Receptor estrogenowy P budowa, regulacja i funkcja* Estrogen receptor p structure, regulation and function
|
|
- Błażej Czajkowski
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Receptor estrogenowy P budowa, regulacja i funkcja* Estrogen receptor p structure, regulation and function 1 2 Marta Tkaczyk, Katarzyna Kalita Spis treści: I. Wstęp II. Rodzina receptorów jądrowych III. Receptory estrogenowe funkcjonowanie w komórce IV. Dwa receptory estrogenowe porównanie V. IzoformyERp VI. Oddziaływanie ER P z innymi białkami VII.Podsumowanie Contens: I. Introduction II. Nucłear receptor famiły III. Estrogen receptors function in the cełł IV. Two estrogen receptors comparison V. ER p isoforms VI. Interaction of ER P with other proteins VI. Concluding remarks Wykaz stosowanych skrótów: AF1 domena transaktywacyjna 1 (ang. activation function 1), AF2 domena transaktywacyjna 2 (ang. activation function 2), DBD domena wiążąca DNA (ang. DNA binding domain), ER receptor estrogenowy (ang. estrogen receptor), ERE sekwencja nukleotydów wiążąca receptor estrogenowy (ang. estrogen responsive element), ERK kinazy regulowane zewnątrzkomórkowo (ang. extracellular regulated kinases), INK kinazy c-jun aminowego końca białka (ang. c-jun N-terminal kinases), kinazy MAP kinazy aktywowane przez mitogen (ang. mitogen activated protein kinases), LBD domena wiążąca ligand (ang. Ugand binding domain), SFRE element odpowiadający na SF1 (ang. SF1 responsive element), SHR receptory hormonów steroidowych (ang. steroid hormon receptors). I. Wstęp Znanych jest obecnie około 150 białek należących do grupy receptorów jądrowych. Nazwano je tak ze względu na miejsce działania oraz lokalizację. Ich ligandy to małe, lipofilne cząsteczki przechodzące przez błonę cytoplazmatyczną na zasadzie dyfuzji. Należą do nich hormony steroidowe i tyroidowe, retinoidy, witamina D 3 i niektóre prostaglandyny [1-7]. Receptory dla tych substancji po utworzeniu kompleksu z ligandem są zdolne do oddziaływania z DNA i regulowania transkrypcji. Ostatnio zwrócono uwagę na zaskakującą lokalizację jednego z tych re- 'Mgr, 2 Mgr, Pracownia Neurobiologii Molekularnej, Zakład Neurobiologii Molekularnej i Komórkowej, Instytut Biologii Doświadczalnej, im. M. Nenckiego, Pasteura Warszawa, tel wew. 356, martat@nencki.gov.pl, kalitak@nencki.gov.pl ceptorów, receptora estrogenowego, [8] w błonie cytoplazmatycznej oraz jego zdolność do pobudzania kaskady wtórnych przekaźników [9-12], Wydaje się, więc, że receptory estrogenowe mogą występować w dwóch kompartmentach komórkowych i funkcjonować na dwa różne sposoby. Po pierwsze jako czynniki transkrypcyjne oraz dodatkowo jako receptory błonowe. Estrogeny i receptory estrogenowe odgrywają ważną rolę w prawidłowym rozwoju i funkcjonowaniu żeńskich tkanek rozrodczych m.in. kształtowaniu się gruczołu mlekowego podczas embriogenezy oraz dojrzewaniu pęcherzyków Graafa w trakcie cyklu miesięcznego. Odgrywają one także ważną rolę w utrzymaniu homeostazy wapniowej, co ma znaczenie m.in. dla prawidłowego funkcjonowania tkanki kostnej [13-15]. Choroby takie jak osteoporoza, nowotwory piersi i endometrium oraz choroby krążenia są często związane z zaburzeniami w funkcjonowaniu receptorów estrogenowych. II. Rodzina receptorów jądrowych Receptory jądrowe zbudowane są z 6 domen oznaczonych literami od A do F [5, 16] (Ryc. 1). Domeny A i B, zlokalizowane na końcu aminowym białka, mają funkcje aktywujące transkrypcję (ang. activation function 1 AF1) niezależne od przyłączenia liganda. Domena C jest zaangażowana w dimeryzację receptora oraz za przyłączanie kompleksu ligandreceptor do specyficznej sekwencji w DNA (ang. DNA binding domain DBD). Domena ta jest w dużym stopniu zachowywana w toku ewolucji. We wszystkich receptorach jądrowych ma budowę tzw.
2 palców cynkowych [17, 18]. Również właściwość wiązania DNA wykazuje w pewnym stopniu domena D nazywana też zawiasem (ang. hinge). Jej sekwencja jest bardziej zmienna niż sekwencja domeny C, region ten zawiera sygnał lokalizacji jądrowej NLS (ang. nuclear localization signal). Następna, w kierunku karboksylowego końca białka, jest zachowywana w toku ewolucji domena E. Domena ta zawiera strukturę hydrofobowej kieszeni przyłączającej specyficzny ligand (ang. ligand binding domain LBD). Domena E umożliwia także dimeryzację receptorów jądrowych, a jej fragment położony na końcu karboksylowym jest odpowiedzialny za aktywację transkrypcji, zależną od przyłączenia liganda (ang. activation function 2 AF2). Co ciekawe, receptory sztucznie pozbawione LBD są konstytutywnymi transaktywatorami tzn. aktywują transkrypcję mimo nieobecności liganda. Niektóre receptory, w tym i receptory estrogenowe (ang. estrogen receptor ER), zawierają również domenę F, której rola nie jest do końca wyjaśniona. III. Receptory estrogenowe funkcjonowanie w komórce Nie związane z ligandem receptory estrogenowe znajdują się w jądrze komórkowym, gdzie połączone są z dużym kompleksem białek opiekuńczych z rodziny Hsp. W ten sposób utrzymywane są w stanie nieaktywnym, ale w zdolności do przyłączenia liganda [19]. Podobnie jak inne receptory jądrowe, receptory estrogenowe są czynnikami transkrypcyjnymi, które po przyłączeniu jednego z estrogenów zdolne są do regulowania transkrypcji innych genów (Ryc. 2). Przyłączenie liganda jest także warunkiem dimeryzacji, która jest niezbędna do utworzenia funkcjonalnego czynnika transkrypcyjnego. Dimery przyłączają się do odcinków DNA mających budowę odwróconych powtórzeń czyli sekwencji palindromowych. Receptory estrogenowe przyłączają się do fragmentu DNA określanego jako element odpowiadający na estrogen (ang. estrogen responsive ERE) o następującej sekwencji: 5' GGTCAnnnTGACC 3', 3' CCAGTnnnACTGG 5' element gdzie n oznacza dowolny nukleotyd. Kolejność pięciu nukleotydów końca 5' jednej nici jest taka sama, jak kolejność pięciu nukleotydów końca 5' drugiej nici, ale w odwróconym porządku. Co za tym idzie analogiczną prawidłowość wykazują odcinki z końców 3'. Jak już zasygnalizowano receptor estrogenowy może pełnić jeszcze drugą funkcję, działać jako receptor błonowy. Przypuszczenie to potwierdzają doniesienia o aktywacji wtórnych przekaźników po podaniu estrogenów w przeciągu kilku minut. Przekaźnikami tymi są: camp [20], Ca 2+ [21], diacyloglicerol (DAG) oraz inozytolotrifosforan (IP3) [22,23]. Najnowsze dane wskazują nie tylko na występowanie receptorów estrogenowych w błonie komórkowej, ale także na ich aktywność w tym kompartmencie komórkowym. W badaniach tych jako model doświadczalny wybrano linię komórkową, w której nie wykryto obecności żadnego z ER. Aby uzyskać ich ekspresję wprowadzono do komórek cdna kodujące te białka. Reakcja z przeciwciałem i przyłączanie wyznakowanego radioaktywnie estradiolu wykazały ich obecność w błonie komórkowej. Co ważniejsze po raz pierwszy stwierdzono, że receptory estrogenowe zlokalizowane w błonie komórkowej są aktywne. Po przyłączeniu estradiolu wydają się pobudzać białka G, zewnątrzkomórkowo regulowane kinazy ERK (ang. e:ctracellular regulated