Wykorzystanie nowej techniki multiplex real-time PCR do wykrywania i różnicowania DNA wirusów opryszczki typu 1 i 2
|
|
- Magda Olszewska
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: Wykorzystanie nowej techniki multiplex real-time PCR do wykrywania i różnicowania DNA wirusów opryszczki typu 1 i 2 Novel multiplex real-time PCR assay for detection and differentiation of herpes simplex virus type 1 and 2 DNA Paulina Machura 1,2, Emilia Górka 1,3, Beata Młynarczyk-Bonikowska 3, Anna Majewska 2, Magdalena Malejczyk 3, Grażyna Młynarczyk 2, Tomasz Dzieciątkowski 2 1 Oddział Medycyny Laboratoryjnej, Warszawski Uniwersytet Medyczny 2 Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny 3 Zakład Diagnostyki Chorób Przenoszonych Drogą Płciową, Warszawski Uniwersytet Medyczny Celem pracy było optymalizacja nowego wariantu techniki multiplex real- -time PCR, który może być wykorzystany zarówno do wykrywania, jak i różnicowania zakażeń HSV-1/2, zwłaszcza w próbkach pobranych od osób z zakażeniami narządów płciowych. Specyficzność opracowanej metody, w połączeniu z szybkością oznaczenia, daje możliwość rutynowego jej stosowania, zwłaszcza u pacjentów z zaburzeniami odporności lub objawami niespecyficznymi, w przypadku których szybka i trafna diagnoza jest szczególnie istotna. Słowa kluczowe: herpeswirusy, choroby przenoszone drogą płciową, real-time PCR ABSTRACT Introduction: Herpes simplex viruses type 1 and 2 are the cause of world spread multiple infections with different course and severity. The aim of this work was to design and to optimize multiplex real-time PCR assay for simultaneous detection of HSV-1 and HSV-2. The second aim of the project was to check if the designed method is laboratory useful analyzing different clinical specimens. Materials and methods: In this experiment primers and probes were designed to specific viral sequences: for HSV-1 to the gene of viral DNA polymerase; for HSV-2 to the UL5 sequence. For performing qpcr assay TaqMan chemistry was used. Reference strains HSV- 1 McIntyre and HSV-2 MS were used as a positive control. To test laboratory utility of the designed method 58 different clinical specimens were analyzed.
2 126 P. Machura i inni Nr 2 Results: Developed multiplex real-time PCR gave positive result only in the samples containing genetic material of HSV-1/2. Of the 58 clinical samples tested, 27 proved to be positive for HSV-1 and 17 for HSV-2. The 7 samples showed the presence of both types of DNA herpes simplex virus, and 7 others were found for both HSV-1 and HSV-2 negative. Conclusions: Obtained results show that the designed method is highly specific and can possibly be used to simultaneously detect and differentiate HHV-1/2. Both high specificity and very short time of analysis have great importance in diagnosing immunocompromised patients, which ought to be diagnosed quickly and effectively in order to provide appropriate treatment. Key words: herpesviruses, sexual transmitted infections, real-time PCR WSTĘP Zakażenia wirusem opryszczki typu 1 (HSV-1, HHV-1) oraz typu 2 (HSV-2, HHV-2) należą do chorób wirusowych występujących powszechnie na całym świecie (1,2). Do zakażenia nimi dochodzi zazwyczaj w wyniku bezpośredniego kontaktu, a wrotami zakażenia są uszkodzone mechanicznie błony śluzowe lub skóra. HSV-1 jest zazwyczaj kojarzony z zakażeniami w obrębie jamy ustnej, takimi jak: zmiany pęcherzykowe okolic ust i innych części twarzy, zapalenia mózgu czy uogólnione infekcje u osób z zaburzeniami odporności (1,2,3). HSV-2 wiązany jest natomiast najczęściej z pierwotnym lub wynikającym z reaktywacji latentnego wirusa zakażeniem skóry i błon śluzowych, zlokalizowanym najczęściej na skórze i błonach śluzowych narządów płciowych i/lub okolicy okołoodbytniczej (4). Nieliczne prowadzone dotychczas w Polsce badania nad epidemiologią zakażeń opryszczkowych sugerować mogą także znaczący udział herpeswirusa typu 1 w etiologii chorób przenoszonych drogą płciową (5,6) Złotym standardem diagnostyki zakażeń opryszczkowych przez wiele lat była izolacja i namnażanie wirusa w hodowlach komórkowych, gdzie materiałem stosowanym do zakażania był płyn pęcherzowy lub wymazy bezpośrednie z powierzchni zmian skórnych (7,8). Zaletą takiego materiału klinicznego była możliwość jego wykorzystania zarówno do zakażenia hodowli komórkowych, jak i do izolacji DNA (8). Wyizolowany z próbek materiał genetyczny posłużyć może do oznaczania i różnicowania typów wirusa opryszczki za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR). Tradycyjne warianty techniki PCR służyły głównie do jakościowego badania obecności wirusa i stopniowo wypierane są przez metodę real-time PCR (qpcr), która ze względu na swą wysoką czułość oraz możliwość oznaczeń ilościowych stała się najlepszą w diagnostyce zakażeń herpeswirusami (7). Celem niniejszej pracy było opracowanie oraz optymalizacja metody multiplex real-time PCR z wykorzystaniem sond hydrolizujących typu TaqMan do wykrywania i różnicowania DNA ludzkich wirusów opryszczki typu 1 i 2, określenie jej czułości analitycznej oraz przydatności do oznaczeń w próbkach klinicznych, zwłaszcza pobranych od pacjentów z podejrzeniem zakażenia narządów płciowych.
