Zastosowanie metod molekularnych w identyfikacji gatunku, wieku i płci owadów użytecznych w entomologii sądowej
|
|
- Małgorzata Jankowska
- 8 lat temu
- Przeglądów:
Transkrypt
1 Joanna Stojak doktorantka w Zakładzie Genetyki i Ewolucji Instytutu Biologii Ssaków Polskiej Akademii Nauk w Białowieży jstojak@ibs.bialowieza.pl Zastosowanie metod molekularnych w identyfikacji gatunku, wieku i płci owadów użytecznych w entomologii sądowej Streszczenie Entomologia sądowa wykorzystuje owady do ustalania czasu i przyczyny śmierci, a nawet miejsca, w którym nastąpiła. W tym celu stosowane są dwie metody. Metoda rozwojowa opiera się na wzorcach rozwoju larw w określonych warunkach temperaturowo-środowiskowych. Metoda sukcesyjna analizuje występujące w różnych środowiskach wzorce pojawiania się poszczególnych taksonów na zwłokach. W obu tych metodach najistotniejszą kwestią jest poprawna identyfikacja gatunków. W poniższym artykule zaprezentowane zostały molekularne metody identyfikacji, takie jak barkoding DNA czy analiza krzywych denaturacji DNA o wysokiej rozdzielczości (DNA-HRM-PCR). Słowa kluczowe entomologia sądowa, barkoding DNA, mtdna, metody molekularne, identyfikacja gatunkowa Wstęp Entomologia sądowa jest nauką wykorzystującą owady na potrzeby wymiaru sprawiedliwości. Proces rozkładu zaczynający się w chwili śmierci i trwający aż do całkowitego zeszkieletowania jest procesem złożonym i nieodwracalnym, przeprowadzanym przez szereg drobnoustrojów i zwierząt. Informacje o czasie, miejscu czy przyczynie zgonu zazwyczaj uzyskiwane są po przeprowadzeniu sekcji sądowo-lekarskiej, na podstawie oceny wczesnych znamion pośmiertnych (m.in. plam opadowych, stężenia pośmiertnego, oziębienia pośmiertnego), czyli do 72 godzin po zaprzestaniu funkcji życiowych [1 2]. Po upływie tego czasu należy posłużyć się metodami oferowanymi przez inne dziedziny nauki, m.in. entomologię sądową. Badanie kolejności pojawiania się i rozwoju gatunków owadów nekrofilnych na zwłokach pozwala oszacować czas zgonu, natomiast znajomość zasięgów występowania poszczególnych gatunków owadów i ich preferencji środowiskowych umożliwia określenie miejsca zgonu oraz ustalenie, czy zwłoki zostały przemieszczone [3 5]. W początkowych stadiach rozkładu zwłoki zasiedlane są głównie przez przedstawicieli muchówek (Diptera), z których najważniejszą rodzinę stanowią plujkowate (Calliphoridae). W późniejszych stadiach rozkładu przeważają chrząszcze (Coleoptera) [6]. Podejrzewa się, że związane jest to z wydzielaniem przez larwy muchówek dużych ilości toksycznego dla larw chrząszczy amoniaku [7]. Znane są przypadki, gdy w warunkach niesprzyjających rozwojowi much (np. zbyt niska temperatura) chrząszcze z gatunku Necrodes littoralis samodzielnie przeprowadziły całkowity rozkład zwłok [8]. Podczas zbierania materiału entomologicznego nie wolno pominąć gatunków pojawiających się na zwłokach przypadkowo (m.in. os, mrówek, motyli) lub przeniesionych przez chrząszcze na drodze forezy (roztocza), stanowiących cenne dla ustalania okoliczności śmierci wskazówki [9 12]. W tradycyjnym podejściu identyfikację gatunkową przeprowadza się z wykorzystaniem specjalistycznych kluczy do oznaczania opartych na cechach morfologicznych. Często jest to jednak zadaniem żmudnym i skomplikowanym, a w przypadku posiadania jedynie fragmentu organizmu czy jego formy młodocianej często niemożliwym. Opracowanie metody ułatwiającej identyfikację gatunkową stanowi kwestię priorytetową, angażującą także inne dziedziny, w tym najprężniej rozwijającą się biologię molekularną. 22 PK_286.indb :49:51
2 Identyfikacja gatunkowa z wykorzystaniem markerów genetycznych Jedną z metod identyfikacji gatunków, nazywaną barkodingiem DNA (DNA barcoding), zaproponował w 2003 roku Paul Hebert z Instytutu Bioróżnorodności Uniwersytetu Guelph w Kanadzie. Wykorzystując tę metodę, przeprowadził analizę setek dorosłych osobników motyli występujących w Kostaryce, bardzo podobnych do siebie morfologicznie, o których sądzono, że reprezentują jeden gatunek Astraptes fulgerator (Walch, 1775). Analiza ta ujawniła jednak, że w rzeczywistości badana grupa stanowiła kompleks złożony z 10 różnych gatunków [13 14]. Barkoding DNA wykorzystuje krótkie, wystandaryzowane sekwencje markerów genetycznych do identyfikacji gatunkowej osobnika, z którego te sekwencje pochodzą. Wybrane sekwencje powinny charakteryzować się niską zmiennością w obrębie gatunku (ok. 2%) i równocześnie wysoką zmiennością między gatunkami (ok. 10%) [13]. Projektowanie starterów do reakcji PCR oraz późniejszą standaryzację ułatwiają duża liczba powtórzeń w genomie i oflankowanie konserwatywnymi domenami. Istotna jest również długość sekwencji kodu paskowego krótkie fragmenty, z małą liczbą insercji/delecji, znacznie przyspieszają i ułatwiają identyfikację. W przeciwieństwie do metod tradycyjnych, do oznaczania gatunku na podstawie sekwencji markerowej wystarczą jedynie fragmenty organizmów (np. pióra, kości) czy stadia trudne w identyfikacji (np. larwy, nasiona) [15]. Odnalezienie jednej markerowej sekwencji DNA standardowej dla wszystkich organizmów okazuje się jednak zbyt skomplikowane, dlatego obecnie prowadzi się badania mające na celu odszukanie markerów DNA najbardziej odpowiednich dla poszczególnych grup organizmów. W przypadku zwierząt (zatem i owadów) najlepszy okazuje się fragment z 5 -końca mitochondrialnego genu podjednostki I oksydazy cytochromowej (cytochrome c oxidase subunit I COI), o długości 648 par zasad. W identyfikacji gatunkowej zastosowanie znajdują również inne regiony mitochondrialnego DNA (sekwencja cytochromu b, białka wchodzącego w skład kompleksu III łańcucha oddechowego oraz region kontrolny, zwany również pętlą D, będący najszybciej ewoluującą częścią genomu mitochondrialnego), a także markery jądrowe. Mitochondrialne DNA występuje w komórce w dużej liczbie kopii, jego kolista struktura zapewnia większą odporność na degradację, a geny (zazwyczaj) nie ulegają rekombinacji. Dlatego też jedynie markery jądrowe umożliwiają identyfikację i analizę hybryd. W analizach tych powszechne zastosowanie znajdują geny rybosomowego DNA (18S, 5,8S i 28S), oddzielone transkrybowanymi przekładkami ITS1 i ITS2 (internal transcribed spacer), stosowanymi jako sekwencje markerowe u grzybów [16], roślin [17 18] i zwierząt [19 20]. Jednak w dobie intensywnego rozwoju technik sekwencjonowania wysokoprzepustowego, gdy poznanie pełnej