kinases ERK) i kinazy JNK (ang. c-jun N-terminal kinases JNK) [8]. Ta sama grupa badaczy zaobserwowała, że endogenny receptor estrogenowy może również być zlokalizowany w błonie komórkowej komórek w hodowli tkankowej [24]. Niestety dane o pobudzaniu wtórnych przekaźników przez receptory estrogenowe zlokalizowane w błonie komórkowej pochodzą z jednego laboratorium i są na razie niepotwierdzone przez innych badaczy, aczkolwiek wcześniejsze badania wskazywały obecność ER również w błonie komórkowej [25-28]. IV. Dwa receptory estrogenowe, porównanie Przez wiele lat uważano, że istnieje tylko jeden receptor, przez który estrogeny mogą oddziaływać na komórki [1, 5]. W 1996 r., w kilku laboratoriach niezależnie, odkryto u szczura, myszy i człowieka drugi, specyficzny dla estrogenów, receptor [29-31]. Wcześniej poznane i scharakteryzowane białko określono jako receptor estrogenowy a (ERa) zaś to nowe jako receptor estrogenowy beta (ERP). Recep- *Praca na temat receptora estrogenowego alfa (ERa) zastała opublikowana w Postępach Biochemii, Kulig E Receptor estrogenowy: budowa i funkcje w normalnej i neoplastycznej tkance" 1994 (40):
3 tory a i P nie są wzajemnymi izo formami, lecz dwoma różnymi białkami, kodowanymi przez dwa odrębne geny zlokalizowane na różnych chromosomach. Gen kodujący receptor estrogenowy beta (ERp) znajduje się w genomie myszy na 12 chromosomie, natomiast u człowieka na 14. Składa się z 8 eksonów rozmieszczonych na obszarze około 40 kb (Ryc. 6a). Oba receptory, pod względem budowy i oddziaływań na poziomie molekularnym, są podobne do siebie, ale występujące różnice wskazują na odmienne, specyficzne dla każdego z nich funkcje biologiczne. Budowa obu receptorów wykazuje cechy wspólne ze wszystkimi receptorami jądrowymi (por. Ryc. 1 i Ryc. 3). Mysi ERa składa się z 599 amino- Jedną z właściwości biochemicznych, wspólnych dla obu receptorów, jest przyłączanie się do charakterystycznej sekwencji DNA, czyli wspomnianej już ERE. Omówiona już sekwencja: 5' GGTCAnnnT- GACC 3' została nazwana sekwencjąkonsensusową. Występuje ona np. w promotorze genu vitełłogeniny. Receptory estrogenowe łączą się również z szeregiem sekwencji ERE różniących się budową od sekwencji konsensusowej występujących w promotorach innych genów [31]. Jednak powinowactwo ERa do tych sekwencji jest inne niż powinowactwo ERp [31, 33]. Odkryto również, że do sekwencji złożonej z jednej połowy palindromu ERE poprzedzonej trzynukleotydową sekwencją TC A [34] ERa przyłącza A/B-AF 1 C-DBD D-H E-LBD-AF2 F Ryc. 1. Schemat budowy receptorów jądrowych. A/B-AF1 domeny A i B funkcja aktywacji transkrypcji 1, C-DBD domena C przyłączanie do DNA, D-H domena D zawias, E-LBD-AF2 domena E przyłączanie liganda, funkcja aktywacji transkrypcji 2, F domena F kwasów, natomiast ERp jest nieco mniejszy i składa się z 485 aminokwasów. Największą homologię receptory te wykazują w obrębie domeny C-DBD 97% i E-LBD 60%. Najmniej zaś zachowany w toku ewolucji jest koniec aminowy tych białek, w obsię aktywując transkrypcję, natomiast nie obserwuje się przyłączenia ERp [32]. Ważną właściwością biochemiczną wspólną dla obu receptorów estrogenowych jest przyłączenie liganda. Naturalnie występującymi Ugandami dla obu hlona komórkowa cytoplazma AAAAAAAAAAAA cytoplazma Ryc. 2. Schemat funkcjonowania receptorów estrogenowych w komórce. ER receptor estrogenowy, 90 białko Hsp90, TIF czynniki inicjujące transkrypcję (ang. transcription initiation factors), TBP białko łączące się z sekwencją TATA (ang. TATA binding protein), TAFs czynniki aktywujące transkrypcję (ang. transcription activatingfactors), Pol II polimeraza II. rębie którego znajduje się domena transaktywująca AF1. Te cechy pokazują, że białka te mimo dużego podobieństwa mogą pełnić różne funkcje. z nich jest 17pestradiol, estron i estriol (Ryc. 4), jednak powinowactwo tych ligandów do każdego z ER wydaje się być różne. Wykazano na przykład mniej
4 sze powinowactwo estradiolu do ERB niż ERa [31]. Poznane, endogennie występujące ligandy ER są w większości tkanek agonistami, czyli Ugandami aktywującymi receptor. Znanych jest też szereg syntetycznych związków będących Ugandami ER. Niektóre z nich są agonistami, inne antagonistami czyli limi. Hipotezę tę potwierdza istnienie trzech grap peptydów (1) łączących się z oboma receptorami związanymi z estradiolem, (2) specyficznych dla ERa i (3) specyficznych dla ER 3. Jeżeli w doświadczeniu zmienimy ligand i zamiast estradiolu ER będą związane z OUT to ERa i ERj3 oddziaływują z inny- 17,5% 97% 30% 59,1% 17,9% A/B-AF1 C-DBD D-H E-LBD Ser 122 Tyr541 AF2 A/B-AF1 C-DBD D-H E-LBD Ser60 Tyr443 AF2 Ryc. 3. Porównanie budowy receptora estrogenowego a i receptora estrogenowego p. A/B-AF1 domeny A i B, funkcja aktywująca transkrypcją l, C-DBD domena C, funkcja przyłączania do DNA D-H domena D, zawias, E-LBD domena E, funkcja przyłączania liganda, F domena F, AF2 funkcja aktywująca transkrypcję 2. Dane w procentach wskazują na stopień homologii poszczególnych domen. Zaznaczono również pozycje aminokwasów ważnych w modulowaniu funkcji receptora. gandami hamującymi te receptory. W przypadku receptorów estrogenowych ten sam ligand może pełnić rolę raz agonisty, raz antagonisty w zależności od tego, czy łączy się z ERa czy z ERp. Przykładem może tu być estradiol. Występując w kompleksie z ERP spełnia rolę agonisty, ponieważ aktywuje transkrypcję genu vitellogeniny, w którego promotorze znajduje się sekwencja ERE. Jednocześnie będąc w tym samym kompleksie z ERp hamuje transkrypcję genu TNF-a, w którego promotorze znajduje się spemi peptydami [37]. Zjawisko to wynika zapewne z budowy struktur pierwszorzędowych tych dwóch receptorów, wykazujących daleko idące homologie, ale jednak odmiennych i sugeruje istnienie wielu dalszych różnic w regulacji transkrypcji przez receptory estrogenowe. Przyłączenie liganda powoduje aktywację ER. Istnieją jednak także inne mechanizmy modulujące ich funkcje. Jednym z nich jest fosforylacja. Analiza delecyjna i mutacyjna ERa wykazała dwa miejsca fosestron estradiol estriol Ryc. 4. Schemat struktury naturalnych estrogenów. cyficzna sekwencja DNA odpowiedzialna za tę inhibicję [35]. Podobnie 4-hydroksytamoksifen (OHT) wykazuje właściwości agonisty ERa, a nie wykazuje takich właściwości dla ERp w tych samych warunkach [32, 36]. Uważa się, że różne efekty biologiczne działania ERa i ERp zależą bezpośrednio od różnych dla każdego z receptorów zmian konformacyjnych powodowanych przez różne ligandy, a co za tym idzie, oddziaływań z różnymi koaktywatorami i korepresora- forylacji wpływające na aktywację transkrypcji, Jednym z nich jest Ser 118 w ludzkim ERa, która wydaje się być ważna dla pełnej aktywności AF1 [38] będąc substratem dla kinaz MAP (ang. mitogen actiwated protein ki nas es) [39,40]. Drugim jest Tyr537 w ludzkim ERa położona w bezpośrednim sąsiedztwie AF2, będąca substratem dla rodziny src kinaz tyrozynowych [41]. Zamiana tej reszty aminokwasowei, na zawierającą mniejsze łańcuchy boczne np. alaninę lub mające mniejszą hydrofobowość np.
