SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ

Transkrypt

1 SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ D1 LOW EEO i D1 MEDIUM EEO, D1 HIGH EEO D1 LOW EEO GQT; (Genetic Quality Tested) D2 HIGH GELLING TEMPERATURE D5 HIGH STRENGTH GEL Agaroza LM Agaroza LM GQT; (Genetic Quality Tested) Agaroza LM SIEVE Agaroza F.P. DNA (Finger Printing) Agaroza MS-4 Agaroza MS-8 Agaroza MS-12 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 1

2 D1 LOW EEO i D1 MEDIUM EEO, D1 HIGH EEO - wyjątkowa wytrzymałość mechaniczna, dająca łatwość i pewność używania żelu; - możliwość regulacji wielkości porów wraz z regulacją wielkości badanych cząsteczek, poprzez zmianę stężenia żelu; - łatwe przygotowanie żelu przez rozpuszczenie w wodnym roztworze buforu za pomocą kuchenki mikrofalowej lub gotowania; - duża stabilność termiczna, wywodząca się z wysokiej histerezy żelowania; - wspaniała przezroczystość żelu; - wyjątkowa niska absorpcja barwników; - brak toksyczności, umożliwia więc uniknięcie neurotoksyczności spowodowanej przez poliakrylamid. D1 LOW EEO: - analiza kwasów nukleinowych i elektroforeza preparatywna; - blotting; - elektroforeza protein. D1 MEDIUM EEO: - elektroforeza kwasów nukleinowych; - elektroforeza białek (serum białek i immunoelektroforeza). D1 HIGH EEO - elektroforeza białek (serum białek i immunoelektroforeza, counterimmunoelektroforeza). D1 LOW EEO D1 MEDIUM EEO D1HIGH EEO EEO: 0,05-0,13 0,16-0,19 0,23-0,26 7% 7% 0,4% 0,5% 1,0% 0,14% 0,2% 0,2% Klarowność (Np.): Siła żelowania (1%)g/cm Siła żelowania (1,5%)g/cm Temperatura żelowania 0 C 36+/-1,5 36+/-1,5 36+/-1,5 Temperatura topnienia 0 C 88+/-1,5 88+/-1,5 88+/-1,5 DNAzy/ RNA zy nie wykrywalne nie wykrywalne nie wykrywalne ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 2

3 D1 LOW EEO GQT; (Genetic Quality Tested) : - wyjątkowa wytrzymałość mechaniczna, dająca łatwość i pewność używania żelu; - możliwość regulacji wielkości porów wraz z regulacją wielkości badanych cząsteczek, poprzez zmianę stężenia żelu; - łatwe przygotowanie żelu przez rozpuszczenie w wodnym roztworze buforu za pomocą kuchenki mikrofalowej lub gotowania; - lepsza stabilność termiczna, wywodząca się z wysokiej histerezy żelowania; - wspaniała przezroczystość żelu; - niższa absorpcja barwników; - brak toksyczności. - analityczna i preparatywna elektroforeza dla cząsteczek DNA 1000bp; - odzyskiwanie fragmentów DNA do przyszłych zastosowań (procesy enzymatyczne, czy klonowanie); - blotting assays. EEO: 0,05-0,13 Klarowność (Np.): Siła żelowania (1%)g/cm 2 0,4% 0,14% Siła żelowania (1,5%)g/cm Temperatura żelowania 0 C 36+/-1,5 Temperatura topnienia 0 C 88+/-1,5 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 3

