ROLNICTWO MOLEKULARNE

Podobne dokumenty
Wykorzystanie systemów roślinnych do produkcji rekombinowanych cytokin

Aneta Gerszberg i Andrzej K. Kononowicz. Zakład Cytogenetyki i Biologii Molekularnej Roślin Uniwersytet Łódzki

PL B1. Polska Akademia Nauk, Instytut Biochemii i Biofizyki,Warszawa,PL BUP 18/04

Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak

Nowoczesne systemy ekspresji genów

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

Ekspresja białek w komórkach ssaczych

Badanie funkcji genu

Układ pracy. Wstęp i cel pracy. Wyniki. 1. Ekspresja i supresja Peroksyredoksyny III w stabilnie transfekowanej. linii komórkowej RINm5F

Badanie funkcji genu

leków biologicznych Teraźniejszość i przyszłość leków biologicznych prof. Paweł Grieb 1 z 7 Temat

Rośliny z probówki. Jak powstają? Alina Trejgell & Agata Stawicka, UMK

SESJA 10 ODPOWIEDŹ ORGANIZMÓW NA CZYNNIKI BIOTYCZNE I ABIOTYCZNE WYKŁADY

października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II

Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca

Sylabus Biologia molekularna

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe

Zawartość. Wstęp 1. Historia wirusologii. 2. Klasyfikacja wirusów

Od kapusty do mamuta wyzwania biotechnologii. Renata Szymańska

Regulacja Ekspresji Genów

Bloki licencjackie i studia magisterskie na Kierunkach: Biotechnologia, specjalność Biotechnologia roślinna oraz Genetyka

Wykład 14 Biosynteza białek

Sukces kultur in vitro oparty jest na zjawisku totipotencji, czyli nieograniczonej zdolności komórek do dzielenia się i odtwarzania całego organizmu

Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany

Białka różnicowe w bulwach odmian ziemniaka o różnym poziomie odporności na bakterie Dickeya solani

Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych

Drożdżowe systemy ekspresyjne

ANNA DOBROWOLSKA. Tom 53, 2004 Numer 2 (263) Strony IV Liceum Ogólnokształcące Pomorska 16, Łódź annadobrow@interia.

Inżynieria genetyczna

1. Biotechnologia i inżynieria genetyczna zagadnienia wstępne 13

WYDZIAŁ BIOCHEMII, BIOFIZYKI I BIOTECHNOLOGII PRACOWNIA GENETYKI MOLEKULARNEJ I WIRUSOLOGII

Mechanochemiczny przełącznik między wzrostem i różnicowaniem komórek

Lp. tydzień wykłady seminaria ćwiczenia

Wprowadzenie do biologii molekularnej.

Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii

Konstrukcja genetycznie modyfikowanych roślin

Marek Figlerowicz 1, Agata Tyczewska 1, Magdalena Figlerowicz 2

TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA

WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS

TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów

WYNALAZKI BIOTECHNOLOGICZNE W POLSCE. Ewa Waszkowska ekspert UPRP

WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

CZY ROLNICTWO EKOLOGICZNE POWIATU SIEDLECKIEGO PODEJMIE UPRAWĘ ROŚLIN GENETYCZNIE MODYFIKOWANYCH?

TERMOSTABILNOŚĆ PEPTYDAZ I INHIBITORÓW PEPTYDAZ NASION ROŚLIN SPOŻYWANYCH PRZEZ CZŁOWIEKA

Pytania Egzamin magisterski

Interakcje między abiotycznymi i biotycznymi czynnikami stresowymi: od teorii do praktyki Elżbieta Kuźniak Joanna Chojak

Prokaryotyczne i eukaryotyczne systemy nadekspresji bia lek.

Inwestycja w przyszłość czyli znaczenie ochrony własności przemysłowej dla współczesnej biotechnologii

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

CYTOKINY. Maja Machcińska

WYDZIAŁ BIOCHEMII, BIOFIZYKI I BIOTECHNOLOGII Pracownia Genetyki Molekularnej i Wirusologii. Kierownik Prof. dr hab. HANNA ROKITA

CHOROBY REUMATYCZNE A OBNIŻENIE GĘSTOŚCI MINERALNEJ KOŚCI

ETYCZNE ASPEKTY INŻYNIERII GENETYCZNEJ

Dr Anna Góra-Sochacka

wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki

Sylabus Biologia molekularna

Charakterystyka izoenzymów aminotransferazy asparaginianowej z siewek pszenicy zwyczajnej (Triticum aestivum L.)

