dr Krzysztof Treder IHAR-PIB, Zakład Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie
|
|
- Jerzy Górski
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 18 Ziemniak Polski 2015 nr 4 METODY WYKRYWANIA OBECNOŚCI WIRUSÓW ZIEMNIAKA dr Krzysztof Treder IHAR-PIB, Zakład Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie k.treder@ihar.edu.pl Streszczenie Ziemniak z uwagi na wegetatywny sposób rozmnażania jest szczególnie podatny na akumulację chorób wirusowych, co jest szczególnie uciążliwym problemem w produkcji nasiennej. Dlatego diagnostyka wirusów jest jej stałym i ważnym elementem. W pracy dokonano przeglądu metod stosowanych do wykrywania wirusów ziemniaka, ze szczególnym uwzględnieniem wykrywania bezpośrednio w ekstraktach z bulw. Przedyskutowano wady i zalety omawianych metod. Słowa kluczowe: diagnostyka, ELISA, RT-PCR, wirusy ziemniaka Z iemniak jest jedną z trzech, po ryżu i pszenicy, najważniejszych roślin rolniczych na świecie (Devaux i in. 2014). Jego znaczenie stale rośnie, szczególnie w Azji i w Afryce, gdzie w ostatniej dekadzie dwukrotnie zwiększyła się powierzchnia uprawy, a pierwsze dwa miejsca wśród największych producentów zajęły Chiny i Indie (FAO 2014). Wzrost popularności ziemniaka w wielu rejonach świata wiąże się z tym, że odznacza się on najwyższą ze wszystkich roślin wartością energetyczną w stosunku do powierzchni uprawy oraz wysoką wartością odżywczą. Z uwagi na te walory Organizacja Narodów Zjednoczonych do spraw Wyżywienia i Rolnictwa uznała ziemniak za roślinę strategiczną, pozwalającą na realizację dwóch (I i VII) Milenijnych Celów Rozwoju. Celem I jest wyeliminowanie skrajnego ubóstwa i głodu, a celem VII stosowanie zrównoważonych metod gospodarowania zasobami naturalnymi (FAO 2009, Devaux i in. 2014). Ziemniak ma również duże znaczenie przemysłowe. Jest źródłem ekologicznego polimeru skrobi, która może być wykorzystana do produkcji biodegradowalnych plastików (Arvanitoyannis i in. 1998). W ostatnich latach zwrócono uwagę na wzrastający potencjał ziemniaków i odpadów ziemniaczanych jako źródła etanolu do produkcji biopaliw (Arapoglou i in. 2010; Hashem, Darwish 2010). Polska, w przeszłości jeden z największych producentów ziemniaków, obecnie zajmuje dopiero 10. miejsce w świecie, produkując ok. 6,3 mln ton rocznie. Jest jednak ważnym eksporterem przetworów ziemniaczanych. Niestety, pomimo bardzo dobrych warunków do produkcji ziemniaków nasz kraj w ciągu ostatnich 20 lat zszedł do roli importera ziemniaków nieprzetworzonych. Sytuacja ta odbija się szczególnie negatywnie na produkcji nasiennej, która pokrywa mniej niż 10% krajowego zapotrzebowania na sadzeniaki. Powodem niekorzystnej sytuacji jest m.in. zły stan fitosanitarny polskich ziemniaków. W przypadku sadzeniaków duży wpływ na ich jakość, a co za tym idzie straty ekonomiczne, ma porażenie wirusami ziemniaka, wśród których najważniejsze są: Y (PVY), M (PVM) i liściozwoju (PLRV). Mniejsze znaczenie ekonomiczne mają wirusy S (PVS), X (PVX) oraz A (PVA). W dbałości o jakość sadzeniaków produkcja nasienna podlega szczegółowym regulacjom prawnym, a przedsiębiorstwa nasienne są urzędowo kontrolowane przez Państwową Inspekcję Ochrony Roślin i Nasiennictwa. Od lat elementem obowiązkowego schematu kontroli są badania laboratoryjne sadzeniaków na obecność PVY, PVM i PLRV. W bieżącym roku do listy obowiązkowo badanych wirusów dołączono PVS, PVX i PVA. Zdrowotność sadzeniaków jest oceniana przez laboratoria Wojewódzkich Inspektora-
2 Ziemniak Polski 2015 nr 4 19 tów Ochrony Roślin i Nasiennictwa (WIO- RiN) na bazie tzw. próby oczkowej. Próba oczkowa polega na wycięciu fragmentów bulw z pojedynczymi oczkami, chemicznym przerwaniu ich spoczynku, podkiełkowaniu w 21 C w ciemności, a następnie wysadzeniu w szklarni i wykonaniu testu DAS-ELISA (ang. double-antibody sandwich enzymelinked immunosorbent assay) z użyciem soku z próbek liści pobranych z 4-6-tygodniowych roślin (Clark, Adams 1977) 1. Każdy z wirusów diagnozuje się za pomocą specyficznego zestawu przeciwciał. Opisana procedura jest dobrze opracowana, czuła, wiarygodna i skuteczna. Jest jednak kosztowna oraz czasochłonna. Wynik uzyskuje się po upływie kilku tygodni do kilku miesięcy od przesłania bulw do analizy. Rocznie laboratoria WIORiN oceniają w Polsce ok prób sadzeniaków, przy czym należy zaznaczyć, że jedna próba to 100 lub 200 bulw, zależnie od klasy sadzeniaka. Oznacza to, że liczba ocenianych bulw mieści się w przedziale od do rocznie. Koszty są wysokie, ponieważ zdrowotność bulw ocenia się w sezonie jesiennozimowym, po zbiorze ziemniaków. W efekcie pochodzące z oczek rośliny do badań uprawia się w szklarniach, które muszą być ogrzewane do odpowiedniej temperatury oraz odpowiednio doświetlane. Dlatego też od ponad 30 lat trwają próby opracowania metody pozwalającej na wykrywanie wirusów bezpośrednio w