WARSZAWSKI UN1WERSYTET MEDYCZNY MEDICAL UNIVERSITY OF WARSAW

Podobne dokumenty
Do oceny przedstawiono oprawioną rozprawę doktorską zawierającą 133 strony

RECENZJA. Rozprawy doktorskiej mgr Mateusza Nowickiego. Ocena wybranych elementów niszy szpikowej u pacjentów poddawanych

WARSZAWSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY MEDICAL UNIVERSITY OF WARSAW

Ocena rozprawy na stopień doktora nauk medycznych lekarz Małgorzaty Marii Skuzy

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

Zabrze r. Recenzja rozprawy na stopień doktora nauk medycznych lekarza Cypriana Olchowy

Ocena pracy doktorskiej. mgr Beaty Jakusik. pt. Ocena żywienia dojelitowego według programu Fast Track u chorych

Dr hab. n. med. Beata Czarnecka, Prof. U.M. Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego. w Poznaniu

kwestionariusze badania ankietowego, karta badania, broszura informacyjna dla pacjentek,

Ocena rozprawy doktorskiej mgr Sudipta Das

Ocena Pracy Doktorskiej mgr Moniki Aleksandry Ziętarskiej

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Arkadiusza Płowca pod tytułem "Wpływ prebiotyków i symbiotyków podanych in ovo na zmianę ekspresji genomu kury"

Ocena pracy doktorskiej mgr Magdaleny Banaś zatytułowanej: Ochronna rola chemeryny w fizjologii naskórka

RECENZJA Rozprawy doktorskiej lekarza medycyny Aleksandry Olgi Kozłowskiej pt: Analiza ekspresji genu FERMT2

Przedstawiona do recenzji praca porusza ciekawe i me tylko medycznie, ale i

informacje zawarte w tych podrozdziałach są szczególne cenne dla praktyki klinicznej z punktu widzenia diagnostyki różnicowej. Część wstępu dotycząca

UNIWERSYTET MEDYCZNY W BIAŁYMSTOKU

Warszawa, r.

OCENA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. pt Ocena jakości życia nosicielek mutacji genu BRCA1 po profilaktycznej operacji narządu rodnego

PROCEDURA PRZEPROWADZANIA CZYNNOŚCI W PRZEWODZIE DOKTORSKIM NA WYDZIALE BIOCHEMII, BIOFIZYKI I BIOTECHNOLOGII UJ

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Piotra Biniarza pt. Optymalizacja produkcji, oczyszczanie i badanie właściwości biosurfaktantów

Poznań, ul. Przybyszewskiego 49 tel Recenzja

Recenzja. Ocena merytoryczna pracy

Katedra i Klinika Kardiologii Wydział Lekarski Kształcenia Podyplomowego Uniwersytet Medyczny im. Piastów Śląskich we Wrocławiu

Poznań, r.

Rozprawy doktorskiej mgr Anny Marii Urbaniak-Brekke. pt.: Aktywność społeczności lokalnych w Polsce i Norwegii

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Olgi Andrzejczak. pt. Badania osadu czynnego z zastosowaniem technik cyfrowej analizy obrazu mikroskopowego

Szanowny Pan. Dziekan Wydziału Lekarskiego z Oddziałem Lekarsko-Dentystycznym w Zabrzu. Śląskiego Uniwersytetu Medycznego w Katowicach

i Europejskiego Towarzystwa Kardiologicznego oraz zasad wykonywania zabiegu także od strony technicznej przydatne dla zrozumienia dalszej części

Prof. dr hab. Zbigniew Adamiak Olsztyn, Katedra Chirurgii i Rentgenologii z Kliniką Wydział Medycyny Weterynaryjnej UWM Olsztyn RECENZJA

WIEDZA. wskazuje lokalizacje przebiegu procesów komórkowych

Wpływ blizny pooperacyjnej na nawrót dolegliwości bólowych po dyscektomii

Lublin, 26 maja, 2015 roku

Skuteczność peloidoterapii, kinezyterapii i pola magnetycznego niskiej częstotliwości w leczeniu objawów dyskopatii lędźwiowej

Ocena rozprawy doktorskiej. Mgr Pauliny Smyk pt.: Wpływ wybranych ksenobiotyków na zmiany parametrów

Zakład Chemii Bioorganicznej, Wydział Chemiczny Wrocław

Warszawa, 7 grudnia 2015 r.

