Biotechnika rozrodu ryb jesiotrowatych. Dr inż. Dorota Fopp-Bayat Katedra Ichtiologii UW-M w Olsztynie

Podobne dokumenty
Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA

Autor: dr Mirosława Staniaszek

Zestaw do wykrywania Chlamydia trachomatis w moczu lub w kulturach komórkowych

Zestaw do wykrywania Anaplasma phagocytophilum w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Zestaw do wykrywania Babesia spp. i Theileria spp. w kleszczach, krwi i hodowlach komórkowych

Genetyczne modyfikowanie organizmów Kierunek OCHRONA ŚRODOWISKA, II rok semestr letni 2015/16

Ćwiczenie 3. Amplifikacja genu ccr5 Homo sapiens wykrywanie delecji Δ32pz warunkującej oporność na wirusa HIV

Długoterminowe przechowywanie nasienia ryb jesiotrowatych - kriokonserwacja

Ćwiczenie 2. Identyfikacja płci z wykorzystaniem genu amelogeniny (AMGXY)

Mikrosatelitarne sekwencje DNA

Morfologia ikry ryb jesiotrowatych

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 04/14. SYLWIA OKOŃ, Dąbrowica, PL KRZYSZTOF KOWALCZYK, Motycz, PL

PL B1. UNIWERSYTET PRZYRODNICZY W LUBLINIE, Lublin, PL BUP 26/11

AmpliTest Babesia spp. (PCR)

Zestaw dydaktyczny. genotypowanie szczepów 5taphy/ococcus aureus metodą PCR-RFLP

Genetyka, materiały dla studentów Pielęgniarstwa

TaqNova-RED. Polimeraza DNA RP20R, RP100R

2. Przedmiot zamówienia: Odczynniki chemiczne do izolacji DNA i reakcji PCR, wymienione w Tabeli 1. Nazwa odczynnika Specyfikacja Ilość*

Tabela 1. Charakterystyka badanego jesiotra syberyjskiego Acipenser baeri Brandt. Miejsce pochodzenia. Liczba ryb. Nr kolejny. Długość całkowita [cm]

Jesiotry Dedicated to your performance. Jesiotry. Pasza tonąca. Stworzona dla RAS (Recirculating Aquaculture Systems) Pasza zrównoważona

bi ~ Zestaw dydal<tyczny umożliwiający przeprowadzenie izolacji genomowego DNA z bakterii EasyLation Genomie DNA INSTRUI<CJA DLA STUDENTÓW

Farmakogenetyka Biotechnologia Medyczna I o

Akwakultura w badaniach Instytutu Rozrodu Zwierząt i Badań śywności Polskiej Akademii Nauk w Olsztynie

Zastosowanie metody RAPD do różnicowania szczepów bakteryjnych

mikrosatelitarne, minisatelitarne i polimorfizm liczby kopii

Metody badania ekspresji genów

7. Metody molekularne jako źródło informacji botanicznej i lichenologicznej

Metody badania polimorfizmu/mutacji DNA. Aleksandra Sałagacka Pracownia Diagnostyki Molekularnej i Farmakogenomiki Uniwersytet Medyczny w Łodzi

METODY MOLEKULARNE STOSOWANE W TAKSONOMII

Badanie próbek żywności na obecność Genetycznie Zmodyfikowanych Organizmów. Rozdział 9

PCR. Aleksandra Sałagacka

ĆWICZENIE 1 i 2 Modyfikacja geu wołowej beta-laktoglobuliny przy użyciu metody Overlap Extension PCR (wydłużania nakładających się odcinków)

PL B1. Sposób amplifikacji DNA w łańcuchowej reakcji polimerazy za pomocą starterów specyficznych dla genu receptora 2-adrenergicznego

Ampli-LAMP Babesia canis

Polimeraza Taq (1U/ l) 1-2 U 1 polimeraza Taq jako ostatni składniki mieszaniny końcowa objętość

ZRÓŻNICOW ANIE GENETYCZNE SZCZEPÓW DROŻDŻY FERM ENTUJĄCYCH KSYLOZĘ

PCR - ang. polymerase chain reaction

PCR bez izolacji testujemy Direct PCR Kits od ThermoFisher Scientific

PROJEKT WSPÓŁFINANSOWANY PRZEZ UNIĘ EUROPEJSKĄ Z EUROPEJSKIEGO FUNDUSZU ROZWOJU REGIONALNEGO 1 z 7

ĆWICZENIE 3 DGGE- ELEKTROFOREZA W ŻELU Z GRADIENTEM CZYNNIKA DENATURUJĄCEGO

Powodzenie reakcji PCR wymaga właściwego doboru szeregu parametrów:

Polimorfizm genu mitochondrialnej polimerazy gamma (pol γ) w populacjach ludzkich Europy

Klonowanie molekularne Kurs doskonalący. Zakład Geriatrii i Gerontologii CMKP

TaqNovaHS. Polimeraza DNA RP902A, RP905A, RP910A, RP925A RP902, RP905, RP910, RP925

Wprowadzenie do genetyki sądowej. Materiały biologiczne. Materiały biologiczne: prawidłowe zabezpieczanie śladów

Metody: PCR, MLPA, Sekwencjonowanie, PCR-RLFP, PCR-Multiplex, PCR-ASO

Glimmer umożliwia znalezienie regionów kodujących

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

Biochemia: Ćw. 11 Metoda RT-PCR

PCR - ang. polymerase chain reaction

Monitoring genetyczny populacji wilka (Canis lupus) jako nowy element monitoringu stanu populacji dużych drapieżników

Metody odczytu kolejności nukleotydów - sekwencjonowania DNA

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

Zakład Biologii Molekularnej Materiały do ćwiczeń z przedmiotu: BIOLOGIA MOLEKULARNA Analityka Medyczna 2016

Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6: wykrywanie liczby kopii genu

PCR - ang. polymerase chain reaction

WETERYNARIA Ćwiczenia laboratoryjne X DNA i RNA

Inżynieria Genetyczna ćw. 3

Seminarium Wpływ realizacji pobytów stażowych (szkoleniowych) na rozwój potencjału dydaktycznego postdoców i doktorantów

Transformacja pośrednia składa się z trzech etapów:

PCR łańcuchowa reakcja polimerazy

Ćwiczenie 3 Oznaczenie polimorfizmu genetycznego cytochromu CYP2D6 metodą PCR w czasie rzeczywistym (rtpcr) przy użyciu sond typu TaqMan

SPRAWOZDANIE O STANIE REALIZACJI ZADANIA z wykonania badań podstawowych na rzecz postępu biologicznego w produkcji roślinnej w 2011 roku

PORÓWNYWANIE POPULACJI POD WZGLĘDEM STRUKTURY

Biologia medyczna, materiały dla studentów

Gel-Out. 50 izolacji, 250 izolacji. Nr kat , Zestaw do izolacji DNA z żelu agarozowego. wersja 0617

Ćwiczenie numer 6. Analiza próbek spożywczych na obecność markerów GMO

Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu:

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Ćwiczenie 12. Diagnostyka molekularna. Poszukiwanie SNPs Odczytywanie danych z sekwencjonowania. Prof. dr hab. Roman Zieliński

Sekwencje mikrosatelitarne. SNP Single Nucleotide Polymorphism (mutacje punktowe, polimorfizm jednonukleotydowy)

Analiza genetyczna w niepowodzeniach ciąży i badaniach prenatalnych

Zestaw do izolacji DNA z żeli agarozowych. Nr kat. EM08 Wersja zestawu:

Szkolenie pt. Manipulacje genomowe u ryb łososiowatych: znaczenie, procedury i diagnostyka rezultatów Olsztyn 16 lutego 17 lutego 2008

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Zakład Biologii Molekularnej Wydział Farmaceutyczny, WUM ul. Banacha 1, Warszawa. Zakład Biologii Molekularnej

Elektroforeza kwasów nukleinowych

Księgarnia PWN: Joanna R. Freeland - Ekologia molekularna

tęczowych, obrazy chromosomów osobników obu płci porównywano w poszukiwaniu charakterystycznych cech kariotypów samic i samców.