ekstraktach z bulw. Historycznie badacze próbowali adaptować test DAS-ELISA do tego celu. Jednak już w połowie lat 80. XX wieku wykazano, że nie jest on wystarczająco czuły, a ponadto często generuje wyniki fałszywie pozytywne (Hill, Jackson 1984). Głównymi przyczynami kłopotów z wykrywaniem wirusów w ekstraktach z bulw za pomocą DAS- -ELISA były: niższa niż w innych organach koncentracja wirusa, nierównomierne rozmieszczenie cząstek wirusa zarówno w obrębie bulwy, jak i w różnych bulwach pochodzących z tej samej rośliny, wysoka częstość występowania reakcji niespecyficznych w obrębie prób z roślin zdrowych oraz intensywność enzymatycznych i nieenzy- 1 Dokładny opis testu DAS-ELISA: Zacharzewska B., Treder K Test ELISA i jego modyfikacje. Ziemn. Pol. 1: matycznych reakcji redox powodujących ciemnienie soku (Hill, Jackson 1984; Tamada, Harrison 1980; Treder, Przewodowski, Barnyk 2009). Flegg i Clark (1979) opracowali test koktajl-elisa polegający na wspólnej inkubacji soku roślinnego z koniugatem (przeciwciało z kowalencyjnie związanym enzymem) w studzienkach mikropłytki (Zacharzewska, Treder 2014). Był on 10-krotnie bardziej czuły od standardowego testu ELISA w ocenie koncentracji PLRV w sokach z liści (van den Heuvel, Peters 1989). Stwierdzono ponadto wyższą czułość tej metody, w porównaniu z procedurą standardową, w wykrywaniu PLRV, PVM i PVY w ekstraktach z bulw (Treder, Pilecki, Łycuś 2009). Jednoroczne wyniki wykazały dużą zgodność koktajl- -ELISA na bulwach z wynikami prób oczkowych dla PVY i PLRV (Treder, Przewodowski, Barnyk 2009). Dalsze, 5-letnie badania potwierdziły dobrą zgodność obu testów dla PLRV i PVM. Niestety, w przypadku PVY wyniki uzyskane za pomocą obu testów znacznie różniły się pomiędzy latami badań (Treder nieopubl.). Ciekawą wersję testu ELISA stanowi test na krążkach z kiełków. W tej metodzie do studzienek mikropłytki wkłada się kilkanaście krążków uciętych z kiełków i inkubuje w celu elucji cząstek wirusa z wiązki przewodzącej. Test pozwalał na eliminację etapu szklarniowego w ocenie porażenia bulw przez PLRV (Syller 1988). Obecnie w Pracowni Diagnostyki Molekularnej i Biochemii IHAR-PIB w Boninie prowadzone są prace nad wykorzystaniem kiełków do wykrywania najważniejszych wirusów ziemniaka. W związku z wątpliwą skutecznością wykrywania wirusów w sokach z bulw za pomocą metod immunoenzymatycznych już w latach 80. ubiegłego wieku podejmowano próby aplikacji do tego celu metod molekularnych, pozwalających na wykrycie i analizę kwasów nukleinowych, z których zbudowane są genomy wirusów. Większość wirusów roślinnych posiada genomy zbudowane z kwasu rybonukleinowego (RNA). Początkowo stosowano metody wykorzystujące hybrydyzację kwasów nukleinowych, a od lat 90. również ich namnażanie (amplifikację). Obie grupy metod są wykorzystywane w diagnostyce wirusów po dzień dzisiejszy.
3 20 Ziemniak Polski 2015 nr 4 W grupie metod hybrydyzacyjnych praktyczne znaczenie zyskała technika hybrydyzacji plamkowej (ang. Nucleic Acid Spot Hybridization, NASH). Polega ona na naniesieniu ekstraktu roślinnego lub wyizolowanego z niego RNA na podłoże wiążące RNA (membrany nylonowe lub odpowiednio modyfikowane szkło) i hybrydyzację ze specyficzną sondą zbudowaną z jednoniciowego, znakowanego cdna (lub crna). W przeszłości sondy znakowano radioaktywnie. Jednak podobną czułość można uzyskać przez znakowanie digoksygeniną i wykrywanie sondy za pomocą koniugatu enzymu z przeciwciałem specyficznym dla tego związku. Możliwe są również inne warianty znakowania i detekcji, np. w układzie biotyna- -awidyna lub poprzez bezpośrednie znakowanie sond barwnikami fluorescencyjnymi. W przypadku sond znakowanych digoksygeniną lub biotyną obecność wirusa można wykrywać kolorymetrycznie, fluorescencyjnie lub chemiluminescencyjnie w zależności od użytego enzymu i substratu. W porównaniu z DAS-ELISA czułość hybrydyzacji plamkowej jest od kilkudziesięciu do kilkuset razy wyższa (zależnie od charakteru i długości sondy), co pozwala na wykrywanie wirusów w bulwach ziemniaka (Singh 1999b). Za pomocą sond znakowanych digoksygeniną wykrywano z dużą czułością PVY w ekstraktach z liści (Dhar, Singh 1994) i PLRV w liściach i bulwach (Loebenstein i in. 1997). Hybrydyzację plamkową adaptowano również do jednoczesnego wykrywania kilku wirusów i wiroida (Hopp i in. 1991, Wełnicki i in. 1994, Janczur i in. 2006). Kolejnym krokiem w kierunku wykorzystania metod hybrydyzacyjnych do diagnostyki patogenów ziemniaka było zastosowanie mikromacierzy DNA. Opracowano mikromacierze pozwalające na multipleksowe wykrywanie wirusów ziemniaka w jednej próbie (Boonham i in. 2003, Bystricka i in. 2005). Dużą zaletą mikromacierzy jest możliwość wykrywania wielu patogenów ziemniaka jednocześnie. Jednak czułość oferowana przez tę metodę jest porównywalna z DAS-ELISA, co uniemożliwia wykrywanie wirusów bezpośrednio