4 D2 HIGH GELLING TEMPERATURE : - wyjątkowa wytrzymałość mechaniczna, dająca łatwość i pewność używania żelu; - możliwość regulacji wielkości porów wraz z regulacją wielkości badanych cząsteczek, poprzez zmianę stężenia żelu; - łatwe przygotowanie żelu przez rozpuszczenie w wodnym roztworze buforu za pomocą kuchenki mikrofalowej lub gotowania; - lepsza stabilność termiczna, wywodząca się z bardzo wysokiej histerezy żelowania; - wspaniała przezroczystość żelu; - zapewnia lepszą chłonność i tworzenie większej ilości wiązań krzyżowych, co pozwala na łatwiejsze przyłączanie enzymów, antygenów i innych substancji do struktury żelu; - wyjątkowo niska absorpcja barwników; - brak toksyczności, umożliwia więc uniknięcie neurotoksyczności spowodowanej przez poliakrylamid. - wspaniała elastyczność; - elektroforeza kwasów nukleinowych; - elektroforeza białek (immuno- i counter-elektroforeza); - przygotowywanie ziaren agarozowych. EEO: 0,14 Wilgotność: 8% Klarowność (Np.): Siła żelowania (1%)g/cm 2 0,4% 0,2% Siła żelowania (1,5%)g/cm Temperatura żelowania 0 C 42+/-1,5 Temperatura topnienia 0 C 87+/-1,5 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 4

5 D5 HIGH STRENGTH GEL - ekstremalnie wysoka siła żelowania, pozwalająca na stosowanie niskich stężeń (0,3%) w wyniku czego umożliwione jest rozdzielania nie tylko DNA o dużej masie molekularnej, ale także dużych cząsteczek, takich jak wirusy, czy rybosomy; - wysoka mobilność elektroforezy, przy porównaniu z agarozami D1 mobilność DNA jest lepsza. Czas elektroforezy może być redukowany w zależności od buforu i zastosowanego stężenia; - łatwe przygotowanie żelu przez rozpuszczenie w wodnym roztworze buforu za pomocą kuchenki mikrofalowej lub gotowania; - lepsza stabilność termiczna, wywodząca się z wysokiej histerezy żelowania; - wyjątkowo niska absorpcja barwników; - brak toksyczności. - standardowa elektroforeza, może być stosowana przy szerokim zakresie stężeń; - elektroforeza pulsacyjna PFGE, wysokie granice dyskryminacji osiągnięte w niższych stężeniach żelu, umożliwiają pasaż większych cząsteczek; - blotting; - przygotowywanie ziaren agarozowych; - immobilizacja komórkowa i enzymatyczna. EEO: 0,12 Klarowność (Np.): Siła żelowania (1%)g/cm 2 0,25% 0,12% Siła żelowania (1,5%)g/cm Temperatura żelowania 0 C 26+/-1,5 Temperatura topnienia 0 C 88+/-1,5 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 5

6 Agaroza LM - niska temperatura topnienia, pozwalająca na odzyskiwanie, bez uszkodzeń DNA poniżej ich temperatury denaturacji; - niska temperatura żelowania, pozwalająca zachować stan ciekły agarozy w zakresie temperatur umożliwiających manipulowanie w żelu, bez uprzedniej ekstrakcji DNA; - niższa siła żelowania, niż w przypadku standardowych agaroz; - wyższa klarowność, niż w przypadku standardowych agaroz; - bardzo dobra zdolność do przesiewania. LM (Low Melt) (o najwyższej temperaturze i sile żelowania) - elektroforeza fragmentów DNA 1000 bp; - elektroforeza kapilarna; - hodowla tkanek i komórek; - uwidocznienia łysinek wirusowych. EEO: 0,12 Klarowność (Np.): 0,4% 0,12% 40 Siła żelowania (1,5%)g/cm Temperatura żelowania 0 C (1,5%) Temperatura topnienia 0 C (1,5%) 65,5 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 6

7 Agaroza LM GQT; (Genetic Quality Tested) - niska temperatura topnienia; - możliwe ponowne rozpuszczenie żelu. - elektroforeza fragmentów DNA większych niż 1000 bp; - procesy enzymatyczne (ligacja, PCR...); - elektroforeza preparatywna; - analiza i odzyskiwanie dużych fragmentów DNA do przyszłej pracy. EEO: 0,12 0,4% 0,1% Siła żelowania (1%)g/cm Temperatura żelowania 0 C (1,5%) Temperatura topnienia 0 C (1,5%) 65,5 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 7