sekwencji genomowej dowolnego organizmu okazuje się coraz łatwiejsze i tańsze, metoda barkodingu DNA staje przed poważnym wyzwaniem. Opracowanie bazy sekwencji barkodowych wszystkich organizmów żywych zajmie naukowcom wiele lat, a do tej pory analiza obecnego w próbce DNA pozwoli jedynie na ustalenie, że należy ono do wskazanego przez bazę gatunku lub innego, dla którego jeszcze nie opisano sekwencji barkodowej. Mimo potrzeby dopracowania danych, barkoding DNA zasługuje na miano pełnoprawnego narzędzia taksonomicznego, użytecznego w entomologii sądowej. Wybierając metodę identyfikacji, należy pamiętać jednak, że to metody tradycyjne, opierające się na obserwacji cech morfologicznych, wciąż są najtańsze, najszybsze i zazwyczaj nie wymagają zniszczenia identyfikowanych okazów. Barkoding DNA staje się coraz popularniejszy w identyfikowaniu gatunków owadów istotnych dla entomologii sądowej, w szczególności plujek (Calliphoridae) i ich larw, podczas gdy równie istotne i znacznie trudniejsze w identyfikacji gatunki chrząszczy są niesłusznie pomijane. Zastosowanie barkodingu DNA w identyfikacji gatunków istotnych w entomologii sądowej Przeprowadzona przez Schroedera i in. [21] analiza powielonych i trawionych enzymem restrykcyjnym DraI fragmentów COI i COII (cytochrome oxidase subunit II, podjednostka II oksydazy cytochromowej) o długości 349 pz trzech gatunków Calliphoridae wykazała, że sekwencja gatunku Lucilia sericata (Meigen, 1826) różni się od sekwencji gatunku Calliphora vicina (Robineau-Desvoidy, 1830) 34 nukleotydami, a od sekwencji gatunku Calliphora vomitoria (Linnaeus, 1758) 30 nukleotydami. Gatunki Calliphora vicina i Calliphora vomitoria różnią się 15 nukleotydami. Natomiast analizy filogenetyczne Wellsa i Sperlinga [22] oparte na fragmencie COI ujawniły, że dystans genetyczny w obrębie pojedynczych gatunków Calliphoridae wynosi 1% i mniej, natomiast między gatunkami 3% i więcej. Meier i in. [23] przeanalizowali 1333 sekwencje COI z 449 gatunków Diptera w celu określenia sekwencji najlepiej identyfikujących gatunki i stworzenia tym samym gotowych narzędzi do potencjalnej identyfikacji osobników odłowionych na miejscu ujawnienia zwłok. Okazało się, że aż 21% gatunków nie ma indywidualnej sekwencji barkodowej. Analiza COI przeprowadzona przez Rolo i in. [24] dla 95 osobników z 7 gatunków z rodzin Musci- 23 PK_286.indb :49:51
3 dae i Calliphoridae (Musca autumnalis, Hydrotaea dentipes, Eudasyphora cyanella, Calliphora vicina, Calliphora vomitoria, Lucilia caesar, Pollenia rudis) potwierdziła przydatność metody w poprawnej identyfikacji z % skutecznością. Satysfakcjonujące wyniki uzyskali również Gil Arriortua i in. [25], analizujący sekwencję cytochromu b (o długości 307 pz) dla 185 osobników Calliphora vicina, Calliphora vomitoria, Lucilia sericata, Lucilia caesar, Lucilia ampullacea i Chrysomya albiceps. Równie popularne okazują się analizy fragmentu COI muchówek z rodziny ścierwicowatych (Sarcophagidae), w przypadku których problemem jest identyfikacja nie tylko larw (a nawet stadium ich rozwoju), ale i osobników dorosłych [26]. Jordaens i in. [27] przeprowadzili sekwencjonowanie COI dla 126 osobników z 56 gatunków ścierwicowatych z Europy Zachodniej, a Meiklejohn i in. [28 29] na podstawie analizy COI z 588 osobników zidentyfikowali barkodowe sekwencje dla 16 gatunków Sarcophagidae z Australii, a także opracowali skuteczną identyfikację stadiów larwalnych Sarcophaga impatiens (z 99,95% skutecznością). Do tej pory opublikowano jedynie dwie prace dotyczące barkodingu DNA chrząszczy istotnych w entomologii sądowej. W jednej z nich Schilthuizen i in. [30] analizowali z zastosowaniem markerowych sekwencji DNA chrząszcze z podrodziny zyzkowatych (Coleoptera: Leiodidae: Cholevinae). Małe rozmiary, trudności w oznaczaniu zarówno larw, jak i postaci dorosłych sprawiają, że mimo częstego odławiania przedstawicieli tej rodziny na zwłokach entomolodzy sądowi nie stosują ich nazbyt często do szacowania czasu zgonu. W badaniach wykorzystanych zostało 86 osobników (wybierano jedynie samce, ponieważ w tym przypadku identyfikacja gatunkowa jest niezwykle łatwa, wymaga jedynie izolacji kopulatora), należących do kilku rodzajów (Catops, Fissocatops, Apocatops, Choleva, Nargus, Ptomaphagus, Sciodrepoides), zebranych na terenie Holandii i Francji. Przeprowadzone analizy COI udowodniły, że metoda molekularna znacznie ułatwia i przyspiesza identyfikację gatunkową osobników z podrodziny zyzkowatych dystanse genetyczne między gatunkami wynosiły aż 9%, a w obrębie gatunków 4% lub mniej. Jedynie Catops nigricans i Catops fuscus nie zostały odseparowane tą metodą. Identyfikacja gatunku, wieku i płci z zastosowaniem innych metod molekularnych Niezwykle ciekawą metodą identyfikacji gatunkowej, łączącą kilka technik, jest metoda DNA-HRM- -PCR. Wykorzystuje ona łańcuchową reakcję polimerazy w czasie rzeczywistym (real-time PCR RT-PCR) oraz analizę krzywych denaturacji DNA o wysokiej rozdzielczości (high resolution melting HRM). DNA-HR- M-PCR umożliwia szybką detekcję i analizę jednonukleotydowych różnic (single nucleotide polymorphism SNP) w otrzymanych produktach PCR, na podstawie pomiaru zmian we fluorescencji, wywołanych odłączeniem się zinterkalowanego z kwasem nukleinowym barwnika podczas rozplatania się podwójnej nici DNA (tworzony jest tzw. profil topnienia DNA). Metodę wykorzystali Malewski i in. [31] do identyfikacji występujących w Polsce 16 istotnych w entomologii sądowej gatunków Calliphoridae. W reakcji PCR powielano dwa krótkie fragmenty COI, o długości 119 i 70 pz. Analiza HRM kilkunastu osobników należących do tego samego gatunku wykazała jedynie niewielkie różnice w krzywych denaturacji. Co więcej, czułość i dokładność metody umożliwiły przeanalizowanie zsyntezowanych oligonukleotydów Lucilia sericata z Polski, Francji, Anglii, Indii oraz USA pod kątem geograficznego zróżnicowania danych genetycznych, tak często utrudniającego poprawną identyfikację. Z kolei ocena wielkości genomów za pomocą cytometrii przepływowej (flow cytometry FCM) pozwala na identyfikację nie tylko gatunku, ale również płci osobnika. Technika FCM opiera się na pomiarze fluorescencji analizowanych komórek, umożliwiając ocenę właściwości fizykobiologicznych ich składników, takich jak np. kwasy nukleinowe. Metoda doskonale sprawdza się w przypadku gatunków blisko ze sobą spokrewnionych, uwidaczniając niezwykle subtelne