1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy

Zakład Anatomii i Cytologii Roślin Instytut Biologii Eksperymentalnej i Biotechnologii Roślin Grupa badawcza: prof. dr hab. Danuta Maria Antosiewicz

AUTOREFERAT ROZPRAWY DOKTORSKIEJ. The role of Sdf-1 in the migration and differentiation of stem cells during skeletal muscle regeneration

Wykład 1. Od atomów do komórek

GENOM I JEGO STRUKTURA

Spis treści. 1. Wiadomości wstępne Skład chemiczny i funkcje komórki Przedmowa do wydania czternastego... 13

(12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11)

Nowe techniki hodowli roślin (NTHR) New Plant Breeding Techniques(NPBTs)

Geny i działania na nich

Genetyczne uwarunkowanie odporności na stres.

Metody badania ekspresji genów

Terminologia. Leki biopodobne. Leki chemiczne vs leki. Leki biotechnologiczne. Wytyczne EMA dotyczące oceny immunogenności leków biologicznych

Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego

Auksyna,,oczami roślin transgenicznych

1

Laboratorium Pomorskiego Parku Naukowo-Technologicznego Gdynia.

Active SERUM 3 KROKI KOMPLEKSOWEJ PIELĘGNACJI SKÓRY

SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA

METODYKA STOSOWANA W ZAKŁADZIE BIOLOGII ROZWOJU ROŚLIN

Biologia molekularna

Biologia molekularna wirusów. Materiały dydaktyczne współfinansowane ze środków Unii Europejskiej w ramach Europejskiego Funduszu Społecznego.

PLAN STUDIÓW. Rodzaj zajęć. e-nauczanie,

dostateczny oraz: wyjaśnia, z czego wynika komplementarność zasad przedstawia graficznie regułę

Biologia komórki i biotechnologia w terapii schorzeń narządu ruchu

Uniwersytet Łódzki, Instytut Biochemii

Dr Marek Daniel Koter / dr hab. Marcin Filipecki

Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii

Inwestycja w przyszłość czyli znaczenie ochrony własności przemysłowej dla współczesnej biotechnologii

Oddziaływanie komórki z macierzą. adhezja migracja proliferacja różnicowanie apoptoza

DOTACJE NA INNOWACJE. Uzyskanie ochrony patentowej aptamerów RNA jako inhibitorów rybonukleazy Dicer Projekt nr: POIG

SPIS TREŚCI WYKAZ SKRÓTÓW WSTĘP... 15

Podstawy mikrobiologii. Wirusy bezkomórkowe formy materii oŝywionej

1995, 44 (3-4): Towarzystwo PL ISSN Ä KOSMOS

DOROBEK NAUKOWY PRZEMYSŁAW JAGODZIK

gibereliny naturalna : GA 3 (kwas giberelowy)

Zakład Chemii Teoretycznej i Strukturalnej

Statystyczna analiza danych

24. Przedziały wewnątrzkomórkowe i transport..(zaz) 25. Przekształcanie energii w mitochondriach i chloroplastach..(zaz) 26.

Faculty of Biology Institute of Anthropology

Recenzja rozprawy doktorskiej mgr inż. Artura Zajkowicza

Transkrypt:

ROLNICTWO MOLEKULARNE Produkcja cytokin w roślinach. Patrycja Redkiewicz Dr Anna Góra-Sochacka Prof. dr hab. Agnieszka Sirko 1

CYTOKINY są to małe cząsteczki (gliko)proteinowe regulujące bardzo różnorodne procesy takie jak proliferacja, różnicowanie czy ruchliwość komórek biorących udział w odpowiedzi odpornościowej oraz komórek hemopoetycznych Postępy Biochemii (2009), 55, 85-94

PODZIAŁ CYTOKIN Interleukiny Hematopoetyny Chemokiny Interferony Nadrodzina cząsteczek TNF Inne cytokiny Postępy Biochemii (2009), 55, 85-94

FUNKCJE CYTOKIN Ann. N.Y. Acad. Sci. 1056: 16 29 (2005).