WYKRYWANIE OBECNOŚCI BAKTERII Z RODZAJU LISTERIA W ŻYWNOŚCI

WYKORZYSTANIE MARKERÓW MOLEKULARNYCH W HODOWLI ODPORNOŚCIOWEJ POMIDORA NA CHOROBY POWODOWANE PRZEZ FUSARIUM OXYSPORUM

SPECYFIKACJA TECHNICZNA AGAROZ

ZA STO SO W A N IE M ETO D Y P C R DO RÓ ŻN IC O W A N IA DRO ŻDŻY PR ZEM Y SŁO W Y C H

MARKERY MIKROSATELITARNE

OCENA RÓŻNORODNOŚCI GENETYCZNEJ PRZY POMOCY MARKERÓW MOLEKULARNYCH ZASTOSOWANIE W EKOTOKSYKOLOGII

Modyfikacje epigenetyczne w czasie wzrostu oocytów związane z rozszerzeniem rozwoju partenogenetycznego u myszy. Małgorzata Karney

Ocena ekspresji genów proangiogennych w komórkach nowotworowych OVP-10 oraz transfektantach OVP-10/SHH i OVP-10/VEGF

SYLABUS. Wydział Biologiczno-Rolniczy. Katedra Biochemii i Biologii Komórki

Ćwiczenie 5 Klonowanie DNA w wektorach plazmidowych

DOT138v1 Instructions for Use Biofortuna SSPGo TM HLA No Template Control Kit BF Strona 1 z 7

Instrukcja używania zestawów do typowania antygenów zgodności tkankowej HLA SSPGo TM firmy Biofortuna (Biofortuna SSPGo TM HLA Typing Kits)

Ampli-LAMP Salmonella species

Badania genetyczne biologicznego materia³u wyjœciowego do prac nad restytucj¹ jesiotra ba³tyckiego (Acipenser oxyrinchus oxyrinchus Mitchill) w Polsce

Zmienność. środa, 23 listopada 11

Ćwiczenia 2-4 KLONOWANIE DNA

Wstęp. Jak programować w DNA? Idea oraz przykład. Problem FSAT charakterystyka i rozwiązanie za pomocą DNA. Jak w ogólności rozwiązywać problemy

Ćwiczenie 1 Plazmidy bakteryjne izolacja plazmidowego DNA

BADANIE WŁASCIWOSCI FIZYKOCHEMICZNYCH KWASÓW NUKLEINOWYCH

Transkrypt:

Biotechnika rozrodu ryb jesiotrowatych Dr inż. Dorota Fopp-Bayat Katedra Ichtiologii UW-M w Olsztynie

Stanowisko systematyczne (Nelson 1994) gromada: ACTINOPTERYGII RYBY PROMIENIOPŁETWE podgromada: CHONDROSTEI GANOIDY CHRZĘSTNE rząd: ACIPENSERIFORMES JESIOTROKSZTAŁTNE rodzina: Acipenseridae jesiotrowate rodzaj: Huso Bieługi rodzaj: Acipenser Jesiotry rodzaj: Scaphirhynchus - Łopatonosy rodzaj: Pseudoscaphirhynchus Pseudołopatonosy rodzina: Polyodontidae wiosłonosowate rodzaj: Polyodon rodzaj: Psephurus

Przedstawiciele ryb jesiotrokształtnych jesiotr zachodni (Acipenser sturio) sterlet (Acipenser ruthenus) wiosłonos (Polyodon spathula)

Import ryb jesiotrowatych do Polski

Lp Gatunek / mieszaniec Różnorodność gatunków i hybrydów ryb jesiotrowatych hodowanych w Polsce Nazwa łacińska 1 jesiotr syberyjski Acipenser baerii SB 2 jesiotr rosyjski Acipenser gueldenstaedti R 3 sterlet Acipenser ruthenus S 4 siewruga Acipenser stellatus SW Symbol 5 jesiotr syberyjski x jesiotr rosyjski 6 bester (bieługa x sterlet) Acipenser baerii x Acipenser gueldenstaedti Huso huso x Acipenser ruthenus 7 bieługa x bester (Huso huso) x (Huso huso x Acipenser ruthenus) SB x R BS B. BS 8 jesiotr syberyjski x jesiotr zielony Acipenser stenorrhynchus x Acipenser medirostris 9 wiosłonos Polyodon spathula W SB x Z

Dojrzewanie płciowe jesiotrów W warunkach naturalnych ryby jesiotrowate osiągają dojrzałość płciową w wieku 12 24 lat, przy czym samce dojrzewają o 2-3 lata wcześniej. Wyjątek stanowią sterlety, które dojrzałość płciową osiągają już po 5-8 latach. Po osiągnięciu dojrzałości płciowej większość gatunków ryb jesiotrowatych przystępuje do tarła co 3-5 lat. Jedynie sterlety mogą odbywać tarło corocznie.

