Wykrywanie oraz różnicowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 metodą real-time PCR z wykorzystaniem sond HybProbe
|
|
- Karolina Helena Tomczak
- 7 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: Emilia Chudzik 2, Karolina Karabin 2, Tomasz Dzieciątkowski 1, Anna Majewska 1, Maciej Przybylski 1, Anna Midak-Siewirska 1, Mirosław Łuczak 1,Grażyna Młynarczyk 1 Wykrywanie oraz różnicowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 metodą real-time PCR z wykorzystaniem sond HybProbe 1 Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny Kierownik: prof. dr hab. G. Młynarczyk 2 Wydział Rolnictwa i Biologii, Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego Kierownik: prof. dr hab. B. Zagdańska Celem pracy była optymalizacja metody real-time PCR do wykrywania oraz różnicowania zakażeń ludzkimi wirusami opryszczki typu 1 i 2, zwłaszcza w przypadkach infekcji przebiegających z niewielkim nasileniem replikacji patogenu. Herpeswirusy są grupą DNA-wirusów człowieka wywołujących powszechne zakażenia (14). Do zakażenia dochodzi w wyniku bezpośredniego kontaktu, podczas gdy wrota zakażenia stanowi błona śluzowa lub uszkodzona skóra. Cechą charakterystyczną wirusów opryszczki typu 1 i 2 (HSV-1 oraz HSV-2) jest zdolność wywoływania zakażeń objawowych o różnym obrazie klinicznym i nasileniu - począwszy od zakażeń skórnych, na neuroinfekcjach kończąc (14, 15). Zmiany skórne wywołane przez HSV-1 zwykle dotyczą skóry twarzy oraz błon śluzowych jamy ustnej, zaś HSV-2 wiązany jest z pierwotnym, lub wynikającym z reaktywacji latentnego wirusa zakażeniem skóry i błon śluzowych, zlokalizowanym najczęściej na skórze i błonach śluzowych narządów płciowych oraz w okolicy okołoodbytniczej (14). Oba te wirusy są także istotnym czynnikiem zakaźnym wielu neuroinfekcji, występujących zarówno wśród osób immunokompetentnych (2), jak i pacjentów z niedoborami immunologicznymi (5). Doniesienia piśmiennictwa wskazują jednak na fakt, iż wirus opryszczki typu 2 jest przyczyną zakażeń ośrodkowego układu nerwowego osób dorosłych, które wcześniej uważano za wywoływane przez HSV-1 (12). W chwili obecnej do laboratoryjnej diagnostyki zakażeń HSV-1/2 powszechnie stosuje się reakcję łańcuchowej polimeryzacji (PCR), która w wariancie tradycyjnym służyła głównie do jakościowego badania obecności (9) i różnicowania wirusa typu 1 od typu 2 (4), a stopniowo ulega zastąpieniu przez metodę ilościową real-time PCR (qpcr) (1, 3) Technika ta, ze względu na swą wysoką czułość oraz szybkość wykonania ma ogromne znaczenie w diagnozowaniu zakażeń w przypadkach neuroinfekcji oraz przy monitorowaniu skuteczności terapii przeciwwirusowej (11). System sond hybrydyzacyjnych HybProbe, zwanych też często sondami LightCycler, oparty jest na użyciu dwu sond oligonukleotydowych hybrydyzujących jedna za drugą do
2 256 E. Chudzik i inni Nr 3 sąsiadujących sekwencji w matrycowym DNA (6). Każda sonda wyznakowana jest innym fluoroforem; pierwsza sonda ma na końcu 3 fluoresceinę jako donor, druga zaś barwnik akceptorowy LightCycler Red na końcu 5. Dodatkowo grupa 3 OH sond HybProbes jest fosforylowana, by uniemożliwić polimerazie wydłużanie startera podczas reakcji PCR. Gdy fluorofory znajdą się w bliskim sąsiedztwie i donor zostanie wzbudzony przez zewnętrzne źródło światła, następuje między nimi transfer energii i fluorescencja (FRET) (6). Celem pracy było opracowanie oraz optymalizacja metody PCR z detekcją w czasie rzeczywistym do wykrywania i różnicowania DNA ludzkich wirusów opryszczki typu 1 i 2 oraz określenie jej czułości analitycznej. MATERIAŁ I METODY Do jakościowych badań techniką real-time PCR (określenie swoistości reakcji) użyto całogenomowego DNA wyizolowanego ze standardowego szczepu McIntyre ludzkiego wirusa opryszczki typu 1 (ATCC nr. VR-539) oraz szczepu MS ludzkiego wirusa opryszczki typu 2 (ATCC nr. VR-540). Jako ujemną kontrolę wykorzystano DNA wyekstrahowane z niezakażonej linii Vero, zaś za kontrole swoistości reakcji posłużyły preparaty DNA izolowanego z: wirusa ospy wietrznej/półpaśca (VZV), wirusa cytomegalii (CMV), wirusa Epsteina-Barr (EBV) oraz ludzkiego adenowirusa typu 7 (HAdV). Określenie czułości metody wykonano z zastosowaniem seryjnych 10-krotnych rozcieńczeń wzorcowego DNA HSV-1 oraz HSV-2 w jałowej, redestylowanej wodzie w zakresie od 10 0 do 10-5 (50-0,0005 ng/µl). Zakres ten, ustalony przy użyciu komercyjnego testu HSV-1/2 LC PCR Kit (Artus/ Qiagen ), odpowiadał 4,35 x ,00x10 2 kopii/ml dla HSV-1 i 4,18 x ,82 x 10 2 kopii/ml dla HSV-2. W celu opracowania starterów i sond do metody real-time PCR wykorzystano sekwencje DNA dostępne w internetowej bazie danych GenBank: dla wirusa opryszczki typu 1 kodującą gen US4 (NC ), zaś dla wirusa opryszczki typu 2 kodującą gen UL5 (NC ). Zaprojektowane do nich, z użyciem oprogramowania