5 nian lub glutaminian, powoduje powstanie białka aktywującego transkrypcję niezależnie od przyłączenia liganda [42,43]. Także w ERp występują reszty aminokwasowe odpowiadające wspomnianym miejscom fosforylacji. Jest to Serl05 i Tyr488 w mysim białku [31,44, 45]. Receptory estrogenowe, podobnie do innych receptorów steroidowych, wykazują zdolność do heterodimeryzacji. Po przyłączeniu liganda mogą one tworzyć zarówno homodimery a-a i p-p,jak i heterodimery a-p in vitro i in vivo [46-48] (Ryc. 5). Wydaje się, że odrębne funkcje domeny AF1 są zachowywane po utworzeniu heterodimeru i obie domeny A/B niezależnie przejawiają swoje specyficzne aktywności. Jeżeli chodzi o AF2 obie funkcjonalne domeny są niezbędne do aktywacji transkrypcji in vivo, ale heterodimer spełnia rolę aktywujacą, gdy tylko izolować kilka różnych izoform ERp zarówno u człowieka [50] jak i u szczura [51, 52] (Ryc. 6c). Różnice w funkcjonowaniu poszczególnych izoform nie są jeszcze do końca poznane. Na przykład, szczurze białko ERp2, posiadające w porównaniu z ERpi, dodatkowo 18 aminokwasów w obrębie domeny wiążącej ligand (ang. Ugand binding domain LBD ) tworzy homo- i heterodimery. Natomiast jego zdolność przyłączania estrogenu jest zmniejszona w stosunku do formy ERp 1. ERp2 działa najprawdopodobniej jako negatywny dominujący mutant, hamując aktywność transkrypcyjną po utworzeniu dimerów z aktywującymi izoformami receptora estrogenowego zarówno a jak i p, czyli jest negatywnym regulatorem funkcji estrogenu. Izoformy ERp283 oraz ERp 183, pozbawione fragmentu odpowiedzialnego za łączenie się z DNA (ang. DNA bin- Ryc. 5. Schemat dimeryzacji ERa i ERp. Strzałkami oznaczono połowy palindromu ERE. jeden z partnerów przyłączył ligand [49]. Odrębne ścieżki regulacji i właściwości biochemiczne obu receptorów mogą więc być połączone, gdy aktywują one transkrypcję jako heterodimer. V. Izoformy ERp W wyniku obróbki posttranskrypcyjnej mrna genów, kodujących zarówno białka ERa i ERp, może powstać wiele różnych izoform. Proces tworzenia izoform, w którym z pierwotnego transkryptu zostają usunięte introny oraz niektóre eksony nazywamy alternatywnym składaniem (ang. alternative splicing). Informacja genetyczna zawarta w genie, w tym wypadku receptora estrogenowego alfa i beta, może być przedstawiona" jako kilka różnych cząsteczek mrna, na podstawie których, po translacji, powstaną różne białka. Receptor estrogenowy beta, jak już wspomniano wcześniej, ma bardzo dobrze scharakteryzowane domeny (Ryc. 6b), silnie zachowane w toku ewolucji, które mają duże znaczenie w jego funkcjonowaniu. Dlatego też można oczekiwać, iż białka pozbawione pewnych obszarów bedą pełnić odmienne funkcje. Do tej pory udało się wy- ding domain DBD) struktury palca cynkowego posiadają zdolność do dimeryzacji z ERa i ERp, same zaś nie łączą się z sekwencją ERE. Wydaje się, że po związaniu z innym receptorem estrogenowym hamują jego zdolność do transaktywacji. Natomiast izoforma ERp 184 posiada delecję w obrębie regionu H, czyli pozbawiona jest sygnału lokalizacji jądrowej (ang. nuclear localization signal NLS). Białko to można zlokalizować w jądrze i cytoplazmie w przeciwieństwie do ERbl, które jest obecne tylko w jądrze. Co ciekawe, izoformy ERp zidentyfikowane u szczura różnią się od tych występujących u człowieka. Do tej pory scharakteryzowano trzy, które posiadają delecję w obrębie domeny LBD, natomiast pozostałe różnią się między sobą głównie w obrębie domeny F (na końcu karboksylowym białka). Najczęściej nie posiadają one ostatniego eksonu. Utworzone sztucznie mutanty ERp pozbawione z karboksylowego końca białka 50 aminokwasów są zdolne do dimeryzacji z receptorem a i P, natomiast blokują zdolność do transaktywacji tych kompleksów [53]. Mechanizm tego procesu nie jest poznany, reakcja taka może na przykład zachodzić poprzez kompety
6 cję o ERE, tworzenie nieaktywnych heterodimerów z dzikim ER lub wyciszaniu transkrypcji (ang. silencing). Istnienie tak wielu izoform receptora estrogenowego beta daje potencjalną możliwość różnorodności w sile przyłączania liganda, oddziaływania z sekwencją ERE jak również aktywności transkrypcyjnej. Możliwe, że specyficzne typy komórek znaj- da. Jest to wyjątkowa sytuacja wśród receptorów jądrowych aktywacja transkrypcji przez czynniki niesteroidowe wymagająca przyłączenia koaktywatora [54]. Inne oddziaływanie zaobserwowane do tej pory w przypadku ERp zachodzi prawdopodobnie z czynnikiem transkrypcyjnym AP1. Podobnie, jak w przypadku SRC1, ERa i ERp oddziałują z tym białkiem a SM n 1-7/H cl S M T T S M h h7a- 11 SM 12 SM 13 SM L4 y/ A/B D AF-1 DBD H LBD AF-2 Cl 1 O II ERp1 rsi ci u I i_ 1 I u 2 l. 3 4 ERp183 IM Cl [ O II ~ l-l t- 2 t_ 3 [ 1-4 \ ERP184 N [ c i C II H L 1 : I_ 2 [ i 3 [ ~[ ERp2 NI [ C I H ] L 1 l_2 I 3 L 4 ERp2S3 Ryc. 6. Schemat budowy genu ERp i jego izoform u szczura, a) Schemat budowy genu kodującego ER(3 u szczura, b) Schemat budowy białka ERp. c) Sklonowane izoformy ERp u szczura. dujące się w określonym stanie fizjologicznym zwiększają poziom ekspresji poszczególnych izoform. Występowanie tak dużej różnorodności białek ERp być może być istotnym czynnikiem regulującym komórkową odpowiedz na estrogen. VI. Oddziaływanie ERp z innymi białkami Jak do tej pory znane