w bulwach. Ponadto koszt wytwarzania mikromacierzy i wykrywania za ich pomocą patogenów ziemniaka jest wysoki z uwagi na konieczność stosowania specjalnych drukarek i skanerów. W związku z tym opracowano makromacierze, przygotowywane za pomocą ręcznych replikatorów, których wynik reakcji wywoływano i dokumentowano bez zastosowania drogiego wyposażenia. Umożliwiały one multipleksową detekcję 11 wirusów infekujących ziemniaki (Agindotan i in. 2008). W ocenie autorów czułość testu jest porównywalna z klasycznym testem DAS-ELISA. Opracowana na początku lat 80. XX wieku metoda łańcuchowej reakcji polimerazy (ang. Polymerase Chain Reaction, PCR) zrewolucjonizowała nauki biologiczne i przemysł biotechnologiczny, włącznie z diagnostyką patogenów roślinnych. Można za jej pomocą namnażać specyficzne fragmenty DNA. W połączeniu z reakcją odwrotnej transkrypcji RNA do cdna (ang. reverse transcription, RT) jako test RT-PCR pozwala na czułą i specyficzną detekcję wirusów w tkankach ziemniaka 2. Już na początku lat 90. XX wieku wykazano, że w przeciwieństwie do DAS-ELISA RT-PCR umożliwia wykrywanie PVY (Barker i in. 1993) i PLRV (Spiegel, Martin 1993) w bulwach w stanie spoczynku (fot. 1 i 2). W ciągu ostatnich 20 lat opracowano wiele procedur wykrywania najważniejszych wirusów ziemniaka w liściach i bulwach (np. Singh 1999ab; Crosslin, Hamlin, 2011). Wykrywanie wirusów ziemniaka w bulwach wymaga szczegółowej optymalizacji wszystkich etapów testu. Szczególnie istotne są takie parametry jak: miejsce pobrania prób, skład buforu ekstrakcyjnego oraz dobór metody izolacji RNA (Zacharzewska i in. 2014). Dla odmian ziemniaka o wyższej zawartości polifenoli konieczne jest też optymalizowanie składników reakcji RT oraz PCR (Singh 1999b). Nakład pracy i koszt wykrywania wirusów ziemniaka za pomocą RT-PCR można obniżyć, dodając do mieszaniny reakcyjnej PCR pary starterów dla kilku różnych wirusów. Tego typu test multipleksowy (m-rt-pcr) wymaga dokładnej optymalizacji składników reakcji PCR i doboru kompatybilnych par starterów. Ważna jest również optymalizacja 2 Opis zasady działania testu PCR: Chołuj J., Przewodowski W Technika PCR i jej modyfikacje w identyfikacji patogenów ziemniaka. Ziemn. Pol. 3: 40-45
4 Ziemniak Polski 2015 nr 4 21 warunków reakcji odwrotnej transkrypcji, szczególnie stężenia oligonukleotydów stosowanych do syntezy cdna (Singh, Nie 2003). Za pomocą m-rt-pcr wykrywano w bulwach ziemniaka od 3 (Peiman, Xie, 2006) do 5 różnych wirusów jednocześnie (Du i in. 2006). 292 pz 292 pz Fot. 1. Przykład zastosowania testu RT-PCR do wykrywania PVY w liściach ziemniaka za pomocą starterów opracowanych w PDMiB w Boninie. Produkty reakcji RT-PCR rozdzielano za pomocą elektroforezy w 1,5-proc. żelu agarozowym. Obecność produktu reakcji o wielkości 292 par zasad świadczy o obecności PVY w badanym materiale. Badane rośliny: ścieżki od 1 do 30; zdrowe rośliny (kontrola negatywna): k1, k2, k3; preparat PVY (kontrola pozytywna): k4; marker wielkości cząstek DNA Nova 100 bp DNA ladder (Novazym): 1. (Źródło własne: PDMiB ZNiOZ w Boninie) Czułość multipleksów była bardzo wysoka, porównywalna z czułością RT-PCR dla pojedynczych wirusów. Dodatkowo wiarygodność wykrywania wirusów za pomocą m- -RT-PCR można zwiększyć, stosując wewnętrzną kontrolę, polegającą na zastosowaniu starterów, które wykrywają RNA roślinne np. 18S rrna (Du i in. 2006). Test m-rt-pcr wykorzystuje się również do identyfikacji szczepów danego wirusa, co jest szczególnie przydatne w diagnostyce PVY (fot. 2) Fot. 2. Przykład zastosowania testu m-rt-pcr do wykrywania i identyfikacji szczepów. Produkty reakcji RT-PCR rozdzielano za pomocą elektroforezy w 1,5-proc. żelu agarozowym. Marker wielkości cząstek w parach zasad (pz) DNA Nova 100 bp DNA ladder (Novazym): ścieżka M; zdrowe rośliny (kontrola negatywna): ścieżki 1, 2; PVY N-Wi: 3, 4; PVY O: 5-7; PVY NTN: 8, 9; PVY N: 10. (Źródło własne: PDMiB ZNiOZ w Boninie)
5 22 Ziemniak Polski 2015 nr 4 Test RT-PCR w czasie rzeczywistym (real-time RT-PCR) pozwala na wykrywanie wirusów z większą czułością oraz umożliwia ilościową analizę wirusa w badanej próbce (Mumford i in. 2006, Boonham i in. 2008). W metodzie tej fluorescencja mierzona jest podczas trwania reakcji PCR. Z uwagi na łatwą adaptację do automatyzacji, wysoką specyficzność i czułość, bezpośrednią detekcję oraz możliwość multipleksowego wykrywania real-time RT-PCR wydaje się idealnym następcą DAS-ELISA w diagnostyce wirusów ziemniaka. Jednak ze względu na wysokie koszty wdrożenia stosowanie tej metody w testach masowych jest mało realne, ale z pewnością okaże się ona nieoceniona przy weryfikacji budzących wątpliwości wyników certyfikacji nasiennej. Metody RT-PCR nie znalazły dotychczas zastosowania w diagnostyce na dużą skalę. Próby praktycznej aplikacji RT-PCR w czasie rzeczywistym i RT-PCR wykazały, że czułość