3 Nr 2 Multiplex real-time PCR w wykrywaniu DNA wirusów opryszczki 127 MATERIAŁ I METODY W celu opracowania starterów i sond do metody multiplex real-time PCR wykorzystano sekwencje DNA dostępne w internetowej bazie danych GenBank: wirusowej DNA polimerazy dla HSV-1 (AB ), zaś dla wirusa opryszczki typu 2 kodującą gen UL5 (NC ). Zaprojektowane do nich, z użyciem oprogramowania LightCycler Probe Design (Roche Diagnostics ), startery amplifikują fragmenty wirusowych genomów o długościach odpowiednio, 111 i 112 par zasad (Tab.I). Zastosowane specyficzne fluorescencyjne sondy hydrolizujące typu TaqMan zostały wyznakowane odpowiednio: dla HSV-1 barwnikiem reporterowym typu FAM i wygaszaczem BHQ-1, dla HSV-2 barwnikiem reporterowym typu TexasRed 610 i wygaszaczem BHQ-2 (Oligo ). Badania wykonywano na aparacie LightCycler 2.0 z użyciem zestawu amplifikacyjnego LightCycler TaqMan Master Mix (Roche Diagnostics ). Mieszanina reakcyjna o końcowej objętości 15 µl składała się z 3 µl mieszaniny amplifikacyjnej, po 30 µm każdego z czterech starterów, po 2,25 µm każdej z dwóch sond, 1 µl wody oraz 5 µl DNA. PCR rozpoczynał się etapem aktywacji (hot-start) termostabilnej DNA polimerazy przez 10 min w 95 C, po którym następowało 40 cykli składających się z denaturacji 10 s w 95 C, przyłączania starterów przez 30 s w 62 C oraz wydłużania nici w temperaturze 72 C przez 10 s. Reakcję kończyło schłodzenie próbek do 40 C na 60 sekund (Tab.II). Odczytu fluorescencji dokonywano przy dwóch długościach fali: 530 nm dla wirusa opryszczki typu 1 (charakterystyczny kanał emisji dla fluoroforu FAM) oraz 610 nm dla wirusa opryszczki typu 2 (kanał emisji właściwy dla TexasRed 610). Tabela I Sekwencje starterów i sond użytych w pracy. Sekwencja 5 3 Zawartość par G+C Temperatura topnienia Starter HSV1_F TGA TCG GCG AGT ACT GCA TA 50,0% 60,0 ºC Starter HSV1_R TGA TGT TAA TAC CCG CCA AG 45,0% 59,5 ºC Sonda HSV1_P FAM TTG CCC CAT CTG GAG CTC TCG BHQ1 61,9% 67,2 ºC Starter HSV2_F GTA GTT GGT GAT GCG ACT G 52,6% 59,9 ºC Starter HSV2_R CTC ACG TTT GTG TCG GT 52,9% 60,0 ºC Sonda HSV2_P TexasRed610 TGC TGC GTG AGC CGT CG BHQ2 70,6% 67,3 ºC Tabela II. Parametry PCR w czasie rzeczywistym Proces Liczba cykli Temperatura [ C] Czas trwania Aktywacja hot-start polimerazy DNA minut Denaturacja sekund Hybrydyzacja starterów sekund Wydłużanie sekund Chłodzenie sekund
4 128 P. Machura i inni Nr 2 Do oznaczeń czułości i swoistości zaprojektowanej metody użyto całogenomowego DNA wyizolowanego ze standardowego szczepu McIntyre ludzkiego wirusa opryszczki typu 1 (ATCC nr. VR-539) oraz szczepu MS ludzkiego wirusa opryszczki typu 2 (ATCC nr. VR-540). Jako kontrolę ujemną wykorzystano DNA wyekstrahowane z niezakażonej linii Vero, zaś za kontrolę specyficzności reakcji posłużył DNA izolowany z: wirusa ospy wietrznej/półpaśca (VZV), wirusa Epsteina-Barr (EBV), wirusa cytomegalii (CMV), ludzkiego herpeswirusa typu 6 (HHV-6), ludzkiego herpeswirusa typu 7 (HHV-7), ludzkiego adenowirusa typu 4 (HAdV-4), poliomawirusa BK (BKV) oraz cdna wirusa Coxackie A i wirusa grypy typu A. Granica oznaczalności metody (LOD) wyznaczona została z zastosowaniem seryjnych 10-krotnych rozcieńczeń wzorcowego DNA HSV-1 oraz HSV-2 w jałowej, redestylowanej wodzie w zakresie od 10 1 do 10 5 kopii/ml. Wszystkie opisane powyżej badania prowadzono w trzykrotnych, niezależnych powtórzeniach. DNA całkowite, wykorzystywane do badań molekularnych, izolowano przy użyciu zestawu High Pure Viral Nucleic Acid Kit (Roche Diagnostics). Izolację przeprowadzono z objętości 200 μl odpowiednich materiałów, zgodnie z instrukcją wytwórcy, zawieszając wyizolowane DNA w końcowej objętości 35 μl wody. Badany materiał kliniczny stanowiło 58 próbek pochodzących od pacjentów Kliniki Dermatologii i Wenerologii Szpitala Klinicznego im. Dzieciątka Jezus oraz z kolekcji Zakładu Mikrobiologii Lekarskiej Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego. Analizowano następujące materiały: surowicę krwi (5 próbek), płyn ze zmian pęcherzykowych (2 próbki), płyn mózgowo-rdzeniowy (5 próbek), wymazy ze zmian bezpośrednich (46 próbek). WYNIKI W opracowanej technice multiplex real-time PCR wynik dodatni, wyrażony jako wykładniczy wzrost fluorescencji w mieszaninie reakcyjnej, osiągnięto tylko w próbkach zawierających materiał genetyczny ludzkich wirusów opryszczki typu 1 i 2. W pozostałych próbkach, zawierających kontrolne DNA niezakażonej linii Vero, wirusa ospy wietrznej/półpaśca, wirusa Epsteina-Barr, wirusa cytomegalii, ludzkiego herpeswirusa typu 6, ludzkiego herpeswirusa typu 7, ludzkiego adenowirusa typu 4, poliomawirusa BK oraz cdna wirusa Coxackie A i wirusa grypy typu A nie zaobserwowano fluorescencji, co wskazuje na brak Tabela III. Wyniki oznaczeń uzyskanych techniką real-time PCR z użyciem sond hydrolizujących typu TaqMan w kierunku zakażenia HSV-1/2 Materiał badany Liczba próbek ogółem Liczba próbek HSV-1 (+) Liczba próbek HSV-2 (+) Liczba próbek HSV-1/2 (+) Liczba próbek HSV-1/2 (-) Surowica krwi Płyn mózgowordzeniowy Wymaz ze zmian na skórze i/lub błonach śluzowych Płyn ze zmian pęcherzowych