są dwa białka oddziaływujące z ERp. Jednym z nich jest koaktywator receptorów steroidowych l (ang. steroid receptor coactivator l SRCl), który oddziałuje z szeregiem receptorów steroidowych. Do zaistnienia oddziaływania z ERp konieczna i wystarczająca jest domena AFl fosforylowana przez kinazę MAP. Oddziaływanie to jest niezależne od przyłączenia liganw odmienny sposób. Jeżeli bowiem ligandem jest naturalnie występujący I7p estradiol, to ERa powoduje wzrost poziomu transkrypcji genu, w którego promotorze występuje miejsce przyłączenia AP-l, natomiast ERp powoduje obniżenie poziomu transkrypcji tego genu. Co więcej trzej sztucznie otrzymani antagoniści ERa tj. tamoxifen, raloxifen i ICI powodują aktywację transkrypcji w przypadku ERp oddziałującym z białkiem AP-l [55]. VII. Podsumowanie Różnice w funkcjonowaniu dwóch typów receptorów estrogenowych na poziomie molekularnym mają także swoje konsekwencje na poziomie organizmu. Świadczą o tym fenotypy myszy sztucznie pozba
7 wionych genów ERa i ER(3. Pozbawienie myszy ERa powoduje całkowitą bezpłodność. Samice nie wytwarzają ciałka żółtego i cierpią na torbiele jajników. Samce wykazują atrofię jąder, zmniejszoną spermatogenezę i mniejszą gęstość plemników w spermie [14]. Poza tym obserwuje się u tych zwierząt aberracje w zachowaniach reprodukcyjnych i rozwoju gruczołów mlecznych [56]. Natomiast pozbawienie myszy ERP nie powoduje całkowitej bezpłodności tych zwierząt [57]. Samice wykazują zmniejszoną płodność spowodowaną zablokowaniem ostatniego etapu dojrzewania pęcherzyka Graafa przed owulacją, wobec tego wytwarzają niewiele, albo wcale nie występuje u nich ciałko żółte. Samce są całkowicie płodne. Sugeruje sięjednak udział ER(3 w przeroście prostaty [29,58]. Niezależnie od mechanizmów kompensujących brak danego białka w trakcie rozwoju zwierzęcia wyniki przedstawionych wyżej badań wskazują, że fenotyp myszy bez ERa jest diametralnie różny od fenotypu myszy bez ERp. Świadczy to o odmiennym wpływie obu receptorów na funkcjonowanie organizmu. Wyniki tych badań mogą być jednak kwestionowane, ponieważ u osobników można wykryć niektóre izoformy usuwanego receptora estrogenowego. Na przykład w macicy jednego ze szczepów mysich pozbawionych ERa można wykryć to białko przy pomocy przeciwciała. Nie wiadomo jednak, czy użyte przeciwciało jest całkowicie specyficzne tylko dla ERa [14]. Natomiast w jajnikach jednego ze szczepów myszy pozbawionych ERP wykryto przy pomocy techniki RT-PCR istnienie fragmentów końca 5' mrna dla tego białka [59]. Dodatkowym potwierdzeniem hipotezy o różnej funkcji, którą pełnią oba receptory jest ich różna lokalizacja tkankowa. Wydaje się, że ERa ulega ekspresji w większej ilości tkanek niż ERp. Występują tkanki gdzie nie wykryto obecności mrna dla ERp, w których jednak występuje mrna dla ERa np. gruczoł mleczny, nerka i aorta [60]. W różnych tkankach występuje także odmienny poziom mrna dla każdego z tych dwóch białek. Na przykład dominującą formą receptora estrogenowego w jajniku i w płucach pod względem ilości mrna jest ERp, w prostacie i w najądrzu występują równe ilości obu transkryptów, a w podwzgórzu u obu płci obserwuje się dwukrotnie większą ekspresj ę ERa niż ERp [60]. Wszystkie te dane zarówno na poziomie molekularnym, jak i całego organizmu świadczą o dwóch drogach oddziaływania estrogenów na funkcjonowanie komórek. Drogi te są z jednej strony odmienne, a z drugiej strony ściśle zazębiają się ze sobą. Piśmiennictwo Artykuł otrzymano 3 lutego 2000 r. Zaakceptowano do druku 7 grudnia 2000 r. 1. Beato M, Truss M, Chavez S (1996) Ann N Y Acad Sci USA1M Forman B M, Ton tono z P, Chen J, Brun R P, Spiegelman B M, Evans R M (1995) Celi 83(5): Gronemeyer H (1991) Amm Rev Genet 25: Kliewer S A, Lenhard J M, Willson T M, Patel I, Morris D C, Lehmann J M (1995) Celi 83(5): Mangelsdorf D J, Thummel C, Beato M, Herrlich P, Schulz G, U me son o K, Blumberg B, Kastner P, Mark M, Chambon P, Evans R M (1995) Celi 83(6): MangelsdorfD J, Evans R M (1995) Celi 83(6): Wahl i W, Martinez E (1991) Fciseb J 5(9): Razandi M, Pedram A, Greene G L, Lcvin E R (1999) Mol Endocńnol 13(2): GametchuB (1987) Science 236(4800): Blackmore P F, Lattanzio F A (1991) Biochem Biophys Res Commun 181(1): Nemere I, Dormanen M C, Hammond M W, O k a - mura W H, Norman A W (1994) J Biol Chem 269(38): Wehling M (1995) Steroids 60(1): Korach K S (1994) Science 266(5190): Lubahn D B, Moyer J S, Golding T S, Couse J F, Korach K S, Smithies O (1993) Proc Natl A ca d Sci U SA 90(23): S mithep,boydj, Frank GR.TakahashiH, Cohen R M, Specker B, Williams T C, Lubahn D B, Korach K S (1994) NEngl JMed331(16): Beato M, Herrlich P, Schutz G (1995)Celi83(6): Berg J M (1989) Celi 57(7): Klug A, Schwabe J W (1995) Faseb J 9(8): Pratt W B (1993) JBiol Chem 268(29): Aronica S M, Kraus W L, Katzenellenbogen B S (1994) Proc Natl Acad Sci USA 91(18): Tesarik J, Mendoza C (1995) J Clin Endocńnol Metab 80(4): LieberherrM, Grosse B, Kachkache M, Balsan S (1993) J Bone Miner Res 8(11): Le Mellay V, Grosse B, Lieberherr M (1997) JBiol Chem 272(18): Morey A K, Pedram A, Razandi M, Prins B A, Hu R M, Biesiada E, Levin E R (1997) Endocrinology 138(8): Pietras R J, Szego C M (1977) Atore 265(5589): Pietras RJ,Sz ego CM (1980) Biochem 7191(3): Berthois Y, Pourreau-Schneider N, Gandilhon P, Mittre H, Tubiana N, Martin P M (1986) JSteroid Biochem 25(6): Pappas T C, Gametchu B, Watson C S (1995)FasebJ 9(5): Ku i per G G J M, Enmark E, Pelto-Huikko M, Nilsson S, Gusta fs son J-C (1996) Proc Natl Acad Sci U S A 93(12): Mosselman S, Polman J, Dijkema R (1996)FEBSLelt 392(1): Tremblay G B, Tremblay A, Copeland N G, Gilbert D J, Jenkins N A, Labrie F, GiguPre V (1997) Mol Endocńnol 11(3): Vanacker J M, Pettersson K, Gusta fs son J-C, Laudet V (1999) Embo J 18(15): Hyder S M, Chiappetta C, Stancel G M (1999) Biochem Pharmacol 57(6): Wilson T E, Fahrner T J, Milbrandt J (1993) Mol Celi Biol 13(9):