wykrywania PVY w bulwach była niższa niż w diagnostyce bazującej na próbie oczkowej (Fox i in. 2005, Bolotova i in. 2009). Duża rozbieżność czułości wynika m.in. z jakości RNA izolowanego z bulw i braku rutynowych metod przygotowania preparatów RNA (Boonham i in. 2008). Na rynku są dostępne wyspecjalizowane stacje robocze, które mo-żna adaptować do automatycznej izolacji RNA i są stosowane w tym celu w diagnostyce medycznej, jednak ich zakup i stosowanie przekracza możliwości finansowe laboratoriów fitosanitarnych. Wiarygodne wykrywanie wirusów w tkankach ziemniaka metodami molekularnymi wymaga RNA wysokiej jakości. Bulwy ziemniaka są organami bogatymi w polisacharydy, polifenole oraz enzymy katalizujące reakcje redox. W kontakcie z tlenem w homogenatach z tkanek ziemniaka dochodzi do intensywnego uwalniania wolnych rodników oraz enzymatycznego i nieenzymatycznego utleniania makrocząsteczek, w tym RNA. Szczególnie trudnym źródłem RNA są bulwy. Wysoka zawartość skrobi w tych organach sprawia, że uzyskanie preparatów RNA do przeprowadzenia reakcji RT-PCR nie jest łatwe. Kolejnym problemem w aplikacji RT-PCR do diagnostyki rutynowej jest brak standardowego protokołu. Procedury opisane w literaturze różnią się warunkami, sekwencjami starterów itp. Konieczne jest zatem opracowanie jednolitej procedury, przetestowanej na reprezentatywnej liczbie bulw przez niezależne laboratoria badawcze. Takie prace, łącznie z optymalizacją metody izolacji RNA (Zacharzewska i in. 2014) oraz projektowaniem i testowaniem starterów do wykrywania wirusów testem RT-PCR, prowadzone są obecnie w Pracowni Diagnostyki Molekularnej i Biochemii w Boninie. Literatura 1. Agindotan B., Perry K. L Macroarray detection of eleven potato-infecting viruses and potato spindle tuber viroid. Plant Dis. 92: ; 2. Arapoglou D., Varzakas Th., Vlyssides A., Israilides C Ethanol production from potato peel waste (PPW). Waste Manag. 30: ; 3. Arvanitoyannis I., Biliaderis C. G., Ogawa H., Kawasaki N Biodegradable films made from low-density polyethylene (LDPE), rice starch and potato starch for food packaging applications: Part 1. Carbohydr. Polym. 36: ; 4. Barker, H., Webster, K. D., Reavy, B Detection of potato virus Y in potato tubers: a comparison of polymerase chain reaction and enzyme-linked immunosorbent assay. Potato Res. 36: 13-20; 5. Bolotova Y. V., Karasev A. V., McIntosh C.S Statistical analysis of the laboratory methods used to detect potato virus Y. Am. J. Pot. Res. 86: ; 6. Boonham N., Glover R., Tomlinson J., Mumford R Exploiting generic platform technologies for the detection and identification of plant pathogens. Eur. J. Plant Pathol. 121: ; 7. Boonham N., Walsh K., Smith P., Madagan K., Graham I., Barker I Detection of potato viruses using microarray technology: towards a generic method for plant viral disease diagnosis. J. Virol. Meth. 108: ; 8. Bystricka D., Lenz O., Mraz I., Piherova L., Kmoch S., Sip M Oligonucleotide-based microarray: a new improvement in microarray detection of plant viruses. J. Virol. Meth. 128: ; 9. Chołuj J., Przewodowski W Technika PCR i jej modyfikacje w identyfikacji patogenów ziemniaka. Ziemn. Pol. 3: 40-45; 10. Clark M. F., Adams A. N Characteristics of the microplate method enzyme-linked immunosorbent assay for detection of plant viruses. J. Gen. Virol. 34: ; 11. Crosslin J., Hamlin L Standardized RT-PCR conditions for detection and identification of eleven viruses of potato and potato spindle tuber viroid. Am. J. Pot. Res. 88: ; 12. Devaux A., Kromann P., Ortiz O Potatoes for
6 Ziemniak Polski 2015 nr 4 23 sustainable global food security. Potato Res. 57: ; 13. Dhar A. K., Singh R. P Improvement in the sensitivity of PVY-N detection by increasing the cdna probe size. J. Virol. Meth. 50: ; 14. Du Z., Chen J., Hiruki C Optimization and application of a multiplex RT-PCR system for simultaneous detection of five potato viruses using 18S rrna as an internal control. Plant Dis. 90: ; 15. FAO International year of the potato 2008: new light on a hidden treasure FAO FAO statistical databases FAOSTAT Flegg C. L., Clark M. F The detection of Apple chlorotic leaf spot virus by a modified procedure of enzyme-linked immunosorbent assy. Ann. Appl. Biol. 91: 61-65; 18. Fox A., Evans F., Browning I Direct tuber testing for potato Y potyvirus by real-time RT-PCR and ELISA: reliable options for post-harvest testing? Bull. OEPP 35: 93-97; 19. Hashem M., Darwish S. M. I Production of bioethanol and associated by-products from potato starch residue stream by Saccharomyces cerevisiae. Biomass Bioenergy 34: ; 20. Hill S. A., Jackson E. A An investigation of the reliability of ELISA as a practical test for detecting potato leafroll virus and potato virus Y in tubers. Plant Pathol. 