5 Nr 2 Multiplex real-time PCR w wykrywaniu DNA wirusów opryszczki 129 Ryc.1 Wynik reakcji real-time PCR w kierunku wykrywania ludzkiego wirusa opryszczki typu 1. Krzywa oznaczona HSV-1 oznacza amplifikację DNA wirusa opryszczki typu 1. Pozostałe krzywe przedstawiają wirusy wykorzystane do oceny specyficzności reakcji (HSV-2, VZV, HAdV-4, CMV, HHV-6, HHV-7, EBV, BKV, Coxackie A, grypa A). Rolę kontroli ujemnej pełniło DNA wyizolowane z niezakażonej hodowli linii komórkowej Vero. Ryc.2 Wynik reakcji real-time PCR w kierunku wykrywania ludzkiego wirusa opryszczki typu 2. Krzywa oznaczona HSV-2 oznacza amplifikację DNA wirusa opryszczki typu 2. Pozostałe krzywe przedstawiają wirusy wykorzystane do oceny specyficzności reakcji (HSV-1, VZV, HAdV-4, CMV, HHV-6, HHV-7, EBV, BKV, Coxackie A, grypa A). Rolę kontroli ujemnej pełniło DNA wyizolowane z niezakażonej hodowli linii komórkowej Vero.
6 130 P. Machura i inni Nr 2 w nich swoistej amplifikacji kwasu nukleinowego i świadczy o wysokiej specyficzności metody (Ryc.1 i 2). Granicę wykrywalności (LOD) opracowanej metody wyznaczono za pomocą algorytmu opisanego przez Burns i Valdiva (9), a wynosiła ona 53 kopii/próbkę w przypadku HSV-1 oraz 69 kopii/próbkę dla HSV-2. Spośród 58 przebadanych próbek klinicznych, 27 okazało się dodatnich w kierunku HSV-1, zaś 17 w kierunku HSV-2. W 7 próbkach wykazano obecność DNA obydwu typów wirusa opryszczki, a 7 pozostałych okazało się zarówno HSV-1, jak i HSV-2 ujemnymi. Wyniki oznaczeń zestawiono w tabeli III. DYSKUSJA Wirusy opryszczki pospolitej typu 1 i 2 powodują szereg chorób powszechnie dotykających ludzi na całym świecie. Choroby te mają zróżnicowany przebieg i nasilenie objawów, mogą także przyjmować postać uogólnioną (1,10). Na szczególną uwagę zasługuje słabo wciąż poznany mechanizm reaktywacji wirusa z zakażenia latentnego, będący dodatkowym problemem diagnostycznym i terapeutycznym. Zjawisko przejścia endogennego wirusa ze stanu latencji do zakażenia produktywnego jest interesujące także z powodu różnorodności czynników, które je mogą wywoływać (11). Prawidłowa diagnostyka zakażeń wywołanych przez HSV-1/2 jest wciąż wyzwaniem w praktyce klinicznej. Wiąże się to z faktem, że rozpoznanie zakażenia wirusowego stawiane jest najczęściej na podstawie istniejących objawów klinicznych, a te mogą mylnie być interpretowane jako symptomy infekcji bakteryjnych lub grzybiczych. Zdarzają się też sytuacje odwrotne, gdzie w zakażeniach o niepotwierdzonej laboratoryjnie etiologii opryszczkowej klinicyści dopatrują się związku z HSV-1/2 (12). Dużym problemem jest poprawne rozpoznawanie opryszczki genitalnej, ponieważ zakażenia te mogą mieć przebieg skąpoobjawowy lub podobny do innych zakażeń narządów płciowych. Także prowadzone dotychczas badania seroepidemiologiczne na terenie Polski wskazują na coraz większy udział typu 1 wirusa w wywoływaniu zmian genitalnych, co dodatkowo utrudnia diagnostykę (6). Wszystkie te czynniki razem sprawiają, że jedynie ok. 20% pacjentów cierpiących na opryszczkę narządów płciowych zostaje prawidłowo zdiagnozowanych. Nieprawidłowe rozpoznanie powoduje z kolei błędne postępowanie terapeutyczne i dalsze rozprzestrzenianie się wirusa w ludzkiej populacji (12,13) Zakażenie mieszane, wykryte w części próbek świadczyć może o współzakażeniu pacjenta dwoma typami wirusa. Siedmiu pacjentów, u których nie wykryto DNA wirusów opryszczki najprawdopodobniej cierpi na schorzenia o etiologii niezwiązanej z HSV-1/2, mimo podobnych objawów (próbki pobierane były od pacjentów mających symptomy opryszczkopodobne). Pozostałe przebadane próbki wpisują się w tendencję ogólną charakterystyczną nie tylko dla obszaru Polski, ale większości krajów europejskich, zgodnie z którą większość zakażeń wirusem opryszczki powodowana jest przez typ 1 wirusa (5,6). Według niektórych autorów, udział HSV-1 w wywoływaniu zmian genitalnych stale rośnie, co najprawdopodobniej wiąże się ze zmianą zachowań seksualnych. Być może zmiana seksualnej obyczajowości odpowiada również za część koinfekcji obydwoma typami wirusa opryszczki (14,15).