Stadium dojrzałości płciowej samców Fot. Paweł Woźnicki

Stadium dojrzałości płciowej samic Fot. Paweł Woźnicki

Do owulacji u samic i spermiacji u samców niezbędna jest stymulacja środowiskowa i hormonalna

Stymulacja środowiskowa temperatura wody od 12 do 16 o C wzrost intensywności przepływu wody Fot. Dorota Fopp-Bayat

Stymulacja hormonalna Iniekcje z wyciągu odwodnionej w acetonie przysadki mózgowej dojrzałych jesiotrów lub ryb karpiowatych w ilości od 2 do 8 mg/kg masy ciała samicy (w zależności od stadium dojrzałości gonad i aktywności przysadki (Barannikova i in. 1983, 1993) Ovopel 1 granulka na 1 kg masy ciała samca Syntetyczne analogi LH-RH i GnRH w dawkach od 0,1 do 0,25 μg/kg masy ciała (Doroshov i Lutes 1984)

Efektywność stymulacji hormonalnej ESH jest uzależniona od stadium dojrzałości oocytów, który ocenia się na podstawie stopnia polaryzacji jąder komórkowych oocytów pobranych przyżyciowo z gonady samicy

Fot. Paweł Woźnicki

Osobnik jesiotra syberyjskiego gotowy do tarła Fot. Dorota Fopp-Bayat

Anestezja przed pobieraniem produktów płciowych Fot. Dorota Fopp-Bayat

Uśpiony samiec przygotowany do pobrania mlecza Fot. Dorota Fopp-Bayat

Uśpiona samica przygotowana do pobrania ikry Fot. Dorota Fopp-Bayat

Pobieranie mlecza od sterleta Fot. Dorota Fopp-Bayat

Pobieranie mlecza od jesiotra syberyjskiego Fot. Dorota Fopp-Bayat

Nacinanie jajowodów w celu pozyskania ikry Fot. Dorota Fopp-Bayat

Pobieranie ikry od jesiotra syberyjskiego Fot. Dorota Fopp-Bayat

Pobieranie ikry od sterleta Fot. Dorota Fopp-Bayat

Pobrana ikra przygotowana do zaplemnienia Fot. Dorota Fopp-Bayat

Odklejanie ikry Roztwór mleka Roztwór taniny dwukrotne przepłukanie ikry za pomocą roztworu taniny o stężeniu 0,3 g/l. Czas trwania kąpieli wynosi ok. 30 s, po czym ikrę należy przepłukać w wodzie (Kolman i Szczepkowski 2005)

Zapłodniona i odklejona ikra przygotowana do inkubacji Fot. Dorota Fopp-Bayat

Odpijanie tarlaków Fot. Dorota Fopp-Bayat

Inkubacja ikry w typowych aparatach Weissa Fot. Dorota Fopp-Bayat

Inkubacja ikry Fot. Dorota Fopp-Bayat

Pierwsze podziały komórkowe Fot. Dorota Fopp-Bayat

Informacje na temat rozrodu ryb jesiotrowatych opracowano w oparciu o Poradnik hodowcy JESIOTRY chów i hodowla. Ryszard Kolman 2006.

Szacowanie zmienności genetycznej ryb jesiotrowatych przy zastosowaniu markerów genetycznych Dr inż. Dorota Fopp-Bayat Katedra Ichtiologii UW-M w Olsztynie

Zachowanie zmienności genetycznej stad rozrodczych jest kluczowym działaniem w pracach hodowlanych

Zastosowania technik molekularnych w badaniach ichtiologicznych mają stosunkowo krótką historię. lata 70-te rozwinięcie technik elektroforetycznego badania białek lata 80-te rozkwit bezpośrednich badań genomu (mitochondrialny DNA, mt DNA) lata 90-te analizy jądrowego DNA (ndna)

Łańcuchowa Reakcja Polimerazy (Polimerase Chain Reaction) PCR W połowie lat 80 opracowano technikę, służącą do amplifikacji (powielania) dowolnej sekwencji DNA z użyciem pary oligonukleotydowych starterów oraz termostabilnej polimerazy DNA.

Łańcuchowa Reakcja Polimerazy (Polimerase Chain Reaction) PCR Denaturacja nici DNA w temp. 95oC Przyłączanie starterów reakcji PCR do matrycy w 55oC Polimeryzacja nici DNA w temp. 72oC

Analiza mikrosatelitarnego DNA 5 ATGGTGTAGCTAAAC ATTAT TATTATT (ATT) 25 ACCTTGATCCTT 3 Sekwencje starterów reakcji PCR Sekwencja powtarzająca się

Metody wizualizacji fragmentów mikrosatelitarnego DNA: Elektroforeza agarozowa i wybarwianie bromkiem etydyny. Elektroforeza poliakrylamidowa i wybarwianie azotanem srebra lub przy pomocy radioizotopów. Elektroforeza kapilarna i wybarwianie fluorescencyjne.