CYTOKINY STOSOWANE JAKO LEKI Cytokiny Interferon-α (INF-α) Interferon-β (INF-β) Interferon-γ (INF-γ) Erytropoetyna-α (EPO-α) Preparaty dostępne jako leki Intron A (Schering Plough) Roferon A (Hoffman La Roche) Betaseron (Bayer) Avonex (Biogen Idec) Actimmune (Intermune Pharma) Eprex (Cilag Jansen) Epogen (Amgen) Procrit (Ortho Biotech) Chronic hepatitis B Chronic hepatitis C Hairy cell leukemia Chronic myeloloid leukemia, Condyloma acuminate, AIDS-related Kaposi s sarcoma Relapsing multiple sclerosis Malignant osteopetrosis Chronic granulomatous disease Anemia due to chronic renal failure, HIV infected patients, chemotherapy, primary bone marrow disorders IL-2 G-CSF GM-CSF Aldesleukin (Novartis) Metastatic renal cell cancer, metastatic melanoma Neupogen Neutropenia (Hoffman La Roche) Leukine /Sargramostin (Bayer) Leukemia, Bone marrow /stem cell transplants Int. J. Mol. Sci. 2011, 12, 3536-3552

PRZEGLĄD LITERATURY (1995-2011)

Cytokina Materiał roślinny Elementy kasety ekspresyjnej Metoda Poziom produkcji Erytropoety na G-CSF zawiesina komórkowa Nicotiana tabacum zawiesina komórkowa N. tabacum GM-CSF zawiesina komórkowa N. tabacum GM-CSF zawiesina komórkowa N. tabacum GM-CSF zawiesina komórkowa Oryza sativa GM-CSF zawiesina komórkowa O. sativa GM-CSF zawiesina komórkowa O. sativa promotor 35S CaMV, terminator 35S CaMV promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji, Ω-wzmacniacz translancji; terminator genu nos promotor 35S CaMV, sekwencja wzmacniająca translację z wirusa TEV, etykieta His, terminator T7 promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji, terminator nos promotor amylazy ryżu, peptyd sygnalny amylazy ryżu promotor amylazy ryżu, peptyd sygnalny amylazy ryżu, wyciszenie genu kodującego α-amylazę za pomocą RNAi do poziomu 8.2% promotor amylazy ryżu, peptyd sygnalny amylazy ryżu, wyciszenie genu kodującego cysteinową proteinazę za pomocą RNAi mikrowstrzeli wanie mikrowstrzeli wanie mikrowstrzeli wanie 0.0026% TSP; 25 pg/l 105 μg/l 150 µg/l (wewnątrz kom.); 250 µg/l (wydzielane) 180 780 µg/l 129 mg/l (25% wydzielanych białek) do 280 mg/l do 290 mg/l GM-CSF zawiesina komórkowa O. sativa promotor amylazy ryżu, peptyd sygnalny amylazy ryżu; współekspresja genu kodującego syntetyczny inhibitor proteaz (spi-ii) mikrowstrzeli wanie do 250 mg/l

GM-CSF liście Saccharum promotor MUbi-1 z kukurydzy i SCubi-9 z trzciny cukrowej mikrowstrzeli wanie 0,02% TSP GM-CSF nasiona N. tabacum promotor gluteiny Gt1, Gt3, peptyd sygnalny gluteiny, terminator nos 0,005-0,03% TSP GM-CSF nasiona O. sativa promotor gluteiny Gt1, peptyd sygnalny gluteiny, terminator nos 1.3% TSP GM-CSF nasiona O. sativa GM-CSF liście Nicotiana benthamiana Promotor gluteiny Gt13a (specyficzny dla endospermy nasion), peptyd sygnalny gluteiny, terminator nos, optymalizacja kodonów wektor pochodna PVX: promotor 35S CaMV, etykieta His wektor wirusowy PVX 0,5-14 μg/ nasiono 0,2-2% TSP IL-2; IL-4 zawiesina komórkowa N. tabacum promotor 35S CaMV, terminator T7 Transformacja 0,09 mg/l 0,45 mg/l

IL-10; IL-4 IL-18 IL-2 IL-10 liście N. tabacum liście N. tabacum bulwy S. tuberosum liście N. tabacum IL-4 liście N. tabacum, bulwy S. tuberosum TNF-α Solanum tuberosum promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji, t-cupwzmacniacz translacji, ELP, KDEL, terminator nos promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji, Ω-wzmacniacz translancji, terminator nos promotor patatyny; terminator nos 1. promotor 35S CaMV, etykieta His, peptyd kierujący do chloroplastów oraz kaseta bez etykiety His 2. promotor 35S CaMV, etykieta His; peptyd kierujący do mitochondriów promotor 35S CaMV, sekwencja KDEL kierująca białka na szlak sekrecyjny promotor 35S CaMV, Ω wzmacniacz translancji, sekwencja SEKDEL kierująca białka na szlak sekrecyjny 0,27% TSP (IL-10); 0,086% TSP (IL-4) 0,004 0,051% TSP; 351 ng/g 115 U/mg TSP 1. 7 ng/mg TSP (bez His); 43 ng/mg TSP (z His) 2. brak akumulacji 0,1% TSP w tytoniu; 0,08% TSP w ziemniaku 15 µg/g tkanki