różnice, trudne do uchwycenia przez inne metody molekularne. Co ważne, cytometria przepływowa doskonale sprawdza się także w identyfikacji gatunku i płci stadiów larwalnych. Potwierdzają to badania przeprowadzone przez Picard i in. [32], w których oszacowano wielkości genomów dla obu płci 17 istotnych w entomologii sądowej gatunków Diptera. Analizy te wykazały, że średnia wielkość wynosiła od 425,8 Mb w przypadku samicy Chrysomya rufifacies do 1197,4 Mb w przypadku samicy Haematobia irritans. Metody molekularne znajdują również zastosowanie w określaniu wieku form preimaginalnych owadów, zwłaszcza problematycznych poczwarek, w przypadku których twarda otoczka kokonu utrudnia obserwację zachodzących w osobniku subtelnych zmian i ocena wieku metodą morfologiczną wymaga niezwykłej wiedzy o zachodzących podczas przepoczwarzania procesach. Obliczenia te umożliwia analiza zależnej od wieku (stadium rozwoju) ekspresji genów (differentially expressed genes DEGs), polegająca na tworzeniu specyficznych gatunkowo profili prezentujących kaskadę hierarchicznie aktywowanych po sobie genów regulujących rozwój osobnika. Przeprowadzona następnie korelacja transkryptomu analizowanego osobnika i poszczególnych punktów pełnego profilu ekspresji genów pozwala na oszacowanie, na jakim etapie rozwoju się ów osobnik znajduje, a tym samym oszacowanie jego wieku. Podstawą tych analiz jest metoda qrt-pcr (quantitative real-time PCR), pozwalająca na określenie ilości powstającego 24 PK_286.indb :49:52
4 produktu w rzeczywistym czasie jego powstawania (jednoczesne namnażanie i monitorowanie ilości po każdym cyklu) [33]. Do tej pory opracowano profile DEGs dla dwóch gatunków istotnych w entomologii sądowej. W przypadku gatunku Lucilia sericata zidentyfikowane DEGs nie pozwalały na poprawne oszacowanie wieku poczwarki [34, 35], natomiast badania nad DEGs u Calliphora vicina pokazują, że metoda ta może stanowić alternatywę dla tradycyjnych metod szacowania wieku owadów [33]. Tę samą metodę zastosowano również do oceny wieku złożonych przez muchówki Lucilia sericata jaj, wykorzystując ekspresję trzech genów: bcd (obserwowany we wczesnym rozwoju jaja), sll (determinujący wzór grzbietowo-brzusznego ubarwienia, jego wysoka ekspresja obserwowana jest w gruczołach śliniankowych) oraz cs (warunkujący prawidłowe tworzenie się chityny podczas rozwoju kutikuli larw). Dzięki zróżnicowanemu poziomowi ekspresji wymienionych trzech genów w zależności od czasu, który upłynął od owipozycji, trwające kilkanaście godzin stadium jaja może być podzielone na mniejsze okresy, umożliwiając tym samym precyzyjne ustalenie jego wieku [34]. Podczas szacowania czasu zgonu i określania wieku form preimaginalnych niezwykle istotne są warunki środowiska. Zbyt niska temperatura może wywoływać okresowe zwolnienie rozwoju larw (diapauza), którego nieuwzględnienie w obliczeniach generuje poważne błędy. Brak morfologicznych różnic między larwą rozwijającą się prawidłowo i tą znajdującą się w stanie diapauzy uniemożliwiało do tej pory stworzenie skutecznej metody ich rozpoznawania. Porównanie profili ekspresji genów larw poza diapauzą i w jej trakcie pozwoliło na odnalezienie genów charakterystycznych dla tego procesu. W przypadku Sarcophaga crassipolpis obserwuje się podwyższoną ekspresję m.in. genów hsp23 i hsp70 [36, 37], u Lucilia cuprina m.in. hsp23 i hsp24 [38], a u Calliphora vicina m.in. hsp23, hsp24, hsp70 oraz AFBP [39]. Analiza zależnej od wieku ekspresji genów jest powszechnie stosowana w biologii molekularnej rozwoju, a wykorzystywane przez nią techniki i narzędzia z łatwością można wprowadzić do laboratoriów prowadzących sądowe analizy DNA. Zastosowanie mikromacierzy i pełne zautomatyzowanie metody zwiększa przepustowość analizy i zmniejsza ryzyko błędu, pozwalając również na dokładne przewidzenie ich poziomu w uzyskiwanych wynikach, spełniając tym samym założenia standardu Dauberta [34]. Podsumowanie Dokładna i poprawna identyfikacja gatunków użytecznych w entomologii sądowej jest niezwykle istotna, gdyż każdy błąd w oznaczeniu doprowadzić może do oskarżenia niewinnej osoby, podczas gdy przestępca nadal będzie pozostawał na wolności. Entomologia sądowa jest stosowana w wielu krajach, z których najwyższy poziom zaawansowania wykazują Stany Zjednoczone, Francja i Kanada. Na całym świecie znaleźć można jedynie 70 w pełni wykształconych i pracujących wyłącznie w tej specjalności naukowców [40]. Wyniki uzyskane z obserwacji procesu rozkładu zwłok (przeprowadzanych przez antropologów sądowych m.in. na Uniwersytecie Tennessee w USA) mogą być przenoszone do prawdziwych spraw kryminalnych, a działająca na terenie USA Amerykańska Narodowa Służba Oceaniczna i Meteorologiczna (The National Oceanic and Atmospheric Administration NOAA), gdzie dostępne są (za niską opłatą) dane temperaturowe prawie ze wszystkich regionów, stanowi źródło niezwykle cennych w szacowaniu czasu zgonu informacji [41]. W Polsce możliwości zastosowania owadów nekrofilnych do określania czasu zgonu bada sześć ośrodków: poznańsko-toruński, gdański, warszawski, krakowski, łódzki i katowicki. Niewątpliwie metody molekularne w istotny sposób podnoszą znaczenie analiz entomologicznych i stanowią ich cenne uzupełnienie. Podziękowania Dziękuję anonimowemu recenzentowi za cenne uwagi, które pomogły podnieść wartość tej publikacji. Bibliografia 1. Dix J.: Color atlas of forensic pathology, CRC Press LLC Shkrum M.J., Ramsay D.A.: Forensic pathology of trauma. Common problems for the pathologist, New Jersey Kaczorowska E., Pieśniak D., Szczerkowska Z.: Entomologiczne metody określania czasu śmierci, Archiwum Medycyny Sądowej i Kryminologii 2002, 52(2 3): Kaczorowska E., Pieśniak D., Szczerkowska Z.: Wykorzystanie metod entomologicznych w próbach określenia daty zgonu opis przypadków, Archiwum Medycyny Sądowej i Kryminologii 2004, 54 (2 3): Matuszewski S., Bajerlein D., Konwerski S.: Katalog owadów przydatnych do ustalania czasu śmierci w lasach Polski. Część 3: chrząszcze (Insecta; Coleoptera), Problemy Kryminalistyki 2010, 269: Gennard D.E.: Forensic Entomology. An introduction, Chichester Crowson R.A.: The biology of Coleoptera, London Kulshrestha P., Satpathy D.K.: Use of beetles in forensic entomology, Forensic Science International 2001, 120: Bharti M., Singh D.: Insect faunal succession on decaying rabbit carcasses in Punjab, India, Journal of Forensic Sciences 2003, 48 (5): Grassberger M., Frank C.: Temperature-related development of the parasitoid wasp Nasonia vitripennis as forensic indicator, Medical and Veterinary Entomology 2003, 17: PK_286.indb :49:52