LightCycler Probe Design (Roche Diagnostics ), startery amplifikują fragmenty wirusowego genomu o długości odpowiednio, 100 i 127 par zasad (Tabela I). Dodatkowo celem zwiększenia swoistości reakcji zastosowano sondy fluorescencyjne w układzie HybProbes, wyznakowane na końcu 5 fluorescencyjnym barwnikiem reporterowym LightCycler Red 640 (HSV-1) oraz Light- Cycler Red 670 (HSV-2) (Oligo ). Tabela I. Sekwencje użytych w doświadczeniach starterów i sond Typ wirusa Nazwa Sekwencja(5-3 ) HSV-1 HSV1_D ATC CAC ACC TTA TCG TTT TTG T HSV1_U CGT AAC GCA CGC TAG GGT HSV1_P1 GCG ACA CAC CTG TGT GGC GGT Fluoresceina HSV1_P2 LC Red 640 TCC AGA CGC GGG CGA CGC Fosforan HSV-2 HSV2_F CGC GAG TCA CCT TTA GGT A HSV2_R TTT GTC GTC CCG GAA AGT HSV2_P1 TGT GGG ACG AGA ACA GCC GCG Fluoresceina HSV2_P2 LC Red 670 ACC CCG GAA GGT TGG CCG GGT Fosforan
3 Nr 3 Wykrywanie wirusów opryszczki metodą real- time PCR 257 Badania techniką real-time PCR wykonywano w aparacie LightCycler 2.0 z użyciem zestawu amplifikacyjnego LightCycler HybProbe DNA Master (Roche Diagnostics ). Mieszanina reakcyjna o końcowej objętości 20 µl zawierała: 2 µl DNA; 1 μl MgCl 2 ; 2,25 µm starterów HSV1_D oraz HSV2_F; 1,75 µm starterów HSV1_U oraz HSV2_R oraz 75 nm każdej z sond. PCR rozpoczynał się etapem aktywacji (hot-start) termostabilnej DNA polimerazy przez 10 min w temp C, po którym następowało 40 cykli składających się z denaturacji 10 s w temp C, przyłączania starterów przez 10 s w temp C oraz wydłużania nici w temp C przez 10 s. Kolejnym etapem była analiza temperatury topnienia produktów (Melting Curves), podczas której próbki schłodzone do temp C podgrzewano przy gradiencie temperaturowym 0,1 0 C /s przy ciągłym pomiarze fluorescencji do temp C. Reakcję kończyło schłodzenie próbek do temp C na 60 sekund. Odczyt fluorescencji odbywał się przy długościach fali 640 nm (HSV-1) oraz 670 nm (HSV-2), odpowiednich dla zastosowanych barwników reporterowych LightCycler Red 640 i LightCycler Red 670. Wzrost poziomu fluorescencji był proporcjonalny do ilości produktu w mieszaninie. Dla porównania wykonano standardowy PCR służący do wykrywania i różnicowania typu 1 i 2 ludzkich herpeswirusów wg. Kimury (4) w końcowej objętości 50 µl z użyciem 10 µl wyizolowanego DNA. DNA szczepów laboratoryjnych McIntyre (HSV-1) i PT368 (HHV-2) służyło za kontrolę dodatnią. Kontrolę ujemną stanowiło DNA izolowane z niezakażonej linii Vero. Rozdziału produktów dokonywano poprzez elektroforezę w 1% żelu agarozowym zabarwionym bromkiem etydyny. Wizualizację przeprowadzano przy świetle ultrafioletowym za pomocą transiluminatora UV. Materiał do badań stanowiły 34 izolaty z hodowli komórkowych, pochodzących z kolekcji szczepów Katedry i Zakładu Mikrobiologii Lekarskiej WUM oraz 16 próbek surowicy krwi i płynu mózgowo-rdzeniowego, pobranych od pacjentów z Kliniki Neurologii Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego w latach Izolację DNA przeprowadzono przy użyciu zestawu High Pure Viral Nucleic Acid Kit (Roche Diagnostics ), zgodnie z procedurą dostarczoną przez producenta, zawieszając wyizolowane DNA w końcowej objętości 35 µl buforu elucyjnego. Wszystkie opisane powyżej badania prowadzono w dwukrotnych, niezależnych powtórzeniach. WYNIKI W opracowanej metodzie real-time PCR wynik dodatni, wyrażony wykładniczym przyrostem fluorescencji mieszaniny reakcyjnej, osiągnięto tylko w próbkach zawierających materiał genetyczny ludzkich wirusów opryszczki typu 1 i 2. W pozostałych próbkach, zawierających kontrolne DNA niezakażonej linii Vero, wirusa ospy wietrznej/półpaśca, wirusa cytomegalii, wirusa Epsteina-Barr oraz adenowirusa typu 7, nie zaobserwowano fluorescencji, co wskazuje na brak w nich swoistej amplifikacji kwasu nukleinowego. Obserwacja taka poczyniona dla próbek zawierających materiał genetyczny innych wirusów świadczy o wysokiej specyficzności metody (Ryc.1 i 2). Podczas określania zakresu czułości metody technika real-time PCR umożliwiała wykrycie DNA HSV-1 we wszystkich użytych rozcieńczeniach, zaś DNA HSV-2 zakresie od 10 0 do 10-4 (Ryc.3 i 4). W rozcieńczeniu 10-5 preparatu DNA wirusa opryszczki typu 2
4 258 E. Chudzik i inni Nr 3 Ryc.1 Wynik reakcji real-time PCR w kierunku wykrywania ludzkiego wirusa opryszczki typu 1. Krzywa oznaczona HSV-1 oznacza amplifikację DNA wirusa opryszczki typu 1. Wykres K (-) to kontrola ujemna (DNA izolowane z niezakażonej linii Vero), zaś wykresy: HSV-2, VZV, CMV, EBV oraz HAdV7 oznaczają kontrole specyficzności reakcji. Ryc.2 Wynik reakcji real-time PCR w kierunku wykrywania ludzkiego wirusa opryszczki typu 2. Krzywa oznaczona HSV-2 oznacza amplifikację DNA wirusa opryszczki typu 2. Wykres K (-) to kontrola ujemna (DNA izolowane z niezakażonej linii Vero), zaś wykresy: HSV-1, VZV, CMV, EBV oraz HAdV7 oznaczają kontrole specyficzności reakcji.