8 Agaroza LM SIEVE: - niska temperatura topnienia; - możliwe ponowne rozpuszczenie żelu; - może być stosowana w wysokich stężeniach. - elektroforeza fragmentów DNA mniejszych niż 1000 bp; - procesy enzymatyczne (ligacja, PCR...); - elektroforeza preparatywna; - analiza i odzyskiwanie małych fragmentów DNA do przyszłej pracy. EEO: 0,1 Wilgotność: 5% 0,3% 0,12% Siła żelowania (4%)g/cm Temperatura żelowania 0 C (4%) 35 Temperatura topnienia 0 C (4%) 65 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 8

9 Agaroza F.P. DNA (Finger Printing): - niska wartość EEO; - wysoka siła żelowania, łatwo formuje się żel; - nie zachodzi łączenie DNA; - brak aktywności RNA-zy i DNA-zy; - gładkie i ostre krawędzie; - wysoce efektywny transport; - nie zachodzi rozmazywanie w żelu; - - wszelkie zastosowania, przy identyfikacji DNA. EEO: 0,13 0,4% 0,14% Siła żelowania (1%)g/cm Temperatura żelowania 0 C (1,5%) 36+/-1,5 ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 9

10 Agaroza MS-4 Ta agaroza o niskiej temperaturze topnienia, jest unikalnym produktem na rynku ze względu na bardzo wysoka przezroczystość, nawet w wysokich stężeniach (5 %) i zdolność do rozdziału fragmentów kwasów nukleinowych mniejszych niż 10 pz. Polecana szczególnie do żelów analitycznych do DNA o wielkości mniejszej niż 500 pz. Polecana do elektroforezy kapilarnej.nie posiada wykrywalnej aktywności DNAzy i RNAzy. Może być użyta ze wszystkimi buforami. Brak wiązania DNA. Nie polecana do technik typu blotting. Ze względu na swoją wysoką lepkość w stężeniach wyższych niż 3 %, jej rozpuszczanie musi być przeprowadzane w łaźni wodnej lub autoklawie. Nie zaburzy to właściwości mechanicznych żelu lub jego zdolności rozdzielczej. Ponieważ temperatura żelowania tej agarozy jest niższa od temperatury pokojowej, żelowanie może być uzyskane poprzez pozostawienie na noc w temperaturze 4 C, co pozwoli na uzyskanie odpowiednich właściwości rozdzielczych. Zalety Doskonała rozdzielczość fragmentów DNA mniejszych niż 500 pz, a szczególnie mniejszych fragmentów w tym primerów. Zdolność do widocznego rozdziału fragmentów DNA mniejszych niż 50 pz, o różnicy 3 pz pomiędzy nimi. Tworzy bardzo czysty i przejrzysty żel w stężeniach 5 % i wyższych. Żel o dużej wytrzymałości i elastyczności łatwy do obróbki we wszystkich stężeniach. WAŻNE: Do uzyskania najlepszej rozdzielczości żelu MS-4, niezbędne jest przechowywanie go przez 20 godzin w 4 C. stężenie 3% 5% 4% EEO: 0,12 Klarowność (Np.) 0,3% 0,11% 75 Siła żelowania g/cm Temperatura żelowania 0 C 31 Temperatura topnienia 0 C 76 Zakres rozdzielania: bp bp bp ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 10