5 11. Disney R.H.L., Munk T.: Potential use of Braconidae (Hymenoptera) in forensic cases, Medical and Veterinary Entomology 2004, 18: Medina A.G., Herrera L.G., Perotti M.A., Rios G.J.: Occurrence of Poecilochirus austroasiaticus (Acari: Parasitidae) in forensic autopsies and its application on postmortem interval estimation, Experimental and Applied Acarology 2013, 59: Hebert P.D.N., Cywinska A., Shelley L.B., dewaard J.R.: Biological identifications through DNA barcodes, Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences 2003, 270: Hebert P.D.N., Penton E.H., Burns J.M., Janzen D.H., Hallwachs W.: Ten species in one: DNA barcoding reveals cryptic species in the neotropical skipper butterfly Astraptes fulgerator, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 2004, 101: Bogdanowicz W., Draber-Mońko A., Malewski T.: Biologiczna metka, Academia 2008, 13: Seifert K.A.: Progress towards DNA barcoding of fungi, Molecular Ecology Resources 2009, 9 (Suppl.1): Mai J.C., Coleman A.W.: The internal transcribed spacer 2 exhibits a common secondary structure in green algae and flowering plants, Journal of Molecular Evolution 1997, 44: Alvarez I., Wendel J.F.: Ribosomal ITS sequences and plant phylogenetic inference, Molecular Phylogenetics and Evolution 2003, 29: Joseph N., Krauskopf E., Vera M.I., Michot B.: Ribosomal internal transcribed spacer 2 (ITS2) exhibits a common core of secondary structure in vertebrates and yeast, Nucleic Acids Research 1999, 27: Schultz J., Maisel S., Gerlach D., Müller T., Wolf M.: A common core of secondary structure of the internal transcribed spacer 2 (ITS2) throughout the Eukaryota, RNA 2005, 11(4): Schroeder H., Klotsbach H., Elias S., Augustin C., Pueschel K.: Use of PRC-RFLP for differentiation of calliphorid larvae (Diptera, Calliphoridae) on human corpses, Forensic Science International 2003, 132: Wells J.D., Sperling F.A.H.: DNA-based identification of forensically important Chrysomyinae (Diptera: Calliphoridae), Forensic Science International 2001, 120: Meier R., Shiyang K., Vaidya G., Ng P.K.L.: DNA barcoding and taksonomy in Diptera: a tale of high intraspecific variability and low identification success, Systematic Biology 2006, 55(5): Rolo E.A., Oliveira A.R., Dourado C.G., Farinha A., Rebelo M.T., Dias D.: Identification of sarcosaprophagous Diptera species through DNA barcoding in wildlife forensics, Forensic Science International 2013, 228: GilArriortua M., Salona Bordas M.I., Caine L.M., Pinheiro F., de Pancorbo M.M.: Cytochrome b as a useful tool for the identification of blowflies of forensic interest (Diptera, Calliphoridae), Forensic Science International 2013, 228: Zehner R., Amendt J., Schutt S., Sauer J., Krettek R., Povolny D.: Genetic identification of forensically important flesh flies (Diptera: Sarcophagidae), International Journal of Legal Medicine 2004, 118: Jordaens K., Sonet G., Bourguignon L., Richet R., Dupont E., Braet Y., Desmyter S.: Identification of forensically important Sarcophaga species (Diptera: Sarcophagidae) using the mitochondrial COI gene, International Journal of Legal Medicine 2013, 127: Meiklejohn K.A., Wallman J.F., Dowton M.: DNAbased identification of forensically important Australian Sarcophagidae (Diptera), International Journal of Legal Medicine 2011, 125: Meiklejohn K.A., Wallman J.F., Dowton M.: DNA barcoding identifies all immature life stages of a forensically important flesh fly (Diptera: Sarcophagidae), Journal of Forensic Sciences 2013, 58 (1): Schilthuizen M., Scholte C., van Wijk R.E.J., Dommershuijzen J., van der Horst D., zu Schlochtern M.M., Lievers R., Groenenberg D.S.J.: Using DNAbarcoding to make the necrobiont beetle family Cholevidae accessible for forensic entomology, Forensic Science International 2011, 210: Malewski T., Draber-Mońko A., Pomorski J., Łoś M., Bogdanowicz W.: Identification of forensically important blowfly species (Diptera: Calliphoridae) by highresolution melting PCR analysis, International Journal of Legal Medicine 2010, 124: Picard C.J., Johnston J.S., Tarone A.M.: Genome sizes of forensically relevant Diptera, Journal of Medical Entomology 2012, 49(1): Boehme P., Spahn P., Amendt J., Zehner R.: Differential gene expression during metamorphosis: a promising approach for age estimation of forensically import ant Calliphora vicina pupae (Diptera: Calliphoridae), International Journal of Legal Medicine 2013, 127: Tarone A.M., Jennings K.C., Foran D.R: Aging blow fly eggs using gene expression; a feasibility study, Journal of Forensic Sciences 2007, 52: Tarone A.M., Foran D.R.: Gene expression during blow fly development: improving the precision of age estimates in forensic entomology, Journal of Forensic Sciences 2011, 56: S Yocum G.D., Joplin K.H., Denlinger D.L.: Upregulation of a 23 kda small heat shock protein transcript during pupal diapause in the flesh fly, Sarcophaga crassipalpis, Insect Biochemistry and Molecular Biology 1998, 28: Rinehart J.P., Yocum G.D., Denlinger D.L.: Developmental upregulation of inducible hsp70 transcripts, but not the cognate form, during pupal diapause in the flesh fly, Sarcophaga crassipalpis, Insect Biochemistry and Molecular Biology 2000, 30: Concha C., Edman R.M., Belikoff E.J., Schiemann A.H., Carey B., Scott M.J.: Organization and expression of the Australian sheep blowfly (Lucilia cuprina) hsp23, hsp24, hsp70 and hsp83 genes, Insect Biochemistry and Molecular Biology 2012, 21: Fremdt H., Amendt J., Zehner R.: Diapause-specific gene expression in Calliphora vicina (Diptera: Calliphoridae) a useful diagnostic tool for forensic entomology, International Journal of Legal Medicine 2013, doi /s x. 40. Kaczorowska E., Draber-Mońko A.: Wprowadzenie do entomologii sądowej, Wydawnictwo Uniwersytetu Gdańskiego Megyesi M.S., Nawrocki S.P, Haskell N.H.: Using Accumulated Degree-Days to estimate the postmortem interval from decomposed human remains, Journal of Forensic Sciences 2005, 50 (3): PK_286.indb :49:52
Metody oceny wieku śladów entomologicznych
Katarzyna Frątczak-Łagiewska Zakład Taksonomii i Ekologii Zwierząt, Wydział Biologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu Pracownia Kryminalistyki, Wydział Prawa i Administracji, Uniwersytet im.
