane przez siebie czynności laboratoryjne z ich ogólną charakterystyką mikrobiologicznej i wirusologicznej z ogólną znajomością ich funkcjonowania Potrafi analizować uzyskiwane wyniki badań z formułowaniem ogólnych Ma ugruntowaną wiedzę na temat błędów w wykonywaniu prowadzonych badań z rozumowym podaniem ich przyczyn i Wymienia techniki diagnostyczne i identyfikacyjne stosowane w diagnostyce mikrobiologicznej i wirusologicznej z podaniem i omówieniem ich oraz procedurą wykonania Potrafi zrelacjonować wykonywane przez siebie czynności laboratoryjne z ich charakterystyką i wyjaśnieniem zasadności i celowości ich wykonania mikrobiologicznej i wirusologicznej ze znajomością ich funkcjonowania i zasadności użycia Potrafi analizować ze zrozumieniem uzyskiwane wyniki badań z formułowaniem szczegółowych 5