IL-12 liście N. tabacum promotor 35S CaMV, terminator 35S CaMV IL-12 IL-12 liście i owoce Lycopersicon esculentum zawiesina komórkowa N. tabacum promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem, terminator 35S CaMV promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji, Ω-wzmacniacz translancji IL-13 liście N. tabacum promotor 35S CaMV z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji; wzmacniacz translacji z wirusa AMV, KDEL, terminator nos Kardiotrof ina-1 liście N. tabacum, chloroplastów IFN-α2b liście N. tabacum, chloroplastów 1. promotor rrn (promotor 16S RNA) i wzmacniacz translacji (5 UTR genu 10 faga T7) 2. promotor psba i wzmacniacz translacji (5 UTR psba) Kaseta ekspresyjna: 5 UTR/HIS/THR/IFNα2b sklonowana w wektorze chloroplastowym pld-ctv mikrowstrzeliw anie mikrowstrzeliw anie 40ng/g 7,3μg/g liści 4,3μg/g owoców 175μg/l 0,15% TSP 1. 0,14 mg/g 2. do 1,14 mg/g 3mg/g, 20% TSP Postępy Biochemii (2009), 55, 85-94

ROŚLINY TRANSGENICZNE: PBJ (2008) 6, 504-515 Co-expression of proteinase inhibitor enhances recombinant human granulocyte-macrophage colony stimulating factor production in transgenic rice cell suspension culture Protein Expr. Purif. (2008) 61, 117-121 Improvement of recombinant hgm-csf production by suppression of cysteine proteinase gene expression using RNA interference in a transgenic rice culture Plant Mol Biol (2008) 68, 263-275

ROŚLINY TRANSGENICZNE 1. Konstrukcja kasety ekspresyjnej (wybór promotora) 2. Wprowadzenie kasety do wektora binarnego (np.pbinplus) 3. Transformacja Agrobacterium 4. Transformacja tkanki roślinnej Figlerowicz i wsp. 2006, Biotechnologia 3, 53-66 12

Konstrukcja kasety ekspresyjnej (optymalizacja transkrypcji i translacji) Promotory konstytutywne: CaMV35S (x2) Promotory specyficzne-tkankowo: gluteiny Gt1,Gt3, patatyny Promotory indukowane: W tytoniu ekspresja po zerwaniu liści przy ich cięciu (CropTech Corp., USA (promotor MeGA TM ) Promotor genu peroksydazy z wilca ziemniaczanego, po ekspozycji na zranienie lub UV, 30x silniejszy od promotora 35S CaMV wzmacniacze translancji: z wirusa AMV, Ω, t-cup produkcja w liściach: kierowanie do ER (KDEL)

PBJ(2008),6,504-515 A novel platform for biologically active recombinant human interleukin-13 production Funkcje: może być stosowana w leczeniu cukrzycy I typu Roślina: N.tabacum Ekspresja: stabilna, promotor CaMV35S z podwójnym wzmacniaczem transkrypcji, wzmacniacz translancji z wirusa AMV,6xhistag, KDEL Poziom produkcji: 0,15%TSP

Analiza Western blot transgenicznych roślin Deglikozylacja

trawienie trypsyną, ph 8 pepsyna, ph 1.2 pankreatyna, ph 6.8

Badanie aktywności komórki TF-1 oczyszczona IL-13

Co-expression of proteinase inhibitor enhances recombinant human granulocyte-macrophage colony stimulating factor production in transgenic rice cell suspension culture Protein Expr. Purif. (2008) 61, 117-121 Roślina: zawiesina komórkowa O.sativa Ekspresja: stabilna, promotor amylazy ryżu, peptyd sygnalny amylazy ryżu; współekspresja genu kodującego syntetyczny inhibitor proteaz (spi-ii) Poziom produkcji: do 250mg/l

Fig. 5 Measurement of hgm-csf accumulation in suspension culture medium Fig.4 Protease activity in suspension culture medium derived from transgenic callus