KARTA KURSU. Kod Punktacja ECTS* 1
KARTA KURSU Nazwa Nazwa w j. ang. Entomologia Sądowa Forensic Entomology Kod Punktacja ECTS* 1 Koordynator Dr Andrzej Górz Zespół dydaktyczny Dr Andrzej Górz Opis kursu (cele kształcenia) Celem kursu jest:
Sukcesja chrząszczy nekrofilnych
SGGW Koło Naukowe Leśników Sekcja Entomologiczna Mateusz Jacek Dworakowski, Piotr Dug Sukcesja chrząszczy nekrofilnych Czyli drugie życie kurczaka Wstęp Chrząszcze nekrofilne- najliczniej reprezentują:
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe
Rozwój metod dozymetrii biologicznej oraz biofizycznych markerów i indykatorów wpływu promieniowania na organizmy żywe Marcin Kruszewski Centrum Radiobiologii i Dozymetrii Biologicznej Instytut Chemii
archiwum medycyny sądowej i kryminologii
Arch Med Sąd Kryminol 2016; 66 (2): 95 105 DOI: 10.5114/amsik.2016.64708 archiwum medycyny sądowej i kryminologii Praca oryginalna Original paper Sanaa M. Aly 1, Shereen M. Mahmoud 2 Przydatność długiego
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19/20 002 SEMESTR 1 Biofizyka Biophysics 2 E 30 20 10 Chemia ogólna i analityczna General and analytical chemistry 6 E 90 30 60 Matematyka Mathematics
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE
PODSTAWY BIOINFORMATYKI 12 MIKROMACIERZE WSTĘP 1. Mikromacierze ekspresyjne tworzenie macierzy przykłady zastosowań 2. Mikromacierze SNP tworzenie macierzy przykłady zastosowań MIKROMACIERZE EKSPRESYJNE
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19
003 Uchwała RW Nr 136/2018 z dnia 24 maja 2018 r. zmiana w ofercie przedmiotów do wyboru dla II roku 2018/19 (zmiana Uchwały RW Nr 130/2017 z dnia 25 maja 2017 r.) Genetyka i biologia eksperymentalna studia
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2015-2021 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:
Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów: 1. Otrzymanie pożądanego odcinka DNA z materiału genetycznego dawcy 2. Wprowadzenie obcego DNA do wektora 3. Wprowadzenie wektora, niosącego w sobie
Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych
Możliwości i potencjalne zastosowania Zintegrowanego Systemu Analitycznego do innowacyjnych i kompleksowych badań molekularnych Dzień Otwarty Klastra LifeScience 31 maj 2017, Kraków dr Agata Piestrzyńska-Kajtoch,
Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu
Techniki biologii molekularnej - opis przedmiotu Informacje ogólne Nazwa przedmiotu Techniki biologii molekularnej Kod przedmiotu 13.9-WB-BMD-TBM-W-S14_pNadGenI2Q8V Wydział Kierunek Wydział Nauk Biologicznych
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21 003 Uchwała RW Nr 141/2018 z dnia 28 czerwca 2018 r. NAZWA PRZEDMIOTU pkt ECTS E/Z suma godz wykł. konw. sem. ćw. lab. ćw. ter. SEMESTR
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan
Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan Klasyczna metoda PCR jest metodą jakościową, nie ilościową co np.
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii
Możliwości współczesnej inżynierii genetycznej w obszarze biotechnologii 1. Technologia rekombinowanego DNA jest podstawą uzyskiwania genetycznie zmodyfikowanych organizmów 2. Medycyna i ochrona zdrowia
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie. Pracownia genetyki
Klub Młodego Wynalazcy - Laboratoria i wyposażenie Zadbaliśmy o to, żeby wyposażenie w Klubie Młodego Wynalazcy było w pełni profesjonalne. Ważne jest, aby dzieci i młodzież, wykonując doświadczenia korzystały
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO
BUDOWA I FUNKCJA GENOMU LUDZKIEGO Magdalena Mayer Katedra i Zakład Genetyki Medycznej UM w Poznaniu 1. Projekt poznania genomu człowieka: Cele programu: - skonstruowanie szczegółowych map fizycznych i
Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB-2-206-BN-s Punkty ECTS: 3. Kierunek: Inżynieria Biomedyczna Specjalność: Bionanotechnologie
Nazwa modułu: Genetyka molekularna Rok akademicki: 2014/2015 Kod: EIB-2-206-BN-s Punkty ECTS: 3 Wydział: Elektrotechniki, Automatyki, Informatyki i Inżynierii Biomedycznej Kierunek: Inżynieria Biomedyczna
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni
Jaki koń jest nie każdy widzi - genomika populacji polskich ras koni Gurgul A., Jasielczuk I., Semik-Gurgul E., Pawlina-Tyszko K., Szmatoła T., Bugno-Poniewierska M. Instytut Zootechniki PIB Zakład Biologii
GRADIENT TEMPERATUR TOUCH DOWN PCR. Standardowy PCR RAPD- PCR. RealTime- PCR. Nested- PCR. Digital- PCR.
Standardowy PCR RAPD- PCR Nested- PCR Multipleks- PCR Allelospecyficzny PCR Touchdown- PCR RealTime- PCR Digital- PCR In situ (slide)- PCR Metylacyjno specyficzny- PCR Assembly- PCR Inverse- PCR GRADIENT
Platforma Genie II. innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification
1 Platforma Genie II innowacyjne narzędzie do identyfikacji materiału genetycznego patogenów techniką LAMP Loop-mediated Isothermal AMPlification 1 2 Charakterystyka platformy Genie II Genie II jest innowacyjnym
Zastosowanie entomotoksykologii w szacowaniu czasu i ustaleniu przyczyny zgonu
Joanna Stojak Instytut Biologii Ssaków Polskiej Akademii Nauk w Białowieży Zastosowanie entomotoksykologii w szacowaniu czasu i ustaleniu przyczyny zgonu Streszczenie Entomotoksykologia pozwala na oszacowanie
Dane mikromacierzowe. Mateusz Markowicz Marta Stańska
Dane mikromacierzowe Mateusz Markowicz Marta Stańska Mikromacierz Mikromacierz DNA (ang. DNA microarray) to szklana lub plastikowa płytka (o maksymalnych wymiarach 2,5 cm x 7,5 cm) z naniesionymi w regularnych
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu w porównaniu z analizą trankryptomu:
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Jaka tam ewolucja. Zanim trafię na jednego myślącego, muszę stoczyć bitwę zdziewięcioma orangutanami Carlos Ruis Zafon Wierzbownica drobnokwiatowa Fitosterole, garbniki, flawonoidy Właściwości przeciwzapalne,