5 Nr 3 Wykrywanie wirusów opryszczki metodą real- time PCR 259 Ryc.3 Badanie czułości metody real-time PCR w kierunku wykrywania HSV-1. Poszczególne krzywe oznaczają amplifikację DNA seryjnych rozcieńczeń szczepu McIntyre w zakresie od 10 0 do Wykres K (-) to kontrola ujemna reakcji: DNA izolowane z niezakażonej linii Vero. nie wykryto, jednak odpowiada ono wiremii na poziomie kilkudziesięciu kopii na mililitr badanego materiału (Ryc.4). Ryc.4 Badanie czułości metody real-time PCR w kierunku wykrywania HSV-2. Poszczególne krzywe oznaczają amplifikację DNA seryjnych rozcieńczeń szczepu MS w zakresie od 10 0 do Wykres K (-) to kontrola ujemna reakcji: DNA izolowane z niezakażonej linii Vero. W użytej do porównania metodzie PCR połączonej z rozdziałem elektroforetycznym produktów (4) uzyskano także specyficzną amplifikację sekwencji HSV 1/2. Jednak roz-
6 260 E. Chudzik i inni Nr 3 cieńczenia DNA obu typów wirusa opryszczki amplifikowane konwencjonalną metodą PCR, dawały wynik dodatni w postaci widocznych prążków w żelu agarozowym wyłącznie w zakresie rozcieńczeń od 10 0 do 10-3 (Ryc.5). Ryc.5 Badanie czułości tradycyjnej metody PCR w kierunku wykrywania i różnicowania wirusów opryszczki typu 1 i 2. Poszczególne ścieżki elektroforetogramu oznaczają DNA pochodzące z seryjnych rozcieńczeń HSV-1/2 w zakiesie od 10 0 do 10-5 ; K (-) to kontrola ujemna reakcji - DNA izolowane z niezakażonej linii Vero; marker - wzorce masowe DNA 100 bp oraz 1 kbp (Invitrogen ). Izolaty z hodowli komórkowych oraz próbki kliniczne poddano opracowanej reakcji real-time PCR z użyciem sond fluoroscencyjnych typu HybProbe. Wzrost poziomu fluorescencji, będący następstwem przyrostu ilości produktu w mieszaninie zaobserwowano we wszystkich próbkach zawierających DNA izolowane ze szczepów wirusa namnożonych w hodowli komórkowej (31 określono jako HSV-1, a 3 jako HSV-2) oraz w 10 materiałach klinicznych (wszystkie typowano jako HSV-1). Pozostałe 6 próbek pochodzących od osób z podejrzeniem neuroinfekcji nie wykazało przyrostu fluorescencji podczas amplifikacji, co świadczy o braku w nich obecności sekwencji DNA typowych dla ludzkich wirusów opryszczki. DYSKUSJA Wirusy opryszczki typu 1 i 2 wywołują powszechne na całym świecie zakażenia o zróżnicowanym nasileniu i objawach, które często przybierają charakter atypowy i uogólniony. Dodatkowy problem stanowi fakt, że wirusy te po zakażeniu pierwotnym ustalają stan latencji w komórkach nerwowych, z których mogą ulec reaktywacji (14, 15). Częstość nawrotów oraz intensywność choroby zależą od wydolności układu immunologicznego gospodarza, zarówno od odpowiedzi humoralnej, jak i komórkowej (14).
7 Nr 3 Wykrywanie wirusów opryszczki metodą real- time PCR 261 Neuroinfekcje, w tym opryszczkowe zapalenie mózgu (herpes simplex encephalitis HSE) wciąż stanowią poważny problem diagnostyczny. Powszechnie stosowane testy ELISA wykazują niewielką skuteczność, zarówno z powodu niskiego poziomu przeciwciał anty-hsv w płynie mózgowo-rdzeniowym, jak i małej specyficzności w różnicowaniu serotypów wirusa (7). Pewna rolę mogą tu odgrywać metody diagnostyki obrazowej jak CT, MRI, EEG, czy badania CSF pod kontem zawartości leukocytów i białek, choć te testy nie wykazują się zbyt dużą czułością (np. EEG zaledwie 32,5%) (13). Mogą być one natomiast skuteczne w połączeniu z innymi badaniami (15). Często stosowana niegdyś biopsja mózgu, wyparta została przez technikę PCR, która jest obecnie metodą z wyboru w diagnostyce HSE (8). Wariant real-time PCR prócz zwiększonej czułości, umożliwia również określenie ilości kopii DNA wirusa w badanej próbce (11). Aspekt ten jest bardzo przydatny przy określaniu obciążenia wirusem (viral load), co pozwala na monitorowanie statusu pacjentów podczas terapii antywirusowej (11). Miano wirusa we krwi może być także pomocne przy określaniu jego patogenności (3). Większość negatywnych opinii dotyczących metodyki qpcr odnosi się do wysokiego kosztu zarówno samego urządzenia, jak i jego eksploatacji. Są to jednak pozory, udowodniono bowiem, że zakup nowej aparatury pozwala często znacznie obniżyć czas i koszty związanie ze zleceniami badań innemu laboratoriom (10). Uzyskane rezultaty sugerują możliwość zastosowania real-time PCR do wykrywania i różnicowania zakażeń wywołanych przez wirusy opryszczki pospolitej, szczególnie w przypadkach nauroinfekcji i u pacjentów z niedoborami odporności. Obecnie w Polsce rozpoznanie zakażeń o etiologii opryszczkowej dokonuje się głównie na podstawie objawów klinicznych, co może prowadzić do błędów i pomyłek z innymi infekcjami wirusowymi. Nieprawidłowa diagnoza może skutkować wdrożeniem błędnego leczenia, poza tym szybkie rozpoznanie czynnika etiologicznego wpływa w znacznym stopniu na rokowania pacjenta i zwiększa jego szanse na wyleczenie. Opracowana technika wydaje się być szczególnie przydatna przy wykrywaniu zakażeń centralnego układu nerwowego, gdzie wirus występuje w bardzo niskich mianach. Ze względu na wysoką swoistość, czułość i szybkość detekcji mogłaby stać się metodą z wyboru w przypadku zakażeń CNS (1). E.Chudzik, K.Karabin, T. Dzieciątkowski, M. Przybylski, A.Majewska, A.Midak-Siewirska, G. Młynarczyk Development of a novel real-time PCR method for detection of HSV types 1 and 2 DNA using HybProbe chemistry SUMMARY Herpes simplex viruses types 1 and 2 are members of the Alphaherpesviridae subfamily, as they can infect both skin and nerves and develop latent infection within the dorsal root and trigeminal ganglia. Infections with these viruses are common worldwide and cause wide range of clinical syndromes. Although HSV-1/2 infect healthy children and adults, disease is more severe and extensive in the immunocompromised individuals and/or during neuroinfections. The aim of the study was development of real-time PCR assay for detection and differentiation of herpes simplex viruses type 1 and 2. DNA in clinical samples, using specific dual-channel HybProbe chemistry. The nalytical