33: 21-26; 21. Hopp H. E., Hain L., Bravo-Almonacid F., Tazzini A. C., Orman B., Arese A. I., Ceriani M. F., Saladrigas M. V., Celnik R., Vas M. del, Mentaberry A. N Development and application of nonradioactive nucleic acid hybridization system for simultaneous detection of four potato pathogens. J. Virol. Meth. 31: 11-30; 22. Janczur K. L., Nakhla M. K., Charkowski A. O Multiplex detection of potato virus S, potato virus X, and potato virus Y by non-radioactive nucleic acid spot hybridization in potato tissue culture plantlets. Am. J. Pot. Res. 83: ; 23. Loebenstein G., Akad F., Filatov V., Sadvakasova G., Manadilova A., Bakelman H., Teverovsky E., Lachmann O., David A Improved detection of potato lefroll luteovirus in leaves and tubers with a digoxigenin-labeled crna probe. Plant Dis. 81: ; 24. Mumford R. A., Boonham N., Tomlinson J., Barker I Advances in molecular phytodiagnostics new solutions for old problems. Eur. J. Plant Pathol. 116: 1-19; 25. Peiman M., Xie C Development and evaluation of a multiplex RT-PCR for detecting main viruses and a viroid of potato. Acta Virol. 50: ; 26. Singh R. P., Nie X., Multiple virus and viroid detection and strain separation via multiplex reverse transcription polymerase chain reaction. Can. J. Plant Pathol. 25: ; 27. Singh R. P. 1999a. A solvent-free, rapid and simple virus RNArelease method for potato leafroll virus detection in aphids and plants by reverse transcription polymerase chain reaction. J. Virol. Meth. 83: 27-33; 28. Singh R. P. 1999b. Development of the molecular methods for potato virus and viroid detection and prevention. Genome 42: ; 29. Spiegel S., Martin R. R Improved detection of potato leafroll virus in dormant potato tubers and microtubers by the polymerase chain reaction and ELISA. Ann. Appl. Biol. 122: ; 30. Syller J Detection of potato leaf roll virus in intact sprout disks by enzymelinked immunosorbent assay. J. Phytopath. 121: ; 31. Tamada T., Harrison B. D Factors affecting the detection of potato leafroll virus in potato foliage by enzyme-linked immunosorbent assay. Ann. Appl. Biol. 95: ; 32. Treder K., Pilecki T., Łycuś P Wykrywanie wirusów ziemniaczanych bezpośrednio w ekstraktach z bulw porównanie testu ELISA z immuno-captured RT-PCR. Prog. Plant Prot. 49: ; 33. Treder K., Przewodowski W., Barnyk A Factors influencing detection of potato leafroll virus and potato virus Y in potato tuber extracts. Plant Breed. Seed Sci. 59: 65-74; 34. Van den Heuvel J. F. J. M., Peters D Improved detection of potato leafroll virus in plant material and in aphids. Phytopathology 79: ; 35. Wełnicki M., Żekanowski C Digoxigenin-labelled molecular probe for the simultaneous detection of three potato pathogens: potato spindle tuber viroid (PSTVD), potato virus Y (PVY), and potato leafroll virus (PLRV). Acta Biochim. Polon. 41: ; 36. Zacharzewska B., Przewodowska A., Treder K The adaptation of silica capture RT-PCR for the detection of potato virus Y. Am. J. Pot. Res. 91: ; 37. Zacharzewska B., Treder K Test ELISA jego modyfikacje. Ziemn. Pol.1: 14-16
WYKRYWANIE WIRUSÓW ZIEMNIACZANYCH BEZPOŚREDNIO W EKSTRAKTACH Z BULW PORÓWNANIE TESTU ELISA Z IMMUNO-CAPTURED RT-PCR
Progress in Plant Protection/Postępy w Ochronie Roślin, 49 (2) 2009 WYKRYWANIE WIRUSÓW ZIEMNIACZANYCH BEZPOŚREDNIO W EKSTRAKTACH Z BULW PORÓWNANIE TESTU ELISA Z IMMUNO-CAPTURED RT-PCR KRZYSZTOF TREDER
Detection of PVY, PVM and PVS in potato plants by DAS-ELISA in combined samples from 5 plants
PROGRESS IN PLANT PROTECTION/POSTĘPY W OCHRONIE ROŚLIN 52 (3) 2012 Detection of PVY, PVM and PVS in potato plants by DAS-ELISA in combined samples from 5 plants Wykrywanie PVY, PVM i PVS w roślinach ziemniaka
AUTOREFERAT PRZEDSTAWIAJĄCY OPIS DOROBKU I OSIĄGNIĘĆ NAUKOWYCH. dr Krzysztof Treder. Załącznik 2
Załącznik 2 AUTOREFERAT PRZEDSTAWIAJĄCY OPIS DOROBKU I OSIĄGNIĘĆ NAUKOWYCH dr Krzysztof Treder Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Biochemii, Oddział w Boninie Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin
Ziemniak Polski 2014 nr 3
40 Ziemniak Polski 2014 nr 3 Ochrona TECHNIKA PCR I JEJ MODYFIKACJE W IDENTYFIKACJI PATOGENÓW ZIEMNIAKA mgr inż. Joanna Chołuj, dr inż. Włodzimierz Przewodowski IHAR PIB, Pracownia Diagnostyki Molekularnej
Założenia kontroli plantacji produkcyjnych w kierunku wykrywania autoryzowanych i nieautoryzowanych GMO
Założenia kontroli plantacji produkcyjnych w kierunku wykrywania autoryzowanych i nieautoryzowanych GMO Sławomir Sowa Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB, Radzików Radzików 14.12.2015 Wprowadzenie zakazów
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
AmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
ZASTOSOWANIE MIKROROZMNAŻANIA W HODOWLI I NASIENNICTWIE ZIEMNIAKA
8 ZASTOSOWANIE MIKROROZMNAŻANIA W HODOWLI I NASIENNICTWIE ZIEMNIAKA mgr Rajmund Bruski Hodowla Roślin w Szyldaku Spółka z o.o., ul. Gdańska 10, 14-106 Szyldak Z iemniak należy do roślin rozmnażanych wegetatywnie.
TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Metody badania ekspresji genów
Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego
AmpliTest TBEV (Real Time PCR)
AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska
Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych
Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
Labowe know-how : ELISA
Labowe know-how : ELISA Test immunoenzymatyczny ELISA (Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay) jest jedną z najpowszechniejszych metod stosowanych w badaniach diagnostycznych i naukowych. Jej zadaniem jest
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie
RT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6
RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
Metody wykrywania genetycznie zmodyfikowanych organizmów
Metody wykrywania genetycznie zmodyfikowanych organizmów Katarzyna Grelewska- Nowotko Laboratorium Kontroli GMO Zakład Biotechnologii i Cytogenetyki Roślin IHAR- PIB Rośliny genetycznie zmodyfikowane:
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu
GENOMIKA FUNKCJONALNA Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu Adnotacja (ang. annotation) pierwszy etap po uzyskaniu kompletnej sekwencji nukleotydyowej genomu analiza bioinformatyczna
Projektowanie reakcji multiplex- PCR
Projektowanie reakcji multiplex- PCR Dzięki nowoczesnym, wydajnym zestawom do PCR, amplifikacja DNA nie jest już takim wyzwaniem, jak w latach 80-tych i 90-tych. Wraz z poprawą metodyki, pojawiły się ciekawe
GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
Geny odporności na wirus Y ziemniaka (PVY)
Geny odporności na wirus Y ziemniaka (PVY) Dr inż. Katarzyna Szajko Mgr Anna Grupa Mgr Krystyna Michalak Projekt wieloletni MRiRW Zad. 3.1. (kolekcja wirusów ziemniaka) Młochów, 23.06.2016 PVY (Potato
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny
Analizy wielkoskalowe w badaniach chromatyny Analizy wielkoskalowe wykorzystujące mikromacierze DNA Genotypowanie: zróżnicowane wewnątrz genów RNA Komórka eukariotyczna Ekspresja genów: Które geny? Poziom
DIAGNOSTYKA POLSKICH SZCZEPÓW WIRUSA MOZAIKI PEPINO (PEPINO MOSAIC VIRUS)
Progress in Plant Protection / Postępy w Ochronie Roślin, 47 (2) 2007 DIAGNOSTYKA POLSKICH SZCZEPÓW WIRUSA MOZAIKI PEPINO (PEPINO MOSAIC VIRUS) HENRYK POSPIESZNY, BEATA HASIÓW, NATASZA BORODYNKO Instytut
Możliwość stosowania uprawy zagonowej w nasiennictwie ziemniaka
NR 232 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2004 SŁAWOMIR WRÓBEL EWA TURSKA Zakład Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin, Radzików Możliwość stosowania
DETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH
DETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH Detekcja enterowirusów Detekcja sześciu typów ludzkich herpeswirusów (HHV) Detekcja pięciu bakterii Seeplex Detekcja patogenów powodujących
Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych
Systemy Inteligencji Obliczeniowej Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych Kornel Chromiński Instytut Informatyki Uniwersytet Śląski Plan prezentacji Dane mikromacierzowe Cel badań Prezentacja
Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKNIA RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji DNA z surowego materiału
Poszukiwanie źródeł odporności u pszenic na wirus odglebowej mozaiki zbóż (Soil-borne cereal mosaic virus, SBCMV)
Małgorzata Jeżewska Zakład Wirusologii i Bakteriologii, Instytut Ochrony Roślin Państwowy Instytut Badawczy, Poznań Poszukiwanie źródeł odporności u pszenic na wirus odglebowej mozaiki zbóż (Soil-borne
Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
SPIS TREŚCI OD AUTORÓW... 5
SPIS TREŚCI OD AUTORÓW... 5 BIAŁKA 1. Wprowadzenie... 7 2. Aminokwasy jednostki strukturalne białek... 7 2.1. Klasyfikacja aminokwasów... 9 2.1.1. Aminokwasy białkowe i niebiałkowe... 9 2.1.2. Zdolność
KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia eksperymentalna i środowiskowa
KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia eksperymentalna i środowiskowa Nazwa Nazwa w j. ang. Wybrane problemy biologii molekularnej kwasy nukleinowe Selected problems of molecular biology
Załącznik nr 1A do siwz Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli
Część I - Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli 1. Zestaw testowy do szybkiej identyfikacji Escherichia coli zestaw zawiera: - 50 pasków testowych, - 50 pojemników z tworzywa sztucznego,
Ampli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu
GENOMIKA FUNKCJONALNA Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu Adnotacja (ang. annotation) pierwszy etap po uzyskaniu kompletnej sekwencji nukleotydyowej genomu analiza bioinformatyczna
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Centrum Badań DNA - przykład start-up u w biotechnologii
Krajowy Lider Innowacji 2008,2009 Centrum Badań DNA - przykład start-up u w biotechnologii Poznański Park Naukowo-Technologiczny Siedziba: Poznań, Laboratorium: Poznań, ul. Mickiewicza 31 Kim jesteśmy?