8 35. Jinping A, Ralff C J, Ribeiro, Webb P, Gustafss on J-C, Kushncr P J, Baxter J D, Leitman D C (1999) PNAS 96(26): Watanabe T, Inouc S, Ogawa S, Ishii Y, Hiroi H, Ikeda K, Orimo A, Muramatsu M (1997) Błochem Biophys Res Commun 236(1): Paige L A, Christensen D J, Grqn H, Norris J D, Gottlin E B, Pad i 11 a K M, C hang C-Y, Bali as L M, Hamilton P T, McDonnell D P, Fowlkes D M (1999; Proc Natl Acad Sci USA 96(7): Ali S, Metzger D,BorncrtJ-M,ChambonP (1993) EmboJ 12(3): Kato S, Endoh H, Masuhiro Y, Kitamoto T, Uchiyama S, Sasaki H, Masushige S, Gotoh Y, Nishida E, Kawashima H, Metzger D, Chambon P (1995) Science 270(5241): Bunone G, Briand P-A, Miksicek R J, Picard D (1996) Embo J 15(9): Arnold S F, Vorojeikina D P, Notides A C (1995)/ Biol Chem 270(50): White R, Sjóberg M, Kalkhoven E, Parker M G (1997) Embo J 16(6): Weis K E, Ekena K, Thomas J A, Lazennec G, Katzenellenbogen B S (1996) Mol Endocrinol 10(11): Tremblay G B, Tremblay A, Labrie F, Giguere V (1998) CancerRes 58(5): Giguere V, Tremblay A, Tremblay G B (1998)Steroids 63(5-6): Cowley S M, Hoare S, Mosselman S, Parker M G (1991) JBiol Chem 272(32): Pettersson K, Grandien K, Kuiper G G, Gustafss o n J - C (1997) Mol Endocrinol 11(10): Pace P, Taylor J, Suntharalingam S, Coombes R C, Ali S (1997) JBiol Chem 272(41): Tremblay G B, Tremblay A, Labrie F, GiguPre V (1999) Mol Celi Biol 19(3): En mar k E, Pelto-Huikko M, Grandien K, Lagercrantz S, Lagercrantz J, Fried G, Nordenskjold M, Gustafsson J-C (1997) J Clin Endocrinol Metab 82( 12): Maruyama K, Endoh H, S asaki-1 waoka H, Kanou H, Shimaya E, Hashimoto S, Kato S, Kawashima H (1998) Biochem Biophys Res Commun 246(1): Petersen D N, Tkalcevic G T, Koza-Taylor P H, Turi T G, Brown T A (1998)Endocrinology 139(3): Ogawa S, Inoue S, Orimo A, Hosoi T, Ouchi Y, Muramatsu M (1998) FEBSLett 423(2): Tremblay A, Tremblay G B, Labrie F, GiguPre V (1999) Mol Celi 3(4): Moore J T, McKee D D, Slentz-KeslerK, Moore L B, Jones S A, Horne E L, Su J L, Kliewer S A, Lehmann J M, Willson T M (1998) Biochem Biophys Res Commun 247(1): PaechK,WebbP,KuiperGGJM,NilssonS,Gustafsson J-C, Kushner P J, Seanlan T S (1997)Science 277(5331): Ogawa S, Taylor J A, Lubahn D B, Korach K S, P f a f f D W (1996) Neuroendocrinology 64(6): Bocchinfuso W P, Korach K S (1997)EndocrineRelated Cancer (4): Krege J H, Hodgin J B, Couse J F, Enmark E, Warner M, Mahler J F, Sar M, Korach K S, Gusta- fsson J-C, Smithies O (1998) Proc Natl Acad Sci U S A 95(26): Couse J F, Lindzey J, Grandien K, Gustafsson J-C, Korach K S (1997) Endocrinology 138(11):
TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów
Eksparesja genów TRANSKRYPCJA - I etap ekspresji genów Przepisywanie informacji genetycznej z makrocząsteczki DNA na mniejsze i bardziej funkcjonalne cząsteczki pre-mrna Polimeraza RNA ETAP I Inicjacja
TATA box. Enhancery. CGCG ekson intron ekson intron ekson CZĘŚĆ KODUJĄCA GENU TERMINATOR. Elementy regulatorowe
Promotory genu Promotor bliski leży w odległości do 40 pz od miejsca startu transkrypcji, zawiera kasetę TATA. Kaseta TATA to silnie konserwowana sekwencja TATAAAA, występująca w większości promotorów
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
października 2013: Elementarz biologii molekularnej. Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II
10 października 2013: Elementarz biologii molekularnej www.bioalgorithms.info Wykład nr 2 BIOINFORMATYKA rok II Komórka: strukturalna i funkcjonalne jednostka organizmu żywego Jądro komórkowe: chroniona
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne
białka wiążące specyficzne sekwencje DNA czynniki transkrypcyjne http://www.umass.edu/molvis/bme3d/materials/jtat_080510/exploringdna/ch_flex/chapter.htm czynniki transkrypcyjne (aktywatory/represory)
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 5 Droga od genu do
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI
ROLA WAPNIA W FIZJOLOGII KOMÓRKI Michał M. Dyzma PLAN REFERATU Historia badań nad wapniem Domeny białek wiążące wapń Homeostaza wapniowa w komórce Komórkowe rezerwuary wapnia Białka buforujące Pompy wapniowe
Wykład 14 Biosynteza białek
BIOCHEMIA Kierunek: Technologia Żywności i Żywienie Człowieka semestr III Wykład 14 Biosynteza białek WYDZIAŁ NAUK O ŻYWNOŚCI I RYBACTWA CENTRUM BIOIMMOBILIZACJI I INNOWACYJNYCH MATERIAŁÓW OPAKOWANIOWYCH
The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna
Streszczenie rozprawy doktorskiej pt. The Role of Maf1 Protein in trna Processing and Stabilization / Rola białka Maf1 w dojrzewaniu i kontroli stabilności trna mgr Tomasz Turowski, promotor prof. dr hab.