8 262 E. Chudzik i inni Nr 3 sensitivity of assay was tested using serial dilutions of HSV-1 and HSV-2 DNA in range between 10 0 and 10-5 (4,35x10 5-4,00x10 2 copies/ml and 4,18x10 5-3,82x10 2 copies/ml, respectively). Thirty four cell line isolates and sixteen clinical samples taken from a group of adult patients with neurological signs were tested for the presence of HSV-1/2 DNA in the LightCycler instrument. Described inhouse real-time PCR assay detected herpesviral DNA in all cell line isolates (31 of them were HSV-1 positive; 3 were HSV-2 positive) and in 10 clinical samples (positive only for HSV-1). The conclusion is that developed HybProbe-based real-time PCR test is very reliable and valuable tool for detection and differentiation of HSV-1/2 viremia in different kind of samples. The high level of sensitivity and accuracy provided by this assay is favorable for the quantification of herpes simplex virus 1 and 2 DNA in clinical specimens, especially during low-copy infections. PIŚMIENNICTWO 1. Drago L, Lombardii A, Vecchi ED i inni. Comparison of nested PCR and real-time PCR of herpesvirus infections of central nervous system in HIV patients. BMC Infect Dis; 2004; 4: Huppatz C, Durrheim DN, Levi C i inni. Etiology of encephalitis in Australia, Emerg Infect Dis; 2009; 15: Kawada J, Kimura H, Ito Y i inni. Comparison of real-time PCR and nested PCR assays for detection of herpes simplex virus DNA. Microbiol Immunol; 2004; 48: Kimura H, Shibata M, Kuzushima K i inni. Detection and direct typing of herpes simplex virus by polymerase chain reaction. Med Microbiol Immunol (Berl.); 1990; 179: Li JZ, Sax PE. HSV-1 encephalitis complicated by cerebral hemorrhage in an HIV-positive person. AIDS Read; 2009; 19: Mackay IM, Arden KE, Nitsche A. Real-time PCR in virology. Nucl Acids Res; 2002; 30: Madhavan HN, Priya K, Anand AR i inni. Detection of herpes simplex virus (HSV) genome using polymerase chain reaction (PCR) in clinical samples. Comparison of PCR with standard laboratory methods for the detection of HSV. J Clin Virol; 1999; 14: Matar GM, Khoudoud W A, Fayad M i inni. Herpes simplex encephalitis casus with typical and atypical symptoms confirmed by PCR-amplification of the DNA polymerase gene. Eastern J Med; 2000; 5: Puchhammer-Stöckl E, Popow-Kraupp T, Heinz FX i inni. Establishment of PCR for the early diagnosis of herpes simplex encephalitis. J Med Virol; 1990; 32: Rand K, Houck H, Lawrence R. Real-time polymerase chain reaction detection of herpes simplex virus in cerebrospinal fluid and cost savings from earlier hospital discharge. J Mol Diagn; 2005; 7: Schloss L, Falk KI, Skoog E i inni. Monitoring of herpes simplex virus DNA types 1 and 2 viral load in cerebrospinal fluid by real-time PCR in patients with herpes simplex encephalitis. J Med Virol; 2009; 81: Tang JW, Coward LJ, Davies NWS i inni. Brain stem encephalitis caused by primary herpes simplex 2 infection in a young woman. J Neurol Neurosurg Psych; 2003; 74: Ustymowicz A, Łukaszewicz A, Tarasów E i inni. Diagnostyka obrazowa opryszczkowego zapalenia mózgu u dorosłych. Pol Przegl Neurol; 2006; 2: Whitley RJ, Roizman B. Herpes simplex viruses. W: Clinical virology. Red. D.D. Richman, R.J. Whitley, F.G. Hayden, ASM Press, Washington 2002, Whitley RJ. Herpes simplex encephalitis: adolescents and adult. Antiviral Research; 2006; 71: Otrzymano: 8 VI 2010 r. Adres autora: Warszawa, ul. Chałubińskiego 5, Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny
ZASTOSOWANIE TECHNIKI REAL-TIME PCR DO WYKRYWANIA DNA LUDZKIEGO WIRUSA OPRYSZCZKI TYPU 1
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 85-92 1 Anna Midak-Siewirska 1, Karolina Karabin 2, Emilia Chudzik 2, Tomasz Dzieciątkowski 1, Maciej Przybylski 1, Anna Majewska 1, Mirosław Łuczak 1, Grażyna Młynarczyk
Bardziej szczegółowoWykorzystanie nowej techniki multiplex real-time PCR do wykrywania i różnicowania DNA wirusów opryszczki typu 1 i 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2015, 67: 125-132 Wykorzystanie nowej techniki multiplex real-time PCR do wykrywania i różnicowania DNA wirusów opryszczki typu 1 i 2 Novel multiplex real-time PCR assay for detection
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody real-time PCR do wykrywania RNA enterowirusów człowieka
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2010, 62: 245-253 Katarzyna Leś 2, Maciej Przybylski 1,2, Tomasz Dzieciątkowski 1,2, Grażyna Młynarczyk 1,2 Zastosowanie metody real-time PCR do wykrywania RNA enterowirusów człowieka
Bardziej szczegółowoPakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time PCR część 67
Pakiet 3 Zestawy do izolacji, detekcji i amplifikacji badań grypy i Borrelia met. real time część 7 L.p. Przedmiot zamówienia Wymagania jakościowe Producent i nr katalogowy dla produktu równowaŝnego Ilość
Bardziej szczegółowoWYKORZYSTANIE METODY REAL-TIME PCR DO WYKRYWANIA DNA LUDZKIEGO HERPESWIRUSA TYPU 6
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 259-265 Tomasz Dzieciątkowski 1, Maciej Przybylski 1, Małgorzata Gieryńska 2, Mirosław Łuczak 1 WYKORZYSTANIE METODY REAL-TIME PCR DO WYKRYWANIA DNA LUDZKIEGO HERPESWIRUSA
Bardziej szczegółowoMODYFIKACJA I OPTYMALIZACJA METOD PCR DO WYKRYWANIA REGIONU MIE LUDZKIEGO HERPESWIRUSA TYPU 5
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 79-86 Łukasz Chabros 1, Maciej Przybylski 2, Tomasz Dzieciątkowski 2, Mirosław Łuczak 2 MODYFIKACJA I OPTYMALIZACJA METOD PCR DO WYKRYWANIA REGIONU MIE LUDZKIEGO HERPESWIRUSA
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV
Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV Cel ćwiczenia Określenie podatności na zakażenie wirusem HIV poprzez detekcję homo lub heterozygotyczności
Bardziej szczegółowoMETODA REAL - TIME PCR W DIAGNOSTYCE ZAKAŻEŃ WIRUSEM EPSTEINA-BARR
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2009, 61: 253-258 Agnieszka Trzcińska, Joanna Siennicka METODA REAL - TIME PCR W DIAGNOSTYCE ZAKAŻEŃ WIRUSEM EPSTEINA-BARR Zakład Wirusologii NIZP-PZH w Warszawie Kierownik: doc.