GENOMIKA FUNKCJONALNA. Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu
GENOMIKA FUNKCJONALNA Jak działają geny i genomy? Poziom I: Analizy transkryptomu Adnotacja (ang. annotation) pierwszy etap po uzyskaniu kompletnej sekwencji nukleotydyowej genomu analiza bioinformatyczna
Autor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKOWANIA JEDNOSTK OWA VAT % RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji
Zestawy do izolacji DNA i RNA
Syngen kolumienki.pl Gotowe zestawy do izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych Zestawy do izolacji DNA i RNA Katalog produktów 2012-13 kolumienki.pl Syngen Biotech Sp. z o.o., 54-116 Wrocław, ul. Ostródzka
Techniki immunoenzymatycznego oznaczania poziomu hormonów (EIA)
Techniki immunoenzymatycznego oznaczania poziomu hormonów (EIA) Wstęp: Test ELISA (ang. Enzyme-Linked Immunosorbent Assay), czyli test immunoenzymatyczny (ang. Enzyme Immunoassay - EIA) jest obecnie szeroko
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Ponad 60% zakażeń w praktyce klinicznej jest wywołana przez wirusy. Rodzaj i jakość materiału diagnostycznego (transport!) oraz interpretacja wyników badań
Technologie szybkich analiz. Szybkie oznaczenie kinetyczne zawartości mykotoksyn
Technologie szybkich analiz Szybkie oznaczenie kinetyczne zawartości mykotoksyn Przegląd aokin AG Rapid Kinetic Assay innowacyjna metoda w analizach śladowych Oznaczanie mykotoksyn w systemie aokinmycontrol
Geny odporności na wirus Y ziemniaka (PVY)
Geny odporności na wirus Y ziemniaka (PVY) Dr inż. Katarzyna Szajko Mgr Anna Grupa Mgr Krystyna Michalak Projekt wieloletni MRiRW Zad. 3.1. (kolekcja wirusów ziemniaka) Młochów, 30.06.2017 PVY (Potato
AmpliTest BVDV (Real Time PCR)
AmpliTest BVDV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla wirusa BVD (Bovine Viral Diarrhea Virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII Opracowanie zestawu do wykrywania DNA Aspergillus flavus za pomocą specjalistycznego sprzętu medycznego. Jednym
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA TECHNIKI ANALIZY RNA
DNA 28SRNA 18/16S RNA 5SRNA mrna Ilościowa analiza mrna aktywność genów w zależności od wybranych czynników: o rodzaju tkanki o rodzaju czynnika zewnętrznego o rodzaju upośledzenia szlaku metabolicznego
Specjalność (studia II stopnia) Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych
Specjalność (studia II stopnia) Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych Studia magisterskie przedmioty specjalizacyjne Bioinformatyka w analizie genomu Diagnostyka molekularna Elementy biosyntezy
Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu
Techniki biologii molekularnej - opis przedmiotu Informacje ogólne Nazwa przedmiotu Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu 13.9-WB-BMD-TBM-W-S14_pNadGenI2Q8V Wydział Kierunek Wydział Nauk Biologicznych
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
PCR - ang. polymerase chain reaction
PCR - ang. polymerase chain reaction łańcuchowa (cykliczna) reakcja polimerazy Technika PCR umożliwia otrzymywanie dużej liczby kopii specyficznych fragmentów DNA (czyli amplifikację zwielokrotnienie fragmentu
Inżynieria Genetyczna ćw. 3
Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie. Pracownia genetyki
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie Zadbaliśmy o to, żeby wyposażenie w Klubie Młodego Wynalazcy było w pełni profesjonalne. Ważne jest, aby dzieci i młodzież, wykonując doświadczenia korzystały
Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*
Poznao, 6 lutego 2012 r. Zapytanie ofertowe nr 001 /2012 dotyczące zakupu odczynników chemicznych do izolacji DNA i reakcji PCR GENESIS Polska Sp. z o.o Ul. Za Cytadelą 19, 61-659 Poznao NIP 778 13 56
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Biologia medyczna. Nie dotyczy
Załącznik Nr 3 do Uchwały enatu PUM 14/2012 YLABU MODUŁU (PRZEDMIOTU) Kod modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów pecjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu I nformacje
Diagnostyka molekularna w OIT
Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
PLAN STUDIÓW PODYPLOMOWYCH: DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA W ROKU 2019/2020. Nazwa modułu ECTS Semestr I Semestr II. Liczba godzin z.
Załącznik nr 5 do uchwały nr 79/2018-2019 Senatu Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie z dnia 24 maja 2019 r. Symbol modułu PLAN STUDIÓW PODYPLOMOWYCH: DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA W ROKU 2019/2020 Nazwa modułu
Zadanie 2.4. Dr inż. Anna Litwiniec Dr inż. Barbara Skibowska Dr inż. Sandra Cichorz
Zadanie 2.4 Poszerzanie puli genetycznej buraka cukrowego przez doskonalenie procesu gynogenezy oraz podnoszenie odporności na wirus nekrotycznego żółknięcia nerwów i tolerancji na suszę Dr inż. Anna Litwiniec
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE WSTĘP 1. Mikromacierze ekspresyjne tworzenie macierzy przykłady zastosowań 2. Mikromacierze SNP tworzenie macierzy przykłady zastosowań MIKROMACIERZE EKSPRESYJNE
Kurs pt. " MOLEKULARNE METODY BADAŃ W MIKROBIOLOGII I WIRUSOLOGII "
Warszawa, 6 lutego 2011 r. Szanowna Pani! Szanowny Panie! Niniejszym uprzejmie informuję, że organizowany jest Kurs pt. " MOLEKULARNE METODY BADAŃ W MIKROBIOLOGII I WIRUSOLOGII " Kurs odbędzie się w dniach
Wykrywanie, identyfikacja i ilościowe oznaczanie GMO w materiale siewnym wyzwania analityczne i interpretacja wyników.