7 Nr 2 Multiplex real-time PCR w wykrywaniu DNA wirusów opryszczki 131 Przeprowadzone w niniejszej pracy badania, wykonane na grupie 58 próbek potwierdzają przydatność kliniczną zaprojektowanej metody. Ze względu na wszystkie wymienione powyżej cechy qpcr - czułość, szybkość wykonania badania oraz możliwość oznaczeń ilościowych - opisywany w niniejszej pracy test mógłby z powodzeniem ułatwić i przyspieszyć diagnostykę schorzeń o etiologii opryszczkowej, zwłaszcza takich jak: asymptomatyczne zakażenia genitalne, uogólnione infekcje u noworodków czy opryszczkowe zakażenia układu nerwowego, w przypadku których tradycyjnie stosowane w diagnostyce hodowle komórkowe okazują się szczególnie nieskuteczne, dając jedynie 4% wyników pozytywnych (16). Rozpowszechnienie w praktyce laboratoryjnej czułych testów umożliwiających wykrycie wirusowego DNA, czy też w wariancie ilościowym pozwalających na monitorowanie wiremii HSV-1/2, może znacząco ułatwić szybką diagnostykę zakażeń opryszczkowych, a w konsekwencji prawidłowe postępowanie terapeutyczne. PIŚMIENNICTWO 1. Chayavichitsil P, Buckwalter JV, Krakowski AC i inni. Herpes simplex. Pediatr Rev 2009; 30: Karabin K, Chudzik E, Dzieciątkowski T. Zakażenia alfaherpeswirusami u pacjentów z upośledzeniem odporności. Post Mikrobiol 2010; 49: Miller GG, Dummer JS. Herpes simplex and varicella zoster viruses: forgotten but not gone. Am J Transplant 2007; 7: Hofstetter AM, Rosenthal SL, Stanberry LR. Current thinking on genital herpes. Curr Opin Infect Dis 2014; 27: Majewska A, Kilijańczyk M, Gajewska M i inni. Identyfikacja wirusów opryszczki pospolitej w materiale pobranym z błony śluzowej narządów płciowych od pacjentek poradni ginekologicznej przy I Katedrze i Klinice Położnictwa i Ginekologii WUM w Warszawie. Ginekol Prakt 2009; 17: Smith JS, Rosinska M, Trzcinska A i inni. Type specific seroprevalence of HSV-1 and HSV-2 in four geographical regions of Poland. Sex Transm Infect 2006; 82: Anderson NW, Buchan BW, Ledeboer NA. Light microscopy, culture, molecular, and serologic methods for detection of herpes simplex virus. J Clin Microbiol 2014; 52: Dzieciątkowski T, Majewska A, Krawczyk E. Postacie kliniczne i diagnostyka herpeswirusowych zakażeń skóry. Przegl Dermatol 2007; 94: Burns M, Valdiva H: Modelling the limit of detection in real-time quantitative PCR. Eur Food Res Technol 2008; 226: Whitley RJ, Roizman B. Herpes simplex virus infections. Lancet 2001; 357: Lachmann R. Herpes simplex virus latency. Expert Rev Mol Med 2003; 5: Strand A. Diagnosis of genital herpes: the role and place of HSV testing in clinical practice. Eur Clin Obst Gyn 2007; 2: Majewska A, Krawczyk E, Łuczak M. Opryszczka narządów płciowych (genital herpes): obraz kliniczny i możliwe następstwa zakażeń. Zakażenia 2005; 5: Walczak L, Dzieciątkowski T, Majewska A. Mieszane zakażenie błon śluzowych narządów płciowych wirusami opryszczki pospolitej typu 1 i 2 - opis przypadku i leczenia. Zakażenia 2008; 5: van Wagoner NJ, Hook EW 3 rd. Herpes diagnostic tests and their use. Curr Infect Dis Rep 2012; 14: Boivin G. Diagnosis of herpesvirus infections of the central nervous system. Herpes 2004; 11:
8 132 P. Machura i inni Nr 2 Otrzymano: 18 V 2015 r. Adres Autora: Warszawa, ul. Chałubińskiego 5, Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny
ZASTOSOWANIE TECHNIKI REAL-TIME PCR DO WYKRYWANIA DNA LUDZKIEGO WIRUSA OPRYSZCZKI TYPU 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 85-92 1 Anna Midak-Siewirska 1, Karolina Karabin 2, Emilia Chudzik 2, Tomasz Dzieciątkowski 1, Maciej Przybylski 1, Anna Majewska 1, Mirosław Łuczak 1, Grażyna Młynarczyk
Bardziej szczegółowoWykrywanie oraz różnicowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 metodą real-time PCR z wykorzystaniem sond HybProbe
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 255-262 Emilia Chudzik 2, Karolina Karabin 2, Tomasz Dzieciątkowski 1, Anna Majewska 1, Maciej Przybylski 1, Anna Midak-Siewirska 1, Mirosław Łuczak 1,Grażyna Młynarczyk
Bardziej szczegółowoAmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Bardziej szczegółowoWystępowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 w zmianach skórnych i śluzówkowych u chorych z podejrzeniem opryszczki narządów płciowych
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2016, 68: 57-62 Występowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 w zmianach skórnych i śluzówkowych u chorych z podejrzeniem opryszczki narządów płciowych The occurrence of herpes simplex
Bardziej szczegółowoAmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
Bardziej szczegółowoPakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time PCR część 67
Pakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time część 7 L.p. Przedmiot zamówienia Wymagania jakościowe Producent i nr katalogowy dla produktu równowaŝnego Ilość
Bardziej szczegółowoAmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
Bardziej szczegółowoWYKORZYSTANIE METODY REAL-TIME PCR DO WYKRYWANIA DNA LUDZKIEGO HERPESWIRUSA TYPU 6
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 259-265 Tomasz Dzieciątkowski 1, Maciej Przybylski 1, Małgorzata Gieryńska 2, Mirosław Łuczak 1 WYKORZYSTANIE METODY REAL-TIME PCR DO WYKRYWANIA DNA LUDZKIEGO HERPESWIRUSA
Bardziej szczegółowoLaboratoryjne rozpoznanie opryszczki narządów płciowych metoda immunofluorescencji bezpośredniej
Laboratoryjne rozpoznanie opryszczki narządów płciowych metoda immunofluorescencji bezpośredniej Laboratory diagnosis of genital herpes direct immunofluorescence method 1 2 2,,, 1 1 Katedra i Zakład Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoAmpliTest TBEV (Real Time PCR)
AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej
Bardziej szczegółowoAmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
Bardziej szczegółowoVZV EBV. AdV CMV HHV7 HHV8. BK virus HSV1 HSV2. Zestawy R-gene real-time PCR HHV6
INFEKCJE WIRUSOWE U PACJENTÓW Z IMMUNOSUPRESJĄ CMV HHV6 BK virus HSV1 EBV HHV7 HSV2 AdV VZV HHV8 Zestawy R-gene real-time PCR Jakościowa i ilościowa diagnostyka najważniejszych wirusów odpowiedzialnych
Bardziej szczegółowoAmpliTest BVDV (Real Time PCR)
AmpliTest BVDV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla wirusa BVD (Bovine Viral Diarrhea Virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Bardziej szczegółowoDETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH
DETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH Detekcja enterowirusów Detekcja sześciu typów ludzkich herpeswirusów (HHV) Detekcja pięciu bakterii Seeplex Detekcja patogenów powodujących
Bardziej szczegółowoWYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ
Strona/ stron 1/8 WYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ Symbol oznacza metody akredytowane, zawarte w Zakresie
Bardziej szczegółowoZałącznik nr 2 do procedury opracowywania i okresowego przeglądu programów kształcenia II WYDZIAŁ LEKARSKI. Rok: IV.
1. Metryczka Nazwa Wydziału: Program kształcenia (Kierunek studiów, poziom i profil kształcenia, forma studiów np.: Zdrowie publiczne I stopnia profil praktyczny, studia stacjonarne): Rok akademicki: 2015/2016
Bardziej szczegółowoOznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Bardziej szczegółowoWYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ
Strona/ stron 1/7 WYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ Symbol oznacza metody akredytowane, zawarte w Zakresie
Bardziej szczegółowoKatedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny w Warszawie 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 139-149 Opracowanie metody PCR w czasie rzeczywistym do wykrywania wirusa ospy wietrznej i półpaśca z wykorzystaniem fluorescencyjnej sondy typu TaqMan TaqMan fluorescent
Bardziej szczegółowoWYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ
Strona/ stron 1/6 WYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ Symbol oznacza metody akredytowane, zawarte w Zakresie
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody real-time PCR do wykrywania RNA enterowirusów człowieka
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 245-253 Katarzyna Leś 2, Maciej Przybylski 1,2, Tomasz Dzieciątkowski 1,2, Grażyna Młynarczyk 1,2 Zastosowanie metody real-time PCR do wykrywania RNA enterowirusów człowieka
Bardziej szczegółowoMODYFIKACJA I OPTYMALIZACJA METOD PCR DO WYKRYWANIA REGIONU MIE LUDZKIEGO HERPESWIRUSA TYPU 5
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 79-86 Łukasz Chabros 1, Maciej Przybylski 2, Tomasz Dzieciątkowski 2, Mirosław Łuczak 2 MODYFIKACJA I OPTYMALIZACJA METOD PCR DO WYKRYWANIA REGIONU MIE LUDZKIEGO HERPESWIRUSA
Bardziej szczegółowoOpis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
Bardziej szczegółowoAmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
Bardziej szczegółowoEwa Skulska. Praca doktorska. dr hab. n. med. Magdalena Malejczyk
Ewa Skulska Porównanie metody diagnostycznej Real-Time PCR z tradycyjną diagnostyką bakteriologiczną i metodą immunofluorescencji bezpośredniej wykorzystywaną do rozpoznania infekcji Neisseria gonorrhoeae
Bardziej szczegółowoCzęść I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKOWANIA JEDNOSTK OWA VAT % RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
Bardziej szczegółowoCzęść I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKNIA RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji DNA z surowego materiału
Bardziej szczegółowoZakład Mikrobiologii, Samodzielny Publiczny Centralny Szpital Kliniczny 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2018, 70: 67-75 Porównanie testów real-time PCR do ilościowego oznaczania DNA wirusa cytomegalii z użyciem systemu LightCycler 2.0 u pacjentów hematologicznych Results comparison
Bardziej szczegółowoDiagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Ponad 60% zakażeń w praktyce klinicznej jest wywołana przez wirusy. Rodzaj i jakość materiału diagnostycznego (transport!) oraz interpretacja wyników badań
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
Bardziej szczegółowoOznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Wirusologia
5650 Wirus cytomegalii - przeciwciała Mikrobiologia - Wirusologia 3 próbki płynnego ludzkiego osocza (>0,7 ml). Przeciwciała przeciwko CMV całkowite, klasy: IgG, IgM, IgG awidność i komentarz 5635 Wirus
Bardziej szczegółowoTaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Bardziej szczegółowoPoznań, ul. Przybyszewskiego 49 tel Recenzja
UNIWERSYTET MEDYCZNY IM. KAROLA MARCINKOWSKIEGO W POZNANIU ZAKŁAD DERMATOLOGII I WENEROLOGII WNOZ 60-355 Poznań, ul. Przybyszewskiego 49 tel. 61 8691285 e-mail: ryszardzaba@gmail.coml Poznań, dnia 27.04.2019
Bardziej szczegółowoDiagnostyka molekularna w OIT
Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C
Bardziej szczegółowoApplied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym
Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym Rynek aparatury laboratoryjnej pęka w szwach od ilości różnych aparatów przeznaczonych
Bardziej szczegółowoDETEKCJA PATOGENÓW DRÓG MOCZOWO-PŁCIOWYCH
DETEKCJA PATOGENÓW DRÓG MOCZOWO-PŁCIOWYCH Detekcja i identyfikacja 7 patogenów dróg moczowo-płciowych Detekcja Neisseria gonorrhoeae i Chlamydia trachomatis Detekcja Trichomonas vaginalis i Mycoplasma
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Bardziej szczegółowo3. częstości występowania zakażeń HSV w populacji o podwyższonym ryzyku (pacjenci podający inne choroby przenoszone drogą płciową).