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
Bardziej szczegółowoAmpliTest Babesia spp. (PCR)
AmpliTest Babesia spp. (PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla pierwotniaków z rodzaju Babesia techniką PCR Nr kat.: BAC21-100 Wielkość zestawu: 100 oznaczeń Objętość pojedynczej reakcji:
Bardziej szczegółowoAmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR)
AmpliTest Salmonella spp. (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzaju Salmonella techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Bardziej szczegółowoAmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR)
AmpliTest Chlamydia/Chlamydophila (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii z rodzajów Chlamydia i Chlamydophila techniką Real Time PCR Nr kat.: BAC18-50 BAC18-100 Wielkość
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa tel. 22 572 0735, 606448502
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych
Nr kat. PK15 Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania w moczu lub w kulturach komórkowych na 50 reakcji PCR (50µl), włączając w to kontrole Detekcja oparta jest na amplifikacji fragmentu genu crp (cysteine
Bardziej szczegółowoAmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR)
AmpliTest GMO screening-nos (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA terminatora NOS techniką Real Time PCR Nr kat.: GMO03-50 GMO03-100 Wielkość zestawu: 50 reakcji 100 reakcji Objętość pojedynczej
Bardziej szczegółowoOznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK25N Wersja zestawu: 1.2012 Zestaw do wykrywania spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Zestaw
Bardziej szczegółowoZakład Mikrobiologii, Samodzielny Publiczny Centralny Szpital Kliniczny 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2018, 70: 67-75 Porównanie testów real-time PCR do ilościowego oznaczania DNA wirusa cytomegalii z użyciem systemu LightCycler 2.0 u pacjentów hematologicznych Results comparison
Bardziej szczegółowoProwadzący: dr Lidia Boss znacznik fluorescencyjny (np. SYBR Green II)
Uniwersytet Gdański, Wydział Biologii Biologia i Biologia Medyczna II rok Katedra Biologii Molekularnej Przedmiot: Biologia Molekularna z Biotechnologią ============================================================================
Bardziej szczegółowoZestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych
Nr kat. PK24N Wersja zestawu: 1.2016 Zestaw do wykrywania phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych dwie oddzielne reakcje PCR 2x50 reakcji PCR (50 µl), włączając w to kontrole Detekcja
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Bardziej szczegółowoVZV EBV. AdV CMV HHV7 HHV8. BK virus HSV1 HSV2. Zestawy R-gene real-time PCR HHV6
INFEKCJE WIRUSOWE U PACJENTÓW Z IMMUNOSUPRESJĄ CMV HHV6 BK virus HSV1 EBV HHV7 HSV2 AdV VZV HHV8 Zestawy R-gene real-time PCR Jakościowa i ilościowa diagnostyka najważniejszych wirusów odpowiedzialnych
Bardziej szczegółowoWYKRYWANIE DNA WIRUSA CYTOMEGALII U PACJENTÓW SAMODZIELNEGO PUBLICZNEGO CENTRALNEGO SZPITALA KLINICZNEGO W WARSZAWIE W LATACH
PRZEGL EPIDEMIOL 2007; 61: 667-673 Tomasz Dzieciątkowski 1,2, Maciej Przybylski 1,2, Agata Sulowska 2, Maja Mucha 3, Mirosław Łuczak 1,2 WYKRYWANIE DNA WIRUSA CYTOMEGALII U PACJENTÓW SAMODZIELNEGO PUBLICZNEGO
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Goose Parvovirus
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego parwowirusa GPV u gęsi techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-GPV-200 AML-GPV-400 Wydanie
Bardziej szczegółowoDiagnostyka molekularna w OIT
Diagnostyka molekularna w OIT B A R B A R A A D A M I K K A T E D R A I K L I N I K A A N E S T E Z J O L O G I I I I N T E N S Y W N E J T E R A P I I U N I W E R S Y T E T M E D Y C Z N Y W E W R O C
Bardziej szczegółowoGenetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16
Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16 Ćwiczenie 3 Identyfikacja genetycznie modyfikowanych roślin w produktach spożywczych - jakościowe badanie obecności
Bardziej szczegółowoPCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific
PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific Specjalnie dla Was przetestowaliśmy w naszym laboratorium odczynniki firmy Thermo Scientific umożliwiające przeprowadzanie reakcji
Bardziej szczegółowoAmpliTest TBEV (Real Time PCR)
AmpliTest TBEV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla TBEV (Tick-borne encephalitis virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV03-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość pojedynczej
Bardziej szczegółowoAmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR)
AmpliTest Panel odkleszczowy (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji DNA specyficznych dla bakterii Borrelia burgdorferi, Anaplasma, Ehrlichia oraz pierwotniaków rodzaju Babesia (B. canis, B. gibsoni,
Bardziej szczegółowoDETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH
DETEKCJA PATOGENÓW POWODUJĄCYCH ZAPALENIE OPON MÓZGOWO-RDZENIOWYCH Detekcja enterowirusów Detekcja sześciu typów ludzkich herpeswirusów (HHV) Detekcja pięciu bakterii Seeplex Detekcja patogenów powodujących
Bardziej szczegółowo(Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE
19.7.2019 PL L 193/1 II (Akty o charakterze nieustawodawczym) DECYZJE DECYZJA WYKONAWCZA KOMISJI (UE) 2019/1244 z dnia 1 lipca 2019 r. zmieniająca decyzję 2002/364/WE w odniesieniu do wymogów dotyczących
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych
Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych Wstęp teoretyczny Technika RAPD (ang. Random Amplification of Polymorphic DNA) opiera się na prostej reakcji PCR, przeprowadzanej na genomowym
Bardziej szczegółowoDiagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej
Diagnostyka wirusologiczna w praktyce klinicznej Ponad 60% zakażeń w praktyce klinicznej jest wywołana przez wirusy. Rodzaj i jakość materiału diagnostycznego (transport!) oraz interpretacja wyników badań
Bardziej szczegółowoZakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, 02-097 Warszawa IZOLACJA DNA Z HODOWLI KOMÓRKOWEJ.