Wykrywanie, identyfikacja i ilościowe oznaczanie GMO w materiale siewnym wyzwania analityczne i interpretacja wyników. Sławomir Sowa, Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO, Zakład Biotechnologii
Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
Wspieranie kontroli rynku w zakresie genetycznie zmodyfikowanych organizmów
Wspieranie kontroli rynku w zakresie genetycznie zmodyfikowanych organizmów Program: Tworzenie naukowych podstaw postępu biologicznego i ochrona roślinnych zasobów genowych źródłem innowacji i wsparcia
Platforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification
1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym
lutego 2012
Dlaczego mikrodysekcja laserowa? Agnieszka Łoboda Zakład Biotechnologii Medycznej Wydział Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii UJ, Kraków Mikrodysekcja laserowa szybka metoda izolacji komórek z preparatów
ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ
ŻYW NO ŚĆ 3(20)Supl 1999 JOANNA CHMIELEWSKA, JOANNA KAWA-RYGIELSKA ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ S t r e s z c z e n i e W pracy podjęto próbę wykorzystania metody
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
Metody analiz GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Metody analiz GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB 09.10.2017 GMO Organizm Genetycznie Zmodyfikowany - organizm inny niż organizm człowieka, w którym materiał genetyczny został
Nowe odmiany ziemniaka w produkcji nasiennej
NR 237/238 BIULETYN INSTYTUTU HODOWLI I AKLIMATYZACJI ROŚLIN 2005 SŁAWOMIR WRÓBEL EWA TURSKA Zakład Nasiennictwa i Ochrony Ziemniaka w Boninie Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie Nowe
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji
Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Bioinformatyczna analiza danych. Wykład 1 Dr Wioleta Drobik-Czwarno Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt
Bioinformatyczna analiza danych Wykład 1 Dr Wioleta Drobik-Czwarno Katedra Genetyki i Ogólnej Hodowli Zwierząt Sprawy organizacyjne Prowadzący przedmiot: Dr Wioleta Drobik-Czwarno koordynator przedmiotu,
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych Jaka jest lokalizacja genu na chromosomie? Jakie jest jego sąsiedztwo? Hybrydyzacja - powstawanie stabilnych struktur dwuniciowych z cząsteczek jednoniciowych o komplementarnych
Techniki immunochemiczne. opierają się na specyficznych oddziaływaniach między antygenami a przeciwciałami
Techniki immunochemiczne opierają się na specyficznych oddziaływaniach między antygenami a przeciwciałami Oznaczanie immunochemiczne RIA - ( ang. Radio Immuno Assay) techniki radioimmunologiczne EIA -
WYBRANE RODZAJE REAKCJI PCR. RAPD PCR Nested PCR Multipleks PCR Allelo-specyficzny PCR Real Time PCR
RAPD PR Nested PR Allelo-specyficzny PR Real Time PR RAPD PR (Random Amplification of Polymorphic DNA) wykorzystywany gdy nie znamy sekwencji starterów; pozwala namnożyć losowe fragmenty o różnej długości;
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników Wojciech Śmietana Co to jest monitoring genetyczny? Monitoring genetyczny to regularnie
Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
inż. Danuta Sekrecka, mgr inż. Dorota Michałowska IHAR PIB, Pracownia Zasobów Genowych i Kultur in vitro w Boninie
Ziemniak Polski 2013 nr 2 15 ZASOBY BANKU GENÓW ZIEMNIAKA IN VITRO I ICH WYKORZYSTANIE W PRAKTYCE inż. Danuta Sekrecka, mgr inż. Dorota Michałowska IHAR PIB, Pracownia Zasobów Genowych i Kultur in vitro
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych
Hybrydyzacja kwasów nukleinowych Jaka jest lokalizacja tego genu na chromosomie? Jakie jest jego sąsiedztwo? Hybrydyzacja - powstawanie stabilnych struktur dwuniciowych z cząsteczek jednoniciowych o komplementarnych
Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
Załącznik nr 1 do Zapytania ofertowego... /miejscowość, data/
Załącznik nr 1 do Zapytania ofertowego... FORMULARZ OFERTOWY W odpowiedzi na zapytanie ofertowe z dnia.. złożone przez Biowet Puławy Sp. z o.o. Ja/my niżej podpisany/i (Imiona i nazwiska osób upoważnionych
47 Olimpiada Biologiczna
47 Olimpiada Biologiczna Pracownia biochemiczna zasady oceniania rozwia zan zadan Część A. Identyfikacja zawartości trzech probówek zawierających cukry (0 21 pkt) Zadanie A.1 (0 13 pkt) Tabela 1 (0 7 pkt)
Biotechnologia jest dyscypliną nauk technicznych, która wykorzystuje procesy biologiczne na skalę przemysłową. Inaczej są to wszelkie działania na
Biotechnologia jest dyscypliną nauk technicznych, która wykorzystuje procesy biologiczne na skalę przemysłową. Inaczej są to wszelkie działania na żywych organizmach prowadzące do uzyskania konkretnych
Kolekcja podstawowa w banku genów ziemniaka in vitro gromadzenie, utrzymywanie i wykorzystanie. Dorota Michałowska
Kolekcja podstawowa w banku genów ziemniaka in vitro gromadzenie, utrzymywanie i wykorzystanie Dorota Michałowska W ciągu ostatnich 100 lat na świecie wyginęło ok. 75% odmian roślin użytkowych. Ochrona
1. Biotechnologia i inżynieria genetyczna zagadnienia wstępne 13
Spis treści Przedmowa 11 1. Biotechnologia i inżynieria genetyczna zagadnienia wstępne 13 1.1. Wprowadzenie 13 1.2. Biotechnologia żywności znaczenie gospodarcze i społeczne 13 1.3. Produkty modyfikowane
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
OFERTA TEMATÓW PROJEKTÓW DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze INŻYNIERII CHEMICZNEJ I PROCESOWEJ
OFERTA TEMATÓW PROJEKTÓW DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze INŻYNIERII CHEMICZNEJ I PROCESOWEJ Badania kinetyki utleniania wybranych grup związków organicznych podczas procesów oczyszczania