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Metody bioinformatyki. Ekspresja genów. prof. dr hab. Jan Mulawka
Metody bioinformatyki Ekspresja genów prof. dr hab. Jan Mulawka Genetyczny skład prawie wszystkich komórek somatycznych organizmów wielokomórkowych jest identyczny. Fenotyp (swoistość tkankowa lub komórkowa)
WYKŁAD: Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Klasyczny przepływ informacji. Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach
WYKŁAD: Ekspresja genów realizacja informacji zawartej w genach Prof. hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej Klasyczny przepływ informacji ( Dogmat) Białka Retrowirusy Białka Klasyczny
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE
THE UNFOLDED PROTEIN RESPONSE Anna Czarnecka Źródło: Intercellular signaling from the endoplasmatic reticulum to the nucleus: the unfolded protein response in yeast and mammals Ch. Patil & P. Walter The
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
Dr hab. Janusz Matuszyk. Ocena rozprawy doktorskiej. Pani mgr Hanny Baurskiej
Dr hab. Janusz Matuszyk INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ im. Ludwika Hirszfelda P OLSKIEJ A K A D E M I I N AUK Centrum Doskonałości: IMMUNE ul. Rudolfa Weigla 12, 53-114 Wrocław tel. (+48-71)
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ 1. Gen to odcinek DNA odpowiedzialny
Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej
Seminarium 1 część 1 Konspekt do zajęć z przedmiotu Genetyka dla kierunku Położnictwo dr Anna Skorczyk-Werner Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Genom człowieka Genomem nazywamy całkowitą ilość DNA jaka
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA
SCENARIUSZ LEKCJI BIOLOGII Z WYKORZYSTANIEM FILMU Transkrypcja RNA SPIS TREŚCI: I. Wprowadzenie. II. Części lekcji. 1. Część wstępna. 2. Część realizacji. 3. Część podsumowująca. III. Karty pracy. 1. Karta
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych
Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich lub prawie wszystkich białek komórkowych Zalety w porównaniu z analizą trankryptomu: analiza transkryptomu komórki identyfikacja mrna nie musi jeszcze oznaczać
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN
MECHANIZMY WZROSTU i ROZWOJU ROŚLIN Jaka jest rola kinaz MA (generalnie)? Do czego służy roślinom (lub generalnie) fosfolipaza D? Czy u roślin występują hormony peptydowe? Wymień znane Ci rodzaje receptorów
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny
Zasady oceniania rozwiązań zadań 48 Olimpiada Biologiczna Etap centralny Zadanie 1 1 pkt. za prawidłowe podanie typów dla obydwu zwierząt oznaczonych literami A oraz B. A. ramienionogi, B. mięczaki A.
Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska
Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych
HORMONY STERYDOWE I PODOBNIE DZIAŁAJĄCE
HORMONY STERYDOWE I PODOBNIE DZIAŁAJĄCE Są to związki należące do grupy steroidów, które charakteryzują się wykazywaniem istotnych aktywności biologicznych typu hormonalnego. Docierając do komórki docelowej,
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs
Disruption of c-mos causes parthenogenetic development of unfertilized mouse eggs W. H. Colledge, M. B. L. Carlton, G. B. Udy & M. J. Evans przygotowała Katarzyna Czajkowska 1 Dysrupcja (rozbicie) genu
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Disruption of c-mos causes parthenogenetic develepment of unfertilized mouse eggs. W.H Colledge, M.B.L. Carlton, G.B. Udy & M.J.
Disruption of c-mos causes parthenogenetic develepment of unfertilized mouse eggs. W.H Colledge, M.B.L. Carlton, G.B. Udy & M.J.Evans Partenogeneza-dzieworództwo, to sposób rozmnażania polegający na rozwoju
Transport przez błony
Transport przez błony Transport bierny Nie wymaga nakładu energii Transport aktywny Wymaga nakładu energii Dyfuzja prosta Dyfuzja ułatwiona Przenośniki Kanały jonowe Transport przez pory w błonie jądrowej
Informacje dotyczące pracy kontrolnej
Informacje dotyczące pracy kontrolnej Słuchacze, którzy z przyczyn usprawiedliwionych nie przystąpili do pracy kontrolnej lub otrzymali z niej ocenę negatywną zobowiązani są do dnia 06 grudnia 2015 r.
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Wykład 4 Jak działają geny?
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Hormony Gruczoły dokrewne
Hormony Gruczoły dokrewne Dr n. biol. Urszula Wasik Zakład Biologii Medycznej HORMON Przekazuje informacje między poszczególnymi organami regulują wzrost, rozwój organizmu efekt biologiczny - niewielkie
Praca kontrolna z biologii LO dla dorosłych semestr V
Praca kontrolna z biologii LO dla dorosłych semestr V Poniższa praca składa się z 15 zadań. Przy każdym poleceniu podano liczbę punktów możliwą do uzyskania za prawidłową odpowiedź. Za rozwiązanie zadań
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski. Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul.
Grzegorz Satała, Tomasz Lenda, Beata Duszyńska, Andrzej J. Bojarski Instytut Farmakologii Polskiej Akademii Nauk, ul. Smętna 12, Kraków Plan prezentacji: Cel naukowy Podstawy teoretyczne Przyjęta metodyka
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
TRANSLACJA II etap ekspresji genów
TRANSLACJA II etap ekspresji genów Tłumaczenie informacji genetycznej zawartej w mrna (po transkrypcji z DNA) na aminokwasy budujące konkretne białko. trna Operon (wg. Jacob i Monod) Zgrupowane w jednym
Wykład 5. Remodeling chromatyny
Wykład 5 Remodeling chromatyny 1 Plan wykładu: 1. Przebudowa chromatyny 2. Struktura, funkcje oraz mechanizm działania kompleksów remodelujących chromatynę 3. Charakterystyka kompleksów typu SWI/SNF 4.
Translacja i proteom komórki
Translacja i proteom komórki 1. Kod genetyczny 2. Budowa rybosomów 3. Inicjacja translacji 4. Elongacja translacji 5. Terminacja translacji 6. Potranslacyjne zmiany polipeptydów 7. Translacja a retikulum
Zarówno u organizmów eukariotycznych, jak i prokariotycznych proces replikacji ma charakter semikonserwatywny.
HIPTEZY WYJAŚIAJĄCE MECHAIZM REPLIKACJI C. Model replikacji semikonserwatywnej zakłada on, że obie nici macierzystej cząsteczki DA są matrycą dla nowych, dosyntetyzowywanych nici REPLIKACJA każda z dwóch
Niegenomowe działanie estrogenów Non-genomic action of estrogens
Postepy Hig Med Dosw. (online), 2007; 61: 541-547 e-issn 1732-2693 www.phmd.pl Review Received: 2007.08.22 Accepted: 2007.09.24 Published: 2007.10.08 Niegenomowe działanie estrogenów Non-genomic action
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane. Genetyczne podłoże nowotworzenia
Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Genetyczne podłoże nowotworzenia Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Rozmnażanie i wzrost komórek sąściśle kontrolowane Połączenia komórek
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych. źródło: (3)
Kamila Muraszkowska Znaczenie wąskich gardeł w sieciach białkowych źródło: (3) Interakcje białko-białko Ze względu na zadanie: strukturalne lub funkcjonalne. Ze względu na właściwości fizyczne: stałe lub
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS
WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS KOLOKWIA; 15% KOLOKWIA-MIN; 21% WEJŚCIÓWKI; 6% WEJŚCIÓWKI-MIN; 5% EGZAMIN; 27% EGZAMIN-MIN; 26% WARUNKI ZALICZENIA PRZEDMIOTU- 5 ECTS kolokwium I 12% poprawa kolokwium
Pamiętając o komplementarności zasad azotowych, dopisz sekwencję nukleotydów brakującej nici DNA. A C C G T G C C A A T C G A...
1. Zadanie (0 2 p. ) Porównaj mitozę i mejozę, wpisując do tabeli podane określenia oraz cyfry. ta sama co w komórce macierzystej, o połowę mniejsza niż w komórce macierzystej, gamety, komórki budujące
Geny i działania na nich
Metody bioinformatyki Geny i działania na nich prof. dr hab. Jan Mulawka Trzy królestwa w biologii Prokaryota organizmy, których komórki nie zawierają jądra, np. bakterie Eukaryota - organizmy, których
Nukleotydy w układach biologicznych
Nukleotydy w układach biologicznych Schemat 1. Dinukleotyd nikotynoamidoadeninowy Schemat 2. Dinukleotyd NADP + Dinukleotydy NAD +, NADP + i FAD uczestniczą w procesach biochemicznych, w trakcie których
Ekspresja i funkcja receptora progesteronu w jajniku u ptaków
Rocz. Nauk. Zoot., T. 38, z. 2 (2011) 127 135 Ekspresja i funkcja receptora progesteronu w jajniku u ptaków S y l w i a O r c z e w s k a - D u d e k 1, M a r i a M i k a 2 1 Instytut Zootechniki Państwowy
The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals
The Maternal Nucleolus Is Essential for Early Embryonic Development in Mammals autorstwa Sugako Ogushi Science vol 319, luty 2008 Prezentacja Kamil Kowalski Jąderko pochodzenia matczynego jest konieczne
Priony. co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski
Priony co dobrego mówią nam drożdże? Takao Ishikawa Zakład Biologii Molekularnej Uniwersytet Warszawski Choroba Kreutzfeldta-Jakoba Pierwsze opisy pochodzą z lat 30. XX wieku Zakaźna choroba, często rodzinna
DNA musi współdziałać z białkami!