Bardziej szczegółowoPlatforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification
1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym
Bardziej szczegółowoOznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Bardziej szczegółowoCzęść I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKOWANIA JEDNOSTK OWA VAT % RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji
Bardziej szczegółowoCzęstość występowania aktywnych zakażeń wirusami z rodziny Herpesviridae wśród członków rodzin wychowujących dzieci
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 115-119 Częstość występowania aktywnych zakażeń wirusami z rodziny Herpesviridae wśród członków rodzin wychowujących dzieci The prevalence of active infection with viruses
Bardziej szczegółowoTaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
Bardziej szczegółowoWYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ
Strona/ stron 1/8 WYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ Symbol oznacza metody akredytowane, zawarte w Zakresie
Bardziej szczegółowoDiagnostyka zakażeń EBV
Diagnostyka zakażeń EBV Jakie wyróżniamy główne konsekwencje kliniczne zakażenia EBV: 1) Mononukleoza zakaźna 2) Chłoniak Burkitta 3) Potransplantacyjny zespół limfoproliferacyjny Jakie są charakterystyczne
Bardziej szczegółowoWykorzystanie techniki FilmArray w diagnostyce zakażeń dróg oddechowych u osób z niedoborami odporności
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2013, 65: 181-185 Wykorzystanie techniki FilmArray w diagnostyce zakażeń dróg oddechowych u osób z niedoborami odporności Application of FilmArray assay for detection of respiratory
Bardziej szczegółowoĆwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
Bardziej szczegółowoCzęść I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO.
Załącznik 4a Część I Zakup zestawów diagnostycznych do GMO. NAZWA WIELKOŚC OPAKNIA RAZEM WARTOŚĆ 1 2 3 4 5 6 7 8=4*7 9 10 11 1. Zestaw do izolacji DNA - zestaw służący do izolacji DNA z surowego materiału
Bardziej szczegółowoGRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
Bardziej szczegółowoAmpli-LAMP Salmonella species
Novazym Products Novazym Polska ul. Żywokostowa 23, 61-680 Poznań, tel. +48 0 61 610 39 10, fax +48 0 61 610 39 11, email info@novazym.com Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego bakterii z rodzaju
Bardziej szczegółowoKatedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny w Warszawie 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 139-149 Opracowanie metody PCR w czasie rzeczywistym do wykrywania wirusa ospy wietrznej i półpaśca z wykorzystaniem fluorescencyjnej sondy typu TaqMan TaqMan fluorescent
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Wirusologia
5650 Wirus cytomegalii - przeciwciała Mikrobiologia - Wirusologia 3 próbki płynnego ludzkiego osocza (>0,7 ml). Przeciwciała przeciwko CMV całkowite, klasy: IgG, IgM, IgG awidność i komentarz 5635 Wirus
Bardziej szczegółowoOpis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów
Załącznik nr 1 do SIWZ Nazwa i adres Wykonawcy Opis przedmiotu zamówienia wraz z wymaganiami technicznymi i zestawieniem parametrów Przedmiot zamówienia; automatyczny system do diagnostyki molekularnej:
Bardziej szczegółowoWYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ
Strona/ stron 1/6 WYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ Symbol oznacza metody akredytowane, zawarte w Zakresie
Bardziej szczegółowoĆwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO
Ćwiczenie numer 6 Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO 1. Informacje wstępne -screening GMO -metoda CTAB -qpcr 2. Izolacja DNA z soi metodą CTAB 3. Oznaczenie ilościowe i jakościowe DNA
Bardziej szczegółowoWYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ
Strona/ stron 1/7 WYKAZ METODYK BADAWCZYCH STOSOWANYCH DO BADAŃ MATERIAŁU BIOLOGICZNEGO WYKONYWANYCH W ODDZIALE LABORATORYJNYM MIKROBIOLOGII KLINICZNEJ Symbol oznacza metody akredytowane, zawarte w Zakresie
Bardziej szczegółowoANALIZA WRAŻLIWOŚCI IN VITRO KLINICZNYCH IZOLATÓW HERPESWIRUSA CZŁOWIEKA TYPU 1 (HIV-1) NA ACYKLOWIR I CIDOFOWIR
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 163-168 Beata Cieśluk, Tomasz Dzieciątkowski, Anna Majewska, Mirosław Łuczak ANALIZA WRAŻLIWOŚCI IN VITRO KLINICZNYCH IZOLATÓW HERPESWIRUSA CZŁOWIEKA TYPU 1 (HIV-1) NA
Bardziej szczegółowoWystępowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 w zmianach skórnych i śluzówkowych u chorych z podejrzeniem opryszczki narządów płciowych
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2016, 68: 57-62 Występowanie wirusów opryszczki typu 1 i 2 w zmianach skórnych i śluzówkowych u chorych z podejrzeniem opryszczki narządów płciowych The occurrence of herpes simplex
Bardziej szczegółowoGlimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
Bardziej szczegółowoApplied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym
Applied Biosystems 7500 Fast Real Time PCR System, czyli Mercedes wśród termocyklerów do analizy PCR w czasie rzeczywistym Rynek aparatury laboratoryjnej pęka w szwach od ilości różnych aparatów przeznaczonych
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Wirusologia
5650 Wirus cytomegalii - przeciwciała Mikrobiologia - Wirusologia 3 próbki płynnego ludzkiego osocza (>0,7 ml). Przeciwciała przeciwko CMV całkowite, klasy: IgG, IgM, IgG awidność i komentarz 5635 Wirus
Bardziej szczegółowoOFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII Opracowanie zestawu do wykrywania DNA Aspergillus flavus za pomocą specjalistycznego sprzętu medycznego. Jednym
Bardziej szczegółowoMikrobiologia - Wirusologia
Mikrobiologia - Wirusologia 5650 Wirus cytomegalii - przeciwciała (EQA 3 -sprawdzian zintegrowany) 3 próbki płynnego ludzkiego osocza (0,5 ml). Przeciwciała przeciwko CMV całkowite, klasy: IgG, IgM, IgG
Bardziej szczegółowoDETEKCJA PATOGENÓW DRÓG MOCZOWO-PŁCIOWYCH