Klinika Alergologii Gdański Uniwersytet Medyczny

Lublin 30 lipca 2017r.

Wrocław, 15 grudnia 2017 r.

Dr hab. Joanna Kruk, prof. US Szczecin, Wydział Kultury Fizycznej i Promocji Zdrowia Uniwersytet Szczeciński

RECENZJA. rozprawy doktorskiej Jolanty GRZEBIELUCH nt. "Znaczenie strategii marketingowej w

Ocena pracy doktorskiej mgr. inż. Adama Ząbka zatytułowanej:

związanych z tą tematyką, ale również o zdolności

Potrzeby instytutów badawczych w zakresie wsparcia procesu rozwoju nowych leków, terapii, urządzeń medycznych... OŚRODEK TRANSFERU TECHNOLOGII

Recenzja rozprawy na stopień doktora nauk medycznych lek. Oliwii Segiet p.t.: Rola wybranych interleukin w niewydolności skurczowej serca.

Materiał i metody. Wyniki

Ocena rozprawy doktorskiej lek. wet. Dagmary Winiarczyk. Przydatność proteomiki w rozpoznawaniu nefropatii różnego pochodzenia u psów

Ocena. rozprawy doktorskiej pani mgr Anety Spóz, zatytułowanej. Cypriniformes.

Wrocław, Ogólna charakterystyka rozprawy

OCENA PRACY DOKTORSKIEJ

Recenzja. Warszawa, dnia 22 października 2018 r.

RECENZJA rozprawy doktorskiej lekarza stomatologa Thomasa Proba pt " Ocena czynnościowa leczenia bezzębia przy zastosowaniu

W 2010 roku, rak płuc był w Polsce najczęstszą przyczyną zgonów spowodowanych nowotworami złośliwymi u obu płci. Wyjaśnianie zależności pomiędzy

polimorfizmów oksygenazy hemowej 1 (HMOX1) podjęty przez doktoranta doskonale wpisuje się w aktualne trendy naukowe.

INSTYTUT PSYCHOLOGII. prof. zw. dr hab. Mariola Bidzan Instytut Psychologii UG. Gdańsk, 25 października 2018 r.

UNIWERSYTET MEDYCZNY w BIAŁYMSTOKU

Dr hab. med. Cezary Piwkowski Poznań, Recenzja. pracy naukowej na stopień doktora nauk medycznych mgr Kingi Gryglickiej p.t.

USG Power Doppler jest użytecznym narzędziem pozwalającym na uwidocznienie wzmożonego przepływu naczyniowego w synovium będącego skutkiem zapalenia.

Kraków Prof. dr hab. Maria Słomczyńska Zakład Endokrynologii Katedra Fizjologii Zwierząt Instytut Zoologii Uniwersytet Jagielloński OCENA

Ocena. wykonanej pod kierunkiem prof. dr hab. med. Małgorzaty Polz-Docewicz

Zakład Mikrobiologii Farmaceutycznej i Parazytologii

Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu

WYDZIAŁ NAUKI O ZDROWIU FACULTY OF HEALTH SCIENCES

Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza

3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu

Spis treści. Przedmowa Barbara Czerska Autorzy Wykaz skrótów... 19

Co naukowiec wiedzieć i robić powinien? Izabela Młynarczuk-Biały

Lublin, 1 kwietnia 2016 r. Prof. dr hab. Wiesław I. Gruszecki Zakład Biofizyki, Instytut Fizyki Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie

Recenzja. rozprawy doktorskiej mgr inż. Yanfei Lu pt. Biomechaniczne i strukturalne aspekty modelowania zrostu i regeneracji kości.