DNA musi współdziałać z białkami! Specyficzność oddziaływań między DNA a białkami wiążącymi DNA zależy od: zmian konformacyjnych wzdłuż cząsteczki DNA zróżnicowania struktury DNA wynikającego z sekwencji
Zgodnie z tzw. modelem interpunkcji trna, cząsteczki mt-trna wyznaczają miejsca
Tytuł pracy: Autor: Promotor rozprawy: Recenzenci: Funkcje białek ELAC2 i SUV3 u ssaków i ryb Danio rerio. Praca doktorska wykonana w Instytucie Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii UW Lien Brzeźniak
DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro
DNA- kwas deoksyrybonukleinowy: DNA superhelikalny eukariota DNA kolisty bakterie plazmidy mitochondria DNA liniowy wirusy otrzymywany in vitro RNA- kwasy rybonukleinowe: RNA matrycowy (mrna) transkrybowany
starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
Sposoby determinacji płci
W CZASIE WYKŁADU TELEFONY KOMÓRKOWE POWINNY BYĆ WYŁĄCZONE LUB WYCISZONE Sposoby determinacji płci TSD thermal sex determination GSD genetic sex determination 26 o C Środowiskowa: ekspresja genu
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych
Regulacja transkrypcji genów eukariotycznych Dr hab. Marta Koblowska, prof. UW Zakład Biologii Systemów, Wydział Biologii UW Pracownia Analiz Mikromacierzy i Sekwencjonowania UW/IBB PAN Klasyczne wyobrażenie
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Transgeneza - genetycznie zmodyfikowane oraganizmy 2. Medycyna i ochrona zdrowia 3. Genomika poznawanie genomów Przełom XX i
Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego
Aleksandra Sałagacka Ocena ekspresji genu ABCG2 i białka oporności raka piersi (BCRP) jako potencjalnych czynników prognostycznych w raku jelita grubego Pracownia Biologii Molekularnej i Farmakogenomiki
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej
Badanie dynamiki białek jądrowych w żywych komórkach metodą mikroskopii konfokalnej PRAKTIKUM Z BIOLOGII KOMÓRKI () ćwiczenie prowadzone we współpracy z Pracownią Biofizyki Komórki Badanie dynamiki białek
etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Temat: Białka Aminy Pochodne węglowodorów zawierające grupę NH 2 Wzór ogólny amin: R NH 2 Przykład: CH 3 -CH 2 -NH 2 etyloamina Aminy mają właściwości zasadowe i w roztworach kwaśnych tworzą jon alkinowy
Imię i nazwisko...kl...
Gimnazjum nr 4 im. Ojca Świętego Jana Pawła II we Wrocławiu SPRAWDZIAN GENETYKA GR. A Imię i nazwisko...kl.... 1. Nauka o regułach i mechanizmach dziedziczenia to: (0-1pkt) a) cytologia b) biochemia c)
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ
WPROWADZENIE DO GENETYKI MOLEKULARNEJ Replikacja organizacja widełek replikacyjnych Transkrypcja i biosynteza białek Operon regulacja ekspresji genów Prowadzący wykład: prof. dr hab. Jarosław Burczyk REPLIKACJA
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała
Profil metaboliczny róŝnych organów ciała Uwaga: tkanka tłuszczowa (adipose tissue) NIE wykorzystuje glicerolu do biosyntezy triacylogliceroli Endo-, para-, i autokrynna droga przekazu informacji biologicznej.
CHOROBY NOWOTWOROWE. Twór składający się z patologicznych komórek
CHOROBY NOWOTWOROWE Twór składający się z patologicznych komórek Powstały w wyniku wielostopniowej przemiany zwanej onkogenezą lub karcinogenezą Morfologicznie ma strukturę zbliżoną do tkanki prawidłowej,
Membrane receptors for estradiol new way of biological action. Nowe aspekty działania estrogenów poprzez receptory błonowe
Membrane receptors for estradiol new way of biological action Agnieszka Lachowicz-Ochędalska Department of Experimental Endocrinology, Institute of Endocrinology, Medical University of Lodz, Poland Summary
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS. Inżynieria genetyczna. Podstawowe pojęcia Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka
Inżynieria genetyczna- 6 ECTS Część I Badanie ekspresji genów Podstawy klonowania i różnicowania transformantów Kolokwium (14pkt) Część II Klonowanie ekspresyjne Od genu do białka Kolokwium (26pkt) EGZAMIN
ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (UE) / z dnia r.
KOMISJA EUROPEJSKA Bruksela, dnia 29.5.2018 C(2018) 3193 final ROZPORZĄDZENIE KOMISJI (UE) / z dnia 29.5.2018 r. zmieniające rozporządzenie (WE) nr 847/2000 w odniesieniu do definicji pojęcia podobnego
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA
INICJACJA ELONGACJA TERMINACJA 2007 by National Academy of Sciences Kornberg R D PNAS 2007;104:12955-12961 Struktura chromatyny pozwala na różny sposób odczytania informacji zawartej w DNA. Możliwe staje
Regulacja Ekspresji Genów
Regulacja Ekspresji Genów Wprowadzenie o Ekspresja genu jest to złożony proces jego transkrypcji do mrna, o Obróbki tego mrna, a następnie o Translacji do białka. 4/17/2019 2 4/17/2019 3 E 1 GEN 3 Promotor
Prezentuje: Magdalena Jasińska
Prezentuje: Magdalena Jasińska W którym momencie w rozwoju embrionalnym myszy rozpoczyna się endogenna transkrypcja? Hipoteza I: Endogenna transkrypcja rozpoczyna się w embrionach będących w stadium 2-komórkowym
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa,
Dr hab. Anna Bębenek Warszawa, 14.01. 2018 Instytut Biochemii i Biofizyki PAN Ul. Pawińskiego 5a 02-106 Warszawa Recenzja pracy doktorskiej Pana mgr Michała Płachty Pod Tytułem Regulacja funkcjonowania
DIOKSYNY- CZYNNIKI ZABURZAJĄCE FUNKCJE ENDOKRYNNE
DIOKSYNY- CZYNNIKI ZABURZAJĄCE FUNKCJE ENDOKRYNNE E.L. Gregoraszczuk Zakład Fizjologii Zwierząt, Instytut Zoologii, Uniwersytet Jagielloński, Kraków Kilka słów o układzie endokrynnym. Układ endokrynny,
Organizacja tkanek - narządy
Organizacja tkanek - narządy Architektura skóry tkanki kręgowców zbiór wielu typów komórek danej tkanki i spoza tej tkanki (wnikają podczas rozwoju lub stale, w trakcie Ŝycia ) neurony komórki glejowe,
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej)
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz.i): wprowadzenie (komórki, receptory, rozwój odporności nabytej) Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt do wykładu
Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney
Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney Epigenetyka Epigenetyka zwykle definiowana jest jako nauka o dziedzicznych
Sposoby determinacji płci
Sposoby determinacji płci TSD thermal sex determination GSD genetic sex determination 26 o C Środowiskowa: ekspresja genu DMRT zależna jest od warunków środowiska ~30 o C ~33 o C ~35 o C n=16
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski. Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T. Joanna Frąckowiak
Gdański Uniwersytet Medyczny Wydział Lekarski Udział mikrorna w procesie starzenia się ludzkich limfocytów T Joanna Frąckowiak Rozprawa doktorska Praca wykonana w Katedrze i Zakładzie Fizjopatologii Gdańskiego
Receptory estrogenowe β w raku piersi
Wspó³czesna Onkologia (2004) vol. 8; 10 (478 482) Obecnoœæ receptorów estrogenowych (ER) w komórkach raka piersi jest korzystnym czynnikiem prognostycznym, a tak e czynnikiem predykcyjnym, okreœlaj¹cym
Transport makrocząsteczek
Komórka eukariotyczna cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii, dzięki której organizm uzyskuje energię biosynteza białka i innych związków Transport
Przybliżone algorytmy analizy ekspresji genów.