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2018/19/20/21 003 SEMESTR 1 Uchwała RW Nr 141/2018 z dnia 28 czerwca 2018 r. Biofizyka Biophysics 2 E 30 20 10 25-GBE-S1-E1-Biofiz Chemia ogólna i analityczna
SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki
SYLABUS 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna z elementami inżynierii genetycznej Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek)
Genetyka i biologia eksperymentalna studia I stopnia 2017/18/19
003 Uchwała RW Nr 136/2018 z dnia 24 maja 2018 r. zmiana w ofercie przedmiotów do wyboru dla II roku 2018/19 (zmiana Uchwały RW Nr 130/2017 z dnia 25 maja 2017 r.) Genetyka i biologia eksperymentalna studia
Testowanie hipotez statystycznych
9 października 2008 ...czyli definicje na rozgrzewkę n-elementowa próba losowa - wektor n zmiennych losowych (X 1,..., X n ); intuicyjnie: wynik n eksperymentów realizacja próby (X 1,..., X n ) w ω Ω :
SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA (skrajne daty)
Załącznik nr 4 do Uchwały Senatu nr 430/01/2015 SYLABUS DOTYCZY CYKLU KSZTAŁCENIA 2016-2022 (skrajne daty) 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna
Potencjał naukowo-badawczy Działu Genomiki i Biologii Molekularnej Zwierząt IZ PIB
Potencjał naukowo-badawczy Działu Genomiki i Biologii Molekularnej Zwierząt IZ PIB dr Agata Piestrzyńska-Kajtoch Laboratorium Genetyki Molekularnej Dział Genomiki i Biologii Molekularnej Instytut Zootechniki
Księgarnia PWN: Joanna R. Freeland - Ekologia molekularna
Księgarnia PWN: Joanna R. Freeland - Ekologia molekularna Spis treści Przedmowa................................. Podziękowania............................... XIII XIV 1 Metody genetyki molekularnej w badaniach
3. Podstawy genetyki S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) I nformacje ogólne. Nazwa modułu. Kod F3/A. Podstawy genetyki. modułu
S YLABUS MODUŁU (PRZEDMIOTU) 3. Podstawy genetyki I nformacje ogólne Kod F3/A modułu Rodzaj modułu Wydział PUM Kierunek studiów Specjalność Poziom studiów Forma studiów Rok studiów Nazwa modułu Podstawy
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1
Anna Litwiniec 1, Beata Choińska 1, Aleksander Łukanowski 2, Żaneta Świtalska 1, Maria Gośka 1 1 Zakład Genetyki i Hodowli Roślin Korzeniowych, Pracownia Biotechnologii, Instytut Hodowli i Aklimatyzacji
mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii
Zawartość 139371 1. Wstęp zarys historii genetyki, czyli od genetyki klasycznej do genomiki 2. Chromosomy i podziały jądra komórkowego 2.1. Budowa chromosomu 2.2. Barwienie prążkowe chromosomów 2.3. Mitoza
Ilość TAK TAK TAK TAK TAK TAK
Postępowanie WB.2420.6.2013.NG ZAŁĄCZNIK NR 5 L.p. Nazwa asortymentu parametry techniczne Ilość Nazwa wyrobu, nazwa producenta, określenie marki, modelu, znaku towarowego Cena jednostkowa netto (zł) Wartość
Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej
Scenariusz lekcji z biologii w szkole ponadgimnazjalnej Temat lekcji: Planowanie doświadczeń biologicznych jak prawidłowo zaplanować próbę kontrolną? Cele kształcenia IV etap edukacyjny: 1. Wymagania ogólne:
Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2
ALEKSANDRA ŚWIERCZ Co to jest transkryptom? A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH 2 Ekspresja genów http://genome.wellcome.ac.uk/doc_wtd020757.html A. Świercz ANALIZA DANYCH WYSOKOPRZEPUSTOWYCH
SCENARIUSZ LEKCJI. TEMAT LEKCJI: Podstawowe techniki inżynierii genetycznej. Streszczenie
SCENARIUSZ LEKCJI OPRACOWANY W RAMACH PROJEKTU: INFORMATYKA MÓJ SPOSÓB NA POZNANIE I OPISANIE ŚWIATA. PROGRAM NAUCZANIA INFORMATYKI Z ELEMENTAMI PRZEDMIOTÓW MATEMATYCZNO-PRZYRODNICZYCH Autorzy scenariusza:
Wykład 9: HUMAN GENOME PROJECT HUMAN GENOME PROJECT
Wykład 9: Polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) odrębność genetyczna, która czyni każdego z nas jednostką unikatową Prof. dr hab. n. med. Małgorzata Milkiewicz Zakład Biologii Medycznej HUMAN GENOME
Sekwencjonowanie nowej generacji i rozwój programów selekcyjnych w akwakulturze ryb łososiowatych
Sekwencjonowanie nowej generacji i rozwój programów selekcyjnych w akwakulturze ryb łososiowatych Konrad Ocalewicz Zakład Biologii i Ekologii Morza, Instytut Oceanografii, Wydział Oceanografii i Geografii,
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)
Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY) Cel ćwiczenia Amplifikacja fragmentu genu amelogeniny, znajdującego się na chromosomach X i Y, jako celu molekularnego przydatnego
Laboratorium Wirusologiczne
Laboratorium Wirusologiczne Krzysztof Pyrd Pracownia wirusologiczna: Powstanie i wyposażenie całkowicie nowego laboratorium w ramach Zakładu Mikrobiologii WBBiB Profil: laboratorium molekularno-komórkowe
PLAN STUDIÓW PODYPLOMOWYCH: DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA W ROKU 2019/2020. Nazwa modułu ECTS Semestr I Semestr II. Liczba godzin z.
Załącznik nr 5 do uchwały nr 79/2018-2019 Senatu Uniwersytetu Przyrodniczego w Lublinie z dnia 24 maja 2019 r. Symbol modułu PLAN STUDIÓW PODYPLOMOWYCH: DIAGNOSTYKA MOLEKULARNA W ROKU 2019/2020 Nazwa modułu
Inżynieria Genetyczna ćw. 3
Materiały do ćwiczeń z przedmiotu Genetyka z inżynierią genetyczną D - blok Inżynieria Genetyczna ćw. 3 Instytut Genetyki i Biotechnologii, Wydział Biologii, Uniwersytet Warszawski, rok akad. 2018/2019
Wprowadzenie do genetyki sądowej. Materiały biologiczne. Materiały biologiczne: prawidłowe zabezpieczanie śladów
Wprowadzenie do genetyki sądowej 2013 Pracownia Genetyki Sądowej Katedra i Zakład Medycyny Sądowej Materiały biologiczne Inne: włosy z cebulkami, paznokcie możliwa degradacja - tkanki utrwalone w formalinie/parafinie,
Mitochondrialna Ewa;
Mitochondrialna Ewa; jej sprzymierzeńcy i wrogowie Lien Dybczyńska Zakład genetyki, Uniwersytet Warszawski 01.05.2004 Milion lat temu Ale co dalej??? I wtedy wkracza biologia molekularna Analiza różnic
LABORATORIUM KRYMINALISTYCZNE KSP SEKCJA VI - BIOLOGII I OSMOLOGII. Strona znajduje się w archiwum.