Gospodarka witaminą B1 u chorych przewlekle hemodializowanych

Plan studiów NA KIERUNKU STUDIÓW WYŻSZYCH: BIOCHEMIA II stopień

Ocena merytoryczna pracy 2.1. Sformułowanie problemu naukowego i aktualność tematyki badań

Warszawa, r. Dr hab. n. med. Łukasz Szarpak Zakład Medycyny Ratunkowej I Wydział Lekarski Warszawski Uniwersytet Medyczny

S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma c j e ogólne

dr hab. inż. Katarzyna Materna Poznań, Wydział Technologii Chemicznej Politechnika Poznańska

Recenzja rozprawy habilitacyjnej i ocena dorobku naukowego dr Anety Kaszy

Katowice, 26 marca 2018 r. Prof. dr hab. n. med. Wanda Romaniuk

Ocena. rozprawy doktorskiej mgr Moniki Grygorowicz pt. Wpływ lenalidomidu na interakcje

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Karoliny Grabowskiej zatytułowanej Cykliczne peptydy o aktywności antyangiogennej

Podstawę formalną opracowania recenzji stanowi uchwała Rady Wydziału Akademii Wychowania Fizycznego we Wrocławiu z dnia roku.

Katowice, 07 listopad, 2017 r.

Szczecin, r.

Recenzja. rozprawy na stopień doktora nauk medycznych autorstwa lek. dent. Joanny Zemlik

Prof. dr hab. med. Maciej Banach Kierownik Zakładu Nadciśnienia Tętniczego Katedra Nefrologii i Nadciśnienia Tętniczego Uniwersytet Medyczny w Łodzi

Ocena. Rozprawy doktorskiej mgr Marii Skrzypkowskiej. na temat: "Aktywność komórek progenitorowych śródbłonka w nadciśnieniu.

RECENZJA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. mgr inż. Anety Pytki-Woszczyło

Streszczenie rozprawy doktorskiej MODEL FUNKCJONOWANIA GOSPODARKI KREATYWNEJ W PROCESIE WZROSTU GOSPODARCZEGO

Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń narządu ruchu

Recenzja. promotor: dr hab. Marianna Kotowska-Jelonek, prof. PŚk

Recenzja. Gdańsk, r.

prof. dr hab. Zbigniew Czarnocki Warszawa, 3 lipca 2015 Uniwersytet Warszawski Wydział Chemii

RECENZJA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ

WARSZAWSKI UNIWERSYTET MEDYCZNY

Biologia medyczna, materiały dla studentów

RECENZJA ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. zatytułowanej

RECENCZJA. Rozprawy doktorskiej Pani mgr Anny Mazur. Promotor: : dr hab. n. o zdr. Ewa Humeniuk. Promotor pomocniczy: dr n. med.

Recenzja rozprawy doktorskiej

Transkrypt:

WARSZAWSKI UN1WERSYTET MEDYCZNY Centrum Biostruktury tel.: 0-22-599-21-99, fax: 0-22-599-21-94 e-mail: immunologiagwum.edu.pl Warszawa, 28 listopad 2012 r. Szanowny Pan Prof. dr hab. Wojciech Froncisz Dziekan Wydziału Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ ul. Gronostajowa 7 30-387 Kraków OCENA ROZPRAWY NA STOPIEŃ DOKTORA NAUK BIOLOGICZNYCH MGR MAGDALENY TERTIL ZATYTUŁOWANEJ: "ROLE OF THYMIDINE PHOSPHORYLASE AND NRF2 TRANSCRIPTION FACTOR IN NON-SMALL LUNG CARCINOMA GROWTH AND ANGIOGENESIS" Rak płuca jest pierwszym nowotworem w Polsce u mężczyzn i drugim u kobiet co do częstości zachorowań, zaś pierwszym co do przyczyny zgonów z powodu chorób rozrostowych u obu płci. Rocznie z powodu raka płuca umiera na świecie ponad 1,3 miliona osób. Jest to niezwykle złożona choroba dotycząca niezbędnego do życia narządu, której wczesne rozpoznanie stanowi jedno z największych wyzwań współczesnej medycyny. Poznanie zmian biologicznych leżących u podłoża rozwoju raka płuca, zadanie niezwykle ważne i aktualne, zostało wybrane przez panią Magdalenę Tertil jako przedmiot badań opisanych w przedstawionej mi do oceny rozprawie doktorskiej. Doktorantka podjęła próbę określenia roli czynnika transkrypcyjnego Nrf2, oksygenazy hemowej-1 oraz fosforylazy tymidylanowej w regulacji angiogenezy w modelu niedrobnokomórkowego raka płuca. Wykazała ona, że zwiększona ekspresja genu dla Nrf2 prowadzi do zahamowania proliferacji i migracji komórek linii NCI-H292 oraz do zmniejszonej ekspresji markera komórek macierzystych ALDH i wybranych onkogennych mikro RNA. Ponadto, w transdukowanych komórkach zaobserwowała zwiększoną ekspresję mikro RNA związanych z zahamowaniem procesów nowotworzenia oraz obniżone wydzielanie prozapalnej cytokiny IL-1f3 oraz wybranych metaloproteinaz macierzy zewnątrzkomórkowej. Do najciekawszych, w mojej 1