Przybliżone algorytmy analizy ekspresji genów. Opracowanie i implementacja algorytmu analizy danych uzyskanych z eksperymentu biologicznego. 20.06.04 Seminarium - SKISR 1 Wstęp. Dane wejściowe dla programu
STRESZCZENIE PRACY DOKTORSKIEJ
mgr Bartłomiej Rospond POSZUKIWANIE NEUROBIOLOGICZNEGO MECHANIZMU UZALEŻNIENIA OD POKARMU - WPŁYW CUKRÓW I TŁUSZCZÓW NA EKSPRESJĘ RECEPTORÓW DOPAMINOWYCH D 2 W GRZBIETOWYM PRĄŻKOWIU U SZCZURÓW STRESZCZENIE
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY
WYBRANE SKŁADNIKI POKARMOWE A GENY d r i n ż. Magdalena Górnicka Zakład Oceny Żywienia Katedra Żywienia Człowieka WitaminyA, E i C oraz karotenoidy Selen Flawonoidy AKRYLOAMID Powstaje podczas przetwarzania
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad
Making the impossible possible: the metamorphosis of Polish Biology Olympiad Takao Ishikawa Faculty of Biology, University of Warsaw, Poland Performance of Polish students at IBO Gold Silver Bronze Merit
Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko. Syllabus przedmiotowy 2016/ /2019
Podkowiańska Wyższa Szkoła Medyczna im. Z. i J. Łyko Syllabus przedmiotowy 2016/2017-2018/2019 Wydział Fizjoterapii Kierunek studiów Fizjoterapia Specjalność ----------- Forma studiów Stacjonarne / Niestacjonarne
Kraków Prof. dr hab. Maria Słomczyńska Zakład Endokrynologii Katedra Fizjologii Zwierząt Instytut Zoologii Uniwersytet Jagielloński OCENA
Kraków 10.05.2016 Prof. dr hab. Maria Słomczyńska Zakład Endokrynologii Katedra Fizjologii Zwierząt Instytut Zoologii Uniwersytet Jagielloński OCENA rozprawy doktorskiej mgr. Piotra Kaczyńskiego Rola receptora
Wykład 1. Od atomów do komórek
Wykład 1. Od atomów do komórek Skład chemiczny komórek roślinnych Składniki mineralne (nieorganiczne) - popiół Substancje organiczne (sucha masa) - węglowodany - lipidy - kwasy nukleinowe - białka Woda
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski
biologiczne mechanizmy zachowania seminarium + laboratorium M.Eng. Michal Adam Michalowski michal.michalowski@uwr.edu.pl michaladamichalowski@gmail.com michal.michalowski@uwr.edu.pl https://mmichalowskiuwr.wordpress.com/
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
Składniki diety a stabilność struktury DNA
Składniki diety a stabilność struktury DNA 1 DNA jedyna makrocząsteczka, której synteza jest ściśle kontrolowana, a powstałe błędy są naprawiane DNA jedyna makrocząsteczka naprawiana in vivo Replikacja
WYDZIAŁ BIOCHEMII, BIOFIZYKI I BIOTECHNOLOGII PRACOWNIA GENETYKI MOLEKULARNEJ I WIRUSOLOGII
UNIWERSYTET JAGIELLOŃSKI W KRAKOWIE WYDZIAŁ BIOCHEMII, BIOFIZYKI I BIOTECHNOLOGII PRACOWNIA GENETYKI MOLEKULARNEJ I WIRUSOLOGII KIEROWNIK PROF. DR HAB. HANNA ROKITA 12 marca 2012 r. Recenzja pracy doktorskiej
Wrocław, Ogólna charakterystyka rozprawy
Wrocław, 26.08.14 Recenzja rozprawy doktorskiej mgr Piotra Zygmunta Trzeciaka pt. Wpływ podwyższonej temperatury na poziom ekspresji wybranych genów w komórkach ziarnistych kompleksu wzgórek jajonośny
Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu prof. dr hab. Krystyna Skwarło-Sońta pracownik emerytowany
Pracownicy samodzielni: dr hab. Piotr Bębas Kierownik Zakładu prof. dr hab. Krystyna Skwarło-Sońta pracownik emerytowany Adiunkci: dr Jan Jabłonka dr Joanna Kotwica - Rolińska dr Paweł Majewski dr Magdalena
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy
1. Lista publikacji wchodzących w skład rozprawy a) Toma A, Widłak W, Vydra N (2012) Rola czynnika transkrypcyjnego HSF1 w procesie nowotworzenia. Postępy Biologii Komórki 39(2):269 288 b) Vydra N, Toma
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją).
Historia informacji genetycznej. Jak ewolucja tworzy nową informację (z ma ą dygresją). Czym jest życie? metabolizm + informacja (replikacja) 2 Cząsteczki organiczne mog y powstać w atmosferze pierwotnej
Komórka eukariotyczna
Komórka eukariotyczna http://pl.wikipedia.org/w/index.php?title=plik:hela_cells_stained_with_hoechst_33258.jpg cytoplazma + jądro komórkowe = protoplazma W cytoplazmie odbywa się: cała przemiana materii,
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B
PODSTAWY IMMUNOLOGII Komórki i cząsteczki biorące udział w odporności nabytej (cz. III): Aktywacja i funkcje efektorowe limfocytów B Nadzieja Drela ndrela@biol.uw.edu.pl Konspekt wykładu Rozpoznanie antygenu
Promotor: prof. dr hab. Katarzyna Bogunia-Kubik Promotor pomocniczy: dr inż. Agnieszka Chrobak
INSTYTUT IMMUNOLOGII I TERAPII DOŚWIADCZALNEJ IM. LUDWIKA HIRSZFELDA WE WROCŁAWIU POLSKA AKADEMIA NAUK mgr Milena Iwaszko Rola polimorfizmu receptorów z rodziny CD94/NKG2 oraz cząsteczki HLA-E w patogenezie
Wprowadzenie. DNA i białka. W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej.
Wprowadzenie DNA i białka W uproszczeniu: program działania żywego organizmu zapisany jest w nici DNA i wykonuje się na maszynie białkowej. Białka: łańcuchy złożone z aminokwasów (kilkadziesiąt kilkadziesiąt
Wykład 13. Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA. Mechanizmy powstawania nowotworów
Wykład 13 Regulacja cyklu komórkowego w odpowiedzi na uszkodzenia DNA Mechanizmy powstawania nowotworów Uszkodzenie DNA Wykrycie uszkodzenia Naprawa DNA Zatrzymanie cyklu kom. Apoptoza Źródła uszkodzeń