Łódź, 23. 04. 2019 Prof. dr hab. med. Aleksandra Lesiak, prof. nadzw Klinika Dermatologii, Dermatologii Dziecięcej i Onkologicznej Uniwersytetu Medycznego w Łodzi Recenzja rozprawy doktorskiej lek. med.
Bardziej szczegółowoGRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
Bardziej szczegółowoWirusy oddechowe jako czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych
Wirusy oddechowe jako czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych LEK MED. JOLANTA KLUZ-ZAWADZKA WIRUSY ODDECHOWE : Określenie kliniczne, związane z umiejscowieniem objawów zakażenia i drogą jego szerzenia
Bardziej szczegółowoDevelopment of TaqMan-based real-time PCR assay for detection of Epstein-Barr virus DNA MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67:
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 115-123 Zaprojektowanie i optymalizacja metody PCR z detekcją w czasie rzeczywistym do wykrywania DNA wirusa Epsteina-Barr z wykorzystaniem fluorescencyjnej sondy typu
Bardziej szczegółowoOFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII Opracowanie zestawu do wykrywania DNA Aspergillus flavus za pomocą specjalistycznego sprzętu medycznego. Jednym
Bardziej szczegółowoPracownia Diagnostyki Molekularnej. kierownik dr n. med. Janusz Stańczak. tel. (22) tel. (22)
kierownik dr n. med. Janusz Stańczak tel. (22) 33 55 261 tel. (22) 33 55 278 e-mail jstanczak@zakazny.pl 1 / 6 1. Struktura Pracownia Diagnostyki Molekularnej (PDM) zawiera trzy działy: Mikrobiologii Klinicznej,
Bardziej szczegółowoMETODA REAL - TIME PCR W DIAGNOSTYCE ZAKAŻEŃ WIRUSEM EPSTEINA-BARR
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 253-258 Agnieszka Trzcińska, Joanna Siennicka METODA REAL - TIME PCR W DIAGNOSTYCE ZAKAŻEŃ WIRUSEM EPSTEINA-BARR Zakład Wirusologii NIZP-PZH w Warszawie Kierownik: doc.
Bardziej szczegółowoRSV RHINO CMV. HCoV. Panel oddechowy Multi Well System (MWS) r-gene. hmpv EBV. AdV HPIV HSV VZV. HBoV. Bordetella pertussis
IDENTYFIKACJA PATOGENÓW ODDECHOWYCH hmpv HSV EV Legionella pneumophila HPIV AdV RSV EBV IB Chlamydophila pneumoniae RHINO HCoV IA Mycoplasma pneumoniae HBoV Bordetella pertussis VZV CMV Panel oddechowy
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody real-time PCR do wykrywania DNA ludzkiego poliomawirusa BK
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 81-87 Angelika Długosz 2, Sylwia Rynans 1, Tomasz Dzieciątkowski 1, Grażyna Młynarczyk 1 Zastosowanie metody real-time PCR do wykrywania DNA ludzkiego poliomawirusa BK
Bardziej szczegółowoHarmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5
Harmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5 GRUPY ĆWICZENIOWE 51, 52 : 8.00-10.30 Wtorek: 17.00-19.30 Data Godzina Rodzaj
Bardziej szczegółowoCENNIK DIAGNOSTYKA NIEPŁODNOŚCI MĘSKIEJ
CENNIK DIAGNOSTYKA NIEPŁODNOŚCI MĘSKIEJ AZOOSPERMIA badanie wykrywa delecje w regionie długiego ramienia chromosomu Y w fragmencie zwanym AZF, będące często przyczyną azoospermii lub oligospermii o podłożu
Bardziej szczegółowoWarszawski Uniwersytet Medyczny Dziekanat II Wydziału Lekarskiego
Warszawski Uniwersytet Medyczny Dziekanat II Wydziału Lekarskiego 1. Metryczka Nazwa Wydziału: II Wydział Lekarski Program kształcenia Fizjoterapia studia licencjackie I stopnia, profil praktyczny, studia
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Wirusologia
5650 Wirus cytomegalii - przeciwciała Mikrobiologia - Wirusologia 3 próbki płynnego ludzkiego osocza (>0,7 ml). Przeciwciała przeciwko CMV całkowite, klasy: IgG, IgM, IgG awidność i komentarz 5635 Wirus
Bardziej szczegółowoTaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
Bardziej szczegółowoPlatforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification
1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym
Bardziej szczegółowoII Wydział Lekarski III. V zimowy. kierunkowy. nie. dr n. med. Iwona Rudnicka
Warszawski Uniwersytet Medyczny Dziekanat II Wydziału Lekarskiego 1. Metryczka Nazwa Wydziału: II Wydział Lekarski Program kształcenia Fizjoterapia studia licencjackie I stopnia, profil praktyczny, studia
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Bardziej szczegółowoS YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne. Lekarsko stomatologiczny (WLS)
S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne Nazwa modułu: Dermatologia i wenerologia Rodzaj modułu/przedmiotu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność - Poziom studiów Forma studiów Rok, semestr
Bardziej szczegółowoGorączka Q epidemiologia, patogeneza oraz diagnostyka laboratoryjna. Wskazówki dla lekarzy weterynarii i hodowców
Gorączka Q epidemiologia, patogeneza oraz diagnostyka laboratoryjna. Wskazówki dla lekarzy weterynarii i hodowców Agnieszka Warda-Sporniak Główny Inspektorat Weterynarii gorączka Q tabela 4 choroby rejestrowane
Bardziej szczegółowoMolecular diagnostics for your routine. Katalog produktów 2011
Molecular diagnostics for your routine Katalog produktów 2011 www.geneproof.com Spis treści Molecular diagnostics for your routine Spis treści O firmie... 2 Zalety zestawów GeneProof... 2 Technologia GeneProof...