Centrum Biostruktury tel 0-22-599-21-99, fax: 0-22-599-21-94 e-mail: immunologia@wum.edu.pl ww. turredu.pl/immunologia ocenie, wyników należy zwiększona ekspresja fosforylazy tymidylanowej w komórkach transdukowanych genem dla czynnika Nrf2. Jest to obserwacja oryginalna, do tej pory nie opisywana przez innych badaczy. Mgr Magdalena Tertil wykazała ponadto, że w regulacji ekspresji fosforylazy tymidyny bierze pośrednio udział oksygenaza hemowa-1 i proces ten jest zależny od statusu oksydacyjnego komórki. Dalsze badania pozwoliły na wyciągnięcie wniosku, że zwiększona ekspresja fosforylazy tymidylanowej hamuje proliferację i migrację badanych komórek, jednocześnie nasila ona wydzielanie czynników proangiogennych i stymuluje proces angiogenezy. Zwiększony potencjał angiogenny komórek transdukowanych genem dla fosforylazy tymidylanowej Doktorantka potwierdziła w mysim modelu in vivo oraz w modelu komórek śródbłonka in vitro poddanych działaniu cytokin prozapalnych zwiększających ekspresję badanego genu. Zbadanie ekspresji fosforylazy tymidylanowej i związanych z nią cytokin prozapalnych w pierwotnym materiale pobranym od pacjentów z niedrobnokomórkowym rakiem płuca uważam za najbardziej wartościowy element recenzowanej rozprawy. Są to bez wątpienia obserwacje oryginalne, o znaczeniu poznawczym i potencjalnym zastosowaniu klinicznym. We Wstępie doktorantka szczegółowo omówiła epidemiologię, podstawy biologii oraz klasyfikację kliniczną raka płuca, podstawy biologiczne procesu angiogenezy nowotworowej oraz możliwości zastosowania terapii antyangiogennej w leczeniu tego nowotworu, głównie wymierzonej w białka ważne dla przebiegu tego zjawiska, takie, jak fosforylaza tymidyny, oksygenaza hemowa-1 oraz czynnik transkrypcyjny Nrf2. Ponadto, jeden podrozdział poświęciła roli mikro RNA w powstawaniu nowotworów oraz znaczeniu zapalenia i nowotworowych komórek macierzystych w rozwoju nowotworów. Tę część rozprawy oceniam wysoko. Doktorantka wykazała się w niej dużą dojrzałością i wprawą w analizowaniu obszernych danych z literatury światowej. Ponadto, zilustrowała część opisywanych zjawisk bardzo czytelnymi i starannymi rycinami, które ułatwiają lekturę tego rozdziału. W mojej ocenie we Wstępie zabrakło jednak płynnych przejść narracyjnych pomiędzy poszczególnymi podrozdziałami. Uważam również, że Tabela 1, opisująca stadia kliniczne raka płuca, nie wpisuje się w tematykę zagadnień poruszanych w części badawczej pracy i jest w związku z tym zbędna. Doktorantka nie ustrzegła się również drobnych błędów językowych (dla przykładu, na stronie 22 zamiast zdania: ".. stimuli, which leads to degradation of extracellular matrix..." powinno znaleźć się zdanie: "..stimuli, which lead to..."). Te drobne mankamenty w żaden sposób nie umniejszają wartości rozprawy, która została napisana niezwykle starannie i przejrzyście. Na podkreślenie zasługuje również bardzo sprawne posługiwanie się językiem angielskim przez Doktorantkę. Cztery cele pracy zostały zwięźle określone i w większości odpowiadają podjętym badaniom.