DETEKCJA PATOGENÓW DRÓG MOCZOWO-PŁCIOWYCH Detekcja i identyfikacja 7 patogenów dróg moczowo-płciowych Detekcja Neisseria gonorrhoeae i Chlamydia trachomatis Detekcja Trichomonas vaginalis i Mycoplasma
Bardziej szczegółowoZastosowanie metody real-time PCR do wykrywania DNA ludzkiego poliomawirusa BK
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2011, 63: 81-87 Angelika Długosz 2, Sylwia Rynans 1, Tomasz Dzieciątkowski 1, Grażyna Młynarczyk 1 Zastosowanie metody real-time PCR do wykrywania DNA ludzkiego poliomawirusa BK
Bardziej szczegółowoTaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925
TaqNovaHS RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925 TaqNovaHS Polimeraza TaqNovaHS jest mieszaniną termostabilnej polimerazy DNA
Bardziej szczegółowoGenetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa
Markery genetyczne: definicja Marker genetyczny jest to cecha, która może być wykorzystana do identyfikacji osobników lub gatunków. Cechy markerów genetycznych Monogeniczny: warunkowany przez jeden gen
Bardziej szczegółowoMetody badania ekspresji genów
Metody badania ekspresji genów dr Katarzyna Knapczyk-Stwora Warunki wstępne: Proszę zapoznać się z tematem Metody badania ekspresji genów zamieszczonym w skrypcie pod reakcją A. Lityńskiej i M. Lewandowskiego
Bardziej szczegółowoLaboratoryjne rozpoznanie opryszczki narządów płciowych metoda immunofluorescencji bezpośredniej
Laboratoryjne rozpoznanie opryszczki narządów płciowych metoda immunofluorescencji bezpośredniej Laboratory diagnosis of genital herpes direct immunofluorescence method 1 2 2,,, 1 1 Katedra i Zakład Mikrobiologii
Bardziej szczegółowoKlub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie. Pracownia genetyki
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie Zadbaliśmy o to, żeby wyposażenie w Klubie Młodego Wynalazcy było w pełni profesjonalne. Ważne jest, aby dzieci i młodzież, wykonując doświadczenia korzystały
Bardziej szczegółowoScenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej
Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej Temat lekcji: Planowanie doświadczeń biologicznych jak prawidłowo zaplanować próbę kontrolną? Cele kształcenia IV etap edukacyjny: 1. Wymagania ogólne:
Bardziej szczegółowoKatedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej, Warszawski Uniwersytet Medyczny 2
PRZEGL EPIDEMIOL 0; 65: 333-338 Problemy zakażeń Sylwia Rynans,5, Tomasz Dzieciątkowski,, Rafał Krenke 3, Magdalena Grabczak 3, Agnieszka Kołkowska-Leśniak 4, Maciej Przybylski,, Agata Sulowska,, Ryszarda
Bardziej szczegółowoWirus zapalenia wątroby typu B
Wirus zapalenia wątroby typu B Kliniczne następstwa zakażenia odsetek procentowy wyzdrowienie przewlekłe zakażenie Noworodki: 10% 90% Dzieci 1 5 lat: 70% 30% Dzieci starsze oraz 90% 5% - 10% Dorośli Choroby
Bardziej szczegółowoWYBRANE RODZAJE REAKCJI PCR. RAPD PCR Nested PCR Multipleks PCR Allelo-specyficzny PCR Real Time PCR
RAPD PR Nested PR Allelo-specyficzny PR Real Time PR RAPD PR (Random Amplification of Polymorphic DNA) wykorzystywany gdy nie znamy sekwencji starterów; pozwala namnożyć losowe fragmenty o różnej długości;
Bardziej szczegółowoAnna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
Bardziej szczegółowoKatedra i Klinika Chorób Wewnętrznych, Pneumonologii i Alergologii, Warszawski Uniwersytet Medyczny 2. Zakład Mikrobiologii SP CSK w Warszawie 3
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2017, 69: 43-48 Wykorzystanie serologicznych i molekularnych metod w diagnostyce pierwotnego ostrego zapalenia wątroby spowodowanego przez ludzki herpeswirus typu 6 opis przypadku
Bardziej szczegółowoAutor: dr Mirosława Staniaszek
Zakład Hodowli Roślin Ogrodniczych Pracownia Genetyki i Hodowli Roślin Warzywnych Fot. J. Sobolewski Procedura identyfikacji genu Frl warunkującego odporność pomidora na Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici
Bardziej szczegółowoCENNIK DIAGNOSTYKA NIEPŁODNOŚCI MĘSKIEJ
CENNIK DIAGNOSTYKA NIEPŁODNOŚCI MĘSKIEJ AZOOSPERMIA badanie wykrywa delecje w regionie długiego ramienia chromosomu Y w fragmencie zwanym AZF, będące często przyczyną azoospermii lub oligospermii o podłożu
Bardziej szczegółowoMED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 23-28
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2014, 66: 23-28 Przydatność wielokierunkowej diagnostyki mikrobiologicznej na przykładzie jednoczesnego zakażenia czterema herpeswirusami jako powikłania po allogenicznym przeszczepieniu
Bardziej szczegółowoAmpliTest BVDV (Real Time PCR)
AmpliTest BVDV (Real Time PCR) Zestaw do wykrywania sekwencji RNA specyficznych dla wirusa BVD (Bovine Viral Diarrhea Virus) techniką Real Time PCR Nr kat.: RV01-50 Wielkość zestawu: 50 oznaczeń Objętość
Bardziej szczegółowoSerological markers of hepatitis B virus
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2018, 70: 77-82 Serologiczne markery wirusowego zapalenia wątroby typu B Serological markers of hepatitis B virus Joanna Wróblewska, Wiesława Chudobińska Kula, Marcin Ziuziakowski,
Bardziej szczegółowoprof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie
prof. Joanna Chorostowska-Wynimko Zakład Genetyki i Immunologii Klinicznej Instytut Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Sekwencyjność występowania zaburzeń molekularnych w niedrobnokomórkowym raku płuca
Bardziej szczegółowoHarmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5
Harmonogram zajęć z Mikrobiologii z parazytologią i Immunologii dla studentów II roku kierunku lekarskiego WL 2018/2019 GRUPA 5 GRUPY ĆWICZENIOWE 51, 52 : 8.00-10.30 Wtorek: 17.00-19.30 Data Godzina Rodzaj
Bardziej szczegółowoPL 217144 B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego
PL 217144 B1 RZECZPOSPOLITA POLSKA (12) OPIS PATENTOWY (19) PL (11) 217144 (13) B1 Urząd Patentowy Rzeczypospolitej Polskiej (21) Numer zgłoszenia: 391926 (22) Data zgłoszenia: 23.07.2010 (51) Int.Cl.