Bardziej szczegółowoPCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Bardziej szczegółowo(Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE
19.7.2019 PL L 193/1 II (Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE DECYZJA WYKONAWCZA KOMISJI (UE) 2019/1244 z dnia 1 lipca 2019 r. zmieniająca decyzję 2002/364/WE w odniesieniu do wymogów dotyczących
Bardziej szczegółowoWYBRANE RODZAJE REAKCJI PCR. RAPD PCR Nested PCR Multipleks PCR Allelo-specyficzny PCR Real Time PCR
RAPD PR Nested PR Allelo-specyficzny PR Real Time PR RAPD PR (Random Amplification of Polymorphic DNA) wykorzystywany gdy nie znamy sekwencji starterów; pozwala namnożyć losowe fragmenty o różnej długości;
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Bardziej szczegółowoS YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne. Lekarsko stomatologiczny (WLS)
S YL AB US MODUŁ U ( PRZEDMIOTU) I nforma cje ogólne Nazwa modułu: Dermatologia i wenerologia Rodzaj modułu/przedmiotu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność - Poziom studiów Forma studiów Rok, semestr
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Wirusologia
Mikrobiologia - Wirusologia 5650 Wirus cytomegalii - przeciwciała (EQA 3 -sprawdzian zintegrowany) 3 próbki płynnego ludzkiego osocza (0,5 ml). Przeciwciała przeciwko CMV całkowite, klasy: IgG, IgM, IgG
Bardziej szczegółowoWykorzystanie techniki FilmArray w diagnostyce zakażeń dróg oddechowych u osób z niedoborami odporności
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 181-185 Wykorzystanie techniki FilmArray w diagnostyce zakażeń dróg oddechowych u osób z niedoborami odporności Application of FilmArray assay for detection of respiratory
Bardziej szczegółowoSylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
Bardziej szczegółowoProwadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II)
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią ============================================================================
Bardziej szczegółowoZAŁĄCZNIK DO PRZEGLĄDU ZLECEŃ
ZŁĄCZNIK DO PRZEGLĄDU ZLECEŃ Lp. Badany obiekt Badane cechy Metoda badawcza Metoda () kał, wymaz z kału, wymaz z odbytu, szczep Obecność pałeczek Salmonella i Shigella Metoda hodowlano- 1. biochemiczno-
Bardziej szczegółowoDiagnostyka zakażeń EBV
Diagnostyka zakażeń EBV Jakie wyróżniamy główne konsekwencje kliniczne zakażenia EBV: 1) Mononukleoza zakaźna 2) Chłoniak Burkitta 3) Potransplantacyjny zespół limfoproliferacyjny Jakie są charakterystyczne
Bardziej szczegółowoWalidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie
Bardziej szczegółowoRT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6
RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy
Bardziej szczegółowoCzęstość występowania aktywnych zakażeń wirusami z rodziny Herpesviridae wśród członków rodzin wychowujących dzieci
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 115-119 Częstość występowania aktywnych zakażeń wirusami z rodziny Herpesviridae wśród członków rodzin wychowujących dzieci The prevalence of active infection with viruses
Bardziej szczegółowoMATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ
MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ Puławy 2013 Opracowanie: Prof. dr hab. Iwona Markowska-Daniel, mgr inż. Kinga Urbaniak,
Bardziej szczegółowoScenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej
Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej Temat lekcji: Planowanie doświadczeń biologicznych jak prawidłowo zaplanować próbę kontrolną? Cele kształcenia IV etap edukacyjny: 1. Wymagania ogólne:
Bardziej szczegółowoEDYTA KATARZYNA GŁAŻEWSKA METALOPROTEINAZY ORAZ ICH TKANKOWE INHIBITORY W OSOCZU OSÓB CHORYCH NA ŁUSZCZYCĘ LECZONYCH METODĄ FOTOTERAPII UVB.
Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Uniwersytet Medyczny w Białymstoku EDYTA KATARZYNA GŁAŻEWSKA METALOPROTEINAZY ORAZ ICH TKANKOWE INHIBITORY W OSOCZU OSÓB CHORYCH NA ŁUSZCZYCĘ
Bardziej szczegółowoPytania z zakresu ginekologii i opieki ginekologicznej
Pytania z zakresu ginekologii i opieki ginekologicznej - 2017 1. Proszę wymienić zagrożenia zdrowotne dla kobiety jakie mogą wystąpić w okresie okołomenopauzalnym. 2. Proszę omówić rolę położnej w opiece
Bardziej szczegółowoColor Compensation Set (FAM, HEX, Texas Red, Cy5)
Color Compensation Set (FAM, HEX, Texas Red, Cy5) Zestaw do wykonania kompensacji kolorów na urządzeniach LightCycler 480 System I/II Nr kat.: OTH02 Wielkość zestawu: 2 procedury kompensacji koloru Objętość
Bardziej szczegółowoAnaliza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych
Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych Dr n. med. Joanna Walczak- Sztulpa Katedra i Zakład Genetyki Medycznej Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Diagnostyka
Bardziej szczegółowoTESTY IMMUNOCHROMATOGRAFICZNE
TESTY IMMUNOCHROMATOGRAFICZNE Wśród innowacyjnych technologii warto zwrócić uwagę na szybkie testy diagnostyczne (ang. rapid diagnostic test). Ze względu na krótki czas wykonania coraz szerzej zyskują
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Bardziej szczegółowoWpływ wybranych czynników przedanalitycznych na wyniki oznaczeń wirusowego DNA metodą PCR
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 151-158 Wpływ wybranych czynników przedanalitycznych na wyniki oznaczeń wirusowego DNA metodą PCR Influence of selected preanalytical factors on viral DNA detection by
Bardziej szczegółowoWYKRYWANIE DNA WIRUSA CYTOMEGALII U PACJENTÓW SAMODZIELNEGO PUBLICZNEGO CENTRALNEGO SZPITALA KLINICZNEGO W WARSZAWIE W LATACH
PRZEGL EPIDEMIOL 2007; 61: 667-673 Tomasz Dzieciątkowski 1,2, Maciej Przybylski 1,2, Agata Sulowska 2, Maja Mucha 3, Mirosław Łuczak 1,2 WYKRYWANIE DNA WIRUSA CYTOMEGALII U PACJENTÓW SAMODZIELNEGO PUBLICZNEGO
Bardziej szczegółowoZastosowanie reakcji duplex real-time PCR do identyfikacji wirusów grypy podtypu A(H1)pdm09 i A(H3)
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 129-137 1 Zastosowanie reakcji duplex real-time PCR do identyfikacji wirusów grypy podtypu A(H1)pdm09 i A(H3) Development of duplex real-time PCR assay for identification
Bardziej szczegółowoDiagnostyka parazytoz jak sprawdzić z kim mamy do czynienia?
https://www. Diagnostyka parazytoz jak sprawdzić z kim mamy do czynienia? Autor: Anna Bartosik Data: 24 kwietnia 2019 W poprzedniej części naszego kompendium wiedzy o pasożytach świń odpowiedzieliśmy na
Bardziej szczegółowoSpis Treści. Przedmowa... 11
Spis Treści Przedmowa................................................ 11 Rozdział 1 Wybrane zagadnienia z anatomii i fizjologii jamy ustnej Maria Anna Nowakowska.................................. 13 1.1.
Bardziej szczegółowoMagdalena Durlik Klinika Medycyny Transplantacyjnej i Nefrologii Instytut Transplantologii Warszawski Uniwersytet Medyczny
Magdalena Durlik Klinika Medycyny Transplantacyjnej i Nefrologii Instytut Transplantologii Warszawski Uniwersytet Medyczny Ryzyko przeniesienia choroby od dawcy do biorcy przeszczepu Zakażenia bakteryjne,
Bardziej szczegółowoANALIZA WRAŻLIWOŚCI IN VITRO KLINICZNYCH IZOLATÓW HERPESWIRUSA CZŁOWIEKA TYPU 1 (HIV-1) NA ACYKLOWIR I CIDOFOWIR
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 163-168 Beata Cieśluk, Tomasz Dzieciątkowski, Anna Majewska, Mirosław Łuczak ANALIZA WRAŻLIWOŚCI IN VITRO KLINICZNYCH IZOLATÓW HERPESWIRUSA CZŁOWIEKA TYPU 1 (HIV-1) NA
Bardziej szczegółowoELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI
PAŃSTWOWY ZAKŁAD HIGIENY INSTYTUT NAUKOWO-BADAWCZY ELIMINACJA ODRY/RÓŻYCZKI PROGRAM WHO REALIZACJA W POLSCE - ZASADY - INSTRUKCJE ZAKŁAD WIRUSOLOGII UL. CHOCIMSKA 24 00-791 WARSZAWA PROGRAM ELIMINACJI
Bardziej szczegółowoDiagnostyka HIV 1. Na czym polegają testy HIV? a) testy przesiewowe
Diagnostyka HIV 1. Na czym polegają testy HIV? a. testy przesiewowe b. test Western blot 2. Kto powinien zrobić sobie test na HIV? 3. Kiedy wykonywać testy HIV? 4. Dzieci kobiet zakażonych HIV 5. Gdzie
Bardziej szczegółowoBiologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
Bardziej szczegółowoMED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 23-28
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 23-28 Przydatność wielokierunkowej diagnostyki mikrobiologicznej na przykładzie jednoczesnego zakażenia czterema herpeswirusami jako powikłania po allogenicznym przeszczepieniu
Bardziej szczegółowoRegina B.Podlasin Wojewódzki Szpital Zakaźny w Warszawie
Regina B.Podlasin Wojewódzki Szpital Zakaźny w Warszawie http://www.ptnaids.pl/ Gorączka, zapalenie gardła, powiększenie węzłów chłonnych Zakażenie wirusem Epsteina-Barr (EBV) = mononukleoza zakaźna Zakażenie
Bardziej szczegółowoDiagnostyka i monitorowanie cukrzycy i chorób nerek
Diagnostyka i monitorowanie cukrzycy i chorób nerek Business Development Manager Konferencja naukowo-szkoleniowa Ryn Badania laboratoryjne w chorobach nerek Wyzwaniem dla współczesnej medycyny jest badanie
Bardziej szczegółowoMetody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
Bardziej szczegółowo