Sprzęt podstawowy 1. Aparat do elektroforezy 2. Obudowa 3. Przewody elektryczne 4. Forma do żelu 5. Grzebień 6. Zasilacz pipety, probówki eppendorf, mikrofalówka Elektroforeza agarozowa Odczynniki 1. Agaroza 2. Bufor TBE lub TAE 3. Bromek etydyny 4. Marker (wzorzec molekularny)

Przygotowanie żelu agarozowego Dodanie bromku etydyny i umieszczenie żelu w formie z grzebieniem Nakładanie prób i wzorca masowego Elektroforeza

Bromek etydyny Wizualizacja żelu w świetle UV

0 Schemat postępowania podczas analizy mikrosatelitarnego DNA Pobieranie prób Izolacja DNA PCR 0,7 0,6 Analiza danych 0,7 0,6 Elektroforeza i wizualizacja w żelu poliakrylamidowym Określenie zmienności genetycznej frekwencja alleli frekwencja alleli 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 długość allelu (pz) 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 długość allelu (pz) frekwencja alleli frekwencja alleli 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 długość allelu (pz) 0,7 0,6 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 długość allelu (pz)

Analiza mikrosatelitarnych loci wybranych gatunków i hybrydów ryb jesiotrowatych Prążki DNA zidentyfikowane jako allele w locus ls-68: M - marker Øx174, jesiotr syberyjski (SB.L) ścieżki 9 18, 21, 26, jesiotr syberyjski x jesiotr rosyjski (SB. L x R) ścieżki 1-7, 20, jesiotr rosyjski (R) - ścieżka 24, bester (BS) - ścieżka 8, bieługa x bester (BBS) - ścieżki 19, 23, 25, 27, jesiotr syberyjski x jesiotr zielony (SB.L x Z) - ścieżka 22.

Frekwencja alleli w locus ls-68 0,7 0,7 0,6 0,6 frekwencja alleli 0,5 0,4 0,3 0,2 frekwencja alleli 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0,1 0 0 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 długość allelu (pz) długość allelu (pz) jesiotr rosyjski jesiotr syberyjski 0,7 0,7 0,6 0,6 frekwencja alleli 0,5 0,4 0,3 0,2 frekwencja alleli 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0,1 0 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 0 110 130 150 170 190 210 230 250 270 290 310 330 długość allelu (pz) długość allelu (pz) sterlet wiosłonos

Obliczanie hetrozygotyczności obserwowanej i oczekiwanej Population Sample size Number of alleleles Volga 31 4.25 Observed heterozygosity (H o ) Expected heterozygosity (H e ) 0,66 0,69 Kama 32 6.50 0,68 0,80 Dnieper 8 4.00 0,63 0,72 Dniester 5 4,50 Danube 12 6.00 0,67 0,65 0,70 0,75

Analiza wariancji Locus F IS F IT F ST Afu- 68 Afu- 19 Afu- 39 Aox- 45 0.022 (0.110) -0.164 (0.052) -0.297 (0.101) -0.046 (0.033) 0.116 (0.133) -0.169 (0.063) -0.251 (0.134) 0.055 (0.090) 0.092 (0.041) -0.005 (0.013) 0.033 (0.040) 0.095 (0.057)

Analiza pokrewieństw filogenetycznych

Zastosowanie analiz genetycznych do identyfikacji osobników ryb jesiotrowatych po manipulacjach genomowych określenie ploidalności w grupach doświadczalnych metoda cytogenetyczna, identyfikacja matczynego genomu u potomstwa przy zastosowaniu analizy polimorfizmu mikrosatelitarnego DNA.

Prążki mikrosatelitarnego DNA w locus Afu-68 u gynogenetycznego potomstwa jesiotra syberyjskiego (Acipenser baeri); (Fopp-Bayat i inni 2006).

Prążki mikrosatelitarnego DNA w locus Afu-68 u diploidalnego i triploidalnego potomstwa jesiotra syberyjskiego (Acipenser baeri); Fopp-Bayat i inni 2006.

Dziękuje za uwagę.