Bardziej szczegółowoPracownia Diagnostyki Molekularnej. kierownik dr n. med. Janusz Stańczak. tel. (22) tel. (22)
kierownik dr n. med. Janusz Stańczak tel. (22) 33 55 261 tel. (22) 33 55 278 e-mail jstanczak@zakazny.pl 1 / 6 1. Struktura Pracownia Diagnostyki Molekularnej (PDM) zawiera trzy działy: Mikrobiologii Klinicznej,
Bardziej szczegółowoKlinika Hematologii, Onkologii i Chorób Wewnętrznych, Warszawski Uniwersytet Medyczny 2
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2016, 68: 113-117 Wstępne badania nad występowaniem chromosomowej integracji ludzkiego herpeswirusa typu 6 (CI-HHV-6) wśród polskich biorców i dawców krwiotwórczych komórek macierzystych
Bardziej szczegółowoWirusy oddechowe jako czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych
Wirusy oddechowe jako czynniki etiologiczne zakażeń szpitalnych LEK MED. JOLANTA KLUZ-ZAWADZKA WIRUSY ODDECHOWE : Określenie kliniczne, związane z umiejscowieniem objawów zakażenia i drogą jego szerzenia
Bardziej szczegółowoZestawy do izolacji DNA i RNA
Syngen kolumienki.pl Gotowe zestawy do izolacji i oczyszczania kwasów nukleinowych Zestawy do izolacji DNA i RNA Katalog produktów 2012-13 kolumienki.pl Syngen Biotech Sp. z o.o., 54-116 Wrocław, ul. Ostródzka
Bardziej szczegółowoWpływ wybranych czynników przedanalitycznych na wyniki oznaczeń wirusowego DNA metodą PCR
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2012, 64: 151-158 Wpływ wybranych czynników przedanalitycznych na wyniki oznaczeń wirusowego DNA metodą PCR Influence of selected preanalytical factors on viral DNA detection by
Bardziej szczegółowoDIAGNOSTYKA WIRUSOWYCH ZAKAŻEŃ OŚRODKOWEGO UKŁADU NERWOWEGO ANALIZA WYNIKÓW RUTYNOWYCH BADAŃ LABORATORYJNYCH
MED. DOŚW. MIKROBIOL., 2008, 60: 253-258 Joanna Siennicka, Agnieszka Trzcińska DIAGNOSTYKA WIRUSOWYCH ZAKAŻEŃ OŚRODKOWEGO UKŁADU NERWOWEGO ANALIZA WYNIKÓW RUTYNOWYCH BADAŃ LABORATORYJNYCH Zakład Wirusologii
Bardziej szczegółowoZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ
ŻYW NO ŚĆ 3(20)Supl 1999 JOANNA CHMIELEWSKA, JOANNA KAWA-RYGIELSKA ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ S t r e s z c z e n i e W pracy podjęto próbę wykorzystania metody
Bardziej szczegółowoSylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
Bardziej szczegółowoMATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ
MATERIAŁY SZKOLENIOWE DLA ZAKŁADÓW HIGIENY WETERYNARYJNEJ W ZAKRESIE LABORATORYJNEJ DIAGNOSTYKI AFRYKAŃSKIEGO POMORU ŚWIŃ Puławy 2013 Opracowanie: Prof. dr hab. Iwona Markowska-Daniel, mgr inż. Kinga Urbaniak,
Bardziej szczegółowoRSV RHINO CMV. HCoV. Panel oddechowy Multi Well System (MWS) r-gene. hmpv EBV. AdV HPIV HSV VZV. HBoV. Bordetella pertussis
IDENTYFIKACJA PATOGENÓW ODDECHOWYCH hmpv HSV EV Legionella pneumophila HPIV AdV RSV EBV IB Chlamydophila pneumoniae RHINO HCoV IA Mycoplasma pneumoniae HBoV Bordetella pertussis VZV CMV Panel oddechowy
Bardziej szczegółowoZestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP
2014-07-17 Zestaw dydaktyczny EasyGenotyping PCR-RFLP - S. aureus genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP Celem ćwiczenia jest przeprowadzenie typowania genetycznego dostarczonych
Bardziej szczegółowoRT31-020, RT , MgCl 2. , random heksamerów X 6
RT31-020, RT31-100 RT31-020, RT31-100 Zestaw TRANSCRIPTME RNA zawiera wszystkie niezbędne składniki do przeprowadzenia syntezy pierwszej nici cdna na matrycy mrna lub całkowitego RNA. Uzyskany jednoniciowy
Bardziej szczegółowoBadanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9
Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów Rozdział 9 Wykrywanie jakościowe kukurydzy MON810, kukurydzy Bt-176 i soi Roundup Ready metodą PCR M. Querci, M. Maretti, M. Mazzara
Bardziej szczegółowoBiologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
Bardziej szczegółowoZałącznik nr 1 do Zapytania ofertowego... /miejscowość, data/
Załącznik nr 1 do Zapytania ofertowego... FORMULARZ OFERTOWY W odpowiedzi na zapytanie ofertowe z dnia.. złożone przez Biowet Puławy Sp. z o.o. Ja/my niżej podpisany/i (Imiona i nazwiska osób upoważnionych
Bardziej szczegółowoAnalysis of infectious complications inf children with acute lymphoblastic leukemia treated in Voivodship Children's Hospital in Olsztyn
Analiza powikłań infekcyjnych u dzieci z ostrą białaczką limfoblastyczną leczonych w Wojewódzkim Specjalistycznym Szpitalu Dziecięcym w Olsztynie Analysis of infectious complications inf children with
Bardziej szczegółowoKurs pt. " MOLEKULARNE METODY BADAŃ W MIKROBIOLOGII I WIRUSOLOGII "
Warszawa, 6 lutego 2011 r. Szanowna Pani! Szanowny Panie! Niniejszym uprzejmie informuję, że organizowany jest Kurs pt. " MOLEKULARNE METODY BADAŃ W MIKROBIOLOGII I WIRUSOLOGII " Kurs odbędzie się w dniach
Bardziej szczegółowo1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz:
Ćwiczenie 2 2018/19 1. Wykonanie preparatów bezpośrednich i ich ocena: 1a. Wykonaj własny preparat bezpośredni ze śliny Zinterpretuj i podkreśl to co widzisz: obecność nabłonków, leukocytów, pałeczek Gram(+),
Bardziej szczegółowostarszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg
STRESZCZENIE Przewlekła białaczka limfocytowa (PBL) jest najczęstszą białaczką ludzi starszych na półkuli zachodniej. Typową cechą choroby jest heterogenny przebieg kliniczny, zróżnicowane rokowanie. Etiologia
Bardziej szczegółowo