11 Agaroza MS-8 Agaroza o pośredniej temperaturę topnienia i żelowania oraz najlepszej charakterystyce rozdzielczej Polecana do żelów analitycznych DNA o wielkości 1000 pz, produktów amplifikacji PCR, małych fragmentów DNA uzyskanych w wyniku trawienia enzymami restrykcyjnymi i fragmentów DNA używanych w analizie mutacji. Może być użyta w stężeniach od 1.8 do 3.0 % do rozdziału fragmentów od 150 do 1000 pz. Zwiększanie stężeń do 4.5% pozwala na rozdział fragmentów o wymiarach do 50 pz. Może być używana w technikach typu blotting z fragmentami mniejszymi niż 600 pz. Nie posiada wykrywalnej aktywności DNAzy i RNAzy. Może być użyta ze wszystkimi buforami. Brak wiązania DNA. Sporządzanie stężeń większych niż 3 % powinno być wykonywane w gorącej łaźni wodnej lub autoklawie. Nie spowoduje to żadnych zmian w mechanicznych właściwościach żelu lub jego zdolności rozdzielczej. Aby zapewnić skuteczność procesu żelowania, należy przenieść żel na l godzinę do 4 C. W zależności od użytego stężenia od 1.8 % %. można rozdzielać fragmenty od 150 do looopz. Zwiększanie stężeń do 4.5 %, pozwoli na separację fragmentów aż do 50 pz. Może być użyta w próbach typu blotting, z fragmentami mniejszymi niż 600 pz. Agaroza jest wolna od RNAz i DNAz, wiąże niewielkie ilości DNA i wykazuje minimalną zdolność do wiązania DNA i bromku etydyny wykazując minimalną fluorescencje podczas barwienia.w stężeniach powyżej 3 % rekomenduje się rozpuszczanie w gorącej łaźni wodnej lub w autoklawie. Nie spowoduje to żadnych zmian we właściwościach mechanicznych i fizycznych żelu. Polepszona przezroczystość i czystość żelu. Wspaniała wytrzymałość mechaniczna w małych stężeniach, co ułatwia używanie, a związane jest ze strukturą żelu. Jest to ogromna zaleta w porównaniu z konkurencyjnymi żelami. Agaroza jest wolna od RNAz i DNAz, wykazuje minimalną zdolność do wiązania DNA i bromku etydyny wykazując minimalną fluorescencję tła podczas barwienia. WAŻNE: Aby zapewnić ukończenie procesu żelowania, należy go przenieść na godzinę do temperatury 4 C przed użyciem. ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 11

12 1,5% 3% 4,5% EEO: 0,12 0,35% 0,11% Klarowność (Np.) 50 Siła żelowania g/cm Temperatura żelowania 0 C 35,5 Temperatura topnienia 0 C 80 Zakres rozdzielania : bp bp bp ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 12

13 MS-12 Ta agaroza ma standardową temperaturę żelowania i topnienia, tworzy żele o wysokiej wytrzymałości, polecane jako żele analityczne dla DNA/RNA. W stężeniach od 2 do 5 % można na nich separować fragmenty od 100 do 1500 pz. Może być użyta do technik typu Northern blotting i Western blotting. Jest wolna od wykrywalnej aktywności DNAz i RNAz. Może być stosowana ze wszystkimi buforami. Brak niespecyficznego wiązania DNA. Zalety Jest wolna od wykrywalnej aktywności DNAz i RNAz. Może być stosowana w technice Northern i Western blotting. Może być stosowana z wszystkimi buforami. Wiąże niewielkie ilości DNA. MS-12 jest polecana do wszystkich rodzajów analiz. W odróżnieniu do produktów konkurencyjnych, może być stosowana do obróbki enzymatycznej uzyskanego DNA. Ma niską fluorescencję tła po użyciu bromku etydyny i pozwala na łatwe przenoszenie materiału na błony w technice Southern blotting (fragmenty DNA od 154 do 2176 pz w żelu o stężeniu 4 %). 1,5% 2% 4% EEO: 0,12 0,35% 0,11% Klarowność (Np.) 50 Siła żelowania g/cm Temperatura żelowania 0 C 40,5 Temperatura topnienia 0 C 93 Zakres rozdzielania : bp bp ul. Vetterów 5, Lublin Lublin, tel.: , fax: w Sądzie Rejonowym Lublin-Wschód w Lublinie 13