Centrum Biostruktury tel.: 0-22-599-21-99, fax: 0-22-599-21-94 e-mail: immonologia@wumsedu.pl Opis Materiałów i Metod jest niezwykle wyczerpujący i staranny. Zastosowana przez Doktorantkę metodyka badawcza jest nowoczesna i zgodna z najwyższymi światowymi standardami dla tego typu doświadczeń. Należy podkreślić, że w swojej pracy mgr Magdalena Tertil wykorzystała liczne, niekiedy zaawansowane techniki laboratoryjne, co wskazuje na Jej duże doświadczenie badawcze i biegłość w posługiwaniu się rozmaitymi metodami biologii molekularnej. Moją wątpliwość budzi jedynie opis oceny ekspresji genu reporterowego (genu dla lucyferazy, podrozdział 6.4.3.). W jaki sposób Doktorantka określała aktywność badanych czynników transkrypcyjnych? Czy otrzymane wartości luminescencji przeliczała na całkowitą ilość białka w ocenianych lizatach? Złotym standardem dla tego rodzaju doświadczeń jest jednoczasowe wprowadzenie do komórek nie tylko genu dla lucyferazy świetlikowej (firefly), ale również lucyferazy Renilla, której aktywność powinna stanowić właściwy punkt odniesienia dla uzyskanych wyników, umożliwiający uwzględnienie również wydajności transfekcji ocenianych komórek. Ponadto, z poznawczego punktu widzenia przydatny byłyby choć skrótowy opis próbek pobranych od pacjentów z rakiem płuca (na przykład rozpoznanie histopatologiczne). Opis uzyskanych Wyników stanowi najobszerniejszą część ocenianej rozprawy. W swoich badaniach Doktorantka posłużyła się modelami in vitro (ludzkie linie komórkowe raka płuca NCI- H292 i A549 oraz ludzkie komórki śródbłonka naczyniowego HUVEC i HMEC), modelem ksenoprzeszczepu komórek NCI-H292 do myszy nagich oraz przeanalizowała materiał kliniczny (próbki guzów pierwotnych oraz przerzutowych pobrane od pacjentów z niedrobnokomórkowym rakiem płuca). Mnogość zastosowanych modeli bez wątpienia znakomicie zwiększa znaczenie poznawcze poczynionych obserwacji. Niektóre z uzyskanych przez Doktorantkę wyników budzą jednak moje drobne wątpliwości i dalsze pytania: 1) Niezręczne jest posługiwanie się terminem "tumorogenność" w odniesieniu do wyników uzyskanych w eksperymentach w modelu in vitro (podrozdział 7.1.5., 7.2.1. oraz 7.3.) - jest to zjawisko opisywane raczej jedynie w modelach in vivo. 2) Na rycinie 7.7 oraz 7.12 różnice w inkorporacji bromodeoksyurydyny pomiędzy komórkami transdukowanymi / transfekowanymi pustym wektorem i genem dla Nrf2 / HO-1, choć istotne statystycznie, są, w mojej ocenie, dość subtelne. 3) Nie sposób odnieść się do oceny ekspresji mikro RNA w komórkach wykazujących zwiększoną ekspresję HO-1, gdyż uzyskane wyniki nie zostały omówione w rozprawie, a publikacja, która stanowi do nich odniesienie, nie jest jeszcze opublikowana / publicznie dostępna. 3