LABORATORIUM KRYMINALISTYCZNE KSP Źródło: http://laboratorium.policja.waw.pl/lk/sekcje/sekcja-vi-biologii-i-os/2367,sekcja-vi-biologii-i-osmologii.html Wygenerowano: Piątek, 6 stycznia 2017, 20:57 Strona
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:
Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów: dobór warunków samej reakcji PCR (temperatury, czas trwania cykli, ilości cykli itp.) dobór odpowiednich starterów do reakcji amplifikacji
Biologia medyczna, materiały dla studentów
Zasada reakcji PCR Reakcja PCR (replikacja in vitro) obejmuje denaturację DNA, przyłączanie starterów (annealing) i syntezę nowych nici DNA (elongacja). 1. Denaturacja: rozplecenie nici DNA, temp. 94 o
Tematyka zajęć z biologii
Tematyka zajęć z biologii klasy: I Lp. Temat zajęć Zakres treści 1 Zapoznanie z przedmiotowym systemem oceniania, wymaganiami edukacyjnymi i podstawą programową Podstawowe zagadnienia materiału nauczania
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP
Klonowanie molekularne Kurs doskonalący Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP Etapy klonowania molekularnego 1. Wybór wektora i organizmu gospodarza Po co klonuję (do namnożenia DNA [czy ma być metylowane
Techniki molekularne w mikrobiologii SYLABUS A. Informacje ogólne
Techniki molekularne w mikrobiologii A. Informacje ogólne Elementy sylabusu Nazwa jednostki prowadzącej kierunek Nazwa kierunku studiów Poziom kształcenia Profil studiów Forma studiów Rodzaj Rok studiów
Przydatność technologii Sekwencjonowania Nowej Generacji (NGS) w kolekcjach Banków Genów Joanna Noceń Kinga Smolińska Marta Puchta Kierownik tematu:
Przydatność technologii Sekwencjonowania Nowej Generacji (NGS) w kolekcjach Banków Genów Joanna Noceń Kinga Smolińska Marta Puchta Kierownik tematu: prof. dr hab. Jerzy H. Czembor SEKWENCJONOWANIE I generacji
KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia eksperymentalna i środowiskowa
KARTA KURSU (realizowanego w module specjalności) Biologia eksperymentalna i środowiskowa Nazwa Nazwa w j. ang. Wybrane problemy biologii molekularnej kwasy nukleinowe Selected problems of molecular biology
Specjalność (studia II stopnia) Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych
Specjalność (studia II stopnia) Oczyszczanie i analiza produktów biotechnologicznych Studia magisterskie przedmioty specjalizacyjne Bioinformatyka w analizie genomu Diagnostyka molekularna Elementy biosyntezy
Metody inżynierii genetycznej SYLABUS A. Informacje ogólne
Metody inżynierii genetycznej A. Informacje ogólne Elementy sylabusu Nazwa jednostki prowadzącej kierunek Nazwa kierunku studiów Poziom kształcenia Profil studiów Forma studiów Kod Rodzaj Rok studiów /semestr
Biotechnologia i inżynieria genetyczna
Wersja A Test podsumowujący rozdział II i inżynieria genetyczna..................................... Imię i nazwisko.............................. Data Klasa oniższy test składa się z 16 zadań. rzy każdym
TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R
TaqNova-RED Polimeraza DNA RP20R, RP100R RP20R, RP100R TaqNova-RED Polimeraza DNA Rekombinowana termostabilna polimeraza DNA Taq zawierająca czerwony barwnik, izolowana z Thermus aquaticus, o przybliżonej
KWP: ROZPOZNAWANIE I ZABEZPIECZANIE ŚLADÓW ENTOMOLOGICZNYCH.." - O WYKORZYSTANIU OWADÓW W PROCESIE KARNYM
POLICJA.PL http://www.policja.pl/pol/aktualnosci/149267,kwp-rozpoznawanie-i-zabezpieczanie-sladow-entomologicznychquot-o-wykorzy staniu-o.html 2018-12-25, 08:10 Strona znajduje się w archiwum. KWP: ROZPOZNAWANIE
DOI: /zenodo
Biuletyn Sekcji Dipterologicznej Polskiego Towarzystwa Entomologicznego DIPTERON Bulletin of the Dipterological Section of the Polish Entomological Society ISSN 1895-4464 Tom 35: 1-7 Akceptacja: 15.02.2019
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych???
Analizy DNA in silico - czyli czego można szukać i co można znaleźć w sekwencjach nukleotydowych??? Alfabet kwasów nukleinowych jest stosunkowo ubogi!!! Dla sekwencji DNA (RNA) stosuje się zasadniczo*
Wydział Biologii Zakład Taksonomii Roślin
Recenzja pracy doktorskiej Pani mgr Katarzyny Krawczyk, stanowiącej zbiór publikacji nt. Ewolucja i taksonomia molekularna rodzaju Lamium L. w oparciu o analizę trzech genomów wykonanej w Katedrze Botaniki
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
Dr. habil. Anna Salek International Bio-Consulting 1 Germany
1 2 3 Drożdże są najprostszymi Eukariontami 4 Eucaryota Procaryota 5 6 Informacja genetyczna dla każdej komórki drożdży jest identyczna A zatem każda komórka koduje w DNA wszystkie swoje substancje 7 Przy
DHPLC. Denaturing high performance liquid chromatography. Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko
DHPLC Denaturing high performance liquid chromatography Wiktoria Stańczyk Zofia Kołeczko Mini-słowniczek SNP (Single Nucleotide Polymorphism) - zmienność sekwencji DNA; HET - analiza heterodupleksów; HPLC
Ampli-LAMP Babesia canis
Novazym Products Zestaw do identyfikacji materiału genetycznego pierwotniaka Babesia canis canis techniką Loop-mediated Isothermal AMPlification (LAMP) Numery katalogowe produktu: AML-Bc-200 AML-Bc-400
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE
CECHY ILOŚCIOWE PARAMETRY GENETYCZNE Zarządzanie populacjami zwierząt, ćwiczenia V Dr Wioleta Drobik Rodzaje cech Jakościowe o prostym dziedziczeniu uwarunkowane zwykle przez kilka genów Słaba podatność
Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych
Systemy Inteligencji Obliczeniowej Analiza zmienności czasowej danych mikromacierzowych Kornel Chromiński Instytut Informatyki Uniwersytet Śląski Plan prezentacji Dane mikromacierzowe Cel badań Prezentacja
Nowe techniki w biotechnologii rolniczej i związane z nimi wyzwania:
Nowe techniki w biotechnologii rolniczej i związane z nimi wyzwania: Prezentacja opinii Grupy Wysokiego Szczebla Mechanizmu Doradztwa Naukowego Komisji Europejskiej DOWODY NAUKOWE prof. Janusz M. Bujnicki
Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO
Diagnostyka molekularna Dr n.biol. Anna Wawrocka Strategia diagnostyki genetycznej: Aberracje chromosomowe: Metody:Analiza kariotypu, FISH, acgh, MLPA, QF-PCR Gen(y) znany Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie,
Wstęp. Jak programować w DNA? Idea oraz przykład. Problem FSAT charakterystyka i rozwiązanie za pomocą DNA. Jak w ogólności rozwiązywać problemy
Ariel Zakrzewski Wstęp. Jak programować w DNA? Idea oraz przykład. Problem FSAT charakterystyka i rozwiązanie za pomocą DNA. Jak w ogólności rozwiązywać problemy matematyczne z użyciem DNA? Gdzie są problemy?
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO. Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB
Walidacja metod wykrywania, identyfikacji i ilościowego oznaczania GMO Magdalena Żurawska-Zajfert Laboratorium Kontroli GMO IHAR-PIB Walidacja Walidacja jest potwierdzeniem przez zbadanie i przedstawienie
Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu
Ćwiczenie 4 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu Wstęp CYP2D6 kodowany przez gen występujący w co najmniej w 78 allelicznych formach związanych ze zmniejszoną
PODSTAWY BIOINFORMATYKI
PODSTAWY BIOINFORMATYKI Prowadzący: JOANNA SZYDA ADRIAN DROśDś WSTĘP 1. Katedra Genetyki badania bioinformatyczne 2. Tematyka przedmiotu 3. Charakterystyka wykładów 4. Charakterystyka ćwiczeń 5. Informacje
Urszula Poziomek, doradca metodyczny w zakresie biologii Materiał dydaktyczny przygotowany na konferencję z cyklu Na miarę Nobla, 14 stycznia 2010 r.
Ćwiczenie 1 1 Wstęp Rozważając możliwe powiązania filogenetyczne gatunków, systematyka porównuje dane molekularne. Najskuteczniejszym sposobem badania i weryfikacji różnych hipotez filogenetycznych jest
Mapowanie fizyczne genomów -konstrukcja map wyskalowanych w jednostkach fizycznych -najdokładniejszą mapą fizyczną genomu, o największej
Mapowanie fizyczne genomów -konstrukcja map wyskalowanych w jednostkach fizycznych -najdokładniejszą mapą fizyczną genomu, o największej rozdzielczości jest sekwencja nukleotydowa -mapowanie fizyczne genomu
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników
Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników Wojciech Śmietana Co to jest monitoring genetyczny? Monitoring genetyczny to regularnie
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII
OFERTA TEMATÓW PRAC DYPLOMOWYCH (MAGISTERSKICH) do zrealizowania w Katedrze MIKROBIOLOGII Opracowanie zestawu do wykrywania DNA Aspergillus flavus za pomocą specjalistycznego sprzętu medycznego. Jednym
New data about distribution of Chrysomya albiceps (WIEDEMANN, 1819) (Diptera: Calliphoridae) in Poland
Biuletyn Sekcji Dipterologicznej Polskiego Towarzystwa Entomologicznego DIPTERON Bulletin of the Dipterological Section of the Polish Entomological Society ISSN 1895 4464 Tom 32: 60-66 Akceptacja: 01.08.2016
Analiza korespondencji
Analiza korespondencji Kiedy stosujemy? 2 W wielu badaniach mamy do czynienia ze zmiennymi jakościowymi (nominalne i porządkowe) typu np.: płeć, wykształcenie, status palenia. Punktem wyjścia do analizy
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Program kształcenia Farmacja, jednolite studia magisterskie, forma studiów: stacjonarne
7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej
7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej 7.2. Metody biologii molekularnej (technika PCR, sekwencjonowanie DNA) wykorzystywane w taksonomii roślin Autor: Magdalena Dudek
Public gene expression data repositoris
Public gene expression data repositoris GEO [Jan 2011]: 520 k samples 21 k experiments Homo, mus, rattus Bos, sus Arabidopsis, oryza, Salmonella, Mycobacterium et al. 17.01.11 14 17.01.11 15 17.01.11 16
METODY STATYSTYCZNE W BIOLOGII
METODY STATYSTYCZNE W BIOLOGII 1. Wykład wstępny 2. Populacje i próby danych 3. Testowanie hipotez i estymacja parametrów 4. Planowanie eksperymentów biologicznych 5. Najczęściej wykorzystywane testy statystyczne
MOŻLIWOŚCI WYKORZYSTANIA BARKODINGU W OCHRONIE PRZYRODY
strony:makieta 1 10/6/2009 8:55 AM Strona 38 MOŻLIWOŚCI WYKORZYSTANIA BARKODINGU W OCHRONIE PRZYRODY Andrzej Grzywacz, Wiesław Bogdanowicz Streszczenie Muzeum i Instytut Zoologii PAN w Warszawie koordynuje
Mikrosatelitarne sekwencje DNA
Mikrosatelitarne sekwencje DNA Małgorzata Pałucka Wykorzystanie sekwencji mikrosatelitarnych w jądrowym DNA drzew leśnych do udowodnienia pochodzenia materiału dowodowego w postępowaniu sądowym 27.09.2012
wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki
Genetyka ogólna wykład dla studentów II roku biotechnologii Andrzej Wierzbicki Uniwersytet Warszawski Wydział Biologii andw@ibb.waw.pl http://arete.ibb.waw.pl/private/genetyka/ Budowa rybosomu Translacja
Badania genetyczne nad populacją jelenia w północno-wschodniej Polsce
Badania genetyczne nad populacją jelenia w północno-wschodniej Polsce Magdalena Niedziałkowska, Bogumiła Jędrzejewska, Jan Marek Wójcik Instytut Biologii Ssaków PAN w Białowieży Cele badań 1) Poznanie
Nowoczesne systemy ekspresji genów
Nowoczesne systemy ekspresji genów Ekspresja genów w organizmach żywych GEN - pojęcia podstawowe promotor sekwencja kodująca RNA terminator gen Gen - odcinek DNA zawierający zakodowaną informację wystarczającą
Projektowanie reakcji multiplex- PCR
Projektowanie reakcji multiplex- PCR Dzięki nowoczesnym, wydajnym zestawom do PCR, amplifikacja DNA nie jest już takim wyzwaniem, jak w latach 80-tych i 90-tych. Wraz z poprawą metodyki, pojawiły się ciekawe
Spis treści. Przedmowa... XI. Wprowadzenie i biologiczne bazy danych. 1 Wprowadzenie... 3. 2 Wprowadzenie do biologicznych baz danych...
Przedmowa... XI Część pierwsza Wprowadzenie i biologiczne bazy danych 1 Wprowadzenie... 3 Czym jest bioinformatyka?... 5 Cele... 5 Zakres zainteresowań... 6 Zastosowania... 7 Ograniczenia... 8 Przyszłe
Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących
Narzędzia ułatwiające identyfikację właściwych genów GLIMMER TaxPlot Narzędzia ułatwiające amplifikację tych genów techniki PCR Primer3, Primer3plus PrimerBLAST Reverse Complement Narzędzia ułatwiające
dr hab. n. med. Czesław Żaba Kierownik Katedry i Zakładu Medycyny Sądowej Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu
dr hab. n. med. Czesław Żaba Kierownik Katedry i Zakładu Medycyny Sądowej Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu Poznań, dnia 01.09.2016 r. Ocena rozprawy doktorskiej mgr Matyldy
Sylabus Biologia molekularna
Sylabus Biologia molekularna 1. Metryczka Nazwa Wydziału Program kształcenia Wydział Farmaceutyczny z Oddziałem Medycyny Laboratoryjnej Analityka Medyczna, studia jednolite magisterskie, studia stacjonarne
Nie wchodzić-trwa metamorfoza Nowy wygląd-nowe życie
Nie wchodzić-trwa metamorfoza Nowy wygląd-nowe życie Co to jest metamorfoza? Metamorfoza proces charakteryzujący się znacznymi zmianami w formie lub strukturze organizmu. Rodzaje przeobrażeń Ametabolia
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi
Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi Mutacja Mutacja (łac. mutatio zmiana) - zmiana materialnego
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna
Wybrane techniki badania białek -proteomika funkcjonalna Proteomika: umożliwia badanie zestawu wszystkich (lub prawie wszystkich) białek komórkowych Zalety analizy proteomu np. w porównaniu z analizą trankryptomu:
SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki
SYLABUS 1.1. PODSTAWOWE INFORMACJE O PRZEDMIOCIE/MODULE Nazwa przedmiotu/ modułu Biologia molekularna Kod przedmiotu/ modułu* Wydział (nazwa jednostki prowadzącej kierunek) Nazwa jednostki realizującej