Centrum Biostruktury tel.: 0-22-599-21-99, fax: 0-22-599-21-94 e-mail: immunologiagwum.edu.pl 4) Zastanawiające jest, dlaczego Doktorantka w swoich badaniach nie oceniła ekspresji i roli mikro RNA, dla którego geny znajdują się w obrębie genu dla czynnika transkrypcyjnego Nrf2 (mir-4444-1 oraz mir-3128)? Ponadto, w ocenie roli badanych mikro RNA należałoby posłużyć się testami umożliwiającymi weryfikację funkcji badanych mikro RNA (na przykład wprowadzić do komórek plazmid zawierający gen dla lucyferazy pod kontrolą konstytutywnego promotora, zawierający fragment 3'UTR genu docelowego dla badanego mikro RNA). 5) Jaką analizą bioinformatyczną posłużyła się Doktorantka przy ocenie miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych w obrębie promotora genu dla Nrf2? 6) Jak Doktorantka interpretuje brak różnic we wzroście guza pomiędzy grupą kontrolną a grupą ze zwiększoną ekspresją fosforylazy tymidylanowej (dane z eksperymentu wykonanego w modelu in vivo, przedstawione na rycinie 7.29.A)? 7) Czy istnieje wytłumaczenie dla znacznych różnic w ekspresji tubuliny pomiędzy komórkami kontrolnymi a komórkami ze zwiększoną ekspresją fosforylazy tymidyny przedstawionymi na rycinie 7.41? 8) Mając na uwadze niewielką ekspresję VEGF w komórkach HUVEC, na rycinie 7.42 należałoby przedstawić raczej wyniki surowe, a nie odsetek wartości uzyskanej dla komórek kontrolnych, gdyż jest to, w mojej opinii, nieco mylące. W Dyskusji, napisanej niezwykle dojrzale, Doktorantka przedstawia wyniki swoich badań na tle literatury światowej i podejmuje próbę ich analizy w oparciu o znane zjawiska uczestniczące w rozwoju nowotworów. Jest to, w mojej ocenie, niezwykle cenna część recenzowanej rozprawy, choć brakuje mi w niej częstszych odniesień do konkretnych wyników uzyskanych przez Doktorantkę w przebiegu Jej badań. Piśmiennictwo zostało przygotowane niezwykle starannie i opiewa na aż 439 pozycji. W rozprawie w znakomitej większości cytowane są aktualne pozycje literatury światowej z zakresu poruszanej w pracy tematyki oraz najważniejsze prace historyczne opublikowane w prestiżowych czasopismach międzynarodowych. Ta część rozprawy również wskazuje na ogromną dojrzałość naukową Doktorantki i Jej sprawność analizowaniu niezwykle bogatej literatury. W mojej ocenie cytowane piśmiennictwo mogłoby się zamknąć w mniejszej liczbie bez znacznego zubożenia rozprawy. Również recenzent czułby się wtedy nieco mniej przytłoczony jego rozmiarem. Na podkreślenie bez wątpienia zasługuje fakt, że mgr Magdalena Tertil jest współautorem dwóch prac oryginalnych i pierwszym autorem jednej pracy przeglądowej opublikowanych w czasopismach z Listy Filadelfijskiej. W podsumowaniu chciałabym podkreślić, że przedłożoną mi do recenzji rozprawę oceniam bardzo wysoko. Uważam, że w pełni odpowiada ona wymogom stawianym pracom doktorskim. 4

Centrum Biostruktury tel.: 0-22-599-21-99, fax: 0-22-599-21-94 e-mail: immunologia@wum.edu.pl W związku z tym zwracam się do Wysokiej Rady o dopuszczenie mgr Magdaleny Tertil do dalszych etapów przewodu doktorskiego. Z wyrazami szacunku, 00,1-111(1)VG- dr hab. Dominika Nowis Warszawski Uniwersytet Medyczny ul. Banacha 1A, budynek F 02-097 Warszawa 5